5L4Q | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	303
structure length	293
Chain Sequence	GYIGRVFGIGRQQVTVDEVLAEGGFAIVFLVRTSNGMKCALKRMFVNNEHDLQVCKREIQIMRDLSGHKNIVGYIDSSINNVSSGDVWEVLILMDFCRGGQVVNLMNQRLQTGFTENEVLQIFCDTCEAVARLHQCKTPIIHRDLKVENILLHDRGHYVLCDFGSATNKFQNPQTEGVNAVEDEIKKYTTLSYRAPEMVNLYSGKIITTKADIWALGCLLYKLCYFTLPFNFTIPDNSRYSQDMHCLIRYMLEPDPDKRPDIYQVSYFSFKLLKKECPIPNVQNSPIPAKLPE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase
molecule keywords	AP2-associated protein kinase 1
publication title	Crystal Structure of Adaptor Protein 2 Associated Kinase 1 (AAK1) in Complex with LKB1 (AAK1 Dual Inhibitor) rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	81
structure length	293
sequence length	303
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date	2016-05-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00069	Pkinase	Protein kinase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.10.510.10	Mainly Alpha	Orthogonal Bundle	Transferase(Phosphotransferase); domain 1	Transferase(Phosphotransferase) domain 1	5l4qA00

4HCTA 3QUPA 5LMKC 3QUEA 3QD0A 4FK3A 4G6LA 5FXRA 3DZOA 2YLFA 3CTHA 4L43A 4IANA 3QKMA 4EHEA 3ZUUA 3ORZA 4E73A 4ANNA 1JWHA 2VWUA 4FSRA 3UP7A 3KFAA 4FIEA 3V5TA 3QL8A 4QQJA 2J50A 5J87A 3GCVA 4AGDA 3KXMA 4DAWA 3GU5A 4U42A 4I6QA 4CSVA 4OTPA 5I0BA 4FX3A 2VTRA 4FTKA 4WSYA 3WZUA 3TV4A 5AA9A 3KULA 3WZEA 3W2RA 2PZ5A 4J99A 2WO6A 3G33A 4TYIA 4X3FB 5DE2A 2XA4A 3NNVA 3OVVA 3NW7A 4AX8A 2JBOA 4GMYA 3DB6A 3MY5A 4JRNA 4XG6A 5K5NA 1OKVA 2PVRA 4BBMA 4L7SA 5B2MA 1WBOA 2XNBA 3HECA 4X6RA 5FDXA 3V8SA 5IEXA 4IADA 1DAYA 2BRHA 1IR3A 3GQIA 4JR7A 5E8XA 4LFIA 3FSFA 2JDTA 2YM7A 3OBJA 5HX8A 4B9DA 3F66A 5CI7A 2W4OA 1UKIA 4CYIA 4RIXB 5A4QA 2PE1A 4JBOA 2R3GA 3PTGA 5C26A 3CQWA 4BZNA 2BALA 3A7IA 3I6WA 3PWYA 3EQIA 4EOPA 2OW3A 4CFMA 3Q52A 4FOBA 5A4EA 4GT3A 2R4BA 3GGFA 4JX3A 1PJKA 3M2WA 4L8MA 3ZXZA 4BYJA 4ASXA 2QQ7A 3GC9A 3QQGA 3QC9A 5HVJA 3SRVA 4BWXA 5AAGA 5DA3A 3FQEA 4HGSA 2VTOA 3WF5A 4MF0A 4GU6A 4BI1A 2QG5A 5JFXA 2ETKA 4RIWA 5DEYA 1FPUA 5DI1A 1MQ4A 2BDFA 4D2PA 5A6OA 2ITWA 2C69A 1QPEA 3QQHA 4B6LA 3TUDA 3VBYA 3O51A 1H27A 5JMSA 3VS1A 3KK9A 