3V0BB

3.9 angstrom crystal structure of bont/ai in complex with ntnha
Total Genus 377
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
377
sequence length
1194
structure length
1150
Chain Sequence
MNINDNLSINSPVDNKNVVVVRARKTDTVFKAFKVAPNIWVAPERYYGESLSIDEEYKVDGGIYDSNFLSQDSEKDKFLQAIITLLKRINSTNAGEKLLSLISTAIPFPYGYIGYRETNYLSSEDNKSFYASNIVIFGPGANIVENNTVFYKKEDAENGMGTMTEIWFQPFLTYKYDEFYIDPAIELIKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVIPYRLRSELENIEYSQLNIVDLLVSGGIDPKFINTDPYWFTDNYFSNAKKVFEDHRNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFRININDIWELNLNYFSKEFSIMMPDRFNNALKHFYRKQYYKIDYPENYSINGFVNGQINAQLSLSDRNQDIINKPEEIINLLNGNNVSLMRSNIYGDGLKSTVDDFYSNYKIPYNRADSSLDNVNIGVIDNIPEIIDVNPYKENCDKFSPVQKITSTREINTNIPWPINYLQAQNTNNEKFSLSSDFVEVVSSKDKSLVYSFLSNVMFYLDSIKDNSPIDTDKKYYLWLREIFRNYSFDITATQEINTNCGINKVVTWFGKALNILNTSDSFVEEFQNLGAISLINKKENLSMPIIESYEIPNDMLGLPLNDLNEKLFNIYSKNTAYFKKIYYNFLDQWWTQYYSQYFDLICMAKRSVLAQETLIKRIIQKKLSYLIGNSNISSDNLALMNLTTTNTLRDISNESQIAMNNVDSFLNNAAICVFESNIYPKFISFMEQCINNINIKTKEFIQKCTNINEDEKLQLINQNVFNSLDFEFLNIQNMKSLFSSETALLIKEETWPYELVLYAFKEPGNNVIGDASGKNTSIEYSKDIGLVYGINSDALYLNGSNQSISFSNDFFENGLTNSFSIYFWLRNLGKDTIKSKLIGSKEDNCGWEIYFQDTGLVFNMIDSNGNEKNIYLSDVSNNSWHYITISVDRLKEQLLIFIDDNLVANESIKEILNIYSSNIISLLSENNPSYIEGLTILNKPTTSQEVLSNYFEVLNNSYIRDSNEERLEYNKTYQLYNYVFSDKPICEVKQNNNIYLTINNTNNLNLQASKFKLLSINPNKQYVQKLDEVIISVLDNMEKYIDISEDNRLQLIDNKNNAKKMIISNDIFISNCLTLSYNGKYICLSMKDENHNWMICNNDMSKYLYLWSFKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords BoNT/A
publication title Botulinum neurotoxin is shielded by NTNHA in an interlocked complex.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 377
structure length 1150
sequence length 1194
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-12-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
B PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
B PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3v0bB02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3v0bB03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3v0bB04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3v0bB01
1MS8A 2P3KA 3SH4A 1S0BA 1UZZA 4WVWA 5F5QA 2ZGNA 3OY8A 1W6PB 1S0CA 2ISHA 2GZBA 2WSUA 2D3PA 4JCKA 2EAKA 4LO3A 3ZYPA 5DSSB 2CY6A 3DDBA 1PZZA 1ZL5A 2CYFA 2ISGA 2AUYA 3BOPA 1A3KA 4QKRA 3PJQA 2EIGA 5L73A 3AFKA 3I2XA 3CRHA 3AJ5A 3BONA 1AXZA 1KDMA 4Q91A 1HWOB 3OJBA 3NBCA 1J1TA 5BP5C 2FDBM 4XILA 2EXKA 5HPZA 6I1BA 3AZVA 4ATFA 1W6NB 5F8WA 4Y22B 5GZDA 3FJ8A 1UL9A 3IPVA 1SLCA 3L2YA 1K5UA 2YUGA 1QF3A 4F34A 3WO2A 3AZXA 3UD9A 1N1VA 1NZKA 1YXWA 2A3XA 4OEGA 1DLLA 2E4MC 4I4RA 3O0XA 1WLCA 1IOAA 3NBEA 1IHKA 5D62A 1RIRA 1FWVA 3MW4A 2ZMNA 1XZZA 3IN9A 3BRGC 4HJJA 1IS5A 3LCPA 2E7TA 1MS9A 1PZ7A 2A5ZA 5BQUC 1E0OA 1TWMA 2V73A 2YROA 3WVJA 3WUCA 1YIFA 5EC5A 1G9BA 3A0KA 4HANA 3WUDA 2ZGRA 3E8LC 1VAMA 4XHBA 4Q8KA 3ZVXA 1IS6A 3BX1C 2OVUA 4UW5A 3FJAA 2ZR1B 1N3QA 4I4XA 1LU2A 1Z4SA 2NYYA 3M3QA 1DZCA 5T54A 4X37A 4M3CF 3FJHA 2KLLA 1ZKXA 1TP0A 4XBLA 5GLVA 5GLWA 4OW4A 3VT1A 4KC3A 4AGVA 2A6ZA 4BOWA 4AVVA 41BIA 5JOWA 4R6UB 3CA5A 1DIWA 1UMZA 1Q04A 3WDXA 2ENRA 2ZQNA 3SNVA 2YV8A 3P53A 3MW3A 2UURA 1MS4A 1Q8QA 2VXRA 4I6IA 3V0AA 2AENA 3O4OA 3NJ5A 1PZ9A 1Z78A 3DUIA 2ZGKA 1KQRA 3AJ6A 4YLZA 1DQ4A 2W08A 4CZSA 1F31A 1WCSA 4PF5A 3BADA 1WD3A 2DUQA 2RG9B 1BARA 4CJMA 3N7KA 1D2SA 1LOFC 2FMDA 5IK8A 2DREA 2ZMLA 5T50A 3PG0A 3H6QA 3AH2A 4FPYA 4UW6A 1MC9A 5IT6A 3A22A 4WZFA 3R05A 3NV1A 4LBMA 3V0BA 2Z42A 1K5VA 1HDKA 4ZBVB 3ZXKA 4R9CA 5DUYA 4P14A 5BQMB 4KEJA 2LALA 1DYPA 2E51A 2A71A 1T3CA 1V6NA 3RMXA 4ZXKA 2JDZA 3HMYA 4R9BA 1C4RA 3AJZA 4I8MA 4KEIA 3UL2A 2DUPA 3WOGA 2XHLB 4P0LA 1PWAA 3FJDA 1GGPB 5IUQA 1JQZA 3B9UA 3AP6A 5F90A 4YZ2A 1ENQA 2DRZA 4I4VA 1YVGA 1V6OA 4NOTA 1GSLA 2VU9A 3UK9A 1D0HA 1ONKB 2C9AA 2ERMA 1LOEA 4QBVA 3AYAA 