3VUOA

Crystal structure of nontoxic nonhemagglutinin subcomponent (ntnha) from clostridium botulinum serotype d strain 4947
Total Genus 330
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
330
sequence length
1196
structure length
1151
Chain Sequence
MDINDDLNINSPVDNKNVVIVRARKTNTFFKAFKVAPNIWVAPERYYGEPLDIAEEYKLDGGIYDSNFLSQDSERENFLQAIITLLKRINNTISGKQLLSLISTAIPFPYGYVGYRETNYIESQNNKNFYASNIVIFGPGSNIVENNVICYKKNDAENGMGTMAEILFQPLLTYKYNKFYIDPAMELTKCLIKSLYFLYGIKPSDDLVVPYRLRTELDNKQFSQLNIIDLLISGGVDLEFINTNPYWFTNSYFSNSIKMFEKYKNIYETEIEGNNAIGNDIKLRLKQKFQNSVQDIWNLNLNYFSKEFNSIIPDRFSNALKHFYRKQYYTMDYGDNYNINGFVNGQINTKLPLSDKNTNIISKPEKVVNLVNANNISLMKSNIYGDGLKGTTEDFYSTYKIPYNEESDNFPLNNISIEEVDSIPEIIDINPYKDNSDDLLFTQITSTTEEVITHTALPVNYLQAQIITNENFTLSSDFSKVVSSKDKSLVYSFLDNLMSYLETIKNDGPIDTDKKYYLWLKEVFKNYSFDINLTQEIDSSCGINEVVIWFGKALNILNTSNSFVEEYQNSGPISLISKKDNLSEPNIEIDDIPDSLLGLSFKDLNNKLYEIYSKNRVYFRKIYFNFLDQWWTEYYSQYFELICMAKQSILAQESVVKQIIQNKFTDLSKASIPPDTLKLIKETTEKTFIDLSNESQISMNRVDNFLNKASICVFVEDIYPKFISYMEKYINNINIKTREFIQRCTNINDNEKSILINSYTFKTIDFKFLNIQAIKNFFNSQVEQVMKEMLSPYQLLLFATRGPNSNIIEDISGKNTLIQYTESVELVYGVNGESLYLKSPNETVEFSNNFFTNGLTNNFTICFWLRFTGKDDDKTRLIGNKVNNCGWEIYFEDNGLVFEIIDSNGNQESVYLSNVINNNWYYISISVDRLKDQLLIFINDKNVANVSIEQILNIYSTNVISLVNKNNSIYVEELSVLDKPVASEEVIRNYFSYLDNSYIRDSSKSLLEYNKNYQLYNYVFPETSLYEVNDNNKSYLSLKNTDGINIPSVKFKLINIDESKGYVQKWDECIICVSDGTEKYLDISENNRIQLVSSKDNAKKITVNTDLFRPDCITFSYNDKYFSLSLRDGDYNWMICNNKVPKGAHLWILKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Toxin
molecule keywords NTNHA
publication title Small-angle X-ray scattering reveals structural dynamics of the botulinum neurotoxin associating protein, nontoxic nonhemagglutinin
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium botulinum
total genus 330
structure length 1151
sequence length 1196
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01742 Peptidase_M27 Clostridial neurotoxin zinc protease
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
A PF08470 NTNH_C Nontoxic nonhaemagglutinin C-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1120.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Clostridium botulinum neurotoxin B, "coiled-coil" domain Clostridium botulinum neurotoxin b, "coiled-coil" domain 3vuoA02
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3vuoA03
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3vuoA04
3.90.1240.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Zincin-like Metalloproteases ("zincins"), catalytic domain like 3vuoA01
4QALA 3OJVA 2DUOA 3OYWA 3ZXFA 1MS5A 2A6WA 1WD4A 2D1ZA 3HSMA 1PUUB 1DQ4A 2ZQNA 3K3QB 4Q8LA 1QF3A 3VSFA 3A0KA 3ILAA 4LO2A 1HCDA 4HEVA 1MS8A 4K21A 5CBLA 4YGBA 2A3XA 1AX2A 4XBLA 4M3CB 1AZDA 4YG0A 2CYFA 1HKNA 4LBLA 2ZMNA 2AQZA 2R0FA 4W65A 1R8NA 2XHLA 3RS6A 1HQLA 4ITCA 3O0WA 4ZFWB 1DLLA 3OBRA 4XILA 4ZKTB 4I30A 4K1YA 2A71A 2K43A 2MLLB 4DPNA 1N3PA 4ZBVB 5FZUA 1LTEA 1IHKA 1G9CA 3SH5A 3N35A 1GKBA 2D6KA 4YOLA 3QIXA 9ILBA 5DUVA 4XDQA 3W9TA 4PBOA 3O49A 2A6VA 1BFBA 2ZGOA 1DGLA 2A3WA 5GJ6A 3V0AA 1V6KA 1S0JA 2Y9XE 1LU2A 1JT4A 3BTAA 3O5WB 3NV4A 4JPZA 4CTEA 2CWSA 5EXOA 5BXPA 3M3OA 1N3OA 2GZBA 2VSEA 5GALA 3WCRA 4GXLA 4JCKA 2D7IA 2HW9A 3BAOA 1S0IA 2R16A 3VKNA 5FNWA 2P23A 1RY7A 4AN6A 2ZGMA 1W6OB 5T54A 2A70A 4OWKA 3UJQA 1G86A 2DTWA 3ZYRA 2V5YA 3WDYA 5HCAA 3D5OA 3T2TA 1DQOA 4G6MA 1SACA 1GV9A 1ISZA 1XTGA 4NOTA 3BAGA 3FJCA 2IMCA 1RZOB 4LO1C 2GALA 3LSEA 2AFGA 1IJTA 2E53A 1WD3A 4FOYA 3D7WB 1ULDA 2E7TA 1O4YA 2NTDA 2VXRA 5GLTA 4M3CF 3ILNA 3APBA 2PHXA 2Q9XA 4QD2C 3AH4A 1D2SA 1B09A 3C88A 4YGCA 1HWNB 3BRFA 3UJ0A 3CRIA 2ISHA 1DFQA 5T50A 31BIA 2WJSA 1J0SA 1BFGA 3Q9OA 1XHBA 3FLTA 4XMAA 3LSDA 1BJQA 2KH2A 3NBEA 4IHZA 1CVNA 2AENA 4I6IA 4I4YA 3MPPG 4H55A 4C1WA 3M1HA 3H6RA 4OUJA 1IKPA 2GNBA 1EPWA 3C2UA 4USOA 3SNVA 4HA2A 3FJ8A 3DDBA 1GGPB 2KM2A 5T5JA 4KUFA 4P0KA 1DYPA 5E89A 4EFRA 4DENA 3AJZA 3ZSLA 3BOPA 2W2DB 4RA0A 4P9WA 3FJIA 3AP4A 3PHZA 3AYDA 3CNAA 4BM8A 3WLUA 4QBVA 