3UBDA 4HVHA 1Q8ZA 2BVAA 2WMXA 1YHWA 3TKIA 2BHEA 3FWQA 3HKOA 1ZZ2A 3EMGA 5AP3A 4HZRA 4JBQA 4QMVA 3OD6X 4WO5A 5D12A 3IOPA 5HE1A 4OT6A 4USDA 4XG7A 3HUBA 3U8WA 4CFVA 5KMOA 5LQFA 5DR2A 4WNPA 4HJOA 5H2UA 3HZTA 2W9ZB 4FL3A 3LE6A 2PUUA 3CKXA 4GJ2A 4JG6A 4MXCA 4QMZA 1YI4A 4QNYA 1JKLA 5CU3A 3DXNA 2C1AA 2X1NA 4RIYB 4Z16A 4G2FA 1HCKA 4RVTA 1ZMVA 3OUKA 1UWHA 3BI6A 3IW6A 4FKGA 4QYGA 4YJSA 3R9OA 4C2VA 2WTCA 3ZO1A 4CZUA 3FLSA 2HYYA 3P1AA 3OXTA 4PDPA 4O0SA 1Z57A 4KIKA 1MP8A 3EL7A 1FMOE 4XV2A 3THBA 1OL7A 4JDKA 4FZDB 3QKLA 3JUHA 4FI1A 4GT4A 5ANEA 2B9HA 1XHAA 4G3EA 2Z8CA 3VBWA 5CXHA 4YBKA 4JDJA 5AWMA 1Y6AA 3W18A 4EKLA 3KRWA 3NNWA 4ASZA 3LQ8A 4NIFA 1XO2B 2RF9A 2VO6A 3EFKA 2PVYA 5IA2A 4D2VA 1OPLA 4ERKA 2C3IB 5FBNC 1W82A 1PXIA 3GC0A 3KXGA 5DN3A 2OG8A 4X3FC 3G2FA 1ZY4A 4ACDA 2BAQA 4DN5A 3AT4A 2YAKA 2BZKB 1OKYA 3NAXA 4DEBA 5J9ZA 1V1KA 1DM2A 3QX2A 4MTAA 4BCGA 3HV4A 4BDJA 3VBQA 2E9OA 4C3FA 3O23A 1A9UA 3MJ2A 3G0EA 4MBLA 3ZCLA 3PVBA 4DCEA 4EK6A 3DQWA 4C4JA 3R8PA 3RCJA 5IA4A 4XBRA 5AIKA 3MVHA 3CQUA 3ZLSA 4IAZA 2EXMA 3UZPA 5K5XA 2J7TA 4EOKA 2BR1A 5HI2A 1YXUA 2V5QA 3BX5A 4I24A 1BL7A 4U97A 3IPHA 4E6CA 3FZTA 4XOZA 5DRBA 3Q53A 1KOBA 4CTCA 5AV1A 3F7ZA 4JOAA 2J0KA 5EYMA 5T3QA 3DJ7A 5L8LA 2BZJA 3VUDA 2EB2A 3HGKA 3W33A 1CMKE 3PIXA 1M7QA 4GW8A 4FVPA 4K18A 4USFA 2W1HA 3KRRA 4RIOA 4M0ZA 3OOMA 4GL9A 4IVBA 3U9CA 2R64A 5J9LA 2JFLA 3DY7A 2XB7A 2IVSA 1VR2A 3MB6A 2PZPA 4I1ZA 3GU6A 3DBEA 2OI4X 4EOSA 2EVAA 3UTOA 5J79A 5L3AA 3QBNA 3R00A 3UNKA 2X81A 5BNJA 1F3MC 2A27A 2YIRA 3LLTA 2G2IA 4QMOA 4ZSGA 3UO6A 2X2LA 4FSQA 4HVDA 3RK9A 4I0TA 4XMOA 2C6OA 3JPVA 4RJ5A 4OLIA 3NYOA 1Q99A 3K3JA 1XH4A 4X2GA 2OH4A 3T3VA 1AD5A 1KE9A 5E92A 5CSXA 4BCJA 4L9IA 2YCSA 4NW6A 4RJ4A 4ARKA 2BMCA 3QLGA 3RKBA 4FG9A 4IB3A 2O8YA 5AP7A 2WU6A 3OS3A 4CQEA 2E9NA 2WB8A 5AR5A 4KBKA 4S32A 5AR7A 3EZRA 3R1QA 3SV0A 4LV5A 3GU4A 4QP9A 4RFMA 5DGZA 4A9SA 4ZTRA 4EH3A 3ACKA 1U54A 2YCFA 3GUBA 4QMMA 4RQVA 1AGWA 5EDRA 3QKKA 2VTHA 3HMIA 3GB2A 3VAPA 5KBRA 1SVHA 3BV3A 4EL9A 4BDEA 3HMNA 4MF1A 4GK2A 1J91A 3LMGA 2BDWA 2YLEA 1CKPA 4QD6A 4ALWA 4U6RA 2BIYA 1YRPA 3GOKA 5IEVA 4TTHB 3OF0A 2Z7QA 4GSBA 1T46A 2QVSE 4EH8A 1JBPE 3POZA 4NIFB 4EWHA 5LWNA 