3AZVA

Crystal structure of the receptor binding domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
427
structure length
418
Chain Sequence
NEYFNSINDSKILSLQNKKNTLMDTSGYNAEVRVEGNVQLNPIFPFDFKLGSSGDDRGKVIVTQNENIVYNAMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNENSEQDINFSYDISKNAAGYNKWFFVTITTNMMGNMMIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFQMNKIPNNINMWIRDFYIFAKELDDKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYDKEYYMINVNYMNRYMSKKGNGIVFNTRKNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGENVLYFNTTIDNKQYSLGMYKPSRNLGTDLVPLGALDQPMDEIRKYGSFIIQPCNTFDYYASQLFLSSNATTNRLGILSIGSYSFKLGDDYWFNHEYLIPVIKIEHYASLLESTSTHWVFVPAS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords D/C mosaic neurotoxin
publication title Structural and mutational analyses of the receptor binding domain of botulinum D/C mosaic neurotoxin: insight into the ganglioside binding mechanism
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 79
structure length 418
sequence length 427
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3azvA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3azvA02
2DWRA 4BPZA 2ES3A 2UWAA 4J2YA 1LCLA 3ZPYA 4XMIA 3O5SA 3CA4A 1S0FA 3CRGA 2ZR1B 2R49A 2WNEA 2HWAA 3BAOA 1AX2A 3FJ8A 3ZXLA 1Z2VA 2WKKA 1I1EA 4DRVA 1KITA 4LO1C 5AVAA 2Z49A 2RG9B 3D4KA 4Y20B 1V6KA 2TEPA 3IN9A 3ZXJA 4DEPA 4KEIA 1VAMA 4QD2C 1HKDA 1S0IA 1F31A 5CAZA 2A3WA 2DTYA 4OWLA 3O12A 3CAHA 1V6WA 1T9FA 3B9CA 2ZGOA 3FBYA 4HR6C 1AX0A 1SR4A 3OYWA 4ZLBB 4YGEA 1Y7BA 2ZABA 4P9XA 2KH2A 2RQ9A 3SH4A 1P63A 3NBDA 1WW7A 1J0SA 3WO2A 1T4QA 3A22A 3T1MA 4TYSA 3OJMA 3ZC9A 4ITCA 2FFUA 1UZZA 4Y1XA 4XJUA 2SBAA 1CPNA 3BA5A 1JQZA 1DYPA 2A6XA 21BIA 4QO3A 4XYXA 3OBRA 2J3PA 4GAFA 1FNYA 3BAUA 3QYDA 3AYDA 