3N7JA

Crystal structure of botulinum neurotoxin serotype d binding domain
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
415
structure length
405
Chain Sequence
NSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYAQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords Botulinum neurotoxin type D
publication title Identification of a Unique Ganglioside Binding Loop within Botulinum Neurotoxins C and D-SA .
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 94
structure length 405
sequence length 415
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2010-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3n7jA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3n7jA02
2ZR1B 2WJSA 3C2UA 4Y1YA 5IUQA 2ZMLA 2ZA9A 1LEDA 1R8OA 2FFUA 1E0OA 5DUWA 1MS8A 2WT0A 2Y9XE 2KI6B 4GWNA 1YYNA 1PZ9A 4JKQA 4LBQA 1FWUA 3O44A 1DZDA 1M16A 4JPZA 3VT1A 5GZFA 1C1FA 1B09A 4QKSA 1G7YA 4RA0A 5CB7A 3H6RB 2SBAA 1NXD1 2VXTI 1GGPB 2BFHA 2GNTA 1ULDA 3VV1A 4H04A 4XDQA 4XMAA 3CA3A 2CWSA 1S0FA 2E7QA 4FOVA 3WDVA 5BVPI 3O0WA 2A6XA 4J2YA 1EPWA 2GMMA 1MVEA 1WD3A 5H9RA 3BAOA 3CA4A 4R9AA 3JU9A 1JT5A 4WBCA 3OJ2A 1GSLA 1V6OA 3ZPYA 1MS4A 4DS0A 21BIA 4YZ3A 1LGBA 2R1BA 1W6PB 2R0HA 2WNEA 1GANA 5F8YA 2D44A 3UJQA 2KM2A 2P23A 4YGBA 4LBJA 4LO3A 1Z0HA 3WG2A 5IK5A 5F9TA 1LU1A 4Q9GA 5EXOA 2JE9A 1MS0A 3AXDA 2NM1A 1PC8B 5F5QA 1YBIA 1N1VA 3ZSJA 3ZXLA 4P14A 3HALA 1ISVA 3RQ0A 4XIKA 2ARXA 4ZFUB 4OEFA 4XYXA 2ZQOA 4Y1VA 3FFZA 1F31A 4FVVA 2EF6A 3VT2A 2D3SA 1O4ZA 3ILFA 2UUSA 2YZ4A 1BFGA 3N35A 2ZGOA 1UX6A 5BYNA 4ZBVB 4FQZA 2D7FA 3OGFA 3SNMA 2ZACA 8I1BA 2UURA 1G8WA 1WUVA 4U36A 1GZCA 3HN1A 1W6MA 4I2SA 4L4IA 3FJ8A 5DXDA 1OQ1A 4OWKA 2QN4A 4LBLA 3O4AA 1IRPA 2ZKNA 3BA4A 2DU0A 3BB2A 1MACA 4IY8A 3MALA 3WINC 1QOSA 2WLQA 1SBFA 1LOFA 3CRGA 3IMNA 3B3QE 3KQRA 1EVTA 1WW4A 2BQPA 5DVHA 1QXMA 4K1ZA 2G4IA 1IOBA 1IHKA 3V0BA 2P39A 3AYAA 4LBKA 3F62B 2OUHA 4OEEA 4BOWA 2ERMA 5GZGA 1HKNA 3ZSLA 3USUB 1L2HA 4X37A 1DBNA 4I0YA 4XJWA 3A0KA 5DZFA 5JOZA 1J1TA 1JT4A 1VCLA 3A07A 2AH2A 3M2MA 1V6XA 