3TUBA

Crystal structure of syk kinase domain with 1-(5-(6,7-dimethoxyquinolin-4-yloxy)pyridin-2-yl)-3-((1r,2s)-2-phenylcyclopropyl)urea
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
272
structure length
253
Chain Sequence
EVYLDRKLLTLEDKELGSGNFGTVKKGYYQMKKVVKTVAVKILKNEANDPALKDELLAEANVMQQLDNPYIVRMIGICEAESWMLVMEMAELGPLNKYLQQNRHVKDKNIIELVHQVSMGMKYLEESNFVHRDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLPVKWYAPECINYYKFSSKSDVWSFGVLMWEAFSYGQKPYRGMKGSEVTAMLEKGERMGCPAGCPREMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDV
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Tyrosine-protein kinase SYK
publication title Identification of Type-II Inhibitors Using Kinase Structures.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 253
sequence length 272
ec nomenclature ec 2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2011-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3tubA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3tubA01
3SX9A 1GIIA 1NVQA 4XUFA 3DBEA 2H6DA 3OC1A 5FTQA 1T46A 5LXMA 3RZBA 4EONA 5E91A 2OI4X 3IW6A 4YJPA 4H3QA 1JOWB 4L6QA 2QKWB 2WIPA 4CVAA 4L7FA 4EEVA 2IZTA 5F1ZA 4BGHA 4FV3A 4HVDA 1YXVA 3JYAA 3VS0A 2RFNA 2ERKA 4NCTA 5HD7A 1FGKA 3ORIA 2WMWA 1DI8A 4PP9A 3RKBA 3A8XA 3EKKA 3HECA 4FK6A 4TWOA 3C4XA 4D4YA 3DU8A 1WBOA 4E8AA 1TKIA 1XH5A 4O38A 5CSVA 4F7LA 4C38A 5HO8A 1R3CA 2QOKA 3E7VA 4FVPA 2PVNA 4TNDA 3OWLA 4QMMA 4F7SA 4AZFA 4BTFA 2O8YA 5M07A 3CTJA 3GB2A 5M57A 2XUUA 4GFGA 3UGCA 3F3WA 3QU0A 1M7NA 5AP4A 1OIRA 4NT4A 1V0OA 2B9FA 4NU1A 2ITPA 2CDZA 3EYGA 4FBXA 2GNGA 3I5NA 5J9LA 3ZH8A 1B6CB 5I9ZA 2YWPA 4D58A 5FBOA 3UBDA 2R3OA 3QCYA 4HGLA 4MXZA 3WE8A 3OOMA 4ERWA 4R77A 2XZSA 5HVJA 4ACHA 4ACDA 5JFWA 2BKKA 3A7JA 5DBXA 4KSQA 2EU9A 3R1YA 5CF4A 1MQ4A 1M2PA 4O86A 4FV2A 3Q60A 2IO6A 3C0GA 1ZMVA 5FEEA 3L9PA 2WOUA 4O7VA 3W10A 3C0IA 4EJ7A 3P7BA 2BAKA 4O21A 