4YPSA

(r)-2-phenylpyrrolidine substitute imidazopyridazines: a new class of potent and selective pan-trk inhibitors
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
294
structure length
280
Chain Sequence
GSGIRVHHIKRRDIVLKWELGEGKVFLAECHNLLDKMLVAVKALSESARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDMSRDIYSTDYYRVTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transfease/transferase inhibitor
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
publication title (R)-2-Phenylpyrrolidine Substituted Imidazopyridazines: A New Class of Potent and Selective Pan-TRK Inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 86
structure length 280
sequence length 294
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2015-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4ypsA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4ypsA01
2YM7A 3RGFA 5DA3A 4BCKA 4DTAA 3ORTA 3KXHA 5FD2A 4EH4A 3IDPA 2Z2WA 1V0OA 4F0IA 1JQHA 4F6UA 2CNQA 1FBNA 2NP8A 4FIJA 5DVRA 4C2WA 2QOCA 5CF8A 4NH1A 3P4KA 2WQBA 1OM1A 3HAVA 4DT9A 3LFNA 2LGCA 3ULIA 4UBAA 3EQHA 5CU2A 4PPAA 3WI6A 4LMNA 4PY1A 5FQDC 1FPUA 2PTKA 3II5A 1CM8A 5EM8A 3GI3A 4KABA 4EK3A 3EN9A 4R8QA 4EYJA 2XCKA 3MY1A 3M11A 4PP9A 3UZTA 3R2BA 4MHAA 3Q3BA 1U54A 3VBTA 4YO6A 3SD0A 1PXMA 2OU7A 3FHIA 3EYHA 3TL8A 4CQGA 4FEVA 1YHVA 3RM7A 3U54A 3ANRA 4RIWB 2Q0BA 3PP0A 2LAVA 3ORZA 5D7AA 3UQCA 3LM5A 2XEYA 3BBTB 4FKQA 5KE0A 4KUJA 1YI4A 4EJ7A 2WU7A 5D7VA 2JKQA 2R3GA 3U51A 4AG8A 4ZMEA 2YAKA 1F3MC 4RRVA 3V3VA 2OJ9A 4ZOGA 5T3QA 2C6EA 2O3PA 4HVGA 2XP2A 1Y6AA 2VWYA 3B8QA 4XV9A 3THBA 4DEDA 3RHXA 3MVHA 3WF6A 3F61A 1J7LA 3K3JA 4F7JA 4Z3VA 1PXPA 5FP6A 4XHKB 3QWJA 4FV2A 2CHLA 4D4YA 5L3AA 5CT7A 5AUWA 5TF9A 3E8NA 5DEYA 3VS2A 3PSCA 2YFXA 3L9PA 5FEDA 2YDJA 4DHFA 4FKLA 4HPUE 3PLAE 4G1WA 5E91A 2GHLA 