3R4UA

Cell entry of botulinum neurotoxin type c is dependent upon interaction with two ganglioside molecules
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
428
structure length
422
Chain Sequence
SMANINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type C1
publication title The biological activity of botulinum neurotoxin type C is dependent upon novel types of ganglioside binding sites.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 99
structure length 422
sequence length 428
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3r4uA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3r4uA02
3L2YA 3B00A 1G82A 4GAIA 1A78A 5KXDA 4JAWA 1W6MA 2E51A 1OFSA 3U4XA 2DUPA 4ATEA 2LIQA 2WT0A 2P39A 1LODA 5IK5A 4FOWA 3D7WB 2NZ9A 4XFSA 4AYUA 2DVFA 1DYKA 1PWAA 1XHBA 4YM1A 1HCEA 3AZYA 1GNHA 4HA2A 1IILA 3BAHA 1DQOA 1W6OA 5E89A 3CA4A 5F8WA 4I37A 2VH9A 1EYLA 3VUOA 1K5UA 2Y9FA 3RQ0A 5EWSA 1PC8B 1J1TA 1RMLA 4JRAA 3AYDA 4AGVA 1WBLA 4GOYA 1ENSA 4Q8LA 2WT1A 3E8LC 4P0JA 5JVVA 1WW7A 2ZGRA 4FPFA 5F5QA 2JE7A 3HR9A 3FJDA 3C2UA 4FOQA 4FPOB 3BODA 3UL2A 2XG3A 1D0HA 4YM0A 1KJRA 4OEGA 4LO8B 1YO8A 4NOTA 1SLBA 3DGTA 1ULCA 1BFBA 1ISYA 4AVTA 4DCKC 5HCAA 2W39A 1LOFC 1UZZA 1DZDA 2E4MA 5BP5C 2WJSA 1DLLA 1F9KA 4XBQA 3AZXA 4FP2A 4XOGA 3C9ZA 5DVHA 2ZHMA 3SH3A 2EXIA 3FJFA 4I7IA 5E8AA 4Y20A 5EYYA 1AXZA 2VSEA 4YW1A 4X38A 1K5VA 1Q8QA 4M3CF 4Y26A 1G9CA 2D6PA 3R4UA 4TLPA 4YG6A 2BEBA 2EALA 4J2YA 3O4AA 4R9BA 3WG2A 1DIWA 3OYWB 3N35A 4USPA 4HR6C 2JECA 2EF6A 4Q2FA 5DUXA 2CWMA 1V6KA 1GZWA 2V5YA 3RMYA 31BIA 1CJPA 3M1HA 1CIWA 3AKIA 5DG1A 2NP0A 2HW9A 1QQLA 4LBMA 4W65A 3N7LA 4I1EA 4GWNA 2GN3A 1IOAA 2VW2A 1S1AA 1Z4SA 3HSMA 3FBYA 2A3WA 5BXTA 2DU1A 4YW4A 1IKQA 1UMZA 1Q8OA 2DREA 3RTJB 1CR7A 3D6EA 4XJZA 2GN7A 2C9AA 2ZGPA 5JOXA 2R1BA 2WQZC 3W9TA 1MC9A 4CRQA 2W68A 1QGLA 2NN8A 2OW4A 1AX0A 3OGGA 3O4BA 5GLVA 2AENA 2GNTA 3IN9A 1DFCA 1DYPA 1KDKA 4Z9WB 1IHKA 1DQ6A 2A6XA 1JW6A 2ERFA 1HKDA 3T2TA 1NLSA 4JC1A 4I1BA 3Q9OA 5DG2A 3FJ9A 2ZGKA 1AFCA 1D2SA 4BMEA 2CY6A 