4I3ZA

Structure of pcdk2/cyclina bound to adp and 2 magnesium ions
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
296
structure length
295
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/cell cycle
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Price To Be Paid for Two-Metal Catalysis: Magnesium Ions That Accelerate Chemistry Unavoidably Limit Product Release from a Protein Kinase
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 91
structure length 295
sequence length 296
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2012-11-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4i3zA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4i3zA01
3DB6A 4K1BA 4S30A 5LMAA 4HOKA 3COMA 5DOSA 3VBWA 2CLXA 2GMXA 5C03A 2PVFA 1P4OA 5CU4A 4F08A 4DFUA 1XQZA 2KULA 3FMJA 5AUTA 1KOBA 4O0RA 3ORLA 3RCJA 4B99A 3OUNB 4C4GA 5JKGA 4O0XA 5CF4A 3QD3A 3O2MA 4HNFA 1JWHA 4C4HA 5AV4A 1H26A 3KXMA 4H3PA 4D4VA 1JKLA 2OFUA 4ZTMA 4DEEA 3DDQA 4TZRA 1Y8GA 4D9TA 2C1AA 2XYNA 3I81A 3ZEPA 4PRJA 4E73A 5A4EA 5IA1A 2YN8A 3E87A 3V5JA 3T8OA 3DBQA 3CY3A 2DWBA 2BKZA 1KWPA 1QPEA 5A9UA 2BFXA 3AD5A 3NEWA 4HGEA 4XLIA 5M4FA 1B38A 3QYZA 1ZYJA 2A1AB 4D4SA 2VTLA 2UV2A 4G17A 4WOVA 3MFSA 1XJDA 4PUZA 5FBOA 4DITA 3FHIA 1V0PA 3OY1A 4IHPA 3R0TA 4Y5QA 3SAYA 2C3LA 1B39A 1Q62A 2C6KA 3CJFA 1UKHA 3VUDA 4FSQA 4EKLA 3RAWA 5FGKA 4FG7A 5E1SA 4D2SA 3DKOA 3S00A 3W2OA 4XBUA 4AXAA 4OT6A 4CFMA 2WQOA 2CCHA 3OTVA 3IOKA 1UWJA 4GUBA 4PF4A 1Z5MA 3WF5A 4GT3A 5BVFA 2ITUA 2YDKA 3P86A 3R71A 4E6DA 1KV2A 2VN9A 5HO8A 4BDCA 3FQEA 2XBJA 2IVTA 3O7LD 3FJQE 1PHKA 4JIKA 4C0TA 1TQPA 5FTOA 1NY3A 4BRXA 5IQHA 4AE9A 1GAGA 4J71A 2CNVA 3MFRA 4G3EA 1Y91A 5HOAA 3F9NA 2PZPA 3KXNA 1XBAA 4CG8A 2XNEA 4I94A 2BDJA 1E9HA 3RZBA 3UYSA 4HVDA 4RPVA 3H30A 4G5PA 4QMTA 4B9DA 3PY1A 4CFFA 4BBFA 3ZM9A 2R0IA 2XA4A 5CVHA 4AFJA 4F65A 3A8XA 4QTCA 4X2JA 3WF8A 2R3KA 4K2RA 5CENA 2XRUA 4O38A 2JLDA 4MXCA 5AUYA 1PJKA 3MJ1A 1OZ1A 3G15A 4XS2A 4CNHA 2FB8A 4QNYA 4DH5A 3LFDA 4XG7A 2FUMA 1OPJA 1VR2A 3ANRA 4QP1A 