3V0AA

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 408
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
408
sequence length
1295
structure length
1280
Chain Sequence
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 408
structure length 1280
sequence length 1295
ec nomenclature ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date 2011-12-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aA01
4XTPA 2P37A 3VT2A 2UWBA 3MPPG 1ILR1 3BAUA 5T54A 2W08A 5L73A 2ZGNA 1M2TB 3WG2A 3BWIA 3A4UA 1T4QA 3IPVA 1SZ6B 1QOSA 3W58A 4ZKTB 2K43A 1W0OA 1UL9A 3DEBA 5DZUA 3BIWE 1UAIA 4UW6A 3NV2A 4QKRA 3H0OA 4XJ9A 5DUXA 4Y1UA 2JKBA 2UURA 3OBTA 1A78A 2NM1A 1QU0A 3KM5A 3AKHA 4HANA 2E53A 2A7AA 3S8JA 1KDMA 4G6JA 3PG0A 4YW1A 3BA5A 1UMZA 1IHKA 3BAQA 1N1TA 2XG3A 4LO1A 4PBPA 2DVFA 2CL2A 1DQ0A 3R4SA 4YZ2A 2D3PA 3M2MA 4J1LA 4USOA 4GP0A 1RY7A 5DG1A 3O0XA 2FDBM 4JC1A 1QMJA 1GGPB 2FGFA 3I2XA 1W6NB 1SBEA 3M3QA 3FJKA 3O0WA 1Q03A 4FOWA 1V6XA 4OWLA 4ZFUB 3PJQA 3IAGC 3V0AA 2XB6C 1ULEA 4XBNA 1DQ4A 3ZX7A 5IK7A 1PZ8A 4XJUA 3ZYPA 1E0OA 4OZXA 4RA0A 1MS4A 5H9QA 3C8BA 4DCKC 4KEIA 2CYFA 4ZLBB 3UJOA 2X2SA 3V79C 2XOAA 1S0FA 1LU1A 1GZ9A 2D20A 4K1YA 1V6VA 1CE7B 3ZXDA 3O12A 2R1BA 3A23A 3FUQA 1PZZA 2EXKA 1AX2A 3RMYA 2OW4A 5F9TA 3AJYA 3QIZA 1CIWA 4LO3A 4TLPA 1WBAA 1LGBA 2D6NA 1WW7A 2V5YA 5DUYA 4AGRA 4AGVA 2DVDA 2VY0A 3A22A 4JKQA 4HL0A 3DS9A 2DU0A 2AR6A 4OUJA 2NYYA 2D23A 3UD8A 1AVBA 3VSZA 5F8YA 1C57A 1RIRA 4EFPA 2K4AB 1YRZA 2BQPA 1A8DA 3CA0A 4EL4A 4XIOA 1SR4A 1LHWA 4DRVA 2W2DA 3MALA 4L8QA 4ASMB 1LHOA 4IHZA 7I1BA 3N7KA 1CPNA 1MACA 1NLSA 4NOTA 4R6UB 1QF3A 3Q7YA 1FV3A 2ZMKA 1ZM1A 2Q9XA 2ZABA 4XHXA 3WCSA 3FJJA 3QJ0A 2ZHNA 1W6OA 3ASIA 5KXCA 1UPSA 5BQNA 4F34A 1S0CA 2ETFA 4KUFA 2YMZA 3OJ2A 2DRYA 3BB2A 5AVAA 1N3PA 2D6KA 1IJTA 4I7IA 3ZYRA 1HQLA 4IYBA 1FWVA 3FIEA 3WV6A 4AVTA 3ZVXA 1V6NA 1GZWA 1YTOA 4KTXA 1IS3A 4Q27A 3GALA 1LHVA 1HLCA 1IT0A 4I1EA 1AJOA 1TTUA 3BRGC 5T5JA 4BPZA 1SCSA 1YIFA 