The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
137
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sequence length |
299
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structure length |
298
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Chain Sequence |
PLPTGYFGIPLGLAALSLAWFHLENLFPAARMVSDVLGIVASAVWILFILMYAYKLRYYFEEVRAEYHSPVRFSFIALIPITTMLVGDILYRWNPLIAEVLIWIGTIGQLLFSTLRVSELWQGGVFEQKSTHPSFYLPAVAANFTSASLALLGYHDLGYLFFGAGMIAWIIFEPVLLQHLRISSLEPQFRATMGIVLAPAFVCVSAYLSINHGEVDTLAKILWGYGFLQLFFLLRLFPWIVEKGLNIGLWAFSFGLASMANSATAFYHGNVLQGVSIFAFVFSNVMIGLLVLMTIYKL
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Structure determination of an integral membrane protein at room temperature from crystals in situ.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Membrane protein
|
| source organism |
Haemophilus influenzae (strain atcc 51907 / dsm 11121 / kw20 / rd)
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| molecule keywords |
Tellurite resistance protein TehA homolog
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| total genus |
137
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| structure length |
298
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| sequence length |
299
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2015-02-20 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Alpha/alpha barrel | Glycosyltransferase | Glycosyltransferase |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M71 A; 3M74 A; 3M77 A; 3M7C A; 3M78 A; 3M7E A; 3M75 A; 3M72 A; 4YCR A; 3M76 A; 3M7B A; 3M73 A; 3M7L A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1RWF A; 3HXC B; 1H54 A; 3E33 B; 2R2L B; 3E30 B; 2V8J A; 2I07 B; 3ANI A; 4FUS A; 3RJ3 A; 1W6K A; 4F13 A; 3PZ3 B; 1FPP B; 4GTT B; 3EZ8 A; 3E73 A; 3G4D A; 3ACT A; 1N95 B; 1J0N A; 1TN6 B; 3T33 A; 5FOB B; 5GW7 A; 4OZV A; 2H6G B; 3KSQ B; 1GAI A; 1QQF A; 1TNB B; 4ZH1 A; 1N4Q B; 5IK0 A; 1ULV A; 5CZL A; 1G6I A; 1JCR B; 1RWG A; 1CB8 A; 1OJN A; 3M72 A; 