2WU7A 3MH3A 2CKOA 3LMHA 4O21A 3U87A 3UIMA 4YNEA 4ZSEA 1A06A 2XK9A 4NL0A 3Q5ZA 2UW8A 1WVWA 2ZV2A 3FLQA 2OJGA 3QQJA 3PWDA 4QYFA 5EM6A 3QTWA 1XO2B 4D0WA 2RFNA 3OD6X 5J5TA 4UN0C 4KNBA 3WIGA 4OTRA 2XNOA 2ZB0A 2G2IA 4JDKA 5CSWA 4BDAA 3PY3A 5HLPA 3A4OX 4L46A 3R02A 4B4LA 4BWPA 5IG1A 4QP3A 5C1QB 4IC7A 4F1TA 2DQ7X 3CXWA 3PXZA 2X4ZA 4FSMA 4E93A 3TUDA 2WFYA 5CS6A 3GT8A 3PG1A 4EYMA 2XEYA 4K77A 3WYYA 2O8YA 2XJ0A 3ZBXA 3LMIA 2XIRA 5LQFA 3VJOA 5L6OA 5AM6A 4E4XA 2YM7A 5FM3A 4L67A 4UMRA 2XBAA 1GIJA 1W8CA 2NNWB 4NEUA 3UTOA 5A4CA 1W84A 4GJ3A 4K8AA 3QD4A 2YITA 4YC6A 4W4YA 1H01A 3ATTA 3LIJA 4F0IA 1KUTA 4ORKA 3QFVA 4HYHA 5DMZA 2VTTA 3L9LA 2XNNA 2RFEA 3LQ3A 2OZOA 1YXXA 4ANNA 4QYHA 3PSCA 3QGWA 2UVYA 3RKBA 2PZYA 2RSVA 3IW7A 4E4MA 1Q8ZA 4FTQA 1FVRA 3P7AA 4FYNA 4JRVA 4FOCA 5CTPA 1JOWB 3SRVA 4BCGA 4A9TA 4BDGA 5AP1A 4J53A 2B9HA 2HY0A 3BX5A 1WBPA 2QOFA 3OMVA 4AA0A 5CI6A 4CXAA 3NSZA 3UIBA 4DTBA 3SGCA 2I6LA 1P2AA 2HOGA 3NYOA 3VBTA 3BWFA 1XHAA 1Q24A 3HRFA 1U5QA 5EG3A 4FKJA 2XK6A 3F5UA 4RX7A 4CTBA 3R00A 3DDPA 3GCSA 4LV8A 4W4WA 5AAFA 4D2VA 4F9BA 2XNMA 3VUMA 4V05A 1HCKA 4XEYA 2QHNA 4EH8A 3EN5A 4FIGA 5JQ8A 3BYVA 1KV1A 3QBNA 4BDIA 2GDOA 2UVZA 5HNBA 3R8MA 4F0FA 3I0QA 2ZM1A 3W32A 5D1JA 3UJGA 3VQUA 2Y4IB 3D7ZA 2JEDA 4YJPA 3QA0A 5ANIA 5E8SA 2C6TA 4IC8A 5DBXA 5ETFA 4Y73A 3MB6A 3RPYA 1J7IA 5T6KA 2QOIA 4ALVA 4U97A 4ACHA 5HE2A 2EWAA 2Z8CA 4GK2A 4CMUA 2CKEA 4NTSA 4IDVA 4WHZA 1DAYA 4FX3A 3O8TA 3ZZWA 2JIVA 4HPTE 2ITQA 4EK6A 3GU4A 4E5WA 1UWHA 2J0MB 2VUWA 4TW9A 2JIIA 4ACMA 1ZRZA 4L52A 2FVDA 1H0WA 4GT5A 2KTYA 4O7ZA 3EMGA 4I5CA 2PVYA 2VWXA 4RX8A 2BZIB 5CANA 3DXNA 4D4RA 4FV4A 4GIHA 4E3CA 1BX6A 4AAAA 3MJ2A 4XG3A 2VTOA 2CGUA 4FEQA 1BL6A 3ZSGA 2QOQA 4FKGA 4HVSA 3L9PA 5CYIA 4II5A 1W7HA 5CXZA 3FV8A 4YJNA 4JR7A 1UNGA 2WMBA 4BC6A 4GJ2A 2X6EA 2C6IA 2NO3A 3MV5A 1YOJA 4HPUE 3WE8A 4ZY6A 3PXFA 5BX0A 5BMMA 3ZO1A 5G6VA 3CS9A 3W2RA 3V01A 5IDPA 4CFVA 3PJ2A 4RIYA 3E8CA 4S34A 2G01A 3R7OA 4BIDA 5A54A 3VWAA 4AA4A 1XH5A 3GOKA 4YJVA 5HX6A 3SQQA 5IUHA 4O84A 2ESMA 4YTHA 4FKWA 4E6QA 