3BTA | Genus

Total Genus 336

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	336
sequence length	1295
structure length	1277
Chain Sequence	PFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNVGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
molecule keywords	PROTEIN (BOTULINUM NEUROTOXIN TYPE A)
publication title	Crystal structure of botulinum neurotoxin type A and implications for toxicity. pubmed doi rcsb
total genus	336
structure length	1277
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	1998-08-12

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3btaA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3btaA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3btaA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3btaA01

1VLNA 4AN6A 4Z9WB 3LLPA 3MW4A 1A8DA 3M1HA 3WG1A 4ISRA 4I2SA 2DTWA 4XIKA 1N3OA 2F2FA 4FOQA 1ULCA 1N1TA 5KXCA 2FPQA 4EEEB 3N7MA 4YW2A 3O4BA 3QW7A 2FMDA 1QXMA 4YM0A 1ENRA 4Y1VA 4GP3A 3WO4A 2A6YA 3B69A 2D24A 5IK8A 3WV6A 2D6NA 1AVUA 4I4VA 1F9KA 1IS4A 1I1EA 2GNMA 2E4MA 2XHLB 3VKFC 5DSSB 4ATFA 1T4QA 4OZXA 5BQMA 1KJRA 2GZBA 4DFSA 1DYKA 1QKQA 3JU9A 3WZ1A 1SBFA 5GLZA 5D63A 3ZXLA 2D20A 3D7WB 1DYPA 1ONKB 4JRAA 2A3WA 1S1AA 2ZQNA 4G1RA 41BIA 4FOVA 3N7KA 4IONA 3AZYA 1DIWA 2P37A 3R4UA 3VEQA 1MZ6A 2E53A 1DQGA 2VY0A 2DUQA 3R4SA 1G7YA 2VW1A 2Y9FA 4K1ZA 1Q03A 1VAVA 3AYDA 3AZVA 2GALA 4ZLBB 1LECA 1Z78A 5EYXA 2NYYA 1Z2VA 2XHLA 2VSAA 2ZABA 1W6OA 4RA0A 1CESA 3QW8A 4Z8BA 1ZL6A 1FV3A 4YOLA 1PZ8A 4YGBA 1YVGA 2ZMNA 3AJ6A 2A6XA 1KQRA 1SLIA 4YLZA 4HR6C 3A23A 2A71A 1UAIA 1ITBA 2WLQA 2F8XC 4ENDA 4XTMA 2P23A 4XTPA 1LOBA 2A3XA 1GYKA 2Y9GA 5GAQA 4EL4A 3AKFA 5H9SA 2RHPA 3VT1A 1IILA 3VKLA 3BX1C 2DWRA 8I1BA 1HCEA 3NV4A 2IMBA 4FPKA 3EF2A 1GV9A 4HEVA 3B00A 3B01A 4IZEA 4TZDA 2D23A 1FYUA 4K1YA 1JW6A 1BYHA 4J2SA 4FP2A 2P3KA 1V6WA 4DPNA 3V0BB 3AH4A 1TWEA 3BA4A 4U36A 2AENA 4BQ1A 4U2AA 3AJ5A 4F34A 4YGCA 1DFQA 1C4RA 4XBQA 4WV8A 1S0FA 2GMMA 4FQ4A 4ZJXA 1FMZA 7I1BA 1LJ7A 3WUCA 3R05A 3AYAA 5CAZA 3ZSKA 3WO2A 1DBNA 5F9TA 1W6PB 