2CGXA

Identification of chemically diverse chk1 inhibitors by receptor- based virtual screening
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
268
structure length
265
Chain Sequence
VEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPLKKGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK1
publication title Identification of Chemically Diverse Chk1 Inhibitors by Receptor-Based Virtual Screening.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 265
sequence length 268
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2006-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2cgxA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2cgxA01
5IA2A 1UKHA 3NW5A 4XHKB 3GC0A 4RFZA 2R9SA 4FEVA 3CCNA 2PVYA 4JDHA 3F82A 3QQJA 3V5PA 3U87A 4NM7A 3EQDA 4GKHA 5AFVA 1GZ8A 1H27A 4OTIA 4RT7A 4RA5A 4O7YA 4RIYA 4APPA 5CQWA 3EB0A 4A06A 3HDMA 3W1FA 5CAQA 4UN0C 4EOQA 3LAUA 2EXCX 3C0HA 2JC6A 4GJ3A 5GNKA 5CASA 3QX2A 1FINA 1MRVA 5BUIA 4EOIA 2VGPA 1Q8TA 5AV2A 4ANOA 1JWHA 4BY9E 3F5PA 2XNEA 4K33A 4YJTA 5L2WA 1PXIA 2J7TA 3BPRA 3QQLA 4MWHA 4AE9A 4I5PA 4N70A 3VS0A 3N4VA 3EOCA 1A9UA 1YWRA 4GU9A 3RTPA 5IEYA 2VTNA 2YWPA 3EWHA 3QBNA 4JL9A 3LQ3A 5A4CA 1U4DA 2G1TA 2QODA 2RFNA 3MB7A 3VBQA 3D7TB 5ACKA 1STCE 1UNLA 3EL8A 4FV1A 4QMMA 5M56A 5I9VA 5FRIA 5BVDA 4GMYA 2PUPA 5AIKA 1PXNA 4XG7A 4O21A 3TI1A 5HLWA 2O64A 4O91A 2OU7A 4ZJVA 2WTVA 4B99A 2O63A 4MKCA 5AP6A 1OL7A 1SVEA 3M1SA 5HKMA 4D5HA 4H05A 3R8UA 4YO6A 4YZ9A 5IA1A 3FKLA 2C5XA 3BEGA 3BYMA 4RVTA 2B55A 3R1QA 1WVWA 4DEAA 4C4IA 4NJDA 3CPBA 4BCIA 4OR5A 3ZC5A 2XP2A 4B0GA 4EBVA 3SG9A 2X8DA 3C51A 5FTQA 4KSQA 2WD1A 4UZHA 4ASDA 3TM0A 5CSWA 5CF6A 3PLSA 4GIIA 4FZFB 1W0XC 3A7JA 3L9PA 4QYHA 5DN3A 4FT9A 2NPQA 3RAWA 5HGIA 3UTOA 1ZLTA 3QA0A 4AW0A 4D9UA 5FBNC 3LKMA 2VWUA 1NT2A 3FSFA 4AFJA 3D5WA 4FICA 4C4GA 5L2QA 5JGDA 5H8GA 4U44A 3N4TA 3HP5A 4P90A 4I0SA 1ZZLA 3QZHA 2IPXA 2XIRA 4CV9A 3A62A 3QUPA 5A9UA 4J8MA 3I6UA 4FKUA 5E8SA 3MY1A 4IZ7A 4QTAA 1Q5KA 1M7NA 2GS6A 4IJ9A 3UQCA 3MY0A 3HV6A 4R3RA 