1D0HA

The hc fragment of tetanus toxin complexed with n-acetyl-galactosamine
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords PROTEIN (TETANUS TOXIN HC)
publication title The structures of the H(C) fragment of tetanus toxin with carbohydrate subunit complexes provide insight into ganglioside binding.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 113
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 1999-09-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1d0hA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1d0hA02
1JXNA 1O4YA 1Y7BA 1FN0A 3VKLA 1KNMA 4R9CA 2D6PA 2NYYA 4XBQA 1S1AA 2NM1A 5AVAA 1AX1A 1UZYA 4DS0A 1W6NB 4EB2B 1QNWA 5T5LA 4Z8SB 1HDKA 3H6QA 3POSA 3H6SE 1Q8PA 2KKIA 3Q7YA 4GOVA 1AF9A 4HA2A 3FJBA 3FFZA 4YM0A 1HKNA 1OQLB 2X2SA 2EF6A 3SH4A 4JPZA 4XKIA 1CVSA 1LULA 2P23A 2PHUA 3QYDA 5CA6A 1YTOA 4JP0A 1R1ZA 3AX4A 1S0IA 4L4IA 4YGDA 3VWCA 3MW2A 1R8OA 4FOVA 3FJAA 4GAFA 4J2YA 3B01A 2ERFA 3RQ0A 2KH2A 3O3QA 4IONA 4IQPA 2I1BA 1LHUA 4ATEA 4WV8A 4DCKC 3T1MA 1GNHA 4WVVA 1AX2A 5T50A 4CJMA 1XHBA 3INAA 4Y26A 3WDTA 4GP3A 1I1EA 5E88A 4X3AA 1TTUA 4ASMB 2GO2A 5DUYA 5T5PA 2W68A 3OPZA 4I96A 3T1LA 1RIRA 4XJZA 4M3CE 1UKGA 3ZXKA 2ET2A 4YM3A 1IKPA 1LU2A 5HCAA 2EXHA 2E7TA 2KI4A 3D5OA 2WRYA 3IAGC 4YG0A 3HALA 1SBDA 1DQ0A 3AKFA 1V6UA 1ULDA 2F2FA 4Q91A 1NZKA 3T2TA 1NUNA 2WNEA 1AFCA 4WBCA 4NO4A 2P34A 4X37A 2ZBJA 3VKFC 1LESA 2ENRA 3AZYA 3GNEA 3O4OA 5D61A 1WLCA 1WCSA 3I29B 2W39A 1YF8B 2E4MA 3IKWA 2P3KA 1N1TA 3KMVA 3O4CA 3SISA 31BIA 1RMLA 1EVTA 4C1WA 1J1TA 1CR7A 2ARXA 4XHXA 3VKOA 2FFVA 4LO3A 2Y9GA 4XXPA 4J2XA 4AGRA 4JAWA 1BYHA 3WNXA 4XJ8A 5SV8A 1QDCA 1QDOA 4FPKA 3CA0A 1RY7A 2Z48A 1S0JA 4QC4A 4XTPA 1DFCA 2D6MA 1UN1A 1QF3A 5FRAA 1WBLA 1XYFA 4YGCA 4Z9WB 4UW5A 1MR5A 3UJOA 2VY0A 5GZGA 3AZWA 1MS4A 3BB2A 2AYHA 2ZGQA 4XFSA 1JT5A 4LO1A 3JRRA 3W9TA 1O4ZA 2R1DA 3AJYA 5KXBA 3UJ4A 1KDKA 1A8DA 1V6NA 3TAYA 1FV2A 3M2MA 3AYDA 5BQUA 1KJRA 3AJ6A 1V6VA 4FQ4A 3WV6A 4I4SA 1D2SA 3IM6A 1WW6A 2CYFA 1JT4A 2JECA 1KJLA 