3PZHA

Crystal structure of maize ck2 alpha in complex with emodin at 1.92 a resolution
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
328
structure length
327
Chain Sequence
SKARVYADVNVLRPKEYWDYEALTVQWGEQDDYEVVRKVGRGKYSEVFEGINVNNNEKCIIKILKPVKKKKIKREIKILQNLGGPNIVKLLDIVRDQHSKTPSLIFEYVNNTDFKVLYPTLTDYDIRYYIYELLKALDYCHSQGIMHRDVKPHNVMIDHELRKLRLIDWGLAEFYHPGKEYNVRVASRYFKGPELLVDLQDYDYSLDMWSLGCMFAGMIFRKEPFFYGHDNHDQLVKIAKVLGTDGLNVYLNKYRIELDPQLEALVGRHSRKPWLKFMNADNQHLVSPEAIDFLDKLLRYDHQERLTALEAMTHPYFQQVRAAENSR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title Structural and functional analysis of the flexible regions of the catalytic alpha-subunit of protein kinase CK2
rcsb
source organism Zea mays
total genus 113
structure length 327
sequence length 328
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2010-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3pzhA01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3pzhA02
2IVUA 2CGUA 3LAUA 5KMJA 4L45A 1OKVA 3OXTA 3FMEA 4FSYA 3RNIA 3KXZA 1BL7A 2PSQA 3Q52A 5KMLA 4W8EA 4NL0A 3ZSHA 4AOIA 2XVDA 3QU0A 4MQ2A 4BDHA 5DMZA 2QKRA 5AIKA 3VQHA 2PUNA 2X9EA 4L43A 4EH2A 2VNYA 3BBWA 1G8SA 2VO6A 5AV1A 4C61A 5HBJA 3R9RA 4QQTA 2J0IA 4GT3A 4C7TA 3G90X 5E9EA 5CXZA 5L4QA 4FSUA 3F5XA 4FIJA 3PJCA 5ETFA 4KKHA 3TKHA 3OY1A 3IOPA 3UIMA 4YR8A 2OU7A 4IFCA 5DR2A 1WBSA 4O7LA 5BMMA 2PUUA 2JIUA 4U41A 4QMQA 3MTLA 2WO6A 4IB0A 3ZRKA 5KO1A 3ORLA 4R8QA 3QTWA 4AAAA 3MESA 4NZWB 3CKWA 4LOOA 3CY2A 3FXZA 4RIYB 3WF8A 3DXPA 2A4LA 2X4FA 4FTJA 4BDDA 3AGLA 4YSJA 4A4LA 3TKUA 2QLUA 3SD0A 1IG1A 3OY3A 4ANOA 2VWUA 4NM3A 4XRJA 1Q97A 2Z2WA 3UMXA 1SNUA 4ASDA 4IXPA 2VTPA 1WFCA 4EORA 1IASA 3RINA 4EONA 5BVNA 5IEYA 2W5HA 4F1TA 2E9NA 5BVWA 3NW6A 4PTGA 5HKMA 1DM2A 3R01A 3QL8A 4ZEGA 4FL1A 2ONLC 4JG8A 4MYGA 4BTKA 1TQPA 2GNHA 5IQFA 3VWAA 2GNLA 2OBJA 4LFIA 4F64A 5CEMA 2OIBA 1XH4A 2ZDUA 5HLNA 3F2NA 4LRKA 4FK6A 2Z8CA 4ZP5A 4CYIA 5JEBA 3FMJA 5AP0A 2W1FA 3ZU7A 4IWPA 2HW7A 4GUBA 4AZSA 1QPCA 2VTHA 2C47A 4XLVA 3A2CA 4APCA 3ORKA 3C4WA 4E3CA 5FDXA 3BGPA 1SVEA 3HZTA 3QQKA 2E9VA 5EHLA 5EOLA 4Z9LA 2P3GX 3VRZA 5DR6A 4ITHA 3K5UA 2CKPA 4BKYA 4HGTA 2RSVA 4IZ5A 4KRCA 2F7XE 4WSYA 3JR1A 4A7CA 4J95A 4QMWA 4ANQA 4ZZOA 3NUYA 5LMAA 3NIZA 4D1XA 4UB7A 3EB0A 3BV2A 4X7QA 2QI8A 5HNIX 3V8SA 2JBOA 3LJ0A 1GZKA 4L67A 2UZBA 4D2RA 2XKCA 3THBA 2VWWA 1LUFA 2DQ7X 2HK5A 2B9FA 4FOBA 4EH5A 2W4OA 4OGRA 2BHHA 3C7QA 3SHEA 4B8LA 5GZ8A 1Z5MA 2W17A 5CAUA 4TWCA 4RVMA 3AC5A 3KXMA 3O7LD 4EWQA 2WB8A 4XRLA 3GU8A 1YDSE 4WNOA 5EYDA 3Q9WA 4MBLA 4X2GA 3E64A 3UZPA 3VHEA 3QTXA 4IE9A 1XH6A 3FLZA 3E62A 4BY9E 2A0CX 4RIXB 2BVAA 3FLSA 3MSSA 3VS3A 3GU4A 3WYXA 4EOKA 5KMKA 5L2TA 5DT3A 2YHVA 2PMNX 5A54A 5DHJA 5BVEA 4XP3A 5AV2A 4HOKA 1H0WA 1UU8A 4R7BA 5AUUA 4I22A 5CF4A 3RHKA 2J7TA 3H9FA 4I6FA 4EOJA 2ITXA 3FMKA 1SM2A 4QNYA 2JKQA 2R3NA 4XNEA 3V6SA 4V05A 2RG6A 4O6EA 4FBXA 3D4QA 3DNDA 2VX1A 5BUIA 3PXZA 5CENA 3UBDA 3IQ7A 5E8XA 2PYWA 1O6LA 2XIYA 3H9OA 3HMPA 4IAZA 5F94A 3BHTA 4UXLA 4XP0A 3VO3A 4C62A 1OKZA 1PXMA 4NWMA 3A7FA 5BUEA 3P23A 3Q3BA 4CFFA 1Q5KA 4GK3A 4YUQA 1JBPE 4ZSLA 2W1GA 5DLSA 3UPXA 4B8MA 3LHJA 4TT7A 4CTBA 4HVIA 3KXGA 5KHXA 4FA2A 4GFGA 2B54A 1BI7A 4YURA 5EHYA 4FK3A 4WD5A 3HP2A 4FTAA 4YC3A 3UNJA 4RX5A 3BKBA 2XK9A 4UWYA 5DPVA 2R3OA 2RFEA 2OICA 1OECA 2YERA 3QC4A 4TYHA 5LCKA 3RZFA 3OUNB 3O17A 2ZYBA 2W05A 3DBCA 4XG4A 3V5PA 4ZTQA 3F61A 3ZMMA 1P14A 1ZMUA 3IK3A 4HYIA 2XNOA 2FSLX 2UZLA 3GC9A 4GU9A 3ULZA 3EN4A 4GK2A 3IKAA 5T6KA 1YOJA 3QCXA 3QUPA 3PPKA 4PWNA 3V8WA 3COIA 4IW0A 4X2KA 3W2RA 3MH2A 4DINA 3E7OA 4DFXE 2H9VA 2QR8A 1S9IA 4UMPA 4CLJA 4H36A 3QCQA 4G9CA 3F5PA 3OWLA 2FO0A 4XMOA 2QO2A 1GIIA 2BROA 4ZLZA 2XNMA 4CKIA 4YJSA 4S30A 3WYYA 3LCTA 3AT3A 5IEXA 1NVRA 3ZBFA 4FV1A 5IF1A 2GQGA 4M68A 3NUSA 2QNJA 3OHTA 1Q62A 4O0YA 4RX9A 5J1WA 4H05A 5AUTA 4A06A 4GMYA 2HXLA 3ITZA 3D5VA 3L1SA 4PDSA 4BTFA 1BX6A 1VJYA 2HOGA 3DBQA 5CS6A 2Y9QA 4V0GB 4KABA 3ID6C 3TV4A 4OTFA 3LCKA 4RX7A 4B4LA 2DS1A 3DKCA 1H1PA 4CZYB 3KKVA 2YDJA 3FZSA 3HEGA 1BKXA 3DFAA 4RWKA 4Y46A 5CTPA 4EH3A 3OD6X 1U5RA 5D1JA 2R3QA 4IHPA 4FKRA 4IBMA 4G17A 3R1YA 4QMYA 5AP1A 2VWYA 5CYIA 3VS4A 4ZY5A 5GZ9A 3FLQA 4CRLA 1OI9A 3E8DA 2X2MA 1YWRA 5F20A 2WU6A 4LL0A 4L9IA 3WZEA 5KCVA 5E8ZA 1ND4A 3C4XA 5K3YA 