The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
91
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sequence length |
249
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structure length |
249
|
Chain Sequence |
LATPFQEYSQKYENIRLERDGGVLLVTVHTEGKSLVWTSTAHDELAYCFHDIACDRENKVVILTGTGPSFCNEIDFTSFNLGTPHDWDEIIFEGQRLLNNLLSIEVPVIAAVNGPVTNHPEIPVMSDIVLAAESATFQDGPHFPSGIVPGDGAHVVWPHVLGSNRGRYFLLTGQELDARTALDYGAVNEVLSEQELLPRAWELARGIAEKPLLARRYARKVLTRQLRRVMEADLSLGLAHEALAAIDLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase
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| molecule keywords |
6-OXO CAMPHOR HYDROLASE
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| publication title |
The 2 a Crystal Structure of 6-Oxo Camphor Hydrolase: New Structural Diversity in the Crotonase Superfamily
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Rhodococcus erythropolis
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| total genus |
91
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| structure length |
249
|
| sequence length |
249
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| chains with identical sequence |
B, C, D, E, F
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| ec nomenclature |
ec
3.7.1.18: 6-oxocamphor hydrolase. |
| pdb deposition date | 2002-12-04 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00378 | ECH_1 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2F6I A; 2F9I A; 3FDU A; 1N6D A; 4JYJ A; 4JVT A; 1TG6 A; 3PGQ A; 3U9R B; 3H02 A; 4U18 A; 2CE3 A; 5CTB A; 3R9T A; 5DZK A; 4YLH A; 3T88 A; 3RSI A; 5DTP A; 4KD6 A; 4QFE A; 2Q2X A; 3ZWC A; 3Q1T A; 3H0Q A; 5G1Q A; 2J5I A; 2CBY A; 4FNB A; 3OME A; 3MFM A; 3MOY A; 4WYO B; 3T8B A; 3TLF A; 5INI A; 3TV5 A; 2C8T A; 3OC7 A; 1EF8 A; 3Q7H A; 4JYL A; 5DU6 A; 1SG4 A; 1FC7 A; 3H0S A; 4JFC A; 3OT6 A; 3H0J A; 4L8K A; 1O8U A; 5G1R A; 3T8A A; 1YG6 A; 5DZK H; 5KJP A; 3GLM A; 4IZD A; 4QIJ A; 4FB8 A; 3U9S B; 4Q0G A; 3R9Q A; 4FN7 A; 5FIF A; 3DJA A; 3GF3 A; 4ZU2 A; 3K8X A; 