4A7YA

Active site metal depleted aldos-2-ulose dehydratase
Total Genus 196
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
196
sequence length
886
structure length
880
Chain Sequence
QPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 196
structure length 880
sequence length 886
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7yA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7yA03
1JT3A 1FN0A 1DQGA 1DJSB 2FDBM 3OBRA 4I8MA 1Q03A 2RG9B 4A7ZA 1D0HA 3OJMA 2MC2A 3T8SA 3Q7XA 5BQUA 4GAIA 3BADA 5I1BA 1JT7A 2Y9GA 3UD9A 2Z48A 1EV2A 4HR6C 1ISVA 2QYIB 1BASA 3O3QA 4GAFA 3AKGA 2E4MC 3PG0A 1QXMA 1WBAA 1XG6A 2NVHA 4IYBA 1A8DA 2ZQOA 1KNMA 3BA5A 3FJFA 1DIWA 2Q3NB 1JTCA 2KLLA 3JUTA 2F8XC 1XYFA 3AH1A 1FMMS 1Z4SA 5JMCA 2X2TA 4QKRA 4F83A 4EB2B 3FJDA 4TLPA 3I29B 4JQ0A 2BEBA 3LLPA 3FJKA 2Y9WC 1Z0HA 4JPZA 1RG8A 9ILBA 1DZCA 4X39A 3P6JA 1W3AA 4X3AA 2HWMA 4L4HA 4QBVA 2NM1A 2J3PA 1ABRB 3R4UA 2K43A 3AKHA 4GP0A 1AVWB 5FZYA 3S8JA 2MLLB 4Q9PA 1IILA 3VEQA 1BFBA 1Q1UA 3AZVA 2KI6B 2WRYA 3BX1C 6I1BA 1HWPB 3IM6A 1RY7A 4JRAA 4OWJA 3BA4A 1NZKA 4GOVA 1DLLA 4ENDA 1GGPB 2KI4A 1G9CA 4P6AA 1JLXA 3HOMA 4XKIA 1QQKA 3OGFA 3RMXA 3CA3A 2K4AB 1AVAC 2AAIB 1MC9A 3CAHA 3HSMA 3V0AB 2DS0A 5FNXA 41BIA 4L4IA 1ISZA 4G6JA 2HW9A 5F8SA 5EHAA 5FZZA 5BXRA 1Z2VA 1BLAA 4CJMA 1S0CA 4J2XA 3BAVA 2Y9FA 1K5VA 1TP0A 1QQLA 4KEKA 1S0BA 4LO2C 2NP0A 2MIBA 4LO8B 1T4QA 1UPSA 2NYYA 4DEPA 3CRIA 5BOWA 3UJ4A 3HBWA 4Q91A 1HWOB 4I1BA 1HCDA 4I6IA 3BAUA 2ERMA 3AKIA 5BXTA 5B2HA 4P0JA 1YTOA 4G9NA 31BIA 1PUMB 2HWAA 4D0TA 3NBCA 4LO1C 2LIEA 4ISRA 4JKXB 3OJ2A 2VSEA 2KKIA 3A21A 2E4MA 3WINC 21BIA 1TTUA 4XFTA 1IRAX 1EYLA 3FJ8A 1J0SA 4ZFWB 1BFCA 4GP3A 3ZX7A 5G00A 3VUOA 3I2AA 4GOYA 4I3NA 4X38A 1V6WA 5BP5C 4LO3C 1RZOB 3B9UA 5GAQA 3H6RB 4P0KA 3BAOA 3A23A 1YBIA 1FWVA 1NUNA 3O49A 2DRYA 3FJAA 5BXPA 3WO2A 4QC4A 1YF8B 4OWLA 4EFQA 4HA2A 1AVUA 4I4YA 1G9AA 3CA6A 4LO0A 1E0OA 3WA1A 