4FJQ A; 2E24 A; 1KSD A; 1FO3 A; 4D94 A; 1XWQ A; 3Q7A B; 2GZ6 A; 3KLS A; 3QRY A; 1FT2 B; 3OED A; 1V5D A; 4OZW A; 4GTS B; 1H3B A; 4TXT A; 2F0Y B; 3K11 A; 1HZF A; 3D5S A; 3ON6 A; 3X17 A; 4AYR A; 1GAH A; 4CJ0 A; 4KKI A; 1G87 A; 4EHM B; 4Z4L A; 3S4C A; 3P5P A; 5EAU A; 5IK9 A; 1AYX A; 3AFL A; 4LNG B; 3M71 A; 3H2W A; 4ZRP A; 1GA2 A; 1O6R A; 3HXD B; 1N7O A; 1O6Q A; 4WVB A; 1DL2 A; 2YIK A; 4D4C A; 2PN5 A; 2FBA A; 5DGQ A; 5KKB A; 3RRS A; 1XW2 A; 3VW5 A; 3M01 A; 3EU8 A; 3KSL B; 2XWJ B; 1FT1 B; 3S4B A; 1WZZ A; 1LF9 A; 5ILI A; 2E22 A; 3QSP A; 5MEH A; 3D3I A; 3M77 A; 1S63 B; 1RQ5 A; 3EU5 B; 5ILY A; 2H6I B; 1N7R A; 1X1J A; 3PMM A; 3W7S A; 1RWA A; 1TNO B; 3AFJ A; 3ANJ A; 3QG0 A; 4NEI A; 2VN4 A; 4J5T A; 1IA7 A; 3QT3 A; 5IL8 A; 1V7V A; 3DSU B; 2OKX A; 3SFX B; 1LXM A; 3SDV A; 3E6U A; 3WKF A; 4WU0 A; 1HCU A; 1NXC A; 1F9O A; 1G9J A; 3VSN A; 5EAT A; 1H12 A; 1N23 A; 5IK6 A; 1HV6 A; 2RI9 A; 4ONT A; 1D8D B; 2XWB B; 1N1Z A; 4Q88 A; 1O6H A; 3QXQ A; 1QBQ B; 1WU6 A; 1H36 A; 1DCE B; 2EAB A; 1KFG A; 1SQC A; 1AGM A; 3SDR A; 1O1S B; 2WDA A; 3DSW B; 5FO8 B; 1HM3 A; 4AYQ A; 2BB6 A; 4MBG B; 2ONG A; 3CU7 A; 3W7W A; 3WKH A; 1GXM A; 3M7C A; 4LIX A; 1LD7 B; 3E34 B; 3M00 A; 2CQS A; 2AHF A; 2BRP A; 2G0D A; 1LXK A; 1F9D A; 4E1Y A; 1LOH A; 4XUV A; 1H35 A; 3LZ9 A; 4MU9 A; 2X03 A; 3HXF B; 4CE7 A; 4D4B A; 3HXB B; 5ILH A; 1HXG A; 3QXF A; 1EGU A; 1GXN A; 2D8L A; 1L2A A; 2D5J A; 1H14 A; 2BRV X; 3M02 A; 4LNB B; 3SDQ A; 3EQA A; 1TNZ B; 3HXE B; 5C05 A; 1CEM A; 3P5R A; 4WVC A; 5EAS A; 5CA3 A; 4YCR A; 3KQ4 A; 1O1R B; 2FUZ A; 1N24 A; 3DSV B; 1HN0 A; 1UG9 A; 1N20 A; 2DRR A; 1G9G A; 3RSY A; 1N1B A; 3W5N A; 1TNY B; 4DOE A; 1GHQ A; 1N4S B; 1X9D A; 2FV1 A; 3A3V A; 1LTX B; 1OJP A; 3M75 A; 5M7I A; 1FO2 A; 1FBW A; 1SA4 B; 3RX5 A; 1TNU B; 4CJ1 A; 2WY8 A; 4Z4J A; 1XWT A; 1CLC A; 1R76 A; 1HXC A; 2XQW A; 1N7N A; 3M78 A; 4YDO B; 5JMF A; 2BED B; 2EAD A; 1KKT A; 2DRQ A; 2WIN B; 3QDE A; 3VSM A; 2XFG A; 2H6F B; 4ZH5 A; 5FO9 B; 3EUV B; 1LD8 B; 4FXK B; 1I8Q A; 4DOD A; 1FCE A; 3QFY A; 1HX9 A; 5DGR A; 1C3D A; 