5KZIA 2ESMA 3IW8A 3ZO1A 4ZAUA 4DBXA 2QOOA 4I4FA 4FSTA 2QG5A 3OF0A 2QURA 4G3CA 1OITA 3ZZEA 3MSSA 4FI1A 4RC4A 3KA0A 3GC7A 4FTOA 5K4IA 5B2KA 5JFVA 5HBHA 1H28A 2QG7A 4CFFA 4RQKA 5IQHA 4BBFA 4HCTA 1WBWA 1YKRA 5EYKA 2CKEA 3FDNA 1WBTA 3QTUA 5T68A 3RPYA 4A9YA 4IZYA 5CEQA 4AUAA 4FV3A 2WQEA 2GHMA 3R04A 5ETFA 4NK9A 5IEXA 1P2AA 2FGIA 1NY3A 5K5XA 4RJ3A 2PUUA 2IO6A 4V0GB 3POOA 5E91A 2XK7A 2QC6A 3EFKA 4TXCA 5LMKA 4USDA 5IQEA 2JBPA 4OLIA 4CKIA 1BYGA 3DBDA 5E1SA 3WE4A 1KWPA 4EYMA 3R21A 4WT6A 4IAKA 3QZIA 2J6MA 1YXTA 5HTIA 3DB6A 5E1EA 3V5JA 3NNUA 3LXLA 3KQ7A 4G3EA 3TNQB 2GQSA 3DXNA 3MH3A 3E8CA 2YISA 3L8SA 3QQHA 4H3BA 4I6HA 5F9EA 4IW0A 2BVAA 2W0JA 3I60A 4YHJA 4G6LA 4MF1A 5JFSA 4DG3E 5I5ZA 3UVRA 2ITQA 1P14A 1DS5A 4QPSA 4JAIA 2X7FA 5D41A 3OCSA 3OOGA 4YTIA 4GRBA 3TNHA 3GCPA 2PYWA 3BLQA 3LFFA 4L7FA 1MQ4A 3NNVA 1AGWA 2XK4A 4JT3A 3GU5A 3MI9A 5DEYA 3NUSA 3VNTA 1PYEA 4EH4A 2B4SB 4I6BA 5KMMA 2WU6A 3P78A 2YFXA 3A99A 4EH5A 3E8NA 3I4BA 4MXOA 2BAQA 3JR1A 3VUKA 5JGBA 3MA6A 2QKRA 4LL0A 3UC4A 1ZOEA 3DBEA 4ITIA 2PHKA 4R1VA 3BHUA 5HE3A 4CTCA 4IFGA 4R3PA 3O8UA 3A60A 4D4SA 5HX6A 4WG4A 2OGVA 1LUFA 2CN5A 3CQUA 5CXZA 1U59A 4DGNA 4JNWA 3DKFA 4DGGA 1Y8GA 3VW8A 2ZM4A 2JKKA 2QCSA 3JXWA 5DGZA 4AWIA 4ORKA 3DFCB 3UYTA 3LJ1A 2WELA 2WHBA 3OXTA 4II5A 1W8CA 2R0IA 3F5XA 2OJFE 4TPTA 2X4FA 4JX7A 4E26A 5CU4A 5FP5A 2HY81 1CM8A 4MXZA 2PVNA 3SLSA 3IS5A 2EUFB 3LMHA 3QD3A 3C1XA 3VJNA 1BI7A 4FZAB 1JKLA 1OI9A 5ANGA 4Z16A 2AYPA 1XHAA 5CAOA 2E2BA 4RRVA 4B4LA 1VEBA 2ITVA 2BMCA 4NM0A 4DEHA 3W2QA 2JDSA 5HE0A 4X3FB 3BI6A 3LJ0A 4BDIA 1GAGA 4ACMA 4EH9A 4EWQA 3R8ZA 2Q0BA 3ID6C 3RK5A 2X2LA 3NAYA 2C0TA 4PMPA 3MESA 2VNWA 3PWYA 3Q52A 5AV0A 1W7HA 3DK7A 2VWYA 3W10A 4C2VA 5KBRA 2XZSA 3VWAA 4FV5A 4YC8A 2IZUA 4LQMA 3ZH8A 4S34A 4S31A 2AC5A 3ORIA 3ANRA 5AV4A 1KSWA 4UWCA 5CNOA 1YWNA 2HK5A 5HU3A 5FDPA 5BUJA 3IGOA 5HVYA 3FMKA 3PZEA 5AP1A 2PTKA 2VO3A 3PIZA 4X3JA 3R9NA 3LCKA 2PU8A 3G15A 3ULZA 4YTHA 3D15A 3R73A 3GCUA 4PPAA 4WKQA 4BFMA 3OFMA 4LFIA 5CENA 5IDPA 2ITTA 3VRZA 4ANQA 3DBCA 4FR4A 2OO8X 5HIDA 3NCZA 4FKSA 5A46A 3A8XA 1OKZA 3U6JA 2DWBA 3QQKA 4RIWB 3T9TA 1S9IA 1NA7A 1U54B 2O0UA 3QZGA 4M84A 4EH2A 3EJ1A 5KBQA 3IDCA 2J0IA 4QMNA 4XP2A 3PPZA 5CVFA 5IU2A 4QQTA 3BWFA 2YM5A 2R3GA 3WILA 5AP5A 3Q4ZA 3WYXA 2FUMA 3G9NA 4P4CA 2BRNA 4FSRA 1BL7A 1ERKA 2P2HA 3LXPA 3C4XA 4LYNA 3H9RA 2A4LA 4QRCA 4U6RA 1U5QA 4RA4A 3PP1A 3KGAA 4MD9E 4XH6A 4W4VA 4TY1A 2C5VA 2PVKA 4X2GA 3ORTA 3DJ6A 4G5PA 4S30A 4U5JA 3ROYA 3SGCA 4CG8A 5LARA 2B54A 4AA5A 5FLFA 1Q3WA 3GB2A 3II5A 4O7NA 4JBPA 3Q4UA 4QYEA 4ALWA 4Z9LA 5HO6A 4BL1A 5CEOA 5GIPE 5AX3A 2H9VA 3CSVA 4RX7A 2XNGA 2W99B 4FTCA 3OXZA 4IM3A 5AP3A 4A4OA 5J7BA 5LWMA 3EIDA 3MVJA 3ZU7A 3F5UA 3DXQA 3C5UA 3TG1A 4O82A 1JAMA 5AA9A 2WGJA 2PE1A 4HGLA 2JGZA 4KBKA 4OAUC 3KXMA 1KE7A 3FMHA 3LM5A 3HMIA 4UALA 4IVBA 1OB3A 5ANJA 5KMOA 4J52A 1PMUA 2WZJA 3P7BA 4ID7A 5FTOA 5LCKA 1WVYA 5AUTA 3QQGA 2C6EA 3KREA 4CQGA 5BVKA 4ZY5A 4L3PA 2CNVA 4KD1A 5LCJA 5GINE 2VWWA 3EN9A 5IQGA 4KAOA 4YMJA 3BLRA 2VX1A 3IOKA 3NIZA 5F1ZA 3ZMMA 4D1XA 4U7ZA 3MFRA 5JZNA 4RSSA 4TNBA 2IW8A 4IX6A 3OCTA 2R3IA 4BZNA 4C3RA 5ETIA 1NXKA 3ORXA 2FVDA 2C47A 3FMJA 5DR2A 4C4JA 4D0WA 1REKA 1TQPA 3DTWA 3OY1A 3QD2B 3QRIA 1H26A 4AN9A 2WAJA 2RKUA 5D11A 4D2SA 4FV7A 1MQBA 5IZFA 4CZYB 4M97A 4DLJA 2W17A 2WMUA 1YHSA 4HVGA 5BMSA 3QLGA 3AXWA 4JXFA 2OBJA 5EW3A 2Y4PA 1H1PA 1UWJA 3GFEA 3JVRA 5EM7A 3ZSGA 4AAAA 5CEMA 4O2ZA 4AFEA 4RLLA 4EC8A 2WNTA 4LRKA 4NM3A 3V8TA 4EH3A 1FOTA 3LJ2A 4K1BA 4NW6A 5DRBA 3HGKA 3QD4A 2BAJA 2VX0A 4KIKB 4MXCA 4UEUA 4A4LA 4N6ZA 4IWPA 4O1OA 4TYHA 4UMPA 5JFWA 2Q83A 4UY9A 3HMPA 4LOOA 1BMKA 2HZIA 2G2FA 3FMMA 2GFCA 2HXQA 3U51A 3IW4A 3AD4A 1G8AA 4WO5A 2IW6A 3N51A 2OIBA 2ZYBA 1PXOA 4FTKA 3PJCA 3UOKA 4F0FA 4F63A 5L3AA 4BTFA 1U46A 5GZ9A 4EHEA 2XCKA 2JDTA 3MH0A 5CI6A 2BHEA 4LGGA 2DQ7X 5HO8A 4GFGA 4BWPA 4FSNA 2PZYA 2IVUA 5J9YA 3FC2A 3FZPA 4EL9A 5IKWA 1E1XA 4D55A 3EHAA 2JITA 3KN5A 3KULB 1OZ1A 1LEWA 5IQDA 1XH8A 4L3LA 3QZFA 4HYSA 5EKOA 4R78A 3KCFA 2F2CB 4U8ZA 4OW8A 2GQRA 3COMA 4G6NA 2RSVA 1KE9A 2YAKA 4E20A 2HENA 3E93A 2QONA 5HBJA 4I4EA 5AUVA 2RFDA 