3NR9A 4AE6A 3I0OA 3QUEA 4BCMA 4EH5A 5EKOA 4BTJA 4HW7A 4FKWA 2BZJA 4CKRA 2XIRA 3R7EA 4EUUA 4NCTC 4XG9A 4AU8A 1OKYA 2R7IA 3V8TA 3PG1A 4IC7A 2YIXA 5EOLA 2W4KA 3L8PA 2UW5A 2YWPA 1PMVA 3RBWA 4BKYA 4FOCA 1XH5A 4N6YA 3DBQA 4E5AX 3VBVA 2F9GA 4EONA 2OF4A 4FSUA 5B7VA 2BZKB 2XNOA 3MVLA 4I41A 4JNWA 3FPQA 1RQQA 3R0TA 1Q41A 5M08A 4R3RA 1O6YA 5HI2A 3UP2A 4BDHA 2W1FA 2WMRA 4ZS0A 2IVTA 3R1YA 4YHFA 2RIOA 5EI6A 3RNIA 4C02A 4ALWA 2ZM4A 4WSQA 5LMAA 2Y7JA 4XG3A 3LIJA 4HVSA 3CJFA 3UG1A 2BIYA 4J1RA 3UDBA 4GFOA 3RAHA 5M07A 1XKKA 3DJ7A 3SHEA 3MFUA 4V0GB 2OBJA 3ACJA 2R0UA 3QWKA 4GV1A 5CNNA 3JXWA 3SRVA 4AZEA 1PMEA 3VQUA 2B55A 3LCOA 4P2KA 3KULB 3PIYA 4FTAA 2RFSA 3FBVA 2RSVA 2VTMA 4S31A 2VWZA 3A4PA 4BCOA 3GCUA 4XH6A 5IEYA 3FV8A 1XO2B 2QOLA 4EH7A 4LV5A 1YI3A 3OROA 4YTIA 3HV5A 4FSQA 4DFZE 3MPMA 5E8ZA 1WBSA 4P7EA 4Y83A 3HP2A 1GJOA 3ETAA 3FZRA 4FSZA 3MDYA 3BKBA 5IA3A 4DH7A 4F7LA 5IQFA 3T3VA 1WCCA 1WBWA 3RCJA 3NAXA 4FVPA 4AFJA 2RFNA 2JBOA 3MPTA 3PIZA 2QNJA 5BVEA 3Q04A 4K0YA 5EM6A 3NLBA 4BTFA 1TVOA 4C8BA 1GNGA 4JAJA 5IQAA 5CAUA 4DG2E 4D5KA 5I9XA 4PDSA 4JG6A 3UE4A 1URCA 4JX3A 4XP3A 3OXIA 3KRRA 4FV1A 3LXKA 4HVDA 4C4HA 4BIEA 3F3TA 5IQCA 4GT5A 3QUDA 2OICA 4HGLA 3V01A 4O82A 4PRJA 3ZEPA 2HZNA 1JOWB 2R2PA 4R5SA 3W2SA 4EH9A 2W1DA 4RA4A 4XBUA 4I3ZA 5ANIA 4EI4A 5HICA 1DI9A 4EZ3A 5BVOA 4EC8A 5AMNA 2JEDA 3QQFA 1V0PA 2WOUA 2YCRA 1JKSA 1T45A 2J0JA 2JIUA 5AEPA 2PPQA 2GCDA 1WZYA 2NRUA 4X7QA 2PE2A 3NPCA 1G8AA 1KE9A 4D2SA 2C68A 2OJFE 2XIYA 2GNHA 1MRUA 3PG3A 5CALA 3L8SA 2Z02A 4FBXA 3V5QA 1BI8A 3OUKA 2YM5A 4BZOA 2HZ4A 4ASDA 3D15A 3F66A 2W5HA 5EHLA 4F9BA 1KOAA 5I9ZA 3WILA 3QGWA 3QXOA 5HO7A 1NY3A 3F6XA 4HYIA 4EHEA 4C61A 2I7QA 2A1AB 3HRCA 4R3CA 5H9BA 5IQBA 3V5TA 3W2QA 5JN2A 2YISA 5HVKA 4MKCA 2BR1A 3KN5A 4LRMA 4AGUA 3POOA 3F7WA 4IM3A 1IA9A 4KD1A 3SVVA 4DBNA 2JAVA 5A4LA 