4A7ZA

Complex of bifunctional aldos-2-ulose dehydratase with the reaction intermediate ascopyrone m
Total Genus 200
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
200
sequence length
887
structure length
881
Chain Sequence
EQPAALPLFQPQLVQGGRPDGYWVEAFPFRSDSSKCPNIIGYGLGTYDMKSDIQMLVNPYATTNNQSSSWTPVPLAKLDFPVAMHYADITKNGFNDVIITDQYGSSMDDIWAYGGRVSWLENPGELRDNWTMRTIGHSPGMHRLKAGHFTRTDRVQVVAVPIVVASSDLTTPADVIIFTAPDDPRSEQLWQRDVVGTRHLVHEVAIVPAAETDGEMRFDQIILAGRDGVDCLWYDGARWQRHLVGTGLPEERGDPYWGAGSAAVGRVGDDYAGYICSAEAFHGNTVSVYTKPAGSPTGIVRAEWTRHVLDVFGPLNGKHTGSIHQVVCADIDGDGEDEFLVAMMGADPPDFQRTGVWCYKLVDRTNMKFSKTKVSSVSAGRIATANFHSQGSEVDIATISYSVPGYFESPNPSINVFLSTGILAERLDEEVMLRVVRAGSTRFKTEMEFLDVAGKKLTLVVLPPFARLDVERNVSGVKVMAGTVCWADENGKHERVPATRPFGCESMIVSADYLESGEEGAILVLYKPSSTSGRPPFRSMDELVAHNLFPAYVPDSVRAMKFPWVRCADRPWAHGRFKDLDFFNLIGFHVNFADDSAAVLAHVQLWTAGIGVSAGFHNHVEASFCEIHACIANGTGRGGMRWATVPDANFNPDSPNLEDTELIVVPDMHEHGPLWRTRPDGHPLLRMNDTIDYPWHAWLAGAGNPSPQAFDVWVAFEFPGFETFSTPPPPRVLEPGRYAIRFGDPHQTASLALQKNDATDGTPVLALLDLDGGPSPQAWNISHVPGTDMYEIAHAKTGSLVCARWPPVKNQRVAGTHSPAAMGLTSRWAVTKNTKGQITFRLPEAPDHGPLFLSVSAIDAIPVIVQGDSIELSAWSLVPAN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Lyase
molecule keywords ALDOS-2-ULOSE DEHYDRATASE
publication title Crystal Structure of Bifunctional Aldos-2-Ulose Dehydratase/Isomerase from Phanerochaete Chrysosporium with the Reaction Intermediate Ascopyrone M.
pubmed doi rcsb
source organism Phanerochaete chrysosporium
total genus 200
structure length 881
sequence length 887
ec nomenclature ec 4.2.1.110: Aldos-2-ulose dehydratase.
pdb deposition date 2011-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF18056 PBP3 Penicillin Binding Protein 3 Domain
