4GW8A

Human proto-oncogene serine threonine kinase (pim1) in complex with a consensus peptide and leucettine l41
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase pim-1
publication title Selectivity, cocrystal structures, and neuroprotective properties of leucettines, a family of protein kinase inhibitors derived from the marine sponge alkaloid leucettamine B.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 273
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-09-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4gw8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4gw8A01
2DYLA 4GIHA 2A1AB 4U0IA 3BWJA 2C30A 4RZVA 5IUHA 1YI6A 4DGOA 2OFUA 2JDSA 4F1TA 2XNPA 5F95A 4D2VA 2AUHA 3C4WA 4R3CA 4D2RA 2H96A 4JLCA 2OW3A 4DH7A 3HZTA 1FVRA 2J4ZA 5I9VA 5FD2A 4NM0A 3RZFA 1PKGA 1XBCA 1ZYSA 4FIIA 4BN1A 3PG3A 4Z9LA 2BRBA 4MNEB 2IW8A 3RWQA 2VZ6A 4BVUA 2FSOX 3R71A 5JN2A 3PE1A 2CNUA 2GFCA 4BDHA 4EQMA 3F5GA 5ANOA 3D5XA 1OPLA 3EN6A 4LOPA 5E8SA 3ZHPC 4O0YA 4D9TA 3JY0A 4CFXA 1YDSE 3TNHA 4D58A 5KBRA 3SW7A 4QP3A 4R1VA 3B2TA 4B4LA 3IOKA 4JAJA 5DR9A 4EK4A 3QX2A 3RAKA 3UQGA 5AFVA 3LXKA 4BTFA 3DZOA 1ZYLA 2EVAA 3W2SA 4QQCA 4AZTA 4Y83A 4FEXA 2C6MA 4YJPA 4O7WA 4OT6A 4GCJA 1NY3A 2I0VA 3QZFA 2IZTA 3NIZA 4I0RA 3DOGA 3KK8A 1GIIA 2FGIA 2ZB0A 2XH5A 3ORPA 4K8AA 5CXZA 4G16A 2BDJA 2XIYA 4CZTA 4DBNA 3D94A 3ALOA 1W0XC 1YDRE 5HVJA 3LCTA 3GCPA 3NW7A 2QOIA 4GG7A 4IJ9A 4RG0A 5DWRA 5HG7A 4BZDA 5C4LA 1JQHA 4BFMA 1XKKA 2R3KA 3E3BX 4YR8A 4YC6A 2XYNA 2XVDA 3BHYA 4FZ6A 5DEYA 3A4OX 3HRFA 4EZ5A 5AAEA 2O65A 3LCSA 4TRLA 4C58A 3MH2A 3PZHA 3UO4A 4YJSA 2X9EA 3VHKA 1CSNA 5A6OA 5I0BA 4PNIA 3SD0A 2YDIA 3HUBA 2QO7A 4Q9SA 2I0EA 1B39A 3UE4A 1MQ4A 1U54A 3F3VA 4PL5A 4ZJIA 4BI2A 4YHFA 5JFXA 2PUUA 2PZIA 2UVXA 5IKWA 3DQXA 4FTQA 3EB0A 4X3JA 5LVOA 1Y91A 1XWSA 4BI0A 3HMNA 3GFEA 4ZZMA 3FEGA 4E26A 4EOIA 2WTJA 4WT6A 1BMKA 5LMKC 2WHBA 4TZRA 3SOCA 1GOLA 3CEKA 3ZUVA 3EMGA 2VTRA 4AZFA 3DXQA 2P0CA 4N4SA 2BRMA 2W7XA 1JKLA 2RF9A 1OL7A 3H4JA 3ORMA 