1X81 B; 2Q1F A; 1UMP A; 5M7Y A; 1N7P A; 5CD2 A; 2BBC A; 1H3A A; 2V3P A; 1N9A B; 1H3C A; 4GTR B; 1NI1 B; 3S4A A; 1HMU A; 2A73 B; 2G02 A; 2ONH A; 4ZRQ A; 1FMI A; 2GOX A; 2F6D A; 2AFA A; 1S64 B; 1C82 A; 3GLY A; 1N4P B; 4LNV A; 2SQC A; 1TN8 B; 1VD5 A; 1RW9 A; 1V7W A; 2NOJ A; 3SFY B; 2P0V A; 1TN7 B; 1UT9 A; 2JF4 A; 2VN7 A; 2B4F A; 1KRE A; 4MMI A; 4FXG B; 3C72 B; 4AYP A; 2ZIS B; 3RX8 A; 1FBO A; 1WU5 A; 1FAE A; 3Q73 B; 1W3Y A; 2GH4 A; 1QAZ A; 3S9V A; 3REN A; 2EAE A; 1H13 A; 3Q7F B; 3H7L A; 4V1R A; 3SAE A; 5AGD A; 1D8E B; 1GXO A; 2AHG A; 3DRA B; 2DRO A; 3P2C A; 3K7X A; 3W7T A; 4V1S A; 1HMW A; 3PZ4 B; 3H3K A; 1GSZ A; 4KTR A; 5DHK A; 3Q79 B; 4GTM B; 4MMH A; 4M76 A; 1O1T B; 4GTV B; 3Q78 B; 4GTP B; 1KSC A; 4OK4 A; 5GZK A; 3RX7 A; 3E37 B; 5IKA A; 3PZ1 B; 1O79 A; 3S4D A; 3ANK A; 2BRW A; 3WIR A; 5ILD A; 1JCQ B; 1DOG A; 1O5M B; 2EAC A; 2V8I A; 2FV0 A; 2RI8 A; 4GL3 A; 3SDU A; 3PZ2 B; 5ILK A; 3W7U A; 4GAX A; 1WU4 A; 4D4A A; 2PMV A; 4ZG8 A; 4F10 A; 2WII B; 4RNQ A; 4TF4 A; 3SDT A; 4L0G A; 3QFZ A; 4OJZ A; 3QT9 A; 2H6H B; 4KTP A; 1N94 B; 2WCO A; 4L6X A; 4C1S A; 1LF6 A; 5JMD A; 2DRS A; 2JJB A; 1F1S A; 1N7Q A; 3ACS A; 2FUQ A; 5JPM B; 5ILJ A; 2JG0 A; 3W7X A; 4D4D A; 3A0O A; 1OJM A; 1N21 A; 4YDE B; 3DPY B; 4Q2B A; 1N4R B; 4BOJ A; 3TF4 A; 1IA6 A; 4WVA A; 1HM2 A; 1KWF A; 5GY3 A; 5DHI A; 4EL8 A; 2ZIR B; 4JJJ A; 5E2J A; 3CIH A; 3DSX B; 3G4F A; 4KKJ A; 2ZZR A; 3NNB A; 1MZC B; 3OXU A; 1K72 A; 3WIW A; 3E80 A; 1N22 A; 1V7X A; 4GTO B; 3DSS B; 1RWH A; 1KS8 A; 3D5R A; 1KRF A; 1J0M A; 4BOK A; 2V8K A; 3N0G A; 1SA5 B; 3GT5 A; 2BB5 A; 2Z07 A; 3E7J A; 4DI5 A; 1GLM A; 1QSJ A; 4AYO A; 3M74 A; 1H37 A; 1X1I A; 1FP3 A; 3QPF A; 5IKH A; 1NL4 B; 1TF4 A; 2ZBL A; 3WKG A; 2RGK A; 1KZP B; 2WYN A; 5FO7 B; 2WY7 A; 1JCS B; 3PYB A; 3WKI A; 1NC5 A; 4OK2 A; 5IL3 A; 5IM1 A; 2A8Z A; 3NFV A; 3M7E A; 2NVP A; 1RWC A; 3SQC A; 5JPN B; 3WC3 A; 3GZK A; 3WUX A; 3N0F A; 3WIQ A; 3G6J B; 4GTQ B; 1W6J A; 1KZO B; 2B39 A; 3M76 A; 4L9P B; 2V3N A; 3QWT A; 2IEJ B; 1IS9 A; 1OJO A; 3M73 A; 3W5M A; 2CQT A; 3DST B; 