1F31A 5E24E 3S8KA 1FV2A 2FGFA 4LO7C 2NZ9A 2IHOA 4OEFA 1SR4C 1SZ6B 1G9DA 3BTAA 2F2FA 3BRDA 1L2HA 3O4OA 1IT0A 3BAHA 3AKFA 3FFZA 2D43A 2FO1A 5DSSB 3E8LC 1S0FA 3QR5A 1AVXB 3FUOA 2Y9XE 4J2SA 4X37A 2AQZA 4I1EA 4USOA 3A22A 4DENA 3BRGC 1R8NA 3C9ZA 2GO2A 1MD6A 5BXSA 1XHBA 4ZLBB 5FNWA 1P63A 5FZUA 4ZOTA 3CRGA 4J2YA 4Q9GA 4XFUA 5BQUC 3UD7A 4I0YA 1V6XA 4II0A 1VCLA 3FGMA 1JLYA 1IHKA 3N7MA 3CA4A 2FFUA 3PUBA 1TWMA 3N0KA 1FMZA 3N7JA 3ZC8A 2AXMA 5D61A 2NTDA 3AH2A 3F1RA 3O44A 5JLVA 2BFHA 5DZUA 2GZBA 3SNVA 1JT5A 4LO2A 1BFGA 1OQLB 2D23A 4D8HA 1I1BA 1N4KA 4I4RA 1M16A 4KEJA 3V0AA 3V0BB 3VSFA 3FJ9A 1S0DA 3D7WB 4ISQA 4J23B 5EC5A 3PMEA 4KEIA 4QKSA 4AN7B 4QD2C 3Q7YA 3FJIA 4KC3A 1DZDA 2XOAA 2VXRA 5EG6C 1PC8B 4EFRA 2ESUA 5HPZA 3UDAA 5D63A 3WINA 3Q7WA 1T9FA 4ZGRB 1ISYA 1DQOA 3FJBA 4I4PA 2VLCA 5BP5A 3FJCA 1AXMA 3O4DA 1JY0A 3CA1A 2Z49A 3FJJA 4F34A 2D22A 3VT2A 2RQ9A 1WD4A 4A7YA 4IZEA 4ZBVB 2VU9A 4R6UB 1ILR1 4IHZA 4YOLA 3CRHA 1K5UA 3RMYA 3HALA 3AJ6A 3BAGA 3HMYA 1XZZA 4Z9WB 3LTQA 4IQPA 3NBNA 3N7LA 3K1XA 4LO7B 3POKA 1YXWA 4IY8A 3RTIB 1YYNA 1EPWA 1SR4A 1WBCA 2Q9XA 1AF9A 4WBCA 4ZA3B 1IRPA 3HN1A 4I4OA 4I96A 3H6RA 1V6UA 4G9MA 4QBCA 4G1RA 3WO3A 3O4CA 3MPPG 3MALA 4JP0A 2K8RA 4USPA 2BEAA 1S0EA 5F8YA 2R9KB 4D0ZA 4QO3A 4OWKA 3FJHA 3UJ0A 2P39A 1FWUA 1FV3A 2WBCA 1DFCA 4KBBA 4FGFA 3ZC9A 3AZWA 2YUGA 3VWCA 3V79C 3UD8A 3WMUA 4EFPA 1II4A 1R8OA 3O4BA 1IOBA 5D62A 4ZFYB 4ZFUB 1M2TB 1HWNB 3I2XA 2I1BA 2QN4A 3VT0A 3RSJA 4PC4A 4I4UA 3ZXDA 1FQ9A 3IM5A 4FVVA 2D44A 3KMVA 4OW4A 1I1EA 4IY9A 3CA5A 3ILAA 1W3FA 2D20A 1JT4A 2DRZA 3H6QA 1PWAA 3JRRA 4JKQA 3A07A 4QALA 1TIEA 1IJTA 5BVPI 1AFCA 1CVSA 1HCEA 4OUJA 2VXTI 1TFMB 4P0LA 1TOOA 3FUQA 7I1BA 1CE7B 4LO0C 4QD2B 2UUSA 4ZKTB 4I2SA 1V6VA 1RMLA 3NBDA 4I7IA 2ET2A 1S0LA 3VT1A 2D7IA 2F2FC 1ONKB 2D24A 1WD3A 3PHZA 4I4XA 1HWMB 4I4SA 4G6MA 1PZZA 4Z8SB 5DVHA 3NJ5A 3O5WB 2M49A 5F90A 3CU1B 1HIBA 1FGAA 2HZ9A 2KH2A 3OBTA 3NBEA 5F8WA 