2AH2A

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with 2,3-difluorosialic acid (covalent intermediate)
Total Genus 188
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
188
sequence length
633
structure length
624
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFDNSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAHM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords trans-sialidase
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase
pubmed doi rcsb
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 188
structure length 624
sequence length 633
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2005-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 2ah2A02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 2ah2A01
1C1LA 4ZKTB 4H53A 3DUIA 1HQLA 5JOYA 3WUDA 3ZXFA 3M2MA 2PHRA 2BZDA 1JUIA 3NV3A 2F28A 2GN7A 5BYNA 2HT7A 1LHUA 1XOGA 2C4AA 4MX0A 3GALA 1L7FA 1DQ1A 1INXA 6NN9A 4XHBA 1B9TA 4LBKA 4MYEA 2DVFA 2AEPA 3AZYA 5JOWA 1BJIA 1DLLA 1V3EA 2QWDA 3IN9A 1GZWA 3R4SA 3M1HA 1IS3A 2P3JA 5EYXA 4FPKA 1LHNA 3OY8A 2EIGA 3VKOA 3W59A 4YW1A 4GA9A 1GYKA 3ZSJA 1IS4A 2ZHLA 4Q26A 4LBLA 1DYKA 1LENA 4GXLA 2E51A 2EAKA 1LOFA 1WCQA 3TI5A 3WG2A 1GNHA 4XTMA 4YZ3A 3O0WA 2JD4A 1LECA 3LSDA 3VKNA 2HYKA 1CPMA 5DUXA 4PF5A 1IVEA 1MS5A 2P34A 4Y1YA 2W68A 1S0BA 2D6NA 3BOPA 2F26A 5KXEA 1V6IA 4Y20A 3OYWB 4DQAA 1LOCA 3BEQA 4YFZA 1W6OA 1I3HA 3A4UA 4GWNA 3FUOA 2RKCA 2R0HA 1QNWA 1Q8SA 2FHRA 2JE7A 2ZGKA 2WQZC 4XJWA 1WLDA 3ZXKA 4GEZA 1UPSA 1C57A 1MZ5A 4KS5A 3SLIA 3O5SA 2YZ4A 4K20A 4AWDA 1LHWA 4LBQB 1SO7A 2YROA 2CL2A 2FMDA 2UWCA 4YZ4A 1SLBA 4X49A 3FLRA 4FP3A 4UW3A 5H9PA 4AYUA 1PZ7A 3VUOA 4FPGA 2VW1A 2ZBJA 1DILA 3M3CA 3RS6A 3N3HA 4WVVA 5T5LA 4MJUA 1E8VA 2GMEA 4K1ZA 4XBLA 