3V0AB

2.7 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Toxin
source organism Clostridium botulinum
molecule keywords BoNT/A
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0aB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0aB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0aB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0aB01
3WLUA 2KI4A 2VUAA 21BIA 3O49A 4AGVA 3OGGA 1SLLA 2E51A 1M16A 3CA4A 2ZGOA 2DTWA 3NBCA 5GAQA 4U36A 4FVVA 2FO1A 4I30A 1TWEA 3Q7XA 2WT1A 1IOAA 5BP5A 1F9KA 1UN1A 1ISVA 1HQWA 2DRYA 1C1LA 1G9AA 3NJ5A 1DZCA 4ZFWB 5I1BA 1QNYA 3RTJB 5CAZA 3UJ4A 4OEGA 1JLYA 4XJWA 2D44A 3BB2A 4ZXKA 3N7LA 4YW2A 1B09A 1ITBA 4KEIA 3FJEA 1YTOA 1AJKA 5BQUC 4ZJXA 1QXMA 1NLSA 3P53A 1GZWB 4BOWA 2VW2A 2W08A 4Y1YA 4XBQA 3O4DA 2ES3A 4BMEA 1H9PA 2WQZC 2AUYA 1V6XA 5BVPI 5BOWA 1YF8B 4HA2A 4I7IA 3SNMA 4K20A 2HWMA 2IMAA 4FPFA 4YGBA 3VV1A 1TWMA 2BEBA 1QGLA 1JY0A 2KH2A 4FPYA 4I6IA 1HWNB 2AXMA 1XTFA 2ERFA 4HANA 1HDKA 4J23B 2A71A 1XYFA 1JTCA 1ISXA 4XIOA 1DYPA 4JRAA 1AFCA 4XFUA 5GZFA 1IHKA 1BASA 3WDYA 1M2TB 1WW6A 2ZHLA 1DLLA 3LTQA 4M3CB 1DGLA 3AJZA 4BLJA 4EKXB 2DREA 2X2SA 5FZZA 1FAYA 2D24A 3WO4A 3ZXFA 1BFFA 2LIQA 3BOOA 3I8TA 1YO8A 3QCWA 5DUXA 2ZGMA 4R9BA 2A6WA 2Q3NB 2RQ9A 3O3QA 1SLTA 1SCSA 1L2HA 1YXWA 3QR5A 2Z42A 1MS1A 2ZA9A 5GJ6A 5T5JA 2A6YA 4U2AA 4OUJA 2AFGA 1WBLA 4BPZA 3QLQA 3UJ0A 2A70A 4Y26A 1LU1A 3AH1A 4XMIA 3C9ZA 1E1HA 4LO2C 4EJ5A 3A23A 4YFWA 3FJ8A 4XOGA 2P23A 2K4AB 1DQ1A 3AP7A 2VXTI 4G6MA 1BA7A 3ZPYA 1LOBA 1WW4A 3E8LC 2PHXA 1FMMS 1LGNA 3DSEA 5GZCA 2AH2A 3NBNA 4IZXA 4XFTA 4D0ZA 3AYAA 1BLDA 4I8MA 2NMNA 2K43A 1AVAC 1WLDA 1LHUA 4P9WA 2E4MA 1Q8OA 2CTVA 2CWMA 2P3IA 3O4OA 3M2MA 1VALA 4P6AA 1NXD1 1BYHA 1S0EA 3VKOA 2L5XA 1RINA 1D0HA 4I4QA 1WBFA 4YGDA 1W3GA 1AX1A 2ZMNA 4YM2A 5G00A 5FNXA 5BXRA 3IIRA 2ZAAA 1FX5A 4LO7B 1AVBA 2LIEA 1KITA 2CYFA 2ZMLA 2QN0A 2P2KA 4I4OA 3USUA 3M1HA 1RZOB 4I0YA 1RG8A 3K3QB 1A78A 2P37A 5GLUA 1DYKA 3B00A 