3ZX7A

Complex of lysenin with phosphocholine
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
296
structure length
296
Chain Sequence
AEGYEQIEVDVVAVWKEGYVYENRGSTSVDQKITITKGMKNVNSETRTVTATHSIGSTISTGDAFEIGSVEVSYSHSHEESQVSMTETEVYESKVIEHTITIPPTSKFTRWQLNADVGGADIEYMYLIDEVTPIGGTQSIPQVITSRAKIIVGRQIILGKTEIRIKHAERKEYMTVVSRKSWPAATLGHSKLFKFVLYEDWGGFRIKTLNTMYSGYEYAYSSDQGGIYFDQGTDNPKQRWAINKSLPLRHGDVVTFMNKYFTRSGLCYDDGPATNVYCLDKREDKWILEVVGLVPR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Toxin
molecule keywords LYSENIN
publication title Structures of Lysenin Reveal a Shared Evolutionary Origin for Pore-Forming Proteins and its Mode of Sphingomyelin Recognition.
pubmed doi rcsb
source organism Eisenia fetida
total genus 57
structure length 296
sequence length 296
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-08-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.980 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3zx7A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3zx7A02
3HALA 3O3QA 2LIEA 3WINC 1WBCA 3BADA 2KKIA 2XOAA 3BRFA 1AXMA 1BASA 3OBRA 3V0AA 1YTOA 4LO0C 4GAIA 2VSEA 3S8JA 3VSZA 3B9UA 3CRHA 2D43A 1EYLA 1DLLA 1QQKA 4DEPA 5BXSA 1PZZA 4I96A 4X3AA 2BFHA 3ZXDA 2AXMA 3FGMA 1VCLA 4XFUA 4HA2A 1FN0A 3Q7YA 2RQ9A 3H6RB 3WINA 1TWEA 3AKHA 4FVVA 3VUOA 5EC5A 4LO0A 1BFFA 3TC2A 2ESUA 4P6AA 1TTUA 2D20A 1EV2A 3WO3A 3H6RA 4ZA3B 4I4PA 1W3AA 2Y9GA 3O4CA 5F8YA 2NTDA 3UJ4A 2FFVA 3FJBA 3BAHA 4IHZA 4JKQA 5B2HA 2D23A 4OWJA 3AKGA 1JTCA 2K4AB 2MIBA 1WD3A 1HWNB 1HKNA 4USPA 3OGGA 3FJKA 4KEJA 4GOVA 3UD9A 4ZKTB 4ZFYB 1D0HA 1HWPB 2NP0A 3AZWA 3PMEA 1IT0A 1IRPA 3H6QA 3FJCA 4I3NA 5I1BA 3O4DA 1JLXA 3P53A 2GO2A 3NBEA 1S0FA 4L4IA 1RZOB 3AKIA 3OGFA 4J2XA 1DIWA 2WRYA 1HWOB 2ZQNA 3CRIA 4XKIA 1OQLB 4J2YA 1RY7A 5E24E 1J0SA 4USOA 2DRYA 1DQGA 5D62A 1AVWB 1TP0A 4FGFA 3AH2A 3OJ2A 