3CRHA 4FOQA 2EXIA 2IWTB 2PHRA 3UJ4A 3WDYA 3WDUA 3SNMA 4R9AA 2Y9WC 4XKIA 3N7KA 3WCRA 1C1LA 3B01A 3M3EA 2DVGA 5D63A 4OEFA 3WCSA 2A70A 5JOZA 4FPGA 1QNYA 3PVOA 3R4SA 3BIWE 3NJ5A 4Q1RA 3WG2A 4J2XA 5BXSA 1VLNA 1Q56A 1QDCA 4Y22A 4I4XA 1KRIA 3CA3A 4II0A 2GMPA 4LBJA 3POWA 5GLTA 3N7MA 2M49A 5GALA 1VAVA 4R9BA 2ARXA 4BM8A 3OJBA 4F83A 4EFRA 1RMLA 4Z8SB 3BRFA 1JXNA 1W0PA 1BFBA 5BXRA 3MW4A 1HDKA 5JOXA 2ENRA 1LOFA 5JOYA 3ZC8A 3SITA 3B9UA 4I4RA 1YBIA 1IS6A 3FLPA 2DVFA 2NMNA 3UDAA 1V6UA 1AJOA 3WOGA 2VW0A 1G9AA 1BFGA 1CVSA 4I8MA 1QQKA 4I30A 3NWKA 1G82A 1BFCA 1LGCA 4FPCA 5CNAA 1KJLA 4QC4A 1ULCA 1H9WA 4PC4A 3FJCA 1G9BA 3U4XA 5HCAA 1IT0A 3NV4A 1LOAA 3O4DA 4H9WA 1CESA 4HA2A 3OGFA 1S0GA 3LSDA 2YZ4A 3O4CA 1JTCA 3H6QA 3H6SE 4IZXA 3M1HA 1QGLA 4FVVA 1NUNA 2DTWA 3AK0A 4Y1UA 2A3YA 2BFHA 4LO1A 2W68A 4X37A 1LEMA 1ZA4A 1R8NA 4XIOA 4BOWA 2AH2A 3O4BA 4PF5A 3WG4A 1V6NA 2A7AA 5EHAA 3ZSKA 2HZ9A 1PZ7A 4YLZA 1UZYA 1QNWA 2GNBA 4L4IA 1RY7A 2GNMA 4C1WA 4LO3A 2V5YA 3FLRA 1S0LA 2LALA 3FUOA 3WG1A 4YGBA 5GLZA 1KJRA 4XJZA 3O49A 3LTQA 4JKXB 3NV2A 3W9TA 1PC8B 1KDMA 1LU1A 4FPOB 3AZYA 2UU8A 3RRDA 2A5ZA 3RTJB 4BMEA 1S0CA 3IAGC 5DSSB 4TZDA 3V0BB 4AN6A 4U2AA 4GP0A 2D6MA 3A0NA 3ILFA 2P23A 1WBFA 1W6NB 4XDQA 1NLSA 1WBLA 3WDWA 1I1BA 1ISYA 3BTAA 1CJPA 1MS1A 4LBQA 1GZWB 3T2TA 3VKLA 4EB2B 4M01A 5IK4A 3PJQA 2ZHMA 4IHZA 4ZFYB 1DZQA 2RHPA 3C2UA 1LHNA 3QR5A 3SH3A 5JMCA 5DZUA 2ET2A 2AREA 2DU0A 2GDFA 5F90A 2L5XA 1AJKA 2GNDA 1ZM1A 2GNTA 2GMMA 4Q1PA 1CQ9A 1UMZA 4I4YA 2ZAAA 4QBCA 1Q03A 4SLIA 3KQRA 1V6IA 4HL0A 4WVVA 3K1XA 2AUYA 4XBLA 3AP5A 3N0KA 3P53A 2JKBA 4ZA3B 4XFUA 2KI6B 4YZ4A 1TTUA 1MR5A 4YM2A 1R8OA 3AJ6A 2ZA9A 3IM6A 1AVAC 5DUWA 4CJMA 1WW4A 4ZFUB 2AAIB 3Q7WA 1MS0A 4PBPA 2PELA 4Y1VA 1GYKA 2DUQA 4GOVA 2DS0A 1W6OA 1SBEA 3OY8A 1AZDA 3RQ0A 