2QKWB 4M0ZA 3QA0A 4QTAA 2X9FA 3OROA 4TYGA 2QOKA 3QXOA 4BDBA 2QU6A 4FT9A 4KINA 4HGLA 3UG1A 5IQEA 2JD5A 2UZBA 3A4PA 4MD7E 4BCOA 3RPRA 4D4RA 3FPMA 5IA1A 1DS5A 4IZYA 1KE5A 5K5NA 4UEUA 5DMZA 4JG7A 4AT3A 4GU6A 2DUVA 3IKAA 3MH1A 3ACKA 4D9UA 4IWOA 5GJFA 4GS6A 4Q2AA 2W1HA 3GU6A 3KQ7A 2UZDA 3LE6A 3OY1A 4YZMA 5AA9A 4PDPA 4CFVA 4DLIA 1ZMVA 5ANJA 4MEDA 4IZ7A 3Q2MA 4FV0A 4Q5EA 4JIKA 1PYXA 2VWYA 4QMTA 5FM3A 3I60A 3IOPA 2BAJA 2BKZA 4KSQA 3T9TA 3C51A 2JKKA 5HQ0A 4RQKA 3C5IA 1IA9A 2WMSA 3RHXA 3CD8A 4JR7A 5JZNA 5EI8A 4MX9A 5FLFA 4UXQA 5CEIA 5KBQA 2Q0BA 2ZV8A 3O7LB 1AD5A 3UYTA 5L2TA 4A4LA 4X2FA 5IH6A 5J79A 3VQUA 4KABA 3C5UA 3EN9A 3I0OA 4Y73A 2X39A 4BI1A 4MNFA 4Z3VA 5E91A 1ZLTA 2B4SB 3FDNA 4G5PA 5G6VA 3VIDA 1H24A 1ZY5A 4ZJVA 4J99A 3ZBFA 3GU5A 3E87A 3W55A 4F1MA 2ETMA 5GZ8A 3H30A 5AP3A 3KRJA 1MRYA 4FIFA 4KIQA 4DEGA 4L3JA 1SMHA 4Y72A 3E8EA 5CY3A 4DFZE 5IQFA 2E9PA 3GU7A 1BYGA 3N4VA 3RALA 1MRUA 1ZYDA 4FV7A 2W1FA 4TYEA 3W32A 4UB7A 5AA8A 2Z7QA 3II5A 2AC3A 1XH4A 3BKBA 4CT1A 3QBNA 1DAWA 3I6WA 3GCVA 4ALUA 3QYWA 4O7SA 4CFWA 1Y6BA 3KEXA 4ANSA 4FKLA 3FV8A 3JUHA 4CRLA 1KE6A 4WUNA 3ZMMA 2C69A 3EFKA 4ANMA 3QTQA 1UNGA 4ZP5A 4MHAA 5CEKA 3C13A 4PP7A 3DNEA 2C5YA 1CKIA 1OL5A 4FV4A 3L8PA 5HKMA 4DGLC 4LRKA 2OO8X 5JGDA 5LCKA 4F0IA 4I0SA 3K5UA 4EC9A 4KKEA 4A4OA 2WKMA 4K9YA 4GFOA 2OZOA 4KA3A 4RBLA 3R8PA 5GIOE 4DA5A 4LMNA 3G5DA 4ZSGA 5E9EA 4UMPA 5DIAA 4J97A 1BL6A 2C47A 4G6LA 1QPCA 1YHSA 4JQ8A 3QWJA 3RWPA 3VJNA 3FPQA 1YW2A 1G3NA 2HYYA 3A8XA 4LRJA 3E7VA 4CKRA 3UDBA 3SRVB 2QLUA 3EIDA 5IQHA 5HORA 3VBQA 3ACJA 4HCVA 3EN5A 2G1TA 5CI6A 4C4HA 3P78A 2J0JA 3SLSA 3HL7A 4ENXA 5HIEA 4RJ4A 3OT3A 4YZ9A 4HVIA 4G1WA 3BGZA 3NAXA 4CFFA 3REPA 3LCKA 2C3IB 2YZAA 2G2IA 2GHLA 5DYJA 3TV7A 4DFUA 2QOFA 3P86A 5GZAA 4D28A 3F61A 2RIOA 3R1NA 3WF7A 5CAPA 1YDTE 1JKKA 1XBAA 2YCSA 4C34A 4EH3A 5CANA 4PL3A 5BPYA 3I1AA 1WBOA 2BR1A 3KKVA 3GFWA 3DQWA 1LUFA 4ANOA 4FT0A 1L3RE 3FQHA 3NX8A 2B9IA 3CD3A 4S32A 4ZAUA 4H05A 3O8TA 4NJ3A 4JXFA 4LOQA 2EXMA 1R0PA 3FKOA 4E93A 4CCUA 3L9MA 