1DFQA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with sialic acid
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords TETANUS TOXIN HC
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 109
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-11-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1dfqA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1dfqA02
2Y9FA 2DUQA 3O12A 1TWMA 5CA6A 1ZA4A 3BRGC 1JBCA 2LIQA 3W59A 3WOGA 1DHKB 3S8JA 4ITCA 1S1AA 3BAQA 2YZ4A 3BA7A 3ILNA 2ZAAA 1CE7B 1CIWA 1NLSA 4WZFA 4UW3A 1DQ0A 1S0EA 3T8SA 4A7KA 1BFCA 1QDCA 3P6JA 5E88A 3WINA 2A70A 1UMZA 2IWTB 2Z49A 5D61A 1DFCA 2ERMA 4AGVA 3M3QA 1TEIA 4IY8A 3OBRA 1G7YA 1WW5A 3M3EA 3AKHA 1WD3A 4YG0A 5F8SA 1ENRA 3INAA 2G4IA 3BAVA 1C4RA 5KXEA 3WLUA 4I96A 2E6VA 1LCLA 1V6UA 1HWOB 2ZGSA 3R4SA 2ZGLA 4GKYA 3B9CA 3H6QA 3IPVA 1JN2P 1WLDA 1CQ9A 5GZGA 1HDKA 1LOAA 1SLCA 2C9AA 3JUUA 1RZOB 4OWJA 4Y1YA 1RINA 1DLLA 2VXTI 3O49A 1TOOA 1DGLA 5CB7A 4Y22B 1W6PB 2ENRA 21BIA 2WT1A 2ERFA 3LSEA 1BA7A 1C1FA 3WCSA 3AYDA 2KH2A 3BADA 3WUCA 4GXLA 2CTVA 3O5SA 1DBNA 1S0GA 3AXEA 1J1TA 1PZ8A 2D6NA 2ES3A 2AFGA 5I1BA 2DU1A 5FZUA 2A71A 1GYKA 3BRFA 4OWKA 5IT6A 5FRAA 3A0NA 3ZXDA 2YY1A 2EXJA 1O4ZA 4WBCA 2ZGNA 1QNYA 3T1LA 4PF5A 5BXSA 1ISZA 4Y20B 4M3CB 2PHTA 1WW7A 1Z78A 1VCLA 2HWMA 1IILA 1F9KA 1LECA 2Z42A 3APBA 5DSSB 2DYCA 2ZR1B 3B9UA 3BA5A 4XFUA 3RTIB 1JW6A 5D63A 4DQAA 5CAZA 1JY0A 2GMMA 1DQ6A 1KDKA 4Y1XA 5KXCA 1W3FA 1RY7A 41BIA 2ZHNA 2AXMA 1YXWA 4YZ1A 3FJHA 4Q91A 2YROA 3VKMA 1OQLB 4J2KA 1ULGA 1JT3A 3HN1A 4I4UA 3H6RB 4I4SA 1YIFA 4XJUA 1G82A 5T55A 3BRDA 2A6WA 4Q1RA 4LO0A 5FNXA 4FGFA 1FMZA 1KJRA 5EC5A 1VAMA 1ISVA 3UJ0A 4Q8KA 1AXMA 1MVEA 1ULDA 7I1BA 4YM3A 5EG6C 3VV1A 3R05A 4FPJA 5T5PA 1KNMA 3PVEA 2ZHMA 2DRYA 1Q56A 2ZBJA 4AVTA 1ENQA 1IOBA 3UDAA 1UN1A 3I4IA 4DRVA 3WZ1A 1HCEA 3MW2A 2XB6C 1I3HA 5GM0A 2KI4A 4QALA 5KXBA 1CVNA 3I2AA 1UZZA 5DUYA 2P3IA 2DURA 2PHRA 1FNZA 5B2HA 5E89A 3VKOA 3VUOA 3ILFA 4K20A 1Q1UA 4QKSA 2ZMLA 