1H1QA

Structure of human thr160-phospho cdk2/cyclin a complexed with the inhibitor nu6094
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
297
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Structure-Based Design of a Potent Purine-Based Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 296
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h1qA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h1qA01
3TN8A 5M44A 3KRLA 4PL3A 5DT3A 5AUZA 3TI1A 3MSSA 2H9VA 2NP8A 1M7NA 3BU3A 4W9WA 3VBTA 5KMKA 3PWDA 3RM7A 4W9XA 4YZBA 1PRYA 5IEVA 3A99A 3DK7A 4JOAA 4RJ4A 4UY9A 5HG5A 2XP2A 1SYKA 3L8SA 3NNUA 4GL9A 4YTHA 3QALE 5B0XA 3VS0A 2OJFE 3MJ1A 3W1FA 4U97A 1XHAA 4WG4A 5TOZA 3P08A 4OAVB 3NDMA 3A7HA 3FC2A 1JVPP 2IVTA 3JVRA 5A6OA 2I6LA 2XK6A 4R5SA 5DG5A 4YJTA 4I5CA 2YM3A 1ZY4A 4PUZA 3A8WA 3G9NA 5LWMA 2C5NA 4FODA 4TPTA 4Z9LA 4U42A 4MXZA 2PMNX 4OLIA 3DA6A 3OC1A 4E6CA 4AXAA 2I0YA 3E64A 5HICA 2ITVA 5AP7A 3REPA 3ZFYA 3E92A 2P0CA 3NZ0A 4QT1A 4XS2A 2UV2A 3KVXA 4DH3A 3DGKA 3R00A 4QP6A 3NUAA 4QTDA 1GZNA 4JX7A 4MBLA 3H0ZA 4QD6A 4PY1A 2B0QA 2WEVA 1Q4LA 5HX8A 4QP3A 4AZTA 5CZHA 3C0GA 2W06A 4QMTA 3MS9A 4HCUA 2VWZA 3ETAA 1BL7A 4LYNA 5CEIA 3EQGA 4F9CA 3P79A 3TDVA 4B8MA 4TY1A 5DE2A 3UZRA 1UKIA 2XM8A 3E8NA 1YI6A 4J53A 4TRLA 3FMEA 3L9MA 2OJ9A 4KBKA 2XIYA 3E7VA 5I9ZA 3CQEA 4UYAA 2VZ6A 2W1EA 3D7ZA 4HCVA 4OR5A 5HG7A 4EYJA 5FDXA 4F9BA 4AOTA 5BX0A 2HY0A 3VRYA 5DNRA 4FKRA 5C8KA 2BDWA 3L8VA 2VTIA 4I94A 3MFSA 4ZEGA 4ZJIA 4EUUA 4E6DA 4YO4A 2A0CX 3D94A 3GU8A 2ONLC 2ZMDA 5JRSA 2VWIA 2YHVA 4JG8A 2Y0AA 2C6TA 3Q4UA 1Q99A 4QYYA 5HVYA 1BUHA 3W2SA 3Q04A 3V51A 1HOWA 4R3PA 3HRCA 4I24A 5HHWA 2UZDA 3D0EA 1L3RE 5HTBA 1MP8A 4UWBA 4WBBB 2OU7A 3LJ1A 3NIZA 4S34A 3AC1A 5JFWA 3ZM9A 4J95A 3WF7A 4TKSA 3HRBA 1Z57A 4EOOA 4FUYA 1U59A 2CKEA 4IFGA 4JBQA 3ZZEA 2G2HA 3WF9A 2VGOA 3VUDA 1OL2A 4KRDA 3QC4A 3ZLSA 3MW1A 1QMZA 4BHNA 4FKVA 4E4LA 3EMGA 5HX6A 4TWNA 5E8VA 3ZUVA 3MVLA 4GKHA 4DTBA 3BQRA 1OUKA 3MJ2A 