1KNMA 4G9NA 1GLHA 2A6ZA 1QF3A 1JT3A 2W39A 3LSEA 4CRQA 1PZ9A 4XILA 4H9WA 4OEGA 4ISQA 2SBAA 4LBQD 1SLBA 2A8AA 3DGTA 1AXKA 3ZXGA 3WDTA 1Q8VA 3KMVA 4AVVA 3UJQA 1ZL5A 1GANA 5CBLA 3HALA 3AFKA 4UW6A 2UU8A 1IS5A 1GBGA 1WCSA 4Q9PA 4XXAA 1LTEA 2YUGA 2EAKA 1WLWA 3W58A 5F8YA 2NP0A 2CY6A 5AVAA 5DZFA 2AH2A 3AX4A 1J0SA 3AXEA 3E8LC 1BLAA 4AYUA 4OEEA 4X38A 3BAGA 2ZGTA 1AXMA 4ZKTB 4I4PA 1CVNA 1W6PA 5T54A 4M3CF 1ZKXA 2TEPA 1W0PA 4H55A 3BAUA 5JOXA 3BAOA 4D8HA 5FZYA 5FZUA 4AN7B 2FFVA 4YW5A 1O4YA 3BIWE 3F62B 4I4RA 2OUJA 4TLPA 3O12A 1JYCA 1DQ6A 1Q8QA 1N47A 1CR7A 3ZXKA 4XXPA 4UW3A 2ARBA 3ZSJA 1DLLA 2DUPA 5DZUA 2R49A 2EXIA 4FPOB 1HDKA 2JD4A 3AKGA 1DGLA 4GP0A 1LHNA 2BFHA 1MACA 2LIEA 3GNEA 3QW6A 3WDXA 5IK4A 1Z7HA 2EIGA 1LGNA 1TOOA 4Y20B 5BQUA 4YGDA 3BA7A 3H0OA 3O0XA 5IK7A 4FPYA 1JOJA 1WLDA 2VU9A 4KBBA 1DQ2A 3T2TA 1RY7A 1V6NA 4LBLA 4I4QA 1W6NB 1G86A 3CRIA 2AREA 1II4A 2ETFA 3NJ5A 2WT1A 3OJ2A 3SH5A 3O3QA 2IMAA 1FV2A 3ZURA 2QN4A 5HPZA 2CL2A 1GICA 4ELCA 3JUTA 1ZN3A 2ZMLA 3NF3A 2Y9WC 1G9DA 4YFWA 3ZUSA 4EJ5A 5DUVA 1G9FA 3M3QA 4F83A 2H0BA 3DDBA 3O5SA 4YG6A 3IPVB 4A7ZA 1SACA 3FJFA 3DSEA 1JY0A 1QOSA 1BFGA 5KXBA 4XBNA 5IT6A 2FO1A 1V6MA 3SH3A 1JQZA 1TEIA 4Y20A 4IYBA 4OWJA 3ASIA 5FRAA 3BAHA 3P6JA 2ZHLA 1W3GA 4IHZA 3FUQA 3UD7A 5EYYA 3JUUA 4AGVA 4XBLA 4JCKA 4YZ1A 4BLJA 2K8RA 3CA0A 1LOGA 3A4UA 3T8SA 1FWVA 3WCRA 1LHVA 1LOAA 1S0JA 1FMMS 3VKMA 2VLCA 3IPVA 1DQ4A 1AVWB 2P3IA 4I3NA 1ISVA 5D62A 1Z4SA 2W52A 4AGRA 1WD3A 3BTAA 3AYEA 4PCRA 1N3PA 3FGMA 1KITA 2MC2A 5KXDA 1S0EA 3UK9A 2DVDA 2WRYA 3C88A 2YROA 1AX1A 4QBCA 4X39A 1LGCA 5CNAA 3RSJA 2C9AA 3FIEA 4Y22B 1LENA 1E1HA 3ZC8A 3HMYA 4FPJA 4TYSA 2E4MC 1B09A 4GAFA 4JC1A 1DQ0A 5GM0A 2PELA 2BEAA 2AGSA 4FVVA 4PQ9A 1OQLB 4ZXKA 1BZWA 1XTGA 4WZFA 1M16A 5CB7A 4YW4A 5F8SA 4ITCA 3USUB 1D2SA 2ISHA 4I7IA 5BOWA 1BXHA 4FPHA 2WSUA 4PBOA 5L73A 3FUOA 3HBWA 5DG1A 4GA9A 1XYFA 5EWSA 5BXSA 2ZGSA 4ZOTA 2JE9A 1IRAX 3BRFA 4P14A 2Z42A 1AJOA 2YZ4A 1G9CA 1FX5A 2D6PA 3POWA 3QIYA 3A0KA 2VSEA 4Y22A 1LULA 3FLRA 2FDBM 3UL2A 3POYA 4P0KA 4ZBVB 1U0AA 1BFBA 3NV2A 3OJVA 