3CA0A 2A3XA 1AX1A 1AVXB 1DFCA 4WBCA 4WVWA 2P39A 1JT5A 3WMVA 2Z48A 4ISRA 2IHOA 2VSAA 1J1TA 2FHRA 3BAQA 4P14A 1UAIA 9ILBA 1S1AA 5JVVA 5GLWA 1QOTA 4EFQA 4USPA 3M3CA 3PVNA 4X3AA 1IHKA 3TAYA 4OWJA 3O4OA 3BADA 4M3CE 3WMUA 3E8LC 1RITA 1MS9A 3WUCA 1DLLA 2VW2A 1FWVA 3AKIA 4I7IA 4Q9PA 1DZCA 1JT7A 3N36A 2FMDA 1B09A 3OPZA 3V0AA 4J2SA 4G6MA 5EC5A 2DVDA 4Y24A 3ILRA 2F8XC 3WV6A 3VWCA 1GV9A 5T54A 1A8DA 3CA6A 1JYIA 3PG0A 4GAIA 4OEGA 5FRAA 1ENRA 5T5OA 4I4SA 1NXD1 4XXPA 1LGBA 1DQ1A 3JUTA 4Q27A 1PUMB 1FYUA 1GSLA 5GM0A 4I96A 3V65A 3VKNA 1LOEA 4XBNA 1JYCA 2ZMLA 1C1FA 2A71A 5DG2A 1E0OA 4JQ0A 1QXMA 1SCRA 3NV1A 2DVBA 4Q2FA 2D23A 2C5DA 4LBQD 4ZGRB 4K20A 3BA4A 4XTMA 2R1DA 3OY8B 3UD7A 2HWMA 4JCKA 2K43A 4Q26A 3ZSJA 3BAVA 1TIEA 3I2AA 3LCPA 4X39A 7I1BA 3D6EA 3OGGA 1WBCA 4J2KA 4BLIA 2UUSA 2Y9FA 1LESA 3O3QA 1CR7A 3TC2A 1WD3A 3HN1A 3B00A 4F34A 2EF6A 2DYCA 3OJ2A 2VH9A 1JLYA 3NV3A 2BEAA 4JRAA 3A0KA 3FJ9A 1ULFA 5E8AA 5FREA 2UWBA 4A7KA 4QALA 3ZVXA 2D1ZA 2JD4A 4ZXKA 1X50A 2PHFA 3AYCA 5DZEA 2AYHA 3LSEA 1IS3A 4AWDA 3F1RA 1BKZA 2CY6A 1OKQA 4LO3C 1IOAA 4IYBA 3I29B 4XFTA 4A7ZA 1KQRA 4IY8A 1QF3A 3IPVB 1Q1UA 1V6LA 4I4VA 4GOYA 5T5PA 1QKQA 4GKYA 3ENRA 1O4ZA 2NMOA 4Z8BA 1PZ8A 1N47A 2D7FA 5GZEA 3WDTA 3O44A 3BAHA 4YZ2A 1JW6A 5T52A 3ILNA 4DQAA 4IZEA 4M3CA 2Y9XE 2W08A 1HWPB 1HCEA 3O5WB 5EYXA 3DGTA 4BQ1A 3VKOA 3BRDA 4XILA 2YUGA 2E7TA 4Q91A 4GWNA 4I37A 3PUBA 3H6RB 4L4HA 1SLTA 2ZQOA 2WRYA 3BA7A 1SBFA 1AVWB 2CWSA 4IY9A 1BYHA 3BODA 1W6PA 4IQPA 4Q8KA 1JT3A 2YXSA 1W0OA 1GZ9A 5DUVA 3AP6A 5JLVA 2DVAA 5FNWA 4LBOA 1LOCA 2ZGPA 1YXWA 4XZPA 3RTIB 41BIA 2DUOA 4ASMB 1FMZA 1QU0A 2MC2A 5CA6A 1CN1A 4Y1ZA 1K5UA 2VSEA 3OBTA 4YG6A 3USUA 5HPZA 1N3QA 2D7IA 1TP0A 3NBEA 4ZOTA 1DJSB 1ITBA 3VT0A 1GBGA 5F8SA 5H9QA 5IK8A 1G7YA 1IKQA 2ZGLA 4LBNA 1AXMA 