3CY3A 2V0DA 4X6QC 5L4QA 2A1AB 3OHTA 2X8EA 3BV2A 4A9UA 4PNKA 2W1GA 3C51A 2C5XA 4BZDA 1H0WA 4HGLA 2FSMX 3D4QA 3PE2A 4XH6A 3W1FA 1JOWB 5IDPA 1PXLA 2BZHB 4HOKA 3KN5A 3UIMA 2XP2A 4PV0A 3FXZA 4GFGA 4D28A 4DGGA 3A60A 3EYHA 4I3ZA 4ACHA 4RJ8A 2WZJA 2IZSA 2J5EA 3L8VA 3OY1A 2ITOA 1YWNA 3S4QA 2QU6A 5BVKA 4BI2A 5FXQA 1WBSA 2HZNA 5BVOA 4WNKA 3MH1A 4QP1A 4DGMA 4FTUA 2ITPA 5TT7A 4RQKA 4TWPA 2GNJA 4I23A 5AMNA 3R22A 3MW1A 3FLWA 4F7SA 1JKKA 2PVHA 2YIXA 4FNZA 2OFVA 4K77A 2W05A 4U7ZA 1M2PA 3KXNA 3F5UA 4BHNA 4IE9A 2WOTA 4APCA 3TNQB 3VHEA 4AT5A 3W2SA 3KN6A 3MS9A 4JBVA 4OBQA 3UODA 2P0CA 1OUYA 1R3CA 5C8KA 3C0GA 1YWVA 3R30A 3T8OA 2Y8OA 3ODZX 4MX9A 3VS5A 3F69A 5BMMA 2GFSA 4GUEA 2W9FB 2XVDA 5BVWA 4AW5A 4J95A 4X2JA 3UIXA 3VWAA 4DITA 4FKUA 4U80A 4W4YA 1BL6A 2HIWA 3DBFA 2C6LA 1X8BA 2VAGA 3GC7A 5E8YA 2IWIA 5ANIA 4DLIA 4TRLA 2IZRA 3AC8A 2KTYA 2OBJA 3UC4A 3UE4A 2GDOA 4FKVA 3VRZA 3WI6A 3RPYA 5CF8A 3GCQA 4U3ZA 1URWA 3MPAA 2OJJA 3F7WA 5IA5A 4TNBA 3R7GA 2PE2A 2QR8A 3K3IA 3ENHA 5AM6A 3CGOA 1H26A 2HZ0A 1JSTA 3EFJA 2HELA 2QI8A 4IAAA 4V05A 1Q8UA 1ZY5A 2HY0A 4LV8A 4Q5EA 4JX7A 3ZFXA 1Q4LA 2UZNA 1URCA 2C6KA 5DPVA 5HG5A 3PXZA 3UVRA 4K11A 5LJJA 3COIA 3FMLA 3VS7A 2BROA 5TE0A 3EN7A 2DQ7X 4AF3A 4EH2A 4TWCA 3E88A 5IUHA 2UVYA 4NKAA 5F9EA 2V62A 3BHTA 4FIJA 5KZ0A 3WF6A 2PMLX 3LFCA 1U4DA 3DZQA 1PXPA 1BLXA 1U59A 4KIPA 3HL7A 1PMUA 4NCTA 4QP2A 2WIPA 3R63A 4NWMA 1OIRA 2FVDA 4EZ5A 4YP8A 4EYMA 3QX4A 1J1BA 3TJCA 4FA2A 4Y85A 5JRSA 2ITTA 5C8MA 4G17A 3OBGA 5AP1A 2GNHA 4AZWA 2J51A 3QCXA 5FGKA 4XG9A 4B8MA 4PMTA 2F2CB 4FMQA 4C59A 5ITAA 2XM9A 3Q6WA 2VNWA 4O1PA 2I0YA 4FT5A 2WU7A 1YOLA 2O3PA 3A4PA 3V5WA 4FNWA 4ANQA 5DR9A 4C3PA 5FDPA 2W5HA 4RWIA 1FGKA 3FZOA 3PJCA 5TOZA 3EWHA 3PLSA 2CGWA 4FG7A 4GH2A 4AAAA 1XBBA 4FT0A 4UXQA 2ZVAA 4GUBA 4M8TA 4RA5A 2XK8A 4C58A 3HX4A 3KRJA 3BGZA 3B8RA 2PMOX 2WTIA 4KINA 1ZYSA 4O0XA 2RFSA 3Q4CA 4BDIA 4EWQA 3DB8A 2CLXA 4ZLZA 3O71A 3V6SA 1R0EA 5CF6A 5B2KA 4J52A 5DT3A 4FIFA 4GVJA 5AM7A 4YHTA 3PRFA 5L2WA 1TVOA 4NTTA 1GIIA 2R3PA 4H58A 2ZMCA 3FJQE 3GQLA 4BCKA 3PG3A 2BCJA 1QPCA 3ZONA 2W4KA 4GS6A 4JG7A 3OT8A 2CSNA 2Y6MA 5BPYA 1ZOEA 2UZOA 3T3UA 5BUEA 2VWWA 4UYAA 1FGIA 3I5ZA 3C9WA 1ZOHA 