1Q51 A; 5DU4 A; 3STA A; 4HNK A; 4U0H A; 3RRV A; 4B3H A; 3R6H A; 2UZF A; 2FZS A; 4ZDE A; 3HIN A; 1WDM A; 4U1A A; 1Y7O A; 2ZL0 A; 2FBM A; 4I4Z A; 5G1S A; 4ZDC A; 2VRE A; 2EJ5 A; 3TT6 A; 3QXZ A; 3ZWB A; 1J7X A; 4OG1 A; 1FCF A; 4JWV A; 2X58 A; 1UYV A; 4RYF A; 1WDK A; 1UIY A; 2A81 A; 4JCR A; 1JXZ A; 4JCS A; 1XNV A; 4OMR A; 2VSS F; 4L6W A; 3IAV A; 4QII A; 3MYB A; 2PG8 A; 4U19 A; 3ZWA A; 3ISA A; 4KWB A; 2Q35 A; 1HZD A; 1HNU A; 4WCZ A; 2J5G A; 4G2R A; 1UYR A; 2Q34 A; 1NZY B; 3IB9 A; 1K32 A; 3GMA A; 4ZDF A; 3G64 A; 2J5S A; 4EML A; 2A7S A; 4B3J A; 2J5I B; 2ZQR A; 4K29 A; 5KDR A; 5INF A; 4B3I A; 4RYF H; 2VSU C; 2VSU E; 1HNO A; 4WZ8 B; 2A7K A; 2PBP A; 4FJW D; 3GKB A; 3Q0G A; 3PEA A; 5DU8 A; 3HRX A; 1WDL A; 3BPP A; 3H81 A; 2DUB A; 2ZL2 A; 5E0S A; 2W3P A; 3HP0 A; 5C9G A; 3KTJ A; 4Q1I A; 4ASI A; 2X24 A; 3QYR A; 4JSB A; 3P85 A; 3NJD A; 5E0N X; 2IEX A; 4GM2 A; 4JJT A; 2FW2 A; 4ELS A; 3GF7 A; 1DCI A; 2HW5 A; 2F9Y A; 1W2X A; 2VSU A; 3T3W A; 1RJN A; 5DTW A; 3KTI A; 4MXI A; 4LK5 A; 4OLQ A; 3TRR A; 3PE8 A; 4JCQ A; 1FC6 A; 1K39 A; 4KNP A; 1OD4 A; 3HLN 1; 4I42 A; 3IBB A; 2D3T A; 3QXI A; 1SZO A; 5E0S H; 1WZ8 A; 4U0G A; 3QK8 A; 3KTH A; 1XNW A; 4RCN A; 4EMP A; 2NP9 A; 3L3S A; 3LKE A; 2F9I B; 4ELW A; 4F47 A; 4K2N A; 3JU1 A; 4ZDB A; 3TVW A; 4Z0M A; 3N6R B; 3HE2 A; 3M6N A; 4MI2 A; 3QKA A; 1FC9 A; 1YG8 A; 3U9T B; 5ING A; 1PJH A; 3V5E A; 4NEK A; 3T89 A; 3R9S A; 3NJB A; 1EY3 A; 3TVU A; 1PIX A; 4U0G H; 5CTC A; 4JOT A; 4NNQ A; 2WTB A; 3V5I A; 2PPY A; 3KTK A; 3LAO A; 2DEO A; 2J5I I; 3Q0J A; 2BZR A; 2F6Q A; 4JCT A; 1ON3 A; 3TZ3 A; 4DI1 A; 5DL1 A; 4IZC A; 4FZW A; 5DUC A; 3R0O A; 3QWD A; 3K50 A; 5DKP A; 4I52 A; 1NZY A; 2F9Y B; 3QRE A; 3ZW9 A; 4KPK A; 1TYF A; 3ZW8 A; 4GHN A; 3FF6 A; 3MT6 A; 3SLL A; 3SWX A; 4EMM A; 5JBX A; 1Q52 A; 3QMJ A; 1N6F A; 4ZDD A; 1XX4 A; 3TDC A; 4HC8 A; 3PZK A; 5JBW A; 5IKL B; 1X0U A; 1UYT A; 3RST A; 3TT7 A; 3WG5 A; 2GTR A; 2VSU F; 4ELX A; 4FN8 A; 1ON9 A; 2VSS E; 4MOU A; 3KQF A; 3VIV A; 4FND A; 2VX2 A; 5MGB A; 1MJ3 A; 1OD2 A; 3P5M A; 1RJM A; 3P2L A; 4IZB A; 4K3W A; 1XNY A; 