3RSJA

Structure of hcrf in complex with ganglioside gd1a
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
413
structure length
406
Chain Sequence
IKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/F
publication title Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 105
structure length 406
sequence length 413
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-05-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3rsjA01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3rsjA02
4PBOA 3EF2A 3E8LC 2D7FA 1LOFA 4Y24A 1FX5A 1KDMA 3U4XA 3NV3A 1RY7A 2A6XA 2JD4A 2A6YA 3SNMA 2FFVA 4KEJA 4W65A 4J2KA 3VV1A 2AENA 5IK7A 2GMMA 1V6LA 4Z8BA 1H9WA 4FPGA 1SLAA 1CPNA 2ZMNA 1G9AA 1FATA 1N47A 4C1WA 4Q91A 3VKFC 2PHRA 3PUBA 4IY8A 5D63A 1AJOA 3AJ5A 5DXDA 3AP9A 4IY9A 2A5ZA 4I6IA 1G9CA 1PUUB 1HCDA 4YW3A 1WD4A 1TWMA 4G9MA 1TWEA 4JC1A 4DEPA 3NBCA 5AVAA 3CQAA 2ZGMA 2NZ9A 4IYBA 1FQ9A 1BJQA 4AN7B 4AVTA 4LO0A 1LENA 1DGLA 3N7MA 2A7AA 6I1BA 1L2HA 4K20A 1W6QA 1BARA 4XZPA 4USOA 1GSLA 2PHTA 4LBNA 4OUJA 1PC8B 3W9TA 3FJEA 4AVSA 1PZ7A 1YRZA 2DUOA 2DTWA 4XIKA 3ZSJA 5H9RA 4P6AA 3O5SA 5BXRA 3MW4A 2DWRA 2GDFA 1CE7B 4HJJA 5KXDA 4J23B 4FP3A 2B7YA 1AVAC 3PVNA 3CA5A 1Z2VA 3FJBA 4PC4A 1IRAX 2P23A 2E7TA 1LEDA 4IQPA 1BZWA 4XJAA 1DQ1A 3TAYA 4H55A 1N1VA 5JMCA 3AZWA 1IS4A 1GZCA 4FPLA 3AKIA 2GNMA 1IS5A 1W6PA 3WG4A 3A23A 5T54A 4IZXA 5CNAA 2PHWA 1HQLA 4YLZA 1SLIA 3FLRA 3FLTA 5GZGA 1V6NA 1W3GA 3DUIA 2CL2A 3SLIA 3ATGA 4P0KA 1NLSA 4WVVA 4P9YA 3OJVA 4GWNA 2W52A 4Y26A 4EFRA 3A21A 3FJFA 2P39A 5BQUA 3WG2A 3IM6A 5BQUC 2ZGQA 4XKIA 1DQOA 1JTCA 4I4QA 2D6NA 4AN6A 2FO1A 2FGFA 4BPZA 4I4RA 4LO3A 4I96A 1FMZA 1UMZA 5FNXA 3UDAA 1ENRA 1RG8A 4XOGA 1E0OA 1LHNA 3NV2A 3W59A 1HKNA 2VH9A 2D24A 3MW2A 2DS0A 1ULEA 4BM8A 1N1SA 3WCSA 2D6KA 4QC4A 1RIRA 4XJ9A 4P9WA 1SFYA 3M3OA 1JT5A 2YV8A 3UJ0A 1TFMB 3RG0A 4XJ8A 2D22A 1S0LA 4Y22B 2W39A 3AFKA 3AYEA 4WVWA 2MLLB 2ZMLA 1Q03A 1MVEA 4ZA3B 1G7YA 2NP0A 1CVSA 2E4MC 3WO4A 3O0WA 2VW2A 4GKYA 4CZSA 1JBCA 1S0JA 4QD2C 1AVUA 1ABRB 4R9CA 3BAHA 1AX2A 4JKXB 4Y1ZA 1ILR1 3MPPG 1UL9A 3RS6A 2ZBJA 1MR5A 1V6MA 1S0CA 1QNWA 3FJHA 2WRYA 2X2SA 3SH5A 1XQNA 1WW4A 2KI4A 2F2FA 5HCAA 2F2FC 2Q3NB 3BA5A 3L2YA 1DQ2A 3OYWA 2ZZJA 3IPVB 4I4SA 3UK9A 3VT1A 4KEIA 4X3AA 2TEPA 1OQ1A 5DG1A 2WJSA 3OBTA 2GNBA 2P3JA 4FP2A 2HYKA 1MS3A 5H9QA 2EF6A 3N0KA 4ZXKA 1WBCA 3D5OA 3FJCA 2WBCA 3ILRA 4DFSA 4JQ0A 2NVHA 1CN1A 3VKMA 3WV6A 4D8HA 4FPKA 3WDYA 1AZDA 4YZ4A 1MD6A 3BOPA 1I3HA 1YIFA 1BYHA 5IT6A 3I8TA 3I4IA 4GALA 4H04A 3UJQA 1UKGA 3PVOA 1IS3A 2ZGNA 4YZ3A 3S8JA 1S0FA 1LOCA 2F8XC 3Q7XA 3QLQA 5BYNA 1KQRA 2OUHA 1AX0A 3SNVA 5DZEA 3H0OA 4Q26A 3AKFA 5BXTA 1LOBA 1FV3A 5E88A 2GZBA 2UWCA 1LHUA 2V73A 8I1BA 1Z78A 2D7RA 2DU0A 5GLUA 4G6JA 1KRIA 4D0ZA 4AGGA 2DU1A 5HCBA 5GJ6A 4YM3A 2UURA 1BKZA 4XJUA 1JYIA 3WO2A 3WCRA 4H9WA 2Z42A 3FGMA 2AYHA 1JLXA 1DZCA 2DTYA 2PHFA 5JDBA 3O12A 1R1ZA 1LESA 1UN1A 4FOYA 4YGEA 3AYAA 1C57A 1DZDA 2CY6A 5BP5C 4USPA 2G4IA 2L5XA 5DVHA 4DRRA 3H6QA 3BB2A 3LLPA 2V5YA 4RA0A 5CAZA 1EPWA 1Q8PA 2R49A 4X38A 1W6NA 1KNMA 3CU1B 3B3QE 4BMBA 3AJ6A 4CJMA 1UZYA 2ZGSA 1G9DA 4XMIA 4J2SA 2K43A 1WD3A 1YYNA 1MS5A 3BIWE 1HWNB 2NN8A 3WG3A 3QYDA 3D6EA 1LHVA 3CAHA 3V0BB 1WW5A 2PELA 4XBLA 1RZOB 1IKPA 3NBDA 2A6WA 2JE7A 1GICA 3O4BA 3IIRA 1SBEA 1SBFA 1DLLA 4LBKA 1QXMA 4LO8B 1W6MB 2EALA 3POKA 4QKSA 1EYLA 1TIEA 4XBNA 2Y9XE 4JP0A 2DVGA 1Z4SA 3A22A 2GO2A 5HPZA 5F90A 1LJ7A 1MZ5A 3WUDA 3P6IA 2ET2A 4I37A 2ARBA 3PG0A 2UWBA 3UJ4A 2K8RA 4I8MA 2MIBA 5BXPA 4I4YA 4GOVA 3RMXA 2VSEA 3D4KA 3AJYA 1DYKA 2BEAA 1II4A 4R6UB 3V0AB 3ILNA 3F62B 2KI6B 1AVXB 4I4UA 1BFCA 1OQLB 1BFFA 4BLIA 1Q04A 4ASMB 4YM0A 3P53A 2JE9A 1HLCA 3NBEA 5T5JA 3JUTA 4FPOB 4GWMA 1T9FA 3AXEA 5E89A 1MVQA 1P63A 3ZYPA 1IRPA 2PHXA 4AYUA 4AVVA 4M3CA 4X39A 4Q9GA 2W68A 1IT0A 3PVEA 4JRAA 3BX1C 3FJKA 4KBBA 2YROA 3Q7YA 3T2TA 5H9PA 4Q9PA 2D20A 4GP3A 1ULGA 4A7ZA 1IKQA 1C1LA 5CA6A 3ZVXA 2AGSA 1FV2A 5JLVA 2LIEA 2CWSA 1YI7A 3PHZA 3OJ2A 1MS9A 1JXNA 1TTUA 3R05A 1QKQA 2PHUA 4C1XA 3WDVA 4QBCA 4YM2A 5KXCA 4FVVA 1WBFA 3T8SA 