2AYPA

Crystal structure of chk1 with an indol inhibitor
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
268
structure length
268
Chain Sequence
AVPFVEDWDLVQTLGEGAYGEVQLAVNRVTEEAVAVKIVDMKRAVDCPENIKKEICINKMLNHENVVKFYGHRREGNIQYLFLEYCSGGELFDRIEPDIGMPEPDAQRFFHQLMAGVVYLHGIGITHRDIKPENLLLDERDNLKISDFGLATVFRYNNRERLLNKMCGTLPYVAPELLKRREFHAEPVDVWSCGIVLTAMLAGELPWDQPSDSCQEYSDWKEKKTYLNPWKKIDSAPLALLHKILVENPSARITIPDIKKDRWYNKPL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase Chk1
publication title Synthesis and biological evaluation of 3-ethylidene-1,3-dihydro-indol-2-ones as novel checkpoint 1 inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 268
sequence length 268
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-09-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2aypA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2aypA01
3H9RA 3FZRA 4IAZA 2FYSA 3COKA 3U87A 3R7OA 3SG9A 3TI1A 4IM2A 4AW5A 4CMTA 3DFAA 4S33A 2PE2A 5IQCA 2OZOA 2VTMA 1XKKA 2P2HA 1OL2A 3C1XA 1M2QA 2X4ZA 3HGKA 4IHPA 2DWBA 4RJ4A 1OL5A 3F5GA 5DR9A 2QO7A 3RAWA 4BDHA 2PZRA 4CKJA 1H1SA 1JAMA 2PZIA 3E93A 3UE4A 3NEWA 1JSTA 2R64A 4L3PA 2BCJA 2XK8A 4EQCA 3ZLSA 4USFA 3NUSA 5BVNA 1S9JA 5DT4A 5CI6A 3R8LA 3D7ZA 4BBFA 1AGWA 3NS9A 5K9IA 3ID6C 3NCZA 3R1SA 1MQ4A 4X2NA 3E3PA 3VW8A 2R3LA 3PIZA 2X7GA 4YC6A 1KOBA 3FPQA 2ITQA 2W9FB 5C27A 1ZAOA 3VS2A 3QTWA 3KXNA 2J5EA 2VRXA 4UALA 5JGDA 2P4IA 4AGUA 4P5QA 3LQ8A 3ZRLA 4IIRA 2XK3A 2R3IA 2XNGA 4FSUA 1XBAA 4FTRA 3IOPA 4X7QA 5F20A 5AWMA 3COHA 2XYNA 3ZEPA 5A6OA 4XG3A 4YZCA 3O71A 3VQUA 5KCVA 3IW6A 3T3UA 4H3BA 5LQFA 4FGRA 4JXFA 5JT2A 2B7AA 2WMRA 3DB8A 5I9WA 2UW8A 3QD3A 4FKVA 4UYAA 3UIXA 3NX8A 4C34A 1ATPE 4EHGA 2VTSA 3MPMA 4BI1A 2CGWA 2W5AA 4D9TA 1BL6A 2DUVA 4QMPA 4Y5QA 2PUIA 2YM4A 3ZBFA 4QP7A 4Q5EA 4YUQA 5A4QA 5KMNA 5BVDA 4OBQA 2CJMA 4I92A 4RQVA 2XRUA 3ODYX 4FL1A 4XCUA 4O0SA 1ZYSA 3UODA 2WTKB 3AMYA 3B8RA 3VS4A 3KRJA 4FV7A 4JQ8A 4FX3A 4OT6A 3DBFA 3A61A 2UW6A 4M8TA 1LP4A 5AP6A 2YDKA 2X81A 3UVRA 4GFGA 1H1WA 4RC4A 2FSMX 3V5QA 4FTOA 3UP7A 2UW9A 3UYSA 5A4TA 