2DURA 3SH4A 2ZQNA 4LO7B 4IY9A 1ONKB 4XJWA 3PVEA 3W9TA 1RG8A 3WUDA 1GICA 1EVTA 4M3CB 5DZFA 3AYCA 2BFHA 1Q8PA 1HDKA 4YOLA 1N47A 1W6MB 3WO4A 3O5WB 4FPGA 2UUSA 4OW4A 3HALA 2AYHA 1YBIA 2ZMNA 4EFQA 2FHRA 4TZDA 4KBBA 5IUQA 4I4SA 3CU1B 4ZBVB 3P53A 4D69A 5F8WA 3WINA 1MZ5A 2WT2A 1DLLA 2DWRA 3SNVA 2DTYA 2BEBA 4P0LA 4CZSA 2PHUA 3WCRA 4X37A 2A8AA 4YW4A 2NN8A 5GLZA 4ZOTA 4I4RA 1MS3A 3BA7A 1S0IA 1YF8B 1JXNA 5GAQA 1QQKA 1TWEA 2A6XA 2A3XA 3B01A 2ERFA 2PHFA 3RS6A 1XQNA 1JQZA 2WT1A 2ZGPA 3OY8A 4AN6A 1LENA 2CWSA 3A0NA 1K5UA 5T5LA 9ILBA 4NO4A 4J2SA 2FO1A 4II0A 1TOOA 5GM0A 1Q8QA 4XBLA 5BQMB 2MLLB 1SBDA 4FPHA 1MS5A 4YM2A 4Y26A 3ZC8A 3B9UA 1G9AA 1HQWA 2J3PA 1C1FA 3FJAA 3ZXLA 2P2KA 5D62A 1WBFA 3D5OA 1FATA 2CY6A 3IPVB 3O5SA 1WD3A 3WO2A 1ISYA 4D0ZA 4EJ5A 4YGBA 5BP5A 1RITA 1WW4A 2AAIB 3AXDA 4DRRA 3N0KA 2FFUA 1Y7BA 4Q8LA 3POKA 1Q1UA 1GNZA 3HSMA 3C89A 4QD2C 3VKFC 3HMYA 3WO3A 1M16A 4D0TA 3ILAA 4YZ1A 1YVGA 1HWPB 2PHRA 2EAKA 1SBFA 2GNMA 1ISXA 4A7KA 1FMMS 1FGAA 2F8XC 2PELA 1DZDA 3NBDA 2ZHKA 1G82A 2SLIA 3WHTA 4YW2A 3MEPA 1GYKA 1IS4A 2QYIB 3WVJA 5BXSA 2IMAA 2YV8A 5FNXA 3V0AB 3O49A 2V73A 2VW2A 4I8MA 1HWOB 3LSEA 4BOWA 1LECA 2VUAA 1T3AA 1JLYA 1IRAX 5CBLA 3ZXJA 2GNTA 1GZCA 3UJ0A 4XIKA 1AVUA 3LTQA 1QDOA 1KJLA 3WLUA 2MIBA 3FJHA 2NTDA 1MS8A 2GNDA 1TWMA 4LO3C 1JW6A 1MZ6A 3IMNA 4Q9PA 2ZHMA 3FUOA 2JDZA 5KXBA 3AKGA 4GP3A 2X2TA 2G7PA 2R16A 2DREA 1ITBA 2ZAAA 1DQ1A 5SV8A 4LBLA 1IS6A 1DQGA 5D61A 1FYUA 3HBWA 4FP3A 1DZCA 2A3WA 2A5ZA 2HYKA 1G9DA 21BIA 1DQ5A 4AGGA 4IY8A 1VAMA 4H04A 1BASA 2ZGOA 4AVVA 2F2FC 4BMEA 4IZEA 3ZC9A 3ILRA 2I2SA 4WZFA 4L4IA 3ENRA 3ILFA 4BLJA 2ES3A 2AQZA 3AZYA 3FJCA 4JAWA 3SLIA 2ZACA 3CA4A 2W2DB 1S0BA 4XYXA 3HOMA 1LGNA 2A6VA 4BM8A 1BARA 3AP5A 5T52A 3OYWA 4LBOA 4SLIA 2D3RA 1Q8OA 2WRYA 1Z0HA 3USUA 2R9KB 2ZQOA 3AH2A 3B3QE 3M1HA 4XDQA 1OQ1A 3FJIA 1GV9A 5GZCA 4JP0A 4DEPA 1W6OB 1MS9A 2JECA 3R05A 1CR7A 2VSEA 3D3XA 4W65A 3PUBA 3H6RB 2A71A 4XMAA 5G00A 1GZWB 3OJBA 5GLVA 1LU2A 2BEAA 