3WVJA 3POYA 4I4QA 4BMBA 1Z78A 5BQUC 4HL0A 3BIWE 4I2SA 3AXEA 5GLTA 4LBLA 5GZCA 3O4BA 2DVFA 3WA1A 3PVOA 3UD9A 2D3PA 4R9DA 4TLPA 4YM1A 2OVUA 5T55A 2ZKNA 1N3QA 1HKDA 5IK8A 1QU0A 1G9BA 3WUDA 2V73A 1WUVA 2ZGOA 2R1BA 1G9CA 1CPNA 1B09A 1DLLA 2UUSA 4OUJA 1C57A 2ZMNA 3NBDA 2M49A 3AP9A 5IK7A 1DQ1A 3BRFA 1QXMA 4AGVA 1VCLA 1LOGA 3WCRA 4PCRA 2D6KA 1WBFA 1GNZA 3OYWA 3A23A 1C4RA 4Y1UA 4I4YA 4OEFA 5GZDA 2RHPA 2ZGNA 3O5SA 4LBKA 4YZ3A 4XZPA 1GZ9A 2GMEA 3IM0A 1IKQA 1XG6A 2D7RA 4FPGA 1C1LA 4A7YA 1LGCA 3WINC 4GP0A 1W3GA 3UD7A 3AJZA 5KXEA 3A0NA 2JE7A 2FDBM 1IRAX 4IY9A 4TYSA 1HCEA 4G1RA 3CA6A 1IS4A 1DQ2A 3K1XA 2KI6B 1LEMA 4QALA 4AVSA 1RZOB 4OWJA 3BAOA 1PZ9A 3UJ0A 1NLSA 3AH2A 3NV4A 2R0FA 1LGBA 4MYEA 3WDYA 5H9RA 4QO3A 3JUUA 1FAYA 5GZFA 5IK5A 2GDFA 4Q1PA 5BP5A 3ZXJA 1W6PA 5IT6A 3AH4A 4AGGA 1S0CA 4M3CA 4LBQA 1Q8QA 2EXJA 3P53A 3CA4A 5KXCA 2ZHMA 3NV2A 2TEPA 1IJTA 1N1VA 3CRGA 4BQ1A 3KM5A 2XB6C 4FPJA 5JVVA 3RTJB 3OYWB 2ZMLA 3FUQA 3AXDA 4P0JA 1C1FA 1ONKB 5H9QA 2DVDA 5GALA 4I0YA 3BA5A 3FUOA 1YBIA 3PMEA 3UDAA 1R8NA 3A21A 1K5VA 2ARBA 4YZ5A 3OJBA 5EXOA 3U4XA 1LOAA 2JDZA 4DRVA 1HQWA 1SCRA 2I2SA 3BAUA 5BVPI 3HOMA 2D6NA 2EAKA 3HBWA 3OGGA 3APBA 1JW6A 5GJ6A 1HWMB 1QQKA 4FOWA 4I1BA 2ZQOA 1GZWA 1S0FA 1SCSA 1K5UA 1PZZA 2DURA 4XIKA 2A70A 1LOBA 3R4SA 4YLZA 4YW1A 1JT3A 4YZ2A 1Q8VA 1IS6A 1MS1A 1W6PB 2A71A 2PHFA 4M3CB 4I6IA 1W6OA 4LBQB 4R9BA 1MVQA 2DTYA 1TWEA 4HJJA 4M3CF 2OW4A 2Q9XA 2E53A 4UW4A 3MW4A 2LTNA 1UMZA 1SLAA 3ZC8A 5IK4A 5LK5A 4Y1YA 1T4QA 3GALA 1PUUB 1D0HA 3AYCA 2ZHNA 4FVVA 4YGEA 2D20A 1A78A 1DBNA 2AFGA 1RITA 1QGLA 3AP5A 1N4KA 1MS9A 4EFPA 1IOAA 3LSEA 1ISYA 1W6MB 9ILBA 3D6EA 1LEDA 3ZYRA 3IN9A 3R05A 1GSLA 4I4PA 5E89A 1YXWA 3IMNA 2ZGKA 2D7IA 1ISXA 4YGBA 2WT0A 5HCBA 2AQZA 1JUIA 5H9SA 2Q3NB 2GMMA 2KM2A 2VSAA 4Q27A 1BQPA 1N47A 2CTVA 1AXKA 3A0KA 1BARA 4OEGA 2HZ9A 4AWDA 5JOZA 2C9AA 1GGPB 2JE9A 2GALA 3V0AB 2AR6A 1CE7B 3PVEA 4DFSA 1QNYA 4ISQA 4LO0A 3S8JA 3ZXEA 3ILRA 4KEKA 2JD4A 5FZYA 1JT7A 4AN7B 5G00A 1BLDA 1IS3A 1JLYA 5DZUA 4X38A 4M00A 1DQOA 