3V5TA 1R78A 3SW7A 4JAIA 3CJFA 4GJ3A 4AGWA 4IC7A 4CQGA 4NL0A 4TYIA 4JR3A 4XJ0A 2ZAZA 1REKA 4HVSA 4D4YA 4ZK5A 3I6WA 5CSHA 1SMHA 4RMZA 3FV8A 5TF9A 3Q60A 3R7GA 4K0YA 1WBSA 3ORPA 4PMPA 4WNOA 3LQ3A 2QLUA 4HGSA 3Q53A 4QTCA 4WNPA 3RNYA 2IZRA 5A54A 3HP2A 3ENMA 5DT4A 3TZ8A 3PXQA 3ZLYA 4FT5A 4MD9E 3Q4TA 2XNNA 4M12A 5FRIA 2HZ4A 3QRJA 2VO3A 3L9PA 3R6XA 2VTJA 3DTWA 1CKJA 3EWHA 4I6FA 4UWYA 1PYXA 2ETRA 3R9HA 3V3VA 5AUTA 3LQ5A 4OW8A 1YDRE 2GNGA 4A9TA 1LEWA 2HCKA 1Y91A 2CCIA 2QO7A 1ZYDA 4ZSEA 5HCXA 3IK3A 2E2BA 3PYYA 1KE5A 4IX5A 4N4SA 1M2QA 2BROA 4CTBA 1HCLA 4CKRA 3U51A 2QHMA 3S4QA 3FLNC 4NFNA 1CTPE 5L2TA 3R73A 3AOXA 4N6YA 4FV7A 3AT2A 4L42A 4EOMA 2FA2A 2YM4A 2Z7QA 2VD5A 4DGGA 4ENYA 3QRTA 3OMVA 4MXXA 5CF4A 5AUVA 4FNXA 3HL7A 3KXXA 4E6AA 3EN9A 4TW9A 1XBAA 2CNQA 4GKIA 1YXSA 5IQDA 4XV9A 3A7JA 3BYMA 3B8RA 4DTKA 5G1XA 5KX8A 2W4KA 5CVGA 1CKIA 2IN6A 5HVKA 3N4TA 3VUKA 5JQ8A 2YIRA 3GOKA 5CT7A 4BDDA 5C1QB 4D2RA 5B2MA 4USEA 5CT0A 2YM8A 5HLNA 3F3VA 4WO5A 2BAKA 4A9SA 4DBNA 3OWKA 4KWPA 4EQUA 3MFUA 3QCXA 3QX4A 5DI1A 2YACA 3PZHA 3WZEA 5KMLA 2C6MA 4F7LA 2Y6MA 4IIRA 5E8ZA 4IM2A 2BKZA 1CMKE 2QOHA 4FV2A 4Y8DA 4H3BA 2W4OA 3UYSA 3FZ1A 2W0JA 4UMUA 4KS8A 3SC1A 2XRWA 4YZMA 2V0DA 4EOIA 4XG7A 4X2KA 5BUJA 2XCHA 3UO5A 1HCKA 3DY7A 3DJ6A 2X81A 4IADA 4UZDA 5JKGA 3LFEA 4TL0A 5DA3A 2VTOA 3VN9A 4N57A 4EHZA 1Z5MA 4I6HA 4I92A 1YOJA 3GFEA 4K18A 5EW3A 2GDOA 3F3WA 4UB7A 4YJRA 3R1SA 1R39A 4O38A 4BDKA 3CTQA 4F64A 4O21A 4U3ZA 3DBQA 5EW9A 4C38A 2C6LA 3DK3A 3MA3A 1ZMWA 2PULA 5ETFA 4CKJA 2EXCX 1H00A 3HLLA 4UBAA 5BVKA 4BGQA 4PDOA 4MK0A 3ZO1A 5FEQA 3S00A 4F0GA 5ITAA 4DFLA 3FZOA 4WNKA 3LE6A 4FTKA 4XG2A 1GAGA 2CN8A 3COMA 5HLWA 4EJNA 3CSVA 4I5HA 1FQ1B 4BDGA 4GEOA 2YN8A 4ZZOA 4L8MA 2XNEA 1H1QA 3FHIA 4Y83A 2OF4A 5CX9A 3RAHA 4DYMA 4EC9A 4F1TA 5LWNA 4M0YA 4MTAA 3U4UA 4FV4A 3R8ZA 4Y73A 2XEZA 3WIKA 2ZV8A 3CS9A 4BI1A 1JSVA 4TN6A 4L45A 2XEYA 4R1VA 4NW6A 3FQEA 2HOGA 5HO8A 2PUPA 3FEGA 2UVZA 3UJGA 3LVPA 1ZWSA 2YERA 3BHYA 