1ISWA

Crystal structure of xylanase from streptomyces olivaceoviridis e-86 complexed with xylobiose
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
436
structure length
436
Chain Sequence
AESTLGAAAAQSGRYFGTAIASGKLGDSAYTTIASREFNMVTAENEMKIDATEPQRGQFNFSAGDRVYNWAVQNGKQVRGHTLAWHSQQPGWMQSLSGSTLRQAMIDHINGVMGHYKGKIAQWDVVNEAFSDDGSGGRRDSNLQRTGNDWIEVAFRTARAADPAAKLCYNDYNIENWTWAKTQGVYNMVRDFKQRGVPIDCVGFQSHFNSGSPYNSNFRTTLQNFAALGVDVAITELDIQGASSSTYAAVTNDCLAVSRCLGITVWGVRDTDSWRSGDTPLLFNGDGSKKAAYTAVLNALNGGSSTPPPSGGGQIKGVGSGRCLDVPNASTTDGTQVQLYDCHSATNQQWTYTDAGELRVYGDKCLDAAGTGNGTKVQIYSCWGGDNQKWRLNSDGSIVGVQSGLCLDAVGGGTANGTLIQLYSCSNGSNQRWTRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords endo-1,4-beta-D-xylanase
publication title Crystal structures of the sugar complexes of Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase: sugar binding structure of the family 13 carbohydrate binding module.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces olivaceoviridis
total genus 169
structure length 436
sequence length 436
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2001-12-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00331 Glyco_hydro_10 Glycosyl hydrolase family 10
A PF00652 Ricin_B_lectin Ricin-type beta-trefoil lectin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 1iswA01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1iswA02
5A2AA 4D72A 4I8MA 1XZZA 4PBGA 3UDAA 5CG0A 4JP0A 1JGIA 1EO7A 1QI2A 4B16A 1YQ2A 2E9BA 4I37A 4P0LA 1GZJA 2XGBA 4HA2A 5HPZA 3WQWA 5A3HA 2GK1B 1E40A 3WBAA 1IJTA 1DEDA 1JQZA 1QVBA 3MV01 2G8ZA 1E43A 1PEZA 2D0HA 2CEQA 1FP8A 1XH1A 3W53A 3AMLA 4GP0A 1E5NA 1EYLA 1UWIA 3ECQA 2AAAA 5JUVA 3VILA 1ZJBA 2DRYA 1W9PA 1KBBA 4QLKA 5A6MA 4L4OA 1LWHA 5D8WA 5BOWA 3FJFA 3A47A 1XYZA 2X0HA 3WH7A 4QLJA 2CIPA 1EH9A 4P8WA 3VWCA 4J28A 1J0HA 1E4MM 2G3IA 2MC2A 1Q6CA 3F5KA 2XVLA 3FUQA 3AMGA 2C8NA 3CZLA 3JRRA 3L4VA 4J3VA 4P7NA 1V6VA 3WQ8A 1UOKA 3CO4A 1BTCA 1LG1A 4N0RA 3QYDA 1DLLA 2ESCA 3CZKA 1TFVA 1M2TB 2V5DA 1MWOA 2KI4A 3TONA 2XGIA 3FW6A 1OD8A 2WRYA 2VJXA 1BFCA 3PZGA 4UFHA 1W1PA 3IJ7A 1HJVA 3BRFA 2D7RA 3WNOA 2D23A 1W3HA 3AS0A 4UOQA 5BWFA 4G1RA 3W9TA 4U2ZA 1JZ6A 