3AKGA 1FQ9A 5E24E 5FNXA 4BM8A 3WG4A 3ZYPA 4P9XA 4R9DA 1YI7A 5HCAA 4CJMA 1J0SA 5GZDA 1IKQA 4YGDA 1RINA 2BEAA 5DZUA 1HWNB 1M2TB 3D7WB 2DUQA 3IPVB 3NV1A 4FPJA 4DPNA 2FMDA 4A7YA 4ASMB 3VSFA 1ULGA 5LK5A 4P0KA 3ZC9A 5GLWA 3W58A 4FPYA 5GZEA 5G00A 2JJ6A 1DQ4A 4LO3C 2AENA 5GALA 1MZ5A 4XTPA 5T52A 5JDBA 3D4KA 1FAYA 1VAVA 4QD2B 4MYEA 1IOAA 1ZA4A 1MS3A 1HCEA 5GM0A 4M3CA 4JRAA 3O49A 3IM5A 4LO0A 1V6LA 3AYEA 4OWLA 2NYYA 3WUCA 5T5JA 5EHAA 3IAGC 4FPLA 5T5OA 2WT1A 3WNXA 1A8DA 1CVNA 3FJDA 2P2KA 1Z78A 3FJFA 2ERFA 1F9KA 2HZ9A 1S0BA 5T54A 1BKZA 1GICA 3INAA 1UKGA 3AJ5A 3B01A 4LO7C 1GBGA 1ISXA 4DFSA 4GA9A 3QLQA 5T5LA 3RTIB 1TWMA 3POYA 1WW5A 2OW4A 4XJ9A 1DFCA 2ZMNA 1FNYA 3CRHA 5IT6A 1ENSA 3L2YA 1JLYA 2CNAA 4X39A 4HR6C 2NVHA 1LHOA 1N1SA 4SLIA 1QQLA 1V6VA 1YF8B 4I4RA 4LBMA 4FOWA 3FJIA 1XHBA 1LJ7A 3PVNA 3HBWA 3N7LA 3HR9A 3FLRA 1JW6A 1AVXB 3U4XA 4AN7B 1S0GA 5CBLA 1FN0A 4AGGA 1AJOA 1BFBA 4YG3A 2VLCA 1MR5A 2JECA 1AF9A 1DGLA 2A70A 3T2TA 2DYCA 4JAWA 2CL2A 1ULCA 1JOJA 1JTCA 1WLWA 3AFKA 3PVOA 3PVEA 3WDUA 2QYIB 3CAHA 4W65A 1HWOB 2GNBA 5EWSA 1HQWA 3WMVA 1X50A 2DV9A 3RRDA 3AP7A 1F5FA 4I4PA 1TTUA 3WUDA 2LIQA 5E8AA 4I1EA 4Z8SB 1IRAX 4YZ4A 2DUOA 1V00A 1FV3A 1RIRA 1AVAC 4U2AA 2Q9XA 3ILNA 3AKHA 2R49A 3WO3A 1CPMA 4I30A 4YZ1A 1N47A 4YW5A 5HCBA 1BFCA 3AP6A 4YM2A 1VALA 1GZWB 2GNMA 5GZCA 3QCWA 1K5VA 1AFCA 1G9CA 4YGCA 2W68A 2UWAA 4DQAA 2ZMKA 1TOOA 2B7YA 2AUYA 4ATEA 4A7KA 1SBEA 2KI4A 5BXRA 1ABRB 4FGFA 1UAIA 3AKIA 1TFMB 1LEMA 3WDYA 2MLLB 3JUTA 2CY6A 2P3JA 4OZXA 2RHPA 3WDTA 1KDKA 4GP3A 4I7IA 1SLIA 1UMZA 2AYHA 3OYWB 4IY9A 4LBQB 2RSTA 1JQZA 5FRAA 4IHZA 2DVGA 5JLVA 3T1MA 1UZYA 2HWMA 3WINA 1HLCA 4GWMA 3Q7XA 4XBLA 4I4SA 2D6NA 2EAKA 5GLTA 2A3WA 3DGTA 1CE7B 1SLTA 4X38A 1Z4SA 1AXZA 3AZVA 3OBTA 2JE7A 1AVBA 2RQ9A 2ESUA 5D61A 4UW4A 3I2XA 1AX0A 3N7MA 1RMLA 3NJ5A 2XB6C 4M3CE 1LU2A 4D69A 3MW4A 2YV8A 4XHXA 4XMIA 4YFWA 3VUOA 4XILA 3FJBA 1WBCA 1Q1UA 1GNZA 2AAIB 3FLTA 3FBYA 4XXPA 2HW9A 2ZGLA 4XBNA 5DUXA 4YFZA 5H9PA 3NV4A 4L8QA 1SCSA 4I4QA 5KXDA 1ONAA 1BARA 4GP0A 3OY8B 4F83A 3NBEA 3ILRA 3IM7A 