5L2QA

Serine/threonine-protein kinase 40 (stk40) kinase homology domain
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
311
structure length
293
Chain Sequence
GNNAKRAGPFILGPRLGNSPVPSIVQCLARKDGTDDFYQLKILTLEEIESQEERQGKMLLHTEYSLLSLLHTQDGVVHHHGLFQDRTCVKKMKKRICLVLDCLCAHDFSDKTADLINLQHYVIKEKRLSERETVVIFYDVVRVVEALHQKNIVHRDLKLGNMVLNKRTHRITITNFCLGKHLVSEGDLLKDQRGSPAYISPDVLSGRPYRGKPSDMWALGVVLFTMLYGQFPFYDSIPQELFRKIKAAEYTIPEDVSENTVCLIRKLLVLDPQQRLAAADVLEALSAIIASWQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase 40
publication title STK40 Is a Pseudokinase that Binds the E3 Ubiquitin Ligase COP1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 293
sequence length 311
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2016-08-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5l2qA02
4FKPA 1R3CA 1XR1A 3CD3A 4H1MA 5DA3A 4BIDA 5LOHA 3CTJA 1S9IA 2XNBA 3MBLA 4QMMA 3C5UA 5EYDA 5IEXA 3QCQA 3PTGA 4C4EA 4F7LA 3C9WA 2QU5A 2GHMA 3UZTA 3I7BA 4EORA 3QRUA 3BGZA 1IG1A 3OWKA 4FKTA 2ZAZA 4FNZA 4KBAA 5HI2A 3ZS5A 5BYYA 3ZDIA 1O6YA 3E87A 5I9XA 1M52A 3EKNA 4HCVA 4D2WA 3MA3A 4H3BA 4EH8A 4XG6A 3D14A 3KB7A 3KXHA 2R3JA 4NM0A 2R5TA 3NEWA 1T45A 2ZMDA 4PRJA 4ZZOA 2XKEA 3P0MA 4NM3A 4FUXA 2PVRA 1H28A 2UZBA 4Q5EA 5DR6A 4I5HA 4FL1A 3FMKA 3EQBA 1U54A 2XVDA 3A7GA 5F20A 4U43A 3R8LA 4BIBA 5FQDC 2OH0E 3BPRA 4YZNA 5C8MA 3P1AA 2PVLA 3OXTA 4F1MA 4KRCA 3DB8A 1OKZA 4CTBA 4TYGA 3CC6A 3W16A 4UZDA 4CRSA 3OWLA 3IS5A 4R6VA 3PWDA 1LPUA 3ULIA 1OGUA 2P33A 4CQGA 4YTFA 3KF4A 2EVAA 3F88A 4F08A 4WIHA 4WUAA 1O9UA 3EB0A 1PXNA 3FMDA 3I79A 3KQ7A 4GUEA 4ZJIA 5HD4A 3NW6A 3DKGA 4ALVA 3FV8A 4FSTA 5BX0A 4C3FA 1JKTA 4AA4A 3ZDUA 4CFUA 3QU0A 4TNDA 3PY3A 3IOPA 3ORKA 3PY1A 4X7QA 3LJ1A 3R8PA 4A9TA 4EOOA 2B9JA 1WBOA 5AUUA 4FKRA 5CSPA 2I1MA 2W1EA 3QC4A 4N6ZA 4HCUA 4EHGA 4EBVA 2X7GA 1V1KA 2RG6A 5C8NA 1MRYA 4AN2A 2CN8A 3ORIA 2UZTA 3DKOA 4ASEA 2P4IA 3KN6A 5DVRA 1FQ1B 5EM6A 3FUPA 3HP2A 4OTGA 5F9EA 2YACA 5H3QA 2VTHA 3OEZA 3FMNA 3FSKA 3I1AA 3QWJA 3GCSA 3UYSA 2WQBA 3QTIA 3I0OA 1W7HA 3IW5A 3QCSA 4GG7A 4IAYA 