4PPCA 4TNDA 3UNJA 4O7YA 2V22A 3ZLSA 1H1RA 4TWCA 3IONA 1ZYSA 4BCFA 2BAKA 5EK7A 4RVTA 2C3KA 4W4XA 3ZMMA 2OJFE 3QTUA 3E93A 4RRVA 4O7NA 3SV0A 3JXWA 2WTJA 3NCGA 3IOPA 4FT9A 4IZYA 2PSQA 4MBLA 4B0GA 4FZAB 2HYYA 4H3BA 5C4KA 3R9DA 1OUKA 4C33A 4D1SA 2XKDA 3Q60A 4UWBA 3CLYA 4RA4A 2F4JA 2RF9A 2HK5A 2YERA 2DS1A 4HCVA 2YEXA 4N57A 3DPKA 4CFNA 4H3QA 4F9CA 4IM3A 2YACA 3VS4A 4CYIA 1DAWA 4KD1A 1XR1A 5A6NA 5JT2A 2QURA 3U4WA 4AUAA 5AP5A 2G2HA 3G6GA 4DA5A 1U59A 3NUXA 4GYGA 1CKPA 3R8ZA 2I0YA 3AOXA 2WOUA 3F2RA 1J1BA 1ZXEA 2H34A 2GS6A 2UW0A 4FKPA 2J2IB 4M67A 3NVMB 4YZCA 5K0KA 4ARKA 3P9JA 5LJJA 3ZFXA 2PVJA 4L3PA 4EBVA 3B2WA 1QPCA 3QCQA 3HP2A 4YLJA 2F7ZE 3PE1A 3RAKA 3BBWA 3GU8A 4JNWA 3CBLA 3FUPA 2XK3A 5HE0A 2C6LA 3R7IA 2YIXA 3V5LA 5EYDA 3OT8A 3E3BX 2W1EA 3WARA 3UMXA 2WZJA 3RBWA 3IDPA 2R2PA 3R7YA 2QODA 4MXZA 4RGJA 4YZDA 5AUWA 2YIRA 1PW2A 3SOCA 4EOPA 4O22A 2VGOA 2W1FA 5M4CA 3TUBA 3QCSA 4JOAA 3FI2A 2VGPA 4R5SA 4N0SA 2XIZA 4MBIA 3ORMA 4U5JA 2J0JA 3O8PA 3FKLA 3CD3A 1NW1A 2OIBA 2B54A 2J0IA 3EJ1A 2OF4A 3A7JA 5DVRA 3PVWA 3BHVA 3LE6A 2UZUE 3HA6A 3FC1X 3A7IA 3IK3A 4L3JA 2W99B 4CRLA 1YXVA 2YM8A 4A4OA 4D5HA 5E8YA 4MWHA 4FL1A 2FA2A 5GZ9A 4C59A 3QRUA 4I24A 4FICA 3ATSA 1R3CA 3HAMA 3BWJA 2Y0AA 2OO8X 1JNKA 4MNEB 3UBDA 2X9EA 3LM5A 2HENA 2R3PA 1H1SA 1YHSA 1H1QA 1WVYA 3G90X 2GFSA 4U42A 3KULA 5KKRC 3MVJA 4FIFA 1H4LA 4PTCA 4TWOA 1Q3WA 3V51A 5B0XA 3GC7A 4XH6A 3N4TA 3KMMA 3OZ6A 4OTHA 2X8EA 4UALA 4ZSGA 3CIKA 3QAME 5HIBA 4EH3A 4M15A 2VRXA 2WQNA 4FTAA 2HCKA 4HYSA 3ALOA 4XCUA 2X2MA 4O96A 3PZHA 3A2CA 2X2KA 3PYYA 4W9WA 3KREA 3PA5A 5HIDA 4FNXA 4I5MA 3NW5A 4I6FA 2AC5A 2C47A 4XG4A 2UZTA 4N6ZA 1OPLA 5I9UA 3UVRA 4DFYA 5L4QA 1NXKA 2WMWA 5DE2A 4O86A 4F7NA 2SRCA 5EFQA 3ZO3A 4Q9SA 5BVEA 1OIQA 2GNGA 3GEQA 4I3ZA 2GSFA 2W05A 3PP0A 4PMSA 5FEEA 3OXIA 5HG9A 5B2MA 1H0VA 3FYKX 2Z02A 3SVVA 5KMLA 1OIRA 3ID6C 5CU3A 5AR2A 2OXYA 4MKCA 3IDCA 5IKWA 3NCZA 3A7HA 2HELA 3RMFA 2X0GA 3QRIA 3TDWA 3UZPA 5HNIX 1CKJA 4FKOA 3PZEA 3PA3A 4RVLA 4XHKB 4L8MA 4CMTA 4CSVA 4D2TA 4USEA 5M4IA 4EOJA 3KY2A 