3ENRA 3T2TA 3MW2A 4Y20A 1IS4A 3SLIA 2GNDA 4XOGA 3ILAA 1SFYA 2DYCA 2P3IA 3BAHA 3WDVA 2GN7A 1Z7HA 2A3YA 4TYSA 1HLCA 1QNYA 3ZC9A 2UUSA 2GNBA 2HW9A 4YM2A 1J0SA 1JY0A 3WHTA 1VIWB 2X2TA 4FGFA 3I4IA 2D23A 1UPSA 2AYHA 4K1ZA 1IRPA 3BOOA 1BYHA 5DZEA 2W52A 2A6VA 1G86A 3IM5A 3BAVA 3AZZA 1DQGA 2ZGMA 2PHXA 4Y1VA 3WCRA 1ENRA 3B01A 1LCLA 1FQ9A 5H9RA 1ISYA 3ZXFA 1YBIA 2AH2A 4XKIA 3ATGA 2VH9A 4I4UA 4OUJA 3A4UA 4XFSA 3WA1A 1I3HA 3ZURA 2D22A 3K1XA 1W6NA 2QYIB 4KTXA 2GMMA 4WV8A 4LO1A 2NM1A 3CRIA 1MVQA 2ZGPA 2G7KA 1JBCA 2P3JA 2D6NA 4XTPA 2R0HA 4OWLA 4Y26A 2D6MA 3T1MA 4GAIA 1CQ9A 3BODA 5T5OA 1GZWA 1AX1A 5FZUA 3BAUA 3WO3A 1A8DA 3TAYA 1EVTA 5H9PA 2KI4A 2UWAA 4HA2A 1CE7B 4LO2A 3D3XA 3VT0A 2DTWA 1T4QA 4IONA 3VSZA 3RRDA 4I4PA 3BAOA 4FPHA 2GN3A 3QCWA 3OYWB 1EPWA 1AJKA 1P63A 3Q7YA 1AX2A 1CIWA 4XZPA 1ZN3A 3FJEA 1HWPB 1DJSB 2ZA9A 3A07A 4QALA 1LENA 4USOA 3V64A 1ONAA 1ZL6A 3SNMA 1V6KA 9ILBA 4YW3A 1YO8A 4BPZA 2DUOA 3AYEA 1YF8B 4X3AA 2WSVA 5D63A 4MYEA 5GM0A 2M49A 3AX4A 1OFSA 4Y1UA 5FREA 4JAWA 2BEAA 2Y9WC 4Z8BA 1WW5A 1W0OA 3PVOA 4A7KA 5GLUA 4JP0A 1DYKA 3VT2A 2CNAA 4TLPA 3FJKA 2DS0A 4IY8A 4J2SA 4XFTA 4JKXB 3AXDA 2JE7A 2ESUA 5E24E 1DFQA 4P9XA 1HKDA 1MS0A 2D3SA 1Q8SA 1V6WA 2AREA 5SV8A 1SR4C 4G9NA 3BWIA 3HOMA 1WW6A 1PC8B 1II4A 3HSMA 1W6QA 2VW0A 3MPPG 1TIEA 1IS3A 2DU0A 3W59A 4CTEA 4X38A 3BA4A 2DV9A 1QKQA 4YG6A 4Y24A 3WG2A 4FOQA 3QW8A 3FLRA 4FPKA 5HCFA 3O0VA 4DPNA 1HQLA 4RA0A 4H04A 2D24A 4YM1A 1LHWA 1UZYA 3I2AA 5BXPA 5CNAA 2DURA 3OPZA 3RMYA 3FJBA 3LSEA 4LO7C 1KDKA 1SLLA 3O4AA 5LK5A 1IOBA 4BQ1A 3FGMA 1AXKA 3N0KA 4EKXB 4XFUA 4W65A 2G7QA 3CAHA 4I37A 1PZ8A 2A8AA 1Z2VA 5GJ6A 3USUA 5GAQA 3WHUA 1MZ6A 1NXD1 3VKFC 1XYFA 1FGAA 1CR7A 1FMZA 1N3OA 2A7AA 4HR6C 3BAGA 1S0EA 4QO3A 3W58A 3OBRA 1Q8PA 4FOYA 1APNA 5FZZA 2NVHA 2XHLA 2NTDA 1ZA4A 1BLDA 3QR5A 1LGNA 4GOVA 2JJ6A 3UJQA 5DXDA 3N35A 4I4OA 1AX0A 5BOWA 2UU8A 1SLIA 4GP0A 3IKWA 2WLQA 3H6SE 3WINA 3O5SA 1SLAA 