2NZ9A 3USUA 3WCSA 5GLWA 2DWRA 2DU0A 2GNDA 3PHZA 1V6WA 1URXA 1BZWA 3HN1A 3Q7WA 5HPZA 5JOXA 1G9FA 1CN1A 3M3OA 2DUOA 2J3PA 4Y1ZA 3AYEA 3OGFA 5EG6C 1TOOA 1F9KA 3WG1A 3QCWA 2YXSA 4Y24A 1G8WA 3BA7A 3O0VA 4P9WA 3WOGA 2ESUA 1ULFA 3SNVA 1HWPB 1Q04A 2MIBA 1V6JA 3BAVA 2W52A 3ZSMA 1H30A 1J0SA 3BADA 4ZFUB 1YI7A 3LTQA 3ZYPA 3SH3A 4D0TA 2MLLB 4U2AA 4R6UB 4Y20A 1KITA 1BFBA 2VW1A 2D23A 4QBCA 5BOWA 3B69A 1MVEA 4ZKTB 2UWAA 2A6XA 1Z2VA 1Q03A 4D0ZA 3AK0A 3POKA 1OFSA 2R9KB 3N3HA 2A3WA 1HQLA 1DYPA 1MS5A 3VT1A 4G6JA 1GYKA 3USUB 4ZLBB 4FOYA 2WT2A 4WVWA 2SBAA 2AGSA 4FP3A 3WHUA 2D7FA 4G9MA 5JLVA 2R0HA 4XJWA 2F2FC 3WO3A 4P9YA 4Q1RA 4BMEA 1ULCA 3HR9A 4JKQA 5F8SA 2R16A 2NP0A 2NMOA 1AXMA 4YOLA 4ZA3B 4I3NA 4A7KA 3ASIA 2A6ZA 1W0OA 2Q5TA 5GZEA 3PG0A 1BKZA 2E4MC 4GOYA 4FOQA 2D6OX 5DUUA 1FGAA 2VSEA 3UD8A 4HANA 2HWMA 3FJ8A 1GV9A 2VW0A 5FNXA 4LO3C 2FMDA 1CPMA 1DFQA 5T54A 3W59A 1BASA 4EEEB 4DPNA 3CAHA 1WW7A 5BXRA 4GA9A 5DUXA 3FGMA 2AXMA 2A5ZA 1H9PA 3RTIB 1W0PA 1ULGA 5GM0A 4I4XA 2UURA 5E8AA 2EXIA 1FQ9A 5CNAA 6I1BA 1DQGA 2D24A 2G4IA 3EF2A 2FO1A 4NOTA 4OEEA 3D7WB 1YRZA 5EHAA 2ZHKA 1LOCA 4LO1C 1LCLA 3O5WB 3WHTA 1GZCA 4I4UA 4LO2A 1AX0A 4OWLA 3ILAA 4QD2C 5GLVA 1M2TB 4I4OA 2D3RA 2E7QA 4XIOA 4XXAA 3PVNA 4LBMA 1U0AA 4L8QA 4Q2FA 3F62B 4ATFA 3AP6A 2DVAA 4LO2C 3AH1A 2WJSA 4Q8LA 2Z49A 2DRZA 4I4VA 4X39A 4F34A 1DQ5A 5BXPA 2XOAA 4KEIA 2EIGA 1FYUA 3FJIA 3MALA 4K1ZA 1IS5A 4GWMA 1DIWA 2DUQA 4YZ1A 1ISZA 4I30A 2GNBA 1LTEA 3AZXA 4XOGA 3OY8A 3B9UA 1L2HA 4ZGRB 1SBEA 1V6LA 3BODA 4QD2B 3WLUA 3AP7A 1IHKA 1JN2P 2XG3A 3FLRA 2Z42A 4EKXB 4GXLA 3ZSLA 5DZEA 4AN6A 4KBBA 2PHXA 1ISVA 3BAQA 3I4IA 1V6MA 3MPPG 4Q26A 3DGTA 4ZXKA 1YYNA 1KDMA 5FZZA 4K1YA 2R49A 1SLCA 3O0XA 3CA1A 4JQ0A 1S0EA 3H6RA 4YG6A 1UL9A 1AXZA 3OJVA 1WW5A 4XYXA 4P9XA 1DZDA 2D43A 1F5FA 1WLWA 1S0BA 1FMMS 2C5DA 1YIFA 1VAMA 1SR4A 1MS3A 5DG1A 1HCDA 1MACA 1E0OA 1JYIA 3WUCA 5B2HA 2UWBA 1PC8B 2FHRA 3BA4A 5BP5C 4DENA 3FJDA 4K21A 5GAQA 1I1BA 5EYXA 2DRYA 2FGFA 1OKQA 1XQNA 3OY8B 5D63A 2ZR1B 4EFQA 3O12A 5DUWA 