The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
84
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sequence length |
259
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structure length |
254
|
Chain Sequence |
FQSMADIDFRIEGHVAHVRLNRPQGLNAITQEMDDLLLDAWTEVNANSDIWAVVLSAEGEKAFCIGADVRKTRMALGGGLTGIGGPLVTCKKPMVAAVQGFCVGGGFELAMCADIIVAADTAQFGLPETKVGIIGECGVVHRAMRQLPYHIALQLILTGERIKADEARHYGLVNEVVPFAELEEAALRWASKLNAASPLAVQAAKAAALGRLGHPLEVALMTRFEPIEEYAATEDKKEGERAAGERRKPVWTGK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal Structure of putative short chain enoyl-CoA hydratase from Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444
rcsb |
| molecule tags |
Lyase
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| source organism |
Novosphingobium aromaticivorans
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| molecule keywords |
Short chain enoyl-CoA hydratase
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| total genus |
84
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| structure length |
254
|
| sequence length |
259
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
4.2.1.17: Enoyl-CoA hydratase. |
| pdb deposition date | 2013-03-27 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00378 | ECH_1 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Lyase 2-enoyl-coa Hydratase; Chain A, domain 2 | Lyase 2-enoyl-coa Hydratase, Chain A, domain 2 | ||
| Alpha Beta | Alpha-Beta Complex | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 | 2-enoyl-CoA Hydratase; Chain A, domain 1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXZ A; 4HC8 A; 5DU4 A; 3TT7 A; 3H0J A; 2ZL3 A; 3ZW8 A; 2UZF A; 5C9G A; 5DU8 A; 5MGB A; 5DUF A; 3MOY A; 3PGQ A; 2F9I B; 4ZU2 A; 1UYS A; 2WTB A; 4EMM A; 3BEZ A; 1WDM A; 4JVT A; 2D3T A; 3ZWA A; 3K8X A; 4ELW A; 4KD6 A; 2VSU A; 3TRR A; 2Q35 A; 3TV5 A; 3TZ3 A; 1WZ8 A; 4JWV A; 5DU6 A; 3L3S A; 5ING A; 2J5I A; 5JBW A; 4F47 A; 