2R3GA 2HAKA 4AZWA 3UO4A 2H8HA 4B8LA 3HV6A 4G5JA 4C35A 3ORLA 1R0EA 1Z57A 1FBNA 4BCIA 5EQYA 2IVVA 3NUPA 2WZJA 3VBXA 1SVEA 2XCHA 4V0GA 5ACBC 5K5XA 4BCJA 1U54B 3QTRA 3QZFA 1IG1A 3P86A 4O0RA 3EQCA 4QNAA 5L8JA 3G0EA 4JX3A 4QP8A 5AUUA 1W83A 5CANA 1G8SA 1U5QA 2KTYA 2QVSE 3KXHA 4JOAA 4BKJA 4QP2A 4QYFA 4F6UA 4JT3A 4IZ5A 4S33A 2GS2A 3FMLA 3UNJA 1NW1A 3R7GA 2PZYA 4CYJA 2WELA 1U46A 3QCXA 4UZDA 4MQ2A 2WD1A 3TV4A 1XH7A 2VGPA 3OXIA 3QD4A 5EYMA 4DHFA 4NL0A 3DOGA 5LARA 5B2LA 4MK0A 3FLZA 1GNGA 3NUAA 1VJYA 2VWYA 3NPCA 4H58A 3WZKA 4WHZA 2OWBA 4BIBA 2P2HA 1W84A 2XK9A 1FINA 5LVLA 4GFOA 4GMYA 4H3BA 3WYYA 2WMVA 4KB8A 5E1EA 4DGGA 4ZEGA 4FTAA 4LMUA 4OBOA 3VQUA 4S31A 5M4CA 4RIXA 1JKSA 3GI3A 1P14A 1WBSA 4O91A 5DWRA 5E8VA 3AMBA 4FNWA 3L9MA 2Y4IB 4X21A 2P3GX 1SNUA 3VF9A 3W2CA 4DFBA 3QQKA 3EQFA 3QRUA 4EH9A 3C7QA 3DJ7A 4Z3VA 2H9VA 2OH0E 5IH4A 3FYKX 3PSDA 2FA2A 3OCSA 5JN2A 5KUPA 4PNKA 4QPSA 1YXUA 3F5PA 2NO3A 4Q2AA 5IQEA 3DK7A 5EHYA 3F7ZA 4D0WA 3E7OA 5FQDC 5BMMA 4JBVA 5GNKA 3H30A 4EC8A 3MIAA 3GXLA 4UMPA 3DBFA 2PPQA 4C4FA 4CFUA 2Z2WA 4M67A 4QQCA 2OO8X 1YHSA 2ETKA 2QR8A 2XBAA 2Z7RA 2XNPA 3IOKA 2VX3A 3EZVA 1Y8YA 3EH9A 5AP7A 4DITA 3EFJA 3RNYA 3TZ9A 2YM5A 3AC4A 2VRXA 3Q5ZA 3VAPA 2ZVAA 4WOVA 1S9IA 2PVLA 2XNNA 3VULA 2X4ZA 4FTCA 5ACKA 2CN5A 4I21A 4UYNA 4K0YA 4QMVA 4NYEA 2JBOA 2OGVA 2XIRA 2ZM4A 3BE2A 3FMJA 3BLQA 3KN5A 2HOGA 3LJ0A 3QQUA 1BLXA 5E1SA 5CASA 5F9EA 5BVWA 4A06A 5CSWA 4BI0A 5HORA 4TYEA 3OFMA 1OIYA 2X39A 3QF9A 4FTQA 4J7BA 2X7FA 2Z8CA 2C4GA 4XOZA 3OG7A 1FVTA 4JX7A 3GBZA 4FSQA 5BYLA 4FKIA 2J4ZA 5BPYA 3ZDIA 3NEWA 4X2GA 3AMYA 3NW7A 4X6QC 1NVSA 2C0TA 4K2RA 4UALA 5EM7A 1P2AA 4C58A 3OW4A 2E9UA 4C33A 1PJKA 5KX8A 3PVBA 2YM6A 1F3MC 3MH1A 1UWJA 1WBTA 2RFDA 4OBPA 2NNWB 5GJFA 1Z5MA 4CKRA 2YWVA 2X7OA 3HV5A 2HXQA 3HLLA 3LFDA 3C5UA 1YXXA 3KCFA 3QD0A 2W9FB 3C1XA 4M15A 4C02A 4R3CA 4PPAA 2OIBA 4XRLA 4DFLA 4FIJA 5HHWA 3ZBXA 2WO6A 2QU5A 