4I93A 4BWXA 4NTSA 5HCYA 3RWPA 3NW7A 2XKCA 4RFMA 3BQRA 4EQUA 4QMLA 3ENMA 3K5VA 5AUUA 5FG8A 3PXRA 5CU2A 2BKKA 3F3ZA 3UODA 4BGGA 5AP4A 2V7AA 4J99A 2A1AB 4FSMA 3Q5IA 1GIHA 3AD5A 2Z60A 5KNJA 2VO0A 4CLIA 4TYJA 5LOHA 1R39A 4QMTA 3SRVA 4OBOA 4D2TA 3QRKA 4E6CA 4EUUA 5GIOE 2GMXA 3UNKA 5HLNA 3UZTA 4ZS4A 4A4XA 2ZMDA 4B8MA 5A4EA 4QNAA 4M69B 4RIYB 4DITA 4AZVA 4USEA 4RPVA 4Q5HA 3C0IA 3NAXA 4R7HA 1TKIA 4BDHA 3AT4A 4DH5A 3W2CA 3DQXA 4QTEA 3PP0A 4ZTMA 5EQYA 2X6DA 3IW5A 2F7ZE 4DLIA 2BCJA 1W98A 3EZVA 2C6LA 4YLLA 2B9HA 3CQWA 5EHYA 4ZSJA 2PVHA 3O50A 4H1MA 5JQ5A 4MQ1A 2VTJA 4DFXE 5L6PA 3EN4A 3WBLA 1FVRA 3GCVA 3HYHA 3LMIA 1YOJA 2UUEA 2HWOA 4LRMA 3LVPA 2Y4IB 3FQEA 2PMIA 1URWA 2ZM1A 4Z3VA 3NVMB 3DXPA 4H1JA 1WZYA 2V5QA 2QD9A 3TV4A 4PMSA 3R30A 5LVPA 1PXPA 2CLXA 4IDTA 3UO6A 3FHIA 2IN6A 4AU8A 3KFAA 3I79A 4YJUA 4BGHA 4APCA 3R22A 5GJFA 4IANA 2WB8A 4BDGA 3FLYA 2ZDUA 3AMBA 4AGWA 4NKSA 2O8YA 3NCGA 3QA8A 1FMOE 4KIQA 1FGIA 4OT6A 2VZ6A 1G3NA 1Y57A 4WUNA 3WZDA 4DG0E 5KHWA 4ZTQA 5HHWA 2RGPA 3DY7A 4QQJA 5DHJA 2VTQA 3PA5A 2WOTA 3TEIA 4EOJA 4U42A 5A4QA 3CEKA 3K5UA 3ZONA 4BKYA 4O7LA 3DKOA 2ONLC 2QOIA 4M67A 3VBWA 2P0CA 5M06A 1M52A 4D28A 5GJDA 4E93A 1CKPA 1UKIA 3AMYA 3KB7A 4PTEA 4RMZA 1JKKA 5L2TA 3I6WA 2PVMA 2LGCA 2PWLA 4G3FA 4O0TA 5CU6A 3RHXA 4YPSA 1IRKA 4ZLOA 4EH7A 2W05A 3V8SA 2REIA 5JRSA 4XBUA 5E92A 3HRCA 3Q5ZA 4O7SA 4RGJA 2YM4A 3EYHA 4TWPA 1XKKA 3FEGA 2YA9A 4I0TA 4R1YA 4RJ8A 5I3RA 5CVGA 4C3FA 3KRWA 5LWNA 4FK3A 2C30A 4XP0A 3PRFA 3ZSHA 3GT8A 2EVAA 2ZMCA 3KRJA 3SAYA 5HX8A 5IH5A 3BYVA 3UO5A 4ERWA 4ZLYA 4RX5A 1M2QA 3C4EA 4BCHA 4FKOA 1SNUA 1PXLA 2WMTA 3D14A 4FT7A 5C9CA 5B7VA 5M57A 5TT7A 4YSJA 3IPHA 2J2IB 1Q3DA 5E4HA 4Y5QA 2XH5A 2HW7A 3F6XA 4HVDA 5AP7A 4K18A 4P2KA 5DRDA 3PXKA 3TV7A 4U9AA 3JYAA 4L44A 1U5RA 1PYXA 4GG5A 4HZSA 3OTVA 3WZUA 2CHLA 2YJRA 4F9AA 3NYXA 4CRSA 1K2PA 2R3QA 3O23A 4NZWB 3ORKA 1NVSA 2XRUA 4WA9A 3EQRA 3HV4A 4HYUA 4LOQA 2E9PA 3QKLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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