1W0OA 3O9JA 3O12A 3K36A 2DTYA 1AX0A 2YA5A 2AGSA 2VUAA 1L7GA 2ZZJA 1QMJA 5KXDA 4AVTA 1GZWB 4FZHA 1FAYA 1OKQA 4K1YA 2DURA 1BXHA 1UN1A 3OY8B 1ULEA 5JDBA 1S0DA 1GZ9A 2YY1A 2WJSA 2GNTA 5GJ6A 1G7YA 1N47A 2DUPA 2YV8A 2A70A 1MS0A 2PHTA 1F9KA 3ZXLA 1NCAN 2ARBA 5IK5A 2JDZA 1GBGA 3AYCA 1LODA 3BODA 1IKPA 1C4RA 1A8DA 5T55A 2ZGMA 1J1TA 4PCRA 4XTPA 5GZCA 4Y26A 3RQ0A 1PZ8A 5IT6A 3R4UA 5DZGA 3SITA 1NSCA 3I8TA 2D6LX 1RITA 1MS9A 2ZB6A 4P9XA 4OZXA 2QWHA 1INWA 4Y22B 5IK4A 5JYYA 1E8TA 4HZYA 5DUWA 1G9CA 1Y7BA 2GNMA 1A4QA 5CNAA 2E53A 1LGNA 1LULA 4XILA 4BBWA 1YIFA 1W1XA 1GLHA 1FX5A 5T5OA 2A6WA 4TZDA 2AH2A 2CMLA 4M3MA 5JMCA 4X6KA 1V2IA 1BZWA 4MWLA 1FNZA 2SBAA 4FPJA 3MEPA 1CPNA 4MZAA 1DQ6A 1LEDA 4MWUA 3IPVB 2YDTA 1NNBA 3B01A 2A7AA 4MZEA 4B7RA 1JN2P 1U0AA 4FPLA 1A78A 2R0FA 3ENRA 4CPOA 3OPZA 3TICA 1BKZA 2A6XA 4WV8A 2QWKA 2CY6A 3V0BA 4HZZA 3TI6A 3H72A 1FYUA 1YRZA 3U4XA 3N7KA 4YM3A 1DHKB 2F25A 4CPLA 4R9CA 1XOEA 1NSDA 3ZXJA 3UJOA 3D12A 2UWAA 4ZXKA 1ENQA 1UZYA 1LOEA 2ZHMA 3VKFC 4YW2A 3WHTA 2F10A 5DZFA 1LOBA 1HDKA 1DZQA 1LHOA 2X9MA 1A3KA 1EUUA 2F11A 2ENRA 4XJRA 1WW4A 2VXRA 2D6MA 1S0FA 1QDOA 1WBLA 1AJOA 5IUQA 3T2TA 4K1JA 4WEFA 2A3XA 2DTWA 3M3EA 3WNXA 3N35A 1KJRA 1NXD1 2Z42A 4YGEA 4FVKA 3D4KA 4WEGA 1LJ7A 1QKQA 3RMXA 3M3QA 3Q9OA 3AJZA 2R16A 2QWIA 2P2KA 2R1BA 2XG3A 2W5OA 2ZA9A 3AZVA 2QWAA 2CYFA 4FOVA 1FATA 1JOJA 3IKWA 2D6OX 5HCFA 4FPOB 1B9VA 3WOGA 2OUHA 2W38A 4XIKA 1W6PB 1INHA 1G9DA 4AGGA 1SACA 4GZXA 1SLTA 4MWVA 1MR5A 2P3IA 4HZVA 3M3OA 4XHXA 2OW4A 4P14A 3ZPYA 2W20A 1VCUA 4L8QA 5GALA 2ZABA 4P9WA 4Q27A 2ZMNA 4DFSA 3OBRA 3SALA 3BIWE 5GLWA 4D69A 4KS4A 2YMZA 2YA4A 4Q2FA 1VCJA 5HCAA 2DVDA 1BJQA 3B3QE 1MS1A 3SISA 1QGLA 2VK7A 3CKZA 3SH5A 2CWMA 1W8OA 2GNDA 3WG1A 3WUCA 2EXHA 2DUOA 4BQ1A 4Y1XA 4J9TA 4YM2A 1N1SA 1USXA 