4EOJA 3W55A 5K0KA 4D2WA 4FZFB 2RFNA 1Q24A 4AW1A 5CEMA 2QO7A 4YLJA 3PY3A 2CDZA 2XCKA 4EH7A 2OZAB 2WMBA 3AT3A 3EKKA 3ROYA 4P4CA 4IH8A 4OUCA 4FKQA 3EYGA 4P90A 4U79A 4R1YA 5GNKA 3EL8A 4RT7A 3QRJA 4CKJA 1FVRA 3NEWA 3PPZA 2PVLA 2HWPA 5D7AA 4Z7HA 1K2PA 4MKCA 1OIUA 4YZCA 4DTKA 4ENYA 3R9NA 1Q97A 4EQUA 2YM5A 4N6YA 1U5QA 4YC8A 1VYWA 5FG8A 4NU1A 3DJ5A 2ZYBA 4EJNA 4S34A 2QODA 4YJUA 1ZZLA 3SDJA 2XK3A 3PFQA 2UW7A 2VWIA 3OT3A 3TZMA 3WBLA 1WMKA 3ZDIA 2ITVA 4ITIA 5FP5A 4ZLOA 4LGHA 3ZEWA 3ZOSA 3PVWA 4HCVA 1VJYA 4YSJA 1OB3A 1V0PA 2Z7SA 4C37A 1I44A 3E64A 5KMIA 3ENMA 2X7GA 3UG1A 3CE3A 3BBWA 2XUUA 3V5PA 3KMWA 3QQJA 4RWKA 4YPSA 4HVIA 3KXXA 3R8VA 3GXLA 3D5WA 4V0GA 4YZMA 2REIA 5AUWA 2Y0AA 3GEQA 3TKUA 3VUHA 5KNJA 4DLJA 4ENXA 3VS2A 2BHHA 2JKMA 1FMKA 5J7HA 4NM7A 3PA5A 3LOKA 4TYEA 3V8TA 2XIRA 3PYYA 4I22A 1SNUA 4YZ9A 5EHLA 5HLPA 2ZM1A 5AV3A 3Q2MA 3RZFA 3QZIA 5LMBA 4RJ7A 4UV0A 2H8HA 4FSUA 4QPSA 4CT2A 3AQVA 4IJ9A 5A14A 4ZTMA 4R3PA 2OZOA 3IG7A 3VS3A 3TNHA 3UNZA 4QTEA 3A2CA 4YJRA 3QWKA 3R0TA 1P4FA 1GAGA 4FZ6A 3K5VA 3NW6A 3EQBA 4OTQA 5EM8A 4BIDA 4ZZOA 3MFSA 3SC1A 3O8PA 3UVPA 3PVGA 4L01A 4D9TA 3D0EA 5CWZA 4RX8A 4KSPA 4FNYA 5CU2A 3QZGA 4XV9A 4YZDA 3O96A 5HNGA 1TQIA 4L00A 5FTQA 4CFFA 4IB0A 4IEBA 3H9RA 2ZV9A 1BX6A 3ZO4A 4IVAA 4A07A 3ALOA 4FL2A 1IRKA 1WCCA 4JI9A 3F88A 4L46A 4DGLC 3ORMA 4EK8A 4W4VA 3HMPA 2G2FA 3R7EA 5KKRB 3D7TA 3C1XA 1KOAA 2P33A 3BQCA 3IOKA 3A8WA 2GS2A 2QC6A 5CQWA 4IMYA 3FMEA 4FKSA 1W7HA 4JR3A 2QNJA 4WNMA 1IASA 4MWHA 5CENA 3T9TA 4QYEA 3TV6A 3AG9A 5C8NA 5G1XA 4YLLA 4FZAB 3LHJA 2HENA 3ITZA 2G2HA 3QHWA 2O2UA 3HDMA 4HYIA 3TT0A 1EH4A 4LGGA 3H30A 3PPJA 5AR2A 2X2KA 3V3VA 2XNNA 3I6UA 2VTIA 3AGMA 3ERKA 2J0MB 2YIQA 4IVCA 4ONAA 5IU2A 2P3GX 1ZMWA 4GFMA 3C7QA 1H0VA 4A9RA 4L3JA 3DKFA 4U40A 2ZDTA 5AEPA 3LJ1A 4F0GA 3F9NA 4DINA 2UZTA 4MXXA 2OJGA 4ZTSA 4OAVB 4R3RA 4PRJA 3EB0A 4HYSA 4BIBA 1ZYJA 2C6MA 3F3UA 4Q2AA 4LMNA 5HESA 4DEDA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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5L4QA

Total Genus

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structure length

Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations