3PJQA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase-like inactive isoform (including the natural mutation tyr342his) in complex with lactose
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
635
structure length
626
Chain Sequence
ASLAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAHSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Sugar binding protein
molecule keywords Trans-sialidase
publication title Crystal structure of an enzymatically inactive trans-sialidase-like lectin from Trypanosoma cruzi: the carbohydrate binding mechanism involves residual sialidase activity.
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 171
structure length 626
sequence length 635
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2010-11-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3pjqA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 3pjqA01
5EXOA 2VK5A 2X9MA 4KS3A 2PHRA 1LOCA 1QU0A 4MWRA 2ZGTA 2BZDA 3O12A 4WZFA 3FUQA 3AZWA 3HR9A 5HUNA 1V6IA 3PVOA 4Q26A 5FREA 1LU1A 5E8AA 3SH5A 1LJ7A 1IVFA 3T1MA 5CBLA 5HX0A 4GZWA 1SLIA 1PZ8A 3GVJA 4XMIA 1INFA 2XG3A 4R9DA 3B7EA 4Q1PA 4MJVA 1BQPA 4OZXA 4H53A 1S0DA 2GMMA 4K1ZA 1IS4A 2ZMKA 4MJUA 3ALXA 1IVGA 4FP2A 1CVNA 1MVQA 1PZ7A 3ILRA 4Y22A 4ATEA 2P37A 3IM0A 3ENRA 4GA9A 4GDIA 1W6MA 1FV3A 4B7JA 4DPNA 3B01A 5IUQA 1NNAA 1L7FA 2B7YA 5DZFA 4GWMA 3VV1A 1LOEA 1NCBN 2RHPA 2ZKNA 2A6XA 4SLIA 2A3YA 5HCFA 3R4UA 1E8UA 3INBA 1WD4A 2ZGPA 3UJQA 2WKKA 2WNEA 4DRVA 4Y26A 3Q9OA 4AGGA 1G9FA 3SLIA 1IS3A 2W20A 4YFWA 3B00A 1DBNA 1B9SA 4C1XA 5HUMA 1AXKA 5IK5A 1U0AA 2AYHA 3AP4A 1NNBA 1FV2A 5DUWA 1CONA 1SO7A 4CPLA 2HT5A 2R1BA 3ZYRA 1S0EA 2GMEA 2UWBA 2QWAA 1A8DA 4X4AA 3D5OA 1V00A 1WW5A 5L73A 4XJ9A 2SILA 5T52A 4FP3A 1UZYA 3D11A 1YRZA 2YDTA 2A70A 2EAKA 1WW6A 1AX2A 4DS0A 1V6OA 4UW5A 1SCRA 2OUJA 1N1TA 1RIRA 3ILFA 3TI3A 5GM0A 1TEIA 5GLUA 2E7QA 2YMZA 1A78A 4GJTA 2PHTA 4TZDA 4AWDA 1LHOA 4WVVA 1APNA 3SALA 1W6PA 2W52A 5DG2A 4YM3A 4L8QA 3O0XA 1JYCA 2RKCA 2ZHMA 3WG3A 3K39A 2P3KA 3O9KA 5H9RA 4PCRA 1S0GA 3V0AA 4LBQA 4YGBA 3ZPYA 4X6KA 1VAVA 3H73A 2ZA9A 3AXDA 2VVZA 1C4RA 1UAIA 3N3HA 3K38A 5JLVA 3OPZA 1GZWA 1W21A 1IS6A 3ZSJA 5FRAA 4BLJA 4D8SA 3SH4A 5GJ6A 4FPJA 1NCCN 1A4GA 1Z78A 4RA0A 4UW4A 1KJRA 1CPNA 2EXHA 2XZJA 2W38A 4XIOA 2JKBA 2VUAA 4LBMA 1G9BA 1V3BA 1QDCA 4DGRA 4XJWA 2AUYA 1NN2A 1W6OB 2GNBA 1DIMA 3T1LA 4D69A 2VW1A 5IK4A 2UWAA 3AYDA 1MZ5A 4YW3A 4ISRA 1V3DA 2QWGA 2CMLA 1YI7A 2HYKA 2AENA 1LOAA 1NXD1 3N35A 2VW2A 3PVEA 1SCSA 2PHUA 4FVVA 2DWRA 3RS6A 4HL0A 3NV1A 1AZDA 2E51A 2PHWA 4BLIA 1V6KA 1RITA 1ULGA 3ZSMA 3MPPG 3WZ1A 4Y22B 3CYEA 1LOGA 1NMBN 1AX1A 3OGGA 1W6MB 1N1VA 1B09A 3OYWA 3AZXA 2QWCA 2CY6A 2A3WA 4PBPA 4Q2FA 2SBAA 4NO4A 1IS5A 1G8WA 3V65A 4PQ9A 4JCKA 4GDJA 1DQ2A 3DGTA 2H0BA 3N7KA 1SLTA 1UMZA 4XJZA 4YLZA 3ILNA 4YG0A 1AXYA 2W5NA 2P34A 2QWJA 3WCSA 2JD4A 2FHRA 4UW6A 3PVNA 2D6PA 2V5YA 2ZGQA 5GLZA 4K1HA 5GZGA 1WCSA 2VSMA 2ZBJA 1IVCA 1V3CA 4FPFA 1VALA 4QN6A 2CTVA 2R1DA 3JU4A 2R16A 2ARXA 1PZ9A 2ZB5A 3PMEA 5B2CA 2E53A 4PF5A 1MVEA 5T54A 4FZHA 1F8BA 5CAZA 3WLUA 2V73A 3N36A 4K3YA 3AJYA 2CYFA 1X50A 5GALA 4XYXA 1G9AA 1VCUA 1JOJA 1H30A 4HZXA 1QKQA 3AJZA 1R1ZA 2A6YA 4K20A 4YZ1A 2ZHKA 1SLAA 1BJQA 4QN5A 5H9PA 1NLSA 1S1AA 3O0WA 3FLTA 3I4IA 2DU1A 1EPWA 1L7HA 2NM1A 2I2SA 2HT7A 5JOXA 4UF7A 2C4LA 1ULEA 4U2AA 4UW3A 3B9CA 4NOTA 1NSBA 1MS4A 2AGSA 2D43A 1DQ0A 1W6PB 2HTQA 3APBA 2VK6A 1GNZA 2DVDA 2YA5A 2QWHA 1QMJA 3POYA 3AYCA 3SILA 4Y20A 5T5OA 2ZB6A 1GBGA 2QWKA 4M3CB 3V0AB 3A71A 1Q8QA 4XXPA 1GZWB 3AP9A 7NN9A 4YGDA 4YW4A 4K1KA 1D0HA 1Z4XA 4XZPA 2PELA 1N1SA 3AFKA 3SITA 1YO8A 5JOWA 2A6WA 4IQPA 5F5QA 4XMAA 2E6VA 1CJPA 1NSCA 4XHXA 2D6LX 1ULDA 2A5ZA 3OBTA 1JYIA 2LALA 2WT1A 1G9DA 2VK7A 2EALA 2YV8A 2OUHA 1VLNA 1AF9A 4CPZA 2A75A 2ZHLA 5GZCA 2WSUA 2ZZJA 4M3CF 4P14A 1LHUA 1I1EA 1DYPA 4ZXKA 3WDWA 1DIWA 3MW3A 5GLWA 4M01A 1KDKA 2NN8A 3IKWA 3TB0A 4FJ6A 4BQ1A 3AZVA 4GKYA 1W8OA 3VKLA 5M1ZA 4KS4A 3RRDA 1LOFA 2VW0A 1DQ5A 3R4SA 3AXEA 3SNMA 3CL2A 1JW6A 1G86A 5IK8A 2FMDA 4XBLA 5E88A 4ZKTB 1USXA 5DUXA 2F0ZA 4K1YA 5LK5A 3BOPA 2CNAA 3WVJA 4NN9A 1MWEA 4MWXA 4B7QA 2F10A 3WCRA 4YG3A 4Y1VA 4Z8BA 5JOZA 2VSKA 3LSDA 4FPOB 2A3XA 4Y1XA 4FQZA 1BKZA 5GLTA 4B7MA 1LULA 2EXIA 2F13A 2EXKA 2AH2A 2UWCA 1SLBA 4R9BA 5KXEA 2QWBA 3BEQA 5CNAA 2ARBA 3B69A 1DQ4A 5HUGA 1URXA 3ASIA 4LBQD 3SISA 3K3AA 1B9TA 1WCQA 3FFZA 3WG4A 4AVVA 4FPGA 4GZSA 3OY8A 3NV3A 1Z4WA 1CQ9A 4GKXA 3TIAA 4XBNA 4FOQA 4BMBA 3WG2A 3WV6A 2CWSA 3HN1A 4X47A 1CN1A 3UJOA 1MS9A 3T1EA 4HZWA 1LODA 2BF6A 2DVGA 3OBRA 2YROA 1IVEA 3GALA 4LBJA 2D3PA 1KRIA 3K37A 3A0NA 1ENQA 1W0OA 1EUUA 1HQWA 1G7YA 4XDQA 3QLQA 1I3HA 2ZAAA 2WLQA 1F8CA 3VKFC 4YM0A 2ZGNA 1N3OA 1SNTA 1JBCA 1Z4ZA 2W08A 4K1IA 4WVWA 3H72A 4MWQA 1DQ1A 3M3OA 4CRQA 3N7MA 1CPMA 4GZXA 1C1FA 2F24A 1LHWA 3V0BA 3V64A 1BXHA 1XOEA 3ZSKA 2JJ6A 1XQNA 5DG1A 5IK7A 1Q8OA 2QWFA 1ENRA 3O0VA 4YZ2A 1LTEA 5T5JA 3TICA 3JU9A 1SBDA 4YGEA 1V6LA 3CNAA 4KS5A 2D6MA 4CPYA 2QWIA 1XOGA 1CR7A 1DYKA 4QNPA 1YIFA 1IVDA 3RQ0A 2WSVA 4P9WA 3UK9A 5KXDA 3A4UA 2VH9A 4KBBA 3AK0A 1UN1A 2WT2A 2XZKA 1MS3A 2F12A 1MS1A 2D6OX 2GNDA 1ENSA 1UKGA 4Y20B 2YA6A 4W65A 3FUOA 4U36A 2PHXA 1Y7BA 3BIWE 3RMYA 1IKPA 3UL2A 1INHA 1UZZA 1QOOA 1MS8A 1V6JA 2GNMA 1SBFA 4Y24A 4YW2A 1GV9A 2ZGOA 3ZXFA 2W39A 2AEQA 1F5FA 1BYHA 4BBWA 1JXNA 3TI5A 1MS5A 1W6NA 3WDVA 3POWA 2ZGLA 5T5LA 4B7RA 3D6EA 2R0HA 4MWWA 1S0FA 3ALWA 3HMYA 2D3SA 1RINA 2Z42A 2AREA 4FPCA 1D2SA 1Z0HA 2EIGA 1OKQA 