3I47 A; 2ZL4 A; 5FUS A; 3M6M A; 3DOR A; 2QQ3 A; 3ST9 A; 3BEZ A; 1DUB A; 1XO6 A; 3H0U A; 3KTG A; 1EF9 A; 2ZL3 A; 2VSS A; 3BF0 A; 4FZW C; 5C90 A; 5KDR B; 2J5G D; 1VRG A; 5DUF A; 2ZQQ A; 1UYS A; 1N6E A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2F6I A; 2F9I A; 3FDU A; 1N6D A; 4JYJ A; 4JVT A; 1TG6 A; 3PGQ A; 3U9R B; 3H02 A; 4U18 A; 2CE3 A; 5CTB A; 3R9T A; 5DZK A; 4YLH A; 3T88 A; 3RSI A; 5DTP A; 4KD6 A; 4QFE A; 2Q2X A; 3ZWC A; 3Q1T A; 3H0Q A; 5G1Q A; 2J5I A; 2CBY A; 4FNB A; 3OME A; 3MFM A; 3MOY A; 4WYO B; 3T8B A; 3TLF A; 5INI A; 3TV5 A; 2C8T A; 3OC7 A; 1EF8 A; 3Q7H A; 4JYL A; 5DU6 A; 1SG4 A; 1FC7 A; 3H0S A; 4JFC A; 3OT6 A; 3H0J A; 4L8K A; 1O8U A; 5G1R A; 3T8A A; 1YG6 A; 5DZK H; 5KJP A; 3GLM A; 4IZD A; 4QIJ A; 4FB8 A; 3U9S B; 4Q0G A; 3R9Q A; 4FN7 A; 5FIF A; 3DJA A; 3GF3 A; 4ZU2 A; 3K8X A; 1Q51 A; 5DU4 A; 3STA A; 4HNK A; 4U0H A; 3RRV A; 4B3H A; 3R6H A; 2UZF A; 2FZS A; 4ZDE A; 3HIN A; 1WDM A; 4U1A A; 1Y7O A; 2ZL0 A; 2FBM A; 4I4Z A; 5G1S A; 4ZDC A; 2VRE A; 2EJ5 A; 3TT6 A; 3QXZ A; 3ZWB A; 1J7X A; 4OG1 A; 1FCF A; 4JWV A; 2X58 A; 1UYV A; 4RYF A; 1WDK A; 1UIY A; 2A81 A; 4JCR A; 1JXZ A; 4JCS A; 1XNV A; 4OMR A; 2VSS F; 4L6W A; 3IAV A; 4QII A; 3MYB A; 2PG8 A; 4U19 A; 3ZWA A; 3ISA A; 4KWB A; 2Q35 A; 1HZD A; 1HNU A; 4WCZ A; 2J5G A; 2YJG A; 4G2R A; 1UYR A; 2Q34 A; 1NZY B; 3IB9 A; 1K32 A; 3GMA A; 4ZDF A; 3G64 A; 2J5S A; 4EML A; 2A7S A; 4B3J A; 2J5I B; 2ZQR A; 4K29 A; 5KDR A; 5INF A; 4B3I A; 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1EF8 A; 3Q7H A; 4JYL A; 5DU6 A; 1SG4 A; 1FC7 A; 3H0S A; 4JFC A; 3OT6 A; 3H0J A; 4L8K A; 1O8U A; 5G1R A; 3T8A A; 1YG6 A; 5DZK H; 5KJP A; 3GLM A; 4IZD A; 4QIJ A; 4FB8 A; 3U9S B; 4Q0G A; 3R9Q A; 4FN7 A; 5FIF A; 3DJA A; 3GF3 A; 4ZU2 A; 3K8X A; 1Q51 A; 5DU4 A; 3STA A; 4HNK A; 4U0H A; 3RRV A; 4B3H A; 3R6H A; 2UZF A; 2FZS A; 4ZDE A; 3HIN A; 1WDM A; 4U1A A; 1Y7O A; 2ZL0 A; 2FBM A; 4I4Z A; 5G1S A; 4ZDC A; 2VRE A; 2EJ5 A; 3TT6 A; 3QXZ A; 3ZWB A; 1J7X A; 4OG1 A; 1FCF A; 4JWV A; 2X58 A; 1UYV A; 4RYF A; 1WDK A; 1UIY A; 2A81 A; 4JCR A; 1JXZ A; 4JCS