1XTGA 3I4IA 2ESUA 1W3FA 1XZZA 1FQ9A 2NMOA 4M3CE 1CN1A 4XMIA 1BFFA 1RMLA 3C8AA 3F62B 1ULFA 4JQ0A 4WVVA 1QGLA 1AXZA 3O0VA 1P63A 4GALA 5HPZA 1S0DA 4MYEA 1Z7HA 4I4PA 3RTIB 2ENRA 1I3HA 3WMUA 4I4VA 3AJ5A 3E8LC 2WNEA 3N7JA 1JUIA 4M01A 1QOOA 1V6MA 2HWMA 5LK5A 1MR5A 1WBLA 2P3KA 1BLAA 1G7YA 1HWMB 3BAVA 3ZXKA 5DSSB 1QKQA 4FPYA 3VKOA 4R9CA 5FZUA 4I96A 4RL7A 2C5DA 1IRPA 2YZ4A 1CPMA 3SISA 2JJ6A 4XXPA 3RTJB 1AXKA 4ENDA 3N7LA 3WDVA 2P34A 4QO3A 3ILNA 2P3JA 1CESA 3WDTA 5GZDA 2ET2A 5GZEA 4Q26A 4H55A 4LO0C 3AKIA 3OJMA 3WZ1A 1SLIA 1DYKA 5F5QA 4KEKA 4OEEA 1B09A 3OGGA 5CNAA 3QR5A 5FZYA 2D7IA 3VSFA 3OY8B 5JOYA 1OKQA 3HN1A 3AZVA 3IIRA 1JTCA 5T55A 3CAHA 2CWMA 3AKFA 3ZUSA 2R0FA 3UK9A 4TYSA 2DVBA 1LOBA 3VUOA 4A7YA 5BP5C 2RG9B 5DUUA 4GKXA 3CRIA 3CQAA 1PC8B 5IT6A 4UW5A 1Q04A 3LLPA 1ISZA 3FLRA 5GLWA 4D8HA 2E4MA 3ATGA 1JT3A 4I4QA 2D6PA 4Q1RA 3K1XA 3C9ZA 3Q7WA 2VXRA 3C2UA 1T9FA 4F83A 1CONA 5T5OA 4OEGA 5F8SA 1EYLA 1C4RA 2ZGUA 4Y1YA 2A75A 5FNWA 3ZXEA 1F82A 2Q3NB 2D7RA 3RMXA 3AYDA 3QIYA 1T3CA 4X3AA 1BXHA 3AX4A 3H6RA 5DUVA 2A6ZA 3V65A 4OEFA 1F5FA 1G9FA 4LO7C 1IILA 1AXYA 1D2SA 2Y9XE 3BTAA 1JT5A 1U0AA 1DQ2A 4QC4A 1SFYA 4YG6A 2PHTA 4XKIA 3O4CA 3A21A 3BOKA 3FGMA 4M3CF 4YM3A 2P23A 3AZZA 5H9SA 1UZYA 1ZN3A 4XTMA 1AVXB 2D22A 3WOGA 2E7TA 3EF2A 2LIQA 3NWKA 1KJRA 1FMZA 4XFUA 2Z48A 4Z9WB 3NBEA 2H0BA 2VH9A 5BXTA 4XFSA 3T2TA 2ZMLA 4XZPA 1JHNA 4J2XA 2GN7A 4LBNA 1DQ6A 4Y1VA 3DGTA 1G9BA 2ZGSA 3JU9A 3SITA 1V6WA 3ZSLA 1SACA 1WUVA 1AF9A 2EXJA 4Y22A 2I1BA 4LO2A 4Q91A 2D24A 3BAGA 1Q56A 3B9CA 1WD4A 5GLTA 2GN3A 1WLWA 2KKIA 5EHAA 4CJMA 3AFKA 4QBVA 5B2HA 3DUIA 4K21A 5CAZA 4J2YA 4PCRA 1W6QA 1PZ7A 3IN9A 1PUMB 2VXTI 3N7MA 1V00A 1HKNA 2DVAA 2AENA 3O4AA 4YW5A 1Q8SA 1BFGA 2ZHLA 5E24E 1BQPA 3OYWB 1FWUA 2ISEA 3JRRA 3USUB 3AJ6A 5IK8A 4UW3A 3C88A 4LBQD 5JOZA 4HJJA 5DUWA 31BIA 2E7QA 3ZSKA 2NMNA 2P39A 2GO2A 5H9PA 3L2YA 3BOPA 1N1SA 2GDFA 4I6IA 4ZFYB 4DS0A 5F90A 2R1DA 4FPLA 3DSEA 1TP0A 3ZXFA 3ZSMA 2R49A 1VLNA 4LBQA 1KRIA 