3FFZA

Domain organization in clostridium butulinum neurotoxin type e is unique: its implication in faster translocation
Total Genus 344
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
344
sequence length
1251
structure length
1246
Chain Sequence
PKINSFNYNDPVNDRTILYIKPGGCQEFYKSFNIMKNIWIIPERNVIGTTPQDFHPPTSLKNGDSSYYDPNYLQSDEEKDRFLKIVTKIFNRINNNLSGGILLEELSKANPYLGNDNTPDNQFHIGDASAVEIKFSNGSQDILLPNVIIMGAEPDLFETNSSNISLRNNYMPSNHGFGSIAIVTFSPEYSFRFNDNCMNEFIQDPALTLMHELIHSLHGLYGAKGITTKYTITQKQNPLITNIRGTNIEEFLTFGGTDLNIITSAQSNDIYTNLLADYKKIASKLSKVQVSNPLLNPYKDVFEAKYGLDKDASGIYSVNINKFNDIFKKLYSFTEFDLATKFQVKCRQTYIGQYKYFKLSNLLNDSIYNISEGYNINNLKVNFRGQNANLNPRIITPITGRGLVKKIIRFCKNIVSVKGIRKSICIEINNGELFFVASENSYNDDNINTPKEIDDTVTSNDLDQVILNFNSESAPGLSDEKLNLTIQNDAYIPKYDSNGTSDIEQHDVNELNVFFYLDAQKVPEGENNVNLTSSIDTALLEQPKIYTFFSSEFINNVNKPVQAALFVSWIQQVLVDFTTEANQKSTVDKIADISIVVPYIGLALNIGNEAQKGNFKDALELLGAGILLEFEPELLIPTILVFTIKSFLGSSDNKNKVIKAINNALKERDEKWKEVYSFIVSNWMTKINTQFNKRKEQMYQALQNQVNAIKTIIESKYNSYTLEEKNELTNKYDIKQIENELNQKVSIAMNNIDRFLTESSISYLMKIINEVKINKLREYDENVKTYLLNYIIQHGSILGESQQELNSMVTDTLNNSIPFKLSSYTDDKILISYFNKFFKRIKSSSVLNMRYKNDKYVDTSGYDSNININGDVYKYPTNKNQFGIYNDKLSEVNISQNDYIIYDNKYKNFSISFWVRIPNYDNKIVNVNNEYTIINCMRDNNSGWKVSLNHNEIIWTLQDNAGINQKLAFNYGNANGISDYINKWIFVTITNDRLGDSKLYINGNLIDQKSILNLGNIHVSDNILFKIVNCSYTRYIGIRYFNIFDKELDETEIQTLYSNEPNTNILKDFWGNYLLYDKEYYLLNVLKPNNFIDRRKDSTLSINNIRSTILLANRLYSGIKVKIQRVNNSSTNDNLVRKNDQVYINFVASKTHLFPLYADTATTNKEKTIKISSSGNRFNQVVVMNSVGNNCTMNFKNNNGNNIGLLGFKADTVVASTWYYTHMRDHTNSNGCFWNFISEEHGWQEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Botulinum neurotoxin type E
publication title Domain organization in Clostridium botulinum neurotoxin type E is unique: its implication in faster translocation.