A; 1XNV A; 4OMR A; 2VSS F; 4L6W A; 3IAV A; 4QII A; 3MYB A; 2PG8 A; 4U19 A; 3ZWA A; 3ISA A; 4KWB A; 2Q35 A; 1HZD A; 1HNU A; 4WCZ A; 2J5G A; 2YJG A; 4G2R A; 1UYR A; 2Q34 A; 1NZY B; 3IB9 A; 1K32 A; 3GMA A; 4ZDF A; 3G64 A; 2J5S A; 4EML A; 2A7S A; 4B3J A; 2J5I B; 2ZQR A; 4K29 A; 5KDR A; 5INF A; 4B3I A; 4RYF H; 2VSU C; 2VSU E; 1HNO A; 4WZ8 B; 2A7K A; 2PBP A; 4FJW D; 3GKB A; 3Q0G A; 3PEA A; 5DU8 A; 3HRX A; 1WDL A; 3BPP A; 3H81 A; 2DUB A; 2ZL2 A; 5E0S A; 2W3P A; 3HP0 A; 5C9G A; 3KTJ A; 4Q1I A; 4ASI A; 2X24 A; 4J2U A; 3QYR A; 4JSB A; 3P85 A; 3NJD A; 5E0N X; 2IEX A; 4GM2 A; 4JJT A; 2FW2 A; 4ELS A; 3GF7 A; 1DCI A; 2HW5 A; 2F9Y A; 1W2X A; 2VSU A; 3T3W A; 3BPT A; 1RJN A; 5DTW A; 3KTI A; 4MXI A; 4LK5 A; 4OLQ A; 3TRR A; 3PE8 A; 4JCQ A; 1FC6 A; 1K39 A; 4KNP A; 1OD4 A; 3HLN 1; 4I42 A; 3IBB A; 5HUQ A; 2D3T A; 3QXI A; 1SZO A; 5E0S H; 1WZ8 A; 4U0G A; 3QK8 A; 3KTH A; 1XNW A; 4RCN A; 4EMP A; 2NP9 A; 3L3S A; 3LKE A; 2F9I B; 4ELW A; 4F47 A; 4K2N A; 3JU1 A; 4ZDB A; 3TVW A; 4Z0M A; 3N6R B; 3HE2 A; 3M6N A; 4MI2 A; 3QKA A; 1FC9 A; 1YG8 A; 3U9T B; 5ING A; 1PJH A; 3V5E A; 4NEK A; 3T89 A; 3R9S A; 3NJB A; 1EY3 A; 3TVU A; 1PIX A; 4U0G H; 5CTC A; 4JOT A; 4NNQ A; 2WTB A; 3V5I A; 2PPY A; 3KTK A; 3LAO A; 2DEO A; 2J5I I; 3Q0J A; 2BZR A; 2F6Q A; 4JCT A; 1ON3 A; 3TZ3 A; 4DI1 A; 5DL1 A; 4IZC A; 4FZW A; 5DUC A; 3R0O A; 3QWD A; 3K50 A; 5DKP A; 4I52 A; 1NZY A; 2F9Y B; 3QRE A; 3ZW9 A; 4KPK A; 1TYF A; 3ZW8 A; 4GHN A; 3FF6 A; 3MT6 A; 4NAR A; 3SLL A; 3SWX A; 4EMM A; 5JBX A; 1Q52 A; 3QMJ A; 1N6F A; 4ZDD A; 1XX4 A; 3TDC A; 4HC8 A; 3PZK A; 5JBW A; 5IKL B; 1X0U A; 1UYT A; 3RST A; 3TT7 A; 3WG5 A; 2GTR A; 2VSU F; 4ELX A; 4FN8 A; 1ON9 A; 2VSS E; 4MOU A; 3KQF A; 3VIV A; 4FND A; 4HDT A; 2VX2 A; 5MGB A; 1MJ3 A; 1OD2 A; 3P5M A; 1RJM A; 3P2L A; 4IZB A; 4K3W A; 1XNY A; 3I47 A; 2ZL4 A; 5FUS A; 3M6M A; 3DOR A; 2QQ3 A; 3ST9 A; 3BEZ A; 1DUB A; 1XO6 A; 3H0U A; 3KTG A; 1EF9 A; 2ZL3 A; 2VSS A; 3BF0 A; 4FZW C; 5C90 A; 5KDR B; 2J5G D; 1VRG A; 5DUF A; 2ZQQ A; 1UYS A; 1N6E A;
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