3N7MA

Crystal structure of w1252a mutant of hcr d/c vpi 5995
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
422
structure length
418
Chain Sequence
SINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNTGLITNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYAFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Neurotoxin
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 418
sequence length 422
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7mA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7mA02
1UZYA 1PC8B 4X39A 4FPLA 5JVVA 3ZXDA 4I6IA 1NUNA 1MD6A 1SR4A 4Y26A 5GM0A 2W39A 2A75A 2P3JA 5DVHA 1Q8VA 4EB2B 1M2TB 4XJWA 4YFWA 3FUOA 1II4A 1R1ZA 3T8SA 2VSEA 1QKQA 1TIEA 4Y22A 1JW6A 1R8NA 2VXTI 1MVQA 5T55A 2ZABA 1A8DA 3BAOA 3WO3A 2Q3NB 2GMPA 2ZKNA 2ZMLA 4G9MA 1Q56A 4ZFUB 4ITCA 5GJ6A 5DZGA 2JJ6A 1WLWA 3AJYA 4Q8LA 5H9SA 2F2FA 2D3SA 1CPNA 5GZGA 1FMMS 3O4BA 4I1EA 3V0AA 1S0EA 4R9BA 5HCBA 5DZFA 1VCLA 1NXD1 1TP0A 3LTQA 3POYA 1DZQA 2J3PA 3NWKA 1JT4A 4QO3A 3QR5A 1KJRA 2VUAA 3FLPA 4DQAA 3VWCA 4DFSA 1HCDA 5DUYA 5H9PA 3AX4A 2HZ9A 3V65A 2ENRA 2YV8A 3NV1A 3ZPYA 4I30A 2DU1A 2R49A 1YI7A 2ZHLA 5JOZA 4Y1VA 2WLQA 5GZEA 3O4DA 4IYBA 1CQ9A 2JD4A 4OWLA 3B69A 1L2HA 4YZ4A 5FRAA 5DG2A 3VUOA 4QBCA 1V6MA 2A6YA 1C1LA 4M3CA 4EFQA 1YRZA 3AP7A 2BQPA 1FN0A 3WOGA 1HQWA 3BRDA 1VAMA 1BFGA 2ZQNA 3QYDA 4XXPA 2IHOA 4AWDA 3MEPA 2DVDA 3WMUA 2ARXA 3BAGA 2PHFA 3AJ6A 3PVEA 3B9UA 1Q8PA 4P0JA 4FPKA 4JKXB 3OYWA 5BOWA 1LHUA 2VW0A 3R4UA 4QBVA 2DYCA 1IS5A 1LOCA 5E89A 3BA7A 1K5VA 4IZEA 3P6JA 3INAA 1Q04A 1J0SA 4Q27A 4LBJA 3ZVXA 4M01A 1QGLA 1ULGA 4YLZA 4M3CE 1QXMA 4M3CF 4R9AA 4QD2B 1DQ6A 3W9TA 3VKOA 3GNEA 5DZEA 5EYYA 3WHUA 2LIEA 2GO2A 3AKGA 5HCAA 1HQLA 3LSDA 2WSUA 4X37A 2D6LX 2WSVA 1LU1A 2WRYA 3CA5A 1GYKA 4CTEA 1ISVA 3OPZA 4G6JA 2D7IA 1MS9A 3VSFA 4YGDA 2KH2A 4JKQA 2AAIB 4A7KA 1S0IA 4KEKA 4YZ3A 2NTDA 4R9DA 1JHNA 3I4IA 1QNYA 2GDFA 3WZ1A 1AZDA 3VV1A 4LO1C 1XYFA 3ZSJA 2D6OX 3WINC 4KEIA 4XKIA 4ATEA 4LO3C 1JLYA 2WKKA 1SBDA 