1XYFA

Endo-1,4-beta-xylanase from streptomyces olivaceoviridis
Total Genus 163
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
163
sequence length
436
structure length
427
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-1,4-BETA-XYLANASE
publication title Crystal structure of Streptomyces olivaceoviridis E-86 beta-xylanase containing xylan-binding domain.
pubmed doi rcsb
total genus 163
structure length 427
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 1999-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1xyfA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1xyfA02
1I1XA 4ZFUB 2VR4A 4DM2A 1SR4C 2D7RA 3OGSA 2VMFA 2YLAA 4GINA 4S3KA 1GJUA 2FFVA 2Y8KA 4UFMA 5D4YA 3TA9A 4AC1X 2ET2A 3F4VA 1J0JA 4J2KA 2X2YA 4GOYA 4OZOA 3W24A 3FUQA 1R8LA 2XPKA 3ZJ8A 3WF3A 2YBUA 1NOUA 4I0YA 2W67A 3FJFA 2Y9FA 4DEPA 2A3BA 3D3AA 3VM5A 1K9FA 3UDAA 1XC6A 2BHYA 2WMHA 1F4HA 3WO2A 5JIPA 4Q91A 1E72M 7A3HA 4B16A 4OUJA 1J11A 2X1IA 3EMZA 3SURA 3GTNA 1OGSA 1R85A 2XHYA 1GVIA 4OOZA 3LPGA 4W7WA 4HOZA 2PC8A 5FCZA 2PBGA 1UUQA 2XSAA 4TOQA 5E6ZA 3UETA 5IHRA 4FLOA 1NOWA 1C8XA 4EAMA 2YJQA 1MD6A 3FN9A 5I6SA 2WHMA 3U7VA 1DQOA 1MW0A 3MSGA 3RILA 3LPFA 2V3GA 2IHOA 4WKAA 3ZQ9A 4GXPA 2JALA 4AEFA 4JKLA 1H5VA 4PSRA 1RMLA 3PZGA 2J79A 2HVMA 3IJ7A 3CUHA 5A95A 1DFQA 1HWMB 2XOAA 2ZUVA 3W0KA 3A21A 4X9YA 1UH2A 1GONA 2AAIB 3WDPP 3V0AB 1TWEA 4AW7A 5I78A 1H11A 5CJ5A 4DWSD 3VD9A 3RO8A 8A3HA 2EJ1A 3WINC 4UR9A 5FKYA 2DSVA 1UD4A 3MU7A 4J27A 2OWCA 3W29A 4JQ0A 4D71A 4HZ7A 2VO5A 1CXLA 1JZ8A 1M04A 2E0PA 4EE9A 5I77A 1MXDA 2VURA 4LO7B 3ARWA 4OUEA 4I96A 3VIFA 3ZXGA 3BLKA 3OGVA 1EQCA 1LG2A 1GGPB 1B31A 1KR1A 4ZE5A 3WUEA 4MTVA 4G9NA 4J2XA 1SR4A 4W89A 2XIIA 2JEQA 4UQAA 5BOWA 4L4PA 1PWAA 1GQKA 3SUTA 4PMRA 2E3ZA 2ZQOA 5D9OA 1CBGA 2QMJA 4P0KA 1H2JA 1EO5A 3JRRA 1R7AA 1P63A 1KXTA 4AXNA 1VBUA 1FV2A 1V0NA 3BAJA 2ZX7A 2CKSA 4IM4A 6TAAA 2VOTA 2W5FA 4QO3A 4OEGA 4A4AA 2XVKA 3CMGA 2VUYA 4HP5A 3TTSA 4WLCA 2J7BA 4KH2A 4PN2A 3WF1A 3OBAA 2QPUA 4UQDA 3VUOA 