2QNO A; 2FUT A; 3M7B A; 5ILZ A; 1X1H A; 1HXA A; 1JS4 A; 3VXD A; 2J5C A; 4QT9 A; 3E32 B; 3M7L A; 3Q75 B; 1L1Y A; 4FNV A; 1V5C A; 3PYA A; 1H39 A; 1F9G A; #chains in the Genus database with same CATH homology 3HXC B; 1H54 A; 3E33 B; 2R2L B; 3E30 B; 2V8J A; 2I07 B; 3ANI A; 4FUS A; 3RJ3 A; 1W6K A; 3PZ3 B; 1FPP B; 4GTT B; 3EZ8 A; 3E73 A; 3ACT A; 1N95 B; 1TN6 B; 3T33 A; 5FOB B; 5GW7 A; 2H6G B; 3KSQ B; 1GAI A; 1QQF A; 1TNB B; 4ZH1 A; 1N4Q B; 1ULV A; 5CZL A; 1G6I A; 1JCR B; 3M72 A; 1KSD A; 1FO3 A; 4D94 A; 1XWQ A; 3Q7A B; 2GZ6 A; 3KLS A; 3QRY A; 1FT2 B; 3OED A; 1V5D A; 4GTS B; 1H3B A; 4TXT A; 2F0Y B; 3K11 A; 1HZF A; 3D5S A; 3ON6 A; 3X17 A; 4AYR A; 1GAH A; 4CJ0 A; 4KKI A; 1G87 A; 4EHM B; 4Z4L A; 3S4C A; 3P5P A; 1AYX A; 4LNG B; 3M71 A; 3H2W A; 4ZRP A; 1GA2 A; 1O6R A; 3HXD B; 1O6Q A; 4WVB A; 1DL2 A; 2YIK A; 4D4C A; 2PN5 A; 2FBA A; 5DGQ A; 5KKB A; 3RRS A; 1XW2 A; 3VW5 A; 3EU8 A; 3KSL B; 2XWJ B; 1FT1 B; 3S4B A; 1WZZ A; 1LF9 A; 3QSP A; 5MEH A; 3D3I A; 3M77 A; 1S63 B; 1RQ5 A; 3EU5 B; 2H6I B; 3PMM A; 3W7S A; 1TNO B; 3AFJ A; 3ANJ A; 3QG0 A; 2VN4 A; 4J5T A; 1IA7 A; 3QT3 A; 1V7V A; 3DSU B; 2OKX A; 3SFX B; 3SDV A; 3E6U A; 3WKF A; 4WU0 A; 1HCU A; 1NXC A; 1F9O A; 1G9J A; 1H12 A; 2RI9 A; 4ONT A; 1D8D B; 2XWB B; 4Q88 A; 1O6H A; 3QXQ A; 1QBQ B; 1WU6 A; 1H36 A; 1DCE B; 2EAB A; 1KFG A; 1SQC A; 1AGM A; 3SDR A; 1O1S B; 3DSW B; 5FO8 B; 4AYQ A; 2BB6 A; 4MBG B; 3CU7 A; 3W7W A; 3WKH A; 1GXM A; 3M7C A; 4LIX A; 1LD7 B; 3E34 B; 2CQS A; 2AHF A; 2G0D A; 1F9D A; 4XUV A; 1H35 A; 4MU9 A; 3HXF B; 4CE7 A; 4D4B A; 3HXB B; 3QXF A; 1GXN A; 2D8L A; 1L2A A; 2D5J A; 1H14 A; 4LNB B; 3SDQ A; 3EQA A; 1TNZ B; 3HXE B; 1CEM A; 3P5R A; 4WVC A; 5CA3 A; 4YCR A; 3KQ4 A; 1O1R B; 2FUZ A; 3DSV B; 1UG9 A; 2DRR A; 1G9G A; 3RSY A; 3W5N A; 1TNY B; 4DOE A; 1GHQ A; 1N4S B; 1X9D A; 2FV1 A; 3A3V A; 1LTX B; 3M75 A; 5M7I A; 1FO2 A; 1FBW A; 1SA4 B; 3RX5 A; 1TNU B; 4CJ1 A; 2WY8 A; 4Z4J A; 1XWT A; 1CLC A; 1R76 A; 2XQW A; 3M78 A; 4YDO B; 2BED B; 2EAD A; 1KKT A; 2DRQ A; 2WIN B; 3QDE A; 2XFG A; 2H6F B; 4ZH5 A; 5FO9 