4K2N A; 3KTJ A; 4JYJ A; 3T89 A; 5E0S H; 5JBX A; 2CE3 A; 3STA A; 2QQ3 A; 3IBB A; 4QIJ A; 3V5I A; 5FUS A; 4K29 A; 4I42 A; 1TG6 A; 2FZS A; 3R9T A; 3MT6 A; 4JSB A; 4OLQ A; 4YLH A; 4U0G H; 4FZW A; 2X58 A; 4WCZ A; 1WDL A; 2Q34 A; 3PEA A; 3TVW A; 5G1Q A; 1K39 A; 3FDU A; 2ZQR A; 2VX2 A; 1TYF A; 1RJM A; 4K3W A; 4ZDD A; 3Q0G A; 3DOR A; 2J5I I; 3RRV A; 2ZL4 A; 3U9S B; 3IB9 A; 2F9Y A; 3T88 A; 1ON9 A; 1EY3 A; 1K32 A; 2VRE A; 2FBM A; 3G64 A; 2J5G D; 1OD2 A; 1Q52 A; 1X0U A; 2ZQQ A; 4QII A; 2IEX A; 1HNO A; 1SG4 A; 3N6R B; 4U0H A; 1UYR A; 3ZWB A; 4JYL A; 4MI2 A; 2C8T A; 4L6W A; 3HIN A; 3ISA A; 3U9R B; 3PE8 A; 1XNV A; 3P2L A; 2W3P A; 4QFE A; 3I47 A; 2PG8 A; 4KPK A; 1YG8 A; 3TLF A; 2EJ5 A; 3DJA A; 3R0O A; 4JCS A; 2DUB A; 3TT6 A; 3OC7 A; 4Z0M A; 2GTR A; 4FJW D; 1WDK A; 3M6N A; 4KWB A; 3LKE A; 1MJ3 A; 4B3H A; 3JU1 A; 4JFC A; 1N6D A; 3RSI A; 4FN8 A; 1Y7O A; 3FF6 A; 3SLL A; 4ELX A; 4DI1 A; 2VSS F; 3M6M A; 4FNB A; 4IZB A; 1FCF A; 1EF9 A; 4ZDF A; 3R9Q A; 3HLN 1; 1XNW A; 4FN7 A; 5DUC A; 4EMP A; 3SWX A; 2A81 A; 3GF3 A; 4LK5 A; 4RCN A; 5E0N X; 3LAO A; 3ST9 A; 3R6H A; 2CBY A; 4L8K A; 3H0S A; 4OG1 A; 3GMA A; 1FC6 A; 3OT6 A; 5INF A; 4EML A; 4ZDB A; 3WG5 A; 3HP0 A; 1YG6 A; 1ON3 A; 2J5I B; 4JOT A; 2ZL2 A; 2X24 A; 2VSU E; 4JJT A; 5DKP A; 4B3J A; 2NP9 A; 1Q51 A; 4IZD A; 3BF0 A; 3QXI A; 4WYO B; 1NZY A; 5CTC A; 3BPP A; 4MOU A; 1J7X A; 4ZDE A; 2J5S A; 1XNY A; 4NEK A; 3QK8 A; 3RST A; 3P85 A; 4IZC A; 2DEO A; 2F6I A; 3HE2 A; 4ELS A; 5KDR A; 3NJD A; 1O8U A; 5G1S A; 2HW5 A; 2Q2X A; 3QWD A; 5DTW A; 2A7K A; 4RYF A; 3H81 A; 3VIV A; 3MFM A; 2F9Y B; 2FW2 A; 4OMR A; 3KTI A; 5FIF A; 1N6E A; 2F9I A; 1EF8 A; 4Q0G A; 4FB8 A; 3MYB A; 4I4Z A; 3R9S A; 3U9T B; 1UYT A; 5IKL B; 1HNU A; 3QMJ A; 3HRX A; 4GHN A; 4NNQ A; 5DZK A; 3V5E A; 4JCR A; 2ZL0 A; 3QRE A; 4U1A A; 4U19 A; 2VSS A; 2VSU F; 1RJN A; 3NJB A; 3K50 A; 3T8B A; 2VSU C; 1PJH A; 1VRG A; 1HZD A; 5INI A; 3H0Q A; 2PBP A; 4WZ8 B; 4U18 A; 1FC9 A; 1SZO A; 3GLM A; 1PIX A; 4Q1I A; 5DL1 A; 4ASI A; 3GF7 