4EUTA 3KXXA 4EJ7A 3BE9A 1GZ8A 2I1MA 3WZUA 2R3LA 3E92A 3NCZA 2QD9A 3WYYA 4D2PA 1P2AA 2BAQA 4KIKB 5HNIX 4HGTA 3VF9A 4X2NA 5HO7A 3G15A 3ZUUA 3KU2A 2FA2A 2FO0A 5HE3A 4I21A 2JITA 1U5QA 4WNPA 5IUGA 5KX8A 3VW8A 2ETKA 5FEEA 3OF0A 2J50A 4IIRA 4K18A 4KIPA 3TN8A 3GOPA 3ENHA 3MFTA 1E1XA 3QUPA 4UBAA 2RL5A 3PRFA 5EG3A 1YXSA 5IMXA 3BLRA 3HA8A 2WOUA 3CTJA 5KMOA 2R9SA 2R7IA 3JR1A 2QOLA 4I4FA 3F3WA 5CAUA 1SM2A 3KL8A 3T3VA 1ZYCA 2XK6A 4NIFB 5FTGA 5IQCA 2F7XE 2XIXA 3MGYA 2XF0A 3HRCA 4K33A 3SV0A 4E6CA 4F9YA 1A48A 3OVVA 4KBKA 4OTHA 4QD6A 4YZCA 4M3QA 1JVPP 4X6QC 5H8GA 2WTDA 4RIYB 2OZAA 4XRJA 3MVJA 4OTIA 5LQFA 5JQ5A 5E8WA 5LARA 4O2ZA 2WQNA 4U6RA 1PMVA 3WBLA 4EH6A 3SKCA 3PJCA 5KE0A 1JSVA 1J7UA 2IG7A 2W0JA 2PVMA 3R9NA 3ZC6A 4QP8A 3MN3A 3KN6A 1ATPE 4HZSA 3PP1A 3GP0A 3OWPA 5M07A 2HY0A 1U4DA 2C6TA 4XX9A 4E20A 5EW9A 4WBBB 4RC3A 4A9SA 1GY3A 4ANBA 1VYWA 2OG8A 2RFEA 2YIRA 4J71A 4W4WA 4IVDA 5EOBA 3ORXA 2Y4PA 3NVMB 4M84A 3DZQA 2VTNA 3QC9A 4A4XA 3MESA 2HZIA 2BUJA 4RT7A 4WD5A 4FICA 4O1OA 4IB0A 2WU6A 2YDJA 4CD0A 2XS0A 4KS8A 1BLXA 4G3EA 3MPTA 2P2IA 5DR2A 3EFLA 1NA7A 3IGGA 3ORZA 5CNNA 3V5PA 1YHWA 2XNBA 1XH7A 2VX3A 1UNLA 2C3LA 3LFBA 3DXPA 4AF3A 3MWUA 1PJKA 5AP1A 2XCKA 3GQLA 4XG6A 2JEDA 4C3FA 4CCBA 3NIEA 4RX7A 3QTIA 3A7FA 3H0YA 4H3QA 4HVGA 2QC6A 5KNJA 3R8VA 5BVDA 5C4KA 3UQFA 3TWJA 3BEAA 3ENMA 4WUAA 4GG5A 2E9OA 4XHKB 3W16A 3RI1A 4OT5A 2R64A 3QCQA 4MXYA 5KMLA 3F3UA 5EHLA 2OKRA 2ONLC 4B8MA 4S34A 4M14A 4KAOA 5AUYA 2XNOA 5C26A 5JRQA 4DTAA 4BWPA 5AUTA 3C4FA 3PJ3A 3L1SA 4ALVA 4NSTA 4TXCA 4X3FB 5EKOA 2R3QA 4U40A 2ITNA 1SVGA 4D0XA 5LJJA 5LCJA 4BKJA 3NSZA 1GNGA 3D83A 5BVNA 1WCCA 3IDPA 3EQDA 3PUPA 2VO7A 3P7BA 3ZUTA 2XMYA 3MH3A 5J5TA 4BZOA 4P90A 4AFJA 3ZRKA 2CGUA 4RFYA 2Q83A 3ULIA 5HX8A 3KULB 4FK6A 4USEA 4FTJA 5HESA 1ND4A 1U5RA 1WBNA 2A19B 2DQ7X 3QRTA 4AW0A 3NUYA 4ZTLA 4EK5A 4CG9A 2OJIA 2I7QA 1Z9XA 4DFNA 3EQPA 3KXNA 1Q3DA 4MQ2A 3WZKA 5FP5A 1JWHA 2GNIA 5LMBA 4ZIMA 1TQPA 1PXKA 2CDZA 3LPBA 3HDMA 4YJTA 4GKIA 3CBLA 1UWHA 2ITQA 1H1PA 3CE3A 3TL8A 