A PF18637 AUDH_Cupin Aldos-2-ulose dehydratase/isomerase (AUDH) Cupin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.990 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 4a7zA02
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 4a7zA03
4JKXB 3UJ0A 5BP5C 1IT0A 3AKGA 3C9ZA 3HN1A 1G9BA 1BARA 2K43A 3NBCA 5BQUA 1JQZA 1Q04A 4X37A 1V6WA 2RG9B 2VSEA 4KEKA 4R6UB 4EFQA 3S8JA 5GAQA 4GAFA 1ISVA 4J2SA 1ISWA 1CVSA 4I2SA 1YBIA 1HKNA 1G9AA 1SR4C 4P0KA 4ZGRB 5EHAA 5F8WA 4I96A 5BQUC 3N7MA 4XKIA 3UD9A 9ILBA 1BFCA 4LO3A 1WBCA 3NBDA 4WBCA 3FJFA 1ONKB 2NVHA 2R9KB 1Z0HA 3A23A 3UJ4A 1EPWA 1V6VA 5BOWA 3WMVA 2AAIB 4GOVA 4J2YA 4ZFWB 4TLPA 1S0CA 3N0KA 3FJJA 1AVXB 3Q7YA 5FZZA 4I4PA 2VXRA 4OEEA 3F62B 3V0AA 4OEFA 2WBCA 1TIEA 3BAHA 3E8LC 1WD3A 3QYDA 4J2KA 4I4OA 3FJAA 21BIA 1QQKA 3A21A 2VUAA 3BADA 1YTOA 4QALA 1TP0A 4I0YA 3V0AB 1TFMB 3RTJB 3N7KA 1JY0A 1S0DA 3FJDA 3CA1A 4LO8B 3OBRA 3BAOA 5DUYA 3ZXGA 3KMVA 1AXMA 3OJVA 1FWUA 4A7KA 3FUQA 1Q1UA 4J2XA 3PHZA 4X3AA 1AF9A 3FJ8A 4JRAA 4LO2C 3T8SA 4D8HA 2FFVA 3H6QA 3ZXDA 1II4A 1XZZA 1ILR1 3AH1A 3O5WB 1BA7A 2MC2A 3VT1A 1AVWB 3WO3A 3OGFA 2NM1A 1F31A 4Z9WB 3ZC9A 3HALA 3H6RA 4ZA3B 1M2TB 3MPPG 6I1BA 3I2AA 1K5UA 4AN6A 1XHBA 4HJJA 3O4OA 1M16A 1K5VA 4IQPA 4OW4A 3H6RB 4GAIA 1T9FA 3D7WB 5I1BA 1S0LA 4Q9GA 2D22A 2Y9FA 1YF8B 3P53A 4PC4A 1FV2A 5FZYA 4EKXB 4I4SA 3V0BA 1V6XA 3W9TA 1ISZA 1MD6A 1BASA 3R4SA 4ISRA 4IY8A 4QKRA 2D20A 2QYIB 1KNMA 3O44A 3K1XA 1XG6A 3AKFA 2KH2A 3A22A 2NYYA 4H9WA 3H6SE 4QBCA 1SR4A 2D44A 2GZBA 1ABRB 3VEQA 1OQLB 2NZ9A 1P63A 2DS0A 3BAQA 5D61A 2ESUA 2D1ZA 2D43A 3AZWA 1DFQA 1S0GA 1YYNA 3O4AA 3FJHA 4H04A 3NBEA 4IZXA 4GP3A 4OWLA 4I4XA 1HWNB 3NJ5A 2FDBM 5DSSB 5F8YA 2DRZA 1W3GA 4CJMA 3CA3A 2QN4A 3PUBA 2XOAA 4OUJA 3P6JA 4P0LA 4IONA 3IM5A 4QKSA 1R8OA 1A8DA 4GP0A 4L4HA 4A7ZA 3JUTA 1DJSB 1ISXA 4ENDA 1DQOA 4EFRA 3WO4A 4KEJA 2J3PA 3CA6A 2BEAA 5EG6C 2FO1A 1E0OA 2UUSA 2VXTI 3WO2A 5FNWA 1T4QA 4I4UA 1TWEA 4ZOTA 