3V0B | Genus

Total Genus 409

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	409
sequence length	1295
structure length	1280
Chain Sequence	MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNAKTFLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGILNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGAKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERP

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Toxin
molecule keywords	BoNT/A
publication title	Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex. pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium botulinum
total genus	409
structure length	1280
sequence length	1295
ec nomenclature	ec 3.4.24.69: Bontoxilysin.
pdb deposition date	2011-12-07

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1120.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain	Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain	3v0bA02
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	3v0bA03
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	3v0bA04
3.90.1240.10	Alpha Beta	Alpha-Beta Complex	Zincin-like	Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like	3v0bA01

1SZ6B 5EG6C 1Q8PA 2YY1A 2PHUA 1LGNA 3WDWA 4QKRA 3SLIA 3TAYA 1IS4A 3ZXKA 1G9FA 1OKQA 1UZYA 2DRYA 1DHKB 4GXLA 3H6RB 4IONA 4YZ3A 1BXHA 2ZMNA 4YW4A 4GWMA 2V5YA 2G7QA 1FN0A 2G4IA 3R05A 4XBNA 2D3SA 4QC4A 2CYFA 3SH3A 5T52A 4FPHA 1FV3A 4HEVA 2CL2A 1CQ9A 3UD7A 4GOVA 5BQMB 1B09A 1N47A 1OFSA 3B00A 2WJSA 4IYBA 4KUFA 1JUIA 2KLLA 3WLUA 4A7YA 2BEAA 2AXMA 3AKGA 5JLVA 4LBKA 2ZGNA 4F83A 4DQAA 2F2FC 2ETFA 1JLYA 1HIBA 2VU9A 1DQ2A 3VWCA 2R16A 1QGLA 1LEDA 1YBIA 3DGTA 4LBLA 4FPKA 1AVBA 1S0EA 3WUDA 5H9SA 4K21A 1MVEA 3POKA 3ZVXA 3RTIB 4D69A 4Q91A 3FUOA 3AJYA 1FQ9A 4K1YA 3C9ZA 3JRRA 2D3RA 3OGFA 3I29B 1HCEA 5BOWA 4DPNA 2D6KA 4J2SA 3A23A 1CESA 3O0XA 3FUQA 3BAHA 4XYXA 3M1HA 3WDUA 2ZGSA 4LBQD 3Q7WA 1PZ9A 1AJOA 3T2TA 