pubmed doi rcsb
total genus 344
structure length 1246
sequence length 1251
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2008-12-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07952 Toxin_trans Clostridium neurotoxin, Translocation domain
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3ffzA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3ffzA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3ffzA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3ffzA01
1C4RA 4Y1XA 4MYEA 3NV2A 5DUVA 3CA3A 2AUYA 1ENRA 1PWAA 2QN0A 2ISGA 3WINC 3AKIA 2P3JA 1VAMA 1N1TA 4AYUA 2VU9A 3ZXFA 2P39A 4ZFUB 1ULGA 2NMNA 3O4BA 6I1BA 4LBQB 3B00A 4J2KA 41BIA 1SLAA 3FUQA 2MC2A 3E8LC 5BVPI 3AZZA 1E1HA 4XFUA 1WCSA 1BFCA 3T2TA 1CONA 3RMYA 3H6SE 5IK7A 3NBDA 1G7YA 2NP0A 3S8JA 1URXA 3AJ6A 2PELA 1DQ6A 3V0AB 3KM5A 4UW5A 3APBA 2VW2A 2AAIB 3BRFA 5HCFA 2YV8A 3F1RA 2NMOA 1XG6A 2IMBA 5JLVA 1J0SA 1IKPA 1B09A 1Q03A 4DPNA 3AJZA 5T5OA 3C8BA 2EAKA 3PG0A 4SLIA 3V64A 1W6NB 2IMCA 2XOAA 2LIEA 5E8AA 3QJ0A 3BAVA 4JAWA 4XZPA 2QYIB 1QXMA 3O49A 5T54A 1BLAA 4YGEA 4IY9A 3OYWA 1IOBA 3Q9OA 3WHTA 1FN0A 1JLXA 4BM8A 2V5YA 2D20A 3IKWA 4XTPA 3PVEA 4GXLA 2HWMA 3I2AA 1LOCA 1KJRA 4ATEA 1IS6A 3A22A 1PZ7A 2K4AB 1ZL6A 1CVSA 1MACA 4DRRA 2GNBA 4JCKA 4R6UB 4FVVA 3BRGC 1ZA4A 2VXTI 1WBCA 4OWKA 2VLCA 3JRRA 4GAFA 4EL4A 4I4VA 4G6MA 3O4DA 4IHZA 4QC4A 4M01A 1DBNA 2ZACA 2VY0A 4YZ4A 1DQ5A 4YG0A 2DU0A 4OEGA 4OWLA 4ISRA 1BASA 4LO7C 3FIIA 4HA2A 3IPVA 3O5SA 3PVOA 5T5JA 4OUJA 4YOLA 4Q27A 1VLNA 3LTQA 4I4SA 2D7FA 4UW3A 5DSSB 5SV8A 3FJ9A 1N3PA 3VKMA 4UW6A 1HQLA 3O0XA 2F8XC 1ABRB 3FJFA 2DUPA 2ZQNA 1PZ9A 3I29B 3DUIA 3BOKA 3WMVA 5B2HA 1JOJA 1JLYA 4IY8A 1SFYA 2ZMNA 4XBLA 5IK5A 1CN1A 3VKFC 5DVHA 4Y1VA 2R0FA 3ZXDA 5LK5A 4GKYA 2DUQA 1LJ7A 4I2SA 1BA7A 5IUQA 2RQ9A 2R9KB 4GWMA 2A75A 4H04A 1SLCA 1KDMA 3M3CA 4FPJA 2L5XA 2W52A 2P37A 5GZDA 5DG2A 2I2SA 2DTYA 3DDBA 3AYCA 4NO4A 4GOYA 2G7PA 4P0JA 4ZFWB 4WVVA 3AFKA 1HLCA 1CPMA 3MALA 1V6VA 1XTFA 