3AKFA 5A2BA 1DHKA 3KEHA 3TTYA 3SEPA 5F8WA 1EA9C 1DWGM 3CMJA 1UWQA 3RMEA 1CZ1A 1NOFA 1K5UA 4F66A 3NBDA 1EO7A 4QCFA 4ZA3B 2ZXAA 1E5JA 1E3ZA 1HIZA 4PMUA 2L5XA 2Y2WA 2PWGA 3OZPA 1JY0A 4MB1A 2ZOXA 1HN1A 2FHCA 2M49A 3AKHA 1ONKB 1L2HA 2Y24A 3QR3A 3DECA 1CDGA 1YYNA 2HZ9A 1CE7B 2WAGA 1LWHA 4PTXA 4I4RA 1TCMA 4GOVA 3P6JA 4AZ6A 2UY5A 3W4RA 5D9NA 1WO2A 1QW8A 3O4AA 2WHJA 4UQBA 3T0AA 1DEDA 3WINA 3RM4A 3UCQA 4JIEA 1D7FA 5ECUA 1WAWA 4CD4A 1PUMB 1W9PA 2RGLA 4F8XA 1BASA 2VXTI 5E24E 3RJYA 1UWUA 4NF7A 2ZX9A 3L2LA 1V6XA 1BFFA 4LO2C 4F34A 1E5NA 2XVPA 5I1BA 2VX4A 4H2CA 1J12A 3ARQA 4W85A 1CVSA 5JMCA 3AH1A 4UOZA 1MYRA 3ECQA 1B3VA 1R8OA 4AEEA 3VMPA 4UFJA 2D3LA 1BF2A 1SMDA 2FGFA 1J18A 3OB8A 4GO8A 1JG9A 2C0HA 1E1EA 4EANA 1MQQA 1HVXA 4ZEPA 2Y9XE 1V6UA 1BLIA 2ZUWA 1V6YA 1UHVA 4TX8A 4LO0C 5F8YA 5GNZA 4HU8A 3WN6A 2HW9A 3BCDA 2VJXA 1PC8B 2WMKA 2VRKA 4Z2GA 3FUOA 3FHQA 3L4WA 1H41A 3CA0A 3PHZA 4XZBA 1G94A 1W9UA 4LYRA 3OLIA 2J25A 1UD2A 2JE8A 2YIHA 1JZ6A 2DH2A 4JCLA 3QHOA 4OWLA 1E6ZA 1J01A 4AZCB 5AC5A 4IZEA 1KB3A 4II0A 4BZYA 4P0LA 1G9AA 1VEPA 3SUWA 4J28A 4XB3A 2VI0A 4F79A 5CLWA 3FJJA 2D1ZA 1W3KA 5JUVA 3BAKA 3GXMA 4UZUA 1UH4A 3GXIA 1IHKA 4EKJA 4A7ZA 4FK9A 2YDQA 2XM2A 4LYQA 4I4OA 3MS8A 3BSHA 6I1BA 1OSEA 1TG7A 2BHZA 2UUSA 1GVYA 2JFEX 1W9BM 3A4AA 3T0BA 4J3UA 1AVXB 2X09A 3AJ5A 1T4QA 1XRVA 2WK2A 4D6GA 4CN4A 6A3HA 3M7SA 4OWKA 4OEFA 3GH5A 3CQAA 4KEIA 1HNYA 3N7MA 1TZ7A 1DP0A 2J8FA 4W7UA 2EPLX 1EOMA 1JZ7A 1FHLA 1UQZA 2YUGA 2Q8XA 4BQ4A 1B1YA 4P7OA 3MANA 3VM7A 1JYVA 1D3CA 2EO7A 3CHFA 1JD9A 2FO1A 5CPQA 1U2YA 2XVNA 4LO2A 1WDRA 1ZJAA 4R5EA 3FY1A 2UY4A 3PMEA 2ZX6A 4IUGA 2D0HA 1ZJBA 3CZKA 1XH2A 3VU2A 1II4A 5DFAA 3ARVA 4P6AA 2PWDA 1B3YA 1Z0HA 1UWRA 1HWNB 1BAGA 2DRZA 4EFRA 3WDRA 1ZBVA 1K9EA 3NBCA 1FMZA 1HKMA 1CXHA 2BXZA 5E09A 3FXYA 5GNYA 4OW4A 2BEBA 6CGTA 4LO0A 3VD4A 1FFQA 1GOKA 1Q1UA 1Z32X 3CIVA 3FAXA 4YHGA 5A94A 3HMYA 2WVVA 7TAAA 1V3JA 3BAOA 2GVYA 4J23B 4LXFA 3I3DA 1HKJA 3CUGA 4MJ2A 1EH9A 4BS0A 3O9NA 1DWAM 1N4KA 2P23A 31BIA 4FVVA 1E3XA 