5JOXA 1QQKA 1DJSB 2K8RA 2SLIA 2V5YA 2GO2A 3ZSKA 1IS4A 3NJ5A 2IHOA 2ZABA 3VSFA 3BTAA 5DVHA 4XFTA 1SR4C 1FGAA 2EIGA 2Y9WC 3ZC8A 2AYHA 3TC2A 2R1DA 2D3SA 4Q2FA 2GZBA 3AX4A 1EYLA 3LLPA 2GALA 2D23A 2E7QA 5BQUC 2ARXA 2ZHKA 2P34A 2P23A 1FV2A 2EAKA 4I4YA 3RG0A 2YMZA 2F2FC 3ZX7A 4YM1A 4ASMB 3SH4A 1AVBA 4YGCA 1TP0A 3MW3A 1LEMA 1FWUA 4TYSA 1QF3A 3F62B 2VXRA 4Y22A 2LTNA 1ULEA 1A78A 5EWSA 4P0KA 2OUJA 3BA4A 3NWKA 1XZZA 4J2SA 4D69A 1V6WA 3IM7A 4I4QA 1AXKA 3Q7WA 2Z48A 4QKRA 3AH4A 1W0PA 3OJBA 1YO8A 1LJ7A 2VU9A 2YV8A 4XKIA 4P0LA 2DUOA 1RITA 2X2TA 4F83A 1DQOA 3IIRA 3MALA 1VAVA 1WUVA 3ZXGA 3CA1A 4G6MA 4Y20A 5GJ6A 1IJTA 4M3CA 3IM6A 4LO1C 5BP5C 3HSMA 1WBLA 1W6NB 3FJKA 1CPMA 4F34A 1SFYA 1GGPB 3VT0A 1JT5A 3P53A 4J23B 3VKNA 4BM8A 2PELA 4I37A 4R6UB 4FOYA 1SLLA 4LO8B 4EEEB 4IQPA 3AKFA 3KQRA 1GANA 1NUNA 1J0SA 4RL7A 4X38A 3UK9A 4BMBA 1FQ9A 1W6MB 3I29B 4L8QA 2GMPA 4PBOA 3WG1A 3WVJA 2CWMA 3IMNA 2D6PA 1S0LA 4X37A 4LBQD 3ZXLA 4ZKTB 4Z8SB 4YW1A 4FOWA 4FP3A 3H6RA 1PWAA 2FGFA 2EXHA 4KEIA 1M2TB 2R9KB 3A4UA 3MPPG 2E7TA 4YFWA 1MZ6A 4YZ2A 1JYIA 1UPSA 4NOTA 3B01A 2R0FA 2L5XA 2P3JA 5GZDA 3VKFC 3WMUA 2VSAA 2FMDA 1NXD1 4JAWA 1GBGA 3O44A 1W3GA 2OW4A 4R9BA 4P9WA 1LU1A 4G9NA 3CU1B 1HQWA 2AH2A 4QO3A 1AX2A 1HWNB 4J2XA 3FLPA 1QDOA 3V64A 3A21A 3B00A 2NTDA 3BX1C 1W6OB 4ISQA 4Y24A 4I4OA 1YBIA 4LO3C 3SH3A 5F8YA 1SBFA 1QQLA 4LBQB 5GALA 4XHBA 4IHZA 2DVFA 1IS6A 1ONKB 3HBWA 2D24A 1MS9A 5E8AA 2NMNA 3RTJB 1D0HA 1V6OA 4YLZA 4JKXB 4Y1UA 5JMCA 4IYBA 4I0YA 2C5DA 1IRAX 2KI6B 1W0OA 1MC9A 2DWRA 4BLJA 5BQUA 1RIRA 2ZGRA 1Z0HA 4I4VA 3N7LA 4XMAA 3D5OA 1LOGA 2F2FA 5JOZA 5DG1A 3DUIA 4P9XA 1Q8OA 3B3QE 1Z4SA 2HW9A 4HA2A 5BYNA 5D62A 2DRZA 4FOQA 3BOPA 4FPKA 1CJPA 4EFQA 4QBVA 3W9TA 1SLTA 1QU0A 1V6MA 3ZXJA 3K1XA 3OPZA 4LBJA 4GOYA 4ZFYB 1H30A 1C57A 1PZ9A 3V65A 3M1HA 2JE9A 3NV2A 4LBNA 1HWPB 3JRRA 3CRHA 1P63A 2VLCA 1QGLA 1L2HA 1WCSA 2A3WA 3RSJA 1C1LA 4YG6A 5BVPI 2WLQA 3OJVA 3AH2A 1MS8A 1AZDA 4FPCA 4JPZA 3N7MA 3LTQA 5EYYA 2DTYA 1FV3A 2D7IA 