4EOKA

Thr 160 phosphorylated cdk2 h84s, q85m, k89d - human cyclin a3 complex with the inhibitor nu6102
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
298
structure length
293
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLSMDLKDFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title An integrated chemical biology approach provides insight into Cdk2 functional redundancy and inhibitor sensitivity.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 293
sequence length 298
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4eokA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4eokA01
3D83A 4OTIA 2F2UA 4KD1A 2ZMCA 4EBWA 5C03A 4USDA 2OK1A 3HMPA 1XWSA 3Q9WA 4U41A 2IW9A 1BYGA 3NRMA 3F3VA 2R3NA 3KMWA 3QAME 3VUIA 4C36A 3IQ7A 4PMMA 3VQUA 3M2WA 2X6EA 3NW7A 3W10A 1UWJA 4CTBA 5KMIA 4H3QA 3F2RA 3OCGA 3M42A 2Y6OA 4K11A 4RIOA 2C69A 3W32A 2OU7A 4DF3A 4KUJA 1MRYA 4YJQA 3D7TA 3IO7A 3H3CA 4W4VA 4A9YA 1NY3A 5C27A 3QA0A 3MW1A 4I23A 4FV7A 4XH6A 2Q0NA 3WF9A 4ANSA 3CD8A 4RA4A 3I4BA 4CQEA 4RX5A 3EFKA 5IEXA 1DI9A 4RX8A 4ASXA 3DLSA 4FX3A 5HG5A 2ITZA 4YSMA 4PL4A 4Y5HA 4EK3A 4WRGA 5I4NA 2X8EA 4EI4A 2J0MB 3IDBA 3ERKA 4JRVA 5FXQA 4MQ2A 2QONA 4YJPA 5E8SA 2WIHA 4CYIA 3NMUF 5I3OA 2FSMX 4KKHA 3NNXA 1KWPA 2CN8A 3D94A 4U8ZA 3KULA 4BZDA 5JGDA 5IQBA 3KCKA 5EI6A 4G3FA 4BDGA 4EK5A 3A8XA 4O2PA 4ENYA 1GOLA 3VJNA 3R30A 5AIRA 3WOWA 2UW5A 5G6VA 5JQ5A 3FZRA 5DNRA 1BI7A 3OOMA 5AA9A 3AGLA 4RJ5A 2BFXA 3K5VA 4XHKB 4AA0A 2Y4PA 3EB0A 1JVPP 3DOGA 3KVWA 3D5UA 3AMYA 4ZSAA 4V0GB 3TNWA 1R78A 3WZKA 2EXEA 5CNNA 5CASA 4I3ZA 4O0SA 3HP2A 3NW6A 1FINA 3P7CA 4LGDA 4ANNA 1H08A 4KIPA 5GIPE 5HLNA 3CGOA 1BLXA 3G9LX 3LFNA 3R1YA 3R28A 4LV8A 5LVLA 3TV6A 2C68A 4YTHA 2C1BA 1WVWA 2GS7A 5E92A 1ZYLA 5T6KA 2JDSA 3SVVA 1ZXEA 1U54A 3LCOA 2VTIA 3EQDA 3PPJA 5HVJA 5J87A 5AA8A 5AUUA 2VO7A 2ZDTA 4GW8A 4BIBA 4D9UA 2CMWA 2FA2A 1YOMA 4FZFB 4RLKA 4N6ZA 1ZMWA 3SG8A 3I79A 4R3RA 4A7CA 1M2RA 2WAJA 5L8LA 2UW6A 3T9IA 5GJDA 4ALWA 2R3FA 2YM6A 3GC7A 3PY3A 3ZO4A 