1JN2P 1LGCA 1V6VA 2XB6C 1TEIA 3BAQA 1NZKA 2DRYA 4OW4A 3WHTA 1AXZA 1JW6A 3ZPYA 1GZWA 5F9TA 4GP0A 1GV9A 2QN4A 1QQKA 1EVTA 4LBQD 3AK0A 3BAVA 5GZFA 5BXSA 4YZ1A 3R4SA 1C4RA 4BMEA 4LO1A 3O49A 5BOWA 3Q7WA 4LO1C 1YBIA 1SLTA 2VXTI 2Y9FA 1S0IA 4Y1VA 2EXIA 1CIWA 2OW4A 2ZAAA 5KXEA 3UD7A 1CQ9A 1SACA 4YOLA 3N3HA 2BQPA 3WLUA 4KEKA 4WBCA 1KITA 3OPZA 4ZKTB 4XMAA 4XDQA 3UD9A 2RG9B 2GMEA 2ZGUA 5EHAA 1VLNA 5GLTA 3FJDA 5EXOA 1PUMB 1O4ZA 1Q1UA 3HSMA 4Y20A 5JOWA 21BIA 1ULDA 4K1YA 4YFZA 4F83A 2P3KA 4GAFA 4PQ9A 2CTVA 2RSTA 4Q1PA 4DQAA 1W6QB 5B2HA 1KJLA 5GLZA 5T50A 1FGAA 2RHPA 4BLJA 1IOBA 4JPZA 1W3FA 4QO3A 1LODA 2VU9A 1OKQA 3AZVA 2UU8A 3POWA 1IHKA 2ZABA 1DIWA 3O0XA 4U2AA 5LK5A 2JJ6A 2D7IA 5GZCA 1N4KA 3WDUA 3HMYA 1I1EA 5DSSB 5CB7A 1JT3A 2R1DA 3VEQA 4R9BA 3S8KA 1VALA 1BFGA 1JUIA 4UW6A 1LU2A 5F8WA 2NYYA 5DZFA 4I4XA 4GKXA 1SLLA 3OY8A 3WZ1A 1I1BA 3I2AA 1W6PB 2EXJA 1B09A 4XILA 4DCKC 3VKNA 1MS8A 1Q8VA 2ZGLA 2DVAA 2EXKA 3ILAA 2AUYA 1ULCA 4D69A 4LO7B 3FJAA 2WSUA 4LBJA 2C9AA 1S1AA 4LBLA 2ZGOA 4FPFA 1CJPA 3AKHA 1GBGA 3AH4A 3M3QA 1S0EA 3M1HA 3VT2A 4FPHA 4AGVA 1JQZA 31BIA 2E4MA 1F31A 4OWJA 1J0SA 4Q27A 1Q8OA 1UZZA 3AKGA 4ZBVB 4R9AA 2A3WA 3ZYRA 4GOYA 4I4OA 3IKWA 1LECA 1WBLA 1DHKB 1LTEA 4PBPA 3BA4A 3FJ8A 2NTDA 3CNAA 2YZ4A 2SLIA 3INAA 2VY0A 2ZGPA 1WUVA 5I1BA 2D3PA 3TC2A 2Y9WC 2FMDA 2VLCA 2ZQOA 1JLYA 1YXWA 3C2UA 4HR6C 1BA7A 2ZR1B 1SLCA 2P2KA 5EC5A 1G9FA 3BAOA 5F5QA 4CTEA 1JT7A 1EV2A 4Q8KA 3V64A 1AF9A 2AREA 3HALA 1SLBA 4XFTA 5T5LA 3QCWA 4I0YA 4LO2C 5BVPI 3O3QA 3WINA 3AX4A 3WINC 3K1XA 4ZOTA 3CA4A 2J3PA 5IK8A 5FZZA 1PZ9A 2GN7A 2E53A 1A3KA 3RMYA 2DVBA 3FUOA 1HCEA 5EYYA 3GNEA 4M01A 2NMOA 3BADA 2I2SA 4XJWA 3ILFA 4ZFWB 3WO3A 1URXA 2HWMA 4I4VA 1ISWA 1BQPA 1XG6A 1W6OA 2XG3A 4WV8A 3OBRA 1AVBA 2AQZA 4ISRA 4I2SA 3ZX7A 1SZ6B 3OYWB 2A71A 4SLIA 1LU1A 2CYFA 2X2TA 1XYFA 1MC9A 2H0BA 4PCRA 4YW5A 2GALA 2JDZA 1W0PA 3O44A 1CR7A 3AXDA 3MW3A 1IILA 2ARXA 1AFCA 2HZ9A 4HA2A 2Z48A 4ATFA 1S0DA 4ATEA 3T1MA 3RSJA 1DQ4A 4YM1A 2D6MA 2YMZA 1CONA 2E51A 1KJRA 