3AC4A 3P78A 4KAOA 4LGDA 4MK0A 2W5AA 2R3RA 2W4JA 2BPMA 4FT3A 2NRUA 4JQ8A 4EWQA 3WZUA 2VWVA 3RJCA 4ZMEA 5DYJA 4X6RA 5IA4A 4WT6A 2LGCA 5DGZA 5TE0A 3R8LA 3SXSA 4HNIA 1WCCA 4K11A 3D5VA 4LMNA 4TKSA 2C1BA 3QQUA 4RC3A 1Y6AA 2WTDA 3MWUA 3CY2A 3HDMA 3V3VA 5IQIA 3R9RA 3UQGA 2VWWA 4NW5A 3CD8A 4QQJA 3U4UA 3RINA 1A48A 1M52A 3GNIB 3CPBA 4P2KA 3GI3A 4FEVA 3EH9A 4DFLA 5KHWA 1VYWA 2YJSA 4FSZA 4Y83A 4FZDB 5I9YA 4EJNA 4V0GB 2Y7JA 3BE9A 4YJOA 2BKKA 2JDOA 3BQRA 5HNGA 3R8VA 3U6IA 3NNUA 3UPXA 1GZOA 3EQGA 3JS2A 5JFXA 4EHVA 2R3MA 4QYGA 1H1PA 3OCTA 2IG7A 4Y95A 3BYOA 2W7XA 3BBTB 1PF8A 3FKOA 4FNZA 4BDDA 3ZLXA 1SVHA 1OL1A 3AMAA 4KIKA 1KOAA 2OZAB 1ZY4A 1XBCA 4H1MA 2OWBA 3VBQA 4FEWA 5I9VA 2JGZA 3D7TA 1XKKA 4OTQA 4UXQA 2C5NA 3DK6A 4RQKA 1DI8A 3R7EA 4E7WA 2RG5A 4QMZA 2R0UA 5ICPA 4U40A 4KSQA 4BI0A 4CFWA 3ZLWA 3P7CA 2XZSA 3M2WA 2W9ZB 3QD2B 3SXRA 3AD4A 3LLTA 2GS2A 4BN1A 3PXQA 3OT3A 5KBQA 5HVYA 3W10A 3UPZA 4AZFA 4LGGA 3OOGA 3ZO2A 4QP7A 3HMMA 4L44A 1E1VA 4F99A 4K33A 4C36A 5HZNA 4WUAA 4O2ZA 3MFTA 3DJ5A 1RJBA 4UMUA 3NYNA 4J98A 1YVJA 1Q8TA 2P55A 3G0EA 4ZZOA 2B52A 3QD0A 3FYJX 4GSBA 4YPDA 5GIPE 5CEKA 2BRNA 2J9MA 3TNHA 3IPHA 3Q9XA 3TJCA 4FT5A 4C37A 2QG7A 1OKWA 5FTGA 4YJQA 4NJDA 4O27B 1S9JA 1Y8YA 3UMWA 3BU3A 3DQXA 4AN2A 3ROCA 1WBWA 1DI9A 2ITNA 5JGDA 3PIZA 3T9TA 4LQMA 3DKCA 5J9LA 4FTCA 2YABA 1WBSA 2PE0A 5AUZA 4RMZA 3GVUA 4EUUA 3TIYA 2ITXA 4G2FA 4U6RA 4O7WA 2NRYA 3MPTA 4IX4A 3LOKA 2XIXA 4D9UA 5IUGA 3EL8A 5TKDA 3ALNA 4P7EA 3W8LA 4FIIA 4FG9A 4XV2A 4YC8A 4B8LA 3QX2A 3PLSA 3OC1A 4NT4A 1H27A 4TWPA 5EOLA 3EFKA 4ZLYA 4PY1A 4IAZA 3MTLA 4F6WA 4IWOA 4ZTNA 5IH5A 3P1AA 4O7SA 3F3WA 4QPMA 2QO2A 2X9FA 5CAOA 2WTVA 5D12A 4L3LA 3EL7A 3F5GA 3LCOA 4FC0A 4YSJA 5CAVA 4QMOA 4FIJA 3UC3A 3V8TA 5EKOA 4PTEA 3RP9A 4GRBA 2RL5A 5L2IA 4M0YA 2YIYA 4BGGA 3DT1A 5KMMA 4WO5A 4QMNA 4NH1A 2O5KA 2P2IA 2UZOA 5KO1A 3OWKA 4FV0A 4EH9A 2Z7QA 3TL8A 3DCVA 4KSPA 5AAGA 5K4IA 4O83A 3UDBA 1PYXA 5IQDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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