5FNXA 4XMAA 1N1VA 3N7MA 1LGNA 1G9DA 1JT7A 2C9AA 4BMEA 2L5XA 1HWOB 2OW4A 2BFHA 4YM0A 1ULFA 2DTYA 1W0OA 2EXHA 5EC5A 1G7YA 3F62B 1TTUA 5T5JA 1TFMB 3BADA 4GXLA 3WDUA 1YBIA 3TAYA 2FGFA 1RMLA 1MVEA 2DU0A 1WBAA 4LBMA 4ZBVB 3WV6A 2LALA 5T54A 1C1FA 1XHBA 1XQNA 4FPGA 3O5SA 3FJJA 4YZ2A 3AK0A 4YFZA 3D5OA 4CZSA 4I1BA 1PZ9A 2D44A 1KDMA 2PHTA 3JRRA 3V79C 2A6XA 1FAYA 1ENRA 1N3OA 1ABRB 4XILA 4Z8SB 1DQOA 2V73A 2CWMA 3UJQA 2DWRA 2G4IA 8I1BA 4XJAA 3EF2A 1AX0A 1S0GA 4I3NA 1OKQA 3W59A 3IPVB 1LHVA 4JP0A 1LULA 3RMYA 4BPZA 3RMXA 3IM6A 1PZZA 3O4AA 4XE9A 3TC2A 1IILA 1S0BA 4USOA 5DUUA 4AGVA 3Q7WA 1DQ2A 2GN7A 3O3QA 2C5DA 4U36A 2ERMA 5FZUA 3NBNA 1FNZA 2GMMA 3I29B 1GZWA 4FPOB 41BIA 4L4HA 1MS5A 4XMIA 3HSMA 1Q8OA 1A3KA 4LO1A 1YXWA 4IZXA 3POKA 2GNTA 5L73A 4XTPA 4OEGA 4RL7A 3FJBA 3WINA 2Y9WC 4L4IA 4LO3A 1DQ1A 1QQLA 3NJ5A 4W65A 3NBDA 4XFUA 1BA7A 4WVVA 3W58A 5EHAA 1RIRA 4G6MA 1GNHA 1G86A 1S0DA 1LHOA 1IKQA 3FJFA 4YW3A 4R6UB 2DS0A 1I3HA 4D0TA 3NV4A 5BXRA 3AKHA 3MW2A 3LLPA 4FPJA 3A0NA 2PHRA 1CE7B 4PCRA 4HL0A 5JOWA 4PC4A 4ENDA 2DVAA 2JE7A 5DG1A 3FJHA 2W52A 2TEPA 1JTCA 3A23A 2GNDA 1MC9A 4II0A 1V6UA 3FJCA 2K4AB 3FJKA 4OW4A 1J1TA 4XJ8A 4KEJA 5DUWA 2MC2A 3ZXJA 1WD4A 5CBLA 3KQRA 3PVOA 1O4ZA 3VKNA 1FWUA 5F8WA 5CAZA 3WHTA 1HKDA 2HWMA 5KXBA 3FJDA 2ZHMA 1AJOA 2D24A 4XDQA 1MS1A 2ZMKA 1DFCA 2NMOA 2F8XC 1D0HA 1WW4A 2LIQA 4LO2A 4XIKA 2GALA 4YM1A 4I0YA 5T5LA 4AN7B 1W6QA 4UW3A 2CTVA 2JKBA 1YF8B 1OQ1A 2ZGKA 1FATA 1MACA 1Q8QA 4XJ9A 2X2SA 4CRQA 1FV3A 3AYCA 1UX6A 4P14A 1BLAA 1LHWA 1YIFA 1MS0A 1T9FA 1QQKA 1S0JA 2VLCA 1WBLA 3BX1C 4Q2FA 2RQ9A 3AP5A 3S8JA 2FO1A 4J2XA 1VIWB 4QC4A 1V00A 4YW5A 3AYDA 1SLIA 3CA3A 5EXOA 4UW5A 1N1YA 3VT1A 4GOVA 1QU0A 1LOBA 4LBNA 1YO8A 1JQZA 1ITBA 3CU1B 2EALA 2E4MC 2ZGUA 4LBQB 1W6QB 1WBFA 4U2AA 3PJQA 2WT0A 4KC3A 1LOGA 4OWJA 1FQ9A 2M49A 2D7RA 1S0FA 1JYCA 2ZGTA 3WNXA 4P0LA 2EAKA 2GN3A 1WUVA 1JN2P 5T5OA 2CWSA 2VH9A 4J2YA 1RG8A 4TZDA 1I1BA 3N7KA 4AGRA 3AP9A 3M3EA 5AVAA 5BQUA 4LBQD 5DZUA 1Y7BA 3IN9A 1UPSA 3WG4A 1LEDA 1HLCA 6I1BA 