2ZHMA 1WW7A 3MEPA 2FHRA 4LBQA 2M49A 5BP5A 1R8NA 1V00A 4QBVA 4I3NA 1JT4A 1WLWA 3ZXKA 1QQLA 1APNA 4YGCA 3AP7A 3DGTA 2DRZA 5D61A 3AP6A 4FQZA 5JVVA 1YO8A 5DUYA 1WLDA 3O5WB 3Q9OA 3IAGC 2NM1A 2D6LX 3O4AA 1ENSA 5JOZA 4G9NA 2C5DA 3A07A 3H6SE 4XTMA 5DZUA 3SH3A 2ES3A 1MS0A 4YW4A 2ENRA 4FOWA 3OJMA 3HR9A 4XXPA 4IONA 3ZC9A 4Y1XA 1LEMA 1QGLA 1ULFA 2WT0A 3V0AA 4XFSA 4RL7A 1VIWB 4ITCA 4YW2A 3AJZA 2QYIB 4YG6A 2D1ZA 3TB0A 5T5PA 3H6RA 1AX1A 3AZXA 2Q9XA 2VSAA 2WT2A 1ISZA 3JU9A 3FFZA 4OWLA 9ILBA 2KKIA 1UPSA 1DYPA 3IMNA 3IM0A 1W6NB 2VW0A 1GLHA 3WHUA 4L8QA 1WBAA 3WDXA 2D43A 1RMLA 1SCSA 2DUPA 3IN9A 2Z49A 3FJIA 1V6XA 3BA7A 2CWMA 3M3EA 5DZGA 3M3CA 4AGRA 2ERMA 3CRIA 3FUQA 5EYXA 5DUWA 1GNHA 1OFSA 4MYEA 2ZGRA 4OEEA 1QDOA 1Q8QA 1FYUA 3N36A 1V6JA 3RTIB 3V65A 3ZSLA 4EEEB 4XTPA 5DG2A 3D7WB 1IS6A 3BAUA 3WDWA 1JHNA 4P14A 3B01A 1WCSA 3V79C 1J1TA 4I4PA 1QOOA 3LTQA 4I7IA 2LALA 2YY1A 3WDTA 2A3XA 1W3AA 5L73A 4X37A 3ENRA 2VUAA 2DYCA 5H9SA 1AXMA 2GNDA 1N1TA 4BOWA 1LOFC 4NOTA 3HN1A 1LOEA 4QALA 1LHWA 1ONKB 1NUNA 1UX6A 2HWAA 1BFBA 2IWTB 4XIOA 1HIBA 2IHOA 5JOYA 4G1RA 2YUGA 1ISYA 3FBYA 1FNZA 1UAIA 1R8OA 4JAWA 3USUB 5IUQA 2WLQA 1ZM1A 1GANA 1FMMS 5FZUA 3B9CA 4DENA 4L4IA 3FLPA 4A7YA 4M3CB 2Q5TA 1FWVA 2VW1A 4FPJA 2BEBA 4M3CE 2D6PA 5DUUA 1V6OA 1CVNA 2A75A 5F8SA 5E8AA 4L4HA 3OGFA 3LCPA 3O0VA 4HANA 4XHXA 3CA3A 1N1YA 2R16A 3N7JA 4GAIA 2AH2A 1JOJA 5FRAA 3M2MA 3NJ5A 2R9KB 5GAQA 3KQRA 3POYA 1QU0A 4XFUA 4ZFYB 2DUQA 4LO0C 3NBNA 4OZXA 2DVDA 2D6OX 4FPCA 1JY0A 3O4OA 1ITBA 2WNEA 3P6JA 2A6VA 3NV4A 1M2TB 2R0FA 4LBMA 2ZMKA 2ZQNA 4FOQA 1LHOA 3PMEA 5IK4A 3VSFA 5JOXA 2D44A 3ZXGA 2KH2A 4P0LA 4A7KA 1GGPB 3T1LA 1GZWB 4EKXB 3R4UA 1V6KA 3VSZA 4ZLBB 1LOAA 3JUUA 3ZC8A 4YFWA 2GMPA 3CA0A 1S0GA 3VUOA 2LTNA 2E6VA 3VWCA 2A70A 1ONAA 1LCLA 2HW9A 2DVFA 3OJBA 5CBLA 2R0HA 1ZA4A 3FJJA 3HBWA 3W58A 3AYCA 5HCFA 1G82A 4II0A 3NWKA 1SCRA 1XHBA 2Y9GA 5F8YA 4NO4A 1IJTA 1F9KA 1FAYA 1QNYA 4XE9A 5KXBA 2D3SA 4LO7C 4Y22A 1DQ5A 1SBDA 4OEGA 4M00A 1V6WA 1DFQA 3N7KA 2RQ9A 1GZ9A 2DURA 