3FMNA

P38 kinase crystal structure in complex with ro2530
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
349
structure length
341
Chain Sequence
ERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein, transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
publication title P38 kinase crystal structure in complex with RO2530
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 108
structure length 341
sequence length 349
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2008-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3fmnA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3fmnA01
4NJ3A 1H1RA 3KRLA 5C8KA 2HIWA 4MBJA 3ZXTA 5CYIA 4C4IA 2W4JA 3OWJA 4Z55A 1M17A 3KRJA 2BRMA 3F2RA 3ZM9A 2WPAA 3SQQA 3UIXA 1U4DA 2V5QA 2Y8OA 3LZBA 4CG9A 3VC4A 5FD2A 4ASEA 2XIRA 4W8EA 4AOJA 2X7OA 1M14A 4H1JA 4FYNA 5G6VA 3ALNA 4EOJA 2YM8A 3CEKA 3Q60A 3SGCA 2WOUA 4EKKA 1UWHA 5AR7A 5H8EA 5GIOE 3MVJA 5GIPE 2XKFA 2WTWA 4M12A 4MQ2A 3UMWA 5TR6A 4AA4A 4HGEA 4RZVA 4EKLA 2PSQA 4EOIA 2C5OA 4IX4A 3QCQA 2UV2A 3EN6A 2Q83A 4O7ZA 4RC4A 2VX0A 1JPAA 3LXNA 3RAKA 1JKTA 3KN6A 5J95A 4QO9A 4Z3VA 4HVHA 4A4XA 2YM7A 5EDRA 4ERKA 4OBPA 2QI8A 4XG4A 4E5WA 3ZRLA 4L9IA 2JFMA 3DA6A 4GT3A 3QUEA 4F99A 5ANGA 3DNDA 4FTCA 1FQ1B 2QO2A 4FUYA 4RIWA 5H9BA 3PVWA 3ORMA 3HUBA 5IZFA 1PXLA 4KABA 4BIEA 4XV1A 3BV3A 5HU3A 5F20A 3QZFA 4IB0A 2QOBA 2AC5A 3O8TA 4NWMA 3TNWA 5GJFA 4C38A 2H8HA 4BYJA 3A7HA 4ZSGA 3EN7A 4XCUA 3G5DA 2G01A 3HUCA 3K2LA 3QF9A 2PULA 4C02A 1Q97A 4UEUA 4BDGA 5BMSA 4TWOA 4ANNA 5FDPA 2OXYA 3OXIA 2NRYA 4AS0A 2YM4A 3FLSA 4NJDA 4C34A 3QYWA 4F9CA 3U6JA 3LCOA 2IVSA 1PXOA 4AW2A 5DR6A 1J7LA 2YWVA 4ZMFA 4Z7HA 3ATSA 4KAOA 3BI6A 1XHAA 5D9HA 2IZUA 4NTTA 3WF6A 3ATTA 2XNMA 2WNTA 4HNFA 4K2RA 3BZ3A 4APPA 4OTPA 3WF9A 4GVAA 1OL7A 5E90A 4M69B 2V7OA 5K4JA 4CSVA 4WNOA 3COKA 1ZYSA 3QQGA 4A9SA 2JBOA 2IW6A 5IA3A 3QQKA 3CXWA 5DVRA 2X8IA 3LXLA 3R2BA 3IONA 4QPSA 4TT7A 2JIUA 2XM9A 3R71A 5HLNA 3R01A 2XP2A 4LFIA 4OT6A 2BR1A 4YPDA 3ZHPC 2J0MB 2BROA 1ZOHA 