4P9YA 1G9AA 4IY9A 2ES3A 4ZGRB 3AXEA 2HYKA 4CJMA 4Q1RA 4XTMA 1SLCA 3RTJB 3I2AA 3FJIA 3S8KA 4EFPA 4FPEA 1SACA 4I37A 2OVUA 3NV2A 3A07A 4Y22B 3CA0A 2P3KA 2YUGA 5FNWA 3VT0A 3PVNA 3OJ2A 1EVTA 4XJUA 4AVTA 2ZZJA 4I4XA 3UK9A 5DSSB 3MW4A 5E88A 1DQ4A 2DURA 4XOGA 5GZDA 1C57A 3V0AB 4I8MA 2VW2A 4LBLA 2UWCA 5KXDA 2DVGA 2D20A 4K21A 4G1RA 3WUCA 5D62A 4LO7B 2EXJA 1CVSA 1BXHA 2ZGSA 3HBWA 1DYPA 3D7WB 2DUQA 3OJBA 2RG9B 4PBOA 3BA5A 2DV9A 5JDBA 1DJSB 3H6SE 3OBRA 2I2SA 1SLTA 2P37A 4ISRA 3WDWA 2E7QA 2A3WA 4M3CB 3R4SA 4L8QA 5BVPI 4DENA 1SZ6B 4TLPA 4DRRA 1E0OA 4YW4A 2VW1A 1W6MA 2Z48A 4XFTA 4YM2A 1V6KA 5GALA 4Y20A 4JQ0A 4EKXB 3N7LA 2YZ4A 4AN6A 2D6PA 2ZHKA 3UDAA 3AH2A 1DLLA 1RZOB 4K20A 4DCKC 1AXZA 2R1DA 3ENRA 1KJLA 2D23A 4X3AA 4IHZA 3IKWA 1VALA 3AXDA 1CPMA 2R16A 1JT3A 2AGSA 3OYWB 3B00A 3AZYA 4YG0A 4XXAA 3H6QA 2D1ZA 3FJ8A 1N4KA 4YGCA 1FV2A 1N3QA 4FP3A 3AP4A 1WW6A 1DHKB 3KMVA 3AH4A 3O0WA 2ZACA 3IIRA 1LECA 4IQPA 1AVWB 1FWVA 2E53A 3CA1A 1URXA 2A3YA 3NBEA 1LOEA 1IJTA 1JYIA 3FLTA 5IUQA 1W6MB 1G9CA 1Q03A 3H0OA 3PUBA 1W3FA 5H9QA 4YG3A 4H9WA 1V6NA 4MYEA 3Q7YA 4I4RA 2DRYA 3VEQA 1BZWA 3CRHA 2P2KA 2ZGOA 3ZXGA 1LGBA 4IONA 1ONAA 2DRZA 3WO2A 4AGGA 4H55A 3B9CA 3N35A 1WBCA 1GZCA 5IK5A 3T2TA 4YW2A 4FQZA 3ZSLA 3FUQA 3NV3A 4Q8KA 2UU8A 2A6VA 3UD9A 2ZMNA 1BQPA 2IWTB 4XBQA 2FFUA 4P6AA 2R9KB 1V6JA 1IS4A 2ZHNA 4FOVA 4USPA 5F8YA 1KITA 3B01A 1JXNA 4F83A 7I1BA 2QN4A 1U0AA 3ASIA 3BAHA 5JOXA 4XBLA 4GAIA 2E7TA 1AF9A 3DUIA 3SH4A 1DQ0A 1AX2A 2PHWA 3WDYA 3POWA 4XHBA 1KNMA 3OY8A 1WLDA 4ASMB 2KI6B 3OJVA 1CESA 3IM7A 3IM5A 3MALA 4H04A 1W0PA 1A78A 1V6IA 3V64A 1TEIA 1HDKA 3JU9A 2NVHA 3WO4A 1BFFA 1GV9A 2ZGLA 1WLCA 2OUJA 1QF3A 1DYKA 2DUOA 2VXRA 2R0FA 1UKGA 4SLIA 2NM1A 1AFCA 3SITA 2KI4A 3O5WB 4Q91A 2DVBA 3WDXA 1YTOA 1FGAA 3VSZA 1O4YA 1FYUA 1LHNA 2ZGMA 1VLNA 4FQ4A 3VKLA 3ILRA 1N3PA 2DTWA 4F34A 2D6MA 3DGTA 1JOJA 3UJOA 1LENA 5BP5C 9ILBA 2D6NA 3D6EA 5KXCA 2D6KA 4Q1PA 3BTAA 2ZA9A 1DIWA 5BYNA 4Y1UA 4HA2A 1SR4C 4YGBA 4Q9PA 4PQ9A 4R9CA 1PWAA 2YY1A 3O4OA 5DUVA 1IS6A 4ATFA 2MIBA 3NBCA 2K43A 1IRAX 1IOAA 1HCEA 1GZWB 1ZM1A 5GLVA 3FBYA 4I2SA 1DQGA 3OGFA 3FJEA 3ZYRA 3A4UA 1NZKA 2PHUA 1G82A 4EEEB 4P9WA 5CNAA 4HJJA 1DFQA 5B2HA 3N3HA 2R0HA 3PG0A 4NOTA 3HALA 5SV8A 2F2FC 2MLLB 2Q9XA 2DVFA 4DRVA 1SBEA 3QLQA 3IMNA 2E6VA 4YG6A 3AKFA 3AH1A 3ZXLA 1PZ7A 4FOYA 4XJZA 3OBTA 3AP6A 1IS3A 1QDCA 5IK4A 1IRPA 1AX1A 4J2SA 4LBOA 1S1AA 1Q1UA 4XZPA 2B7YA 1N1TA 2D22A 4JPZA 4YOLA 2KM2A 1YYNA 2A6ZA 4TYSA 2FFVA 2NZ9A 4OEFA 4FVVA 1BFBA 3MPPG 2VY0A 4IY8A 1AVUA 1W6NA 1TWEA 2ZAAA 3BRGC 1JUIA 3Q9OA 1K5UA 1AVBA 3CRGA 1LOAA 2KLLA 4BMBA 3POSA 2XOAA 3O44A 1HWMB 1G9FA 1GSLA 3OJMA 4QD2C 2YROA 5FZZA 1CIWA 3M3OA 2GMEA 3M3CA 5E24E 5JLVA 1SCRA 3HOMA 4FOWA 1JLXA 3BRFA 5BP5A 1V6LA 1OQLB 4Y1XA 4I7IA 1ULCA 4Y24A 3CA4A 1D2SA 4ZFWB 2ZGRA 1V6WA 3A22A 2WT1A 5GAQA 4D0ZA 4YGEA 4PF5A 2CYFA 3ZYPA 2VSAA 1MS4A 1RINA 3HN1A 2ARBA 4K1YA 4BOWA 2SBAA 2R1BA 4QALA 1W6NB 4HR6C 1ISYA 4BQ1A 3IAGC 5T52A 1LGCA 3ILFA 1AVAC 1RITA 4JAWA 1ENSA 3AZZA 1BYHA 2W68A 1AXMA 1Z78A 2A6WA 2NMNA 3VT2A 2Q5TA 3WDVA 5CA6A 2BEAA 4J23B 1BFCA 2D3RA 3CRIA 3P53A 21BIA 3QCWA 2KKIA 3FGMA 4JRAA 2SLIA 3AFKA 1WCSA 3RG0A 1PUUB 4X38A 1QMJA 1SLBA 3I2XA 3BB2A 4J2KA 3O49A 3HR9A 2DREA 3CNAA 5CB7A 3CQAA 1LCLA 1FNYA 1EPWA 1V6XA 5GLTA 3C2UA 4JC1A 5GZCA 3RSJA 4AVSA 4XFSA 1DQ5A 1SBFA 3M2MA 2EF6A 1H30A 5DUXA 2ZBJA 3A21A 3WA1A 1QNWA 2I1BA 3UJ4A 1H9WA 3M1HA 2WQZC 1MS3A 4LO0C 3ILAA 3USUA 5BXSA 3UL2A 3F1RA 2Y9FA 1IKPA 2AFGA 3WCRA 1CN1A 1S0CA 3AZVA 2AR6A 2JDZA 3SNVA 3HMYA 4YM3A 1JBCA 2EXKA 4Q9GA 3FLRA 1FX5A 1GZ9A 2ZGNA 1BLDA 3WMVA 4ZLBB 3OGGA 4Z9WB 3SH5A 1LJ7A 3CA6A 3ZXEA 3N7JA 3RTIB 1G9BA 2WT2A 2EXIA 2E4MA 1DZDA 1V6VA 2V5YA 1XZZA 1R8OA 1LESA 1MZ6A 1CR7A 1CONA 3SH3A 1GGPB 2QYIB 4BLJA 5T5PA 3KM5A 1SFYA 3BAQA 3L2YA 1UMZA 2P3IA 5FZYA 2Y9GA 4A7ZA 1BASA 4GP3A 4WV8A 5G00A 2Z49A 3TB0A 4GALA 2LTNA 2WNEA 2P34A 3BA4A 4C1WA 2AREA 3T1LA 1X50A 3USUB 2JECA 1EV2A 5EG6C 4I4PA 2XB6C 4I4SA 2YXSA 4XBNA 2E51A 3O0VA 4DS0A 4WZFA 1ONKB 5IK7A 2JE9A 1WW7A 2GNMA 4WVWA 1HWPB 3SNMA 5IT6A 3V0BA 