2YISA 3F82A 2VAGA 2XIRA 1PXKA 4GJ2A 4L3LA 5CNNA 4RJ8A 4NM0A 3ZSGA 4GFGA 4ANMA 1O6LA 4IDTA 4ZTQA 5HO6A 2UZEA 5IH5A 2EU9A 4E3CA 4GT5A 4KS7A 5KCVA 4FK6A 3KXMA 3FC1X 2W1FA 4J52A 4FKGA 4YZ9A 4QQCA 4ZLYA 5KE0A 2XF0A 1KWPA 4EK6A 3WE8A 3SVVA 3BKBA 3FI3A 3IO7A 3LCSA 1PXPA 4IX6A 4AN9A 2RL5A 4DF3A 3ALOA 3CQUA 4DFYA 2BDJA 3HX4A 2JKKA 4L6QA 2P2HA 5FD2A 4PMMA 3H9RA 2QD9A 3T3UA 1U46A 3RAKA 5LVOA 4O86A 3DS6A 2WEIA 3SDJA 1Q24A 1Q5KA 3Q9WA 4CMTA 5LMKA 2EVAA 4HNIA 3F7ZA 3A7FA 3UVRA 4XG3A 5A6NA 3U6IA 5EDRA 5AV0A 2CKQA 4XRLA 4CSVA 3LFFA 1KSWA 4QNYA 5KNJA 5AP5A 2R3FA 3QC9A 1AGWA 4QO9A 4XBRA 5DMZA 4R78A 5EKNA 3HMPA 4QPAA 1KE9A 3AC8A 4JIAA 3RALA 4CYIA 3HAVA 3QBNA 2JC6A 4CVAA 4RA5A 5CNOA 3L1SA 3QQKA 2VNYA 2R3KA 2RIOA 4C7TA 3KU2A 3R9DA 4O7NA 3EHAA 5L2IA 3FLWA 1ZARA 4BL1A 2O65A 3VF9A 3EKKA 4D2TA 3LLTA 4FIFA 4O0SA 3LFAA 2QOCA 5GZ8A 3DNDA 3QZIA 3R7IA 2NO3A 2X7GA 4DGOA 1WBTA 2F2UA 3C5UA 2PVMA 3PJCA 2WTDA 4X2JA 2R3GA 3DZQA 3NVMB 5AP4A 4FV0A 1U54B 3FWQA 5F94A 3PXRA 5CU4A 1FVTA 3HGKA 2PK9A 5K0XA 2R2PA 4YZCA 2CKPA 5M09A 2HXLA 4FT0A 2FB8A 3C4FA 3HMMA 4XLVA 4I5MA 4DEHA 4F7SA 4RIYA 2YM5A 3DAKA 3IKAA 3F3UA 3PFQA 4FG9A 2X7FA 3P7AA 1OGUA 3BHHA 3G0FA 2JKMA 2JFMA 2VV9A 4DE4A 3RPYA 2CSNA 5DOSA 3SG9A 4MX9A 5FWKK 5L8KA 5L8JA 4FV9A 3VW8A 2QOBA 3BLQA 3F61A 3IW7A 1VEBA 4RIWA 5ETAA 1PKDA 4OTPA 2VTTA 1PXIA 2W1GA 3IPHA 3ZDUA 4EWQA 1OKZA 3FZRA 4FKWA 3FPQA 4PL4A 3RWPA 2X9EA 3W8QA 4DH8A 3NUUA 2PWLA 1MRUA 3AD4A 1KV1A 3ZU7A 4DEDA 1ZYSA 2XS0A 2WQOA 3QRKA 5DH3A 5DGZA 3EQIA 2C68A 3BI6A 2J0IA 4OUCA 1ZYCA 3G0EA 5ANIA 4C4JA 4G6OA 3UVQA 4Z55A 5HCYA 2F9GA 4O7RA 4IVAA 4QMMA 2WTIA 1K2PA 1ZZLA 5EI2A 3VUMA 3ZSIA 1J1BA 4D0WA 5L8LA 2YABA 3AD5A 3FAAA 2NRUA 4CQEA 4Y72A 3K5UA 2G01A 2VX3A 2PVLA 5GHVA 4QTAA 2OJGA 2WMBA 2UW8A 5C01A 2OIQA 4ASXA 3HP5A 1K9AA 4JJRA 5EHLA 4WUNA 1MQBA 2XNMA 4IE9A 4FKPA 3W18A 1K3AA 1IR3A 1LR4A 2PTKA 4LL5A 4AA0A 3DJ5A 1OMWA 3F66A 3GCVA 1ZYJA 3RAIA 3AGLA 4O6LA 4G17A 3MV5A 3RKBA 3DDQA 5I9XA 2VWXA 