1MS5A 3ZSMA 5T5JA 2JDZA 4P14A 5T50A 5BP5A 1GZ9A 1BZWA 1DQ5A 2EXKA 3FLTA 3FLRA 2DS0A 3CRGA 4I6IA 4XXPA 5H9RA 2E53A 3MW4A 2NVHA 1BYHA 3O4OA 4XILA 1KRIA 3AP7A 3IN9A 2W68A 1AXZA 4P9YA 2UUSA 3AZVA 3OYWB 2H0BA 1W6NA 2WJSA 1FNYA 1JHNA 4CTEA 5E24E 1XQNA 3WDWA 3HALA 2FO1A 3UD7A 1SACA 1TFMB 1LHOA 4H55A 3ZPYA 3UD9A 3A23A 1IKPA 1LOEA 3V0AB 4LO2C 9ILBA 1QMJA 3RQ0A 2D6OX 1QKQA 3USUB 1S0IA 3CA3A 1N47A 5SV8A 1XYFA 3NBEA 1K5UA 4XJWA 5T5LA 4USPA 4EFPA 2EALA 1W6MA 1AX1A 2X2SA 2JKBA 2ZGTA 4K21A 1AVUA 3BAHA 1LHWA 4M01A 5CNAA 4FOVA 3H6SE 4I1BA 3SH5A 3WV6A 3FJCA 1PUUB 3N0KA 1QOTA 2PHUA 3AKIA 31BIA 3WG3A 2ZGOA 4Q1PA 3CRIA 4JCKA 1QOSA 3AYAA 3TAYA 3WDVA 2AGSA 1PZZA 1AFCA 5LK5A 4FQZA 4KEKA 1TTUA 3N3HA 3BIWE 5CBLA 1UKGA 1W6QB 1DQ4A 1DZDA 2ZGMA 2TEPA 1UX6A 2GN7A 4LO3A 4XJAA 2GNDA 2E4MC 3FJEA 4GAIA 1HKNA 3MEPA 5IK7A 3CA4A 1HQLA 4ISRA 2A6XA 5DUXA 1UZYA 4R9AA 4YM0A 1D2SA 5HPZA 1B09A 1N3PA 2WBCA 1WBCA 2OUHA 4KC3A 3ZVXA 4Q8LA 5GLWA 5DUWA 2BEAA 4IONA 1MZ5A 1W6OA 3AP5A 4G1RA 2FDBM 5IK5A 1NZKA 4LBQA 1JYCA 1BFBA 3N7JA 3VT2A 2RSTA 1FAYA 3PJQA 2A75A 3POSA 1ONAA 4USOA 3WUDA 2QN4A 2Q9XA 4HANA 4FPLA 4DPNA 3ZYPA 1Q8QA 2FFVA 1PZ7A 2ZQNA 1IOAA 2K43A 2CL2A 4GA9A 4W65A 4YGBA 5H9QA 2GNMA 1KJLA 1AVWB 1EPWA 1QXMA 1SLBA 3ZXEA 3UD8A 1GZCA 1YYNA 1V6NA 1HLCA 2ZHLA 1PUMB 2D7FA 2A3YA 2A5ZA 4A7ZA 1IS5A 2WRYA 2P2KA 2Y9XE 3WO2A 4DS0A 3Q9OA 3T2TA 4P6AA 4XFSA 2VUAA 4R9DA 3NBNA 4I3NA 3IM0A 3JUTA 2WSVA 1YI7A 5G00A 2R49A 1WBFA 4M3CE 2DVAA 2EF6A 3AP9A 5T52A 1WLCA 4DEPA 4AN6A 2CWSA 4DCKC 3QYDA 1H9PA 2VY0A 4YGEA 1IRPA 4Z8BA 2GDFA 3FGMA 2GNBA 1JOJA 5DZEA 1T9FA 4XBLA 3E8LC 1ABRB 2Q5TA 3D4KA 2AREA 4BLIA 2WT0A 3WG4A 2MC2A 2W39A 1LU2A 1FX5A 4XYXA 1ILR1 4LO2A 5FNWA 5GLZA 2MIBA 1ITBA 4EFRA 1W6PA 3ATGA 1CONA 1GLHA 2AENA 2ARBA 2WSUA 3WMVA 4XIKA 3JU9A 1I1BA 3FUQA 2UURA 2MLLB 5H9PA 5HCBA 2PHXA 2ESUA 4WVVA 1HWMB 2NYYA 2ZA9A 1BJQA 2AR6A 3V0AA 2ZMKA 5EHAA 4L4HA 4J2YA 2JE7A 4K1YA 3POKA 1JQZA 3WDXA 2WNEA 4FVVA 3OJ2A 4Q9PA 2ZGUA 3VWCA 4I8MA 