1LU2A 2NYYA 3N36A 4C1XA 4LO8B 1T4QA 1MZ5A 5GLUA 1QDOA 2NP0A 1HKNA 3WG3A 1SCSA 4D8HA 3LSEA 4FPCA 3VKFC 4D69A 1IHKA 1NLSA 2CL2A 1W6OA 1TOOA 3WCSA 2Z42A 1LTEA 1ENQA 2P39A 1P63A 4GKXA 2AUYA 1XG6A 4PBPA 3UD7A 3IM0A 1IOBA 5D63A 4GWMA 3BODA 3ZXFA 4P0KA 1DBNA 1SLLA 3ATGA 1UZZA 4GKYA 1HWNB 2D3PA 4LO0A 1V6OA 1FMZA 1N47A 1Z2VA 1F31A 4Z8BA 4GWNA 1M16A 4FOQA 4AVVA 3PMEA 4OZXA 4Y20B 2CNAA 1AXYA 1DGLA 3Q7XA 4ISQA 2BEBA 5F8SA 1BJQA 1ILR1 3WUDA 4XYXA 3V0BB 1Z0HA 3FFZA 3P6IA 3AYAA 4UW4A 3WG1A 1ISZA 3IPVA 1CVNA 1W3AA 3AJ5A 3H6RA 5I1BA 2A70A 3ZX7A 5T50A 1W6OB 3ZSKA 2ZR1B 3C9ZA 2RHPA 4ZXKA 3UJ0A 2GZBA 5GLWA 3A0KA 1H9PA 3ZC9A 1GBGA 1KDKA 2H0BA 1W6PA 1WW5A 1KQRA 4BLIA 5JOYA 1GNZA 5EYXA 5HCFA 5F9TA 4XHXA 3ILNA 4YZ1A 2K8RA 3O4CA 3M3QA 3GALA 1ISXA 1KRIA 2PELA 1ISWA 4ZA3B 1G8WA 4GOYA 3AJZA 3AZWA 3N0KA 2DUPA 3LCPA 4BM8A 3U4XA 5LK5A 1GLHA 3FJAA 4FGFA 1DZCA 1SLAA 4LO2C 1C4RA 2W08A 1W3GA 3AYEA 4I4YA 5BXTA 4JCKA 2A7AA 3H6RB 3D4KA 4OWKA 3AKIA 3BOPA 4FP2A 3RS6A 1CJPA 1MR5A 2D7FA 4Q26A 4YZ5A 1I1EA 1IT0A 2AH2A 3CAHA 1Q8SA 1W6PB 1S0LA 2ZQOA 4GA9A 1UL9A 2ET2A 2EIGA 2XG3A 1JY0A 31BIA 3WDTA 2FMDA 1LOFC 2ESUA 3E8LC 3WLUA 1OFSA 1GICA 4HANA 1WD3A 4ZFYB 3I8TA 3K1XA 2FHRA 1AJKA 3JUUA 4EFRA 1VAVA 1QOOA 1ULDA 3OY8B 2NN8A 5EWSA 4QKRA 4UW6A 4Y1YA 1QOTA 1LEMA 3MW3A 4K1ZA 2Y9XE 4DEPA 3VKMA 2ZGPA 4M00A 2P23A 4I4VA 1UAIA 4NO4A 1HIBA 1UN1A 4I4UA 1F9KA 4I4QA 5KXEA 3AZXA 4I96A 4FPHA 2UURA 4YW1A 2HW9A 3ZSMA 1BKZA 4DPNA 3WG2A 5GZFA 1PUMB 4A7YA 5HPZA 3SLIA 5F5QA 5F90A 3APBA 4FPFA 4G9NA 3BIWE 2UWAA 1APNA 3UD8A 3BAUA 5DXDA 1ULEA 5FREA 3O0XA 4P9XA 5BQUC 4OEEA 2OUHA 2ZGQA 5IK8A 2D43A 1AVXB 2WJSA 1QOSA 1GANA 2CY6A 2FDBM 4ZKTB 1TWMA 1GKBA 1ZA4A 4LBKA 4LO7C 3ZXKA 1BARA 4OUJA 3FJ9A 1Z4SA 2UWBA 4Y1ZA 4XIOA 1JT5A 2X2TA 5D61A 5BXPA 2AENA 3WVJA 3BAVA 2A5ZA 4LBQA 3PHZA 1LODA 2GNBA 1PZ8A 1RY7A 3B3QE 4GAFA 3RRDA 2VU9A 2A71A 4I4OA 5H9RA 2AXMA 2RSTA 3ZC8A 3RQ0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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