3AMBA 2FH9A 3FQHA 1AQ1A 4I6QA 4N4SA 3N4TA 1R0PA 4XBRA 4D2PA 2YCRA 3S00A 1FQ1B 5CU3A 4XX9A 5E8XA 1SM2A 1ZY4A 4RWLA 1KSWA 3PFQA 4EQMA 4CKRA 5LMKC 4G6NA 2V5QA 5HNGA 5EYKA 4ZJIA 3MH0A 3DV3A 5M56A 3N4UA 1ZY5A 3DBEA 3EYGA 1GZKA 4NM7A 3G33A 2F7ZE 3FHIA 5CT7A 3BI6A 4EK8A 5KMKA 2XNBA 4KA3A 3VN9A 2HELA 2EXCX 4HVDA 3OUNB 2XCKA 3ZMMA 4RC4A 3VIDA 2PUIA 4K9YA 3D5XA 1CSNA 4EH7A 5LMBA 3BYOA 3GU8A 4IE9A 2I0HA 2ZVAA 4GJ3A 2A19B 3OC1A 3W1FA 1IR3A 4FOCA 3U9NA 4EH9A 1SMHA 4PDSA 4EHEA 5D12A 1JNKA 3ZZWA 5D1JA 4Y5QA 5AP4A 2QODA 2VD5A 2J4ZA 4EH3A 4JG7A 3DK7A 4DLIA 3RHKA 2CLXA 3ZRKA 2P0CA 2NO3A 4A9RA 4F0IA 3W2QA 3FL4A 3DJ6A 4M13A 1TQMA 3NUAA 3DDQA 3PPKA 4O6LA 3FYJX 3PXKA 3O50A 5EFQA 4TNDA 4IZ7A 4JG8A 4NCTC 1R3CA 3F82A 2KTYA 4Q2AA 2OKRA 4N0SA 3AC2A 1FOTA 3QUEA 4QP2A 4DFBA 4AZEA 3BHVA 3EFLA 4CMTA 2PZYA 4PDYA 4NTSA 4JI9A 4OTQA 4WNKA 4EOPA 2JKOA 4N57A 2IWIA 4TYEA 2VTPA 4YC8A 2WU6A 4BZOA 3AG9A 1M7QA 2IZTA 3ANQA 2C6OA 3JVSA 3RCDA 1E9HA 3TKHA 3UOHA 5I9YA 4DA5A 4GKIA 5AR7A 1PXOA 2C4GA 4UMQA 3HDMA 3V6RA 5I5ZA 3H0ZA 3R7IA 4EZ7A 2B0QA 2XIYA 4IX3A 3DKCA 4PRJA 2PUUA 3SDJA 4BDJA 4WIHA 4JXFA 4F70A 2B55A 1QMZA 3POZA 4DN5A 1ZAOA 4MNFA 4WNOA 4IDTA 3WZDA 2VTJA 2YEXA 2FUMA 4RJ8A 1PW2A 1TKIA 1OL6A 4RVTA 3T9TA 3I1AA 4XRLA 4HYUA 4C35A 5K9IA 3UYSA 4EHGA 2QU6A 4O6EA 3RAHA 3ORXA 4W9WA 1H0WA 3UVPA 4YURA 2P4IA 1IAHA 2RFSA 4YPSA 4IAKA 4FNYA 1QL6A 2YWPA 4J97A 5M57A 4Z7HA 3MPAA 2XS0A 3F5GA 2XK8A 4WO5A 5FM2A 5HICA 4D4VA 4C59A 1PMUA 4LG4A 1W0XC 4D4SA 2ITNA 3FUPA 3HYHA 4MXZA 4QMTA 4DG3E 3PA4A 1PJKA 3VBWA 4FA2A 3PJ1A 4FKLA 3JUHA 2Q83A 4QNYA 4ZXTA 5L6PA 1OBGA 5FP5A 4E26A 1UKIA 3FY2A 3HV6A 3JYAA 4WOVA 1S9IA 4AXAA 4F0FA 4U45A 2CNVA 4CCUA 4EH6A 2QO2A 5AP5A 5GZ8A 2OF4A 2YABA 5LQFA 3PE1A 5ANJA 3HMOA 3Q5IA 4I5CA 5H8EA 5AUYA 5L6OA 3GI3A 4AT3A 3O96A 3TUCA 5AR2A 1DS5A 4AA4A 4M66A 4BZNA 2XF0A 4DH1A 2ITQA 3HMMA 2R3HA 3WF5A 2OF2A 3ALNA 3RNIA 3ZFXA 3F5PA 3KRRA 4FEQA 4FZ7A 3GCSA 3R8UA 2WTVA 4IWQA 5AFVA 4EQUA 5IPJA 2ZB1A 1XH7A 2V22A 5AP1A 5AP3A 5EOBA 5EM6A 5E8YA 