5IEYA

Crystal structure of a cdk inhibitor bound to cdk2
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
298
structure length
286
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Conformational Adaption May Explain the Slow Dissociation Kinetics of Roniciclib (BAY 1000394), a Type I CDK Inhibitor with Kinetic Selectivity for CDK2 and CDK9.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 286
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-02-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5ieyA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5ieyA01
5K5XA 2UZOA 4NK9A 4U42A 3WE8A 2GS7A 2BTSA 5CVFA 4P90A 5I9YA 4YZ9A 3LXPA 3PA4A 4GG5A 3NYVA 1PJKA 2CJMA 3QA8A 3MY5A 4EL9A 5LWMA 2PYWA 5HG9A 5EOBA 1V0BA 1PXJA 4MF1A 3DT1A 3LCSA 4BDIA 2WMUA 1OL6A 4RSSA 1EH4A 4MXYA 4NM5A 2X0GA 1W7HA 2ZJWA 3F66A 4IEBA 1Y57A 2FH9A 3HV4A 3KF7A 3Q4TA 4K18A 2C3KA 4FSQA 2XNBA 4BDJA 3MYGA 3NNWA 2WOTA 3UIMA 4S2ZA 4E73A 2O8YA 3G6GA 3LCOA 2XIKA 4O0RA 5HVYA 4FTMA 5K3YA 4AOJA 4IC8A 3DV3A 3P4KA 2F57A 3E8NA 4AUAA 5IUHA 2QO2A 4KINA 5IA4A 1BMKA 3D7ZA 2PUNA 2JD5A 4D4YA 3OFMA 2DQ7X 4WD5A 3GCVA 3NNUA 5BVEA 1MUOA 5C03A 2Z7RA 2BHHA 1SZMA 2WPAA 2XCKA 1ZXEA 4FIHA 2PUIA 4NCTA 4UEUA 3Q96A 4WG5A 3QTWA 5KX8A 2A19B 4BCOA 3R7OA 4ZTNA 2YIWA 4TPTA 4GIIA 4WNKA 4JBVA 4ENYA 5AMNA 2IWIA 3DZQA 5CZIA 2CDZA 2JIIA 2FUMA 3ERKA 4Q5EA 3RVGA 3QYZA 3E62A 3JVSA 4U97A 4HVDA 4CG8A 3RAWA 3Q6UA 3R30A 2ITWA 4QNAA 4IAIA 5LMKA 5H8EA 5J7BA 5HLWA 3MIYA 3EYHA 3ORIA 3BHTA 4OTPA 2H96A 4CLJA 4ASEA 2NPQA 5AP5A 4IB5A 3ZBFA 3AXWA 2E9VA 2UZTA 2ITPA 2XRWA 4QMMA 4AFJA 3HL7A 2G15A 5ICPA 1FQ1B 2YDKA 2PL0A 3TL8A 1U59A 2WQNA 2YIRA 5FQDC 4C3PA 4G9CA 1JQHA 3NWWA 5KBQA 4GFGA 3ZFYA 5L2WA 2GNHA 4DN5A 4J96A 2BDWA 5HKMA 3ZO4A 4BL1A 2I0EA 4FTUA 5BYYA 3BGPA 3ZS5A 4MBLA 2VTLA 3TWJA 3DFAA 1Y6BA 4FMQA 4EOLA 1WVYA 3OW4A 4I24A 2Z60A 1NVQA 4G17A 1U4DA 2ONLA 3DFCB 1W84A 3GU8A 3QQJA 3N51A 3NPCA 5AV3A 3G15A 3ORZA 2DS1A 4Q2AA 5I9UA 3OXZA 3RINA 3AC8A 4GCJA 5CYIA 1PXKA 