4J2KA 3IAGC 3RTJB 3V0BA 2X2SA 3BRFA 2L5XA 1ISXA 3W9TA 3VSZA 1G9BA 1JQZA 3TC2A 1TWEA 4LO1A 4EEEB 4IONA 4XFSA 3IIRA 3FJEA 1BARA 2RSTA 4OEGA 2AFGA 2IWTB 3H6SE 2D1ZA 3BB2A 1ITBA 1PUUB 4LO3A 4I4VA 4HJJA 1G82A 3OGGA 3CQAA 2ZQNA 2VSAA 3OJVA 3R4SA 3BA7A 2VUAA 3P53A 1BFFA 1HKNA 3WMVA 4OEEA 1ISWA 2P23A 5DUYA 1BA7A 3F62B 2DREA 1W3GA 4I4QA 4H04A 3ZXGA 3IM7A 1EVTA 1DFQA 4AN6A 3EF2A 3N7KA 1Q04A 4I37A 4JAWA 4H9WA 1BLDA 2ZR1B 8I1BA 3O4AA 2FFVA 4IZXA 3AJ5A 3P6IA 3AH4A 3WO4A 1S0GA 3CA0A 3QYDA 4EKXB 2D7RA 4A7KA 4DCKC 3BAQA 2LIQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4AEJA 2W95A 2BDRA 2WS93 5A7NA 5FO7B 4OI2A 2BV4A 3VHRA 2Y26A 1O59A 1RUF2 2HWB1 1HRI3 3O14A 3QACA 5FO8B 1KDMA 3PURA 2EVXA 4XFCA 5T3NA 3RZLA 1Q8VA 1D0HA 2JG9C 1SHWB 4NUBA 1CZVA 5A3UA 3T8SA 1K3IA 2BQPA 3KT4A 4LBKA 4R9DA 1O8SA 2VCMA 4AFCA 2PLV3 1BBT3 3BADA 1JT7A 4LPLA 3MEPA 5FP7A 5FZGA 4FT8A 3LDKA 4NIHA 1EV2A 2ZX1A 4MUVA 4YARA 4HR6C 2ZAAA 2B46X 4LKDA 4DMIA 2L9LA 1AXKA 4IE7A 2D97A 3CO2A 1S55A 2DYCA 2O1QA 3KCCA 4FPFA 2E4MC 1QXMA 4JQTA 5L36A 1OHFA 1WCKA 3A0KA 3NJXA 1A8DA 5FR3A 3H42B 4KI5M 4HPKA 2KR2A 3LOBA 1KNMA 1LGNA 4KL1A 1XB9A 3R0RA 3FJFA 1V6JA 1O5UA 4ZHNA 3WNXA 3O0XA 1JTCA 2Q3NB 5KHKA 1SFNA 2ZKNA 3OTFA 3SITA 1QKQA 3WQBA 2ZBJA 2XVGA 2XBO2 3AP4A 1NYWA 4URTA 1XYFA 1H8TB 2JDZA 4EWDA 5A1LA 5FP9A 1YQ5A 4MV2A 1A8MA 5JMCA 4CZSA 2X2TA 1OKOA 1W8UA 2C0ZA 2PLV1 4EWAA 3GZTB 1J3PA 4P5HA 4DUXA 1C1FA 1QHDA 2BEBA 1YI7A 4L99A 2WL1A 4META 3ST7A 5J48A 1CZSA 1COV1 2JE8A 5FQ0B 4NIDA 2VMEA 1W0OA 1XRUA 4LHLA 4IGPA 3RZGA 4JPZA 9ILBA 3H3ZA 4NROA 1ZA7A 5CAZA 3O1OA 5LA0A 3GALA 1E5RA 5L7OA 2GN7A 1RUH2 2NM1A 4JC1A 4BISA 3GHNA 4FTSA 5ABJA 1QJEA 3HQXA 1F5FA 5FMCA 5J96B 3QLQA 3VHNA 2MLLB 2ZPXA 4LOTA 4ZXEA 2BRTA 3BTYA 2JKBA 4XFIA 1BFBA 5C5UA 1NCRA 4WM8A 3VGIA 5HV0A 2CDPA 4RS5A 3VL9A 4IERA 2KI6B 2ZEZA 3CF6E 5FBJA 3UGFA 1OVPA 4YW3A 4A42A 2W08A 2WRYA 3BX1C 1D2QA 1QGLA 3DKWA 4QWNA 