1XYZA 3QOKA 1M7XA 1WDQA 2EBNA 3RM9A 2KLLA 3WDHA 1V3IA 3WQVA 5GQBA 1WZLA 4UOJA 4H41A 3VIMA 2ZICA 1ISXA 1NM9A 2V3DA 3VGBA 1ODUA 1HKKA 2DT1A 4HOWA 3IIRA 4IHZA 1IZKA 2XFYA 3BADA 3AHTA 3WBAA 5A6BA 4D6HA 3EDEA 2WANA 5I5RA 3HN3A 4W84A 3VNZA 3VD7A 5DMYA 2YL5A 2WZIA 4MJ4A 5M17A 4HA2A 4G6MA 1ZB5A 4I4UA 3W27A 1V6WA 1OIMA 1RPKA 3K4AA 1HP4A 1JLXA 2OSXA 4IPNB 1CXEA 1JGIA 4V2XA 1EDGA 4TTGA 5HDRA 4EFQA 1BQCA 1CGTA 3Q7WA 2JIEA 3PTMA 4WKHA 4W86A 4J3WA 3MO4A 2DEPA 4PMNA 1AQHA 4I4SA 2AAAA 1QI4A 1AVAC 1RH9A 1WCGA 1Q6DA 4WIWA 1BGAA 3AS1A 1WZKA 3UG4A 1H4PA 2YBTA 2XFFA 2DGAA 4BQ5A 2ZXQA 1DWJM 1XHGA 1XSIA 2YKKA 4JKXB 3H6RA 3O4DA 1SFSA 3CUJA 3DYOA 2E8YA 1CXFA 2WB5A 4QP0A 1JL8A 4D0ZA 1PX3A 1G9HA 3OJMA 3KL5A 3VX1A 4PTVA 4WSJA 3ZC9A 1QBAA 2OLHA 1FQ9A 1W9VA 4B3LA 1E15A 1XV8A 3KE0A 1FFRA 3GXFA 1C3FA 2BNJA 4QALA 5D8WA 1S0BA 1KWGA 4DCKC 1MC9A 3GH4A 1H0GA 4MPKA 3WH6A 3WKZA 1W91A 2F2FC 3K8MA 1MW2A 2DS0A 2NZ9A 2BFGA 2YOCA 3O49A 1DZCA 3ZSSA 3VIGA 1C7TA 2J3PA 1G0CA 3AIQA 4W5ZA 1HJSA 1EVTA 3WSUA 2XVGA 4PBGA 3CU1B 1HP5A 5E0FA 3DHUA 4P7QA 1RP9A 3N04A 4D72A 2G3NA 1EOKA 1EYLA 1GUVA 1V0KA 1Q04A 2YA1A 3AJ7A 3N15A 1JYNA 2GO2A 1PJ9A 3VGDA 1Q6FA 4CD8A 1PZ2A 3WMSA 1MVYA 1ISZA 1PIFA 4QLJA 3P53A 3PTQA 1AMYA 1FH9A 2IWTB 2XJ7A 4M81A 4YN5A 3ZR6A 3LPPA 1PBGA 4QLLA 4GZIA 3SCPA 1BARA 2DDXA 3N13A 5BQUC 3NIYA 3PZIA 1GPFA 1UR0A 2J7DA 2C8NA 1CTNA 1WPCA 2X2TA 5EG6C 2ZE0A 3CH9A 4AY1A 2WKLA 1IZJA 3WD0A 4Z2JA 2PI6A 5A8NA 2CERA 1RY7A 3VSZA 4D6CA 2G4FA 1JQZA 3CA4A 2NW0A 3MPPG 1AVAA 2X2SA 3RM8A 3ALGA 1EGZA 5EHAA 1UD5A 5BRQA 1RG8A 4X39A 1UD8A 3Q7YA 5CGTA 2RG9B 3ZJ7A 5CPSA 3BAXA 3WDIA 1QHOA 4UQEA 1G9BA 3W9TA 3TTOA 4D6IA 4L4IA 3UR7A 1PIGA 4BA0A 3AHXA 4UQCA 1JXKA 3W25A 1MXGA 2CBUA 4PTMA 2W91A 2I1BA 1JDAA 2XWDA 4IISA 1Q6CA 4F9JA 1AFCA 3BAGA 4N42A 4GKLA 2CBJA 3AXIA 3BAIA 3BA4A 3UG5A 4JFTA 3SCTA 2VCBA 3BA7A 3WBEA 2VU9A 2BVYA 4MNLA 3ILAA 1T9FA 3CUIA 5BXSA 2NSXA 3WEMA 4AZ7A 1CLVA 4H8UA 1QI2A 1EHNA 1MFUA 5GPRA 2F2FA 4P8XA 2VR5A 2WVTA 4QD2C 2VZSA 1QPKA 3F5KA 2CBIA 