5BQUC 5BYNA 1W3GA 3HALA 2NZ9A 1P63A 4Q2FA 1UX6A 4FPHA 4H04A 1Q04A 4L8QA 3KQRA 3DSEA 1MZ6A 2AYHA 1LU1A 2D6PA 1N1VA 4XJ9A 3DDAA 2VW2A 3O4CA 1N1TA 5DXDA 1D0HA 4YGEA 3N0KA 3O5SA 3B9UA 2P3KA 4AN7B 2ZHNA 2FO1A 4BQ1A 1R8OA 2GO2A 3B01A 1JLXA 3C8AA 5JOYA 2YUGA 4M00A 4UW6A 1SBDA 3Q7XA 1JHNA 1ENRA 4U36A 2P34A 2G4IA 1S1AA 2LTNA 5IUQA 1YIFA 2A6YA 5IK5A 3N36A 1TP0A 2GNDA 5L73A 5D63A 5H9SA 3ASIA 1V6IA 3FFZA 4XBQA 4J2SA 1CPMA 1BLAA 4Y20B 1Z2VA 1YYNA 1AXMA 1DQ0A 1BASA 5GZGA 4Y1ZA 5KXDA 1ULCA 3HOMA 1YTOA 1BXHA 4OW4A 5H9PA 3JUUA 2MC2A 3FUOA 3B00A 3FJBA 3OGGA 4G9NA 3TC2A 1DHKB 1DQ5A 4XKIA 1AVWB 4G1RA 1S0CA 1ISYA 4FQ4A 2YMZA 2EXJA 5GM0A 3UDAA 3ILRA 4JKQA 2C5DA 2CL2A 3HBWA 1SCRA 1WCSA 3AX4A 4JRAA 4BOWA 1A3KA 3ILFA 4FP2A 4YZ5A 1LHUA 3JU9A 3UJOA 1DQ2A 2R0HA 2A3YA 3RQ0A 4QO3A 4Q8KA 1KDKA 1TOOA 4LO1A 1JT7A 5DZEA 2WLQA 3PVNA 1SLLA 2P39A 1Q8SA 5E8AA 4JC1A 1Z4SA 4GAIA 1EVTA 2J3PA 4DQAA 2BEAA 3H0OA 4ASMB 3FJAA 2WT1A 1BKZA 3WDXA 5BP5C 4XOGA 4HJJA 2I1BA 1W6PB 4IY9A 4XBNA 3F62B 2EXIA 3M3CA 1UZZA 2R1DA 4Q1PA 5F9TA 3UL2A 3B69A 3V64A 1CQ9A 1Z78A 2DRZA 4Y22A 2K8RA 2YXSA 3PJQA 2SLIA 2K4AB 3ZVXA 1YXWA 1WUVA 3AKGA 2Y9FA 3RSJA 5BOWA 3ENRA 2FMDA 2A6ZA 2CNAA 3IPVB 3P6JA 4DRRA 5DZUA 4PF5A 1ULEA 3ZYPA 1MD6A 1FATA 1QXMA 5EYXA 2D6MA 1AVUA 5KXEA 4ZOTA 3CU1B 1WLCA 1MR5A 4XE9A 4LBKA 5BQMB 3VWCA 3ZXDA 4M01A 3M2MA 2WT2A 3I2AA 3H6QA 2UWAA 4YW4A 1YI7A 3OBTA 3BONA 2C9AA 2ZZJA 2G7KA 1H9WA 2DVGA 3I8TA 2H0BA 1SLIA 4XFUA 1LOCA 4DEPA 1AJOA 1NLSA 3AH2A 1V6JA 1LOEA 1DZQA 4ZA3B 2FPQA 1PUMB 1S0FA 1GSLA 1FYUA 2JE9A 3BB2A 4YM3A 2VLCA 1SLTA 3FJDA 1CR7A 1QQKA 3BOKA 1W6MA 2RQ9A 1OQLB 3VT1A 2ERFA 3D4KA 2IWTB 1AX1A 3KMVA 1N1SA 1NXD1 4WVWA 3IIRA 3WO2A 1C1LA 4FPOB 4YG6A 4U2AA 2VSAA 4X37A 4XHBA 1AX0A 1Q8PA 2ETFA 2IMBA 5BQNA 4PCRA 3O4AA 4XZPA 5G00A 4AVSA 5E24E 2E4MC 3VKLA 3M3EA 3E8LC 4I4XA 5HPZA 3IM5A 2UU8A 2KKIA 3T8SA 2W68A 4YZ2A 4YG3A 2ZHMA 3WZ1A 3QCWA 3IN9A 3IM6A 3AP5A 1HWOB 4TZDA 2ZMKA 4I4SA 5DUUA 2D43A 1ISVA 1L2HA 2ZR1B 4DCKC 1GZWB 5FRAA 3VKFC 