4L4HA 3IPVA 4YM2A 1W3FA 3WMUA 3SH5A 2RQ9A 4XMIA 5FREA 2FFUA 2A6WA 1UAIA 3PUBA 1S0GA 3F1RA 1EYLA 3BRDA 2ZHLA 1V6IA 1DHKB 1W3AA 3NV3A 5EC5A 1Q8SA 4J2KA 5DUVA 2OUHA 1HIBA 5D62A 1G9DA 3H6RB 3KQRA 1M16A 1ENRA 2ZA9A 4F83A 3R4UA 1VAVA 4P0KA 3BOPA 3M3QA 4XDQA 3VSZA 1II4A 3P6IA 4XMAA 4FP2A 3RG0A 1SLIA 4XTMA 1SLLA 1A3KA 4I1EA 3OJMA 1GANA 1UX6A 4XBNA 4AYUA 2AENA 5DG2A 5CBLA 1ABRB 3RMYA 3FJ9A 4G6MA 1IOBA 2W08A 2RSTA 2P37A 3UK9A 2ZABA 2WSUA 3HSMA 3FJKA 3NBCA 4LO7C 3V0BA 3AKHA 3QR5A 2ES3A 2WSVA 1VIWB 1PZ7A 2A3YA 4UW3A 2D22A 1QOSA 4Q9GA 3ILFA 1G7YA 3ZSJA 1W6QA 4DRRA 2ZGMA 4IZXA 1FWVA 1FNYA 3N7JA 1Z0HA 1LGNA 2BFHA 1N1SA 3BRGC 1S0LA 1DZCA 3ZPYA 4U36A 2D44A 4PBOA 2D3SA 1FWUA 1H9WA 5DXDA 2GMPA 5DSSB 2K4AB 3ZXDA 1X50A 1BFCA 1DJSB 2CY6A 2BQPA 1HLCA 5JDBA 2WQZC 2P3IA 3WG3A 2A6YA 3AYAA 3ATGA 1P63A 4FPLA 1QOOA 4J23B 1GZWB 4YW3A 4II0A 1F31A 4ZFWB 4ITCA 3W58A 3CA3A 1V6KA 3O44A 21BIA 4LO7B 1FMZA 4CTEA 3O49A 1N1YA 3FJCA 2E6VA 1SFYA 3DUIA 1W6OB 4I8MA 5DZFA 3QLQA 4ISRA 3UL2A 4UW6A 2DTWA 2ZGLA 5FZUA 3V0BB 1WD3A 2B7YA 2PELA 2ZGTA 4QBVA 4Y22A 2A7AA 3AKGA 5E24E 1W6QB 1DGLA 2VU9A 4LO0C 3BAHA 3PJQA 2DYCA 3L2YA 3T8SA 5CAZA 3RS6A 1UPSA 2EXKA 4XFUA 4J2SA 2L5XA 1IT0A 1CVNA 3OJ2A 3VKNA 1WBCA 1KRIA 1I3HA 3RSJA 1PUMB 1JY0A 4DQAA 3BAGA 5L73A 4USOA 3VUOA 1BJQA 4ZBVB 3RMXA 4USPA 1SACA 1TP0A 2P3JA 2V5YA 2DREA 2VW2A 1JQZA 2LIQA 3FLTA 3SNMA 1JBCA 3H0OA 1AVXB 1KQRA 2D6LX 2ZGRA 2K43A 1QOTA 1SLTA 3CRHA 4P14A 4RL7A 2EALA 5BXTA 1FX5A 4D8HA 3WZ1A 2BEAA 1LJ7A 1IRPA 3FJEA 1JYCA 2A3XA 3WDXA 2AH2A 4FPYA 4IZEA 1VALA 3I8TA 3N7LA 4JRAA 4WZFA 3ZX7A 4GWNA 1LHNA 3CNAA 3VT0A 1WD4A 3D4KA 2IHOA 1CESA 4Y22B 4FQZA 2CNAA 1N3PA 2ZMKA 1AZDA 4FPCA 5IUQA 1BLAA 5BXSA 1PWAA 3C2UA 4LBNA 1AVWB 1TFMB 4PC4A 5KXDA 4BLJA 1HWOB 1GLHA 2VXRA 2CL2A 1MZ5A 3WDVA 2HWAA 4YW5A 1TWMA 3WG4A 4BOWA 4DEPA 3I2XA 1CJPA 2QYIB 2YY1A 3C9ZA 1G9AA 3AKIA 3JUTA 4QKRA 1WW4A 8I1BA 4FPEA 1SZ6B 3HMYA 4ZOTA 1EPWA 3O4DA 1LECA 1AVUA 2YUGA 1LHWA 4XJUA 3M3EA 4XJAA 4R9AA 2ZGSA 2DU1A 2WLQA 4M01A 1BXHA 1JOJA 