3OTUA 2R3GA 2V5QA 5HZNA 1YXUA 3W18A 3Q04A 4DEAA 4H3BA 3ZU7A 4X3FB 3ZDUA 5HO7A 4NEUA 5CAOA 4EKKA 5JK3A 3A60A 4L00A 4IAYA 3T3VA 5IQFA 2GMXA 3O8UA 4IM0A 4GEOA 2G2HA 3R83A 3BLHA 3ID6C 4RVTA 5DYJA 1FPUA 2HW7A 3EH9A 5DIAA 3IECA 2JFLA 2G1TA 3D83A 4QYYA 5CXZA 5EDRA 5A6NA 2C6DA 4FT5A 2UW0A 4YLLA 5A54A 5CEPA 1U5RA 5LCKA 4FC0A 4D58A 2IW8A 1P2AA 2RKUA 2J50A 4LV8A 4R3PA 4OW8A 4IW0A 4I92A 3E64A 3GCUA 2QKWB 4DCEA 3QRIA 5EDQA 5AUVA 2AYPA 3R9DA 2OIBA 5KMOA 2YWPA 5AX9A 1MRUA 2OGVA 4O0YA 2ZV2A 2CKPA 3O17A 2BMCA 3GVUA 2SRCA 2YJRA 5EHLA 3UQFA 3TKHA 1ND4A 5AA8A 5E4HA 3MVJA 3NLBA 4FVQA 4CZYB 1IASA 4HW7A 3ORNA 2JIVA 2W9FB 4QMZA 3ZZWA 4X7QA 2PPQA 4FZ6A 4IH8A 3JS2A 4HCTA 4AW5A 3EL7A 4IVAA 3VBXA 2W1FA 3FKNA 3UMWA 4YLJA 5B7VA 3ZUTA 4NFNA 4Q5HA 5IDPA 1GZNA 5JN2A 5M06A 3KULA 4WBBB 1YXXA 1PYEA 3DQXA 1J1CA 2BDJA 4NKAA 4GU9A 4F0FA 3BU3A 3QTSA 3DOGA 3PA5A 4BIBA 5J9YA 4G6NA 3HAMA 2Y6MA 4U7ZA 1K3AA 4M14A 4EQUA 3ZSHA 3L9MA 5EI2A 4CTBA 2Y4IC 4GYIA 4IWDA 4L8MA 2WO6A 4LV5A 3QXOA 1H1QA 5IZFA 3R8PA 3VF8A 4FE2A 3Q4UA 2XKEA 2QKRA 4YJNA 2JDRA 3HP2A 4Y73A 2XNOA 4USEA 3GQIA 4USDA 4IC7A 3I5NA 2VD5A 2VAGA 3E87A 3SW7A 1OKVA 3LQ5A 3OTVA 4K9YA 2XNEA 3CIKA 2C6TA 3MW1A 3ZXZA 2C3LA 3V5JA 3KRJA 1BX6A 3PXYA 4OBOA 3L8XA 4EH3A 1IEPA 4UMUA 4F9BA 3MA6A 2XBJA 4PPAA 3HYHA 3AMYA 3OWKA 4UWCA 2J90A 5AR3A 4Y85A 5BNJA 3DY7A 3I0QA 5ETCA 3DB8A 3EQBA 3HMMA 3CY2A 4H3PA 3R8MA 3ODYX 3KULB 4I5MA 3VAPA 4BCKA 3DBCA 3U6IA 3RKBA 3C4ZA 3UE4A 4G1WA 1P14A 2Y8OA 4F09A 5KCVA 3GXLA 1YQJA 2R5TA 4B6LA 3II5A 2VWZA 4NSTA 2F2CB 2YM5A 3BKBA 4LRJA 4UWBA 3LFBA 4O7RA 1R0EA 3TT0A 2VNYA 3BU6A 4R5YA 2QOHA 4MQ2A 2CGUA 4RA4A 3IDPA 4FEVA 4GIHA 4D28A 2W05A 3HUBA 2BIYA 3Q53A 5K9IA 4XG9A 4TYEA 3N4UA 3RM7A 3DJ6A 4OGRA 4N6YA 4WNMA 4HVGA 4CFFA 2CNVA 4AZFA 3VUIA 2JAMA 4HYSA 4F1OA 3WZJA 2W17A 3OW3A 4PNIA 2XKCA 4WRGA 4DGOA 4K77A 3NGAA 3R7YA 1H24A 3UYTA 2P3GX 3ZC6A 4ZLZA 3EKKA 4IJPA 4TZRA 4EK3A 3UOJA 3UDBA 4HZRA 4UY9A 4CD0A 3I81A 3NYXA 4ORKA 3VQUA 3ZLYA 3HRCA 4FTQA 2YJSA 3DAEA 4MXXA 3U6JA 