3ILRA 1ULCA 3AKIA 2RQ9A 2YXSA 4GAFA 1FNZA 3C8BA 2Y9GA 3DS9A 1HWMB 2ILPA 5GLZA 3AP5A 5HCAA 2W2DB 4K1YA 4LBQB 2ZHNA 4NO4A 1QXMA 1CJPA 2D7IA 2QN0A 4OZXA 3PUBA 3DEBA 4R9DA 2CTVA 4PBOA 4DENA 4YW5A 3ASIA 5FRAA 2VY0A 1V00A 4PBPA 4D0ZA 1F9KA 1AVWB 3LTQA 2FO1A 1SBFA 5EYYA 2XOAA 3IAGC 4ISQA 1ABRB 3JU9A 4R9AA 1V6UA 5IK5A 1GZCA 1WBCA 4YG0A 5G00A 3R4UA 2GALA 2JD4A 1YYNA 4YZ4A 1A78A 4FPCA 1OQ1A 2DU1A 2WT1A 1W6MA 1GANA 5BVPI 1LHUA 5GLTA 1MS1A 4G9MA 3TB0A 1IRAX 2RHPA 1JHNA 1LGBA 2ZQOA 3QW7A 1JUIA 1FMMS 3PHZA 1CVNA 1AF9A 3DDAA 2DVFA 5KXBA 4IZXA 5DZUA 1MVEA 3A0NA 2HYKA 4Q9PA 4IQPA 5KXEA 2CL2A 3BA7A 4GXLA 2ARBA 3NV4A 1G82A 3NBDA 3Q7XA 4PC4A 2R9KB 1GKBA 3U4XA 3OGFA 3OBTA 2Q3NB 1FN0A 2C5DA 2A75A 2G7NA 5F8SA 2TEPA 4Q2FA 2J3PA 1MR5A 5CA6A 3FJ9A 1LTEA 1KRIA 2D44A 1H9WA 3CNAA 3WDWA 4YW2A 1DZQA 4A7ZA 3WG4A 4YG3A 1B09A 5E89A 4Y1XA 1QOTA 3RG0A 3F62B 3O4DA 5H9SA 3VEQA 3JUUA 3ZUSA 1Q56A 3QLQA 4PCRA 5JOYA 3WDYA 1SBEA 4YOLA 2XB6C 4BMEA 4LBJA 3M3CA 1DGLA 2PHTA 5DZFA 3AKFA 2WT2A 3NF3A 4FQZA 1Y7BA 1GICA 3WDTA 1M2TB 1JOJA 1WLDA 1AZDA 3AZYA 2VSEA 2KI6B 4M3CB 2P37A 4Y1YA 3O44A 4WVVA 1SBDA 4BMBA 2HWAA 5H9QA 3WCSA 2Z48A 2WKKA 1DHKB 2I1BA 3FIIA 1W3AA 1Q1UA 3M2MA 1G9AA 4G1RA 3ZXEA 2IHOA 4FVVA 2D1ZA 4K21A 1GZ9A 3H0OA 2R1DA 3C8AA 2F2FA 1UKGA 1AVAC 3AJYA 3A23A 1T3AA 2K43A 2EALA 5HCBA 3C9ZA 4YW4A 3H6RB 4M3CE 1SCSA 3N7MA 3AP9A 3AXEA 4YGCA 2Y9FA 2G7PA 4FPJA 4YGDA 1AXMA 3HALA 1N1TA 3ZSJA 2D6LX 5AVAA 3NWKA 4I1EA 5GALA 1DQ0A 1Z0HA 1H9PA 1QDOA 5DG2A 4XYXA 3KMVA 1QQKA 2D7RA 5GZEA 3AYDA 4H55A 1ZKWA 1LHVA 3FBYA 3CRGA 1VCLA 1KNMA 4D69A 3WNXA 1AXYA 2EXIA 3QIYA 2P34A 1EV2A 4LO3C 2LIEA 2FFVA 2ET2A 1JXNA 3ZXDA 4U2AA 1W6PA 1VALA 5JMCA 4ZGRB 4H9WA 3VUOA 5DUVA 3K3QB 1RZOB 1WBAA 3AH4A 1ILR1 3FIEA 2ETFA 2VLCA 4Q1PA 5BP5A 5F8YA 2GNMA 3CA4A 3OJMA 1V6IA 1V6JA 3FJJA 5E88A 2OUJA 3BIWE 4LBQA 2MC2A 1G9FA 1UAIA 2VUAA 3INAA 1TEIA 2A6YA 5CB7A 2BEBA 1QNWA 1F5FA 1BFGA 2E4MA 