2OZAA 5CLPA 1SZMA 4GCJA 4BCIA 4E3CA 5FM2A 4FOCA 3LFQA 2OSCA 4L67A 4BDIA 3HA6A 4EC8A 4FNYA 3RM6A 3SG9A 4BL1A 2QVSE 5IA0A 4OUCA 4BKYA 3QHRA 3WBLA 4LGGA 2YLFA 3M11A 5HESA 1TQMA 3QUDA 5KE0A 4DAWA 1DS5A 4N57A 2YISA 3DDQA 3Q3BA 2R5TA 2HY81 4L8MA 4IW0A 3W1FA 5GZAA 1JKKA 3KRWA 3PIXA 3NNXA 3FXXA 4WT6A 3LQ3A 3CBLA 4ENXA 3EIDA 4W9WA 2C6LA 2QHMA 5HCXA 5HE0A 2WOTA 5EYKA 3FKOA 4A7CA 2ITYA 2O63A 4O7YA 2YACA 2BMCA 4UMUA 3QTZA 2B9JA 1XBBA 5CEIA 4FZFB 3RJCA 4C57A 3BCEA 5I3OA 5HGIA 4XLIA 3QD4A 3HRBA 1YOJA 2XK4A 4N0SA 3SXSA 4AE6A 4YLLA 5BVFA 3JS2A 5HCYA 4M15A 5JFWA 4Q2AA 3AC1A 4C3FA 2VTAA 3FHIA 4O96A 4L3PA 4BTJA 3C4ZA 5EI6A 1W84A 2VGPA 2PWLA 3M42A 3NUNA 3DOGA 3V51A 1IAHA 5IQHA 3MVMA 4FT3A 4NM5A 3TV4A 3LFSA 4FK6A 4R3CA 2ZOQA 2BHHA 2FSOX 3Q4TA 5A9UA 1GAGA 1Q24A 4R7IA 2J90A 5AR3A 4MXCA 1BLXA 5BVEA 1PMNA 4WG3A 3TIYA 5DWRA 2ERZE 4YPSA 4ZOGA 3PJ3A 3F6XA 3KXNA 2WGJA 3HRCA 2WZJA 5C8MA 4PDPA 2HCKA 2RG6A 3CCNA 3JUHA 5EHYA 5FBOA 3RVGA 1GJOA 5FEEA 1WZYA 4HCTA 4FEWA 1WBSA 4GYIA 5ACKA 5EDPA 3B8QA 2G2HA 3FBVA 2OH4A 4HGLA 2HW7A 4EYJA 2P3GX 3NRMA 2J7TA 1RW8A 4BBEA 4BI0A 1WAKA 4KINA 2VTOA 2PVKA 1PYXA 3A7JA 5CU2A 4YZ9A 3PY1A 3BLRA 2GS2A 3SX9A 2F57A 4V05A 4AW1A 2VO3A 4R6VA 2YIXA 4UZHA 5FP5A 3PPKA 3VS2A 4R1YA 2O0UA 3FHRA 4ANSA 1QPDA 2W4OA 2ZB1A 1H8FA 1WFCA 5LWNA 3NPCA 2FSLX 4D5HA 3ZUVA 4H1MA 3BV2A 4A9TA 1PXMA 1ZY5A 3PLAE 3MBLA 2ZB0A 3DS6A 3E62A 3RAWA 2BAKA 4U42A 5HE1A 2R2PA 3QWJA 2JKOA 4ITJA 4B8MA 3FJQE 5CSPA 4M0YA 3MY1A 4XV3A 3L9MA 3TKHA 2ZM4A 4D28A 5JRQA 4AA0A 2AC3A 4F1OA 3UPZA 3O50A 5DYJA 3EJ1A 3R9OA 4GJ3A 4ZJJA 2WTKC 4NM0A 4GG5A 4IX5A 4Q9SA 4H05A 3LXPA 4I94A 2YM3A 3FYJX 4FV8A 5DN3A 5HOAA 1P4FA 2C0IA 4IAKA 4C4GA 4RLKA 4CT2A 1GZNA 3VBTA 4C8BA 5CWZA 5M51A 4N6YA 1M7NA 4QTBA 2BDWA 3VS7A 3MFTA 3QWKA 2JDVA 3AD6A 1MRYA 3L1SA 3VO3A 4N4SA 4FKPA 4USEA 2UZDA 4KUJA 3Q6WA 2XYUA 3LIJA 3BU3A 3VS0A 3UNJA 5IH5A 1GIIA 2RF9A 2FSTX 1PRYA 5DG5A 2IN6A 4OT5A 4BIDA 3A62A 2XNGA 3DDPA 1GIJA 3LQ8A 5HBEA 2RSVA 1PKDA 3LLTA 4RFMA 4J53A 3PZEA 3BHHA 4EHZA 