3RMYA 1NZKA 4JKQA 1BFGA 3LLPA 3FJCA 3B9UA 2HWAA 1FN0A 1JT7A 3LTQA 2AFGA 4LO2A 2HWMA 4HR6C 3O4BA 5E24E 2BEBA 5BXRA 4ZBVB 4USOA 4LO0A 4JAWA 2IHOA 4JP0A 1QQLA 4Q91A 1WD4A 1TTUA 3AH4A 3VSZA 1BLDA 2RSTA 3S8KA 1CE7B 2M49A 2I1BA 2P39A 1EV2A 4A7YA 3HOMA 3OBTA 4JQ0A 4L4IA 3VSFA 1I1EA 3RSJA 3BRFA 1EYLA 1JT5A 1MC9A 4LO0C 1PC8B 2FFUA 1BFFA 5F8SA 1DZDA 1BFBA 3FUOA 1FMMS 3IAGC 5B2HA 5DVHA 2Y9WC 2L5XA 3CA0A 3CRIA 3JRRA 3AKHA 2D23A 1I1BA 5F90A 2BFHA 2ET2A 3PMEA 4G9MA 5BXTA 1AVAC 4LO1A 2MLLB 3R4UA 1Z4SA 4Z8SB 3OJ2A 3BA7A 3BTAA 4G9NA 4XFUA 1FWVA 2Y9XE 1AFCA 1PUUB 4EB2B 1GGPB 5DZUA 1JT4A 2X2SA 2MIBA 1IOBA 1DIWA 2ZQNA 5HPZA 3CQAA 4QC4A 4YOLA 1IILA 2VLCA 4OWJA 1WBAA 3O4DA 1S0EA 4J23B 4LO1C 4QBVA 2D24A 4X38A 2KLLA 2K8RA 4II0A 1HWMB 3UD8A 3WINA 3V0BB 7I1BA 2ZQOA 3CRHA 3AKIA 3Q7XA 3CRGA 2Q3NB 5EC5A 1ITBA 4KEIA 2E4MA 3RTIB 3BAUA 1FQ9A 4D0ZA 1ISYA 1JLYA 2KI4A 1R8NA 4DEPA 3FJ9A 3O4CA 2ERMA 1FV3A 2KI6B 2P23A 3AH2A 8I1BA 4I7IA 4JPZA 3CA5A 3WINC 3WMUA 4ZFYB 5BVPI 1G82A 4IY9A 1HIBA 4FGFA 1DZCA 1L2HA 1V6UA 2E4MC 3TC2A 1HCDA 4G6JA 3HBWA 2KKIA 3POKA 1W3AA 2RQ9A 3VUOA 1JT3A 2DREA 3WA1A 1G9DA 3VT0A 3BAGA 41BIA 5G00A 4OWKA 4X39A 4I8MA 4IZEA 4I3NA 3N7JA 4DENA 4AN7B 1RZOB 1VCLA 4G1RA 4G6MA 3I2XA 4OEGA 3FJKA 2Y9GA 5BXPA 2AXMA 2Z49A 2D7RA 3OJMA 3N7LA 4EEEB 4I1BA 2LIEA 3QR5A 5JMCA 1TOOA 4ZKTB 2NP0A 3P6IA 2D7IA 1EVTA 1FMZA 3AZVA 3BRDA 4ZFUB 1N4KA 4XFSA 1PWAA 4GOYA 2VU9A 1J0SA 1HCEA 1HWOB 3FJEA 3PG0A 2LIQA 3AJ6A 3CU1B 4USPA 1YXWA 4P6AA 4KC3A 4DCKC 4LO3C 4IYBA 31BIA 4I4VA 3VT2A 4I1EA 3BB2A 4ISQA 4KBBA 3SNVA 2AQZA 1FGAA 4F34A 1UPSA 1RMLA 1W3FA 3HMYA 1NUNA 1G9CA 3NBNA 3BA5A 2NTDA 2F8XC 1RY7A 3MALA 4I6IA 5D63A 3IM7A 1Q03A 1PUMB 2HZ9A 5D62A 3O3QA 3Q7WA 3UD7A 3FFZA 3F1RA 1HWPB 3CAHA 1DQGA 3FJBA 4P0JA 4Q9PA 2F2FA 1S0BA 3V79C 1IRAX 1DLLA 2K4AB 4I4RA 3CA4A 1DFCA 4FVVA 3BRGC 3BAVA 3OGGA 4I4YA 