5FREA 2ZHNA 3GALA 3WDWA 4EEEB 1TP0A 4JC1A 1NUNA 3B9UA 1T4QA 1SLAA 2D7RA 4ZA3B 1V6KA 2IHOA 4JKXB 1RITA 3UL2A 3GNEA 4XJAA 3OGGA 3BA5A 2K43A 3JRRA 4GOVA 4ZFWB 3ZYRA 1RY7A 2TEPA 4GKXA 1FGAA 3IKWA 3HMYA 2OUJA 3ZXDA 2DS0A 1W6NB 1N1YA 4CZSA 4FQ4A 5KXEA 1G9DA 3AK0A 1N3OA 4OW4A 1G82A 1CVSA 3O5WB 4LBNA 3V0AA 4I8MA 1LODA 2A71A 3BAVA 1SLCA 4TZDA 4BPZA 3M3OA 4YOLA 1QMJA 5JOYA 1APNA 1WBLA 1AVUA 1MZ6A 3QYDA 2HYKA 2WSVA 4J2SA 3VWCA 2NZ9A 4Y1XA 4Z8BA 5E88A 3H6RA 1QU0A 1N4KA 4ZKTB 9ILBA 4Y1ZA 3CQAA 1Q8PA 3AP5A 3NV3A 4YLZA 3UD9A 4OWJA 5FZUA 1FV2A 3WLUA 1FNZA 1V6IA 3DUIA 4FPKA 4Q2FA 3SH5A 1TEIA 4K21A 4M3CF 2WSUA 4J23B 1FATA 1S1AA 3EF2A 3FGMA 2AGSA 4YZ2A 1GNHA 4Y20B 1I1BA 1S0JA 1A3KA 4HANA 1W6PA 4XJUA 1SR4C 3B00A 4XFSA 2DURA 2E6VA 2PELA 5DUVA 3A23A 5BXSA 4FPFA 1I1EA 2X2SA 1VIWB 4KBBA 3WOGA 4II0A 3AKFA 2KLLA 3PHZA 1DQ1A 2K8RA 4J2XA 3AJYA 2FHRA 5DUYA 3LLPA 4XFUA 3O4DA 3WMUA 4XBQA 1DYPA 1BFFA 3BRFA 1LESA 4PBOA 1SCRA 2ZABA 4Y24A 3FJKA 5DG2A 2YMZA 1W3FA 1W0OA 5SV8A 3BIWE 1IS3A 1EV2A 1KITA 2P37A 3B9CA 1QDCA 4I4XA 1BQPA 4XXAA 3WHTA 2NMOA 2HWAA 5EC5A 4YM1A 4LO2A 2Y9WC 4I4OA 1ONKB 1N3PA 2C5DA 2ZZJA 1G9AA 1W3AA 1WCSA 1W6QA 5CA6A 2NTDA 2PHUA 3ZXGA 2VXRA 1CIWA 2GN3A 1H9WA 3AZWA 3I8TA 2JDZA 2CWMA 4A7ZA 2LTNA 4YG0A 3UD8A 2A6VA 4AVSA 5BQUA 5KXBA 2PHXA 1IJTA 1LOCA 1O4YA 1YTOA 3CA6A 1XZZA 1H30A 2VW1A 2LIEA 4FOQA 3Q7YA 5FNWA 3RMYA 3USUA 3N7JA 1HIBA 2DU1A 3WV6A 2PHFA 3POKA 5L73A 1AX2A 3UJOA 4D0TA 3APBA 2ZAAA 3E8LC 3SITA 3SLIA 3WZ1A 1I3HA 1NZKA 3WHUA 5EG6C 4G9MA 5IK7A 2AXMA 4OEGA 2DTYA 5IK8A 1CJPA 3N3HA 2VSEA 5IK4A 1DFQA 1DQ0A 3OBRA 2UWCA 3S8JA 1S0EA 2A7AA 2D6PA 3IPVA 5DSSB 5EYYA 1MS1A 2I2SA 3O5SA 1JHNA 2Z48A 3A0NA 1JY0A 4Q8KA 2P3KA 3AJ6A 3RSJA 1Z2VA 4FPOB 1PWAA 3A21A 3CU1B 3T1LA 3BAUA 4EFRA 2LALA 5BP5C 1URXA 4FPHA 5GLZA 1VLNA 1FYUA 1UZZA 3P53A 4Y22A 4AN6A 3V65A 1GKBA 5EYXA 4AGVA 3KMVA 1D0HA 2E4MA 4I4UA 2DRYA 3N0KA 2YXSA 2D23A 1FWVA 1LOBA 3BRDA 3NV2A 2F2FC 2DVAA 1KRIA 4FPEA 4Z9WB 3BA7A 1AJKA 2VH9A 3AZZA 3FUOA 4P0JA 1FMZA 2ZGNA 1RZOB 4QBVA 3BX1C 4HA2A 1SZ6B 