2HYYA 4DG0E 2VTIA 5DR9A 5BUJA 2YDIA 2IZSA 2J0IA 3UQFA 3ZLYA 4YSMA 3NVKI 5FRIA 2XK8A 3FI4A 5DGZA 5J1VA 4ZJVA 3CC6A 2JKQA 4QMPA 3BBTB 3QTIA 3UJGA 3VS1A 1M7QA 4BDGA 4F1TA 5HLPA 4ZS0A 3ORTA 1ZYCA 4E5WA 4YP8A 5TE0A 4BF2A 3CTHA 1QPDA 3Q9YA 5A6NA 5D10A 2J5EA 2ONLA 3OROA 3G9NA 3TUDA 3EWHA 3IW7A 3BV3A 3G33A 1NY3A 4H3PA 2PUPA 3AXWA 4JBQA 4ORKA 1M2QA 2IW6A 4AN9A 3CD8A 1WVXA 3R02A 4CFNA 1WBWA 3II5A 1A9UA 4FZ6A 3V01A 3NAYA 5JGBA 2Y4PA 4G3EA 3JPVA 3ZO3A 5AP3A 5A6OA 1YOMA 3QLGA 2PMNX 3MTLA 3NCZA 3QQFA 4G2FA 4BICA 1K3AA 3F6XA 3OS3A 3LJ2A 5D7VA 2IPXA 1I09A 3O7LB 3KREA 1NT2A 4YMJA 3R7UA 4U8ZA 2X7GA 1YWVA 3V5JA 4U41A 3UOKA 3ZUTA 1H01A 4D1XA 5CAQA 2ZDUA 3COIA 5EYKA 4X2JA 3RAIA 5DT0A 3FDNA 3ULIA 3BQCA 5J7HA 4JDKA 4DT8A 5JRQA 5EQEA 2ZV8A 1XWSA 3SG9A 4V0GB 4AQCA 5A4LA 4NH1A 4YNEA 3DQXA 4USDA 3BU3A 1B39A 3B8RA 3RJCA 3FL4A 3H4JA 2JDRA 1OL7A 2AC3A 4YJQA 5B2MA 1K9AA 3O50A 4G1WA 5D11A 5BUEA 4PDYA 3Q9XA 4FVQA 1JPAA 4L67A 2VX0A 4AW2A 3ZUVA 3FY0A 5KO1A 4FTTA 2C3JA 1VYZA 4QMSA 4QP4A 2XH5A 4RMZA 5FLFA 4FSNA 5L2TA 2CKPA 2CGXA 4ZLYA 4YTIA 3KXMA 5AX9A 2Q83A 4KD1A 3NSZA 3HP5A 2PVJA 3DKOA 3UO6A 4BZDA 2XNBA 3MFUA 1NVRA 4Y5HA 3GT8A 4XX9A 4ZSJA 3RCJA 3RK9A 3OBJA 4O27B 4BB4A 5HLWA 4FV0A 3AT4A 3R7YA 1V1KA 3NW5A 3AC8A 3QWKA 1WFCA 4GUEA 1YDRE 1OIUA 2J5FA 2I0EA 2XVDA 3AC3A 4PP7A 4FE2A 4AXAA 1WMKA 4XS2A 1ZY4A 2B9HA 2JDVA 4ZTLA 1APME 4GV1A 4YHTA 5ANEA 2V7OA 4E6CA 3FL5A 5C1QB 5I4NA 4GK3A 1JAMA 5CQUA 4L01A 3O2MA 4FYOA 4XNEA 4G31A 3WI6A 1GZ8A 1KE7A 3QX2A 5CENA 4W4WA 3TXOA 3BRBA 3ZONA 3LFFA 5HE3A 1OECA 1PXNA 2EVAA 2QOBA 3CP9A 3D5WA 3LMGA 4AT5A 3A61A 4KABA 3O8PA 5ANOA 4P90A 4JXFA 4DEAA 4QMUA 4JVGA 5A14A 4R1YA 3PJ2A 3BYVA 4IC8A 3FKLA 2UW4A 3BEGA 4BDKA 4D2SA 4D28A 3E8DA 1UU9A 2FSMX 4RJ3A 1MP8A 3NUNA 4AE6A 2EUFB 5EYCA 4GVJA 3AC2A 4GT3A 2W06A 5F20A 3NMUF 4A07A 4AZSA 5AAEA 2GMXA 2BDWA 1BL6A 5BVDA 4HPUE 3VS2A 2QO9A 4GYIA 3ZMMA 3HYHA 1OITA 