4GUEA 5AP5A 4NW6A 2RFEA 3DLZA 1J91A 1H1WA 5E1EA 3AQVA 1M52A 3VS4A 4ZTMA 5AUXA 4G2FA 4XYFA 3HA8A 3T9TA 2WTKB 5IMXA 2I6LA 4PMSA 4WBOA 4D55A 3SKCA 3BELA 4EUUA 3EFWA 4U40A 4AXAA 3V5QA 4YC8A 5I9UA 4F7NA 4AT4A 4K0YA 5CASA 3ACJA 1H08A 4X2NA 4AN2A 1M7QA 1OKYA 1VEBA 2QO9A 3COIA 4F6SA 4Z7GA 1DAWA 2Z2WA 3QUPA 3OY1A 4J8MA 3IOKA 4CV8A 5HG9A 4ANLA 4N70A 4TWCA 1CMKE 1F0QA 2ZVAA 4IWPA 3TTJA 5HZNA 4EQMA 2EU9A 2XNEA 4IH8A 2FA2A 2XS0A 2WD1A 4QMTA 2X81A 4CZYB 5IUGA 3NZ0A 4F63A 5CVHA 2H6DA 4IFCA 4QNYA 4E6CA 2ETKA 4X2JA 2IZTA 3UMXA 5BYZA 4AOTA 5M44A 4ZS0A 5M56A 4II5A 1F5QA 4FVRA 1XH8A 4V01A 5JN2A 3IW6A 2VWUA 4BHZA 3EQPA 5J1VA 1Y8GA 5KKRC 4PTEA 4Y85A 1A48A 4B6LA 2JAMA 3VJOA 2XNBA 2XZSA 4R8QA 3MY5A 3UYTA 1P2AA 4E4MA 2OJ9A 4ZSJA 5H2UA 4GKIA 3UO5A 1YXUA 3O51A 4FK3A 3O0GA 2JKKA 5L6PA 5E4HA 2XMYA 2W1ZA 3ZBXA 4FV0A 3O71A 3EFKA 5A46A 3DZOA 2XEYA 5JT2A 2PUNA 4XRJA 1KWPA 2X9FA 4X3FC 5EHLA 3LJ1A 3PA5A 3Q96A 4L7SA 3CKXA 4CV9A 1OL1A 3I7CA 2X4ZA 3DBQA 1ZAOA 1OPLA 3QX2A 5H8GA 3R8ZA 2OICA 1LEWA 2G9XA 2PZRA 2YJSA 4MVFA 2ETRA 5CNNA 2E9NA 5F1ZA 4AU8A 4D0WA 3OUKA 4FTNA 4LGHA 4D2RA 1ZRZA 1VR2A 3C51A 2XRWA 1H1PA 4WRGA 3DAKA 1K3AA 3QTXA 4XP3A 1YQJA 3DXNA 4L3LA 4CFVA 5LMKA 1XKKA 2YHVA 3QKLA 4ANQA 2GS6A 4FKRA 4DBXA 4F0GA 4M66A 3OWLA 3BWFA 4CFFA 4ZLZA 2OK1A 3MPTA 4FKVA 3T9IA 1ZZLA 3OCTA 3K3JA 3FKNA 5AJQA 5KKRB 4PX6A 5HNIX 1STCE 4PRJA 4U0IA 4IAYA 3QALE 2XRUA 3EFJA 3UOJA 1Q5KA 3FC2A 4FV5A 3ZLWA 4DLIA 5M53A 4Q5EA 3EHAA 4CKRA 2PHKA 3HDMA 5IU2A 3VBVA 2EUFB 1SNUA 4I6QA 4P5ZA 4X3FB 2C3KA 3QRKA 1NVRA 1L8TA 4LOOA 1OBDA 5DGZA 3PFQA 1R39A 3EYHA 3I79A 4G1WA 3ANRA 4DFLA 4R1VA 5AUZA 4E6QA 2I0YA 3GCUA 5M4IA 3TUCA 2BAJA 4C61A 4FZ6A 5C1QB 4Y5HA 3VBQA 3RAIA 2QOOA 4PDOA 3FLYA 4YTIA 4M3QA 2QR8A 3G6HA 2P55A 5DHJA 2VTSA 4MXYA 4CVAA 4JLCA 2FGIA 2C6EA 5D1JA 5E8SA 4WHZA 4YJRA 4KA3A 2C5VA 2ZV7A 3FLNC 4MNEB 3WZUA 2PY3A 4O0TA 5HVYA 5ANIA 3HEGA 4KS7A 4RA4A 4AWIA 3MJ2A 3ORPA 5I4NA 4G3FA 4GU9A 4CQGA 3F61A 4RJ4A 5CI6A 2ITWA 4Y5QA 1DI9A 4ASDA 3K5UA 5KHWA 3AXWA 3OC1A 3OD6X 