5FZEA 1Y9MA 3NNLA 4YVSA 3ZO0B 4JRAA 3ZXLA 3MF9A 4AW7A 4BE3A 1AL22 3ZXKA 4AHYA 1NZKA 2WNUB 1EV11 1MS1A 1Z7S1 2YBKA 4QQOA 5DAXA 5A6ZA 5AFBA 4OCTA 1GGPB 1G9CA 2VCCA 5KHJA 3DYMA 4L92A 3VBUB 3LAGA 1OA3A 3VBHB 3DKQA 4EN8B 3RZHA 1WWYA 3OGFA 2RS31 3ZM8A 1W04A 4Y1VA 3N4MA 1ZRFA 4OZOA 1AVAC 2K4AB 3CA3A 3HSMA 4KGQA 4EN0A 4KU7A 3GZUC 4LBQA 2JG8C 4MVTA 3OF1A 1RMU1 1XBFA 4L4IA 1ISZA 5BNPA 5FV3A 3I59B 4E4HA 1O3QA 5FZ4A 4U2AA 1LB2A 2HW9A 3LF7A 1N1TA 3O4DA 3VDBA 1W0NA 1W6PA 4Y4RA 4BPZA 5BXRA 1LTEA 2CAVA 5GLZA 3AP6A 1V6IA 2DBNA 1S0CA 1VRH2 2H6CA 2P37A 4LR4A 4AVCA 2CGPA 3BAVA 4J2XA 2DUQA 3PTRB 4WVZA 4GKXA 1V6KA 3ZFFB 2ZTNA 1N3QA 5A3NA 5A33A 5JI9A 2QQLA 2NP0A 1QJY3 4LA2A 4CDUB 1ST8A 1UPSA 1UXZA 2NYYA 1DZQA 2XH6A 4Q4Y1 1XPWA 4ZONA 5BOWA 1J3RA 3HBWA 1A6CA 1AXZA 3JQWA 4V2WA 1NCQA 3ZDSA 2WUHA 5JUVA 3E1F1 5BNNC 1HWOB 1WMEA 1HCDA 1DQ0A 1YFWA 3WLUA 4HL0A 4I6IA 2QQNA 4UF0A 3ABZA 1H1IA 1JYTA 2BEOA 4P0JA 4LBQD 2JG9B 4SBVA 1YTOA 2BVBA 1DZTA 2XJQA 3QBQA 4DXSA 5FP3A 4G9NA 4BJ0A 31BIA 1GQGA 3IPVB 4PQQA 2GSYA 1N1YA 5BY5A 1ASJ1 2VMGA 5HXVA 3ZDVA 2HWAA 3V64A 1QJZA 1PHMA 4KG8A 4LO1C 4ISRA 2JDUA 5AC91 2ZQOA 3VBOB 5IVBA 3TEZA 1DQ1A 5FJHA 1QJX1 2YU1A 3PL0A 4V2VA 5FUIA 1QH6A 4XE9A 3WDXA 1DG6A 1G86A 1FNZA 1MEC3 2DV9A 4CTEA 4QPWA 1UOJA 1A78A 1K5MC 2VBPA 1LGCA 5F7UA 4DRRA 1U5IA 4ZFWB 4CCLA 4YGDA 5FYIA 2IVJA 4GOYA 1U5ZA 2RJLA 5EHDA 5FMOS 2OKXA 1V6WA 5BP5C 1HB1A 3OEAA 1XNTA 1PO22 1R1A3 2RM23 4QX5A 3DYPA 1SZ6B 4P0KA 5GAQA 1J83A 4RHV2 3VKOA 3W21A 4AVAA 1YBIA 4YZ2A 4FO9A 1I3HA 3VDCA 3O49A 5F2SA 4OZXA 4PF1A 3FJAA 5BXPA 2P3KA 4N9HA 2EXIA 3GBWA 3NNJA 4CCJA 1CAWA 4Q4W3 1I5ZA 1RUNA 4OWLA 2IZWA 1G9AA 4Q4V1 4RR3A 1AVUA 4IESA 1E0OA 3MV11 4ZPIA 1F31A 1UIKA 3T2QA 3VKNA 1CJDA 2F17A 2D6MA 4FQZA 4ZXKA 3WP5A 5FDBA 2VTFA 2WT2A 1PX3A 2FGFA 1WA4A 1ZX5A 2XKOA 3DV8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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