2GNMA 1QMJA 4XE9A 2JJ6A 2RG9B 5T5OA 4LBJA 1RG8A 1EV2A 4Y20B 3BTAA 2H0BA 1BFGA 1GICA 4Z8BA 2YZ4A 3WO4A 4BM8A 3B3QE 41BIA 1DYKA 2PHRA 3LSDA 4D69A 4ZFYB 5BYNA 1APNA 4IHZA 3WG2A 4SLIA 2GZBA 2Y9FA 1SBFA 5DZGA 4P0LA 3LCPA 1V6OA 1ILR1 2WT1A 2ZQNA 2YMZA 3IIRA 2X2TA 4YFWA 2GNTA 1AVAC 1VLNA 3JU9A 1CIWA 2PHTA 1N3OA 1JTCA 2CWSA 5F90A 3ENRA 1CQ9A 2Y9WC 3TB0A 4YFZA 1G86A 1LHOA 5F9TA 4H55A 4CZSA 3A4UA 2AAIB 4QKSA 1QQLA 3AP4A 4FGFA 4FPHA 3FBYA 3A07A 2BEBA 4OZXA 1DQ4A 2E51A 4JCKA 1MC9A 1QKQA 3ZC9A 3N35A 2YROA 4FPFA 5T5JA 1TIEA 1FATA 4FPOB 1GKBA 3ZVXA 1PZ8A 2NMNA 5EWSA 4XILA 5F5QA 3IM7A 4BLIA 2JKBA 3N7MA 3Q9OA 2LIEA 4CRQA 2ZGUA 2A6VA 4KEJA 3V65A 2CWMA 2SLIA 4TZDA 2UWCA 4Q9PA 5JMCA 5JOYA 1CONA 3B00A 4GKYA 4PQ9A 2ZGPA 1MS8A 3WINA 3NJ5A 4PF5A 5JOWA 2DS0A 1RINA 5GLZA 5GLUA 3N0KA 1XZZA 2DUPA 4Y1XA 3M3CA 3N36A 4HR6C 5EYYA 1YO8A 1ZM1A 1WBAA 3VSFA 1JLXA 4GAIA 3VKMA 4I37A 3AZVA 3CRIA 2HW9A 1BA7A 4PBPA 4YG3A 3UJQA 3CA5A 1IILA 2LALA 3OBRA 5F8WA 2DVBA 2K8RA 4LBOA 3NV1A 4C1XA 4XJ9A 5H9PA 2VLCA 3FJJA 2WKKA 2ZACA 1GBGA 1LOFA 3P6JA 4LO8B 1ULEA 4BPZA 1SR4C 3E8LC 1WLDA 4RA0A 4EFRA 1BFFA 3AZZA 2ERMA 4AVVA 3ZXLA 3Q7XA 3B9CA 1FNZA 1LOFC 4JC1A 5I1BA 4I7IA 2YV8A 2QN4A 2GN3A 3N7KA 1DZQA 1V00A 2PHWA 3MW3A 2A75A 3NWKA 1AJKA 4W65A 2D1ZA 4XBLA 2ZZJA 4H04A 3NBNA 1ENSA 1LHVA 5HCFA 4Q8KA 3VT2A 4OWKA 5T52A 3BX1C 1Z4SA 3M1HA 3SLIA 3CU1B 3FLPA 2AUYA 3LLPA 1Q56A 1W6MA 1LOEA 1LODA 3AJ5A 1SLBA 4OW4A 3NBEA 1AVBA 2NN8A 3WDWA 1G82A 4GALA 3O0WA 3A22A 2KLLA 1MS0A 1HWNB 3CQAA 2DVGA 3AFKA 2HYKA 4KC3A 3SITA 1ISWA 3O4AA 2UU8A 1LENA 3FJHA 2NVHA 4LBQD 4JKXB 4YW4A 5F8YA 3MEPA 2ZAAA 3OBTA 1LU1A 7I1BA 1ENQA 1V6XA 3FJFA 5FNWA 3V0AA 1W6NA 2DV9A 3I2AA 1AJOA 1JHNA 4IY8A 3TC2A 1Q1UA 2P39A 2P2KA 2IWTB 3S8KA 2VH9A 4GKXA 3VV1A 3WDUA 3IPVB 4AVTA 3ZXGA 1OQ1A 1NXD1 4YW2A 5CB7A 3POWA 4P6AA 2VUAA 3ZSKA 3ILNA 2GN7A 1S0DA 2AREA 3WO2A 3V79C 2MC2A 2F8XC 4K20A 1ITBA 1ZA4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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