4GALA 3T2TA 3CA1A 1Q8QA 1AVXB 3OY8A 3AP9A 4LO3A 3ILAA 3NV1A 4MYEA 4XE9A 2EALA 1CR7A 1JT7A 2E6VA 3INAA 4Z8SB 2JD4A 4BLIA 1IS5A 2PELA 1BKZA 1JHNA 1Q8SA 2D22A 1Z0HA 4WVWA 5KXBA 3PJQA 1JT5A 2A75A 5T52A 3FJDA 4IY8A 2P34A 5SV8A 1VAVA 1ZL6A 1PZ9A 2VU9A 3OJVA 3SH3A 1C57A 3WDTA 3BA5A 2BEAA 4JPZA 3AXDA 4YW4A 1GZ9A 4YGCA 2D7RA 4Q9GA 1KRIA 5D61A 3F1RA 2UU8A 3KMVA 4IZEA 2RSTA 3QW8A 1W0PA 3ZC8A 1SLIA 4M01A 2GN3A 3POYA 1HLCA 1DZQA 4LO3C 2WBCA 3V64A 3HN1A 4FQ4A 3H0OA 3LCPA 4ZGRB 4HR6C 1FNYA 1S0LA 4XZPA 2KI6B 3O4AA 4LBKA 1ENRA 4D8HA 2XB6C 5GALA 2YXSA 3NWKA 2R16A 4DPNA 1DZDA 2D7FA 1II4A 1WBAA 4WV8A 5BQNA 1JOJA 2I1BA 3ZXEA 1LOGA 3TB0A 1LHNA 2WSUA 2DV9A 1V6NA 3DS9A 1S0CA 3P6IA 2J3PA 2DUPA 4HL0A 5DUVA 2CNAA 4LBLA 2FDBM 4YW3A 3VT0A 5IUQA 3D3XA 1BJQA 5T5PA 1T3AA 5CA6A 1V6MA 3RG0A 4XMAA 3VWCA 4DEPA 1CJPA 3IMNA 3B3QE 4QKSA 3N0KA 1XG6A 1K5UA 1UPSA 4ZA3B 1HKNA 4YZ2A 5FZYA 5T50A 3AH2A 5EG6C 1J0SA 5JDBA 2OUJA 1LGCA 4UW4A 2D43A 2DVDA 4II0A 1JYIA 4KBBA 2Y9XE 5EHAA 4QC4A 3H6RA 2ZQOA 3I29B 2G4IA 2KM2A 3QIYA 3CRHA 2NYYA 2ZZJA 2VXRA 3B9CA 2H0BA 5T55A 4KEKA 1IILA 5JOYA 4P9XA 2A6ZA 3ENRA 1KNMA 4XKIA 2C9AA 3SH5A 4XJUA 3O0VA 1SR4A 4DCKC 3T8SA 7I1BA 4Q1PA 4ZLBB 1TOOA 2R49A 1FN0A 4HJJA 1V6UA 2ZGSA 4P9YA 1BLAA 3AKGA 4LO1C 2ZGUA 3FUQA 1IT0A 3CRGA 3R4SA 1ISWA 5DZGA 3V79C 3RQ0A 3FLRA 3RS6A 3ASIA 3AZYA 2DS0A 4XDQA 4AN7B 5GLVA 4Y1VA 4FOWA 2A97A 5EC5A 1XQNA 2Y9GA 1X50A 4LO0A 1WW5A 4ATFA 3M3OA 4AYUA 1T3CA 4GOYA 5AVAA 3HBWA 3MALA 1SBFA 1QU0A 4A7YA 2A5ZA 4M00A 1JXNA 2GNTA 3UD7A 4GKYA 4Q9PA 2P3JA 3BOKA 5E24E 1SBEA 2D7IA 4YGEA 4IQPA 4LBJA 2DYCA 1QQLA 1XTGA 4G9NA 1IRPA 1QKQA 4FOQA 1S0JA 2ZGPA 4QALA 2ISEA 2IMCA 1AXYA 3W58A 4D69A 1ZL5A 4Y24A 2UWBA 2WNEA 3FLPA 2JECA 1IS4A 3AKFA 3CQAA 4KTXA 1PZ8A 2ZABA 1ONKB 3BAHA 2GO2A 1I1EA 1W6OA 1MVEA 5D63A 1R1ZA 2FPQA 3VEQA 4DENA 1KJLA 2UUSA 4USPA 1UKGA 5CB7A 1WD3A 4PC4A 4KUFA 4JKXB 1BQPA 3BRDA 2D6LX 4XJ8A 3I2AA 2AQZA 5DSSB 1MS9A 4L4HA 5GZGA 2NVHA 