A; 2PPY A; 3T3W A; 1OD4 A; 5C90 A; 1DCI A; 1XX4 A; 1W2X A; 4JCT A; 3Q0J A; 4RYF H; 4JCQ A; 3KTH A; 5CTB A; 3ZW9 A; 3T8A A; 3H02 A; 2BZR A; 4MXI A; 3Q1T A; 2J5G A; 2A7S A; 3P5M A; 4FZW C; 2VSS E; 3KTG A; 4I52 A; 3GKB A; 3QKA A; 5G1R A; 3OME A; 3TDC A; 1UYV A; 1FC7 A; 4GM2 A; 3QYR A; 4ZDC A; 3TVU A; 3KQF A; 4FND A; 3IAV A; 3KTK A; 2F6Q A; 5DZK H; 4HNK A; 5E0S A; 1NZY B; 4G2R A; 3H0U A; 3PZK A; 1N6F A; 1UIY A; 3Q7H A; 4U0G A; 1XO6 A; 4B3I A; 3ZWC A; 5KDR B; 1DUB A; 5KJP A; 4KNP A; 3QXZ A; 5DTP A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JXZ A; 4HC8 A; 5DU4 A; 3TT7 A; 3H0J A; 2ZL3 A; 3ZW8 A; 2UZF A; 3IRB A; 5C9G A; 5DU8 A; 2P63 A; 5MGB A; 5DUF A; 2YJG A; 3MOY A; 3PGQ A; 2F9I B; 4ZU2 A; 1UYS A; 2WTB A; 4EMM A; 3BEZ A; 1WDM A; 4JVT A; 2D3T A; 3ZWA A; 3K8X A; 4ELW A; 4KD6 A; 2VSU A; 3TRR A; 2Q35 A; 3TV5 A; 3TZ3 A; 1WZ8 A; 4JWV A; 5DU6 A; 3L3S A; 5ING A; 2J5I A; 3BPT A; 5JBW A; 4F47 A; 4K2N A; 3KTJ A; 4JYJ A; 3T89 A; 5E0S H; 5JBX A; 2CE3 A; 3STA A; 2QQ3 A; 3IBB A; 4QIJ A; 3V5I A; 5FUS A; 4K29 A; 4I42 A; 1TG6 A; 2FZS A; 3R9T A; 3MT6 A; 4JSB A; 4OLQ A; 4YLH A; 4U0G H; 4FZW A; 2X58 A; 4WCZ A; 1WDL A; 2Q34 A; 3PEA A; 3TVW A; 5G1Q A; 3ADC A; 3FDU A; 2ZQR A; 2VX2 A; 1K39 A; 1TYF A; 1RJM A; 4K3W A; 4ZDD A; 3Q0G A; 3DOR A; 2J5I I; 3RRV A; 2ZL4 A; 3U9S B; 3IB9 A; 2F9Y A; 3T88 A; 1ON9 A; 1EY3 A; 1K32 A; 3RQG A; 2VRE A; 2FBM A; 3G64 A; 2J5G D; 1OD2 A; 1X0U A; 1Q52 A; 2ZQQ A; 4QII A; 2IEX A; 1HNO A; 1SG4 A; 3N6R B; 4U0H A; 1UYR A; 3ZWB A; 4JYL A; 4MI2 A; 2C8T A; 4L6W A; 3HIN A; 3ISA A; 3U9R B; 3PE8 A; 1XNV A; 3P2L A; 2W3P A; 4QFE A; 3I47 A; 2PG8 A; 4KPK A; 1YG8 A; 3TLF A; 2EJ5 A; 3DJA A; 3R0O A; 4JCS A; 2DUB A; 3TT6 A; 3OC7 A; 3RQF A; 4Z0M A; 2GTR A; 4FJW D; 1WDK A; 3M6N A; 3L8I A; 4KWB A; 3LKE A; 1MJ3 A; 4B3H A; 3JU1 A; 4JFC A; 1N6D A; 3RSI A; 4FN8 A; 1Y7O A; 3FF6 A; 3SLL A; 4ELX A; 4DI1 A; 3W8H B; 2VSS F; 3M6M A; 4FNB A; 4IZB A; 1FCF A; 1EF9 A; 4ZDF A; 3R9Q A; 3HLN 1; 1XNW A; 4FN7 A; 5DUC A; 