1FV2A 1W6MA 4QBVA 3Q7XA 4YOLA 1Z4SA 3BB2A 3AJZA 5F9TA 1ISZA 3FJFA 4G9MA 1FAYA 4LO7C 1GICA 3OYWB 2I2SA 3F62B 1YF8B 1F5FA 4I1EA 4FQZA 2ZGKA 5D61A 1V6VA 4KEKA 3ZYPA 4OZXA 2QN4A 1G9FA 2CTVA 3NBCA 1VALA 2V73A 1SACA 2D6NA 2ZGUA 4FP3A 3RS6A 3IKWA 2JJ6A 1BASA 3IMNA 4ISQA 3I4IA 1DIWA 1KNMA 3QCWA 1YI7A 1GKBA 2WSUA 2P3KA 1ISXA 3FJEA 3C9ZA 5GJ6A 2CL2A 4UW4A 1S0JA 2CYFA 1QOOA 1MD6A 3AJYA 1DFQA 3UD8A 3AXDA 4AVVA 4I4OA 3UJ0A 2PHUA 1I3HA 3D7WB 3SH5A 2GO2A 1V6JA 3N35A 1UL9A 3M3QA 3UK9A 1YO8A 4Q9GA 1FNZA 5DZGA 3ZXDA 3A21A 2KLLA 2ZGMA 3FFZA 3JRRA 1MS4A 3AP4A 5T55A 3ZSLA 4YFWA 1LU2A 4Y22B 2KM2A 4YZ1A 1MS8A 2B7YA 1CVNA 3GNEA 5F5QA 1XYFA 2OUJA 5IK5A 1ENQA 2P3JA 1IJTA 3AZVA 3MALA 3AXEA 3IM5A 3VSZA 2BQPA 2NP0A 3O0VA 5FZZA 1BLDA 4FPFA 2VXTI 1DHKB 5DXDA 1TEIA 2CNAA 1H9PA 3FJBA 4AGVA 3RMYA 3N3HA 1N1TA 3BX1C 2K8RA 2VY0A 2DUPA 1SFYA 2D22A 4R6UB 1S0BA 2EXKA 2GALA 1BLAA 3WO4A 2EIGA 2WQZC 1Z0HA 1LJ7A 4I4QA 1PUUB 1N3PA 4CZSA 4LBKA 5IT6A 4R9DA 4IONA 4D0ZA 31BIA 3PMEA 2D3RA 5BOWA 4GKXA 4YFZA 4J23B 4AYUA 4XXAA 4USOA 6I1BA 2SLIA 1G86A 1RG8A 1II4A 3AZXA 3NBNA 1W6QA 2FDBM 1DQOA 3DUIA 4PQ9A 1GNZA 1PWAA 3FJJA 1YRZA 1BARA 1Q8VA 1FQ9A 2Y9GA 1W3FA 2DREA 4QD2B 1XHBA 2D24A 1TOOA 1DBNA 1K5VA 4OWKA 1LODA 2XG3A 1WW5A 3R4UA 4M3CF 1HWOB 2VUAA 3IIRA 4GALA 5EXOA 1V6XA 1DYKA 2FFVA 1JHNA 4FPEA 1IRAX 1JOJA 2Z42A 4G9NA 2DU1A 2ZMKA 1QOSA 5CB7A 1EYLA 4ZBVB 4XJAA 2EALA 1IS4A 3I8TA 3CQAA 1IRPA 3SISA 1FGAA 1HKNA 1ISWA 1VIWB 2VW1A 3AZZA 4I1BA 3HSMA 1GZCA 3FJKA 3WG3A 1IILA 1CPMA 2CWMA 1DQ6A 2E51A 3JUUA 1LOGA 3UD9A 4LBQB 2G4IA 3A4UA 2WT2A 3ILAA 4JPZA 4QKRA 4Y20A 1IKPA 5EWSA 4LO2A 4EFPA 4Q8LA 5SV8A 2K4AB 2KKIA 1C4RA 4FQ4A 3FLTA 4OUJA 1OQ1A 2GZBA 2JECA 3VV1A 4KEJA 3MW3A 1ULGA 2ERMA 2F2FA 2VLCA 1EPWA 1VCLA 1OFSA 3BOPA 2UURA 2LTNA 1R1ZA 