5JVVA 3OJVA 3W59A 3V64A 4CRQA 1SLBA 2ZGUA 2A3XA 3O4CA 5DZGA 2GO2A 3FJ9A 1WD4A 1LOAA 3FJAA 1JLXA 5T5PA 4LO2C 1QGLA 4XE9A 3QR5A 5AVAA 4BMBA 1QQKA 3RS6A 4G6MA 4ISRA 2V73A 5F90A 4EFQA 3H0OA 1KNMA 3K1XA 2W39A 2F8XC 4ISQA 3PG0A 3H6QA 2P34A 4K1YA 2WBCA 2AFGA 4LBOA 1DQ2A 2GMPA 2JD4A 2D43A 3IIRA 2FFVA 2W52A 1MS5A 1EYLA 3HSMA 2ZGSA 2XOAA 3FLPA 2NN8A 1JN2P 1QKQA 2EXKA 3A22A 4XJ8A 5BQUC 41BIA 1DQOA 2SLIA 4UW6A 4TYSA 4WZFA 5FZYA 2GNDA 1LOEA 2D22A 1SBDA 5FZZA 1DQGA 1V6MA 4BMEA 1LHVA 3O12A 1LGCA 3WCSA 4YM3A 4Q27A 5DUUA 4Q8LA 2NP0A 4LO1A 2I1BA 2ZHLA 1ISYA 4I6IA 1WLCA 2VUAA 4BLJA 4ATFA 2Q5TA 4J2KA 1SACA 3AH4A 4YW3A 1Q56A 3F1RA 2GALA 1W6OA 1SR4A 1WBFA 3VSZA 3WDXA 3H6SE 5HPZA 3SH3A 4ZOTA 1IKPA 3O4BA 3NBNA 4Q1PA 3JUUA 1FX5A 3AP9A 1OQLB 4QALA 3NWKA 4XTMA 3TC2A 1GZWA 1AZDA 2DTWA 4YW1A 5JOXA 3AH1A 3WCRA 1W0PA 3M1HA 3FUQA 4RL7A 1LHNA 3RTJB 3ZXFA 5DZEA 3BTAA 2D6MA 3OJBA 1CN1A 4QD2C 1JT7A 3UJ4A 4HJJA 4F34A 3Q7WA 3D6EA 2E4MC 4DRVA 4C1WA 4QKRA 4K20A 4Y1UA 1DJSB 1ZM1A 3V0AB 3ILAA 2D1ZA 3VEQA 3AZXA 2AREA 4H9WA 3MEPA 2KKIA 1JXNA 3FJCA 2DRZA 3OYWA 2D6KA 1K5UA 2D3PA 2EIGA 4YW2A 1ULEA 2MIBA 2P3IA 3AX4A 4AYUA 4QC4A 5GLVA 1Q8SA 3LSDA 4KC3A 1HKDA 4FP3A 1UN1A 3SH4A 2R9KB 3NBCA 2UU8A 4DENA 4IZEA 1CR7A 1DQ5A 4ZLBB 3FJEA 1V6NA 3CA1A 1PUUB 3ZSKA 4H55A 2ZQNA 4EB2B 6I1BA 5I1BA 1A78A 4IQPA 1TIEA 4LO7B 2VW0A 4XJZA 3VKFC 2WKKA 1W6MB 3R4UA 3Q9OA 4Q26A 4FPCA 3T8SA 3NBDA 3ZXJA 3WG1A 4JQ0A 2WRYA 2D3RA 3N36A 1XG6A 1IILA 2EXHA 2E7TA 1Q8OA 3AZYA 1LGNA 3VKNA 2DREA 2A5ZA 1C1LA 4R9CA 4PBPA 3ZC8A 3OY8A 5GJ6A 1YRZA 3ENRA 4I96A 1BYHA 5BXTA 3AYCA 4D0ZA 3LCPA 1GLHA 2X2TA 3V0BB 4P6AA 2WT2A 4P0LA 4G6JA 4I37A 4LO1C 2ARBA 4PQ9A 1ISWA 2A75A 4BQ1A 1JBCA 4I3NA 3BAGA 1QF3A 2J3PA 4JCKA 1BXHA 1XQNA 1MD6A 1LENA 1BLDA 4R9BA 3ZXKA 3VKMA 4ZFYB 3ASIA 2PHTA 4GAIA 1HWPB 3W9TA 3S8KA 4QBCA 1W6NA 1KQRA 1KJLA 2VSAA 4ITCA 2D24A 5BP5A 1DZCA 1KDMA 2YROA 4LBQD 1UL9A 4PF5A 4YZ5A 1QDOA 3I2AA 2Y9FA 1JT3A 4R6UB 1W6QB 3CA5A 4WVVA 1QNWA 1LHWA 4AGRA 2GZBA 1ISZA 2CTVA 2GDFA 3IM0A 5H9SA 3IN9A 3I4IA 4AVTA 2F2FA 3A4UA 