5DLSA 5LJJA 3BBTB 3ORIA 1G8AA 3KMMA 1ZAOA 3MI9A 3TV7A 3N4UA 4AFJA 3DB6A 3R8LA 4CFXA 3BWFA 2AUHA 2OFVA 5CENA 5L2SA 2WPAA 4FTRA 4L00A 1JWHA 2Z7LA 3K5VA 4NIFB 3RMFA 1AD5A 4O1PA 4Q9SA 4D28A 5HNGA 2ZJWA 1BL6A 2WIHA 3BU5A 3MB6A 4J99A 3ITZA 3MYGA 3I5NA 4MD7E 2OKRA 4DAWA 5JGBA 3RPRA 5M08A 2XKFA 4ZTSA 4DEBA 2XMYA 1PJKA 2ZV9A 3R30A 4QP2A 4YSJA 5ANJA 2BIKB 2W1ZA 2XK8A 3HV7A 4FKQA 4OT5A 3CEKA 4KA3A 4E4XA 3R8UA 4YHTA 4U5JA 5LARA 1STCE 1IASA 2VRXA 3NUSA 2CKOA 3AC3A 2IW6A 4GW8A 2DQ7X 3RAWA 2OFUA 2UW9A 3KXZA 3RCDA 1UNGA 1PYEA 2F7XE 3PIXA 1BLXA 2X4ZA 3DXNA 2GNIA 4YP8A 3VWAA 2RG6A 3W33A 5EHYA 2XNBA 3EZRA 1PXLA 4L44A 4LRMA 2BRNA 4KB8A 1QPJA 2GSFA 1RQQA 2IO6A 3UG1A 4Y95A 4WSYA 5IA1A 1YHVA 4OBOA 5EI6A 5DEWA 3QTSA 3ULZA 3UVPA 5J9ZA 4YJVA 4BF2A 3QQGA 1WBWA 3K3IA 2XJ1A 5T3QA 3M11A 4EHVA 5AV1A 5AMNA 5GJDA 1NXKA 4I93A 2W5BA 4AGDA 3T3VA 1PMVA 1M2RA 4FTOA 2QU5A 4NTTA 3CD3A 3TKHA 5FDPA 3D15A 3DOGA 4MCVA 4BCJA 5FP6A 5EYKA 5HESA 4BYJA 5AP1A 1NT2A 4FIHA 4GK3A 3ZXZA 4EOQA 3BX5A 3CP9A 3H9OA 4O7WA 3F3TA 4JG7A 4X6QC 3O17A 4FKUA 3PPJA 2WB8A 4RGJA 4I1ZA 4PNIA 3OXTA 3QHWA 2GFSA 4GIIA 3VS6A 2WO6A 5CS6A 4NCTA 4RBLA 1BYGA 3UPZA 3LFDA 4NJ3A 4EI4A 3EJ1A 1JOWB 2ZM4A 2BAJA 4RQKA 1H28A 4QNAA 4AWIA 5I3RA 4C58A 3KK9A 3QCQA 2XKEA 5FM3A 2J90A 2A4LA 3IGGA 2UZTA 3EFLA 2WFYA 3QA0A 3CPCA 4B9DA 2B53A 2UZWE 3CTHA 3VBXA 4BDEA 4V0GA 2C0TA 4WA9A 2OGVA 4O7SA 4ANOA 4U9AA 3PVGA 5ETCA 4MBIA 4HGTA 4QMWA 4AG8A 4F6WA 4R77A 3LFCA 2IZSA 4FOCA 4XRJA 4DFNA 4OAUC 4JQ8A 3ORZA 1PXMA 3G6GA 4RG0A 2QI8A 1KUTA 3AG9A 3M42A 4WUAA 3EL7A 3UG2A 4MVFA 4I21A 4CCBA 3UQFA 4O7ZA 4S33A 4L67A 1KE8A 5KZ0A 2PMOX 5AWMA 3PIZA 2Z2WA 4S31A 5BVEA 3R83A 4JS8A 5J1VA 4PPAA 3LM0A 4BDIA 5HEZA 3FPMA 3BEGA 3AMBA 2RFEA 3FYKX 4RIOA 2YLFA 3QHRA 3P78A 5F1ZA 4X2FA 4ALVA 4AZFA 2VWVA 2W17A 3UC4A 2C0OA 5AA8A 1KE7A 2QR7A 5J1WA 1ND4A 4FK3A 3GU5A 4NK9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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