3FJAA 3AKFA 1AFCA 4AN6A 3PUBA 4D8HA 4JRAA 1PUMB 1AF9A 3A07A 3BRGC 4JP0A 5G00A 5BP5C 5EHAA 3HMYA 3WO4A 6I1BA 4J2SA 4P0JA 4KEKA 1BARA 1PUUB 2WBCA 5FNWA 4LO3C 4EB2B 4I1EA 4KC3A 3S8KA 3KMVA 3QR5A 2IHOA 1YXWA 1JT5A 2Z49A 2L5XA 3MALA 5FZZA 1BLDA 3CAHA 5EG6C 1CE7B 4QD2B 5F8SA 1XYFA 4Q9GA 3IM5A 2ERMA 3CQAA 3FJJA 4I4SA 4Q9PA 2F2FA 1II4A 3AZVA 4G6MA 1IRAX 4JKXB 1A8DA 1V6UA 2NVHA 3BA4A 3Q7WA 4WBCA 1AVUA 4EFQA 1G9AA 1CVSA 1KNMA 4X38A 3LLPA 4ZFWB 4I4YA 4IY8A 2BEBA 4D0TA 1HWMB 3O49A 4OWLA 1ITBA 4OWKA 4XFTA 1JQZA 3WMUA 4I4QA 3FJEA 4LO1C 3AJ5A 2D44A 3CA5A 1XZZA 1QQLA 2NYYA 1IILA 4I4UA 9ILBA 4Q91A 4KBBA 3RTIB 2IWTB 3O4AA 1SZ6B 3BAUA 4LO1A 2VXTI 3UD7A 1WD4A 1BFBA 4GP0A 1JT3A 1NUNA 1FGAA 1N4KA 4IONA 3P6JA 3N0KA 1YYNA 1SR4A 4XFSA 5BOWA 3WA1A 5F8WA 7I1BA 2ET2A 1IHKA 5FZYA 3A23A 4OEEA 2MLLB 1BA7A 1YF8B 2NZ9A 1JY0A 3FFZA 5HPZA 1ISVA 1W3GA 3VT1A 3OJVA 3H6SE 1W3FA 5GAQA 4IZXA 4P0LA 4F83A 4ZGRB 1JT7A 3Q7XA 2GZBA 3ZC9A 3C9ZA 3I2XA 4OW4A 1T9FA 4QO3A 5DSSB 3VSFA 3RSJA 1FV2A 4GP3A 2K43A 4TLPA 2Y9XE 1ISZA 3N7MA 3NJ5A 4L4HA 5BXTA 1E0OA 4YOLA 2FO1A 4I1BA 1K5VA 1ILR1 2VUAA 3CA3A 1I1BA 4X39A 4I7IA 3N7KA 1S0BA 3NBCA 3O5WB 2F8XC 3BAGA 4PC4A 3WMVA 1G9DA 1Q1UA 2LIQA 3CA0A 4X37A 3FJIA 4I8MA 3K1XA 4G9NA 3HSMA 3D7WB 4A7KA 1TWMA 1V6VA 41BIA 3FUOA 4G6JA 3R4UA 3BTAA 1G82A 4LO2A 2FDBM 1DZDA 3CU1B 1F31A 3T8SA 2F2FC 1EPWA 5BVPI 1S0GA 1ISXA 4QD2C 5BXPA 3FJDA 4I6IA 3FJ9A 1ABRB 4LO7B 1FMMS 2YUGA 1DZCA 1NZKA 3PG0A 4ZOTA 1Q03A 1P63A 1TFMB 3CRGA 3ILAA 2UUSA 2FFUA 3I2AA 4QALA 1RG8A 2Z48A 3WO2A 1MC9A 3OBTA 3SNVA 4J23B 1FWVA 1Z0HA 4IYBA 1MD6A 3UD8A 1M16A 3FUQA 5JLVA 5D63A 3QYDA 2Y9WC 1BFCA 2X2SA 1BLAA 5JMCA 4I37A 3BAQA 4F34A 4KEIA 4G9MA 1S0EA 1IOBA 2AAIB 2HWMA 1FQ9A 3CA6A 4JAWA 1PC8B 3R4SA 2KLLA 4QKSA 4J2KA 1SR4C 8I1BA 2KI4A 4IQPA 1I1EA 1FV3A 5DVHA 2RSTA 4OEFA 1V6WA 3MPPG 2Q9XA 3A21A 2X2TA 3FJ8A 4ZFUB 4I4XA 