1EPWA 1IOBA 7I1BA 1H9PA 1AVUA 2PHRA 2A7AA 4YG3A 3LLPA 5T5LA 3WNXA 1T3CA 2CWSA 1HWPB 1APNA 4K20A 1JN2P 1F5FA 3IMNA 4OWKA 2UWAA 3USUA 4OWJA 5FZUA 2G7PA 3AP6A 4JKQA 1WLCA 5E88A 1ZA4A 2EXJA 2KM2A 3UD9A 3WUCA 4Q2FA 5BYNA 1JTCA 5DUXA 3O5SA 1W3FA 1L2HA 4G9MA 2F8XC 4FPYA 4I4QA 1ISWA 4M00A 4FPCA 3OBRA 4QD2C 4P9YA 2ZBJA 1Z2VA 3AP4A 3AXDA 4AGVA 3HMYA 4AVTA 4YW3A 1ZKXA 4CTEA 4GP3A 4Q9PA 3ZC8A 3D7WB 3SITA 1S0LA 4H9WA 3VT0A 3AJ5A 4EFPA 1N4KA 4I30A 3C88A 1W6NA 1WLDA 2C9AA 1AXZA 3O4BA 3RMXA 5HCBA 4I2SA 3AKFA 2A6ZA 2C5DA 1G9BA 3FJEA 3C89A 4RL7A 3WA1A 1U0AA 1RG8A 4YZ4A 1FWUA 2I2SA 5BXPA 1SR4C 3N35A 5FZYA 2D7FA 5KXDA 3CAHA 1N1SA 3USUB 5BVPI 3NBNA 4LO8B 2RG9B 2AQZA 4ZLBB 4DRRA 2Z42A 1AX0A 1TWMA 2DU1A 2EF6A 3V64A 3IM7A 3BONA 4XJZA 1HDKA 4WZFA 1ISVA 2ES3A 4Y1UA 2GNBA 2NP0A 2W68A 1WCSA 2MIBA 4Q1PA 3AJ6A 1Z7HA 1P63A 4I4UA 2K8RA 1ONAA 1QQLA 2E53A 1YVGA 3LSDA 1TFMB 1DBNA 3OY8A 4YM0A 1HKNA 3W59A 1DJSB 1ISZA 2FMDA 1K5VA 1QNYA 4JRAA 4XJ8A 1BFBA 1BKZA 3M3OA 3WHUA 1NUNA 5G00A 4EKXB 1MS3A 1HLCA 2HWAA 1SCRA 1DLLA 3R4SA 2ZQOA 5FREA 1SBEA 4AN7B 3D6EA 2PHFA 1GLHA 1W6NB 2GNTA 4HANA 4GKYA 3F1RA 3AZWA 1Z4SA 1VAVA 1LTEA 4I4OA 2OW4A 1Q56A 1DGLA 1TWEA 1SLTA 4IHZA 3WDYA 5GZDA 1CPNA 4I96A 5EYXA 3A4UA 3E8LC 2Q5TA 4A7KA 2ZGQA 2R1BA 3ZPYA 1W6QA 5T5PA 3PUBA 4P0KA 5DZEA 3WV6A 1IJTA 5T50A 1J0SA 2XG3A 2TEPA 4W65A 2QN4A 4EFRA 2CTVA 1Q8SA 4J2YA 2ZZJA 1AX2A 4Q8KA 3I2AA 4A7ZA 3H6SE 3IM0A 3AZYA 3ZX7A 3ILNA 1QNWA 5BXSA 4YGEA 4LO2A 1MS5A 3H6QA 3VV1A 3WO4A 2VSAA 2W52A 3OY8B 2WKKA 4FQ4A 3M2MA 3AYAA 1YRZA 3UL2A 4PF5A 2FPQA 4HJJA 1ABRB 2B7YA 2Q9XA 1H30A 5BQNA 3BA7A 2A3YA 1F9KA 1XZZA 1PZZA 3A21A 6I1BA 2G7KA 1AF9A 9ILBA 3FJCA 4LO1A 2VW0A 3KM5A 1K5UA 1QOSA 2GMMA 1V6LA 4FOWA 2ZKNA 2ISEA 4DFSA 1G9DA 2K43A 2AENA 4YLZA 1LHUA 1IKQA 3N7JA 4YZ5A 1YXWA 2ZHKA 1E0OA 3C8BA 4I4VA 3CNAA 1WBAA 1PZ8A 3S8KA 1ULDA 4IY9A 2DTWA 2D24A 4I6IA 3AXEA 1W6QB 1YIFA 2E4MA 2VH9A 4XFUA 3WG4A 2VUAA 3M3EA 4EL4A 3WCSA 4Y22A 3BAUA 