4I37A 2YUGA 4ZLBB 3VWCA 3O49A 3IM6A 5FZUA 3BX1C 1JLXA 1TWMA 2Q9XA 1IHKA 2F2FC 2WRYA 3BA4A 2HW9A 1QXMA 4I4QA 4QD2B 2GO2A 4XFTA 4EFPA 4QO3A 3UDAA 1XYFA 3IIRA 1AVUA 2FGFA 1Z2VA 2ZR1B 3ZC8A 1D0HA 4D0TA 4QD2C 1RG8A 2Z48A 3A07A 1BLAA 4HA2A 3AJ5A 5BXSA 5JLVA 5FNXA 3FGMA 1IRPA 3ZX7A 4LO7B 2VSAA 3EF2A 1JTCA 1PZZA 5BP5A 2DRYA 4F83A 3FJIA 3I29B 1S0FA 4LO7C 2IWTB 2X2TA 1IJTA 3ILAA 4IHZA 3RMXA 1SZ6B 3HSMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JKXB 3UJ0A 4AL9A 4RQPC 3I97A 2JICA 1NY71 5JOXA 5BP5C 3LZZA 3D4KA 5LWBA 1OSGA 1RUJ3 2JD9A 4WZFA 5F2SA 2K43A 5FCCA 2XMLA 3TNPB 1KXGA 2Y6GA 4LBKA 4N43C 4JQRA 5KHJA 4L0PA 1O6UA 1ACCA 2BBAA 2VVFA 1O5UA 2QQNA 2RR12 2VCCA 3FHIB 4Y22A 4AR2A 5AC93 5GAQA 4PLOA 5FZ8A 3VDDC 1J84A 2DCTA 1OI6A 3IDEA 2Y6FA 4JDOA 2ZGPA 3ZSMA 1CVSA 4CDQA 2VOKA 1G9AA 3WLUA 4FPJA 1UYZA 5DAQA 4ZU4A 1G7YA 2BERA 1AYN2 3VKFC 2JB8A 2Z5WA 4E2SA 4K21A 1ZZBA 1LHNA 1B35C 3KV9A 1S1AA 3MDPA 4DS0A 5EHAA 5BQUC 4IW3A 3LSDA 1RUG1 3F2ZA 3OUJA 4RYDA 4Y22B 1W99A 2RS12 1BK0A 3AL6A 5F3EA 4XKIA 3UD9A 2AZ5A 2J1TA 4XEZA 3WDWA 5KXCA 1BFCA 4LO3A 4CDQB 3HNMA 3H7YA 3T3YA 3VBHA 5BYNA 3N35A 3NBDA 5CKMA 3FJFA 1AR73 2NVHA 2R9KB 1V9U3 4MVTA 4EV0A 4QPGA 1S4CA 4UW5A 1RMU2 2YB7A 3MIEA 4Y1UA 5BOWA 4Z8BA 1H30A 2AAIB 1XNCA 4OUMA 1CPNA 2PAKA 4P9IA 2J1RA 4K20A 1J1TA 1S0CA 3M7AA 3VBRB 5FZZA 4B1MA 1LTEA 4QDRA 4QM9A 1L7RA 3WNMA 4DEQA 5CFCC 4OEEA 5F5IA 3WP5A 5C9AC 3F62B 4W6YA 3ZIWA 2XQRA 3E8LC 2IWGB 3C7FA 4C8DA 1D2SA 4CCJA 3A21A 1POQA 5EP9A 3VD9A 2WS93 5C3RA 5FP4A 5JDBA 3ME2A 3C7EA 3OGJA 2Y6KA 1UMIA 1GP4A 5DUWA 2WZR1 1TP0A 3WW4A 2DF7A 4COZA 2CGOA 4EN7B 4GMP1 4EROA 4Z2WA 4M01A 4CDXA 4BQ3A 2CDPA 3ZFEA 4PT6A 2YBPA 5CVRA 3JXSA 1S0DA 2RM21 4FCAA 4D6SA 3CA1A 1HDKA 3KMVA 2D6NA 2FQPA 4GULA 4UT5A 4XUQA 5F8PA 5FJHA 1YLLA 4FFFA 4A7KA 1AXMA 2CV6A 1F4HA 2XHKA 4O65A 2Y33A 4CEWC 3VB9A 1WW4A 1K5MC 