4EMP A; 3SWX A; 2A81 A; 3GF3 A; 4LK5 A; 4RCN A; 5E0N X; 3RQE A; 3LAO A; 3ST9 A; 3R6H A; 2CBY A; 4L8K A; 3H0S A; 4OG1 A; 3GMA A; 1FC6 A; 4NAR A; 3OT6 A; 5INF A; 4EML A; 4ZDB A; 3W8I B; 3WG5 A; 3HP0 A; 4J2U A; 1YG6 A; 1ON3 A; 2J5I B; 4JOT A; 2ZL2 A; 2X24 A; 2VSU E; 4JJT A; 5DKP A; 4B3J A; 2NP9 A; 1Q51 A; 4IZD A; 3BF0 A; 3QXI A; 4WYO B; 1NZY A; 5CTC A; 3BPP A; 4MOU A; 1J7X A; 4ZDE A; 2J5S A; 3AM1 A; 1XNY A; 4NEK A; 3QK8 A; 1UX4 A; 3RST A; 3P85 A; 4IZC A; 2DEO A; 2F6I A; 3HE2 A; 4ELS A; 5KDR A; 3NJD A; 1O8U A; 1Y64 B; 5G1S A; 2HW5 A; 2Q2X A; 3QWD A; 5DTW A; 2A7K A; 4RYF A; 3H81 A; 3VIV A; 3MFM A; 2F9Y B; 2FW2 A; 4OMR A; 3KTI A; 5FIF A; 1N6E A; 2F9I A; 1EF8 A; 4Q0G A; 4FB8 A; 3MYB A; 4I4Z A; 3R9S A; 3U9T B; 1UYT A; 5IKL B; 1HNU A; 3L8J A; 3ADD A; 3QMJ A; 3HRX A; 4GHN A; 4NNQ A; 5DZK A; 3V5E A; 4JCR A; 2ZL0 A; 3QRE A; 4U1A A; 1UX5 A; 4U19 A; 2VSS A; 2VSU F; 4HDT A; 1RJN A; 3NJB A; 3K50 A; 3O4X E; 3T8B A; 2VSU C; 1PJH A; 1VRG A; 1HZD A; 3A4M A; 5INI A; 3H0Q A; 3A4N A; 2PBP A; 4WZ8 B; 4U18 A; 1FC9 A; 1SZO A; 3GLM A; 1PIX A; 4Q1I A; 5DL1 A; 4ASI A; 3GF7 A; 2PPY A; 3T3W A; 1OD4 A; 5C90 A; 1DCI A; 1XX4 A; 1W2X A; 4JCT A; 3Q0J A; 4RYF H; 4JCQ A; 3KTH A; 5CTB A; 3ZW9 A; 3T8A A; 3H02 A; 2BZR A; 4MXI A; 3Q1T A; 2J5G A; 3A4L A; 2A7S A; 3P5M A; 3ADB A; 4FZW C; 2VSS E; 3KTG A; 4I52 A; 3GKB A; 3QKA A; 5G1R A; 3OME A; 3TDC A; 1UYV A; 1FC7 A; 4GM2 A; 4GEH B; 3QYR A; 4ZDC A; 3TVU A; 3KQF A; 4FND A; 3IAV A; 3KTK A; 2F6Q A; 5DZK H; 5HUQ A; 4HNK A; 5E0S A; 1NZY B; 4G2R A; 3H0U A; 3PZK A; 1N6F A; 1UIY A; 3Q7H A; 4U0G A; 1XO6 A; 4B3I A; 3ZWC A; 5KDR B; 3AJM A; 1DUB A; 5KJP A; 4KNP A; 3QXZ A; 5DTP A; #chains in the Genus database with same CATH homology 1JXZ A; 4HC8 A; 5DU4 A; 3TT7 A; 3H0J A; 2ZL3 A; 3ZW8 A; 2UZF A; 5C9G A; 5DU8 A; 5MGB A; 5DUF A; 2YJG A; 3MOY A; 3PGQ A; 2F9I B; 4ZU2 A; 1UYS A; 2WTB A; 4EMM A; 3BEZ A; 1WDM A; 4JVT A; 2D3T A; 3ZWA A; 3K8X A; 4ELW A; 4KD6 A; 2VSU A; 3TRR A; 2Q35 A; 3TV5 A; 3TZ3 A; 1WZ8 