4IVAA 2PWLA 3L1SA 3COKA 3EN7A 4FKIA 2OK1A 2ZV2A 4AE9A 1ZMWA 4BI2A 1KWPA 3OP5A 1UWJA 2OFVA 3QA8A 5GZ9A 2ACXA 3F69A 4Z55A 3MW1A 2BDJA 4O2ZA 4PF4A 2R9SA 4UYAA 3DGKA 3AQVA 2CDZA 4M67A 3AG9A 3CQWA 2BIYA 2BRMA 2ITQA 1XJDA 2YM8A 3BELA 3CY3A 3HNGA 4YHFA 4AFJA 5AR5A 3OBJA 2UW0A 3VUKA 1Q4LA 3HVCA 2BZIB 1FVTA 1WVWA 1MP8A 2FGIA 3GFWA 3GI3A 3WE4A 2V22A 2UZVA 2C5OA 2PVHA 5JFWA 3PVBA 4XOZA 3VUHA 1YI6A 2OJ9A 2W1GA 4J8MA 1J91A 3HUCA 3CJFA 4R3RA 4D2PA 4EEVA 4EZ5A 4FYOA 4HYHA 4M84A 4RA4A 4FKQA 4FNWA 5HBEA 4V04A 3HV4A 3L8SA 3DJ7A 3BBWA 2VRXA 4WNKA 3QGYA 5J87A 2OW3A 3ZFXA 3ZONA 4WSYA 3BGPA 3BHVA 3QD0A 3UPXA 3EQDA 2X9EA 3BWFA 4U79A 5T68A 3FLZA 4S31A 2X6DA 3ZU7A 4BGQA 2J6MA 3CXWA 3QALE 1MRVA 4EOLA 5HU3A 5L3AA 4W9XA 2BDWA 4U97A 3DBDA 4RMZA 3OVVA 3PIXA 1XBCA 1YWVA 2BRHA 2IZRA 2ZDUA 2RF9A 3BHUA 4ASZA 4A4XA 5IKWA 2RFNA 2X1NA 3OF0A 5JK3A 2QR7A 2WQMA 1U5RA 2JAMA 3C4CA 2UV2A 5F94A 3PRFA 4FTLA 2R3HA 4ZY6A 3D2KA 4QP4A 5CT7A 5TOZA 3OWPA 3TJDA 5CAUA 3P79A 3ENHA 4G3CA 5K5NA 1LP4A 2WTCA 2C5NA 3R1YA 5EI2A 4FTKA 3IG7A 3TTJA 4J71A 4AT5A 4EOSA 3CIKA 5L8JA 5FDPA 4U41A 4I1ZA 4FODA 3RK7A 2ONLC 4KB8A 4DEGA 1Y6AA 3FKOA 1RJBA 3SVVA 5DEYA 1PXIA 2R3LA 4O6EA 4L7SA 4G1WA 4XV2A 3SRVA 1BUHA 3FMHA 3MVLA 3W55A 4CSVA 4BHZA 5HTIA 5DH3A 3KA0A 4FNXA 3UOKA 4XRJA 3DDPA 4JDIA 4QP8A 3R22A 3R30A 3R7GA 4BWXA 4EONA 4JJRA 3IKAA 5JZNA 2BAKA 2BZJA 3LMGA 3VW8A 3Q6WA 2H8HA 4C37A 4TTHB 5IH6A 1TVOA 4BKZA 5E91A 4CNHA 2HELA 4OAVB 3V3VA 3FZRA 2A19B 3LFFA 2OJGA 4C02A 2B53A 5DN3A 4FUYA 4HJOA 3LOKA 2IWIA 2XP2A 4HCTA 4NCTC 4F9CA 5JEBA 4TXCA 3D5WA 4IEBA 5ANIA 5KE0A 4FA2A 4BCJA 5IA1A 3PXFA 3DKCA 5EHLA 4DEIA 3HMOA 4BCHA 3TNQB 4JQ7A 1BX6A 2X81A 3R7UA 1Q8UA 2C6OA 3GT8A 3OCGA 4FSYA 4MXCA 3Q4ZA 3EOCA 5EG3A 4OTQA 3ZO3A 2ITYA 3IW8A 5BUJA 1XH9A 4NUSA 2WIPA 2XIXA 3QZHA 4U40A 1PY5A 4KS8A 2R2PA 3OT3A 3WF9A 5FXRA 5K9IA 4PMSA 4IH8A 4ITIA 5CU2A 5CAQA 5JMSA 3NYOA 5IUHA 1H0VA 3RCDA 4F9AA 4MTAA 5KHXA 1HCKA 2VWBA 3UTOA 3B2WA 4FSRA 2YIRA 2ZB1A 3VS0A 2ERKA 4C62A 3EHAA 3BLHA 4AQCA 4PPCA 4HGTA 2QQ7A 4C59A 1M7NA 1FVRA 4JDKA 1UNHA 2W1IA 