1IS3A 4QD2B 3IPVB 1MR5A 3SNMA 2I2SA 1F5FA 3CA6A 1TIEA 1G86A 1GICA 3UJQA 3WHTA 1N1YA 1APNA 3I8TA 4I7IA 5DUVA 2D3RA 5JOYA 4ZFUB 5GLVA 3AYEA 6I1BA 3AZWA 3QLQA 4Y1ZA 1XHBA 4BMEA 1BASA 2VW2A 1LHUA 4JQ0A 4QD2C 3KM5A 5EYXA 2SBAA 4YW4A 1Q04A 4I4RA 1G9CA 4ENDA 3LCPA 3ZXFA 3CA0A 1W6QA 4XJ8A 3ZSJA 1II4A 4ZBVB 4OW4A 1GKBA 3FJJA 3NBCA 3AJ6A 4BOWA 4OUJA 4II0A 4G6JA 2OVUA 1LOCA 4OEFA 1ULFA 5BXRA 1TWEA 4FQ4A 2J3PA 2R16A 1GNHA 4I30A 4X39A 2KM2A 2AUYA 5T54A 2EXIA 3H0OA 4K1ZA 4XIOA 2VSEA 1T4QA 1Y7BA 3D6EA 3RS6A 5FZZA 1A3KA 1AVXB 1MS1A 1HCDA 4EKXB 4JKQA 1BQPA 4XTPA 1EV2A 3AJYA 2D43A 4GALA 2AQZA 1MS0A 5DZGA 1LOFC 3O0XA 1AJKA 1G9FA 3N7KA 5JLVA 1Q8VA 3CNAA 3VKLA 3FJDA 5GAQA 3DGTA 2KKIA 3RRDA 5F9TA 4XXAA 1V6IA 2HWAA 4GP3A 3AKGA 1FWVA 4Q9GA 1KDMA 4BPZA 2F8XC 1SR4A 3ZYRA 3FJAA 3Q7XA 1ISWA 1V00A 4ZGRB 3GNEA 4YFZA 1UL9A 3A22A 1YF8B 4Y1VA 4Y26A 1OKQA 1YRZA 4XBQA 2LIEA 4YW2A 1I1EA 1LOBA 2A6ZA 1LTEA 1F31A 2YXSA 4JP0A 4FPYA 4DFSA 3FJ9A 3NBDA 1BXHA 5DG2A 2W52A 1SCSA 3D7WB 5F8WA 3OBTA 1DIWA 1LGCA 4AWDA 3WO4A 2ZGPA 1AXYA 2XG3A 1JUIA 2E51A 1VIWB 5DXDA 2UWBA 3QCWA 1RMLA 3T1MA 1URXA 5FREA 4L4IA 1X50A 2DVGA 2AAIB 1LHNA 2D3PA 3R4UA 1Q8PA 3V0BB 4IZEA 4QC4A 4YG3A 2D7RA 4YZ5A 1HIBA 2BFHA 4XBNA 3IAGC 3N35A 2DU0A 3Q7YA 1LHVA 1A8DA 4GAFA 4SLIA 4AGRA 3WA1A 1JLYA 4G9MA 5FZYA 3O0WA 2ZGQA 3IM5A 4C1WA 1JTCA 3OGGA 4FPGA 2GNTA 4C1XA 4H04A 2WT2A 1SCRA 1AX0A 4FP2A 3HR9A 1FYUA 3AZXA 4LO1A 2DV9A 1SLIA 4ZFWB 1BFFA 2CY6A 1ULCA 3PHZA 1WW4A 2PHWA 5F5QA 5IK8A 3AP4A 3WO3A 3FUOA 4H9WA 1GNZA 4ZLBB 1JXNA 3BAOA 4YGDA 1JT7A 1N1VA 1BKZA 1RG8A 4U36A 3TB0A 2DREA 3BAGA 4ZA3B 5GLUA 1R8OA 3FBYA 3ZXKA 2JD4A 4WV8A 4WVWA 1LEDA 2DVDA 1HKDA 4UW4A 5JVVA 2XOAA 4XZPA 2LALA 1V6JA 1R8NA 3O4DA 3AFKA 2JJ6A 3P6IA 4AYUA 1U0AA 4Q27A 1DFQA 2YUGA 1VLNA 4AVVA 1FN0A 1MD6A 5DZFA 4CJMA 1WW6A 1S0JA 4OZXA 4FPFA 1ENSA 1AF9A 5GZFA 3FJ8A 4YOLA 4GP0A 4YZ4A 4I1EA 1WLWA 3WDTA 1GV9A 1LOFA 4CZSA 4GWNA 1S0DA 3ZC9A 4LBOA 4CRQA 1DQGA 3PMEA 3L2YA 1N4KA 1GSLA 3POWA 