1S0EA

Crystal structure of botulinum neurotoxin type b at ph 6.0
Total Genus 407
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
407
sequence length
1290
structure length
1287
Chain Sequence
PVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin, hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type B
publication title Role of metals in the biological activity of Clostridium botulinum neurotoxins
pubmed doi rcsb
total genus 407
structure length 1287
sequence length 1290
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2003-12-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 1s0eA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0eA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1s0eA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 1s0eA01
2LALA 3MALA 1PZZA 3ILAA 4I3NA 2E7QA 1LGCA 4J2XA 3V0BA 1KDMA 3RRDA 1WBAA 5D63A 1MS8A 1DJSB 1Z4SA 3ZC9A 4XE9A 1W6MB 3FBYA 3IM6A 4KS6A 1ZA4A 1GGPB 3D5OA 2W39A 2BFHA 3KMVA 2V73A 4XFSA 4DRVA 3IM7A 1JT7A 2Y9XE 4QO3A 3ZXGA 1LTEA 4UW3A 2R9KB 1J1TA 3O4AA 1NXD1 1JOJA 4FVVA 1FV3A 4DFSA 1A78A 2FGFA 2FFUA 4GAIA 4WVVA 4IY8A 1KRIA 3CQAA 2JKBA 3A21A 1WUVA 5DUUA 3BOPA 5T5PA 3O5WB 1W6PB 4GP0A 3O44A 3K3QB 1QKQA 1CR7A 1V6XA 4PCRA 3MW4A 3WMVA 3AZYA 5T5OA 2OUJA 3FJCA 1LECA 1SBEA 1AVBA 2PHXA 2ZGOA 1D0HA 3C2UA 1LU2A 1CVSA 2EIGA 2M49A 4BM8A 3BAQA 3NBCA 1DFQA 2ZGRA 2WRYA 5DG1A 1HWMB 1C1FA 2HZ9A 4NOTA 3OJBA 4XXAA 4QKRA 2RHPA 4OEGA 3O0VA 2ZGKA 2P39A 1VCLA 4K21A 5EWSA 2ZGTA 1G9FA 1SLTA 1KITA 3AP9A 4J2KA 3M1HA 3LSEA 4I6IA 1AXYA 1BKZA 1IRAX 1WBFA 2NVHA 4BMBA 3M2MA 3W9TA 2ZQOA 2YXSA 2JDZA 3N3HA 2ZACA 3VT2A 1S0IA 4IQPA 2D6PA 1HCEA 1SLIA 1JBCA 1P63A 1UZZA 1XHBA 3AYAA 1PZ7A 2CNAA 2PHTA 1JT4A 1M2TB 4GOYA 4OWJA 2CL2A 1MC9A 3B01A 4FOWA 2VSAA 3O4BA 1PZ9A 4AN7B 2P23A 1UL9A 3PHZA 5G00A 3AZWA 4Q27A 2E4MA 5FZUA 1BARA 1HLCA 3AKFA 2GNDA 2OW4A 3WDYA 5T52A 3BAGA 4XJWA 1QOOA 4J1LA 2FFVA 2FPQA 3A07A 3ZUQA 3DGTA 3LSDA 2WQZC 3WO3A 2R1DA 4Q26A 2K8RA 2ZR1B 4HJJA 4Y1XA 1Z0HA 4HA2A 2BQPA 4LO0C 4ENDA 1IS4A 1Q8QA 1W0OA 