5CSHA 2HZ4A 4FG8A 3C7QA 2XK7A 5AA9A 3ZYAA 4J96A 3WILA 4UMUA 3VF8A 3PVWA 4I24A 4BCMA 5GINE 1OKYA 1K2PA 2BRHA 4OR5A 1REKA 2E2BA 2OZAA 3AC4A 2VTTA 3ZM9A 5FXQA 4FT7A 3GXLA 4O2ZA 2YIWA 3EFKA 3Q4ZA 2OZAB 4CZTA 4FA2A 2PVLA 3VUHA 3RNYA 3KRLA 4P4CA 3KK9A 3NIZA 5CALA 3DKCA 4GYGA 2Z7SA 3W2PA 1W0XC 4UV0A 3FLSA 3P86A 5CAPA 3CGOA 3E7VA 3PXKA 4P90A 5HICA 4R1YA 4RWLA 4YHFA 4ACMA 4MQ2A 3MFSA 4NZWB 1H08A 5CU4A 5DFPA 1U59A 1JNKA 3BZ3A 5C4LA 4LRMA 2IZTA 3NAYA 3C4XA 3RINA 4E3CA 3MVMA 5E8UA 5DMZA 2VTOA 3ORKA 4E6QA 3FMJA 1GZNA 2CKEA 2UZBA 4W8DA 5HO8A 1REJA 3ACKA 3R00A 4RLLA 5AR4A 5TT7A 4KIKA 4L00A 2PZPA 2YZAA 4CFXA 3JPVA 4BYIA 5FP6A 4ZSEA 1Q61A 3W16A 4QMXA 4KIKB 4PWNA 4BDDA 2W1EA 3QHRA 4BVUA 3U54A 3UZRA 3B8QA 4NM0A 5LARA 3BYVA 2ETKA 3QD0A 3BV3A 4IW0A 3QZHA 3BIZA 4CFWA 3DJ6A 4JG8A 4FK3A 4IB0A 3C4EA 4H36A 4DEGA 4YHTA 5A46A 3LAUA 5FXRA 4IB1A 5EW8A 4EK6A 4YTCA 3OCSA 4FSYA 3G51A 4C2WA 3F5PA 4A4LA 3QC9A 3G6HA 3IW8A 3OROA 4WA9A 3T9IA 2RL5A 2CSNA 5FEEA 4E20A 3RVGA 3OWJA 2GS2A 1PXIA 3QTXA 2YLEA 4HYIA 1JQHA 4BKYA 3NNXA 3D15A 4W4YA 1O9UA 3MTLA 2WEVA 3R02A 4CTBA 3UC3A 4D2WA 5L2IA 2VTJA 4JQ7A 5BMSA 5HU3A 5KMKA 2JLDA 4I6FA 3D7TA 4MH7A 4XG4A 3A7IA 3C0IA 4DFZE 4HVSA 4YJPA 2C5OA 3DDPA 3AC2A 2X8DA 4RVKA 3D4QA 4JBQA 1CKIA 1KWPA 3CR0A 4DEHA 2AC5A 2W1DA 4AX8A 4R7IA 2GHLA 5FQDC 4FV3A 2ACXA 3QQFA 4PTGA 5AAFA 5L2TA 5GZ9A 3BHUA 3WIKA 4ACDA 2IVTA 2YHVA 4JR7A 3UC4A 4PV0A 5FDPA 3OW4A 1MQBA 2VTNA 4BDIA 5JFWA 4ZLOA 3SDJA 3FI4A 3QXPA 2QNJA 3DTWA 4DH3A 3RHKA 3SV0A 5J7BA 3HUCA 2W4OA 3FKOA 3DQWA 3PWDA 4K9YA 4QQTA 2NRYA 3G0FA 2UUEA 3IKAA 4A9UA 4EQMA 5I4NA 3FQSA 4BFMA 4LI5A 4RWJA 1IEPA 1SM2A 4X3JA 4E5AX 3LMHA 4FSTA 2YITA 2W5BA 1ZOEA 3HRCA 4M15A 3QUPA 3CGFA 3GFWA 1J3HA 3IW5A 4UB7A 1OIRA 3KN5A 4XP3A 5L8LA 4IWDA 3AT4A 2PVHA 2BALA 4U45A 3IO7A 4I0SA 5B2KA 4IVAA 4F70A 4K77A 3SG8A 5KMLA 4FSQA 5EFQA 1OUKA 2GS7A 3W55A 4YR8A 2BIKB 2CLQA 5BQ0A 4BCPA 4O7RA 1OPLA 3BCEA 3EQGA 1XH5A 3VJOA 4E4LA 3IOKA 3C4WA 4BC6A 3TV6A 5M4UA 3EQDA 5E8SA 1Z9XA 1Q3WA 4BN1A 3P08A 3R21A 1JVPP 4FTMA 3EN5A 3AG9A 4QMLA 4BDEA 2G9XA 4C4IA 4MK0A 