5JZJA 4L3JA 1YWVA 4JIAA 5G6VA 3ZRKA 4HGEA 1F0QA 2C30A 3TJDA 3ZH8A 4O7TA 2YABA 5A4CA 3HMIA 2IW8A 5C9CA 4CGAA 4AE9A 4WG4A 2FSOX 1U54B 3VQHA 4ANMA 4BDKA 4EUTA 3KEXA 5GJFA 4RVMA 3VAPA 4A4OA 4CNHA 3P0MA 5DWRA 2QOFA 4NM0A 1KE7A 5E1SA 4E4NA 2YM8A 3P7BA 4FIGA 4PDPA 3U55A 4KNBA 3AC8A 1GY3A 3PA3A 4PMSA 4QMWA 4P90A 4PPBA 4W9XA 2GFCA 3IW8A 4D9TA 4OTPA 2OXYA 4EKKA 2RFEA 4U81A 2XEZA 2B9JA 5EYMA 4L6QA 2VTOA 2Y4PA 3E64A 4L53A 3AC1A 4DH8A 3GFWA 2WMUA 4F09A 2WMBA 1ZOHA 1NVQA 2C4GA 4JDJA 3ZRLA 2I0HA 5DHJA 5L2SA 2IW6A 3VW8A 4DFXE 4OR5A 3U4UA 2OI4X 2J4ZA 4AOTA 3FDNA 3LFSA 5CYIA 5JEBA 3CP9A 4R1VA 4OT6A 3GOKA 4UWCA 3F5UA 4F1MA 3EQDA 3FZPA 4FVQA 3TV4A 2YZLA 2B9IA 4G3DA 2W9ZB 2BKZA 4PMPA 4ASXA 3F3VA 5JFWA 5K0KA 3PVUA 1H24A 3QKMA 5IQHA 5DPVA 4A9RA 3NIZA 5TR6A 3ITZA 3V51A 5C1QB 3AGMA 4IWOA 4KRCA 4MNEA 4I22A 2HENA 2PVJA 2QO7A 3IG7A 3PWDA 5E8UA 2OLCA 3UIXA 2R3MA 3ATSA 4DEHA 4WNKA 5L2QA 3O96A 4RIXB 2RG5A 5J5SA 5EW8A 3DLSA 1IG1A 3FE3A 2CMWA 3DBEA 3QALE 3I5NA 2Y0AA 2GTNA 3ZC6A 3R8ZA 3R22A 3MBLA 1SVGA 4MWHA 5D41A 4AOIA 4DFBA 5AV3A 2XYNA 4IACA 1KE5A 2B54A 3SRVB 4XG4A 1NT2A 1LEZA 2EWAA 2YITA 4BCQA 3BHTA 3RAIA 3TKHA 3BQRA 3A60A 3FXWA 4NWMA 5C26A 3A99A 5EFQA 3VS3A 4D2TA 4YJTA 1Q8TA 5HE3A 5KNJA 1GAGA 3K2LA 3R00A 4Q2AA 5BMSA 5FBOA 3KC3A 3KRJA 3KRWA 4IB0A 3HV3A 3LFAA 3Q96A 4FOBA 3VBXA 3IO7A 1OIQA 3UO4A 3NW6A 4KKHA 5DT0A 3C4EA 2HIWA 2Y4IB 2HCKA 4ZMFA 3CE3A 3RI1A 3LW0A 5F94A 4O7RA 4FG9A 4C37A 1CSNA 3WZJA 3G0EA 4GG5A 3TV7A 4HJOA 2X4FA 5D12A 4IANA 4QP4A 4RIOA 4FNXA 3GBZA 3ORXA 4ITHA 4CV8A 2J50A 4RX5A 4ASEA 3DY7A 4L52A 4R3PA 5EKNA 4XP2A 5KMOA 1KUTA 4OTGA 4JG7A 3JY0A 4XOZA 3A7FA 4C4GA 1O6LA 2W1ZA 3AT2A 4FNYA 4JJRA 4YC6A 4IX4A 3D5VA 3FI4A 4IAFA 3PTGA 4KBKA 4Q9SA 5AP7A 4AGCA 3RZFA 2BAJA 3OCTA 1ZZ2A 3R02A 2VX3A 5KHXA 5G1XA 3S95A 4NSTA 3TJCA 3NUPA 4YSMA 1IR3A 3KCKA 