4TTHB 1SVHA 3Q04A 4JG6A 4CMUA 5CASA 3VULA 2GPHA 3BQRA 4TYJA 4RG0A 4O1PA 5JZJA 5AR3A 3IOKA 4YZDA 4F0GA 4F7SA 4FV2A 2EB3A 2QOLA 3K2LA 5FQDC 1FGKA 1ZMVA 2FGIA 5AEPA 4DA5A 3RAHA 4RIWB 4BYIA 4X3FB 1QPDA 4ZS0A 3VBWA 4ZJVA 4F63A 2O65A 5IDPA 2HZ0A 3EN9A 3MPAA 4RQVA 1FQ1B 4I3ZA 1GY3A 2QOOA 3OWPA 5FEDA 5AWMA 5IDNA 5KBRA 4PX6A 3RAIA 4F0IA 4I0RA 3IG7A 4D1SA 4JAJA 3DDQA 3KVXA 1W83A 4W4VA 2ITZA 4DGOA 5H9BA 3U8WA 2R3LA 4EUTA 5D10A 3EWHA 4QMZA 4FTNA 2W4KA 4YU2A 3UNZA 1LEZA 3CE3A 4RFMA 5ETCA 1HCKA 3UZTA 3BYSA 3U6JA 3A4PA 3GU7A 2BKKA 3IGGA 1ZOGA 2W9ZB 1M17A 1ZY4A 4YTHA 3SRVA 4BDFA 3EFKA 1JPAA 5A4EA 4RSSA 3O8UA 3WARA 5CEPA 1SYKA 4LRMA 4IVDA 1PXIA 4FR4A 3Q9ZA 4J96A 3W33A 1L8TA 4MVFA 2VWBA 4GRBA 3NNUA 3RJCA 3H3CA 2WMSA 3Q96A 3QKKA 2F57A 4P4CA 1H1RA 3VUDA 3E8EA 4Y5HA 3GU6A 1B39A 3L9LA 4IB5A 5JGDA 1ZYDA 4C8BA 3LXKA 4RPVA 2CGVA 3H9RA 4YJPA 5FD2A 5HNGA 3TEIA 1OIRA 5CSWA 4ZJJA 3UOHA 4DH5A 4LGHA 4MQ1A 4FV6A 5M08A 3Q2MA 5FWKK 4MXXA 3RPOA 4AQCA 2IN6A 5AADA 4WRGA 1R78A 3PIXA 5D12A 2YLFA 3TWJA 3LQ8A 2JD5A 2YM8A 5M57A 3G51A 3KMMA 1W98A 4YNEA 2C68A 3ET7A 3I79A 3MWUA 3RKBA 3NSZA 5BYLA 4E5WA 4FKSA 2FH9A 1UNGA 4FKJA 3QQFA 3R73A 3FZOA 3GFEA 3MS9A 3R8UA 2UW0A 2O0UA 5G1XA 2UZNA 4Z3VA 3U54A 3QX4A 4CG9A 5AIRA 4L42A 4BVUA 4BRXA 4GVAA 3ENMA 1E1VA 5AUWA 3VJNA 2VUWA 5M4UA 4JG7A 5FM3A 4R1YA 4G9RA 2Y7JA 2YACA 2JAVA 1M2PA 2XH5A 4N6YA 5AX3A 4BTJA 4G16A 2C6OA 4IFGA 3UG1A 3RM7A 5C8KA 3LE6A 2CNUA 2XKFA 3KF7A 2REIA 4O7TA 3AXWA 4GKIA 4GSBA 3VW8A 3TL8A 1PXNA 4HJOA 3CY3A 2IVVA 3WIKA 2GFSA 4QQ5A 4BCIA 2CSNA 5DG5A 3ODZX 5FEQA 4CYJA 3OXZA 3U87A 3R1QA 4CVAA 2HYYA 2CLXA 3SG8A 4ZLYA 4L3LA 2AUHA 3FC1X 5HTCA 1W84A 5IH6A 2YIWA 2A2AA 3K3JA 3AMAA 4IX5A 4Z7GA 3HECA 2BFXA 3OBJA 2X8DA 4JL9A 5CU3A 2QG5A 4O0RA 4F6SA 4UYNA 4I6HA 2YWPA 3ORXA 4D0WA 3DKFA 3CS9A 1JKLA 1OBDA 4FT0A 5DEWA 3WE4A 3HAMA 2EB2A 2IVSA 3GC7A 2WQOA 3QBNA 1WBVA 3NPCA 2ITOA 4EOLA 3LMGA 1ZZ2A 1ATPE 4R1VA 4TRLA 3KY2A 2VD5A 4K2RA 2V7AA 5DI1A 1YHSA 2XM9A 4KBKA 4IDTA 4QMPA 2PZRA 4GJ2A 4OR5A 1OBGA 1OKYA 3PPJA 2JC6A 2WIHA 3Q4UA 3GFWA 3UYTA 4EHEA 1U46A 3RWPA 1VYZA 5C4KA 4G31A 4E6DA 4FV4A 1WAKA 