3F66A

Human c-met kinase in complex with quinoxaline inhibitor
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
298
structure length
288
Chain Sequence
HIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKYLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEYYSVAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPDVNTFDITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
publication title Discovery of a novel series of quinoxalines as inhibitors of c-Met kinase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 288
sequence length 298
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2008-11-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3f66A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3f66A01
2ITQA 1B38A 5C8NA 1OPJA 5DH3A 5EOLA 3C5UA 5C9CA 2VTRA 4EWHA 4MXZA 3QQJA 4ANNA 4DN5A 5M07A 2PK9A 2UW5A 3DAJA 4O86A 4J95A 3GOPA 3QALE 2E9UA 4FOCA 3R7VA 4JDKA 5ANEA 3RALA 3I7CA 1M2PA 3BQRA 2BKZA 2GQRA 2JDVA 5EHLA 3FZRA 3KXMA 4NW5A 4TWPA 3S00A 4IC7A 3OEZA 3QZIA 3QD3A 4DLIA 4BI2A 4ORKA 4FEXA 5B0XA 1YWNA 2WKMA 2XIZA 2VGPA 2YM4A 4O7TA 3KCKA 1WZYA 4F65A 5I3RA 2B53A 5IQBA 2FYSA 1JSVA 2NNWB 3MS9A 5FTGA 4QMLA 4R5YA 3FSFA 4Y83A 4HYSA 4NWMA 4NM5A 2XK7A 4O91A 4U0IA 5JT2A 4DH8A 5FEQA 2UUEA 3PSBA 3OY3A 5HOAA 2IZSA 4MQ2A 3BV3A 2VTOA 4PY1A 5HESA 4BCNA 4ZMEA 3KMMA 5C26A 1YWRA 3DS6A 1H0WA 1XH4A 2QLUA 1ZWSA 3NYVA 1OB3A 2BAJA 2FSTX 4OTHA 2JD5A 5A4QA 3UQFA 3BIZA 4N0SA 2W0JA 3DQXA 3FZ1A 4FNWA 2BRBA 2QOLA 2YJSA 4CRLA 2PULA 3D7TB 2XA4A 2WXVA 5KBRA 4NL0A 3FPQA 1OKWA 2W4KA 4G3CA 5CSVA 5K0XA 3TZ9A 3KK9A 1JOWB 4F9CA 5CF5A 3QQUA 4AT5A 4CV8A 3TZ7A 3BYVA 3IW6A 4XX9A 5ACKA 4N57A 1HOWA 3GENA 4G9CA 3CTHA 2E9OA 4H3PA 4ONAA 3R8ZA 4BIEA 4GRBA 1OECA 4C4JA 2PSQA 4P4CA 2I0EA 3U9NA 3LOKA 1J91A 5AMNA 4EC9A 3NRMA 1V0OA 2OZAA 4RWIA 5CT7A 2JC6A 4BTMA 2X1NA 5BVDA 3VUKA 4FIFA 2OKRA 3TI1A 3CKWA 4Z16A 2OJIA 4L3LA 3PXKA 3EIDA 4WNPA 3UIMA 5GHVA 4C35A 4RJ5A 5IA3A 1UU3A 1FINA 2XH5A 4EQUA 3F6XA 3BYOA 3FMNA 4I4FA 3FQSA 3D7ZA 3I0OA 1YHVA 5IKWA 1V0PA 2Q0NA 2QR7A 