3QR5A 2CYFA 3SISA 2I1BA 2UWCA 1XG6A 1MS3A 3SLIA 5IK4A 3WDYA 1N1TA 4NO4A 3ZSLA 4XJ9A 3EF2A 1AVAC 4PBPA 3O0VA 2P3KA 2K4AB 1DYPA 4LO7B 2ZQOA 1LESA 2HYKA 4HL0A 4I4XA 1KQRA 3V79C 5KXDA 3ASIA 4AN7B 1BLAA 3SNVA 4BQ1A 2UU8A 1WD4A 2DUPA 2VW1A 1FATA 3UJOA 4XOGA 4R9CA 2HZ9A 4I2SA 1V6VA 1CN1A 3O4AA 4IY9A 3AZZA 4XHXA 3AXDA 4I4PA 4LO7C 1S0FA 3RMXA 4JRAA 4YM2A 1S0CA 3S8KA 3NV4A 2PHFA 4DENA 1DQ2A 3CAHA 5IUQA 1QOOA 3OJMA 1CR7A 2GN3A 1V6LA 3O5WB 2ZMNA 3AJZA 3OY8B 1UAIA 4FPOB 1GZWB 3HMYA 3FJBA 3V0BA 2NZ9A 1ISXA 1G8WA 2W08A 2BQPA 4OEGA 4XMIA 4DRRA 3PVOA 4JC1A 5BXTA 2D1ZA 2JECA 5GZEA 4D8HA 2FFUA 2Y9GA 3KMVA 3PG0A 3ILRA 3ILAA 1IT0A 1JT4A 5HCAA 3POYA 2ZGKA 1DZCA 5T5OA 1DZQA 3M3OA 4XE9A 2WQZC 2NP0A 3AH1A 5BXPA 3LSDA 4MYEA 4D0ZA 3AP6A 5DZUA 4IZXA 2M49A 4GWMA 3FFZA 8I1BA 1M16A 1OFSA 5JOWA 4XJZA 4OWLA 5GZCA 3C9ZA 3B69A 5BOWA 2ZACA 4ATEA 4FPHA 1Q03A 1IHKA 4PCRA 2NMOA 3NV3A 4UW5A 1LGBA 2A7AA 4ATFA 4HJJA 3OYWA 4PC4A 3I2XA 3C2UA 1SBDA 1CPNA 3PUBA 2D22A 4LBLA 1K5VA 4HR6C 3O4CA 2BEBA 1H9WA 1AJOA 1V6KA 2KLLA 1E0OA 1WBAA 1MS4A 1PC8B 2WKKA 3WINC 1IKQA 2R0HA 3BB2A 4ZOTA 1G9AA 1DYKA 1Z2VA 4TLPA 3USUA 3VEQA 2ZKNA 3VSZA 3AK0A 1N3QA 3NV1A 4RA0A 3GALA 1BLDA 3WG2A 1QNWA 2P37A 3CA5A 1LENA 1KITA 4P0JA 1BARA 2ZZJA 4LBKA 3W58A 1G9BA 1S0BA 1YTOA 3IKWA 2NN8A 2E4MA 1DQ1A 2RHPA 2UWAA 4LBMA 1O4YA 3HOMA 5JDBA 2CNAA 2V73A 3O4BA 3FJIA 4M00A 4AVSA 3UJ4A 3A07A 4XDQA 4FPEA 1MACA 3FJFA 4X3AA 2Q3NB 2P39A 1CVSA 2FHRA 3UL2A 2DTWA 4ZXKA 1ISYA 3SITA 4Q26A 1LGNA 4OEEA 3AJ5A 2ET2A 4KEJA 4YW5A 3ENRA 4GOVA 3AZYA 1R1ZA 3OGFA 1W3AA 1VALA 5AVAA 5L73A 1JLXA 4A7YA 3M2MA 2GMEA 3A0KA 1G9DA 1MVQA 3BAUA 2A6VA 5DUUA 2QYIB 1SZ6B 4EB2B 5GLTA 1LULA 3CQAA 3U4XA 1N1SA 3VT1A 3WCRA 2D6KA 5H9SA 4QBCA 2B7YA 3N36A 2VH9A 4YZ3A 2A3XA 2D6LX 3WNXA 2VW0A 4XTMA 4U2AA 4TZDA 1SBEA 1CESA 2NM1A 4KBBA 2RQ9A 1SLAA 3AYCA 5F90A 3M3CA 4PQ9A 1FMMS 2RG9B 3OY8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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