2QKWB 4E6CA 1H24A 3R9NA 3HDNA 2ITWA 5BYZA 4AA4A 1UNHA 2YJSA 5B2MA 2UW4A 4XCUA 3F82A 3MYGA 3OUKA 4J7BA 4WNKA 4XG3A 4YSMA 1Q3WA 3M1SA 4NM7A 2ITPA 5FP5A 4BIEA 2X81A 2ZV2A 3QRJA 3FLWA 2BHEA 4ACMA 3CQEA 2IZUA 4IWQA 5KZ0A 5F1ZA 4B6LA 3T9TA 3L9PA 4FX3A 4I21A 4FTLA 4ZY4A 5A6NA 2O3PA 3QWKA 1ZY5A 1ZOEA 4Y85A 4ZIMA 3I6UA 4YJNA 4FT3A 4DGGA 4F7LA 2BAKA 4K8AA 3HV4A 3R00A 4OTRA 1FOTA 4X2FA 4ORKA 1GOLA 2QG7A 1TQIA 4QMNA 2CN8A 3FPQA 5IA1A 2XNNA 3QLGA 4W9WA 3I4BA 3R0TA 1IAHA 4KIPA 5LWNA 4RJ4A 3EQCA 1F5QA 3D94A 4JQEA 4O0TA 1M52A 2ZAZA 1YXTA 2OKRA 2X7GA 3IECA 3TIZA 3RAWA 4PPAA 3RZBA 5K5NA 2FSMX 4ENYA 3FQHA 5ANEA 3DFCB 4W9XA 1O6YA 2XJ2A 1YHVA 3PVWA 4OBOA 4AZTA 3EKNA 4FUXA 4BBEA 3OT8A 4TL0A 3GB2A 3E7VA 5GIOE 4E6AA 4G6LA 2C6KA 1PF8A 2C0TA 3RGFA 3F88A 5M09A 3UP7A 3UQFA 2X1NA 4KS8A 2ZMDA 2ITVA 2W06A 4ZS4A 2P55A 3QWJA 4O22A 3G9LX 4CMTA 2EXEA 4Y72A 4K0YA 4CFMA 3I81A 3A62A 4YO6A 5HGIA 2SRCA 4FV7A 4ONAA 4TNBA 3S2PA 3NUPA 3SXSA 4EHVA 4O2PA 3PP1A 4HVHA 1Y6BA 4DEHA 3TIYA 3AC4A 3UMWA 1WVYA 5AAEA 3FQEA 3W2OA 2J5EA 4EQCA 4EC8A 3RI1A 5K0XA 2EUFB 2B4SB 2R3PA 3C0HA 3HDMA 1Q3DA 2IZRA 4JOAA 4U0IA 4JS8A 3TXOA 4NTTA 3WE8A 4L6QA 3VS5A 4FVRA 3F6XA 3ZOSA 5HVKA 1YWNA 4TWOA 1FVRA 3WOWA 3BPRA 1HOWA 2WMAA 3TI1A 4O86A 4A9UA 4YZCA 3REPA 4WUAA 5EKOA 4C59A 3FXWA 3FHRA 3Q5ZA 4FSQA 4OTGA 1H28A 5IQBA 3A8XA 5AUYA 4NEUA 4ZMFA 4FZDB 2EWAA 5J9LA 2UZWE 4D58A 3ACJA 2ITUA 5IA0A 5KMNA 2QO9A 2Z60A 3LLTA 4OTIA 3SXFA 5HORA 3NMUF 2ZDTA 3OS3A 4M97A 3NDMA 4HPTE 3VUMA 4FEQA 4JI9A 3HV3A 2XJ0A 3MGYA 4YP8A 5HG8A 4CSVA 3PLAE 4FUYA 4ZTRA 5JFVA 1R39A 2BKZA 3HRBA 4TY1A 2GHGA 3NYOA 5HLPA 4YTCA 5FUTA 4RX8A 3CTHA 4DFLA 3DA6A 3K5VA 5EDQA 4EHGA 3A8WA 2XIKA 2VTMA 2W96B 4QO9A 1G8AA 3EZRA 4UBAA 5IKWA 1U54B 4AW1A 3OTVA 3PDTA 3RBWA 4J8NA 3CGOA 1CKJA 2W1ZA 3PWDA 4K11A 4U8ZA 5AP5A 3FI2A 4WG3A 5EFQA 3C4ZA 5HO6A 3ZDUA 4QTBA 4AUAA 3DT1A 3D83A 3JY9A 4TYIA 5J79A 3ZEPA 5DE2A 4R6VA 4F6WA 3MN3A 5C1QB 3AGMA 3S1HA 1P4OA 2WNTA 3OP5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3KUL B;  3IO7 A;  4RGJ A;  4X3J A;  3BGQ A;  3KCF A;  3LIJ A;  2R3H A;  4P7E A;  4RIX A;  3FZT A;  