5D1JA 4P2KA 2C4GA 2PE0A 2WTWA 2WMUA 4A4OA 4KRCA 4ENXA 5A4EA 3I0QA 2ONLC 3AC1A 2YIQA 3KN5A 4ANOA 1GIHA 5BVEA 4QMNA 3M42A 4JDJA 4UBAA 4FC0A 3GCPA 3SVVA 1KE5A 3FMEA 4M69B 3ZDUA 3A8WA 3AG9A 4APPA 4QYGA 4Q9SA 2PL0A 3K2LA 1BI8A 2UZUE 2YA9A 4ERKA 2G2IA 3KFAA 3P0MA 1PW2A 1YW2A 4LMNA 2O65A 3NW6A 3RK7A 4MWIA 2P55A 4GK4A 4IVBA 4JR7A 2VD5A 3MN3A 4NTSA 3UJGA 1B6CB 4MF0A 4Z7HA 5GINE 1XBAA 4ZIMA 4NFMA 3LCKA 4LL5A 3K5VA 3R9DA 4IM2A 4O7SA 3UOLA 3CY3A 4FNXA 3LVPA 4ZS0A 3NSZA 3RBWA 2J0JA 3ORIA 5HORA 4GKHA 3PFQA 3VJNA 4DGGA 3KU2A 2PUNA 1DAWA 3PDTA 1UU8A 4CT1A 1Y8GA 3W32A 4YJQA 4HNFA 4G5PA 5DFPA 1YXXA 5L8LA 1CMKE 1ZLTA 3HA6A 3ID6C 3IGOA 4AT3A 3UP7A 3VQHA 2Y6OA 1BX6A 2G15A 4AGCA 1EH4A 4K1BA 3CTJA 3NVMB 3UMXA 1ZOEA 3DBCA 3COMA 3CCNA 4D4VA 2VWUA 4MBIA 3ZC6A 4CT2A 4DE4A 3VQUA 1WBNA 4E8AA 4S30A 4C59A 2R4BA 2W1EA 4TW9A 3ZMMA 3CTQA 4CVAA 2GHGA 1JWHA 4PV0A 4IAIA 3F3ZA 2Z2WA 4BDIA 1VZOA 1ZXEA 4DG3E 5ANJA 4BTKA 2YIXA 3SAYA 3E92A 3TWJA 2ZAZA 1NY3A 3OG7A 1I09A 2C6IA 4JBVA 3EQDA 2JIUA 3IPHA 4HNIA 4F0GA 3UO5A 2J4ZA 2WHBA 5TOZA 4XP0A 4HCTA 3LFSA 3OW4A 4FV8A 5CXZA 2A2AA 3DXQA 1F5QA 3LFAA 5J8IA 2OLCA 3U54A 3PSCA 5K9IA 5F20A 4RPVA 4EOPA 4UMRA 2IO6A 4MTAA 1Y57A 1TVOA 3O8PA 4E20A 3OFMA 1HCLA 4UXQA 3OUKA 3CBLA 2RG5A 4UWCA 5AP6A 2OSCA 4I5HA 3KF7A 4KKGA 4J1RA 4B7TA 4ZSEA 2JKQA 2BIYA 1FVRA 2ETMA 4X2GA 3VHEA 3EL8A 3U6HA 2A1AB 3GFEA 3ZLYA 2GFCA 3ETAA 4FKLA 4O7VA 4BCJA 4ZS4A 1UNHA 3GXLA 2CN8A 3FLWA 2Z7RA 4TNBA 4CFMA 4KABA 2QLQA 3WE4A 4MD7E 4QMYA 3UOKA 2AC3A 3MW1A 3WE8A 3FYKX 5TE0A 4RX8A 4U3ZA 4LOPA 4QMPA 3G90X 3R22A 3V5QA 1ZOHA 3EQHA 3VWAA 5JFSA 5JFXA 4IC8A 4AG8A 1H07A 4MD8E 4BR3A 3MPAA 5F95A 4AA0A 4RWJA 1O6YA 3QCQA 4RC4A 3OTUA 3P7AA 2FSLX 4R7IA 4XG7A 3HRFA 3LQ5A 3DFAA 3K3JA 4YLLA 3THBA 3LJ1A 3ENHA 2UZOA 5IUIA 4K0YA 2QR8A 4MNFA 2W05A 4U8ZA 4W9XA 3U87A 4I0TA 4B8MA 5H8BA 5CEKA 2RFDA 2C5YA 3FQEA 2VO3A 3MVHA 4RJ3A 4CSVA 4YNEA 2XP2A 2HXLA 4JS8A 4GFGA 3GT8A 2BVAA 2GTNA 4GEOA 2G1TA 2X7FA 4IJPA 4KA3A 3V01A 3KRLA 5KCVA 4L45A 3QWKA 3IW4A 3MFSA 5F94A 5J87A 5HU3A 4X2KA 2X2MA 5IH5A 3E3BX 3H0YA 