5JMCA 4ZFUB 1AXZA 2Z42A 1X50A 2M49A 4EFPA 2PHUA 1UKGA 1GICA 1SLBA 3QIZA 3VKMA 1WW7A 1HWMB 1WBLA 2FHRA 4XTMA 2QN4A 1W6OA 2Y9GA 3AP9A 4JKXB 4OEGA 2A97A 1KRIA 3ZC9A 3SH4A 3V79C 4KTXA 1E0OA 4EB2B 3I4IA 3WDWA 1W3AA 4XJWA 1F9KA 1GNZA 3WMUA 2BFHA 3WNXA 1W6QB 4IQPA 5BP5A 1Q56A 3LTQA 4EKXB 1FNZA 5GZCA 3MW3A 4CJMA 4FQZA 2GNMA 3IAGC 5LK5A 3BRDA 4FVVA 1V6WA 4ELCA 5CAZA 4JQ0A 4EFQA 3P53A 3AFKA 4D69A 1LHWA 4OEEA 4Y1UA 3QW7A 4XXAA 4Q1RA 2WQZC 5T5PA 4YLZA 3EF2A 4Q91A 3DEBA 1QOTA 1CONA 2P37A 1IS5A 4PQ9A 2ENRA 2BQPA 3AZXA 1FV2A 1DFCA 1N1YA 5GLWA 3C8BA 3D3XA 4LO7C 3UK9A 5EYYA 3O0XA 1G82A 5KXBA 3FJKA 1S0GA 1O4ZA 1QNYA 2D3RA 5JDBA 4I2SA 4II0A 1IKQA 3FBYA 5FZYA 4DRVA 1T9FA 4J2XA 8I1BA 3W59A 3QW5A 3WO4A 2DVFA 1LEMA 5IT6A 1VAVA 1DJSB 3AXDA 1T4QA 2FFUA 1AF9A 1JYIA 3BAHA 4ISRA 1WLWA 4QKRA 2VW1A 2W2DA 1ENQA 3BIWE 4XJ8A 1ONAA 3ZURA 5JOXA 1WLDA 4Y1YA 1TWEA 3WDUA 5DZFA 1C4RA 2GN3A 3FJEA 4ZFYB 5GZEA 2DVDA 2DWRA 1BFCA 2JE7A 1ZL6A 1XTFA 1MVQA 1ENSA 3SNMA 1WBFA 4I96A 4G6JA 4YM1A 1V00A 4FPEA 3WVJA 2QYIB 4HR6C 3O4OA 3AJ6A 2I2SA 4XIKA 1DQ6A 1W0OA 5DUWA 4IZXA 4X3AA 1G9DA 2WSUA 3OPZA 2EALA 1FNYA 1JLYA 2VH9A 1JYCA 3RTIB 2ZGRA 3WOGA 4QC4A 3A0NA 3A23A 4UW5A 2ZGPA 2E4MA 3CA1A 1FV3A 1ULFA 5EG6C 4ZGRB 1IRAX 5BXTA 1CVSA 4LBOA 2ZACA 3AKIA 4ISQA 2GNTA 3VKOA 4IYBA 4KEJA 2W52A 1DYKA 2D20A 2E7QA 3FGMA 3BA4A 2EXKA 3VUOA 1MS0A 3T1LA 1IS4A 2XG3A 2WNEA 3HR9A 1VALA 3ZPYA 5GAQA 3CA4A 1G9AA 1KJLA 1TTUA 3N7LA 3OJBA 3S8KA 3SITA 3FIEA 2ZGTA 2VXTI 2PHFA 1LHOA 1N3QA 1SZ6B 4YGDA 3ZXLA 3O44A 1QDOA 3TAYA 3LLPA 3OGFA 1ZKWA 2ESUA 2W39A 3CRGA 3O12A 3FJ9A 1S0DA 3B9CA 1W0PA 3QLQA 3DGTA 2KI4A 3USUB 2D44A 3HMYA 3I29B 4XHXA 3QR5A 2ISEA 2D3SA 4I4PA 3ZSKA 1KITA 2JD4A 1QMJA 3DUIA 2ZMLA 1RG8A 2P3JA 1URXA 3WCSA 2P2KA 4NO4A 1TEIA 4YZ4A 2GMMA 3QJ0A 1CIWA 3V65A 1W6PA 1IT0A 4TLPA 3C89A 2FGFA 5CB7A 4FGFA 2UURA 1MS3A 1QOSA 3BA7A 2DREA 4C1XA 4I1BA 1G8WA 3WO3A 2KI6B 3MALA 2A7AA 2GDFA 2NVHA 4FPGA 3ZXKA 4ZLBB 1PC8B 3AZZA 2D6NA 1FWVA 1N4KA 2FDBM 1JOJA 1XZZA 1ZL5A 