1R092 2HEYF 3D3AA 4ITCA 1US2A 4K6BA 4JHZA 4XJAA 5H9QA 3ZFEB 5A6XA 1CZVA 2GN3A 3T8SA 2FFVA 3H6QA 3IWZA 4WVZA 1W8UA 2RMU1 1XZZA 4MGYE 2DBNA 4LHLA 4BU2A 2JJ6A 2Q1ZB 3D6EA 3H1YA 3AXEA 3VT1A 3QH6A 3J7MA 4XBLA 5BXXA 1KITA 3NQHA 1NA1C 3ZOIA 4RHV2 1V9U2 2W08A 3AB0A 2F6BA 1HRI1 2GC0A 2QQJA 2BVVA 4FPFA 1NOVA 4RR3C 2J1UA 1FAYA 5A1LA 3HALA 4Q4W2 2Z69A 1US3A 1H8VA 2WA4A 3U07A 3ZYJB 4IEPA 4Y26A 1QWRA 4GWIA 3HNBM 5J1XA 4AN6A 3MI8A 2HKXA 2AENA 2OPKA 2VZPA 5C71A 4HJJA 5CNAA 4YVSA 2JIGA 2G9FA 5JR7B 2A5ZA 2GNTA 2UY9A 2QQOA 2VUCA 4Y20A 1T9FA 1NLRA 5I1BA 1I3HA 4IV3C 4BQWA 5I91A 4XTMA 4FTBA 2AREA 4R9BA 1YF8B 1OF4A 4Q9GA 4GKXA 5FO9B 5FZYA 2WS92 3OGRA 1NCQC 2W52A 1NCRC 5T50A 4YVSB 1VBB2 3ITQA 5E6HA 2B4KA 2W1WA 2WRAA 4GH4C 4I4SA 3V0BA 5FWEA 2HBUA 4R4ZA 1ZZ7A 4ZXEA 4Y20B 5FYMA 1BXHA 1PVXA 1DF0A 1IG0A 2GU9A 3R4SA 1Y9MA 4P5YA 5C3QA 1AZDA 4ZHNA 3GHMA 5IVVA 2DWRA 1TMF1 3OUHA 5ERLA 4XJWA 3O1TA 2G19A 4AEDB 3A22A 2WZEA 4DXTA 1LECA 4H9WA 3H6SE 1SR4A 4IEYA 1C8M3 2GZBA 4MGSA 3OJBA 1HCEA 1BMV2 5LRSA 1UNBA 4O9EA 3SXWA 1LESA 4MADA 3HD8B 2JDUA 4GALA 3H8RA 3CF6E 1C28A 2VOWA 3AL5A 3RWKX 3BAQA 1S2EA 1Q43A 5KBFA 1CAWB 3I59B 5FYSA 5T52A 4HK9A 3MLJA 1W90A 1YYNA 4XW3A 4H04A 4HBNA 2AGSA 2JE8A 2ZTNA 5JCTA 1OQDA 3NL1A 3NJ5A 4HANA 4NHYA 4I4XA 4MV2A 1RUE2 2PHDA 2FDBM 2VZVA 1R1ZA 1UIKA 1C5HA 1W6OA 4L97A 1WMXA 4WM8C 5F3CA 5F8YA 3NWKA 1O4ZA 1PO11 2R041 5I8SA 4DZGA 4NIHA 2WNUB 4U2AA 2GZWA 4FO9A 5GZCA 3TEZA 1YFWA 1RUH3 4ONUA 3P6JA 4OUJA 2HWF3 3IPVA 4UOJA 3IM5A 2VQ0A 1YQCA 4C0HA 2C6SA 2C1FA 2PHLA 4GB31 4OHWA 1GQGA 1W8FA 3O1MA 1GKBA 4A7ZA 4CSWA 5JSPA 1W6OB 1DJSB 4L4HA 5GLVA 4QX2A 4ENDA 3J8F3 4Q0VA 1VB4A 4R9CA 2E63A 5FZ3A 1C5IA 4CEYC 2XG3A 1AR83 2LUWA 3E5UA 2J3PA 3IPVB 4FPKA 3VGIA 1E0OA 4FPLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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