4BCHA 2ITPA 3P7AA 4AFEA 4BKYA 3SW4A 2BKKA 2XIKA 5FTGA 3BV2A 5IMXA 1IA8A 3A7IA 2W7XA 3E3BX 5IQIA 4MYGA 3PIXA 2W1FA 4WHZA 1H01A 1ERKA 1J7IA 2QHMA 1QCFA 1M14A 4HVGA 4XG2A 1H26A 2ITVA 5DYJA 5ANDA 5HNBA 1FGKA 4N70A 1DI8A 3OUKA 4R3PA 4TYGA 4XJ0A 3WF7A 4O82A 5LOHA 1YWVA 3L8XA 4ZY6A 4JDKA 1AD5A 4AOTA 2C5NA 4PPBA 1ZWSA 4RMZA 2P55A 4ZOGA 3UZPA 1Q99A 2VU3A 4U40A 3SHEA 2ACXA 5JFVA 1H24A 4OBOA 4JQEA 4WRSA 3R8ZA 1Z5MA 5TR6A 5JFWA 3LQ3A 4AAAA 4DFNA 4YNOA 2OGVA 4EOQA 4CNHA 3LFSA 3KRJA 5AV4A 4ZLYA 5EQYA 1E1XA 1WBSA 1SVEA 3LCTA 4FOBA 4G31A 4KBKA 3BGZA 5DEYA 4GFMA 1FVRA 1HOWA 2HWPA 3KXXA 4EJ7A 1OITA 3F2AA 2J7TA 2VGPA 5BVEA 4EKLA 1Q8UA 3O23A 4WNMA 2GNHA 5I9ZA 3ZM9A 3UG1A 5JT2A 4FT0A 4MXAA 3RWPA 4ACGA 4CKJA 5KMMA 3OROA 2PY3A 2XJ1A 1YDTE 3AQVA 4IJ9A 2BDWA 3MV5A 3KF4A 2B54A 1BUHA 3DXNA 2O2UA 2BZJA 4E20A 3AMAA 3BHTA 3OZ6A 2PVHA 4XOYA 1XH6A 2HY0A 2C6IA 4AGWA 3CR0A 3OWKA 4YHJA 5E8VA 2X7GA 3L8VA 3FPQA 1HCLA 4EZ5A 4APPA 3HAVA 1PF8A 4D0WA 2W06A 4QMSA 2PVLA 5KBRA 4IX5A 4L42A 3FL5A 3T3VA 4APCA 4CRLA 3F5XA 4EH8A 2DS1A 4YJVA 5HGIA 4ASDA 1OBDA 3DXPA 1GZ8A 5FGKA 5LJJA 2CJMA 3UNKA 3NAYA 2IW8A 5I9UA 2XNOA 3GU5A 5ETAA 5L4QA 2WU7A 4W4XA 3FMMA 3QZFA 5ETIA 3UZTA 4BIEA 5A4EA 4IZYA 3EN4A 4JS8A 3FXXA 2OICA 1DAWA 1YXUA 2ZDUA 4BF2A 3UC3A 4I6BA 4K18A 1YXSA 2F7XE 3EZRA 5CQWA 3FY0A 5DIAA 5IUIA 3ROYA 4ZZOA 2YZLA 4IJPA 4O2ZA 3NYOA 3S1HA 1YQJA 2WTKC 4O96A 3RGFA 5IH4A 3AD6A 3CE3A 2W1HA 5EQPA 2WFYA 3E63A 2CDZA 2PVMA 4KIKA 3GENA 2BAQA 3HRFA 4O7WA 1DM2A 2XJ2A 2Z02A 4E4XA 5KKRC 2R3IA 4D2VA 1GIHA 4WT6A 4BDBA 3CTQA 3LPBA 4YGAA 5DG5A 2DWBA 3I6WA 4F1MA 2GTMA 3RJCA 3VHEA 5IF1A 1WBTA 2ETMA 3CIKA 3KU2A 3TNQB 3GCVA 3RVGA 4HNIA 4FL2A 4YR8A 5HBJA 2VX0A 4FNXA 4D1XA 1TVOA 3EQGA 3TTJA 4ZTNA 4B4LA 3ZRLA 3C1XA 3E92A 1JLUE 2E9VA 5LCKA 4FUXA 4ANOA 3BYMA 5CWZA 5HCZA 4ZJJA 3RM6A 3O8TA 4P2KA 4FV6A 3O17A 2SRCA 1Q3WA 1Q61A 4BDAA 4RC3A 5HO8A 2O65A 5BX0A 1PMNA 4FNZA 4PP7A 5BQ0A 2RFDA 3A62A 3CCNA 4GCJA 2W9ZB 3R1QA 5CLPA 5H2UA 2B9HA 3V5PA 3G51A 1OUKA 3QQHA 3OWPA 1H00A 4V0GA 