4HZXA 4UF7A 2WT0A 4U36A 1HKDA 1Q8PA 4FJ6A 4LBJA 1SBEA 2HU4A 1AVBA 3D5OA 5FREA 4XDQA 5EXOA 3V0AA 2HT5A 4GZQA 1N1TA 2G4IA 2AREA 1V0EA 2CTVA 2A75A 4GALA 2NZ9A 1JYCA 2HTUA 5B2DA 1LU2A 5FRAA 4K21A 3WDVA 2CNAA 5GLVA 4KS2A 4GKYA 4NCSA 1JXNA 1SBDA 4M4NA 1QOSA 2VVZA 2ZB5A 2AEQA 1AXZA 2SLIA 4XMIA 1WW5A 2GDFA 2VY0A 3WG4A 2XZIA 4D8SA 4MWRA 4YZ5A 3WG3A 5JLVA 1USRA 1V3CA 1YI7A 1RIRA 2WSVA 2ZGTA 4XXPA 4HIZA 2V5YA 1QU0A 1JHNA 4F83A 4K1IA 1QNYA 5HUNA 4I00A 4ITCA 4DRRA 5HUGA 1SNTA 5DZEA 4CTEA 4XIOA 2PHWA 2D44A 2Q5TA 1Q8QA 4FOWA 3TI4A 4B7MA 1YXWA 3IMNA 3O0VA 4PQ9A 3W58A 1G9BA 1INGA 5DUVA 1N3PA 1VIWB 4BMBA 4K3YA 4CPYA 3N7MA 5JOXA 3WDUA 2BERA 1QDCA 3N7JA 1MACA 1UMZA 3MW2A 1NMAN 2ERFA 1IVGA 4WA5A 2D6KA 5GLUA 2V73A 4XJ9A 5JVVA 1KDMA 3W09A 1F8CA 2A71A 5KXCA 4YM1A 2AYHA 3N7LA 2HT8A 3QCWA 3ZVXA 4YFWA 2D7FA 2YA7A 3WVJA 1H30A 4XJZA 1EUTA 1W6MA 5JOZA 4HANA 1W20A 1N3OA 1W6NA 1F5FA 2F13A 4MWYA 1NCDN 2ZGPA 5SV8A 2QWFA 3KM5A 4XJQA 5HCBA 4ATEA 1WBFA 2NMNA 4UW5A 1RINA 1ULCA 4DRVA 2R49A 3MW3A 2EF6A 3RSJA 2XCYA 1AX2A 1LCLA 4WA3A 3WLUA 1GANA 2ZHKA 4XBQA 1X50A 4CZSA 1EUSA 4HZWA 1IVBA 3QLQA 1G86A 4GKXA 4QN4A 4YGBA 3AP9A 4QNPA 4Y20B 5F9TA 3K3AA 2PHXA 1I1EA 1NMBN 3O0XA 3SH3A 1W6OB 4M3CA 3N36A 4QN7A 4Q8KA 1EURA 2GMMA 1F8EA 1Q56A 3ZXEA 2GMPA 2HTYA 4XBNA 1GICA 2PELA 2VK5A 1SFYA 2ZMLA 1IVCA 4WVWA 3GNEA 3GVKA 2EXKA 4CPNA 2RHPA 2ARXA 5GLZA 4K1HA 1MS8A 4R9AA 3H71A 1MZ6A 5H9QA 1YO8A 1DBNA 1Z4YA 7NN9A 1Z50A 1NCBN 4YGDA 2WSUA 1V6NA 5HUMA 2W39A 1NSBA 1DYPA 2WLQA 2EALA 3NV4A 1VAMA 3TIBA 3AP4A 3T1MA 4YW5A 1W6MB 1HQWA 4I30A 3MW4A 1SBFA 1W6NB 3O9KA 1G8WA 3POWA 1W8NA 3AP7A 2ZAAA 4H55A 1ENSA 2GNBA 3CL0A 5HUKA 1CJPA 3UK9A 4Q1RA 2DWRA 1OFSA 5GZGA 3INBA 4GZWA 1V3BA 2ZGLA 2QWBA 4MC7A 1YYNA 2DUQA 4MWWA 4XXAA 3FFZA 4XMAA 5H9RA 