3UJ0A 2D24A 1JLYA 2KI6B 2VSAA 3A22A 3BAVA 1ISWA 3IIRA 2NM1A 21BIA 2Q3NB 2DRZA 4IZEA 3VT2A 3RTJB 4P0KA 4QC4A 3IAGC 3ZXGA 3RMYA 1FMZA 3CA1A 4LO8B 1G9CA 5F90A 1R8OA 2AFGA 3O4BA 1BFGA 5DUYA 2K8RA 2VLCA 3BAOA 4OUJA 5DZUA 4IY9A 1Z2VA 4A7YA 1G9BA 4ISRA 4QBCA 1DQOA 4I2SA 1XHBA 2DS0A 3VWCA 1HIBA 3O44A 4G1RA 3RMXA 2QN4A 4II0A 1JT4A 1DJSB 2P39A 3V79C 5FZUA 4D0ZA 2Y9FA 3JUTA 4DCKC 4ISQA 1AVXB 1Q04A 4JQ0A 4Z8SB 1ONKB 1S0DA 4R6UB 3FJFA 4JPZA 1HCDA 3VEQA 4LO2C 2J3PA 2DREA 2RG9B 4EFRA 5BXRA 1V6XA 3CA4A 3HBWA 3F62B 2HZ9A 4A7ZA 2ZQOA 3AJ6A 4QKRA 4ZBVB 1YBIA 2MC2A 1M2TB 3IM7A 2AQZA 3POKA 4LO7C 4I0YA 4EFPA 3ZC8A 2KH2A 2VXRA 3LTQA 4I4OA 2E4MC 3AH4A 2BEAA 4HJJA 1WBAA 2R9KB 31BIA 1EVTA 2FGFA 1UPSA 3P6IA 1ISYA 3NBDA 3ZX7A 3BA7A 3N7LA 4CJMA 4OEGA 4HR6C 1R8NA 3F1RA 1K5UA 4AN7B 1DFCA 2D7IA 4Z9WB 3VT0A 1TIEA 3BA5A 3IM6A 4ENDA 1DFQA 4I4RA 3HOMA 2E4MA 4H9WA 3BX1C 4DENA 3EF2A 3OJMA 5BQUC 3W9TA 3BRDA 1TOOA 2ZR1B 3AH1A 4GAFA 4I4VA 1S0LA 3JRRA 1IJTA 2HWAA 2HW9A 5FNXA 2I1BA 5BP5A 1T4QA 1QXMA 3PHZA 1S0CA 2D7RA 3FJHA 1AVAC 3O4OA 4EKXB 3V0BB 1PWAA 2D22A 1XG6A 2M49A 1Z4SA 3HN1A 2P23A 5BQUA 3NBNA 3E8LC 1GGPB 4LO3A 4GOYA 4EEEB 2D1ZA 1L2HA 4ZLBB 5D61A 4H04A 2VU9A 2QYIB 1RMLA 3V0BA 4QBVA 3V0AB 3I29B 3BB2A 1FWUA 3N7JA 1HCEA 3UDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1W6NB 1VBE1 2JG8B 3JQXA 4RR3B 3ITQA 2KKIA 3BRFA 1LJ7A 4IEWA 3AP5A 1TNRA 3JXSA 4CE8A 4FFGA 3V0AA 1AXMA 1H9WA 2EICA 3PTRB 2QJVA 1AL23 2WWUA 3VSZA 1AL0G 2AEZA 2JE8A 3I4IA 1LESA 1JYCA 1RUH3 1OA2A 2WFF3 2FCTA 1RHI3 1VBA2 2W91A 2WR9A 4IV1C 2DTWA 5FZCA 4I96A 1NXMA 2VBPA 3FGMA 1VCLA 4XFUA 4AL9A 2ZMLA 4QXBA 4HA2A 3OD0A 1O6UA 3J8F3 4D8MA 1QF3A 2O0OA 5T54A 1UCXA 3O1MA 5A7OA 2WIIB 1XU1A 3RGBA 2YPDA 3WINA 3E6CC 1F4AA 3H7JA 4FVVA 1RITA 4I30A 4IV1B 5A32B 3AKHA 2IZWA 2A73B 2ZGUA 4LO0A 3ELNA 1RUJ2 2NQYA 5CFCA 2ESUA 1ZA7A 1TTUA 3KMHA 