1UR1A 4W89A 1CGXA 3N0KA 1ZB5A 1CZ1A 4DWSB 2XFRA 3FJAA 2CKRA 2ZQNA 1BG4A 4ZOTA 1WB0A 4CD5A 1L2HA 2WMIB 2J8FA 3PTKA 5BXPA 4AEEA 1NWRA 1KCKA 1PX4A 3AXXA 4GZIA 3AI0A 4IONA 4JFVA 4LYQA 2NT0A 1SZ6B 1IHKA 1HVQA 4AZHA 4UTFA 4QP0A 4USOA 3HMYA 3PZTA 2IUZA 5A8OA 4HOZA 1QNPA 4L4HA 3CTTA 1KFWA 2MLLB 3G6MA 4CVUA 4LO2A 4EKJA 4DCKC 1LQ0A 2BY1A 2VRKA 2WMGA 3WL1A 4AZ5A 4U3AA 1Z32X 3FNDA 5I6SA 2F2HA 4BQ4A 3BAIA 2V3DA 3CU1B 3WUGA 1SR4C 4LO7B 1E5JA 1EXPA 1GVYA 2UY2A 4PTVA 4GZEA 3SURA 2V3GA 3FFZA 4MB1A 2Y9FA 4N42A 3RMXA 4YHEA 1E9LA 3U7VA 2WVSA 3MKKA 4G9MA 2PI6A 4WLCA 1G82A 2DT2A 4XZWA 4KEKA 3W37A 2FH6A 4CCEA 1UD4A 2YLLA 3H6QA 3UJ0A 3WH5A 1PC8B 1CEOA 4ENDA 5A8MA 1H5VA 4YOLA 4OEFA 5E70A 1HCDA 1HL8A 4PSPA 4AC1X 4ATWA 1EPWA 3N1AA 4HP5A 2BY3A 2E4MC 3HN3A 5I1BA 3L4WA 2HWAA 4KRUA 3CA6A 4PRWA 3N11A 4PUEA 1JZ4A 4QC4A 2FHFA 1W1TA 4JIEA 4LYRA 1AVXB 3ALFA 1I1XA 1WE5A 4JCLA 1BGGA 1B3VA 2XFYA 3CMJA 3BAXA 1OWQA 2E40A 3T09A 1RMLA 1SMDA 1BHGA 1JI1A 1W9VA 3ZSSA 1ZU8A 2BY0A 1IV8A 3W82A 4G9NA 2WHLA 1Z4SA 1EOKA 3IM6A 4R27A 4KBBA 3FHQA 7TAAA 3D7WB 1KXTA 4UR9A 1W91A 3MSDA 3W26A 4B3KA 4PMYA 4TOQA 3PZVA 2VL4A 4R5EA 3I3DA 1K6AA 2XVPA 4EEEB 2PB1A 4B3LA 2BNJA 2WHMA 2YDQA 4OW4A 3I2XA 4A7ZA 1I1EA 3VX1A 3O6AA 2WB5A 5GNYA 1IZKA 2JIEA 1UWUA 1J0KA 1QHPA 3IK2A 5F7UA 3CGTA 3WDIA 1G9BA 3UESA 4ML4A 3QHOA 2YL6A 4GKLA 4X38A 1UR4A 1V3JA 2MIBA 4OBSA 1HNYA 4HZ7A 3NSNA 3UERA 4W7VA 1E0WA 3M7SA 3IIRA 4URIA 2JIWA 1I75A 1B1YA 3ZC8A 3H6RA 3NBCA 3T0DA 4EB2B 3OGGA 1U2YA 5CPQA 3FGMA 1KGWA 3RM4A 5DEZA 3SUUA 3O4BA 1CDGA 3OGFA 3B9AA 3CPUA 4W5ZA 5DT5A 1W2PA 7A3HA 1EV2A 2CBJA 8A3HA 2WW5A 3AMCA 2J78A 2VR5A 4LPCA 3I2AA 3B9UA 4UQEA 3SNVA 3BAQA 4JZ5A 1ODUA 4ACYA 5BRPA 3N7MA 1WNOA 4DENA 4GAIA 1XHGA 4HZ8A 5EBAA 2D3LA 2VX5A 4P8XA 4UQDA 3WUBA 2WZIA 1OQLB 3FJ9A 1SYTA 2W61A 3OJ2A 2BVTA 3T08A 4ZE4A 1CGWA 3EDEA 4LO1C 1XCXA 1JT7A 5BP5C 4WKHA 7CGTA 1AQ0A 1ZS2A 2J7EA 3JUGA 4OWLA 2XG9A 2XM2A 3SCOA 3VUOA 4JFTA 1PUMB 3AICA 3WINA 2OWWA 1NQ6A 1PX3A 2RGMA 4QKSA 3UCQA 1FN0A 5DSSB 1HWNB 4AZIA 2C0HA 2XFFA 1YYNA 4PTMA 2NW0A 1GNXA 1ABRB 4U5KA 5I0DA 3GBDA 4C7FA 3VIIA 3WO4A 3MUIA 5FKYA 4DWSC 2VC9A 5D9MA 1R7AA 1RG8A 2W91A 3O5WB 1V02E 4F79A 1LL7A 5JBDA 1KR0A 1E6SM 3VD5A 2WCGA 3DYPA 