3C13A 4YLKA 3R7YA 4D5KA 2HIWA 3O2MA 4GL9A 2IJMA 2PVNA 3O7LD 3VUGA 5LVMA 4PQNA 4HW7A 4XMOA 4AW2A 2CN5A 2QLQA 4TN6A 4O7YA 4C0TA 3MVLA 3PP0A 1PYEA 2BHEA 1O6KA 3GUBA 4RG0A 3JS2A 2RG5A 2XIXA 5CF4A 1PXPA 4A4XA 2YWVA 2HYYA 4E6AA 4ZTRA 4E3CA 3VS4A 1XHAA 2PZPA 3A7JA 4GFOA 3SXSA 1A06A 2WPAA 3MH2A 4FKJA 3AT3A 3ZZEA 4FTMA 4A06A 3N4VA 2I1MA 3GFWA 4EONA 4OR5A 4YJOA 5HKMA 4D2SA 5BNJA 1OVEA 2P2IA 1OIYA 4IWDA 4XP2A 3RZBA 3Q5ZA 1Q3DA 5A4QA 3ZU7A 2BALA 4FV5A 1XR1A 3HV4A 4NM5A 4XG3A 1V0BA 5KZ0A 3M11A 4DAWA 3IW7A 5HX6A 5J5SA 2YDKA 4IVAA 4JQ7A 1VYZA 3TL8A 4I4FA 1ZOEA 1WBWA 3OY3A 3C7QA 5FBOA 2BR1A 4XV1A 3ZUVA 1Y8YA 3HZTA 4OTFA 3QC9A 5A6OA 3W2RA 3BHYA 3D9VA 3NR9A 4KINA 3Q9XA 4YJNA 2WXVA 3ODZX 4U80A 3CBLA 1NA7A 3BBTB 4FSZA 4EORA 4UZHA 5KCVA 4FT3A 5J95A 4L3JA 1H27A 4QRCA 3DNEA 3ZUUA 1V0OA 3DJ5A 4A07A 4CVAA 5K4JA 3MIAA 2YM8A 4RQKA 4CFVA 1GY3A 2C5YA 2FB8A 1UNLA 2VZ6A 1O9UA 1K3AA 3NUNA 5DOSA 3ZLXA 4CMUA 3SA0A 3I5NA 3ENHA 3VF9A 5BVDA 5M53A 1KE6A 3KB7A 2V55A 4HOKA 4ITJA 4R7IA 1W98A 4XNEA 3U51A 3BHHA 1REJA 1UNGA 5AM7A 5M4UA 2G15A 3DA6A 3I5ZA 2H9VA 3VS6A 3W16A 5CI7A 2A1AB 4PMPA 3NUUA 5EHYA 4H3PA 2JBPA 4LI5A 1PKGA 2W0JA 2XNMA 5FQDC 4M69B 2I0EA 3DQXA 5DFPA 4FGBA 2WD1A 3BRBA 5GJGA 3MPTA 5IDPA 3R04A 4II5A 4BWPA 1CKIA 4CQGA 1G8SA 4BB4A 2WB8A 3BLQA 2ZM4A 4PPCA 3RPOA 4JBOA 4QMYA 4HGEA 4RZVA 3QL8A 3LQ5A 3DAEA 4XV3A 1X8BA 3GCQA 3RBWA 4NIFB 4CXAA 5CI6A 2CHLA 3R8MA 4G17A 4QPSA 3VS7A 5BYLA 4Z9LA 1W82A 4MBIA 5D7AA 3D15A 3G90X 4M8TA 2IN6A 2VTLA 4D28A 4C58A 5IQGA 2GS2A 4PMTA 4CV9A 3S0OA 4E1ZA 3Q6WA 2WMTA 3TACA 4DFXE 3KMUA 3O71A 2B1PA 4H58A 5HVYA 3LJ1A 2E2BA 3OEFX 3LMIA 2C6DA 5E91A 2XB7A 4ZMEA 3SC1A 3NIEA 1XKKA 3VULA 4BBFA 4JAJA 4QQTA 3LLTA 3TZ8A 2IPXA 4JBQA 2ONLA 3NAXA 4GU6A 2VO0A 4J96A 4MAOA 3QYZA 3TUBA 1VZOA 4IFGA 3RK5A 4HVHA 3IPHA 2W1GA 2VTHA 3ORKA 5HBHA 3R9RA 1NVRA 3UVRA 2QCSA 3V8TA 4O0VA 3ITZA 3A7HA 3OEZA 4B0GA 5HNIX 4GG5A 1I44A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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