1MVQA 1ULCA 1QMJA 4M3CB 1GV9A 5DZUA 3IMNA 2ZGNA 3NV1A 1Q1UA 3O0VA 3KMVA 4EB2B 3POSA 1SBFA 1S0BA 2KH2A 5DXDA 1EV2A 1A3KA 5H9QA 1FWUA 2OVUA 1IT0A 3FLTA 3SNVA 3QW7A 1GKBA 2EXHA 1F82A 1CR7A 1IRAX 3WDWA 2A3XA 2YZ4A 4P9XA 4G9NA 2HW9A 4KS6A 3N3HA 2Q3NB 4BQ1A 1M16A 3ZYRA 1Q8VA 4IONA 3FFZA 2UUSA 1GBGA 2KLLA 3RMXA 1HKDA 2ZABA 2GN3A 4CZSA 2R1BA 1CVNA 4I96A 4PBOA 1Q04A 4GP3A 1W3FA 5DZFA 2D6NA 2BEBA 4I1EA 1LOAA 4QO3A 4X39A 3VSFA 5F8WA 4YZ5A 4P6AA 2A7AA 2HZ9A 4AN6A 1S0LA 1HCEA 3BAQA 1BJQA 2CWMA 1S0DA 5BOWA 3PUBA 3IPVB 1ITBA 2ZGQA 3ZPYA 1PZ8A 4P0LA 3QR5A 2D6KA 3K3QB 1OKQA 2WKKA 4EKXB 2D6MA 4ZKTB 2A6XA 3AP5A 1II4A 5GLVA 5D63A 2XHLA 3L2YA 2GALA 2ERMA 1ISYA 2J3PA 2UU8A 4XBQA 1YTOA 1K5VA 1XYFA 5E88A 1SLIA 3NV4A 5JMCA 1S1AA 3ZC9A 3NWKA 3O12A 4LBJA 1V6OA 4LBKA 1QQLA 3D4KA 1XZZA 3N0KA 4EFPA 1DQ2A 1C1LA 4YW4A 5HCBA 3ASIA 3OY8A 5L73A 5GZCA 3ZUSA 4Y20A 1LENA 3FJDA 1KITA 1DJSB 3D7WB 4P9WA 2D6OX 1TWEA 1PC8B 1QF3A 2ERFA 1H9PA 1S0EA 1O4ZA 2ZMKA 4XYXA 3OBTA 5DUWA 3RTIB 4YZ1A 2YMZA 3ZYPA 1GLHA 3OJMA 1WBLA 1WW7A 2IHOA 2Y9GA 5DZEA 2PHFA 4LO1C 4LO3A 1JW6A 2D3RA 1AVBA 1G8WA 4I7IA 3ATGA 4QKSA 3OPZA 3O4OA 3C8AA 1GZWA 1Q56A 4XJ9A 3IM0A 4PBPA 4M3CE 2WT2A 3WNXA 3WLUA 1UMZA 3NV3A 1BFFA 5CAZA 1VAVA 4PQ9A 2W08A 3N7LA 2CWSA 4TZDA 2AFGA 3B9UA 3V0AA 1XQNA 1TOOA 3DDAA 1Y7BA 1LCLA 3ILAA 4D0TA 4FGFA 4Z9WB 1G9BA 3FUOA 4LBOA 4Q8KA 2B7YA 4TYSA 1W3AA 3AKFA 1AXYA 2ZAAA 1AXKA 1QQKA 4AGRA 1GANA 3ZSMA 1SACA 3TC2A 1ISZA 2VUAA 4J2YA 4XHXA 4QD2C 1ENQA 5BXSA 3BTAA 2FFUA 3BA5A 1FWVA 2ISEA 4ZJXA 3WDTA 1N3QA 1TWMA 4ZLBB 3JUUA 3Q7XA 4LO2C 2XHLB 3VKOA 1IILA 3GNEA 5F90A 5BP5A 5CNAA 5E89A 1TEIA 4K1ZA 3WO3A 2WNEA 2AH2A 4HJJA 4USPA 1ZN3A 3H0OA 3ZSJA 1AFCA 2C5DA 4KUFA 2BQPA 2CYFA 4GALA 5GLTA 3OY8B 4Y20B 1YRZA 3WG1A 4KEJA 4G1RA 2DUOA 1APNA 2KI4A 1Z78A 3BAUA 3VT0A 1DQ4A 1BLDA 4QBCA 2ZA9A 2A3WA 4Q2FA 3AZVA 2IWTB 4YFWA 1CJPA 2PHUA 3CA0A 2ZHLA 1ULFA 3OGFA 5T5LA 1V6MA 4YW5A 3DSEA 2AQZA 2GO2A 4Q8LA 2NTDA 4JC1A 3WG3A 3BB2A 2AXMA 4UW4A 