3QTZA 4JS8A 3DOGA 3NUAA 1STCE 1J1CA 1FGKA 2VGPA 4RX7A 4DC2A 4ZZNA 2WKMA 3Q32A 4J95A 2C6EA 4WNMA 2I0YA 4RA5A 2YACA 4LGHA 3ZU7A 4AZSA 4G34A 4YP8A 3VUMA 4O84A 1RQQA 4H58A 2OXYA 4HNIA 5GJFA 3FYJX 3WI6A 3QUEA 4L46A 3CIKA 1PYXA 4AGWA 5ANIA 5JH6A 5KHWA 5E4HA 4FVRA 4XV2A 3LE6A 1KE9A 1GAGA 4M14A 5EW9A 2W0JA 2YJSA 2ZMCA 3I4BA 4WSQA 1MRYA 1WBWA 4DN5A 5ANGA 5ITAA 1NW1A 1XH8A 4QPAA 4EOMA 1CKPA 4GJ2A 5ANEA 5HE3A 3VJNA 4FF8A 1FVRA 4XNEA 2LAVA 3JR1A 1YI3A 3EN7A 4FTTA 3DGKA 4E6CA 5IKWA 3Q2MA 4U9AA 3UNZA 3LXKA 4BIEA 5EM6A 5L8KA 2X6DA 3LW0A 4QT1A 3PXQA 3H3CA 1ERKA 3P7AA 3PVBA 1E1XA 3HA6A 3UVQA 3ZCLA 3ODZX 5DI1A 4TWOA 4FKQA 2VD5A 4YZBA 3DAEA 1AQ1A 4QYGA 4KKHA 5KE0A 4K1BA 3D83A 4NJDA 5TR6A 2F2UA 5DE2A 5CU2A 4HYHA 3W2SA 5DH3A 5AM7A 2DQ7X 1A9UA 2WZJA 2X0GA 3FHIA 4KBCA 3T3VA 3AC3A 4BCOA 1FINA 2YJRA 4DGOA 5IZFA 2C4GA 2PUUA 3F88A 3LCTA 2WHBA 4FKIA 4HVGA 1OIQA 4O27B 2ITZA 3IK3A 5CEQA 2JDRA 4RVMA 1IA8A 4Z3VA 2C3KA 1BI7A 3S2PA 4I4EA 4IDVA 5IDNA 2Y8OA 1V1KA 1TQIA 4JDKA 3G33A 3LOKA 3OP5A 5CAUA 4IVBA 4EH9A 3BV2A 1OUYA 1QL6A 1OECA 1WVWA 4ID7A 4M69A 3DKGA 2YLFA 4BR3A 1UA2A 4G5JA 5ETCA 4JBOA 4FTUA 3MJ2A 1OGUA 3DXQA 4I20A 4L7FA 4UYNA 3VUDA 3EQHA 5KBQA 4QQCA 2WU6A 3AC8A 2HIWA 3N9XA 1U5RA 4O0TA 3VS5A 2X9FA 4CFFA 5AV4A 5HX6A 5M4IA 3PY0A 4PL5A 2W5HA 4BWPA 3UPZA 3F3VA 3QD2B 3N4VA 4EZ7A 4CYJA 3HMMA 3HL7A 1ZYLA 2UVYA 4PPCA 3EH9A 2J90A 4IX6A 3W2QA 2BTSA 3JS2A 5FGKA 1T45A 2IN6A 2Z8CA 3THBA 1NVQA 3PZHA 3VBVA 3QXOA 3WZKA 4GK3A 3BE9A 1YXXA 2O8YA 1UU7A 3KB7A 4GMYA 2E9OA 3MFRA 4XOYA 3Q5ZA 3GCUA 4WBBB 1APME 1CKJA 1IR3A 2J7TA 4QP2A 4ANMA 4AWIA 1CDKA 4AE9A 2VV9A 4WG5A 5K0KA 4O82A 2GTMA 4FMQA 3BBTB 3O96A 2OIQA 4RZVA 4PX6A 1KE5A 5FEDA 3E88A 4YJUA 5CS6A 4FTJA 4R7BA 4RIYA 4FV6A 1GJOA 5TOZA 4OTGA 2PVFA 5IMEA 2ITPA 4HYUA 3PWYA 2JKMA 3ZDIA 4QPMA 2J9MA 2XK4A 3KRRA 3LFQA 1MRUA 2H34A 4G6LA 4TT7A 3GCVA 2YDIA 2WGJA 5AUUA 4G3CA 2HELA 3MA6A 4RLKA 4AZTA 5J9YA 4J7BA 3CKXA 3FQHA 2WQBA 4X2FA 2V62A 4FTQA 4RIXB 1U46A 4C2VA 3R9RA 5M4CA 4C3PA 4DLIA 2I0VA 4MXOA 2IVUA 3ZFXA 3Q96A 4DGMA 4EZ5A 5B2MA 2BMCA 4FSWA 4ZLYA 2REIA 1L8TA 