3AXEA 3AK0A 4RL7A 2A6YA 3TI8A 3VKMA 4CPZA 4GZPA 2PHFA 1ULFA 4LBMA 1WUVA 2JECA 3A72A 1BYHA 4X47A 3ALXA 4XYXA 4NOTA 1WD3A 3AXDA 1GV9A 1S0JA 4GZSA 1AX1A 2ZKNA 4FOYA 2B8HA 5CAZA 3V64A 2HTQA 5DG1A 1XQNA 4Y1VA 4GB1A 1WD4A 3UL2A 1VALA 2UWBA 4QN5A 1IVDA 3JU4A 1F31A 4NN9A 1S0GA 2BATA 1KQRA 4XOGA 1C1FA 1INFA 5IK8A 5GZDA 3A0KA 1EPWA 3JUUA 5LK5A 3AYDA 4FP2A 2UU8A 3TI3A 5T54A 3VKLA 2QWJA 1DQ5A 4DGRA 4GDJA 1MWEA 1UX6A 4FPEA 2W08A 1AF9A 3RG0A 3K37A 2A3YA 3SANA 3ALWA 5EWSA 4B7JA 5T5JA 1WW7A 1Z4ZA 4UW4A 1V3DA 2F29A 3V0BB 1AZDA 1KJLA 3LCPA 1DFQA 3JU9A 3AZXA 3OYWA 1D2SA 5T5PA 3H6JA 3ZSLA 1V6JA 2SIMA 5E8AA 3D6EA 1D0HA 4GZOA 1B09A 3WCRA 3PVEA 2HTRA 2TEPA 3NV1A 2H0BA 5CBLA 3SILA 2HTWA 3I4IA 2VU9A 3ILFA 3OBTA 3TB0A 4C1XA 1CESA 1W0PA 4LBQA 2C9AA 1UL9A 1DQ2A 4YG3A 3HR9A 3ZSKA 1LOFC 2D3SA 1KITA 3OGGA 4FPCA 3FLTA 1DIMA 2E7QA 5B2CA 2VWDA 1SLCA 3GVJA 3GVLA 3B00A 2AR6A 4M3CF 4FVVA 2W5NA 1UZZA 5EYYA 4ISRA 3OJBA 3WCSA 1MVEA 2AUYA 4QN6A 4XZPA 3ZSMA 4XE9A 4M00A 2P37A 1CR7A 1B9SA 1VLNA 1NN2A 1Z4WA 1FV3A 4JCKA 3LSEA 1IOAA 5GZFA 1WW6A 2JJ6A 2DVBA 2R1DA 1INYA 1W6QA 2ZHNA 1Z4VA 4DS0A 2JKBA 4FQ4A 1NNCA 2VSKA 1GZCA 4XJUA 3R05A 1IKQA 1S0IA 2BQPA 1DGLA 3INAA 4BLJA 1HLCA 4B7NA 3NSSA 2P3KA 4MJVA 3POYA 1CIWA 1SCRA 2LTNA 5E89A 4NO4A 1SLIA 4K1KA 3B7EA 4Y22A 2SILA 2XZKA 2DVAA 4M4VA 4BPZA 4M3CE 3AP6A 4C1WA 2CWSA 4YZ2A 3VV1A 2NYYA 2EXIA 3V0AB 1O4YA 3K39A 3DGTA 3T1EA 4IQPA 2ZGNA 1WLCA 2B7YA 1GSLA 2YA6A 3MPPG 2E6VA 4TYSA 3SH4A 1A14N 3FLPA 1R1ZA 4GDIA 2GN3A 4HL0A 3CL2A 5F5QA 3CNAA 4FQZA 4XJ8A 4BMEA 3KQRA 5HX0A 2ZGOA 3B69A 2YDPA 3IPVA 1V6KA 3USUA 2W52A 3APBA 4QN3A 3ZYRA 4YGCA 2HTVA 1PZ9A 2D43A 4FPYA 3PVOA 1G9FA 1AXKA 3ZYPA 1H9PA 3HMYA 4GWMA 5E88A 4CRQA 1Q8VA 2A6ZA 4FPHA 3WDYA 1TEIA 1N1VA 2YXSA 3B9CA 1O4ZA 3C2UA 2ZACA 4Z8BA 