4M3CF 4IZEA 4Q2FA 1K5VA 1ENQA 5E24E 2AFGA 3CRHA 1BLAA 3BAGA 1QMJA 4ZGRB 1D2SA 4YG3A 4YGDA 3IM5A 1ISXA 4I1BA 1W0OA 4Y20B 3AZYA 4ISQA 1NXD1 1N3QA 4LO3C 1QOTA 3WNXA 3KMVA 5T5OA 2ERFA 3ZXJA 3RTJB 3BTAA 1DQGA 1MZ6A 3AZZA 4OWKA 1V6IA 4FQ4A 4DPNA 4G6MA 2JECA 2OUJA 3LSDA 3IPVA 4I1EA 5EWSA 3WMUA 1V6UA 2EXHA 1N3OA 2VXRA 3ZXLA 1MACA 1DBNA 2A6ZA 1Q56A 1SR4A 1AXKA 3OGGA 3CA6A 2WKKA 5GLWA 1SR4C 4UW4A 1DQ0A 1LGNA 4J2XA 5DUXA 5D62A 2ZKNA 4UW3A 3AH1A 1Q8SA 5GALA 1HKDA 3JRRA 2SBAA 1TP0A 2ESUA 1VAVA 3O4CA 3OY8B 3B00A 4GXLA 4YG0A 1F5FA 1DFCA 4JCKA 1XZZA 1RITA 4JKQA 3KM5A 3I29B 2BFHA 4U36A 4GA9A 1WLCA 1MS1A 2JKBA 5GM0A 4XBQA 3VKLA 4K1ZA 2I1BA 1FWUA 2EAKA 1WW6A 4LO2A 1TOOA 2P3IA 3CA1A 2A3YA 3WVJA 3HOMA 4QD2B 1H9PA 2AAIB 4F34A 1CESA 4Q8LA 5IK5A 4EB2B 3N35A 1AXYA 1H30A 3BRFA 2R1BA 4IHZA 4J2YA 1JYCA 4R9DA 2YXSA 2ZACA 3AP4A 1VCLA 2AXMA 4KC3A 1LGBA 3WA1A 4K21A 4TYSA 4YZ2A 1HDKA 1S0BA 3SISA 3ZXFA 2GNTA 4QKRA 4Q1RA 1G86A 1D0HA 4DRVA 3ZXDA 3I2XA 4P0JA 2ZGTA 1N3PA 3VT0A 1HWPB 4EFQA 1O4YA 3WG1A 3GALA 2EIGA 3ZSKA 1C1FA 3MALA 2K4AB 4Y1UA 2ZA9A 5EG6C 1PZ8A 2D23A 2FDBM 2FFUA 1Z0HA 4LBOA 5DUVA 1KDKA 1DQ6A 3N7LA 3BRDA 3V0BA 4XJZA 3SH4A 2WSVA 2LIQA 4Y1YA 3LSEA 1HWOB 1U0AA 1FNYA 1LULA 1G9BA 4DS0A 4Z9WB 1BXHA 2MC2A 4HL0A 2CNAA 2KLLA 3PJQA 1BLDA 1FN0A 1W6MA 1W6OB 3F1RA 1QF3A 7I1BA 2W08A 2P34A 1GYKA 5FZYA 41BIA 1MS4A 2AR6A 1PWAA 1A78A 2ZHLA 3NV1A 3IM7A 3BODA 4FPEA 3CRGA 4P9XA 3ZSMA 1G8WA 3APBA 5SV8A 5GZDA 4OEFA 4D0TA 1DZQA 5FREA 1K5UA 4XHBA 3UJOA 3WUCA 2P37A 1VAMA 4FPYA 1M16A 2UWAA 2NMNA 3POSA 2OVUA 4ZFUB 1DJSB 4XXAA 1QOSA 1AJKA 1HWMB 2ZHNA 2ZGKA 1BASA 1CPMA 2E7QA 3AP5A 3VKOA 4LBQB 3UD8A 4UW5A 4BQ1A 3BRGC 1GKBA 4PF5A 3WOGA 4YW1A 2UUSA 3AH2A 4AWDA 5GZEA 4EFPA 1QDCA 1RINA 1YF8B 1HQWA 1Y7BA 3B9UA 2WQZC 2ZHKA 5FNWA 3UL2A 1YTOA 2DV9A 2KM2A 4I30A 1PZZA 3B69A 4CRQA 3WMVA 1IOAA 4ENDA 4WZFA 1GNZA 3FJ9A 1LOGA 4FOVA 2D3RA 3ZXEA 3QR5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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