3HV5A 4R5SA 4YJVA 5B2KA 2CSNA 1NXKA 5EFQA 1JKLA 3H9RA 4O22A 4IX4A 4FTAA 4EH8A 4NZWB 4R78A 3AC4A 1JOWB 4M68A 3PWDA 4U80A 2CGWA 3R7EA 1W83A 3BYSA 3R1QA 4F64A 1R0PA 2REIA 4FF8A 5A4LA 3E8CA 2OLCA 3KRXA 1H0VA 3C4EA 3LJ2A 4BDKA 2GTNA 3FLWA 3LXKA 4QTEA 4O0SA 2IJMA 4GH2A 3G5DA 4TYIA 4OTFA 4O2PA 1H00A 4CZTA 4JAIA 3QCXA 3MH1A 4F0GA 3A62A 5HIEA 2RG5A 2C0OA 2C3JA 3F9NA 4GK2A 4FKLA 2WQMA 3UOLA 5LARA 5CAPA 4O1OA 5EK7A 1O6KA 3DCVA 4ZMEA 3V8SA 3LFAA 3VO3A 3QF9A 4CV8A 3D5WA 3FMJA 4EBVA 1UKHA 4EK8A 3NW7A 5AAEA 3UVPA 1NVSA 1YRPA 2V7AA 2EXEA 4O96A 3VS5A 2W1CA 3R21A 3AG9A 4U3ZA 5IA0A 5AUWA 3NW6A 3U8WA 2OF4A 4W9WA 4TL0A 1JNKA 4FV0A 3FLSA 3LFNA 4BN1A 3W8LA 4V01A 1FVRA 2X7OA 3RJCA 2J0IA 2P2IA 2R7BA 5JGAA 3HV3A 4L7SA 2WTWA 3MTFA 4JX7A 4RA5A 4TNDA 4ZTQA 4XNEA 4PQNA 4ZY6A 4BZDA 4DFYA 4RJ6A 1FBNA 2A27A 4L9IA 3DA6A 4CFWA 4DH3A 1QPDA 4IWQA 3ZFMA 4I4EA 2C0TA 5JRSA 2YM4A 3QTQA 1RE8A 5IH4A 1H1WA 1ZYLA 3D5UA 2XMYA 3QZHA 4FODA 4OBPA 4AE6A 5CASA 3F2RA 4BGHA 4IDTA 3UODA 4C35A 5CT0A 4IFCA 4FV1A 3V6SA 4ERWA 4UBAA 4EYMA 1JSUA 3FY0A 4PTCA 4BKJA 3MA3A 1KSWA 2BZJA 1YOLA 2QVSE 4I20A 1BLXA 4IWOA 4R3CA 3MB7A 2HWOA 3ACKA 1KOAA 2VWWA 4UX9A 3MFUA 4M69A 2GNFA 3IGOA 1FGKA 3A8XA 2B4SB 2ACXA 2CHLA 4FEWA 1MRVA 3QYWA 3ULZA 4PTEA 2C6LA 3QU0A 3VHKA 4XP2A 4I5HA 3A7FA 4U6RA 2HCKA 3ANRA 5FTQA 2GHMA 4X2FA 4BCIA 4EUUA 4X21A 4F7JA 4R7HA 4J99A 4CCBA 4F6UA 4BCHA 3GP0A 5C1QB 2PVYA 4HVIA 2YN8A 4L68A 4OTHA 3BU5A 5AX3A 4KBAA 4I4FA 4MNEA 4UZHA 5HHWA 3RALA 3VULA 4ERKA 5FM2A 4AA4A 4J52A 5E8VA 2YWVA 2WHBA 4GV1A 4HZSA 5LVPA 4TYHA 5FWKK 4F70A 2OH0E 4GVJA 1E9HA 3FMHA 3P7CA 3WIGA 4QMPA 4DGLC 2C5XA 5CY3A 3NUXA 4IMYA 4NM3A 1J7LA 4EOOA 3P79A 3R73A 2WMRA 5H8BA 4U79A 5KZ0A 3W2CA 3WYXA 2NNWB 2P4IA 4O27B 4O7TA 4DGGA 4JDKA 1IAHA 4X3FC 3DGKA 2R3OA 3EHAA 3DNEA 3VW8A 3FUPA 2YDJA 5LMKC 4YZCA 4FTJA 1GZKA 4JBPA 5L6PA 2HZNA 2V7OA 4HCUA 4S33A 3ZO1A 1OL2A 2W7XA 4JX3A 4XV1A 3MGYA 3OEFX 4EHVA 2RGPA 5JKGA 3FLZA 4ZY4A 4AGUA 3VJOA 4IFGA 4LMNA 5IA5A 4HGLA 3KXZA 3LIJA 4KIOA 3SRVA 