4NOTA 2D7IA 2A6YA 2EALA 5B2HA 4G9NA 2DUPA 1HDKA 4M00A 5CAZA 1QNYA 2ZGTA 3POSA 2Y9GA 1WW7A 4DEPA 1DYKA 4FP2A 3PUBA 2ZHKA 3AXEA 4Q1RA 1C57A 4ZXKA 3V79C 4UW3A 3PJQA 1JYIA 2GMEA 4ZGRB 3ATGA 1MC9A 4M3CB 4IZXA 2DWRA 1ILR1 5JOWA 4Y20A 1ITBA 2PHWA 4XHBA 1V6UA 2AR6A 1IS5A 1D2SA 1WLDA 3WA1A 3BADA 3B69A 2VU9A 2PHRA 3M3CA 4USPA 1BZWA 2A3YA 3AYDA 1V6JA 5CNAA 4Q91A 1QOOA 1HQLA 1OKQA 2R0FA 2VW2A 4YGEA 3ZX7A 2A6WA 1SLLA 3PMEA 1Q8VA 4L4HA 2D6LX 3VKOA 1H9PA 7I1BA 1WBAA 4GALA 1RG8A 1WW6A 1GV9A 2ZGQA 2NMNA 1HWMB 3R05A 4HL0A 5BXPA 4YM0A 3OPZA 1JYCA 5E89A 4KEJA 3M3QA 5BOWA 4UW5A 1MVQA 4WV8A 1DIWA 3LTQA 2KH2A 3IM6A 4NO4A 2XG3A 1LTEA 4TLPA 3UK9A 4IONA 4KEKA 1Q03A 4Y22B 3D5OA 3CNAA 1Q04A 4DRRA 4KEIA 1S0LA 3VT0A 1CONA 4QO3A 2FO1A 2FGFA 1S0IA 1G9BA 1DQ6A 1II4A 2YY1A 2D6OX 2ZHMA 1N3QA 3MW3A 4WVWA 5DG1A 5GLUA 2DVFA 1BLAA 2ZGPA 1QOTA 1HCDA 1R1ZA 2H0BA 1DLLA 1W3GA 3KM5A 1IS6A 1Y7BA 2ENRA 2R16A 2ET2A 3C9ZA 1T9FA 4ENDA 1ENQA 2ZGRA 3ZSMA 4EFPA 2EXIA 1LULA 3WVJA 1AXYA 2OVUA 4XFTA 3UJ0A 2EXJA 3BAHA 3CA0A 1BA7A 1ULFA 2BEBA 1LOFC 1DZQA 3AH2A 1GZ9A 4JP0A 4GAFA 2L5XA 4GKYA 3VKLA 1LCLA 3P6JA 2Q3NB 1LOGA 4USOA 2CYFA 4CTEA 1BASA 3UDAA 1MS9A 1ENRA 4AVVA 3BOPA 3RG0A 3WG3A 4I4VA 4XOGA 4XKIA 1VAMA 3BODA 5D63A 3AJZA 1C4RA 4P9YA 1AVWB 1AXKA 2E51A 3ZXEA 2ZGMA 1LECA 2Z42A 4EKXB 3HOMA 1PUMB 4XZPA 4Y26A 1PZZA 1S0DA 4G1RA 4X3AA 1IS4A 1DHKB 4PCRA 5JMCA 4BLIA 1LHUA 5GAQA 2ES3A 4DCKC 1BJQA 1V6WA 2RG9B 1Q8QA 2M49A 3MPPG 3FJHA 2VY0A 3WO2A 3I29B 1CESA 1N1TA 3BAQA 2ZGKA 3AP4A 3N7KA 3SISA 2K4AB 1W6OB 2IWTB 3SNVA 1JUIA 4FOYA 2WQZC 1KJRA 1OFSA 3O0XA 2A6ZA 2V5YA 1U0AA 4I4YA 1FMMS 3P6IA 3ZVXA 2Z49A 1PZ7A 1TWEA 3TB0A 4GOYA 2ZBJA 4YW4A 1IT0A 3RMXA 4IYBA 2DVDA 3O0VA 31BIA 5H9QA 4Q9PA 4OUJA 2R1DA 1G86A 2UWBA 2E53A 3MW2A 4C1XA 1PZ8A 3BRGC 4LO8B 1YO8A 2AQZA 4AWDA 1GYKA 1CQ9A 1CPNA 3O4OA 3OJMA 4LO0C 3TAYA 2W08A 2MC2A 3R4SA 2FDBM 4M01A 2YUGA 1XYFA 1AXMA 2D20A 5HCFA 1P63A 1YIFA 1G9FA 4YG6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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