3V65A 4XIKA 1LHWA 2VXRA 4AGVA 5DUWA 1YRZA 4H55A 2KI6B 4JC1A 5IK7A 2P2KA 1Q04A 1ISVA 1W3FA 2JE7A 1BFBA 2G7QA 5BOWA 1XTGA 5F8WA 2UWBA 4I4SA 3FGMA 1GBGA 1KNMA 1AX1A 1FN0A 1DFCA 1SZ6B 2QN4A 2P3JA 1SR4A 3RTJB 2AH2A 5GALA 4GAFA 1O4YA 1V6OA 5GAQA 1YBIA 2GNTA 3V0AA 2AAIB 1QXMA 1I1EA 5IK5A 1ILR1 4BPZA 2K4AB 3C9ZA 4BLIA 2DYCA 3D6EA 3ZXLA 3WZ1A 2ZA9A 1BFGA 3A22A 4P9WA 3IPVB 1TTUA 3K1XA 2IMCA 2G7KA 1S1AA 4D0TA 2A71A 3BTAA 4WVWA 1ULGA 2QYIB 2ZMNA 3BOOA 5FZYA 1W6QA 3NBEA 1Q56A 2BEBA 1E1HA 3IN9A 2GN3A 2DREA 3BRDA 4M3CE 3FFZA 4NO4A 4ZFUB 2KM2A 3UJ0A 2VU9A 4R9CA 4IYBA 4ISQA 4I8MA 3POYA 2XHLA 1MS9A 4ZGRB 4ZJXA 3B9UA 1YXWA 1V6WA 3AFKA 1DIWA 1G86A 4P0JA 4OWLA 2ZHNA 3WG3A 1MS4A 4BQ1A 3APBA 3JUTA 3FIIA 4YW1A 1WLDA 1BLDA 4OEEA 1N3QA 3AZZA 1G9AA 3PG0A 2NN8A 6I1BA 4XTPA 4PC4A 2PHRA 1F5FA 3PUBA 5FREA 4YZ2A 4QD2B 1A3KA 2D6LX 5KXBA 3T1LA 1YI7A 1CVNA 4A7ZA 2HWMA 1KQRA 4ZA3B 2Z49A 3B3QE 1TWEA 2XG3A 3FUQA 2ZMKA 3UL2A 1IS5A 4LO0A 2VW1A 4Q9GA 3MPPG 4GXLA 5DUYA 3GALA 3WDVA 2NMNA 4AVVA 4XBQA 3AZVA 1JLXA 3M3QA 3D4KA 1V6IA 3BA7A 3H0OA 5HCBA 3ZYRA 2A6ZA 3O49A 3ZX7A 4Y20B 3ZSKA 1GZWB 3WOGA 3INAA 1F82A 1Q8OA 3WCSA 1IOAA 2ZGLA 1HWPB 4ZKTB 3OYWB 1UAIA 3BRGC 3QW6A 3BA5A 4Q9PA 1DQ0A 2CYFA 4Q91A 1OKQA 4U2AA 1MACA 3FJJA 3ZUSA 5CA6A 5GLVA 2YMZA 1IKQA 1LESA 1LU1A 3O12A 1DYKA 2WT0A 3FJAA 4X39A 3Q7YA 3O0XA 4QBCA 1V6LA 4YFZA 3VKLA 1AXKA 1QDCA 5L73A 1HWNB 4USPA 1GYKA 1PUUB 5H9SA 1WLWA 1UN1A 4JAWA 1S0FA 4YG3A 4TZDA 4P0KA 2ZABA 2GMMA 5GZFA 3AX4A 2VW2A 4I0YA 1HKDA 1XG6A 4AWDA 2C5DA 1IILA 2D44A 4CZSA 2R49A 1W6MA 1HCDA 3NJ5A 3A0NA 2R16A 2WT2A 4KUFA 2X2SA 3QJ0A 2GMPA 1NZKA 2SBAA 1DQ1A 1DZDA 1LGNA 5GZDA 3IMNA 4Z8BA 8I1BA 3IKWA 4XXPA 4FGFA 3D3XA 2D7IA 5EG6C 4IZEA 4R9AA 2ET2A 3T2TA 5GLWA 1R1ZA 3R05A 3AYCA 1QMJA 3QW7A 4YW2A 4WBCA 5HPZA 5DSSB 4KTXA 3CRHA 2JECA 1S0GA 4ASMB 2A6VA 5F90A 2WNEA 3C8BA 4D8HA 4JP0A 2Y9GA 1II4A 1V6UA 4XILA 3VV1A 3Q9OA 3HR9A 3AP4A 2JJ6A 1FGAA 4RL7A 4Z8SB 5EC5A 4XMAA 5GM0A 2ERFA 2ZGNA 1RINA 1VIWB 3BAOA 3FLPA 1JW6A 4YW4A 3SH3A 1AX0A 1JY0A 1H9WA 5GLTA 2IMAA 4FPOB 5JOZA 