4EHEA 2BRGA 3WZEA 4FTMA 4DYMA 4L3PA 1F5QA 4K2RA 4C36A 3W2SA 2J0KA 4H3PA 1UKHA 2ONLA 2JBPA 5BMSA 4NW6A 5F1ZA 5AR7A 3REPA 1Q97A 3TNHA 1PMEA 4IJPA 4IZAA 4FV4A 1K3AA 4D5KA 4BB4A 5AM7A 3NCGA 4QMPA 3ODYX 4R1VA 4BWPA 3O51A 3P86A 3Q60A 3Q9YA 4NH1A 4TWNA 5EDRA 4O96A 5TF9A 4CZUA 2VU3A 5HU9A 3CJGA 2QO7A 1SVGA 4ZTSA 4BGHA 3NYNA 2PE2A 4NM5A 3EQCA 2R3IA 3RPSA 2ZMCA 1GZ8A 3DK3A 3VUTA 2QD9A 4GS6A 1RDQE 1WZYA 1CKIA 4JBPA 4FT0A 3KN5A 4F6SA 1U5QA 3TTIA 5A4EA 3JY9A 3A61A 5JRQA 4EK3A 3PXZA 4EUTA 4IDVA 1WBWA 2B52A 4FK3A 5AAGA 4FKVA 3TCPA 3FPMA 4ZLYA 3PJCA 2VTQA 4FV7A 5AV0A 4NCTA 3HUBA 4YSMA 2CCIA 2IO6A 2BZHB 3RALA 1H8FA 4UWBA 4CD0A 4F0GA 1PXMA 4I5PA 3RAHA 4YO4A 3E7VA 4XHKB 3F5GA 2H9VA 4QQJA 4A9SA 3NZ0A 2WTJA 4FK6A 3GXLA 4JBQA 3TKHA 4B99A 4JI9A 4ZTNA 3EN9A 4PWNA 2JITA 5KMJA 2WQEA 2YISA 2EUFB 2XIYA 3FHIA 3RBWA 4BF2A 4HW7A 4KS7A 3Q32A 3HRFA 4C4IA 3V51A 2HW6A 3R8ZA 2WEIA 3PSDA 2OZAB 3PXRA 4Z7GA 4UXQA 2UW3A 1P4OA 5DFPA 5LVOA 4FMQA 4E4LA 1UU7A 3QQHA 1OIQA 4YJQA 3EYHA 1O6LA 4QYYA 2BPMA 4LGHA 2NRUA 5CVGA 5AEPA 5FEQA 3Q6UA 4HGLA 1OPJA 4FIHA 4CFFA 3WF5A 1XKKA 2PZ5A 5AAFA 3KULA 4I6QA 4FV1A 4MD8E 3MV5A 5BVWA 5HLPA 4V05A 2YA9A 4NTTA 4XUFA 3GFEA 3VS2A 5CY3A 2ERZE 3VVHA 2NRYA 4M7IA 1VYWA 3NNWA 5GJDA 5CEKA 2HENA 3UO4A 4DFXE 4AP7A 3MPAA 4ZZNA 1QPJA 3FZTA 2OWBA 3DV3A 4ID7A 4H3QA 4A9UA 5G6VA 5BQ0A 5JZJA 3L8XA 4CFWA 3DBCA 1DI9A 2FA2A 5L4QA 2B1PA 4L43A 2F7XE 2IN6A 4YGAA 5D41A 4J52A 5DEWA 5AP5A 2VGPA 4BC6A 4GRBA 2PL0A 2ZV9A 4Y83A 5IDPA 2O2UA 2R3KA 3G0EA 1J1BA 2BROA 4XG9A 5LWMA 5CNOA 2AC3A 1OI9A 4X2JA 1JQHA 3AC1A 3G90X 3L9PA 3MH1A 3IW6A 3F7WA 2QG5A 1YXSA 4U5JA 3W18A 2UZEA 4QMYA 5ACBC 5TR6A 1IA8A 2YM6A 3HMIA 5KCVA 1ZZ2A 1OL6A 3OC1A 3IGGA 3KRLA 5EKNA 2XRUA 3W1FA 3BHHA 3NUPA 5IG1A 4RWJA 2I0EA 2HZIA 4BCFA 2C4GA 4FV9A 4QP9A 1CTPE 4LRJA 4TYHB 4V0GB 1OPKA 3RM6A 3TXOA 4BKJA 4EOIA 3P5KA 1FGIA 4K18A 4Y8DA 5M51A 4XS2A 4GT3A 4U6RA 2C47A 4EH2A 3RPYA 3TUBA 2WMBA 4IC7A 2G1TA 3QZGA 4O2PA 3ZMMA 3BBTB 3BQRA 4G6NA 3TI1A 5EM7A 4FGBA 4RIWA 2JGZA 4RVMA 4AE6A 4LOPA 4MYGA 4QP1A 4FTAA 3PP0A 4ANLA 4I6HA 