3L2YA 3ZXLA 2R1DA 3KM5A 2G7NA 3BX1C 2ZGKA 1ISZA 3A0KA 5JOZA 4CRQA 1PWAA 3AKHA 4P0JA 4GP0A 2FGFA 1I1BA 1Q8VA 1CONA 3V0BA 3C8AA 3GALA 2DU0A 2DU1A 2LALA 1UL9A 3D6EA 2X2TA 4R9DA 1U0AA 1G9CA 3NBDA 2I2SA 4I2SA 5BQMA 1H9WA 2EXHA 1ULEA 3JUUA 1DBNA 3WG2A 2DRZA 3QYDA 1WUVA 1V6KA 5H9PA 3USUB 4QBVA 2E7QA 3R4UA 3BRGC 5BP5C 1LULA 3AYEA 3OY8B 4R9CA 4XBLA 1MS0A 2GMEA 2JE7A 3D4KA 3WCRA 3WDWA 3PUBA 1MS3A 4EL4A 4ZFYB 3DEBA 4I4PA 5HCFA 1FMZA 4Q1RA 2R0HA 4OZXA 3VSZA 3WMVA 4J1LA 3P6JA 1WD4A 3C88A 1ZN3A 5FZUA 4YZ1A 3JUTA 1V6OA 2A7AA 4Q8KA 4A7KA 3FGMA 3B69A 3S8KA 1DFQA 4C1WA 1Z78A 4LBQD 2KKIA 3WG3A 4DFSA 4JAWA 2GALA 3CA3A 5IK4A 1LEMA 1QQKA 4FQZA 3ZVXA 3VKMA 4I3NA 2WLQA 1O4YA 1JUIA 3ZYPA 3ILNA 1HQLA 1YVGA 5IK7A 4AVSA 4FGFA 3MW3A 3B01A 1JT3A 1N3PA 2GMMA 1RY7A 4NOTA 1UX6A 2F2FA 3IKWA 2NMOA 1YBIA 2ERMA 3U4XA 5F90A 1Q8PA 4AN6A 5F8SA 4ZKTB 4KS6A 2P39A 4X3AA 4UW5A 3A21A 4H04A 3FUOA 2A8AA 2DUQA 3FJBA 2ISHA 1NUNA 2XHLA 4Q8LA 2IMBA 1LEDA 5EXOA 4GAFA 1SBDA 1CIWA 1MVQA 2AGSA 2E7TA 3A4UA 3O0WA 4FP3A 4C1XA 5T5OA 5JLVA 3CAHA 1DFCA 2FFVA 1G7YA 1AVWB 2AAIB 2D20A 4ISRA 2DURA 4P0KA 1IJTA 5JVVA 5IT6A 4BM8A 1Q03A 2Q5TA 4F83A 4GP3A 3WA1A 3AZZA 1HWMB 1AXKA 2NZ9A 4LO8B 1MZ6A 1ULGA 4UW3A 31BIA 4UW6A 4I4UA 4FPLA 3ZYRA 1MS5A 4D0TA 1CQ9A 2JDZA 1MD6A 4A7ZA 4IHZA 2ZGQA 1CN1A 3UD9A 3VSFA 4G9MA 4JQ0A 1LHOA 4I4YA 3QW6A 3O5SA 3S8JA 4ZOTA 3FJFA 3CU1B 4EEEB 3RRDA 3BA7A 3TC2A 3AH4A 3FJHA 3DUIA 4ZBVB 2DVBA 4FP2A 2ZBJA 3H6RB 5HCAA 1S0IA 2A6XA 5DG1A 2YROA 3C89A 3ILRA 1QNWA 1AF9A 1I3HA 2D6MA 1W6MA 4XJ9A 3PVOA 2C5DA 5BYNA 2GZBA 3UJQA 2GN7A 1DQ6A 4H55A 1GNZA 3FFZA 1UAIA 2R1BA 2E4MC 4XIKA 3W9TA 2G7QA 4K1ZA 5DZUA 3QJ0A 1W3AA 2R0FA 2B7YA 4QD2B 4YZ3A 4ENDA 4HEVA 2PHTA 1ZKWA 2E53A 4I96A 1GANA 2HW9A 1CVNA 3ZUSA 2UWAA 3OBTA 3HR9A 2A3WA 3WHUA 4EFRA 4J2KA 2XOAA 2NM1A 1HWPB 3QIXA 3WO2A 1N4KA 4YM1A 4W65A 4IONA 1D2SA 1GZCA 4WVVA 4AVTA 3ZSMA 4EB2B 3PHZA 1ILR1 1PUMB 1KDKA 4QKRA 3BTAA 1Z2VA 4XHBA 3SLIA 3T1LA 