1TEIA 1CPNA 2VLCA 5BQUC 4XJWA 2YXSA 2ET2A 1MR5A 1IS4A 5CA6A 4ISQA 2ESUA 4GKYA 3IIRA 3ENRA 4KC3A 1VALA 4RL7A 3K1XA 1IKPA 2DTYA 2WLQA 5GZEA 2P3KA 3HOMA 3H6RA 3V0AB 4ZA3B 3WDVA 3WINC 1W3GA 2EXJA 3H6SE 3UK9A 3WOGA 3UD9A 2QYIB 4YOLA 1LJ7A 2ZGTA 1S0IA 1LGNA 1QNYA 4FQ4A 1IRPA 2ZKNA 3BRFA 3UJQA 3WUDA 1N1SA 1CVSA 3IM5A 1JQZA 4QO3A 3PVOA 5T5JA 1KRIA 2A5ZA 4XJAA 3WZ1A 3V65A 3WDWA 4GWMA 3OJ2A 5DSSB 5DZUA 1JN2P 1KNMA 2GMMA 2D1ZA 2JD4A 2BEAA 1N47A 2D6KA 2KH2A 3T8SA 3ZXDA 1BQPA 4WVWA 1S0EA 2P34A 4ISRA 4K1ZA 2PHFA 4XYXA 4IZEA 1EV2A 1V6OA 1MS8A 2RHPA 2NVHA 5GAQA 1QDOA 1W6QB 4J2SA 2D3SA 5FZZA 5HCFA 2A7AA 1V6XA 4XIKA 1S0LA 3O0XA 3O5WB 2D44A 4PBPA 1WUVA 1CVNA 21BIA 1IJTA 3IMNA 1LHWA 2DUQA 1FMZA 4R9AA 2PHWA 2K8RA 4Q26A 2KI4A 3IM0A 1HDKA 5GLZA 2E7QA 4BM8A 4LBJA 1G7YA 3ASIA 2XOAA 3JRRA 3FFZA 3POKA 5GLWA 1NXD1 1HWOB 2OUHA 4LBOA 3ILAA 4M3CE 3ILNA 3AZWA 1SR4A 3BADA 1DQ2A 4XHBA 2HZ9A 3FLPA 5IK8A 3BAVA 1LCLA 3WO4A 3AH2A 3RMXA 1LOAA 2ZGNA 3MALA 3ILFA 1KDMA 4NO4A 3I8TA 4I8MA 1AVBA 4XHXA 4LBKA 4I4PA 1M2TB 2A71A 4LBNA 1DQGA 2YROA 3DUIA 3BX1C 4D0TA 1FX5A 5EYXA 1DQ0A 1T4QA 1ISVA 1H9PA 1SFYA 4LBLA 1PZZA 2DURA 3A23A 3S8JA 2W52A 1FNYA 5KXEA 5F8SA 3OJVA 1DJSB 4BOWA 1VCLA 5BOWA 4LBQB 2NMOA 3QYDA 5GALA 3INAA 4YM3A 3AP4A 2LIEA 3ILRA 4IY9A 1SBFA 2GNMA 5JDBA 1N1YA 3N7JA 3BRGC 3WVJA 1R8NA 1W6PB 1W6NA 1JYCA 3RSJA 3NV1A 5DUWA 5GZDA 2DUOA 5BYNA 1KQRA 4DS0A 1WBFA 3F1RA 2V73A 2WBCA 4IY8A 3HMYA 1DQ1A 4YW5A 3B9CA 4XKIA 1LHVA 3WNXA 3NBNA 1N1VA 5JOYA 1FWUA 2GDFA 1WD3A 2GMEA 4XXPA 1GGPB 2YUGA 1RITA 2NYYA 1G9DA 5FZUA 3AXDA 2VXRA 5DZFA 4Y1XA 2K43A 5EC5A 4AGRA 1AXKA 1V6IA 3JUUA 2FFUA 3BAQA 5IT6A 3LLPA 2AGSA 2ERMA 1O4ZA 3ZX7A 4DRRA 2D43A 1ITBA 2BFHA 4ZFUB 1G9AA 5EXOA 5DUYA 3BRDA 1WD4A 4CZSA 1WLDA 5JLVA 4FQZA 2Q5TA 4D69A 3ZYPA 1GNZA 3BAGA 1RIRA 5CBLA 3FJEA 3LSEA 4XMAA 3V0BB 5JMCA 4Q27A 1BA7A 1B09A 4ZKTB 1GSLA 4LO7C 5LK5A 2UU8A 2WKKA 1BFFA 2WSVA 4Y22A 2DVBA 1BZWA 4JKQA 1S0FA 3BA4A 1XZZA 2B7YA 3B3QE 4YW2A 4DEPA 4XE9A 1WW4A 4UW4A 1C1LA 1AX1A 4C1XA 5EG6C 4I0YA 2P3IA 