4Y22A 4XE9A 1V6MA 2EXHA 3MEPA 1FNYA 3KM5A 3O4BA 2WBCA 3GNEA 4ZFYB 1JT4A 4JQ0A 2HWMA 2Q5TA 4AGRA 1S1AA 5FNWA 1LHOA 4J1LA 2IMBA 4ATEA 1F82A 2CWMA 2PHFA 1RINA 3UJOA 4L4IA 1UX6A 2IMCA 4FPOB 2K4AB 4EFQA 1QDCA 3JUTA 4HEVA 1DBNA 1FAYA 3ZSLA 3V65A 4I96A 2OUHA 4P0JA 1YI7A 4GP3A 1DZDA 3ZXGA 1KJRA 2BQPA 2KH2A 4YW1A 1AVXB 1T9FA 5BXRA 4II0A 1XG6A 4P9WA 1BQPA 1XTGA 1OKQA 1FYUA 1S0GA 2Q9XA 1QOOA 1N1SA 1MD6A 4P6AA 1G8WA 1CVSA 1LEMA 1SZ6B 3ILNA 3IM7A 1V6LA 1IJTA 3BAQA 2P2KA 1BKZA 2D6KA 1V6VA 5B2HA 2IWTB 1IKPA 3V0AB 1QU0A 5BQNA 1ISWA 4EL4A 3P6JA 5JOZA 4Q27A 5FZYA 2PHRA 3NV2A 3N36A 5T55A 2ISEA 2HZ9A 1S0JA 1M16A 3O3QA 1GNHA 2D3RA 2P39A 3CA0A 2ZABA 2ZZJA 4RL7A 1SLTA 3UDAA 4ITCA 2WQZC 3F1RA 4GALA 2ZGQA 4AVTA 2D20A 5E8AA 1AVBA 4M00A 2I2SA 1YRZA 1ITBA 5KXCA 3DSEA 2ZGUA 3PVEA 4LO7B 2W68A 1BFCA 1GLHA 4F83A 2FHRA 1W6OB 4J2KA 3SH5A 5EHAA 4AWDA 2IMAA 1LOCA 1CESA 2ARXA 2ZHMA 1DQ1A 3B69A 3C88A 4I4YA 1C57A 5BYNA 4LBQD 2CWSA 3POWA 4GA9A 2D6OX 1LECA 2F2FC 4DRRA 1S0FA 1KJLA 2DTYA 5BQMA 4XBQA 1ULDA 1FATA 1JW6A 1SCRA 1IT0A 1WBFA 1C1LA 4FP3A 4FP2A 5JVVA 3D7WB 3AK0A 4Y20B 3BA5A 3ZUQA 4D8HA 3S8JA 3POYA 4KEKA 4BM8A 3BRDA 1NLSA 2ZMKA 1Q8OA 4EJ5A 3B00A 1R8OA 2NMOA 2UWBA 1IILA 5DVHA 4G6JA 4IY9A 2A6XA 3WG3A 3ZC8A 2PELA 5KXDA 2V5YA 5T5JA 5DZGA 4XBNA 4I3NA 2FPQA 1V6XA 4GWMA 4LO0A 3M3EA 4UW3A 4YFZA 3VSFA 3FUOA 1AFCA 1URXA 4OWKA 4YZ1A 3WDUA 3N3HA 4LBLA 4DRVA 3FFZA 1BFFA 4J23B 1JYCA 3N7LA 4WBCA 1ISXA 2DVAA 4DS0A 4J2XA 4QC4A 2GMEA 3I29B 3V79C 2MLLB 3WMUA 4DQAA 1LHNA 1ULGA 1Q03A 4XHXA 2AAIB 4FQ4A 1MZ5A 4ZA3B 3NV3A 3IM6A 2NZ9A 1FWUA 4DFSA 2ERFA 4XXPA 1DFCA 3OJ2A 4I1BA 4A7YA 4CRQA 3D6EA 4LO1C 2F8XC 1GZWB 2JKBA 4I4SA 3BOKA 2LIQA 1G9DA 3O12A 4I0YA 2GDFA 4XJ9A 1SLBA 3W9TA 1L2HA 1R8NA 2H0BA 2AXMA 2WT0A 1ULEA 2WNEA 1DQ2A 2VW1A 4ZLBB 4KBBA 1W3GA 3O49A 4LO2C 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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