1SLAA 1TWEA 2AENA 3AFKA 1BJQA 4LO0A 5FZUA 1WW6A 3WDVA 1OQLB 2Q9XA 1D2SA 2VXRA 1W6QB 2PHXA 2WSVA 5IUQA 4AGGA 2Q3NB 3RG0A 8I1BA 5DZFA 1DGLA 5T50A 4XIKA 2QYIB 2OW4A 1MVQA 4PCRA 4JAWA 3APBA 4EKXB 4BMBA 1JN2P 1G8WA 1W6OB 3W58A 1ONAA 3HOMA 5L73A 5GZCA 5GZGA 4PBOA 5BQUA 1Z78A 1M16A 4LO7B 1A3KA 1A78A 4UW3A 3EF2A 2AQZA 4LO8B 1SZ6B 4D8HA 4GP3A 2A6ZA 1MZ6A 1BFFA 4ATFA 1WUVA 1U0AA 3ZXKA 2JDZA 2ZBJA 4I3NA 2YY1A 4FGFA 1UN1A 1S0EA 4DS0A 1ILR1 2R16A 5FNXA 2ZGRA 4U36A 1YTOA 1SLLA 1BZWA 4YZ3A 2W39A 4FOWA 3A07A 2NVHA 3BAGA 1BXHA 2AR6A 1SLCA 4RA0A 2ZGQA 4M00A 1RINA 4OW4A 4CTEA 1W3GA 1MVEA 3V0AB 1N3OA 4XOGA 2ZHKA 2GMEA 4CRQA 5B2HA 5DUYA 3PHZA 2BEBA 1Q8QA 4FPJA 1WCSA 3D5OA 2PHTA 5BP5A 2DRYA 1ULDA 3HBWA 1Q8OA 4FPHA 4YG3A 2OUHA 2OVUA 5D62A 3VEQA 4I4PA 3R05A 3WHUA 5DUXA 2P37A 4DCKC 1ONKB 5JOWA 2D6LX 2HYKA 3Q9OA 1ULEA 4FOYA 1BA7A 3PVEA 4JP0A 1SLBA 3MEPA 1LHOA 3N7JA 5E89A 3A23A 3ZSMA 1DQ5A 2D43A 2W52A 1EVTA 3RSJA 1SCSA 1LECA 1NZKA 1CE7B 2R9KB 4XJ8A 4OEEA 2AGSA 1Q04A 1LTEA 1YYNA 1RZOB 5F8WA 2D7RA 2C9AA 3CNAA 2HW9A 3S8JA 3JU9A 4XBQA 5DVHA 2WBCA 3CA5A 1QQLA 1V6MA 2ARBA 4KBBA 4UW6A 1SLIA 5JDBA 3FGMA 4L8QA 3WO3A 4NO4A 3AP9A 3AJ5A 1URXA 1G9CA 1LEDA 1WLCA 3P6JA 3RMXA 4DENA 2WLQA 3ZYRA 1O4YA 2D6PA 4NOTA 2VU9A 2ZZJA 1AFCA 4YGCA 2X2TA 2ZGTA 5GAQA 3AKHA 2D20A 2A6VA 2EAKA 1LHWA 3AKFA 4GWMA 1JY0A 2D3SA 5E88A 3N7LA 2WT0A 3CRIA 1KDKA 4WZFA 1LULA 1JBCA 3CU1B 2H0BA 4I0YA 2EXHA 4JC1A 1EV2A 4YZ5A 2X2SA 4TLPA 1HIBA 4YG0A 1N1YA 2E4MA 3WINA 3SNVA 3WNXA 3V0BA 2A6YA 4QKSA 2XB6C 3O4AA 4AVSA 3IM0A 3MPPG 5BXPA 1UX6A 1W6NA 4I2SA 3TB0A 3WVJA 4I6IA 4DRRA 4YM3A 4FOVA 3LLPA 1IOBA 4M3CB 1GZWA 2YV8A 1XQNA 1MACA 5DUUA 2NTDA 2FGFA 4R9CA 3V64A 4H55A 3ASIA 4XFSA 2JE9A 4P9YA 4XMAA 3KMVA 1N1SA 4DFSA 4K1YA 2R0FA 3H0OA 1F9KA 4LO2C 3AH2A 