2J4GA 1KBKA 2K43A 4L4HA 1V6VA 4JKKA 1PX8A 3KMVA 2VCAA 4PC4A 3RIKA 3WMCA 2QN4A 1O6IA 1TTUA 2J7FA 3CPUA 2D44A 4NI3A 3S6TA 1QW9A 1ZS2A 1JF6A 1XHBA 4J2YA 4U33A 5JBEA 1XSJA 3BX1C 4QBVA 5E0CA 4W93A 1NUNA 4G6JA 4I4VA 4PRWA 1E4NA 1LJYA 4Q9PA 2DSWA 1VRXA 4KGLA 5FL0A 3VEQA 3W38A 3VMNA 2JF6A 1B90A 3VDAA 1GJWA 5D63A 3IAPA 3SNVA 1KR0A 4UNIA 1IRAX 3WMBA 2G8ZA 3CHDA 2G3MA 3WF4A 1JIBA 3O3QA 5DEZA 5BQUA 2BY2A 2P39A 3MUIA 4TX6A 4DWSA 3IJ9A 5IDIA 4GI8A 5D9PA 4ZBVB 5HNNA 5GNXA 5M3WA 1E43A 3FJHA 3IM5A 3QGVA 3A4XA 1R8NA 5HPZA 2WVVB 3GYCA 4IPLA 2VZVA 4MB5A 1HKNA 1QI5A 1FP9A 2EXOA 3OZOA 3HOMA 1I1WA 1JTCA 2BV9A 2KI4A 3W53A 3JUTA 2WSPA 1HF6A 3E1F1 4TUFA 4IZXA 3ZSTA 4X38A 3RDKA 2PBOA 3W82A 2FFUA 3CZJA 3CZGA 1UKPA 2ZIDA 2WM0A 2BY0A 3B8SA 1ITCA 3T09A 3ZOAA 2DRYA 4PUDA 3CLWA 3GBDA 3BAWA 1NARA 4ATDA 2G3IA 2CKRA 4AZ5A 1V3HA 2E9LA 4OJYA 3SUUA 4QLKA 4X0VA 1J0ZA 4OOUA 1WE5A 2DQXA 2O9RA 1Q4NX 1F31A 3FJ8A 1EDQA 3AICA 1FOBA 3RSJA 3SCUA 5BVPI 2EPMX 1CECA 1UQYA 4GI9A 1HJWA 1AF9A 1GORA 2J62A 3MUZ1 2JIWA 3WH9A 1GQJA 4I1BA 3I3BA 5LYRA 4CJMA 3AZTA 4TVUA 1EPWA 1E6PA 2QMKA 3VIOA 4CN6A 3ZJ6A 3DYMA 3TP4A 3WD2A 1N82A 2YL6A 4M24A 1WB0A 1DWIM 1YTOA 3NSXA 1WBAA 1J0SA 4W8BA 1JT4A 3AMGA 3BH4A 5FOOA 3A22A 3WH8A 5FL1A 4KGJA 3OGGA 1JD7A 1KFWA 4RL3A 5CXPA 2E40A 4JKMA 3WELA 1XYFA 3BSGA 1BPLB 4XFUA 4EFPA 1C91A 1V08A 3H6RB 1QBBA 4MDPA 2ZWZA 2YDRA 1E56A 3VDHA 3FJIA 1NH6A 3QOMA 3SCRA 1OIFA 4CU6A 1GQIA 2K4AB 4CU7A 1HCDA 1KXQA 1VAHA 5D61A 4AZGA 5HPOA 3F5LA 2NYYA 4AN7B 3K1XA 1FP8A 1LL6A 3ARPA 3WMVA 1E1FA 2GDUA 2XM1A 3ZT5A 2DH3A 3AH4A 2WMJA 4FLSA 1QQKA 4JCMA 1GOIA 3G6MA 1A8DA 1J10A 4C7GA 4TVCA 1TR1A 1VCLA 3MUAA 1FMMS 3F1RA 4DUVA 1Q03A 4I4PA 3FAWA 1WDSA 2F61A 2WVSA 4HZ8A 3AKIA 4S3JA 3UD7A 2ZX5A 1UPSA 3L4XA 3OLEA 1C7SA 1LQ0A 2X0YA 1WKYA 3T2OA 3W81A 2AMGA 1D2KA 2VL4A 2C7FA 1ISWA 4Q22A 2Y8VA 4OIFA 2D23A 3HALA 2A3HA 4PUEA 3VILA 2AQZA 3RTIB 3NUKA 5EFFA 1QNSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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