5LMBA 3O0GA 4O81A 4H1JA 4MXXA 4NFMA 1O6YA 5LWMA 1QCFA 3PXRA 5HQ0A 4FYOA 3AC1A 3UIUA 2HY81 3V01A 2I40A 2VWWA 1H0WA 3KVXA 4QO9A 2EUFB 4GIIA 4RG0A 3TTJA 3MB6A 2B52A 4IM3A 3E64A 4OUCA 3DJ5A 3DTCA 3TNPC 1M7QA 1WCCA 5AP3A 4CVAA 4JNWA 1UU9A 2R0IA 2PVYA 5L3AA 3R7UA 2J2IB 2CCIA 5J8IA 3QTQA 5CSWA 1WBSA 4X2GA 2VZ6A 2WMXA 4FKWA 3VWAA 4NEUA 5GZ8A 3ORPA 4AZEA 2X2KA 2EXCX 4RZWA 4XYFA 5LVLA 4IX5A 1PMVA 4K18A 1YHWA 4RC2A 3L8VA 3WZJA 2HWPA 1DM2A 2OICA 2WTKC 3QZGA 3Q6WA 2FO0A 5FEQA 4UXQA 4AT5A 5J1VA 5HZNA 2EB2A 4O6LA 3FLNC 2JC6A 4EONA 3VUGA 2UZLA 3VBWA 3MN3A 3HLLA 2XEZA 5D7VA 3MB7A 4PF4A 2BKKA 3ZZEA 4AXAA 3HV4A 3R04A 1G8AA 4YZDA 4ANQA 4LQMA 5I0BA 3V5PA 4QMTA 2CLXA 3G9NA 3Q9ZA 3W33A 4LV5A 4R1VA 2C6LA 4LOOA 3BQCA 2X7FA 5C01A 3ZC6A 5EW3A 3BGZA 3PIXA 3RZFA 4O96A 3R9HA 2R3FA 3ITZA 2WAJA 3KF4A 3P7BA 4FV8A 2R3NA 3UVPA 4YSJA 3LCKA 2OH0E 5EYDA 1MP8A 4PDPA 3VS3A 4C38A 2GQGA 2YM7A 2UV2A 3C5UA 3C4CA 3SQQA 5AJQA 3JUHA 4WKQA 4MXAA 5F1ZA 4AE6A 5HBEA 3BQRA 4DEIA 4DEDA 3DU8A 3EQPA 4ZP5A 2QKRA 5HD7A 3BHVA 4YTIA 4XH6A 4ZAUA 4O0UA 4F1MA 2Z7RA 3FY0A 4MXCA 4O7NA 1WBNA 4GUBA 4K33A 4QP4A 3CS9A 1RJBA 4IH8A 5EM5A 3V8WA 3W32A 4KWPA 4DFXE 4ENYA 4ZMEA 3QKLA 4O7ZA 2B54A 1ZY5A 1KV1A 2UZEA 4AU8A 4U8ZA 4FUXA 3UMXA 4I5MA 4ASDA 4EORA 3L9NA 4QP8A 3EZRA 5EH0A 3P78A 3HAMA 4BL1A 3K5VA 5BYZA 3KGAA 1KV2A 2VTIA 5I9VA 3SC1A 5E91A 3OWLA 4U79A 3E8NA 3RMFA 2HK5A 4U0IA 5FG8A 2WIHA 4KABA 3LCDA 4ZY6A 3HRBA 2YIRA 4IZAA 5H2UA 3AQVA 3VS6A 3FMMA 5C26A 3R1YA 2I6LA 5HIDA 3SAYA 4MWIA 5AIKA 3A62A 4FG9A 1SVHA 4KRDA 4IE9A 4KSPA 4Z9LA 3R8MA 4IWQA 3P0MA 4AW0A 5IQFA 3UNKA 5HCZA 4DAWA 4MCVA 3REPA 2UW3A 3RAKA 1EH4A 4PDSA 1Y6BA 2OBJA 3B2TA 4FKPA 4B6LA 5CTPA 2OIDA 1TQPA 5E1SA 5J1WA 2OJGA 3ANQA 2WTJA 3MIAA 5D7AA 3FL5A 3BEAA 3KN6A 4E8AA 3ZRKA 2PMLX 2ETRA 3FSKA 4QMNA 4X6RA 4CRSA 3VAPA 1TVOA 3ERKA 3D5WA 3Q9WA 1UNLA 5HTBA 5IA3A 3FMKA 2XCKA 4PMPA 3FZTA 5KBRA 4UY9A 5JZJA 1ZY4A 3CSVA 3EKKA 4CFUA 3QTRA 2F57A 2G2FA 2PHKA 2JFMA 5CAOA 5EHOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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