1SBDA 4F34A 1AVAC 4XJ9A 1MD6A 3VT1A 3FJAA 3OJ2A 3AYEA 2OVUA 4ITCA 1UKGA 1LHVA 2ZACA 3NBCA 2DUPA 3QCWA 5DUWA 3QJ0A 21BIA 4I0YA 3LSEA 1EV2A 2ERMA 3NF3A 1G9CA 3BADA 3NV4A 3O4OA 2L5XA 1SLCA 3TB0A 3FGMA 1CIWA 2DVBA 2Y9FA 3BRGC 1CR7A 3WDXA 3OJBA 2RSTA 3C8AA 2ZABA 3WDVA 1JT7A 1FNZA 4LBQA 4KEJA 4D0ZA 5JVVA 1J1TA 1ZL5A 1HQLA 4I4YA 1AFCA 3N7MA 2YV8A 4ZGRB 4USOA 3DS9A 4X3AA 4H55A 3C2UA 2HZ9A 5DZFA 4D8HA 1N1YA 1WW5A 2ZGMA 1FWVA 4X39A 5L73A 3BRDA 1GKBA 3SNVA 1CPMA 1FGAA 2WT0A 1JT4A 2JD4A 2WLQA 3O4CA 1DQ4A 3D3XA 1DQ0A 1RY7A 4LBJA 4I4XA 1O4ZA 2DREA 5DUYA 3T8SA 4R9BA 1PUUB 3A0NA 3L2YA 3WCRA 5E24E 1KJRA 1ITBA 5BQUA 3A07A 1VALA 1MR5A 1WBLA 4P0LA 2AAIB 3D4KA 4Y22B 4CRQA 2SBAA 2LIQA 2R0FA 1AXKA 5T54A 3ENRA 3BB2A 3B01A 4XZPA 4ISQA 5CAZA 4AGRA 2E7TA 1LOGA 1DQ5A 1DQGA 4XXAA 4OZXA 5E8AA 3VSZA 2ENRA 4BOWA 2GNMA 1YO8A 4HL0A 3AK0A 2YROA 5GLWA 1MS4A 1XQNA 1GZCA 3IPVA 3OJVA 5F8WA 1RZOB 2DUOA 3ZC9A 1UL9A 4I8MA 5T55A 1QXMA 4KTXA 2D7RA 4FOYA 4KEKA 2BFHA 4ATFA 4FPJA 3AZVA 4LBQB 3O44A 1LHNA 1LESA 1Y7BA 3ZSKA 2UURA 4AGGA 4FP2A 1XYFA 4QALA 2XOAA 1C1LA 1IS3A 2WNEA 4XIKA 1BLDA 1DQ6A 3ZXFA 1MVQA 3FJJA 3ILAA 2V73A 3NJ5A 2JJ6A 3POSA 2ZGRA 3K1XA 4PCRA 4JPZA 4DRVA 1QOTA 4XJAA 4ZJXA 2GMPA 1C1FA 4UW6A 4WVVA 2FFUA 4YG6A 1KJLA 2ZHMA 4GAIA 1G8WA 1GNZA 1LEMA 2ZGTA 3IN9A 1ENRA 4Y24A 1W0OA 2QN0A 1ILR1 3OPZA 2MC2A 5D63A 4CZSA 2DVDA 4RA0A 3QYDA 1UAIA 1Q8OA 2BEBA 3OBTA 1DQOA 1QU0A 3V0AA 1A3KA 2DVAA 3CA1A 1YF8B 2LIEA 2KKIA 5EYYA 2AREA 2ZMLA 2YMZA 4XJUA 3IPVB 3KMVA 2VLCA 4YOLA 1UX6A 1EVTA 1CVNA 2WSVA 3AH2A 1DIWA 1N3PA 2HYKA 1LODA 4XKIA 1OQ1A 3QIXA 3SNMA 2R9KB 4LO2C 1V6OA 1SLIA 5DZGA 2NVHA 1UMZA 2DYCA 3N36A 1JT3A 1LOBA 4ZFYB 1URXA 1JW6A 4Y1VA 3IAGC 2WBCA 1BASA 2W08A 5GZCA 3IIRA 1Q8VA 4IY8A 1SLAA 1V6KA 1IS5A 5F9TA 2A71A 3BOOA 2SLIA 3HR9A 4MYEA 4R9AA 2QYIB 4XMIA 1CJPA 3VT2A 3JU9A 3POYA 3VKLA 2R1DA 2Y9WC 1ISYA 3FJHA 5JOZA 1JT5A 2E7QA 3FJ9A 2GNDA 4LO1C 3VKFC 4WV8A 5B2HA 3FJKA 3CU1B 1FAYA 1WBFA 