5E8AA 3SNVA 4YZ5A 4G9MA 1DQ5A 4Q1PA 4QO3A 1QNYA 4MYEA 3ZYRA 1Q8OA 4XZPA 2VUAA 4A7KA 3QCWA 2EF6A 3WNXA 2UUSA 5F90A 1ISZA 3LCPA 4I4SA 3USUA 4XKIA 1ZM1A 1JXNA 3ILRA 4GKXA 3AP7A 2FGFA 4Y1XA 3N7LA 4YW3A 1LU2A 3MEPA 2W2DB 2WT0A 4PF5A 3FJJA 2D6KA 1SCRA 4NOTA 4DEPA 4YZ4A 5T5OA 3KM5A 1YI7A 1C57A 3O0VA 1MVQA 3CA4A 1EPWA 1CJPA 5T50A 1SZ6B 4KC3A 4LBMA 1CPNA 4L8QA 5GZFA 1AF9A 4LBQB 3O4AA 4R9CA 1P63A 3K1XA 3KQRA 1W6OB 2AUYA 4GOYA 3AH2A 3N36A 2NMOA 1VCLA 4UW5A 4D0ZA 4HL0A 2RQ9A 2HWMA 4FP3A 4IZXA 1W3AA 3BOPA 5E24E 2DVFA 2Q5TA 3APBA 5EC5A 1HWPB 4WBCA 4I6IA 2W2DA 3IM0A 3WINC 1Q04A 4CTEA 2AFGA 5T5PA 2JKBA 1ULEA 1HKNA 2GO2A 4IY9A 1BJQA 4M01A 1KDKA 3T1MA 2BEBA 1MS8A 3QW5A 3CRHA 4FPEA 1AXZA 1UN1A 3AZXA 2M49A 3FLPA 4FPGA 4LBQA 2G4IA 3PVOA 1W6QB 4UW4A 1WBLA 1BA7A 4P9WA 3TC2A 1S0GA 5F5QA 9ILBA 3RG0A 2ENRA 1WBCA 3QIZA 1MD6A 2AQZA 2E7TA 2KI4A 5GALA 2CWMA 1UX6A 3MW2A 5EXOA 1GZWB 4GOVA 1ILR1 1R8NA 2ESUA 4EFQA 4GWNA 5HCFA 1CE7B 1MR5A 1SBEA 4XHBA 2NVHA 4USOA 1YRZA 3POKA 2A6WA 4IQPA 5JOZA 2AXMA 4YGEA 1V6IA 1AFCA 3WDVA 5F8WA 2JJ6A 2P34A 3ZVXA 5IUQA 1W6QA 2SLIA 2DS0A 2YMZA 1TFMB 1G8WA 3W9TA 1T3AA 1UZZA 1H9WA 2GN7A 3C89A 1UKGA 1V6OA 1RZOB 3VKNA 2D3RA 3AP4A 3PJQA 4GXLA 2QYIB 3VT2A 1XHBA 2ZBJA 1GZWA 2UWCA 2KKIA 2E6VA 4I4YA 2HZ9A 4ZFUB 1ISXA 3RMXA 4I1BA 3NBNA 2G7KA 3MW3A 3UD9A 4USPA 4LO3C 4JQ0A 3WINA 2GMPA 2ZGRA 2ES3A 5HCAA 3UDAA 3BOKA 4Q1RA 4LBNA 4ZGRB 2GDFA 4LBJA 1D0HA 4NO4A 3IN9A 3BAQA 3DDAA 5G00A 1CPMA 3D6EA 3CRGA 1G9BA 3HOMA 4P0JA 5BQUC 3HSMA 2ZGOA 2ZHKA 3WG2A 4SLIA 4ZA3B 3DEBA 2EALA 4LO7C 1CQ9A 1BFFA 3O44A 3OBRA 1LOCA 2AAIB 4LO2C 5T5JA 1T9FA 3BRDA 3L2YA 2NM1A 5BP5C 1DQ1A 3BRGC 4BOWA 3AK0A 3FJAA 1L2HA 3H6SE 1H9PA 1W0OA 2ZHMA 5DUUA 1LHUA 5JOWA 2G7PA 5BQNA 1JBCA 4R9DA 3O49A 4XFSA 1S0BA 4QKRA 4HA2A 2ZGKA 1ABRB 4RL7A 4XIOA 2DUOA 1LHWA 1F5FA 3S8JA 1JUIA 3RTJB 4DENA 4AVSA 1EYLA 3DUIA 4II0A 3AH1A 2YY1A 1S0IA 1LGBA 4X3AA 1XQNA 2K4AB 1ENQA 1RINA 3HR9A 3NBDA 4XFUA 3WUDA 1Y7BA 4J1LA 1NUNA 2W08A 2X2SA 2NMNA 4LO7B 2D6MA 1EV2A 3VUOA 4J2KA 1QDOA 2ZR1B 4D69A 1OKQA 1QQLA 1TTUA 