3V0AA 4XXPA 3AYCA 1GYKA 1YRZA 4JKQA 1PZ7A 2NTDA 1SLCA 3T1MA 1W3FA 1IRAX 1DQ4A 1V6VA 4XXAA 1OKQA 1DIWA 1TEIA 3BAGA 2ENRA 4J2SA 2VW0A 3UDAA 2ARBA 3AP6A 3AZVA 2XG3A 5T54A 1LOAA 1FWVA 1W6OB 1N3OA 2HYKA 1TTUA 4JC1A 3BOPA 1IOBA 3BAVA 3FLTA 3AXEA 2YZ4A 1V6LA 3FIEA 4RA0A 4I4RA 1QMJA 2W39A 4K1YA 3VUOA 3POSA 1ENQA 3WDUA 1EYLA 4I4VA 5BXSA 1GICA 2FMDA 2TEPA 2ZGRA 3BWIA 3WDVA 4G6JA 2V5YA 1Q04A 4RL7A 4OWKA 4Z9WB 5GM0A 3V0BB 1MACA 4DRRA 1N1YA 4H9WA 2ZACA 4K21A 1V6WA 2ZHKA 3WDXA 1CPNA 3IPVA 5GZDA 4ZFUB 2JJ6A 1CESA 3LSDA 4JP0A 2EAKA 4XJZA 3QW5A 5BQMB 1KJRA 2YMZA 3AP4A 4YZ4A 1WCSA 5FNWA 1DHKB 1W6QA 4YLZA 1FV3A 3DDAA 1MS4A 1LESA 1W6PA 1BARA 3AX4A 1TIEA 3I2XA 3EF2A 3ZSJA 2D6NA 2VSEA 4OEFA 4LBQA 4AGGA 5H9SA 1YIFA 5EYXA 4QO3A 3RSJA 1MR5A 3UJOA 2K8RA 3IN9A 1JW6A 8I1BA 3OYWA 2DVAA 1MS8A 3POKA 3N35A 1S0FA 2LTNA 3GNEA 4PBOA 1LOCA 3ZSLA 2HZ9A 1GV9A 2D6OX 1V6IA 1JN2P 3RMXA 2WSVA 3QW7A 1G9DA 5KXEA 2D1ZA 3Q7YA 1OFSA 3N7MA 4CZSA 1R8OA 4ATEA 3MW4A 5GLWA 1XHBA 1HWOB 2ARXA 3BONA 1LU2A 1BFBA 1RIRA 2VH9A 3AJ5A 2W68A 4GKXA 4LBMA 3RTIB 2HWAA 2GDFA 5F5QA 4GWMA 1SR4C 5H9QA 3AYDA 5BQUA 1ZM1A 1URXA 3CA5A 4XBNA 4Q27A 2MIBA 2XHLB 2VY0A 4QD2C 3F62B 3WUCA 2WT0A 1TP0A 5IK8A 4I37A 4YFZA 2NN8A 4JCKA 3VKLA 1S0GA 5EYYA 2BFHA 4LO0C 1CPMA 1LHVA 3PMEA 1QDOA 1LOEA 3N36A 4FPEA 3WNXA 1DJSB 3VKFC 3DGTA 3M3EA 5JOXA 4PQ9A 5LK5A 2QYIB 1QOSA 4M3CF 3AK0A 2D3PA 4YM3A 2G7KA 1SACA 1G9BA 2D3RA 2MLLB 1APNA 3N7JA 4ASMB 3APBA 1ISYA 2SBAA 5KXCA 1BFGA 2YY1A 3V65A 1W6NA 2EF6A 1ZB7A 4PCRA 2WKKA 2OVUA 1A8DA 2A3YA 3CRIA 3OJMA 4IYBA 5JMCA 1N1SA 5HCBA 5H9RA 4LBOA 1JQZA 3AKIA 1FNZA 1LJ7A 1XZZA 2OW4A 4PF5A 3FJAA 2FHRA 1WLWA 3I4IA 4GOVA 1E0OA 1SCRA 4DQAA 4SLIA 3AFKA 2WT2A 1FYUA 5DUWA 2MC2A 5DG2A 2ZR1B 1W6MB 3HOMA 3RMYA 1BZWA 1UZZA 2ESUA 1GSLA 4YZ5A 2SLIA 1MC9A 2D6KA 2Y9WC 3UL2A 1T4QA 3ZXJA 2W2DA 5D62A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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