1CONA 5GZDA 4JKQA 4XHBA 1S0DA 1MS5A 1G9DA 1W6PB 1XZZA 4K21A 2F2FC 3AKGA 3AYEA 3WDXA 1APNA 1AXYA 2WT1A 3L2YA 4ENDA 3ATGA 1FV3A 3M2MA 1XG6A 1DZDA 1MZ5A 2LIEA 4FPLA 2ZHLA 4G1RA 4XE9A 1GGPB 1LHVA 3Q7YA 4LO0C 2ZHNA 3FJAA 4LBLA 5GLVA 1HQWA 3W59A 2E7QA 3USUB 4YM1A 2WJSA 3FJDA 3POSA 2ZACA 4HANA 2E6VA 1HQLA 2RSTA 1HWNB 2DRZA 4GA9A 1LOBA 3AH4A 2D6KA 2MIBA 3VT2A 1D0HA 3ZX7A 4P6AA 4XHXA 1JLXA 1PZZA 1JT4A 2A6WA 2ESUA 4WV8A 5GLUA 2AXMA 4MYEA 1W6MB 2KI4A 4Z9WB 3S8KA 1GNHA 1DQ2A 4ATEA 3HR9A 5CBLA 5EYYA 5BQUC 5I1BA 4FP2A 2R0HA 2NYYA 2ZGSA 3O0WA 3QLQA 4EEEB 3WLUA 5DG1A 1SBDA 4GXLA 1DQ4A 2NZ9A 3POKA 1QMJA 4YW1A 1ISVA 4P0KA 2DV9A 2XOAA 5E24E 1GLHA 4I4UA 3WHTA 3VUOA 3HMYA 5GZFA 3KM5A 5KXDA 5T5JA 1HWMB 3GALA 1AF9A 4AN7B 2YROA 2ZGNA 5IK7A 4AVTA 1HLCA 1MC9A 4P0LA 1FX5A 3IM7A 1GANA 2LIQA 4A7YA 4Y26A 4H04A 3UJQA 2FO1A 1WLDA 1H30A 4AGRA 1RIRA 1AVBA 3I2XA 3WA1A 5BP5C 3FUQA 3CA1A 1FATA 4P0JA 1QDOA 2UWCA 1M2TB 1SR4C 4K1ZA 2ZQNA 2YMZA 2DURA 4W65A 5H9PA 3AYAA 3FJHA 4FPKA 3VKMA 4YW3A 5H9SA 1W3AA 3T8SA 1UKGA 4YW5A 5G00A 3B3QE 5BVPI 1TFMB 5T5LA 1WD4A 3B69A 4KC3A 3INAA 3FJIA 3T1LA 2D44A 4D0TA 2EXJA 3UL2A 2GN3A 1N4KA 1V6OA 4XTPA 3O0XA 1V00A 3HALA 3ZXEA 4ZFWB 5BXTA 2PHWA 1HCDA 3WUDA 5FZYA 1FWUA 1C57A 3P6IA 2NM1A 1DQGA 3ZXGA 4YGDA 2Q5TA 3UJOA 1BQPA 1IS5A 4P9WA 4ZKTB 1ENSA 4G6JA 4LBMA 4XJ9A 3MW2A 3OJVA 5KXBA 3AH1A 3POYA 2ZMNA 1AVUA 1WBAA 3AZWA 4UW5A 1LHUA 1LENA 1JUIA 4RL7A 2P34A 1LGNA 3IPVA 1MS3A 1AXZA 1FMMS 2D6OX 4FPYA 3BRGC 4YW4A 2MLLB 2E53A 5LK5A 2R1BA 2ZKNA 3ZXFA 1FN0A 5F8YA 4X38A 4D69A 5BYNA 1YIFA 2JE7A 2P3IA 1PZ9A 3M3OA 5H9RA 2E4MC 3WINC 1ABRB 2GN7A 4XJWA 2NN8A 1Q8PA 1WLWA 4Y1YA 1N1VA 1LOFC 4DPNA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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