3QLQA 1ULFA 3PMEA 2ZGMA 3V0AB 4LO3A 2R16A 1IS6A 2WQZC 2I2SA 1RMLA 1TIEA 1GZCA 2ZGPA 1WD4A 1MC9A 3ILFA 1IRPA 3OY8B 2EXJA 1WUVA 2UWAA 1MVEA 1N1VA 3SLIA 2IMCA 2R9KB 4ATEA 5DG2A 4H04A 1BKZA 3AKIA 3HN1A 3M3OA 1QMJA 4OWLA 4Q91A 3V65A 1VALA 4WVWA 3H6RB 2HW9A 1APNA 3Q7YA 1G9AA 4FPLA 1WW4A 4LO2A 5BP5A 4AWDA 3AZWA 1BQPA 3V0AA 1HQWA 2G7NA 2NZ9A 3B9CA 3PHZA 2OVUA 3UD8A 1DQOA 3AXDA 3OY8A 4I96A 4OW4A 4KTXA 2NN8A 2DU1A 3WMUA 4ZFWB 1YO8A 3RMYA 5LK5A 3BAVA 1N3QA 5EG6C 1C1LA 2KM2A 3VWCA 4M00A 3H6RA 3ILAA 3BWIA 3CAHA 31BIA 3CQAA 4BM8A 2DURA 5H9PA 1QOTA 2HWAA 3DS9A 4XJZA 2MLLB 3Q9OA 1GSLA 2IWTB 1GNHA 2XOAA 4FQZA 5H9QA 2PHTA 4I4XA 2DREA 3VKOA 1O4ZA 3N7JA 2ZHNA 1I3HA 4XJUA 4YM3A 1SLLA 4R6UB 3K3QB 2D43A 1XZZA 4KEJA 2CTVA 1UL9A 1URXA 2CWSA 1S0LA 5JMCA 3I4IA 4DCKC 3AJZA 3WDYA 1JTCA 5GZEA 4Y1ZA 1IKQA 1LOEA 3Q7WA 3TAYA 4XDQA 4X37A 2NTDA 1QNWA 2ZGUA 4KEKA 2ISGA 1ZB7A 2ERMA 1JYIA 1C1FA 2EXKA 4C1WA 4P9XA 3FJ9A 5DZGA 2UWBA 4PC4A 1QU0A 4QBVA 2GNBA 2ZAAA 2DVBA 1FATA 2WKKA 4HJJA 3WO3A 2K43A 1V6LA 2RG9B 1ONAA 2ISEA 4Q9GA 1BFCA 4YZ2A 4GKYA 4J2YA 4L4HA 1RIRA 4Y1UA 1IOBA 1SBDA 3ZSLA 2KI6B 3D3XA 2A5ZA 1HQLA 1UZYA 2WT2A 2DRYA 4DQAA 2Z49A 1YYNA 4QKSA 2G7QA 1NZKA 2D6LX 4DRRA 3C9ZA 2D7IA 1R1ZA 2WBCA 1UMZA 1MS9A 4Q27A 2PHWA 2R1BA 4XHXA 3OJMA 5GZCA 1Q56A 1VAMA 1V6VA 1CN1A 4Q8KA 4LO0C 3I8TA 1DZDA 4Y24A 3OGFA 1J1TA 4P9YA 4BMBA 2D3PA 5BVPI 1OFSA 2YXSA 4YW1A 1EVTA 3O4CA 1PZ7A 3AJYA 3FJKA 1MS0A 4XFTA 1LOFA 1E0OA 2ET2A 5GLWA 1LCLA 1H30A 3I29B 1MZ5A 3FIIA 2A70A 3B3QE 2A6VA 3WDWA 4BPZA 5JDBA 3PVEA 2JE7A 1PZZA 3BOOA 2Q3NB 1SFYA 5JOYA 2E7QA 3BODA 4R9BA 4KS6A 1A78A 1YF8B 4LBKA 1AX2A 2DV9A 3T1LA 2ZKNA 3ENRA 3IKWA 3ILNA 5T52A 1W6MB 3BADA 1YBIA 4OEFA 3ZXDA 4XE9A 3CA6A 4I1EA 4BLIA 2P2KA 1S0DA 3SH4A 3P53A 2J3PA 1JT4A 4FGFA 1ULDA 3IAGC 2P3JA 2D3SA 1HWMB 1RITA 1MS3A 5FNWA 3ZUQA 1Q8SA 2E51A 3TB0A 2IHOA 4YZ3A 2JDZA 4J23B 2KLLA 2AYHA 4GWMA 3O4OA 3WVJA 4I8MA 1WBFA 3WMVA 4YM2A 3I2XA 3VT0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3BTAA

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