4FSQA 1JQHA 3VW6A 2HCKA 3VBWA 4BHZA 2HOGA 3QRKA 2UZTA 4JIAA 2JEDA 3V8TA 3TTIA 2C6DA 1LR4A 1A06A 5K5NA 1WCCA 3UOJA 1Y6AA 5D7AA 3EL7A 4ZSAA 4JQEA 4JIKA 3O51A 5LVLA 2QURA 3VS7A 1M17A 4EK6A 2C0IA 3IQ7A 4X0MA 4ZTLA 4YLKA 5BUJA 4IE9A 5I9XA 4FSYA 3R21A 3HAVA 1PYXA 2YIYA 5E9EA 4FZAB 2XNBA 4YGAA 3V5TA 4AFEA 2QNJA 3WF5A 3BQCA 2OFUA 1R1WA 4U6RA 2CLQA 4S32A 3OHTA 4I6HA 4ZZOA 1E9HA 1DI8A 2OJGA 1UNGA 4WSYA 3SA0A 5AR3A 3SXFA 4IFCA 4LFIA 4BI1A 4ZLZA 1PRYA 4L67A 1LEZA 3PA5A 3ANRA 5HI2A 3VBQA 4ZAUA 1ND4A 4X2FA 2FA2A 3GB2A 3Q9WA 1P4FA 4CG9A 2C6KA 4QP1A 4FKVA 5IQCA 4DFXE 4FKRA 4QQCA 5D12A 3VS1A 2I0VA 4FVQA 2CNQA 3F69A 5FUTA 1NT2A 3D9VA 1H8FA 3ALOA 4LRJA 5A54A 4DBNA 4FTQA 4OTRA 5JQ5A 2C69A 2WU6A 2B9HA 2YWPA 1J1CA 1PYEA 3PJ8A 3V6SA 3SGCA 3LW0A 2X8IA 5IA5A 1Q97A 3RZBA 5GZAA 2QCSA 3SKCA 4AN3A 4FIEA 2UW7A 3COIA 2ZJWA 4M12A 4WG4A 1PXKA 4YSJA 5M4UA 1Z5MA 4C3RA 4I6BA 3N9XA 3BGZA 3A7IA 3QWJA 1BYGA 4V01A 5L4QA 4AZTA 4GFMA 4OAUC 2GQGA 4BF2A 3QRUA 4FOBA 3BELA 3VS5A 4D2PA 5E8TA 3TDVA 3AC4A 5E8SA 4H1MA 2HIWA 4KNBA 4KSQA 5DBXA 4F6SA 5L6PA 5HU9A 2HWPA 4DITA 4QQJA 2VTHA 5T68A 2OH0E 1W98A 2PVNA 5LOHA 4WG5A 4CCBA 4XHKB 2VTAA 4TYJA 4MYGA 3RPRA 5LMAA 1I44A 3OF0A 2B9JA 2ETRA 3KY2A 3FLNC 2VWXA 4ZJJA 4XS2A 4U3YA 2YAAA 1MP8A 4FSNA 3PY3A 3RM7A 1JLUE 1JPAA 5IUHA 3BRBA 2GS7A 2W5HA 3HUCA 2WPAA 1WVWA 4GU6A 2QOOA 1FMKA 3FWQA 3NPCA 5EYDA 3IONA 4U40A 3R00A 2IG7A 1KSWA 4RIXA 4MHAA 3DB8A 3R8LA 5JSMA 2ERZE 4FK6A 4JQ8A 4RFYA 2YFXA 1RQQA 4ACHA 3EN4A 1SNXA 4I94A 3NIEA 3WZKA 3FZSA 4JXFA 4QTAA 4X3FA 4S34A 2AYPA 4YTHA 2E2BA 1OZ1A 3C4EA 3E7VA 3ZRKA 2ITYA 3DKCA 1PKDA 4GVJA 3ERKA 5LMBA 4FIHA 5CANA 2ZB1A 4FUYA 2E9NA 4C7TA 5DN3A 2CLXA 4DG0E 2QOKA 2UVXA 4YJNA 4IAFA 2X7GA 2YISA 4FZ7A 3S1HA 2ZV7A 4X6QC 4YJVA 5DEYA 5F9EA 2QG5A 5IMEA 2YWVA 1BLXA 4FX3A 4QP8A 4CFXA 4UMPA 2H34A 2JDOA 3FV8A 3UIBA 2GTMA 2WMXA 4ZY5A 3FZTA 4JBOA 2R7BA 3QFVA 4FTLA 3A7JA 2PWLA 4OBOA 5DOSA 4ZSJA 3VS2A 4LRMA 3A7HA 3IK3A 3QGWA 2C47A 1JKSA 4G17A 4LL0A 2XK3A 2GDOA 5M06A 4RG0A 4QTEA 3HX4A 4Y46A 3DXPA 1ZMVA 4GT4A 3DAEA 4IB1A 4ASDA 3FMDA 