4M3CF 4AVSA 2ZHNA 1CE7B 3FJ8A 4LO7B 1V6JA 4XILA 1BJQA 5GALA 1QKQA 1AVWB 3BOPA 3CA5A 5SV8A 1LHWA 1CONA 1MZ5A 4XHXA 3V0AB 4UW5A 4L8QA 4ZOTA 2UWCA 4AN6A 3MW4A 2VSEA 1LENA 3DSEA 3GNEA 1GZ9A 2E4MC 4FOQA 1MS0A 5DZUA 3WZ1A 2DVGA 2NYYA 1FATA 1I1BA 4XFSA 1V6UA 2KI6B 1ZN3A 1AXMA 1PUMB 3P6JA 3QW8A 3ZUQA 4UW3A 2ZR1B 4PBOA 1C57A 2ERFA 4YGDA 4ZFWB 4BMBA 1GSLA 4EB2B 1IS6A 5BP5A 3FJFA 1TIEA 4ZXKA 1W3GA 2P3IA 4ZKTB 3ZSLA 5JOYA 5EXOA 3A0KA 2RQ9A 1NZKA 3NBDA 4P9XA 3FLPA 5GLZA 1X50A 5LK5A 2NMOA 2A5ZA 3WINA 3PVNA 1S1AA 4OW4A 4OEFA 1II4A 1M2TB 4LO3A 3AH4A 1IOAA 4Y1XA 5EWSA 1G9AA 1T9FA 5DVHA 5KXBA 3Q9OA 3T1MA 2ET2A 1W3AA 2XHLA 4ELCA 1IKPA 2ZQNA 3VEQA 3AX4A 3AYCA 4Q27A 3FJIA 1XTFA 1V6NA 5IK8A 1V6VA 4R9DA 1GV9A 5D61A 1WD3A 1R1ZA 3RQ0A 3HOMA 4M3CA 5JOWA 3FJBA 4I7IA 3WOGA 2GDFA 2A75A 1WW4A 1Q03A 2FGFA 1LCLA 2CY6A 2JECA 2ARBA 1DFQA 1VCLA 2GALA 2JE7A 5JOXA 5BQUC 4YFWA 5GJ6A 1BYHA 3CA4A 3O4DA 3BAQA 2ISHA 2ARXA 4CJMA 3RSJA 3T1LA 1RMLA 1S0FA 3WVJA 2LTNA 1GGPB 1IT0A 1FMZA 3QW7A 2ZGPA 1MACA 1ZB7A 2Z49A 3WO3A 3SISA 1DFCA 3QIYA 2NZ9A 3OYWA 4Z9WB 1KNMA 3WO2A 1R8OA 4ZA3B 1BZWA 4DENA 1NXD1 2VW2A 4M01A 2X2TA 1W0PA 1ULEA 1ZL6A 2DUQA 4FVVA 2XB6C 2OUJA 2AUYA 1V00A 4JAWA 3CRIA 2IMCA 4AYUA 2ZGLA 1BLAA 3IKWA 3UJOA 4KBBA 5F5QA 2XHLB 2EXIA 2VW1A 4USPA 2IMBA 2ZGOA 4P14A 5H9QA 3ZUSA 1PZ7A 1JLXA 4M3CB 4Y26A 3AH1A 1F82A 2NN8A 3NV1A 2K4AB 2RHPA 1GZWA 2DTYA 4K1ZA 4XIOA 2P37A 3POWA 4Y1YA 5IK7A 2A6WA 4XXPA 1SLBA 4R9CA 4ZFUB 4I3NA 1A78A 2YUGA 4D0TA 3TC2A 1LECA 2R0HA 1JYIA 2EAKA 1JOJA 4FPEA 4TYSA 3MPPG 8I1BA 3VKMA 5IT6A 4LO7C 4FP3A 3N3HA 2UUSA 4XHBA 3PVEA 2D22A 4DCKC 1JHNA 2D7IA 2IWTB 1GNHA 1T4QA 1HWNB 4PQ9A 3APBA 1BARA 2AH2A 2DWRA 1V6XA 3A22A 3K3QB 4GKXA 1R8NA 2UWBA 3FJDA 4NOTA 3Q7YA 3RG0A 3ZXEA 2ZHLA 3PVOA 1HCDA 4LBNA 3WDTA 4ENDA 1W6OA 5T5OA 3OYWB 5GAQA 4EEEB 1T3AA 4IQPA 4P6AA 1M16A 2OUHA 5F90A 1CN1A 4FQZA 2P2KA 1LJ7A 1KQRA 3JUUA 4XE9A 1A8DA 1DYPA 2D44A 3LCPA 2A6YA 2IMAA 4SLIA 3CRGA 4XBLA 