3SD0A 3HMPA 2R3HA 4MNEB 4AS0A 3PRFA 4DLJA 4TW9A 1PMEA 3FYKX 4GS6A 5HO8A 4ASXA 3GEQA 3QRTA 5I5ZA 4QPMA 1H1RA 1GIIA 4LOQA 3ATSA 4TYHB 3Q9XA 5GJFA 4BCQA 5FXQA 4R7BA 2XS0A 3MVLA 5D41A 4W4YA 4A06A 3UZRA 2YITA 3FJQE 1XH8A 3MPTA 5CF6A 1OGUA 4B8MA 1UV5A 3MV5A 3C1XA 3LFFA 3FQEA 4GT4A 1VR2A 2GNLA 4LOOA 4LMUA 4RJ8A 5DBXA 4DLIA 3FPQA 4BY9E 2UZNA 2PWLA 4Y5QA 3AC2A 3BBTB 1ZLTA 4R3RA 3GU7A 3D2IA 4ZTHA 5BUIA 3LMGA 3H0ZA 1H4LA 3TACA 3S0OA 4RVKA 2UW7A 1Q8UA 3QGYA 4U40A 3TXOA 1WBTA 3SG8A 3DKCA 4EONA 4WO5A 5DEYA 3E3BX 2Z7LA 2CMWA 5IUIA 4A4OA 2R4BA 4K8AA 4FGRA 5DI1A 4CYIA 2QLUA 3UZPA 3NUYA 5KKRB 3L8VA 4EC8A 3SOCA 4C4GA 2UW3A 4P4CA 4KIKA 1F0QA 4U9AA 2ZMDA 3EWHA 3TV7A 2I6LA 4KWPA 5K0KA 5C4KA 2YZAA 4EC9A 3C5UA 3TN8A 2WMAA 4H1MA 4M8TA 4YGAA 4PNKA 4ID7A 4LM5A 4OBQA 4E5BA 3VF9A 1IA9A 5DG5A 3C5IA 3NIZA 4JG7A 5HESA 3HVCA 3FC1X 3RWQA 5EQPA 4U3YA 5G1XA 4U43A 3CBLA 3F5XA 3BLQA 5A4QA 5FDPA 5LMAA 5HTCA 4O0VA 1M52A 4ANQA 3LLAA 3KU2A 4C62A 2B54A 4FNZA 4LRMA 3EQGA 2QLQA 3HLLA 3ZYAA 3MFTA 3RCDA 4ACHA 4KKGA 4F9AA 5HORA 3WILA 4FYNA 3F7ZA 3RPSA 1K2PA 2OXDA 3FSKA 4IZ5A 4OTDA 4XX9A 2JKMA 4ZK5A 3KCFA 2ZDTA 3MB6A 4JIKA 2FSOX 4YJPA 4E26A 5AV4A 1FGIA 3CR0A 3PJ3A 2J9MA 1IG1A 2VNWA 2YCRA 4KIKB 3ZRMA 4W8EA 1KE9A 4I93A 2RFEA 2OJGA 4UMPA 1YOMA 2QQ7A 2VWBA 3PLAE 2JDOA 5EM7A 2KULA 1WVWA 1A9UA 5EOLA 4C7TA 2YLFA 2QO7A 4F4PA 4FG9A 1OIRA 3S3IA 2E9UA 4KRDA 3P0MA 5H2UA 4A9YA 2X9FA 4GUBA 5ACKA 3BHHA 3COMA 5LWNA 1ZYJA 2J0LA 3H30A 4FSTA 4ZIMA 1GY3A 5GZ8A 1Q61A 2WKMA 4ZJIA 4FVRA 3VS6A 4EOMA 3CJGA 3OWPA 4FKOA 4LI5A 1BL6A 3QHWA 4ARKA 3R71A 4FIGA 4ZJVA 4O7SA 3LZBA 3PIZA 3R2YA 4YPDA 5J5TA 2B9JA 5CEKA 4IACA 3DLZA 2WTKC 3N9XA 4MTAA 2RL5A 4O21A 5AR2A 3R7UA 2UUEA 4RIWA 4EUTA 3NNVA 1ZY5A 3L8SA 3TI1A 3AMBA 3I7BA 2VTQA 2XZSA 5A4EA 5EI8A 3FL5A 3I1AA 3ORPA 4KS8A 2BVAA 1VEBA 4BZNA 2QR8A 4FKPA 5E90A 3QCSA 5IQIA 2QOBA 3TUDA 3M2WA 3OWLA 5KMNA 5IUGA 4YJSA 4DTBA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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