1H4PA 1ZBWA 1HN1A 2CITA 1CGUA 2VUAA 1QQKA 3KZSA 3VDAA 4D6GA 5AC5A 1BLIA 5FZUA 1IOBA 3OBTA 1E56A 4P7RA 1Y7VA 2V3FA 3S2CA 2VVSA 1QHOA 5FD0A 3OB8A 5HDRA 2XSAA 4Q9PA 4M81A 3SCRA 4BQ5A 4I0YA 1B9ZA 1ISXA 3OGVA 2XJ7A 1V6WA 1YBIA 2Q8XA 2D0GA 2QMKA 4MADA 4AD3A 3WDPP 2XOAA 1TVPA 5EB8A 2V3EA 3TP4A 3PTQA 4WSKA 3O49A 4AZCA 3V79C 3CUHA 1J01A 4LO7C 4AN6A 1Q4NX 1GJUA 3ARYA 4Y7EA 1US2A 2HW9A 3T2OA 2JEPA 4BZYA 3ZX7A 1B0IA 2D20A 1VBUA 4C7DA 3WD0A 4J3UA 2VRJA 3B9DA 1CLVA 3AISA 3AIEA 4PMUA 1DWIM 4OWKA 2X2YA 3QR3A 3O4AA 3QR5A 2VO5A 3DYMA 3FUOA 1G9AA 1F4HA 4CU8A 4FVVA 5M17A 2WLYA 1J12A 3FJ8A 2DIJA 1VCLA 2DT0A 4WIWA 1C93A 1EHNA 1H11A 4H41A 3Q7YA 3WDHA 2ZWZA 3AOFA 3M6DA 5E0FA 3OBRA 4PC4A 3CUGA 4GQRA 2OYLA 3D3AA 2J4GA 3TOPA 3FJBA 4W87A 1FMZA 1PZ2A 3OZOA 3N9KA 3QHMA 1DWAM 1MW1A 2BHZA 3AJ5A 3UD8A 1HJWA 1FQ9A 1DZCA 2QLYA 3BA4A 3WY1A 1LG2A 2WPGA 3CHEA 5GPRA 3OIHA 2G3JA 2J79A 3BAOA 1M04A 2WBKA 3HMCA 3I3EA 4M1RA 5M3WA 2GJPA 1OCQA 4NI3A 3WD2A 1ZBVA 2ZR1B 4Z2KA 1MXDA 4QCEA 1C91A 5HOSA 3ZOAA 3VMPA 1WBAA 2AQZA 4QBVA 1QNSA 2P23A 2ZUTA 4RL3A 3UD7A 4ISRA 1R8OA 1W9DM 1KR1A 1MW2A 3A21A 1HJXA 2XYLA 3MUZ1 5C70A 1KXVA 1Q03A 4OJYA 5BQUA 2VOTA 4M24A 4DEPA 1QNRA 2W63A 3WENA 2D44A 5GNXA 3JUTA 1BA7A 8I1BA 3T2PA 3FJHA 1CWYA 3ARUA 1PIFA 2QF8A 2G3NA 2Y9GA 4DWSD 3LPGA 2YA2A 1BQCA 1TTUA 4J2SA 1CGVA 4WJXA 4S3KA 4MTVA 1TA3A 5A6AA 4P6AA 2DS0A 3BTAA 1TVNA 4AIOA 4I4XA 3WQ4A 3DECA 3K46A 2E9LA 1BYDA 2W62A 1NP2A 2VZUA 3AS3A 1UG6A 4BF7A 1MXGA 4PYSA 1Z2VA 4F66A 3AYRA 4UFIA 1VBRA 1UR2A 1GUVA 2DSZA 2ZWYA 4BS0A 1CIUA 2GJXA 4UFMA 3SUTA 4M29A 3VKKA 3WD3A 3MUY1 2VTFA 4GI6A 3OZPA 4LO8B 4DUVA 4I4OA 5CPTA 1C8XA 1G1YA 1UR9A 3II1A 5A8QA 2CERA 1S0DA 3MV11 1MQRA 1S0FA 1G9CA 4J2XA 1OGGA 1UR8A 2IXVA 5FL0A 3T0AA 4QD2B 2FGZA 4JHZA 4CCDA 1MQQA 1XYFA 1TMQA 1UZ1A 4J3TA 4JL1A 1J0IA 2HVMA 7I1BA 5A6BA 1W9XA 4IQPA 3A23A 2EPNA 5JBFA 1JIBA 3CHDA 2F2FA 4HTYA 4YN5A 2CBUA 1GW1A 1VJZA 4CU7A 2FFVA 3AFBA 3O3QA 1BVZA 3CRGA 1JDAA 3PZIA 3K1XA 2BS9A 4U5IA 3MALA 3AIWA 1FH8A 2J77A 2PWHA 4BA0A 3SCUA 2DGAA 2KI6B 1UKPA 1UQZA 1Q04A 2O9OA 2AXMA 1CXKA 3A3HA 2YDSA 3A4WA 3W24A 1EDGA 4X0VA 1UD6A 2YBTA 4QKRA 3IAGC 3OLGA 2RQ9A 3RJXA 4TTGA 4JKLA 2VX7A 4FMVA 2Y9WC 4J27A 4IUGA 5ABEA 2Y24A 