3QCWA 5FZYA 2XB6C 4I37A 3SH3A 2DURA 1R1ZA 4OEEA 1JXNA 5DUXA 3SISA 3NF3A 3T8SA 2ARXA 4OZXA 4YM2A 3WHUA 4GAIA 4WV8A 2JECA 5GAQA 1GZWB 5BXTA 4IYBA 1U0AA 3WOGA 4C1XA 1DYKA 4G6JA 4YGCA 5GALA 3AZXA 4Z8SB 4FOYA 4KBBA 4P9YA 3O4AA 2DVBA 1W6MA 1V00A 3OGGA 1FNYA 1CE7B 1A78A 1LOEA 1HWNB 3AXDA 4CTEA 4Q26A 1BYHA 2Z42A 5H9SA 5KXCA 1AVXB 5F8SA 2ZKNA 3A0NA 3T1MA 1IOAA 3N7MA 2PHTA 2SLIA 1AXZA 1QKQA 4I4XA 1A8DA 4M3CA 1GNZA 3VWCA 2D23A 2LIQA 4U36A 2P34A 4LO7B 3V79C 3ENRA 1AX0A 2ZQOA 1UZZA 4KEKA 3QIZA 1RITA 3W58A 1LU2A 1I3HA 3AYEA 2NZ9A 1G82A 1V6UA 1D2SA 2VW0A 1OQ1A 3ILNA 1W3GA 3T1LA 3Q7YA 4F34A 1LOBA 1MZ6A 2EXIA 1KQRA 1S0GA 4Y24A 2ES3A 1DQ0A 4XIOA 1DQOA 4XJZA 3FJEA 3AX4A 4HEVA 1HKNA 1DFQA 1PZZA 1ZKWA 5FREA 3M2MA 3WDYA 1DFCA 3F62B 1YXWA 3CU1B 2GNTA 2OUJA 3R4SA 4DENA 2E4MA 2ZGOA 3NBCA 5GLZA 1QNYA 1UN1A 2ZHNA 4H9WA 1DZCA 1DLLA 3UJQA 2NVHA 5KXDA 3BRDA 3HN1A 4FOWA 2GMPA 2ISHA 3WDVA 2P23A 2C9AA 3D5OA 2VXRA 3C88A 3CRIA 1JYCA 3NBNA 3D6EA 1MS3A 1LHUA 2ZGMA 1V6LA 3ZUQA 3H6RB 5DUUA 1IRPA 4WZFA 3I2XA 2D3PA 3S8KA 1EPWA 4K1YA 4FPYA 2WT1A 4ZA3B 3N7JA 1FV3A 1V6XA 4I30A 4XJWA 2AREA 1W6MB 4D69A 4YG6A 4NOTA 4DS0A 3WV6A 3BOPA 1QOOA 2D1ZA 4ZGRB 3N36A 4ITCA 3HBWA 4I4UA 1IKQA 3CRHA 2KI6B 2A5ZA 4IZXA 1AX2A 4X38A 1HQWA 1LHNA 3UD7A 5BQUC 3VT1A 4XFTA 3M3OA 3AH2A 5E24E 4AVSA 5G00A 4C1WA 1DGLA 2UURA 3QW8A 4RL7A 3Q7WA 1TIEA 1QOSA 3RRDA 3FJKA 2YY1A 1V6WA 4A7KA 1C57A 4ELCA 4JRAA 3MW3A 2D7RA 3D3XA 1PUUB 4LO8B 1HWMB 1W6OA 2ESUA 1AX1A 4KEIA 2KM2A 1LHOA 3BAHA 1Z2VA 1BARA 1QDOA 1G9FA 1EVTA 4LO0A 3C2UA 1SCSA 3BA7A 4DQAA 2E7TA 4XXPA 1JT4A 4Q91A 5GM0A 1W6QA 5D62A 3UK9A 4K20A 2EIGA 3PMEA 1JUIA 1VIWB 1N1VA 5JOXA 3ILFA 1ZM1A 1MZ5A 1GYKA 1C1FA 1OFSA 4XJ8A 1YIFA 1WD4A 2F2FA 5D61A 3BODA 1TFMB 3WDUA 2Y9XE 1WLDA 1UAIA 2AGSA 5GLWA 3WMUA 1T9FA 4XIKA 1QDCA 1LGNA 3WINA 3O5WB 5HCAA 1ULDA 4YM3A 1AVAC 2FDBM 5F5QA 3ZXLA 1I1EA 3MW2A 3JUTA 2Y9FA 3SNMA 2E51A 3WVJA 5H9PA 2DVAA 1JT3A 3UDAA 3GALA 3RQ0A 4R9BA 3WZ1A 1JBCA 3A4UA 1FQ9A 3FIEA 