3IK3A 1IRKA 4I94A 3KCKA 2WMQA 3ZLWA 4BC6A 3MTFA 4J98A 2BZIB 2W5HA 3BU3A 4U79A 1Q5KA 2Y9QA 3NWWA 5CEQA 4FTCA 4RQVA 2X81A 4OAVB 4JVGA 3BHVA 2X4FA 3I79A 4YO6A 3TUBA 4A9RA 4BDFA 2PMNX 2PE1A 3DK6A 3ZTXA 2GCDA 3TM0A 4HCTA 2JKMA 3PY0A 3A60A 4RJ5A 5CI7A 3VHEA 1G8AA 3KC3A 4AP7A 5ANGA 1YVJA 4FSYA 4IMYA 3K2LA 4C0TA 5FDXA 3DB6A 1FVTA 2J51A 3Q53A 4WNKA 3RM6A 4I6HA 4C35A 4FSUA 4QP7A 2WD1A 2NRUA 4Y8DA 4FV8A 3DXNA 2J90A 5DT3A 5AR4A 4FK3A 3R8MA 4S2ZA 3QD2B 2IZSA 4M68A 3VNTA 3RP9A 2CKQA 3EN4A 5CEMA 3HV5A 3ORIA 3MDYA 2X2LA 4O0XA 5DVRA 4PPAA 4M7IA 3RGFA 3Q5ZA 2C1BA 3MY0A 3ZSHA 3PJ2A 3GC9A 3NUNA 5DFPA 2X4ZA 3G0EA 4AACA 3FLSA 2F2UA 4GUEA 4I6BA 4HGEA 3OBGA 4XV3A 5EHYA 4TL0A 1H1QA 3QD0A 4S31A 5K4JA 3OCGA 4QQTA 4YJNA 5AMNA 2JKQA 4GIIA 3LMGA 4D5KA 3S1HA 4LL0A 4LG4A 5EM6A 4I5CA 3OTVA 5EDQA 3TNWA 2V5QA 3ANRA 3NNWA 3QQKA 3M42A 3VUMA 3WF5A 4BCGA 4FT7A 3LLAA 2VWZA 3C9WA 3H9OA 3E63A 3P23A 3QTXA 3TJDA 2YA9A 3GENA 3MS9A 3EFJA 3TZ9A 5TF9A 4MXZA 2R3FA 3R7YA 2YN8A 4CFMA 3PIYA 2A27A 4FSMA 4FKSA 2VAGA 3Q4ZA 2XM8A 3FHRA 3KMUA 4ACHA 2XM9A 3BU6A 4YJQA 5I9WA 1R78A 4IDTA 3JS2A 5LMAA 3FLQA 3NYVA 1YI4A 3COIA 3AXWA 2OXYA 3RAIA 5JFVA 1Q3WA 2UZUE 3OG7A 1DI8A 5TKDA 3ZC5A 4EL9A 3ATSA 5HICA 4R78A 3A2CA 4QMMA 1KE9A 2W96B 3KK9A 3UZRA 2ITVA 2C6IA 3TZMA 3TZ8A 1YI3A 4CQEA 1WAKA 3FBVA 3GCSA 4CTCA 2XBJA 1OBGA 4GL9A 4AW1A 4NT4A 4FL1A 4DCAA 3ORLA 1PXOA 3NCGA 5FG8A 2XB7A 1H00A 2W4JA 4U8ZA 5HEZA 4EH4A 1H0VA 2HIWA 4GVJA 2PE0A 2WU7A 4EOQA 5JQ8A 4IADA 2BZKB 3UP7A 3QTZA 4MXAA 3ZFMA 2HCKA 4TTHB 5EW3A 3W2OA 3Q32A 2YJSA 4HNIA 5BMSA 3FQSA 3U4UA 3COMA 3I5ZA 4QTCA 2BCJA 4PX6A 4V01A 2UW3A 3OTUA 3R21A 1A06A 3FMJA 3F66A 3NUAA 4D4VA 2E2BA 2P2HA 3HECA 4QMZA 1ERKA 3ZLSA 3T3UA 4MD9E 2KULA 1JOWB 2JFMA 2W4OA 2WMWA 1ZZLA 3BI6A 3AGLA 1UWJA 2X8DA 3LHJA 3QTUA 1F3MC 2EUFB 2X8EA 1FINA 3FZ1A 3DU8A 2WNTA 5EH0A 4ALWA 4DG2E 4E6QA 3ATTA 4DT9A 1XO2B 4O1PA 4MQ1A 5FTOA 5I3OA 5FXQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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