5L2SA 4MD7E 3Q4ZA 4QYHA 5CVFA 2FB8A 5ETCA 4E73A 4TWPA 4HW7A 3DAEA 4F70A 3QYZA 3UOHA 2IO6A 3GOKA 2FYSA 4IIRA 2NNWB 2W9FB 3BYMA 3WF7A 3N4TA 4R77A 3QCYA 4NM7A 3RPSA 5J1WA 4IJ9A 4BIBA 4PF4A 3MPAA 4QYFA 1L3RE 3HVCA 3S00A 2VAGA 3C4CA 5EQPA 2YEXA 4HZSA 4Y72A 3VHKA 3EKNA 5E91A 2IW8A 1VZOA 2I40A 2QOKA 1W83A 3ACKA 3R1NA 4G34A 4JRNA 3ORNA 4QMZA 3ZO4A 2GQRA 5CAVA 2WFYA 2CNQA 2Y4PA 3KVXA 4G6LA 4KIKA 3Q6UA 2UW8A 5T68A 4FICA 3UO4A 2BZIB 4IB1A 3QA0A 4HCUA 3OTVA 3UODA 3VS1A 3AMBA 4PNIA 4I6BA 4IWOA 2VTTA 2Q0NA 4XG3A 2CNUA 2BILB 4QP9A 1BL6A 3QRJA 4GYGA 3DQXA 4PMTA 2CKPA 4FEUA 3KU2A 3OEFX 5J8IA 3GP0A 4KBKA 3VBXA 3VUTA 2DQ7X 2UVZA 3QKKA 1MUOA 4TN6A 2PVRA 3FY0A 3R7IA 1OKWA 4XJ0A 2PYWA 3NDMA 3QAME 4XMOA 4DCEA 2GNIA 3UE4A 3R8LA 5CVGA 5CF8A 4FV1A 1Q99A 4S32A 2CHLA 5D12A 5GNKA 3F7WA 5HD7A 3EQBA 4FL2A 4ZEGA 1YW2A 5IUHA 5EI2A 4A4LA 5CEPA 4G5JA 3SW7A 3DJ6A 4YMJA 5CF5A 4I4FA 3VVHA 5M4CA 3W2RA 5LXMA 3FY2A 4NT4A 4HYUA 2BUJA 3FI4A 2X6DA 5HCZA 3T3VA 4HGTA 4BDHA 4ENYA 5GJGA 4ZJIA 3KF7A 4I4EA 4KIQA 5JRSA 3BGPA 1OVEA 1J1CA 5EYDA 4YR8A 4MBLA 4AT5A 1BUHA 5AAFA 4MXZA 3FXZA 2WQOA 3ITZA 4YSMA 5HICA 3UVPA 4BWKA 2OXDA 1JSTA 2BPMA 4KS8A 5AX3A 2UW7A 2VTPA 2WB8A 2WQNA 3JVRA 4P4CA 4QMXA 3NYNA 2VWYA 3A99A 3BYUA 2J51A 4TNDA 2J6MA 4ONAA 2IVUA 4O6EA 2PTKA 3ZMMA 1XH9A 3UG2A 3C4WA 1WVYA 1XJDA 2DS1A 4FZDB 4FEQA 4JI9A 1ZOEA 4FT7A 4FTTA 2IPXA 5ITAA 1APME 2QU6A 2YM6A 3SXFA 3FZPA 4X2KA 3ZDUA 4DG0E 2C5NA 4FIJA 3QQFA 4RGJA 3F3UA 4CCUA 1H0WA 4IXPA 4O84A 3DCVA 4NL0A 5AP3A 2QONA 2HZ0A 4D2WA 4DEGA 1QPJA 3GC0A 4OW8A 2OH0E 4ZY6A 1WBOA 4P90A 5BVOA 3CQUA 1ZYJA 3WIKA 4TPTA 3W16A 3NCGA 4LOPA 3CGOA 2Z7RA 3O8UA 3LE6A 4FA2A 2P2HA 2Y7JA 3UPXA 4QP8A 3QTSA 3KMUA 4O27B 3S0OA 4EC9A 3PA3A 4RZWA 4CZTA 3LXKA 5AV2A 4D0XA 2OLCA 1H25A 3MY0A 4IVCA 3L9PA 3RBWA 4H3BA 2W1HA 5DT0A 1V0PA 3P86A 1H01A 2CGUA 4BN1A 2GNHA 1KE8A 2QOIA 4GFMA 5AP4A 3G9LX 5JFVA 2OIQA 5IA2A 4RJ6A 3NUSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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