4AN7B 2G4IA 1G9CA 2CTVA 3WG2A 8I1BA 1JT7A 3WUDA 1AZDA 2ZGPA 5DUYA 4XDQA 3AKHA 1ZL5A 1RINA 3AP4A 1E0OA 2NN8A 4FOVA 3AP7A 3VT2A 1SBEA 4A7YA 4X37A 3ZURA 2XG3A 4ZFYB 2JJ6A 4XKIA 3AJ5A 4FPKA 2A3YA 5BQMA 3VEQA 3M1HA 3ZSLA 3P6JA 1MS8A 1LULA 4EJ5A 2ZGRA 4R9DA 2GN7A 1IS4A 4XHBA 3UL2A 2R16A 2G7NA 1NXD1 1R8NA 1JTCA 2ZGUA 5FNWA 2E6VA 3IM5A 3A07A 4YM0A 1Z7HA 1HWPB 4QD2B 4M3CF 4EFRA 2WLQA 4FPEA 1DQGA 1W6OB 3K1XA 2R1DA 4LBMA 1K5UA 3C89A 2VSEA 1SCRA 1VALA 3CA5A 4I4QA 1D0HA 2DS0A 4FPLA 4KTXA 5GZFA 2Z48A 1DHKB 4YGDA 1ILR1 2Q5TA 2VW1A 1Z4SA 3BAGA 2WRYA 1S0JA 1W6QB 1H30A 2R0HA 4PCRA 4LBQD 1ZB7A 4XBNA 1RIRA 5KXEA 3RSJA 2A6VA 4GWNA 3LLPA 3A21A 3C9ZA 1FMMS 1IS5A 4OW4A 2CL2A 2CY6A 2EXJA 1MS9A 4EFQA 1MC9A 4Z8BA 2AENA 2GNDA 1H9WA 1ZKXA 1FATA 2HYKA 3AP6A 1JT5A 3QW6A 3ZVXA 2W2DA 2ZMLA 3BWIA 4TLPA 2PHRA 4DFSA 4JP0A 1ONAA 3FBYA 4ATFA 4X3AA 1LODA 3IN9A 3LCPA 4DRVA 3AXEA 3CAHA 1VCLA 1MS4A 4XMAA 4KC3A 1J1TA 3WA1A 3ZXEA 3FLRA 5EYYA 5EG6C 2K8RA 1Q8PA 1ONKB 4W65A 3UJ0A 4Q9PA 5JVVA 1JHNA 3W59A 1LOFC 1Q8QA 1FX5A 3CA1A 2DRZA 2AYHA 3I4IA 3AYAA 4I0YA 4LBNA 1QGLA 3WO2A 4PC4A 3WDXA 4HL0A 1N1YA 5DG1A 1HWOB 4H55A 1WW6A 2K43A 3TB0A 5BQMB 5FZZA 4BLIA 2GDFA 1KRIA 4I4RA 1GSLA 4FOQA 4XMIA 3BOOA 4XOGA 2ZGSA 4YW3A 3CRGA 1WW5A 4P14A 3H6RA 4J2SA 3MW4A 1AXMA 1V6KA 2FMDA 1SR4C 2RG9B 5T52A 2RSTA 3IM6A 1XHBA 1CPNA 2JDZA 1FMZA 1S0FA 1WD3A 2JE9A 1WBAA 4Y1ZA 1DQ1A 2Z49A 4BPZA 2ILPA 1ENSA 4U2AA 3AZWA 2FHRA 2JKBA 5GZEA 4EEEB 2DTWA 3RS6A 2ETFA 3HMYA 5EC5A 3VKNA 1HIBA 1I1BA 3O44A 2GZBA 1MS0A 1YYNA 3WO4A 2DV9A 4XXAA 4YW2A 4F83A 4JKQA 1HCDA 5DZGA 5EWSA 4II0A 1AJKA 4XFSA 4Y1UA 3QYDA 4IQPA 3USUA 2W2DB 1N1SA 4YGBA 3FJJA 2BEAA 3N35A 1RZOB 4LO3C 4A7ZA 2DRYA 3ZXGA 5IK4A 1QOTA 1MD6A 1SLTA 3M3EA 2SBAA 1YI7A 1UKGA 2EF6A 3OJ2A 1M2TB 1LGCA 1WBFA 2DVFA 4PF5A 4HR6C 3DEBA 3SH4A 4L8QA 4FPGA 3POYA 2A6ZA 1ISWA 3AH4A 1ISVA 2M49A 2A71A 2A97A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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