2CTVA 1WW6A 3VUOA 4I7IA 4MYEA 2GDFA 4JCKA 5AVAA 1FX5A 1Z78A 5IT6A 3OY8B 1IJTA 3FJ8A 3AKIA 3HSMA 4GP3A 2JE9A 2WSVA 2A3WA 3CU1B 2D7FA 4P0LA 1ULCA 3L2YA 3HN1A 3QIYA 3ZXJA 1QF3A 1MVEA 3WMUA 3BX1C 5BQMB 1RITA 1MS3A 2VLCA 2WLQA 3TC2A 4LBKA 3UJQA 1FATA 1WBCA 2IMBA 4CJMA 1LHUA 2P34A 1HDKA 4FPYA 4XJ9A 3QIXA 3PMEA 5F9TA 3NF3A 2ZAAA 4LO1C 3USUA 1OFSA 1V6VA 1MVQA 3DS9A 5EYYA 1QOTA 1MS0A 4PQ9A 1WCSA 4XJUA 4LO2C 1BJQA 4XYXA 4G9NA 4ELCA 2FO1A 1ONKB 4GALA 3OJVA 4I30A 1TFMB 2D7RA 4FP3A 4R9BA 3Q7WA 3BOKA 5DZFA 2ZQNA 5JVVA 3H6RA 4FQZA 3FJ9A 5HCAA 4OW4A 4LO7B 3AK0A 2AREA 3DSEA 4USOA 2E51A 1RZOB 5DZEA 3WV6A 3VKFC 3T8SA 3ATGA 5D61A 4X37A 4XJAA 3IIRA 2HWAA 2HW9A 3A23A 4I4UA 2A97A 2SLIA 5BXTA 4GKXA 2E7TA 1Q03A 1BQPA 2R1BA 4YGEA 1DQ2A 4KC3A 3B9CA 2MLLB 2UUSA 1LEMA 1JTCA 3SLIA 1K5VA 3N7LA 1ISXA 4Q8KA 2W2DA 1DGLA 1NUNA 2A3YA 1PC8B 2ERMA 5BP5C 1JUIA 4K1YA 3NV3A 2ZGMA 1ZL5A 2LTNA 3V0BB 3AKHA 3WUCA 4GOVA 3QLQA 2EXJA 4XMIA 2EAKA 3LCPA 4XHBA 3DDBA 4HEVA 1UZYA 1G7YA 4Y1UA 3M3CA 3C88A 3N35A 1RY7A 1QNWA 1Q8VA 2NTDA 3BB2A 4LBLA 1FNZA 3BRFA 1EYLA 1APNA 1DQOA 2WBCA 2D23A 3F62B 2R0HA 5GJ6A 1AVXB 1FWVA 4PBPA 4FPGA 2DRYA 2ZGSA 3MW2A 3MW3A 3UJOA 3RTIB 4LBMA 1SLLA 3WG1A 3A0KA 1ITBA 1AFCA 1URXA 2KLLA 2ISEA 2GN7A 3WO2A 1VLNA 3W58A 4JKQA 1HQLA 4U36A 3OJ2A 5F8YA 3V79C 2V5YA 1R8NA 5E88A 1B09A 1V6KA 1V6MA 1BXHA 2UU8A 3WDUA 3AH1A 4H9WA 4ZLBB 3QIZA 4M00A 4J23B 4LO1A 3ZVXA 1AZDA 5F8SA 4WZFA 3KQRA 4GWNA 1HKNA 4LBQA 1BA7A 2RG9B 4UW5A 1HQWA 2KI4A 3IM0A 4LO2A 1NLSA 4YW3A 1ENRA 2RQ9A 3FJEA 1H9PA 1DBNA 3CA4A 3O5SA 3I2XA 4A7YA 3CA6A 2WSUA 2B7YA 3AP7A 4CRQA 1EV2A 2EF6A 4HL0A 3ZC8A 2EXIA 5BXSA 1AXZA 3ZSMA 4Q2FA 1MD6A 1QQKA 2DVFA 2DUOA 3POKA 4SLIA 5FZZA 1ONAA 2A8AA 5D62A 2ZMLA 1BASA 3U4XA 2RSTA 3I4IA 1BZWA 1LOGA 1LHOA 2DTYA 2D6MA 1QOSA 3OGFA 3CA5A 5BP5A 4YOLA 3WINC 2AUYA 2TEPA 4DQAA 2YZ4A 5DZGA 2R0FA 2F2FC 5JLVA 2GO2A 1CJPA 1JXNA 4EJ5A 3POSA 2XB6C 3ILNA 3FJDA 3UJ4A 4F83A 3BAVA 4FOVA 2D3RA 5BXRA 3SITA 4TLPA 2DVGA 4L4IA 3ILRA 2Z42A 5BYNA 3WDXA 3ZXEA 3AJYA 2KH2A 2DUPA 2ZHMA 3VT0A 2VW0A 1WBLA 1ISYA 