4I00A 1FATA 2DUOA 2BATA 4DQAA 1C1LA 1MACA 3D12A 2ZGMA 1DGLA 1AX0A 1A14N 3NV4A 1Z50A 4M3MA 2PHFA 1LCLA 5DXDA 2YZ4A 1KITA 1F8EA 2YXSA 4CTEA 3TI6A 1J1TA 1NCAN 4H55A 1IVBA 1FNYA 1VAMA 4ATFA 4ISQA 4CPNA 5EWSA 4WEFA 1MS0A 4Q1RA 2NYYA 2A7AA 3ZXJA 5NN9A 1INYA 4R9AA 4YZ5A 1JUIA 1OFSA 3ZVXA 4LBKA 4MX0A 2YA8A 4CPMA 1Q8SA 1V6MA 5JMCA 3LCPA 4NCSA 2R0FA 1WW4A 1EURA 5GZFA 3MW4A 4WV8A 5H9QA 1V0ZA 3BODA 3WUCA 4NC5A 4YZ4A 2BQPA 3WOGA 5DZEA 3AZYA 2LTNA 4GZTA 3OY8B 2W68A 1QF3A 1LGCA 3AP5A 2ZABA 4MC7A 1INXA 2ZMNA 4FPLA 1N47A 4WA5A 1A4QA 4I30A 5HCAA 2ZACA 2NP0A 1O4YA 4GZOA 2NZ9A 3OJBA 1L7GA 2W5OA 2DU0A 1GLHA 3NV2A 4FOYA 1DHKB 3ZYPA 4M3CE 2VU9A 1QOSA 1WUVA 3I8TA 2CWMA 4JC1A 1GANA 3NWKA 4YW1A 3AP7A 4XILA 1FAYA 1LHVA 2GN7A 2DURA 4YM1A 3VUOA 3W59A 4X49A 4KS2A 2ES3A 1HQLA 4PBOA 1WBLA 1WLWA 1ULCA 2C9AA 1G9CA 3WNXA 3GNEA 4MWVA 1SBEA 1EUSA 4Q27A 3V0BB 4K21A 4Q8KA 1N3QA 4LBQB 3U4XA 4FVKA 5SV8A 5H9SA 4K1JA 1WLCA 4Y1UA 4YM2A 4MWYA 5GZEA 4XXAA 1FYUA 1OQ1A 1Q56A 2P3JA 4BPZA 4HZYA 2HU4A 2D7FA 2A71A 2DUQA 2ZHNA 3VKNA 2VXRA 3H6JA 1B9VA 2C4AA 1WBFA 1S0JA 3D4KA 1GICA 1SACA 1F31A 1LENA 3B3QE 1BZWA 4J9TA 3O9JA 1EUTA 3KQRA 3DUIA 3N7LA 3RMXA 2ZGSA 2F28A 4QN4A 1LOBA 1AJOA 3IMNA 4LBLA 2BERA 5BYNA 1KJLA 2CL2A 2OVUA 2QWDA 3IN9A 3FBYA 2F26A 1NMCA 3H71A 1KDMA 5HUKA 4XTMA 1W6NB 1NSDA 4QN7A 3R05A 4DFSA 2DTYA 4P9XA 1Q8PA 2P3IA 2QWEA 3IPVA 2ZGKA 4LBNA 2JECA 4AVTA 4F83A 2XB6C 4GALA 3POSA 3SANA 2XCYA 2DVFA 3RG0A 2F25A 1ZM1A 2Q5TA 3L2YA 3W09A 2NMOA 3WUDA 3PJQA 3H0OA 2A6VA 1HDKA 2EF6A 1NCDN 2YDPA 3M1HA 3AP6A 4MZEA 3OYWB 3GVLA 3WG1A 5T55A 2EXJA 1LEDA 1AVBA 4HIZA 1F9KA 3WDYA 1QNWA 1W0PA 3NN9A 1DZQA 5EYYA 2DUPA 3WHUA 5DZGA 4MYEA 1DQ6A 4GXLA 2A6ZA 3USUA 4M00A 1GZ9A 3T2TA 1FX5A 5HCBA 1JN2P 5E89A 1Q8VA 3WDUA 4GWNA 3WDTA 4HANA 1W6QA 4AVSA 1LU2A 1KQRA 