4LO1C 1QOTA 1IOBA 2D3SA 1G8WA 4XE9A 1S0GA 1L2HA 4CRQA 3QYDA 1CVNA 3NV1A 2GMPA 1ULGA 3I29B 2KH2A 3P6JA 3VEQA 2G7NA 3W59A 2QN0A 1BYHA 4L4HA 2L5XA 3SH5A 1UKGA 1N3QA 2IMBA 1BFCA 4FPKA 4H9WA 4DQAA 3A0KA 1LOGA 1APNA 1ZB7A 1S0EA 1II4A 1RINA 5I1BA 2ZA9A 1PZ9A 3LSDA 3AJZA 1LESA 2JE9A 2PHXA 2YY1A 3ZUQA 4GOYA 1JN2P 1DBNA 1ISWA 4HR6C 3KMVA 5FRAA 1JYCA 4KS6A 2SBAA 4XJZA 2D44A 4Q9GA 1EV2A 1N1VA 1R8NA 1SLLA 2D6LX 5CA6A 2WT0A 2DUQA 4U36A 4FPCA 3CA5A 1V6KA 1RZOB 1LULA 5BQUA 2Y9GA 4R9AA 1SLAA 3PVOA 2EIGA 2UU8A 4ISRA 4BLIA 1KITA 1DGLA 1ENSA 6I1BA 2R0HA 4M00A 1Q8VA 3BAHA 2D6OX 1HKDA 5BXPA 1FNZA 5JMCA 3T1LA 1WW6A 1C1LA 3CA3A 3AH1A 1YYNA 1I1BA 1VCLA 2A70A 2WBCA 4OWKA 1UN1A 4P9XA 1F9KA 5GZFA 2YROA 2HW9A 3FJBA 4PF5A 4FQZA 4K1ZA 3FBYA 4XXAA 1V6OA 2FMDA 3M3CA 1SR4C 1XYFA 3CA1A 2UWAA 3CRGA 2LALA 4AVSA 3WMVA 1PUUB 2DYCA 3N3HA 3NBNA 1FX5A 2QN4A 1GLHA 4KC3A 3WDWA 2RQ9A 1LTEA 1DJSB 1WLDA 1LHUA 2AREA 1V6JA 4QBCA 2YUGA 4G9MA 3VT1A 1QNWA 2XHLA 4WVWA 4USPA 2WQZC 2ARBA 2EXIA 3O4DA 1N3OA 4C1WA 4YG3A 4LO8B 1ZKWA 1WW5A 1H9PA 2G7QA 4FPFA 3PMEA 1JT4A 1O4YA 41BIA 4P0KA 4QKSA 1MS1A 1O4ZA 3JUTA 1VIWB 1TIEA 4BMBA 2ERMA 5JOWA 4ZA3B 3AK0A 4YM1A 5JLVA 1IOAA 3FJ8A 1FV2A 2Z42A 4XBQA 2GMMA 5DG2A 3WUCA 1LGCA 1QDCA 5E88A 4DPNA 3FFZA 1IS5A 4XHBA 1J1TA 3ZXGA 2DV9A 1NUNA 2KLLA 1R1ZA 1CVSA 3MW3A 1WCSA 4ZXKA 1MS0A 1HCEA 2W52A 2ILPA 4Y1XA 1XG6A 3V64A 1ABRB 3FLTA 3VKLA 2D7FA 5BOWA 5D63A 5FREA 1J0SA 2KM2A 2ZBJA 4FP2A 1AX0A 4EKXB 1LHNA 2ZGRA 2CNAA 3D4KA 1ZL5A 4LBMA 1AVAC 2KI6B 3BX1C 4I37A 1EPWA 3WINC 3I8TA 1DYPA 3S8KA 3O4BA 1S0LA 4LBKA 1W6PA 2DUPA 4LO2C 4C1XA 3LCPA 4GWMA 1JBCA 4DENA 3WG4A 3QLQA 3H6QA 4YZ5A 4FOQA 3PVNA 2DRZA 1LOAA 1ISVA 5BVPI 3TB0A 3AYAA 4FOVA 4Y22B 5JOXA 1CQ9A 5GJ6A 3NBCA 1V6IA 4GAFA 2FFVA 4GAIA 4HA2A 2D1ZA 5HCFA 4EEEB 5EG6C 3WNXA 2WSVA 2Z49A 2Y9WC 2E6VA 2AFGA 4XFTA 3V0BA 1AZDA 3POYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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