4QD6 A;  4FYO A;  3OFM A;  4QOX A;  4O96 A;  2IW6 A;  3RPY A;  4QYH A;  3BYV A;  1WVW A;  3KVW A;  2ZVA A;  3PUP A;  1FGI A;  4JBV A;  3IW6 A;  1IA8 A;  1Y8Y A;  3P9J A;  3QC9 A;  5A4L A;  3QD2 B;  5GJD A;  1KV2 A;  4XH6 A;  2VX0 A;  1JLU E;  4WBO A;  2HZI A;  4DFB A;  2WIP A;  3FHI A;  3LFQ A;  1OMW A;  4MCV A;  1DAW A;  1LEW A;  3QGY A;  4YJU A;  5AP6 A;  4RA4 A;  4DN5 A;  1K3A A;  4HYS A;  3FE3 A;  4IC7 A;  3RHX A;  2F49 A;  5IQC A;  2QR7 A;  4CNH A;  4CKJ A;  4BWP A;  2R3J A;  3ENH A;  2YAK A;  3LFA A;  4J99 A;  4EH9 A;  5CAL A;  4IH8 A;  3QF9 A;  3PJ2 A;  4FV8 A;  3QYZ A;  4EKL A;  3U6I A;  4U44 A;  5DOS A;  4C33 A;  2ZB0 A;  3ORN A;  4NW5 A;  5DT4 A;  1UA2 A;  5E8U A;  2OXY A;  3F3W A;  2BZH B;  5CU0 A;  4Y73 A;  4ASX A;  3CQW A;  1YXV A;  1Z57 A;  1PYX A;  4RMZ A;  2VWX A;  1YRP A;  3G2F A;  3S4Q A;  4AP7 A;  2XIZ A;  3BV3 A;  4G34 A;  5AND A;  5I9X A;  3BCE A;  3MFU A;  2C6M A;  3RM6 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2IVU A;  2CGU A;  3LAU A;  5KMJ A;  4L45 A;  1OKV A;  3OXT A;  3FME A;  4FSY A;  3RNI A;  3KXZ A;  1BL7 A;  2PSQ A;  3Q52 A;  5KML A;  4W8E A;  4NL0 A;  3ZSH A;  4AOI A;  2XVD A;  3QU0 A;  4MQ2 A;  4BDH A;  2NYA A;  5DMZ A;  2QKR A;  5AIK A;  3VQH A;  2PUN A;  2X9E A;  4L43 A;  4EH2 A;  2VNY A;  3BBW A;  1G8S A;  2VO6 A;  5AV1 A;  4C61 A;  5HBJ A;  3R9R A;  3BL9 A;  4QQT A;  2J0I A;  4GT3 A;  4C7T A;  3G90 X;  5E9E A;  5CXZ A;  5L4Q A;  4FSU A;  3F5X A;  4FIJ A;  3PJC A;  5ETF A;  4KKH A;  3TKH A;  3OY1 A;  3IOP A;  3UIM A;  4YR8 A;  2OU7 A;  4IFC A;  5DR2 A;  1WBS A;  4O7L A;  5BMM A;  2PUU A;  2JIU A;  4U41 A;  4QMQ A;  3MTL A;  2WO6 A;  4IB0 A;  3ZRK A;  5KO1 A;  3ORL A;  4R8Q A;  3QTW A;  4AAA A;  3MES A;  4NZW B;  3CKW A;  4FJV A;  4LOO A;  3CY2 A;  3FXZ A;  4RIY B;  3WF8 A;  3DXP A;  2A4L A;  2X4F A;  4FTJ A;  4BDD A;  3AGL A;  4YSJ A;  4A4L A;  3TKU A;  2QLU A;  3SD0 A;  1IG1 A;  3OY3 A;  4ANO A;  2VWU A;  4NM3 A;  4XRJ A;  1Q97 A;  2Z2W A;  3UMX A;  1SNU A;  4ASD A;  4IXP A;  2VTP A; 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