1W6MA 2D1ZA 1N1TA 1ENSA 5IK5A 3P6IA 2EXKA 1IILA 4Z8SB 2ILPA 3CQAA 3BIWE 4BM8A 1FV2A 1WD4A 1PC8B 1LOEA 5KXCA 4IZXA 4LO0A 3JUTA 4QKSA 1IHKA 3BA4A 1AXYA 3MW3A 3W58A 1RINA 1GZWB 3ZXLA 1BFGA 2D3PA 3ILRA 3HSMA 1ONKB 1G7YA 1TEIA 3DUIA 4PBPA 3BWIA 3NBEA 5FRAA 5CA6A 1ZKWA 3SH5A 5FNWA 1MS8A 2JE9A 2A70A 4G6MA 3N7LA 2P39A 1WW7A 3UDAA 2R49A 1JBCA 3ZYPA 1XHBA 4KC3A 5HPZA 2M49A 3UJQA 4KEIA 1VLNA 1W6OB 2YZ4A 3FIIA 3B3QE 4J2XA 1N1VA 2Z48A 2ZMKA 2P3KA 1SBFA 1JY0A 1O4YA 4YFZA 3UJ0A 4QO3A 1QOOA 2A3WA 3BODA 4P9WA 4YW2A 1HQWA 5FNXA 4I4RA 2EIGA 2ZGUA 1HWMB 1SACA 1W6MB 4BLIA 1GYKA 4XJWA 2BQPA 1CVSA 5BP5C 3O12A 4FPOB 4J1LA 1JQZA 4H04A 1GICA 2P34A 3AP7A 1QDOA 4FPLA 2HW9A 1RITA 2ESUA 2D23A 3WINC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2HWC 1;  2HWE 1;  3HQX A;  1SZ6 B;  3KZ4 C;  1OPM A;  5EG6 C;  2PLV 2;  1Q8P A;  5FAX A;  1YFY A;  1VAK A;  2YY1 A;  4W6X A;  5A33 A;  3D8C A;  2PHU A;  1LGN A;  3NAP B;  1H8T A;  3WDW A;  4QKR A;  3SLI A;  3TAY A;  4MGY E;  1IS4 A;  3ZXK A;  1G9F A;  5BV6 A;  1OKQ A;  4YVS C;  1UZY A;  2DRY A;  1DHK B;  1R08 1;  2BFU L;  4GXL A;  3H6R B;  4ION A;  4B4P A;  3MLK A;  4C91 A;  4YZ3 A;  1BXH A;  1ZYB A;  1VB2 A;  2ZMN A;  4YW4 A;  4GWM A;  2XJS A;  3KD4 A;  2V5Y A;  2G7Q A;  4A2U A;  1FN0 A;  2WS9 2;  1HXS 2;  1VBB 2;  3VBR C;  2HWF 2;  5CFC A;  2G4I A;  2DCZ A;  2GC3 A;  3R05 A;  1PVC 1;  4XBN A;  1VBD 1;  2D3S A;  4QC4 A;  2CYF A;  3QH7 A;  3SH3 A;  1ND3 C;  1COV 3;  4IES A;  5T52 A;  4Q4Y 1;  4FPH A;  1T6G C;  1FV3 A;  4HEV A;  2CL2 A;  1CQ9 A;  4HMZ A;  2EVX A;  3UD7 A;  4GOV A;  1DGW A;  3M4F A;  5BQM B;  1B09 A;  1N47 A;  1PGL 1;  1OFS A;  1RUG 3;  2WJS A;  3B00 A;  3QBQ A;  1QJY 3;  3S0M A;  4QPI B;  4IYB A;  4KUF A;  1JUI A;  2KLL A;  3WLU A;  4A7Y A;  2BEA A;  2AXM A;  2XJQ A;  3AKG A; 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3V0BA

Total Genus

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