3PZQA 4USPA 5I3DA 1LF1A 2QN4A 1TWEA 3BCDA 1KWGA 3AZTA 4HOWA 1KXHA 4CU6A 1FWUA 2VCCA 2BHUA 4JPZA 1VAHA 3I29B 3BX1C 1PIGA 5LA0A 4P0KA 4H7VA 4QBCA 3L4YA 1IT0A 4XV0A 3ZXGA 4I1BA 2WC4A 1EQCA 2ZUVA 1WO2A 3VM7A 5DUYA 3SIMA 4J7RA 2FO1A 2ZXDA 2DQXA 4FGFA 3NBNA 2WC7A 4ZKTB 2J7FA 5D62A 2GUYA 3BLKA 4R6UB 3HOMA 3HSMA 1QHZA 4KWUA 4PMOA 5CGTA 1CE7B 3AIBA 2D7IA 3AKIA 1UH4A 2ZUUA 1E73M 5CGMA 5ABFA 1W9UA 1M53A 3LTQA 3ZR5A 2WSPA 1S0LA 1EVTA 1RPKA 4LO0C 2J7BA 3GXMA 4OEEA 1ITBA 1JAEA 3MUAA 3WN6A 4OOZA 5F8WA 1G9DA 4JL2A 2OWXA 1WKYA 2ZOXA 1C7SA 1BYBA 1J18A 1WAWA 2BV9A 1RD6A 1TIEA 3AMKA 4D1JA 4IPLA 4XX6A 1TZ7A 4C7GA 1KGXA 2D3NA 3W28A 5I2UA 3ARSA 1EOMA 2Y2WA 2ESUA 1VIWA 4JCMA 1DWFM 4MAZA 1HL9A 3ZT5A 4UCFA 3VINA 3HU7A 2X1IA 1C7TA 3WNKA 2ZX9A 3V0BA 3BCFA 3VT1A 3VIOA 3VM5A 2ZUSA 4ATDA 2CYGA 1V3IA 3RDKA 2JE8A 3K4DA 5BXRA 4RE3A 1CXIA 4CGTA 1I1BA 4UFKA 3V0AA 1B31A 3EBVA 1UA3A 2BY2A 5CPSA 2J7CA 4CD7A 3FJIA 3L4UA 1RZOB 5A69A 2VT0A 2WANA 5LA2A 1JYVA 1QNQA 4W5UA 3U57A 6I1BA 1DWGM 2BHYA 3WNNA 4JFSA 3W29A 2K43A 4J2KA 4D6HA 1E72M 3NUKA 4OKDA 2A3BA 4AD2A 1II4A 1JZ2A 3WUEA 4I6IA 3SCTA 3N7LA 2X05A 5I77A 2QHAA 1E55A 1C3FA 1QBBA 3TTYA 4AD5A 1UKTA 2O92A 2NSXA 2W4XA 4PN2A 3AYSA 4HMDA 4M8UA 1UD5A 3NBDA 2DSVA 1HIBA 3EMQA 2ET2A 3VGFA 1A47A 1J0YA 2VCBA 1D0HA 1T9FA 4NRRA 4KEJA 1D3CA 5EC5A 4FK9A 3D5HA 3V0AB 2EBNA 2XVNA 3M46A 1UA7A 3MMWA 3NIYA 3S8KA 4KEIA 2GDVA 5JMCA 3GXFA 2RGLA 4W84A 5FZZA 2VXTI 3Q7XA 2CCRA 2UY5A 1H1NA 4D0TA 4EK7A 1E0OA 5B2HA 4QD2C 1HP4A 3WF2A 4TUFA 4A7YA 3ZJ8A 5AC4A 1WD3A 2WK2A 3VEQA 1QPKA 4QFUA 2WZHA 2DT1A 2XWDA 2C7FA 4MB5A 4PMVA 4XZBA 1PWAA 1D2KA 2DEPA 5GQBA 4X9YA 1LLOA 3WMVA 2E3ZA 4F34A 2G3MA 3LLPA 4DM2A 5CQ1A 3VTRA 1W1VA 4NZCA 1QBAA 4XKIA 2DSKA 1VFOA 3VD4A 1JG9A 3RCNA 1W9BM 1QW8A 4PMQA 4DM1A 2F61A 4ATLA 4XUYA 4EFQA 1XRVA 3EDDA 4CKQA 2WVVA 4OUJA 2ZX6A 1H0GA 1V0KA 1VEMA 3AMDA 4GIAA 3IJ8A 5HPCA 1JTCA 2QPUA 3WEOA 3ARRA 1E4IA 1JD9A 3SCQA 4AEFA 1FV2A 3KL0A 3PTMA 1WDSA 1NH6A 3MMUA 1UZ4A 2PWFA 2VZVA 1BSIA 1JZ7A 2F2FC 2HZ9A 2VSEA 1G94A 2WSKA 3K8KA 4AMCA 1XCWA 2D0FA 2XIBA 4IM4A 4GO8A 2F8QA 1UWSA 4W7UA 2YLAA 3FHAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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