1MZ5A 2W08A 4IHZA 4DENA 2PHWA 5T54A 4HANA 4EL4A 5FRAA 4UW6A 21BIA 3PVEA 4G6MA 4Y26A 2NYYA 3ZXDA 4ZXKA 3MEPA 3OGGA 3N7KA 2ARBA 1W3GA 3UDAA 1VALA 5T5LA 4Z9WB 5KXCA 2A6YA 2ILPA 1WW4A 4M3CA 4I2SA 1L2HA 5KXDA 1DQ5A 5T55A 3NBNA 4XZPA 3C89A 3RSJA 4AVSA 5H9PA 1YF8B 4YW5A 3QW5A 1SFYA 2D6KA 3QCWA 2AENA 3HBWA 2UWCA 4BLJA 9ILBA 2DVAA 4AGRA 2DU1A 3BADA 3IAGC 1W6QB 5KXEA 3WG2A 4BOWA 3AP6A 1SLAA 4AYUA 4G6JA 1ZKXA 2WKKA 3BA4A 2GZBA 4FPKA 2DS0A 3FLRA 3WNXA 1JT5A 4Y22A 4GKYA 2XHLB 3RMYA 4LO3C 5E89A 1O4ZA 3LLPA 2DUQA 5EYXA 3BWIA 1IOBA 3WG4A 1ENSA 2ZHKA 1DLLA 2ZGPA 4P6AA 2VH9A 4FOQA 1HWOB 2OVUA 1G9BA 2D1ZA 4I4QA 4ZOTA 41BIA 2FMDA 4J2SA 1WD4A 4I1BA 4ATEA 4G9MA 1OQ1A 3VT1A 3AXEA 4XJZA 2A5ZA 4XJ8A 1JN2P 2GMEA 2ETFA 5SV8A 2UWAA 5CAZA 5IK4A 1N1VA 1JHNA 3CRGA 3AYDA 5T50A 4XTMA 4YM0A 3WINA 5F5QA 5H9QA 1EVTA 1IS3A 1D2SA 4DS0A 2F2FA 3ENRA 4EKXB 4JKXB 1W6PA 5DZUA 3ILFA 4K1ZA 1UX6A 3FJIA 4CTEA 3VWCA 1GANA 3WO4A 1T9FA 1MR5A 4LBJA 1QNYA 5BQNA 2E53A 4KEJA 1UMZA 2FDBM 3BONA 4IONA 1AVAC 4KEKA 2CY6A 1WLCA 2A6XA 3N36A 2J3PA 3BAHA 4D69A 3O4DA 4XIOA 4I4XA 5B2HA 5BXPA 1T3AA 1EPWA 1AX2A 4X38A 1M16A 2DVBA 1W3AA 2E6VA 3RQ0A 1LOCA 1T3CA 2A70A 1JT3A 2OUHA 1ZKWA 2Z48A 4YZ4A 2ZKNA 1AJOA 4ATFA 3UD7A 1KJRA 1ULFA 3JU9A 1ULEA 3D7WB 3S8KA 1LENA 5DG2A 1GLHA 1IS6A 1UPSA 4YM2A 3POWA 1N1TA 2ARXA 2Q3NB 2G7PA 3KM5A 2KKIA 4YM3A 3AJ5A 3RMXA 1C4RA 4Y24A 4RA0A 4YG6A 2D20A 1XQNA 3SH5A 4C1XA 2K43A 2I1BA 4QD2C 4M3CF 1TOOA 2UURA 4LO3A 4LO8B 1WW7A 2NM1A 1W6OB 2X2TA 1DQ4A 1V6JA 3AJ6A 4P9XA 4FOYA 1CESA 1Q1UA 2L5XA 1AF9A 4FPJA 3R4UA 1SR4C 2W52A 4OWKA 1Q8PA 2ENRA 1ULDA 1F31A 2ZBJA 4YZ3A 1ZL6A 3ZPYA 2C9AA 3IM5A 4I4VA 3FJKA 4KEIA 5E8AA 2DURA 3DEBA 3N7JA 3AP5A 3VKNA 3CNAA 4XOGA 1F9KA 4DCKC 3I29B 3NV4A 5CNAA 4I96A 3T1MA 5FNWA 4F34A 1S0DA 2WT1A 3PVNA 2LIEA 3ZSJA 3M3EA 1IT0A 1W6NB 1FWUA 4I1EA 1SLCA 3UD9A 3QR5A 4I4PA 1GKBA 4FPEA 3FUOA 2MC2A 4IY9A 2P3KA 1C57A 1LOFC 1ISWA 1C1LA 1S0CA 5JMCA 3O4OA 3ZXFA 3SNMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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