B; 3EUV B; 1LD8 B; 4FXK B; 4DOD A; 1FCE A; 3QFY A; 5DGR A; 1C3D A; 1X81 B; 1UMP A; 5M7Y A; 5CD2 A; 2BBC A; 1H3A A; 2V3P A; 1N9A B; 1H3C A; 4GTR B; 1NI1 B; 3S4A A; 2A73 B; 2G02 A; 4ZRQ A; 1FMI A; 2GOX A; 2F6D A; 2AFA A; 1S64 B; 3GLY A; 1N4P B; 4LNV A; 2SQC A; 1TN8 B; 1VD5 A; 1V7W A; 2NOJ A; 3SFY B; 2P0V A; 1TN7 B; 1UT9 A; 2JF4 A; 2VN7 A; 2B4F A; 1KRE A; 4FXG B; 3C72 B; 4AYP A; 2ZIS B; 3RX8 A; 1FBO A; 1WU5 A; 1FAE A; 3Q73 B; 2GH4 A; 3S9V A; 3REN A; 2EAE A; 1H13 A; 3Q7F B; 3H7L A; 4V1R A; 3SAE A; 5AGD A; 1D8E B; 1GXO A; 2AHG A; 3DRA B; 2DRO A; 3P2C A; 3K7X A; 3W7T A; 4V1S A; 3PZ4 B; 3H3K A; 1GSZ A; 4KTR A; 3Q79 B; 4GTM B; 4M76 A; 1O1T B; 4GTV B; 3Q78 B; 4GTP B; 1KSC A; 5GZK A; 3RX7 A; 3E37 B; 3PZ1 B; 1O79 A; 3S4D A; 3ANK A; 3WIR A; 1JCQ B; 1DOG A; 1O5M B; 2EAC A; 2V8I A; 2FV0 A; 2RI8 A; 4GL3 A; 3SDU A; 3PZ2 B; 3W7U A; 1WU4 A; 4D4A A; 2PMV A; 4ZG8 A; 2WII B; 4TF4 A; 3SDT A; 4L0G A; 3QFZ A; 3QT9 A; 2H6H B; 4KTP A; 1N94 B; 4L6X A; 4C1S A; 1LF6 A; 2DRS A; 2JJB A; 3ACS A; 5JPM B; 2JG0 A; 3W7X A; 4D4D A; 4YDE B; 3DPY B; 4Q2B A; 1N4R B; 4BOJ A; 3TF4 A; 1IA6 A; 4WVA A; 1KWF A; 5GY3 A; 4EL8 A; 2ZIR B; 4JJJ A; 5E2J A; 3CIH A; 3DSX B; 4KKJ A; 2ZZR A; 1MZC B; 3OXU A; 1K72 A; 3WIW A; 1V7X A; 4GTO B; 3DSS B; 1KS8 A; 3D5R A; 1KRF A; 4BOK A; 2V8K A; 1SA5 B; 3GT5 A; 2BB5 A; 2Z07 A; 1GLM A; 1QSJ A; 4AYO A; 3M74 A; 1H37 A; 1FP3 A; 3QPF A; 1NL4 B; 1TF4 A; 2ZBL A; 3WKG A; 2RGK A; 1KZP B; 2WYN A; 5FO7 B; 2WY7 A; 1JCS B; 3PYB A; 3WKI A; 1NC5 A; 2A8Z A; 3M7E A; 2NVP A; 3SQC A; 5JPN B; 3WC3 A; 3GZK A; 3WUX A; 3WIQ A; 3G6J B; 4GTQ B; 1W6J A; 1KZO B; 2B39 A; 3M76 A; 4L9P B; 2V3N A; 3QWT A; 2IEJ B; 1IS9 A; 3M73 A; 3W5M A; 2CQT A; 3DST B; 2QNO A; 3M7B A; 1JS4 A; 3VXD A; 4QT9 A; 3E32 B; 3M7L A; 3Q75 B; 1L1Y A; 1V5C A; 3PYA A; 1H39 A;
#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait... #similar chains, but unknotted ...loading similar chains, please wait... #similar chains in the pdb database (?% sequence similarity) ...loading similar chains, please wait...