3FSFA 3RZBA 2HCKA 3SOAA 4KBCA 2XYUA 3RK5A 2EU9A 3MSSA 4YJSA 1KE9A 5JFSA 3A99A 2GQGA 3OY3A 2J5FA 5CI6A 3VBQA 3AT3A 1X8BA 4QT1A 1OMWA 2RFDA 4ZTMA 5I0BA 3UBDA 2GCDA 3EJ1A 4II5A 4MF1A 4QTEA 3Q5ZA 2J5EA 5BVKA 2PHKA 5B7VA 4BCMA 3BYVA 4RX8A 4I21A 1BYGA 4IW0A 5JQ5A 5DBXA 5IUIA 3FLSA 1W98A 4YZBA 3VULA 4GIIA 2F2CB 3RCJA 4RFZA 1LR4A 3CQEA 4FSUA 4RLKA 3EFKA 4ZLZA 5C1QB 2OFUA 3R1SA 3COMA 2CGVA 2WTVA 4XYFA 1H1SA 5JFXA 3BEGA 4I92A 4JQ8A 4EQUA 3KRJA 1H25A 2Z2WA 4ACGA 5LVPA 2IVVA 5AADA 3RHXA 4QOXA 5HZNA 4NSTA 2QOBA 5KKRB 1Z57A 3OFMA 3AOXA 3ALNA 3NR9A 4MNFA 4APPA 4FKGA 4K0YA 2XKDA 2X8DA 1WBNA 4CCUA 2B7AA 2Z8CA 4LOOA 5CZHA 1U54B 5HIDA 1YI4A 3R9DA 3AD6A 2Q0BA 4TPTA 4ZTLA 5CSHA 3RMFA 4FKUA 2JIUA 4ZTRA 3MB7A 4LQMA 4QTCA 4CEGA 3EMGA 1KV2A 1DI8A 4P2KA 2IW9A 3WF7A 2VWYA 1CKJA 3IOKA 5C01A 4CQEA 5LVNA 3ROYA 5DOSA 1DAYA 3HMMA 4AG8A 2ZDTA 3HKOA 1STCE 5A9UA 4PDSA 4X0MA 2WMQA 5CWZA 5CSVA 2JKOA 2W9ZB 4RIYA 3ALOA 4YC3A 3HZTA 3LFQA 3UC3A 3ZH8A 4TYEA 5L2QA 5CVHA 4DAWA 2VGOA 3VBWA 2PVNA 4R1YA 4IM2A 1PXJA 4RVKA 4XG2A 4BDIA 1WVXA 2YM4A 3ITZA 4GCJA 4GK2A 4NK9A 3PG3A 5CEIA 3QWKA 3V8SA 4B8LA 4YURA 2BAQA 5CQWA 4I4FA 1Q61A 1YWRA 5A4TA 2I0YA 4IJ9A 2BRNA 1DS5A 2X2MA 3K54A 3OXIA 4FZ6A 4I5CA 4ANBA 5K4JA 2XYNA 4R7HA 5A46A 4PQNA 4EK5A 1R0PA 1DAWA 4LUDA 4RX7A 3ZXZA 3B8QA 3VC4A 3SV0A 2XMYA 4CMUA 3RGFA 4U0IA 4PTEA 4ANQA 4BVUA 3A8WA 3R8MA 4BBEA 2X0GA 2JLDA 4YLKA 5CAPA 3HGKA 2BVAA 3SW4A 5E8WA 1MUOA 2VTPA 4WKQA 4HYUA 5HE0A 4FBXA 2ETMA 2GS6A 3IONA 3CR0A 4U80A 2GTNA 3QGWA 3FYJX 4CZYB 4WNMA 2BUJA 3C4EA 3UODA 3QX4A 4RQKA 1XH5A 2GNIA 4RA5A 4ZP5A 4E5AX 1QPEA 1E1VA 1G3NA 2J0JA 4FSWA 4G3GA 2LGCA 4GFOA 3UVRA 3VAPA 4AW2A 3PXKA 4YJOA 3DY7A 4YNEA 4DINA 5KMLA 3E8EA 2A0CX 2P0CA 3RJCA 1JBPE 2JC6A 1CMKE 3D15A 5KBQA 2O5KA 5HE2A 3DDQA 2QO2A 4ANSA 1U46A 2HY81 2CPKE 4ITHA 1KE7A 4S32A 5HICA 2F49A 2FB8A 3T9IA 2QURA 3QD4A 3U9CA 3UYTA 2EB2A 4Q2AA 4E26A 2Y0AA 3KK9A 3CP9A 5ETIA 3MFTA 1OIRA 4CLJA 2AC5A 1H1WA 3SXSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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