A; 4JWV A; 5DU6 A; 3L3S A; 5ING A; 2J5I A; 3BPT A; 5JBW A; 4F47 A; 4K2N A; 3KTJ A; 4JYJ A; 3T89 A; 5E0S H; 5JBX A; 2CE3 A; 3STA A; 2QQ3 A; 3IBB A; 4QIJ A; 3V5I A; 5FUS A; 4K29 A; 4I42 A; 1TG6 A; 2FZS A; 3R9T A; 3MT6 A; 4JSB A; 4OLQ A; 4YLH A; 4U0G H; 4FZW A; 2X58 A; 4WCZ A; 1WDL A; 2Q34 A; 3PEA A; 3TVW A; 5G1Q A; 1K39 A; 3FDU A; 2ZQR A; 2VX2 A; 1TYF A; 1RJM A; 4K3W A; 4ZDD A; 3Q0G A; 3DOR A; 2J5I I; 3RRV A; 2ZL4 A; 3U9S B; 3IB9 A; 2F9Y A; 3T88 A; 1ON9 A; 1EY3 A; 1K32 A; 2VRE A; 2FBM A; 3G64 A; 2J5G D; 1OD2 A; 1Q52 A; 1X0U A; 2ZQQ A; 4QII A; 2IEX A; 1HNO A; 1SG4 A; 3N6R B; 4U0H A; 1UYR A; 3ZWB A; 4JYL A; 4MI2 A; 2C8T A; 4L6W A; 3HIN A; 3ISA A; 3U9R B; 3PE8 A; 1XNV A; 3P2L A; 2W3P A; 4QFE A; 3I47 A; 2PG8 A; 4KPK A; 1YG8 A; 3TLF A; 2EJ5 A; 3DJA A; 3R0O A; 4JCS A; 2DUB A; 3TT6 A; 3OC7 A; 4Z0M A; 2GTR A; 4FJW D; 1WDK A; 3M6N A; 4KWB A; 3LKE A; 1MJ3 A; 4B3H A; 3JU1 A; 4JFC A; 1N6D A; 3RSI A; 4FN8 A; 1Y7O A; 3FF6 A; 3SLL A; 4ELX A; 4DI1 A; 2VSS F; 3M6M A; 4FNB A; 4IZB A; 1FCF A; 1EF9 A; 4ZDF A; 3R9Q A; 3HLN 1; 1XNW A; 4FN7 A; 5DUC A; 4EMP A; 3SWX A; 2A81 A; 3GF3 A; 4LK5 A; 4RCN A; 5E0N X; 3LAO A; 3ST9 A; 3R6H A; 2CBY A; 4L8K A; 3H0S A; 4OG1 A; 3GMA A; 1FC6 A; 4NAR A; 3OT6 A; 5INF A; 4EML A; 4ZDB A; 3WG5 A; 3HP0 A; 4J2U A; 1YG6 A; 1ON3 A; 2J5I B; 4JOT A; 2ZL2 A; 2X24 A; 2VSU E; 4JJT A; 5DKP A; 4B3J A; 2NP9 A; 1Q51 A; 4IZD A; 3BF0 A; 3QXI A; 4WYO B; 1NZY A; 5CTC A; 3BPP A; 4MOU A; 1J7X A; 4ZDE A; 2J5S A; 1XNY A; 4NEK A; 3QK8 A; 3RST A; 3P85 A; 4IZC A; 2DEO A; 2F6I A; 3HE2 A; 4ELS A; 5KDR A; 3NJD A; 1O8U A; 5G1S A; 2HW5 A; 2Q2X A; 3QWD A; 5DTW A; 2A7K A; 4RYF A; 3H81 A; 3VIV A; 3MFM A; 2F9Y B; 2FW2 A; 4OMR A; 3KTI A; 5FIF A; 1N6E A; 2F9I A; 1EF8 A; 4Q0G A; 4FB8 A; 3MYB A; 4I4Z A; 3R9S A; 3U9T B; 1UYT A; 5IKL B; 1HNU A; 3QMJ A; 3HRX A; 4GHN A; 4NNQ A; 5DZK A; 3V5E A; 4JCR A; 2ZL0 A; 3QRE A; 4U1A A; 4U19 A; 2VSS A; 2VSU F; 4HDT A; 1RJN A; 3NJB A; 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