1Z0HA 3T1LA 1MS4A 1WCSA 5T50A 2DU1A 1CN1A 3PMEA 5NN9A 3V65A 1LGBA 1NLSA 2E7TA 4AVSA 1W6QB 2F27A 2WT1A 4NC5A 1AJKA 1F8DA 1IS6A 4Y1ZA 2NP0A 3FBYA 2VH9A 3AZZA 4DPNA 3A71A 4B7QA 4M01A 1NCCN 1G9AA 1BQPA 2QWEA 1E8UA 4U2AA 2DVGA 3SNMA 4FPFA 3ASIA 3HN1A 4PBOA 4P9YA 5IK7A 2D3RA 1ZM1A 2OUJA 4X4AA 3UJQA 4JF7A 3TAYA 3D11A 5DXDA 2WNEA 4YM0A 1MVQA 1FNYA 3AP5A 2ZMKA 1ULDA 4YG0A 1Z4XA 3ATGA 4Q8LA 1GNZA 2NM1A 4CPMA 4XJAA 4YW4A 3AYEA 4LBNA 4H52A 4M4UA 4YW3A 5DG2A 2NMOA 3NN9A 4WZFA 1LOAA 4JRAA 1CQ9A 1F8BA 2F0ZA 3TIAA 1IS5A 1V6OA 3PJQA 1FV2A 4LBOA 1JBCA 2DV9A 3NV2A 1LEMA 4LBQD 3WDWA 1MS3A 1W21A 1LU1A 1DIWA 1V00A 4YZ1A 4ASMB 2NN8A 4RA0A 1S0CA 3AFKA 3A0NA 4KS3A 1W6PA 3USUB 2EXJA 1V6LA 1APNA 2XZJA 4ISQA 1SLLA 5CA6A 5GM0A 2JE9A 1V0FA 1A4GA 3WDXA 1QOOA 4Q6KA 2D3PA 2OVUA 4JC1A 5L73A 3WHUA 1ZA4A 4SLIA 3RRDA 1ONAA 2BF6A 1URXA 5H9SA 1ULGA 4ATFA 3AYAA 2F12A 4M3CB 1DQ4A 2ES3A 1UKGA 2XB6C 2ZGSA 1VAVA 3AJYA 4FOQA 1KDKA 4MWXA 1S1AA 2GALA 3CYEA 1N1YA 2A3WA 3WDTA 3ILRA 2ZGQA 5DUUA 2DU0A 1KRIA 3K38A 1JW6A 4R9BA 2F24A 2VW2A 1S0EA 1QF3A 5M1ZA 3WZ1A 2A5ZA 5GLTA 4W65A 1LTEA 1CONA 1ENRA 4KBBA 5AVAA 1H9WA 5T52A 3WV6A 1IVFA 4AVVA 1V6MA 1NMCA 1LOGA 2A6VA 3AZWA 3RMYA 3POSA 1V0ZA 2C4LA 4R9DA 2WKKA 2PHUA 1JYIA 2VK6A 4YLZA 2VSMA 4AGRA 1CVNA 3BTAA 2HU0A 5GZEA 2VW0A 3AX4A 4AGVA 2C5DA 2YA8A 2WT2A 2UURA 4Y1UA 4MWJA 1Q8OA 1L7HA 2LALA 2ZGRA 4BM8A 3ILNA 3FUQA 1GKBA 2QWGA 3IM0A 1Z78A 2AENA 1SLAA 1SCSA 2D6PA 4BLIA 4UW6A 4GJTA 3PVNA 1OQ1A 2QWCA 4PBPA 1NNAA 4WA4A 4MWQA 2ZGUA 3H0OA 1UAIA 2I2SA 1DQ0A 3H73A 4KS1A 1INVA 3L2YA 1LESA 1AXYA 1N3QA 1LHVA 4GZTA 1QOTA 1LGCA 5KXBA 3NWKA 2KM2A 4Y24A 2DYCA 4BOWA 1WLWA 5CB7A 4Q1PA 4YG6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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