3LCKA 3U51A 3RINA 3TUCA 2VWVA 1PKGA 4APCA 1MRVA 4AGUA 3R8PA 2VN9A 2R3HA 5HG9A 2IW8A 4TW9A 5HIBA 4I94A 3IGGA 3C51A 1PF8A 3QGWA 2X0GA 5M55A 5EYDA 4XYFA 3O7LD 5AUZA 5IA5A 3ZZEA 4YGAA 4XV3A 1Q8ZA 3CBLA 3FMKA 2YA9A 5HQ0A 3ZO2A 3PJ1A 5LWNA 2GNLA 2CCHA 2J50A 3QQJA 4CMUA 2PULA 1ZOEA 2VZ6A 4OTDA 3QRTA 4M7IA 4OR5A 2F2CB 2WQBA 2XK3A 3AGLA 3OHTA 4FKOA 4JRNA 3H9FA 4R1VA 4S30A 4BIEA 2HWOA 5HBHA 3TDVA 5A4EA 3RCDA 1KOAA 3P79A 3L1SA 3MH0A 1UKIA 3S3IA 3MN3A 1OKZA 3PFQA 4UY9A 3O23A 5ANGA 5HGIA 2C5NA 3CLYA 4K11A 5A9UA 5DHJA 4RWJA 1Q5KA 3T3VA 5I9VA 1OBDA 3NUXA 4CEGA 3RK7A 3ZLXA 4E7WA 4RQKA 4UEUA 4IWPA 4OAVB 3ORXA 3EYHA 1YOJA 3NS9A 5EW8A 5IQBA 5B7VA 2JKKA 1OI9A 4J1RA 3IDPA 4LUEA 4DA5A 4NWMA 2QO7A 2WTKB 4PDPA 2GCDA 4GS6A 2Q0BA 5FXSA 3FQEA 4F9BA 3NLBA 2O3PA 4F9YA 2B54A 3UPXA 5CF6A 2C6OA 3PA5A 1J1CA 4XJ0A 3T9TA 4GW8A 4DF3A 5EDRA 3E93A 2ITXA 3Q4TA 4RIYA 4IB0A 2IN6A 2QD9A 2UV2A 3TJDA 2FB8A 4C8BA 5BYZA 4EHVA 3HZTA 4I24A 3T3UA 2PVFA 4KKEA 2CGWA 3ZZWA 3MYGA 4O7TA 2WQMA 3LFEA 1DS5A 2W7XA 4JS8A 4MCVA 1UU8A 1YKRA 4BHNA 3FC2A 2WTIA 4I93A 4O81A 1Q8WA 4ZZMA 3OXZA 4DN5A 1BMKA 4N4SA 4ZMEA 3BHVA 4DEGA 3R0TA 4K1BA 3ZRKA 4ZTMA 1XBBA 5LVMA 4EZ7A 2OU7A 3Q32A 3V3VA 3WIKA 4FT7A 3VW6A 2C3LA 4QQJA 3VUMA 4XP0A 4XOYA 3UIMA 3GENA 5ITAA 1W7HA 4WNMA 4EOIA 2WEIA 4ZTQA 3MVHA 2BMCA 2FUMA 5FEDA 4MXCA 4E93A 4MBLA 3ELJA 2C30A 2VO3A 5H8BA 1KUTA 3ODYX 4NTSA 5DIAA 3GU4A 4L7SA 2JFMA 2VWIA 4NTTA 2QHMA 4GEOA 1REJA 3QTZA 3M2WA 4J8NA 2WMUA 4OTRA 3BWJA 4KBCA 2GU8A 2ITTA 5C01A 2YM4A 4RVTA 2PZIA 4RZWA 1PKDA 5HIDA 3LZBA 3NVMB 3TNIA 4E4MA 2QOFA 5FD2A 4FGBA 2XIYA 5CNNA 3ODZX 4YTHA 2X4FA 2CGUA 3FXXA 1GZNA 4GFMA 4P4CA 3O0GA 5TT7A 4CXAA 4OTHA 1HCLA 1JSUA 4L52A 3VVHA 4TT7A 3R8MA 3RAHA 2PMOX 4KBKA 2UW7A 3E3BX 3PYYA 4CYIA 4BDDA 5HEZA 4KIKA 4FEWA 5JFSA 2ETRA 3EL8A 5HBEA 4IADA 1ZMUA 1A06A 2W96B 5I3RA 4XG8A 3KMMA 5CF8A 4L46A 2C5OA 5D9HA 4AP7A 5IMEA 2XA4A 3UOJA 