3POYA 1MVQA 3I29B 1QDCA 1V6LA 4P0KA 2M49A 2Y9GA 3WHUA 3AJZA 2PHUA 2ZQNA 5H9SA 4A7YA 5T54A 4J23B 5E24E 1BJQA 3AP9A 3O0WA 2ES3A 3V64A 3O5SA 3O3QA 3FJ8A 1W3FA 4KEIA 2E4MC 5BP5A 2GALA 2DU0A 3A0NA 3VT0A 4LBQD 4EEEB 2R1DA 3OJBA 1MS4A 4FGFA 2PELA 5BXSA 4I96A 2C5DA 3PG0A 1E0OA 1KITA 3IAGC 5F8YA 1GZ9A 4OWLA 4Y1YA 1GBGA 3BOPA 4ZLBB 3AJYA 1O4YA 4J2KA 3TC2A 3A4UA 1AVAC 4KBBA 1QF3A 3FJKA 2A3YA 2HWMA 2FGFA 4FOVA 3BB2A 4DPNA 4U36A 2UWAA 3SH5A 3UDAA 2ZGUA 1HQWA 3A22A 5GLTA 1QKQA 1GZCA 5BXPA 1A8DA 1KJLA 1UL9A 1UN1A 3CU1B 3BIWE 2GMPA 1ONAA 1W3AA 7I1BA 1BXHA 1HCDA 1TFMB 4OEFA 4HANA 3ZC8A 1IT0A 3NV2A 4GXLA 3IPVB 1IRAX 2DRZA 1ILR1 4H55A 3W58A 3O12A 3F62B 1SLCA 1AXYA 3QCWA 1HKNA 1GKBA 5GLUA 2AYHA 1WCSA 4I4XA 1WW6A 4A7ZA 2HYKA 2RSTA 4TZDA 2IWTB 2R16A 2UWBA 3P53A 4JKXB 4X3AA 4LO0C 3AP7A 3USUB 1MS3A 2A6WA 1QOOA 4YFZA 1FV2A 4LO1A 4QALA 2A6VA 1ABRB 4BLIA 3I2XA 2DVGA 2A75A 1JT7A 4G6MA 1LOGA 4FPJA 4TYSA 3OGFA 3N3HA 2WNEA 2NTDA 4F83A 3KMVA 1JXNA 2KLLA 1QOSA 3CAHA 4UW6A 4D0ZA 4HJJA 5IUQA 5CNAA 1DBNA 1SLTA 3H6QA 5T5LA 2ARBA 1AJKA 1QQKA 3SISA 1NZKA 1N3QA 1N1TA 1GV9A 4LO3A 1LGBA 3AX4A 2DTWA 2LALA 4YGDA 1XG6A 4XBLA 2ZGMA 4ASMB 2SLIA 1RY7A 2ZHLA 3CA5A 1S0DA 3WDYA 1Z78A 2R49A 3A07A 3PMEA 2JJ6A 1JYIA 4PF5A 1ISXA 1LENA 1BARA 1S0GA 3QR5A 5FREA 5F9TA 3RTIB 3WLUA 2GNBA 5DUUA 2R0HA 1CE7B 4XILA 3WHTA 2PHRA 5DZGA 4II0A 4JPZA 4ZGRB 4YZ4A 3OYWA 2AXMA 9ILBA 2Y9WC 1QNWA 3ATGA 4P9XA 3ZXGA 2UURA 1T9FA 2JE9A 4M3CB 4Q1PA 3PVEA 5GM0A 2VY0A 4R9DA 4OWJA 2VSAA 3OBRA 4AWDA 5HPZA 2WSUA 2HWAA 3FLRA 2D24A 3MW3A 1TTUA 5BVPI 3IPVA 4GAFA 4LO2A 4JQ0A 4CJMA 2AQZA 4DFSA 1FWVA 1C4RA 1SCRA 5KXBA 3IM7A 3SNMA 2H0BA 1JT3A 1Q8VA 2CYFA 1BFGA 3WO3A 4EKXB 4YGEA 1YXWA 3MEPA 1Q04A 3VEQA 5E88A 4XFUA 3AYEA 1P63A 3O4DA 3AKHA 3FJCA 1IS6A 4YZ5A 2FMDA 2D20A 3OJMA 3M3QA 3IM6A 2XB6C 2MC2A 3WDTA 3R4SA 2ZMNA 3UJ4A 1DZQA 4QD2C 3VKMA 1HIBA 4ENDA 3PUBA 2KM2A 4YGBA 2ZAAA 1AVXB 1JTCA 4A7KA 3OPZA 3O4OA 3VKLA 3M3CA 3N7MA 2DV9A 3HN1A 1BLDA 1SLLA 3AKFA 2GNDA 4F34A 2KKIA 1FV3A 3O44A 1JHNA 1GICA 1OQLB 3CRHA 1Q1UA 2YY1A 1APNA 1WLWA 1NUNA 3ZSMA 3FJJA 1HQLA 1JLXA 3M3OA 4I2SA 4Q9GA 5G00A 1EPWA 2CTVA 3WCSA 1LEMA 4YG0A 4P9WA 2F2FA 3V0AA 3PVNA 4XIOA 3NV3A 1SR4C 3O0VA 2Y9XE 3CA1A 1V00A 3OBTA 1BFCA 2X2TA 3AH4A 4L4HA 5CB7A 2VW0A 4I4UA 2K4AB 1GANA 1W0OA 2YMZA 1CN1A 4GA9A 3JU9A 1DQ5A 1CPMA 4OUJA 4LO7B 4DENA 2ENRA 1W6OB 1ZM1A 1G9FA 3OY8B 3P6JA 2P23A 2Q3NB 2LTNA 1CONA 2E6VA 1ISZA 3AXEA 4FPCA 1VAMA 4QBVA 3A21A 5GZGA 4EFRA 3AJ6A 3Q7WA 3S8KA 1PZ9A 1JLYA 4Q1RA 2PHTA 4Y24A 2FHRA 3BA5A 4YLZA 5I1BA 4I3NA 1BLAA 1V6JA 4JCKA 1RZOB 1ZA4A 4U2AA 2AFGA 3CA3A 3N36A 3Q7XA 4H04A 1JBCA 4GALA 4I30A 2GZBA 2L5XA 1W6QA 5IK4A 1HLCA 3ZXJA 4Y20B 3SITA 2EAKA 4QC4A 5GZFA 2D3PA 3JUTA 5D62A 4D8HA 1SBDA 1HWMB 2NMNA 1YIFA 2QN4A 4GP0A 2R0FA 4AVVA 3MW4A 1TWMA 3POSA 2D22A 5B2HA 4I4VA 1G8WA 1V6UA 3T1LA 1JOJA 1LHOA 3UJOA 4P9YA 1AVWB 2VW1A 1JT5A 3TB0A 1ENRA 4FPEA 4Y1ZA 4ZFWB 1GZWB 5DXDA 3FJHA 3WUCA 2P3JA 1X50A 4OWKA 3HBWA 41BIA 3POWA 2PHXA 3NJ5A 2AREA 1Q03A 3AZVA 1IS5A 4M00A 3AK0A 3MW2A 2D7RA 3AH1A 3NBEA 3QLQA 4ITCA 3ZXEA 2SBAA 4IHZA 1YBIA 1YRZA 2ZABA 1HWPB 3WDXA 1TOOA 1R8OA 1DQ4A 1MS5A 3GALA 1VLNA 3FJAA 4IZXA 1FMMS 4KEJA 4CTEA 5CAZA 5JOWA 3OY8A 2DVDA 1L2HA 2JKBA 1Z0HA 1HWNB 1BASA 5H9PA 1MVEA 3HALA 3UJ0A 2RG9B 1ULDA 5GZCA 1ONKB 1Y7BA 3ZXFA 1C57A 5T5PA 3VT2A 8I1BA 1URXA 4XFTA 3VKFC 4ZOTA 4YZ1A 4PCRA 3R05A 4LBQA 2DYCA 1LOFA 2YZ4A 4PBOA 4YZ2A 1DHKB 2E7TA 3T1MA 1FYUA 3FLTA 1I3HA 1AJOA 1LU2A 3AP5A 4DRVA 2D6NA 3AZZA 3ZSKA 2P37A 3D5OA 1W6PA 3FUQA 1GYKA 1I1BA 4FPKA 4Y1VA 4UW5A 2A3XA 4GP3A 3TAYA 1MS9A 3WDUA 1WBAA 1ULGA 5L73A 4ZFYB 1OQ1A 1MS1A 1FATA 1LHUA 3H6RB 2EIGA 2Q9XA 2ARXA 4GKXA 3WA1A 3AJ5A 1QMJA 1YYNA 1SLIA 3RG0A 5F90A 3O4CA 3CRIA 4BLJA 4UW3A 1G9BA 4Q9PA 2ZMKA 1FAYA 2VU9A 3CA0A 2CWSA 1WLCA 2BQPA 4EFQA 1DFQA 3LCPA 4K21A 1YF8B 4I6IA 4YFWA 4P14A 5DZEA 3P6IA 2ZR1B 1WW5A 3UD7A 1V6WA 3VKOA 3H0OA 2VXTI 1SBEA 4XJUA 1FN0A 1YI7A 3ZPYA 4XZPA 2EXKA 4WBCA 4BQ1A 4G9MA 3WMVA 5D63A 2I2SA 3W59A 3BAOA 3ZYRA 3V0BA 3WV6A 4I4YA 1XYFA 4L4IA 3UD8A 3VSFA 3SLIA 3NWKA 4EFPA 2ZGSA 4LO0A 4DQAA 2ZBJA 2FO1A 5T55A 1M16A 2I1BA 3V79C 4LO1C 1CESA 2AR6A 1LOEA 1N3PA 1JY0A 3FJBA 4FP3A 1H9WA 3A0KA 4G1RA 2F8XC 4QD2B 1Q8SA 1TWEA 1YTOA 1QOTA 2E53A 4FPHA 2VUAA 4YG3A 1MZ6A 3ZXKA 1LU1A 5BQUA 3CNAA 3SH4A 1PZ8A 1SLAA 4XDQA 3WO2A 1IOBA 3AKGA 5JOZA 4WV8A 1MS0A 2JDZA 4LO3C 3CQAA 4M01A 5BXRA 1DZCA 1FGAA 4QBCA 1Q56A 4FOYA 4P6AA 2W08A 4USOA 1AXMA 3MPPG 3SNVA 3BAUA 2AH2A 3BTAA 1GLHA 1ISWA 2RQ9A 1PUMB 1CQ9A 4H9WA 1VAVA 1MACA 2AUYA 3WINA 1AZDA 3LTQA 3B9UA 1N4KA 1WBCA 4G9NA 2ZGQA 3N7KA 3FGMA 3B01A 1LTEA 2OUJA 5FRAA 1BYHA 3WG4A 4XJ9A 3KM5A 1JUIA 3VV1A 4XTMA 6I1BA 1TP0A 4QKRA 5T52A 4GOVA 1XQNA 2X2SA 2Z42A 2TEPA 1IS3A 3CA6A 2DVAA 1AX2A 4AN6A 2D7IA 2FDBM 4XXAA 2MIBA 3ZC9A 3M2MA 2D23A 3CRGA 3AP6A 4X39A 3AYAA 3D4KA 1DGLA 3B69A 2ZZJA 3ZSJA 1LOBA 3WMUA 1SZ6B 4YW3A 4LO2C 3NBDA 4XMIA 4BMBA 1V6VA 1AF9A 1BKZA 2ZGLA 4FPGA 2MLLB 2ZACA 1ENQA 3ZXLA 2ZHNA 4ATFA 1Q8PA 3USUA 4EB2B 3LSDA 3WG3A 1EVTA 2J3PA 4R6UB 3AYCA 5D61A 1QXMA 5GJ6A 4G6JA 4RA0A 4AGGA 2CNAA 1J0SA 5FZYA 1ULEA 5SV8A 1F5FA 3VT1A 3BA7A 2Z49A 1R1ZA 3RRDA 1W6NB 1LOCA 2A6YA 1QU0A 1UX6A 4MYEA 4WZFA 4QKSA 1G86A 1S0CA 3N0KA 4I4OA 4AN7B 4I4QA 4Q91A 4PC4A 1AVUA 3PHZA 2FFVA 3RS6A 3VWCA 1UKGA 1UZYA 1S0BA 2P2KA 4K1YA 4JP0A 2UWCA 4I4SA 3I2AA 4Y1UA 1LEDA 3VKNA 4KEKA 3NV4A 3APBA 4ZBVB 1W6MB 4SLIA 4FVVA 1UAIA 4FPYA 3IKWA 2ZA9A 1Z2VA 1II4A 2GO2A 3AFKA 3I4IA 1VIWB 2NM1A 4XJ8A 4OEEA 2F2FC 4J2XA 5H9RA 4K20A 1RG8A 3GNEA 5DUVA 2DRYA 1V6MA 5H9QA 2A6ZA 2A70A 4ZXKA 2IHOA 2YV8A 1A3KA 1MD6A 5T5OA 3ZSLA 5IK7A 4I4RA 4M3CA 4OW4A 4HL0A 5FNXA 4Y22B 2AAIB 3KQRA 2G4IA 4FPLA 1PZ7A 2ZMLA 4AVSA 4Z8SB 2DWRA 3WG1A 4R9CA 2Z48A 3PJQA 1RINA 2ZQOA 1N3OA 1PUUB 5KXCA 1JT4A 4IQPA 3EF2A 4YGCA 2DS0A 4PQ9A 1S0JA 3FUOA 3O49A 1I1EA 5FNWA 2D6LX 4XTPA 4Q8KA 4WVVA 1C1FA 1F31A 3NBCA 3M3EA 1MZ5A 3WCRA 1LULA 4IONA 5HCBA 2D3RA 2WT2A 4OZXA 2D6OX 1LECA 2R9KB 2ZGOA 1TIEA 2UUSA 1FQ9A 3FJIA 1SACA 1ULFA 2OVUA 5EHAA 4L8QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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