3VD3A 2D20A 3LE0A 3LFMA 5C9AB 2IFWA 3K4ZA 2BOJA 1OF4A 4K3UA 4N7UA 1EV13 2HJIA 2GN7A 1R093 2P6HA 4FI9A 5F5QA 2Y9GA 2WYSA 4Y22A 4NHXA 2CNAA 2WNVA 4MZUA 1YI7A 3R6SA 1OLQA 4IHZA 4YZ1A 4K1ZA 2D23A 1PO22 4MVTA 3NKGA 5CFDB 5C71A 2I45A 1J83A 3AKTA 1UY4A 4YG0A 4I09A 1JTCA 1WD3A 2WWSA 2BGPA 3PMSA 4USPA 5FUNA 2C1FA 4QKDA 2P3IA 1BBT1 3OTFA 4ZKTB 3H0OA 1PO21 4PIYA 4ZFYB 5KHKA 1D0HA 4LKFA 5JR2A 2XL9A 5IUQA 3PUSA 2C9AA 3USSA 4AW7A 2FHRA 3CHXA 1GLHA 1GKBA 1WLCA 2JKXA 4HN1A 4KNCA 1RTVA 5LA9A 4AFAA 4XAEA 3KGLA 5FZDA 5I1BA 4MHRA 1UN1A 2IXLA 3DXUA 4HK9A 4R9BA 1IZ3A 2DBIA 3P53A 5EZWA 2OUHA 3MUZ1 1HJGA 4S2HA 3NBEA 4L4IA 2P2KA 2UURA 3LAGA 3OUIA 2NN8A 2WAOA 5IK7A 3O1TA 3ETQA 4LA2A 3M1HA 1LHUA 3E97A 2OA2A 1HQNA 4XJZA 4J2XA 2VZUA 4Q4W1 3VDDA 5KHGA 3GCWA 2PAMA 1J3QA 4USOA 3KF5A 5FZGA 2DRYA 1DQGA 4MOAA 5DABA 3N9MA 3TRSB 1AVWB 1ZBA3 1AXKA 3AFGA 2E33A 3HBZA 1TP0A 5FYYA 4FGFA 2HEYF 3GJAA 2A70A 2RS33 4JVAA 4L11A 1D7PM 5F6LB 4AN6A 1YHFA 2WABA 3B69A 4LXLA 4D8HA 2A6VA 1RGSA 5F3EA 4QB6A 5I0DA 3O0XA 1DQ0A 1PUMB 1AR93 3AJYA 2IC1A 3EJKA 4Y1XA 2AGSA 4GH4B 1YQ6A 3U07A 3POWA 4XXPA 4YGBA 5FY4A 3VBRC 1UKGA 4XTMA 1US3A 2VZRA 3NNMA 1N1TA 4YYOA 5EHAA 1GZCA 4NO4A 4PF1A 5FMDA 2XQXA 2GP5A 3KLSA 2BJSA 3KV5A 1OUSA 1W6OB 4ORFA 4JKMA 2GNDA 2XKPA 4BIFA 5DMYA 4KEKA 1BARA 2RM23 1PUUB 3PUAA 3VBRB 1BXHA 5K7PA 3W5NA 4LO3C 3OYWA 4KC3A 5CG9A 3QR5A 3B02A 2OKXA 4HPKB 1AR83 1ZZCA 2ARXA 2X29A 5C3QA 3WVJA 3POJA 1V6OA 5C8CB 1OQEA 1Z7S3 3TEYA 3CAHA 1HB1A 1GZWA 3CJIC 4P9LA 3WUDA 2ZZQA 4GIQA 1V9U2 2R1BA 4WM7C 5FYCA 5A7WA 1QJEA 3CQAA 1F5JA 4XFIA 3N9LA 4AFBA 2ZJCA 4CXYA 1TWMA 4FPGA 3FJJA 1DQ5A 1H0BA 3M2MA 1RUI2 2VPVA 1II4A 1UY3A 4OHVA 4I6IA 4QD2A 5BNOC 2Z69A 4CDXC 1FATA 3BA4A 1FPN2 1H8TB 2JKBA 2A6WA 1LHNA 3POIA 5FY0A 1V9U1 4RFT0 1PIV2 3DN7A 4YFZA 1UXZA 4WM7B 1PZ9A 4XVHA 3GBFA 1HWMB 2C0ZA 2WSVA 3U37A 1TFMB 1N1SA 4LK7A 5J36A 