4EOPA 3KRRA 1BUHA 2PUNA 4QYEA 4OAUC 3LW0A 4RFYA 2OJJA 5ETIA 3TNWA 4AGDA 4PMMA 3BKBA 2FSTX 2X9EA 4HPTE 3Q4UA 5IA0A 2VTSA 2YCSA 4GU6A 3W32A 4EYJA 5TR6A 4FZAB 2WMXA 4NEUA 5CQWA 5CVHA 1AD5A 3OCTA 5AP1A 4N70A 4QP6A 4U42A 4WNOA 5E92A 5HNBA 4M0YA 3COHA 2W1DA 4MBJA 3WF7A 4BCPA 4FV6A 1JBPE 1Q3WA 3VBQA 1X8BA 3NYNA 2X2LA 2XCKA 4DH8A 4O7LA 4CV9A 4E6QA 3S95A 4NJDA 4FGRA 5CU2A 4U80A 4RX7A 4FVRA 4MD7E 3BIZA 4GK2A 4I5CA 3FE3A 3EN7A 1H8FA 3DJ5A 3OWJA 1BKXA 1PMNA 3JVSA 1CKPA 2RF9A 3L8SA 3R83A 2YN8A 4IJPA 4YZ9A 3F3TA 2PSQA 4O6EA 3QTSA 4WBBB 1IASA 4BWKA 3DQWA 4ENYA 4C7TA 3DZQA 4BL1A 2IJMA 4RQVA 4RVMA 2BHHA 4HZRA 3UVPA 2OZAA 1ZYLA 3C4EA 5IA4A 2ZJWA 3DAKA 4KUJA 3Q6WA 3G6GA 4OTPA 3QQLA 4IVCA 3MDYA 2UZUE 3GCVA 4ZSGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3TTJ A;  4ACG A;  3UIX A;  3P4K A;  1J7I A;  3BZ3 A;  4D5K A;  5AP5 A;  4IJ9 A;  4AS0 A;  3D9V A;  1DM2 A;  4BDI A;  2R3M A;  3RPO A;  3QHR A;  4HZS A;  4YZB A;  3POO A;  2AEG A;  3MPA A;  1YWR A;  4QPA A;  4EQU A;  2I7Q A;  1OL5 A;  2QHN A;  4GG5 A;  4H05 A;  3OOG A;  2G15 A;  1O9U A;  5EI2 A;  3Q9Z A;  5K9I A;  2VWU A;  3WZJ A;  4ZS4 A;  4FTU A;  3HV3 A;  4O0U A;  4TWC A;  4AN2 A;  2BIK B;  2VAG A;  4FZF B;  4RA5 A;  5IU2 A;  4FT5 A;  2DWB A;  4M8T A;  3EKN A;  2ZMD A;  3PP1 A;  1VEB A;  2ZM3 A;  3PXF A;  4RIX B;  2P55 A;  4BDE A;  4CMO A;  3F3U A;  1G8J A;  4EHE A;  2HK5 A;  2Y4I C;  3AG9 A;  1GAG A;  2BTR A;  3AT2 A;  3PRI A;  2UW5 A;  2NRY A;  3A7H A;  1J7L A;  3MH2 A;  3AOX A;  2YZL A;  5LVO A;  2I0Y A;  3AC5 A;  4ZSL A;  3CY2 A;  4FKT A;  4CFV A;  3VHE A;  4ZJI A;  4I6Q A;  3W2Q A;  3BV2 A;  3GU8 A;  2WTC A;  3H9R A;  3E92 A;  2QLQ A;  4IWQ A;  5HVK A;  3MVL A;  2Y8O A;  4YUR A;  4AQK A;  3FWQ A;  4BBE A;  4QMX A;  3PUP A;  1R39 A;  4CTB A;  4MBI A;  4BKY A;  1JSV A;  4YLK A;  1PXI A; 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