1ISXA 4OEFA 3IPVA 2DTYA 2R49A 1C1FA 4I4OA 3O3QA 4BMBA 4YZ3A 2JJ6A 2AR6A 2ARXA 5GLVA 5BVPI 4LBQD 3WG4A 1JY0A 1S0EA 1HCEA 1KDMA 4A7ZA 1Q8OA 1QKQA 5BQMA 3V0BA 4Q9PA 1YO8A 3BAVA 3SH3A 1MZ5A 4KEIA 1XQNA 1XYFA 2OUHA 3AZWA 3NBCA 2R1BA 2ZABA 3DS9A 2L5XA 1UL9A 2PHWA 2HWMA 2DU0A 3WHTA 5CA6A 5FNXA 1YBIA 3FJJA 3CQAA 3VV1A 1V6UA 1LHNA 3HN1A 1LULA 1GLHA 1IS3A 3FIIA 4D0ZA 4GWMA 4Q27A 3NWKA 6I1BA 2WBCA 1LOAA 4PBPA 2NP0A 1WBAA 4DFSA 3WG3A 4I7IA 3FJFA 1SLAA 1W6NA 1DZCA 3FJHA 1ULGA 3MEPA 2DUPA 1QGLA 1IRPA 1ITBA 5H9RA 5EHAA 1JT3A 1WW5A 2YZ4A 1SR4C 1BARA 3OJMA 2G7QA 2ILPA 2ET2A 1SLCA 1FMMS 4KBBA 4LBJA 2D6OX 4SLIA 3VEQA 4EL4A 5BXSA 2NM1A 1K5VA 3Q7WA 4A7KA 4AYUA 1M2TB 2LIQA 5T55A 1AXYA 4FOQA 4AGVA 2DURA 3D6EA 2D6LX 3POWA 3O0VA 4GOYA 2D24A 4USPA 1SBEA 1DQGA 1YF8B 1V6LA 1J1TA 3B3QE 3ZXEA 1JT5A 3UD8A 1DBNA 1CJPA 1GZ9A 4YFZA 3PVOA 3A07A 3RTJB 3O4BA 2F2FC 4M3CA 5DSSB 3CAHA 4RL7A 2D22A 5AVAA 4YW1A 2AUYA 4GWNA 1FQ9A 2DS0A 1WBCA 1JBCA 1GZWA 3QIYA 3FLPA 4LBQB 3AXEA 5B2HA 1TFMB 4P9YA 3AP7A 3RMYA 3W58A 5SV8A 1PWAA 1EYLA 3POSA 4XIOA 1FAYA 3AH1A 4R9AA 5EC5A 5D62A 7I1BA 1IOBA 1WW4A 4Y1VA 1V6XA 3CA3A 2ZGKA 3OY8B 2CWMA 4I3NA 2D3PA 3BX1C 1HQWA 2DUQA 2UWCA 3AK0A 2YY1A 4D0TA 1W6QA 4WV8A 4XJUA 3AP6A 1K5UA 1ZM1A 2ZGQA 2FFVA 5JOWA 3T1MA 4P6AA 1IOAA 1LOBA 1C57A 4I8MA 4TYSA 3WHUA 4LBNA 3QW6A 4PC4A 1QDCA 4FPFA 1Q1UA 1H9PA 1KNMA 2JDZA 4J2KA 4XFTA 2NMNA 1JUIA 2Z49A 2TEPA 1QNWA 2ZBJA 2VU9A 2RSTA 2E6VA 4R9BA 3NF3A 3N3HA 1LJ7A 3VT0A 5IK7A 4XMIA 4A7YA 2ZGLA 5T5OA 4YFWA 4YW5A 2Y9WC 2VY0A 5F5QA 3M3QA 4EJ5A 3AYAA 3POYA 4OWLA 4YM2A 1LCLA 3CA5A 1W6MB 3AKFA 2EXHA 1LGNA 1A78A 3WG2A 4F83A 3WG1A 1OQ1A 3AJ5A 4Z8BA 3WINC 3FUQA 3WDVA 5BXRA 3IM7A 3WMVA 4LO8B 1VCLA 2CY6A 3TB0A 3OYWB 1MS1A 1S0LA 1QU0A 3ZC8A 4I37A 2WSVA 1GYKA 2EAKA 1BZWA 1G9FA 1Q03A 4YW2A 2CTVA 2A8AA 4GP0A 1CESA 2D7FA 3MW2A 1MVEA 2F8XC 1AJKA 1JN2P 3AYCA 3CA0A 4BLJA 1Z7HA 3INAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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