2ERFA 6NN9A 2HTYA 4Y1YA 4XE9A 3WHTA 1C57A 4HZVA 1ONAA 3FLRA 5F9TA 2ZMLA 2DTWA 2DVBA 4BOWA 2ZGUA 3LSEA 4MWJA 4R9CA 4Q8LA 3M3EA 3N7JA 5JYYA 2DV9A 1LHNA 1O4ZA 2F27A 2HTVA 4XBQA 1NNCA 3ZXKA 1UX6A 4CZSA 3A0KA 3MW2A 3M3CA 3FLPA 1LESA 4BMEA 5B2DA 1JHNA 5T5PA 4ASMB 4M3CA 2JE9A 3ZXEA 4XJRA 5GLVA 3AX4A 2GALA 4MWLA 2HTWA 3MEPA 3M3QA 1WD3A 1GYKA 2F11A 1MZ6A 2E7TA 4XHBA 1INWA 1IOAA 5CB7A 1E8VA 2XZIA 4MZAA 1YYNA 5DUUA 2SIMA 2F29A 1DFQA 1F8DA 5DUVA 3NSSA 2D3RA 3SH3A 4Y1ZA 1IKQA 4WA3A 2JDZA 4BM8A 1ZA4A 1QDOA 3TAYA 1GZCA 2AEPA 4JRAA 1V3EA 4C1WA 1QOTA 1AXZA 4H52A 4TYSA 1GKBA 1V6NA 1A3KA 1NMAN 2YA4A 1LECA 4FPKA 2HU0A 1ULFA 4MWUA 1INGA 2DYCA 1LEMA 4GB1A 2HTRA 5JDBA 1UPSA 4AYUA 4B7NA 4XJQA 1W1XA 3O5SA 3CL0A 4XOGA 1DLLA 3QCWA 2D44A 1DILA 4GZQA 1HLCA 2AR6A 3CKZA 2WQZC 1V0FA 5AVAA 1LGBA 3GVKA 4M4VA 3C2UA 1E8TA 3ZXLA 5IT6A 3AYEA 4Q6KA 1GSLA 1H9PA 4QN3A 2GMPA 4FQ4A 1S0CA 1QGLA 2D6NA 4FOVA 1SLLA 3IPVB 2B8HA 4FPYA 4XJUA 4GZPA 2OW4A 3AZZA 3WDXA 3ZSLA 3K36A 2GNTA 1CIWA 1AJKA 3A72A 3TI8A 1H9WA 2KM2A 1QNYA 2ENRA 2WJSA 3ATGA 5T50A 3M2MA 2NMNA 4XJAA 5KXCA 3KM5A 5KXBA 2JE7A 2UURA 2YY1A 1W20A 4WA4A 4WEGA 2R49A 4DRRA 4YFZA 4LBOA 4GEZA 1YXWA 5CA6A 3BTAA 1LGNA 1W8NA 2UU8A 2HT8A 2G4IA 3TI4A 4RL7A 3W58A 4ITCA 1WW7A 1V2IA 5EYXA 3USUB 4XJ8A 1WLDA 2HTUA 1CESA 4M4UA 1SLCA 2YA7A 2D6KA 2TEPA 3VKMA 4M4NA 2GN3A 4YG6A 2WT0A 4YW5A 1SFYA 1W6QB 1VIWB 1HKDA 2VWDA 5GZDA 3INAA 1MR5A 4YZ3A 4HZZA 1Z4VA 1LOFC 3TIBA 4CPOA 3RSJA 1FNZA 2DVAA 4AGVA 4KS1A 1VCJA 3JUUA 1S0IA 1UL9A 1N1YA 4JF7A 2C5DA 4XTPA 1N3PA 1Z4YA 5JVVA 1INVA 2GDFA 1V0EA 5JOYA 4P9YA 1GNHA 1USRA 2P2KA 4FOWA 2VY0A 4XIKA 1BJIA 3AYAA 2SLIA 4FPHA 4YGCA 2ZGRA 3VKOA 1S0BA 4FPEA 1W6OA 4AGRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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