1GZKA 3R2YA 5HICA 5K0KA 3ZTXA 4N70A 3EOCA 4JOAA 1APME 2VTMA 4MEDA 3CJGA 3OXTA 5AA9A 1MRVA 4FKTA 4TWNA 3Q4ZA 3L8SA 5IA0A 4M15A 4R1YA 4DEAA 3FI8A 3VW8A 4KBCA 4BCHA 4FKGA 4NIFB 5CF8A 4I21A 2XKFA 4LYNA 4BDAA 1P2AA 4F7NA 3N4UA 3EQGA 2J0MB 2Z60A 2QO7A 4NW6A 3EWHA 3EZVA 5AX3A 5CEQA 3HV4A 2C68A 4KKEA 5HE2A 5GZ9A 2JIVA 2XVDA 4TY1A 1WBWA 4FYOA 3TKUA 5E8XA 5M4IA 2HW7A 1NVRA 2YZLA 4FF8A 4ZY4A 2PVJA 5CAOA 4RJ8A 2BZIB 4L7FA 3W2CA 1Y8YA 4FVPA 4AF3A 4CD0A 3KA0A 4FL1A 1U54B 3BWJA 5CI7A 4IWOA 3OWJA 4JRNA 3HDNA 4I5PA 3CE3A 4FGBA 1MUOA 2W1FA 2ZOQA 5JGDA 4UZDA 4EH9A 3WZJA 2EU9A 3H4JA 4ZTMA 5CASA 3QAME 2O3PA 3UNJA 3HRBA 3F2RA 5AV1A 3I81A 4R7BA 3E8NA 3OWKA 3F5PA 3H9OA 5LCJA 2B1PA 3OD6X 4ITJA 5M55A 2Z7LA 4E7WA 4IB0A 5J9ZA 4IM0A 5GNKA 1YXTA 3BX5A 3BLRA 3OROA 4EHEA 4CGAA 3R8UA 2YM5A 4G31A 3TNPC 3BEGA 3QLFA 4J98A 4ASZA 4KBKA 4EC8A 1YWVA 2ZM1A 2PVMA 3EFKA 3I60A 1H0VA 3LIJA 4JG8A 5ETIA 3FXZA 3VBXA 1BL6A 3ZM4A 2XK8A 4EOSA 5KMKA 3FEGA 3SC1A 3MV5A 3QQHA 2XEZA 3ZLXA 4PWNA 3DV3A 4O0UA 3OXZA 1O6KA 4GG7A 3SRVB 4TYHA 4HZSA 2OF2A 4RZWA 2GNLA 1H1SA 4D2TA 4LQMA 2PVHA 4HVDA 5E90A 5HG8A 1W0XC 2YDIA 3OZ6A 4BZOA 2BRMA 4FTNA 3NDMA 2NPQA 3BE2A 3A4OX 4FZ6A 3VHKA 4QMQA 5LMKC 5KMJA 3DK7A 2V22A 3H10A 3CS9A 1M7QA 3MDYA 4USFA 2Y4PA 3E8DA 3PZEA 4KSPA 5D7VA 4BDEA 4O1OA 4PQNA 1FPUA 4W4WA 1Q3DA 4G6LA 4YLJA 2GU8A 4QMVA 2WQMA 4ZEGA 1OL5A 3L1SA 4O83A 2UZEA 3FL5A 2ZM4A 3FZOA 1OKZA 4IB3A 2NRYA 4LOQA 2BR1A 3DKOA 2XRWA 1O9UA 3IOPA 4R8QA 4RIYB 3KK8A 5FRIA 4ACDA 1U46A 2C1AA 5AP5A 1UU7A 4F08A 4F6WA 3G33A 4Z3VA 2DUVA 3AGMA 3RTPA 3VRYA 3WF6A 4O21A 4PDOA 4U79A 3AOXA 3R1YA 4CKRA 5AFVA 3UYSA 1KE8A 1ZYLA 4Q2AA 4XMOA 4R3RA 1YKRA 4BKYA 5JK3A 4G2FA 3F82A 4LMUA 3F88A 2EB2A 1RDQE 2A4LA 2C3IB 2PZRA 3GC9A 4IX4A 3FMLA 3MJ2A 2YITA 3RK9A 3KREA 1YOLA 3OC1A 3NNWA 4P90A 4DH1A 3U4UA 4ZTRA 4AACA 4OAVB 2P2HA 1H1QA 4GVAA 3FKNA 1ERKA 4A9SA 4DH7A 4BTFA 4BYIA 3ET7A 4M8TA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2ITQ A;  1B38 A;  5C8N A;  1OPJ A;  5DH3 A;  5EOL A;  3C5U A;  2AQX A;  2VTR A;  5C9C A;  4EWH A;  4MXZ A;  3QQJ A;  4ANN A;  4DN5 A;  5M07 A;  2PK9 A;  2UW5 A;  3DAJ A;  4O86 A;  4J95 A;  3GOP A;  3QAL E;  2E9U A;  4FOC A;  3R7V A;  4JDK A;  5ANE A;  3RAL A;  3I7C A;  1M2P A;  3BQR A;  2BKZ A;  2GQR A;  2JDV A;  5EHL A;  3FZR A;  3KXM A;  4NW5 A;  4TWP A;  3S00 A;  4IC7 A;  3OEZ A;  3QZI A;  3QD3 A;  4DLI A;  4BI2 A;  4ORK A;  4FEX A;  5B0X A;  1YWN A;  2WKM A;  2XIZ A;  2VGP A;  2YM4 A;  4O7T A;  3KCK A;  1WZY A;  4F65 A;  5I3R A;  2B53 A;  5IQB A;  2FYS A;  1JSV A;  2NNW B;  3MS9 A;  5FTG A;  4QML A;  4R5Y A;  3FSF A;  4Y83 A;  4HYS A;  4NWM A;  4NM5 A;  2XK7 A;  4O91 A;  4U0I A;  5JT2 A;  4DH8 A;  5FEQ A;  1VLR A;  2UUE A;  1W2C A;  3PSB A;  3OY3 A;  5HOA A;  2IZS A;  4MQ2 A;  3BV3 A;  2VTO A;  4PY1 A;  5HES A;  4BCN A;  4ZME A;  3KMM A;  5C26 A;  1YWR A;  3DS6 A;  1H0W A;  1XH4 A;  2QLU A;  1ZWS A;  3NYV A;  1OB3 A;  2BAJ A;  2FST X;  4OTH A;  2JD5 A;  5A4Q A;  3UQF A;  3BIZ A;  4N0S A;  2W0J A;  3DQX A;  3FZ1 A;  4FNW A;  2BRB A;  2QOL A;  2YJS A;  4CRL A;  2PUL A;  3D7T B;  2XA4 A;  2WXV A;  5KBR A;  4NL0 A;  3FPQ A;  1OKW A;  2W4K A;  4G3C A;  5CSV A;  5K0X A;  3TZ9 A;  3KK9 A;  1JOW B;  4F9C A;  5CF5 A;  3QQU A;  4AT5 A;  4CV8 A;  3TZ7 A;  3BYV A;  3IW6 A;  4XX9 A;  5ACK A;  4N57 A;  1HOW A;  3GEN A;  4G9C A;  3CTH A;  2E9O A;  4H3P A;  4ONA A;  3R8Z A;  4BIE A;  4GRB A;  1OEC A;  4C4J A;  2PSQ A;  4P4C A;  2I0E A;  3U9N A;  3LOK A;  1J91 A;  5AMN A;  4EC9 A;  3NRM A;  1V0O A;  2OZA A;  4RWI A;  5CT7 A;  2JC6 A;  4BTM A;  2X1N A;  5BVD A;  3VUK A;  4FIF A;  2OKR A;  3TI1 A;  3CKW A;  4Z16 A;  2OJI A;  4L3L A;  3PXK A;  3EID A;  4WNP A;  3UIM A;  5GHV A;  4C35 A;  4RJ5 A;  5IA3 A;  1UU3 A;  1FIN A;  2XH5 A;  4BJJ A;  4EQU A;  3F6X A;  3BYO A;  3FMN A;  4I4F A;  3FQS A;  3D7Z A;  3I0O A;  1YHV A;  5IKW A;  1V0P A;  2Q0N A;  2QR7 A;  5D1J A;  4P2K A;  2C4G A;  2PE0 A;  2WTW A;  2WMU A;  4A4O A;  4KRC A;  4ENX A;  5A4E A;  3I0Q A;  2ONL C;  3AC1 A;  2YIQ A;  3KN5 A;  4ANO A; 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