3ZYJB 1ZRCA 1OBNA 3SH4A 3WEZA 5BNOB 4PQ9A 1CQ9A 4GQ7A 3FJEA 2ZHNA 4B7EA 4SLIA 3TEWA 1IPSA 2QNKA 2VMDA 5ISLA 1REFA 1DQ4A 1PIV1 2Q1FA 5IVEA 2D6OX 1ND3B 3O7OA 5CFCC 1GU3A 2DBNA 3E6DA 2GNTA 2QQUA 1R1A3 1LGBA 1POV1 4FPOB 5FO8B 5C33A 4I4UA 9ILBA 4KBBA 1GZTA 1CN1A 1ENSA 4CPBA 1DP0A 3FLPA 2IWTB 4E8CA 4HT1T 5FP7A 2JENA 2WNVC 4LIUA 1SZ6B 1ASJ1 3VZNA 4CDUC 2VCBA 5LRRA 4QPGA 1MS8A 2E26A 3LD8A 3S30A 4D0QA 3NV2A 4LO1A 4BOWA 2JJ6A 3LEMA 4FPKA 1HXS3 1WD4A 4LBLA 4XJUA 3WF1A 1UNBA 2DYCA 2ADEA 2BBAA 1DU3D 1H9PA 1FGAA 1N4KA 4CDUB 1RUNA 1RUD2 2PXJA 2I74A 3ASIA 5A6YA 3BI3A 4X6RB 3P6JA 1WW7A 4WVMB 4QWNA 2VUJA 5FZOB 1QQP3 4XQ4A 2XL7A 5BOWA 2ARCA 3MPBA 1SCSA 1YC61 1DQ6A 4GWIA 3AKRA 3AP6A 1QGLA 3K77A 1UQXA 3A23A 1C1FA 3U0ZA 5F2WA 1BA7A 4OEEA 5L9VA 1JY0A 5HPZA 1WMEA 1JHJA 1O5LA 4LKEA 5CEHA 4XILA 4QPYA 5A33A 2QE3A 4MGKE 1VBC3 1WCKA 5T5LA 1KFUL 4ASMB 4ZGRB 5LBCA 4ARXA 1DLCA 4MZGB 1O8PA 5F8PA 3POFA 1LENA 3I7DA 3VDDC 5FMCA 3ZN5A 3GCXA 1X33A 4MADA 2GC2A 2WSUA 1FX5A 3T2TA 1H2MA 3VHOA 3OY8A 3I2OA 2XLFA 1HV0A 3RSJA 3ZFFA 5JSPA 4NRMA 1FV2A 1YQCA 3RDIA 4Z92B 1DQ2A 1QH6A 4L4HA 4R9AA 1UW8A 1ZZ9A 2CL2A 3B9CA 3GZUC 1XC6A 2IXHA 4P9GA 5AVPA 5T55A 1E5SA 4I1BA 2R6QA 5FBZA 3H3ZA 2BV4A 2Y6KA 1HDKA 2VW1A 2WWJA 4XJAA 1C3HA 4OQ8A 1I1BA 3K46A 1OVSA 3MI8A 3RFRA 4EE2A 2HWF3 1D0GA 1RVF3 1ONAA 1QDOA 2K46A 3KVBA 3CIHA 3N9QA 3NBCA 4RQPA 4QKBA 2HWC3 3FX3A 2Z5WA 2VZ1A 3LSEA 4IUGA 5JOZA 1O8SA 3POYA 2J1TA 3T4HB 4CP2A 4YOLA 4ZS2A 3DF0A 1PMHX 2WJSA 4LO5B 3VBHB 3CA0A 1UYYA 3AM2A 1BVVA 4EWDA 3UKTA 5D8AB 2UWAA 2PTMA 4LHLA 3H50A 5IVBA 3R4DB 2ADDA 2A5ZA 1J58A 3D7WB 5F3IA 1V6VA 2XG3A 1VP6A 1JOJA 2Y0OA 4L99A 4RS5B 3U78A 5A6QA 4G6JA 2QQNA 3AP4A 3CU1B 2R043 1SLLA 4QU2A 1LU2A 3WF4A 1GNZA 2RDNA 3I54A 4JKKA 5LB6A 3T2QA 3IPVA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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