4MWIA 3OOGA 4NM7A 1A06A 3OBJA 5DBXA 3QXPA 3QTSA 3N51A 3A61A 4HYHA 3OBGA 3KCFA 4S32A 1M2PA 4BIBA 5HESA 5FXRA 3DDQA 3MB6A 5D10A 4U8ZA 3PP1A 3TXOA 3Q60A 2ITYA 4MD8E 4FG8A 4A06A 2X81A 4HNFA 4H3BA 5CU4A 4MAOA 4FI1A 3DU8A 2GS6A 3FSKA 4PUZA 3ZS5A 4RX7A 4JR3A 4CFUA 5M4FA 2O63A 2JD5A 1JSTA 3HX4A 3NGAA 4EBVA 2B7AA 4IBMA 1UU9A 5FTQA 1DAWA 3RALA 4EH6A 4C36A 5HTCA 3FYJX 3SX9A 5CEOA 2F2UA 1XH8A 1Q97A 3UC3A 5DT3A 4EH3A 4C33A 4F0FA 4MBJA 3LPBA 2B4SB 1WVWA 4RA5A 1IRKA 2VO7A 5FRIA 2PZRA 3CR0A 1B39A 4QQCA 4U79A 3R9DA 3CCNA 4GH2A 4MD7E 3UNJA 4RGJA 1UNGA 4LRKA 4IJPA 2HAKA 4J7BA 4JVGA 3DBCA 4MTAA 4E3CA 4TW9A 2PSQA 3MIAA 2ETMA 2FSLX 1W8CA 5C03A 2PVKA 3G9NA 4DYMA 2W4OA 3MYGA 4EQUA 4C58A 5CEIA 4MYGA 4XCUA 4BCGA 4FC0A 2ITTA 2XNEA 2YCQA 5JSMA 2RL5A 5JMSA 4DEAA 2BHEA 2G2HA 4O7WA 2QI8A 3QYWA 3TUBA 3DPKA 4EZ5A 4OTFA 4JDIA 3R63A 1UKIA 3QLFA 2X9FA 4XP0A 4MCVA 3BE2A 4RFMA 4F08A 2B1PA 4EHVA 3NZ0A 4Q5HA 1WMKA 3PIXA 3ZLWA 4OAVB 4DFUA 3PXQA 1M2RA 4CT2A 4XG2A 2RKUA 2ITWA 5FBNC 2PZPA 4RWJA 2E9OA 2XKCA 4YJSA 3TEIA 4JL9A 3QQLA 4BBEA 3C9WA 3D5WA 2C6TA 2R3OA 1ZXEA 2EXMA 3GNIB 3V6SA 3BLRA 1URWA 3GCPA 2BTSA 3KGAA 2HZ0A 2IVUA 1GZNA 3I6UA 2PVFA 2PVMA 2W0JA 2VTPA 4WG5A 4CRLA 4MNEB 2VWIA 4UY9A 4XUFA 2J9MA 5FP5A 4FIFA 5L4QA 3RPSA 4TRLA 4L3LA 4BCNA 5L2TA 4U6RA 3R7GA 4MK0A 2Q0NA 2WTJA 3KMWA 3AC5A 4TT7A 3KKVA 4ENXA 2IZRA 1P4OA 4UB7A 2X8DA 4FKRA 5BVWA 3RAKA 5AR2A 1UWJA 1JLUE 3MFTA 2YJSA 2OGVA 1J7UA 4CZYB 2Z7SA 3GU5A 3HV4A 2ITNA 3A7HA 3P86A 4I6BA 4H1MA 4RWLA 4U9AA 4D4SA 4EOOA 4FTQA 3VHEA 3WZEA 4XG7A 4BY9E 4QTCA 4FT0A 4YJUA 4IWDA 1H4LA 4W9WA 4RVKA 4D2WA 4DGMA 3OTVA 5KHWA 2BRBA 4WBOA 4WOVA 4DH5A 4Q9ZA 5IF1A 3R04A 4FVRA 4O0UA 4FSRA 5AUXA 4ALUA 1GIJA 5C27A 4DCEA 4USEA 3N4VA 4E5WA 4FKTA 2J5FA 2OFUA 2XRUA 5FM3A 4NJDA 1SVEA 3JS2A 4IAAA 3QU0A 4KBCA 4YLKA 5GZAA 3F3WA 2YDKA 4OBOA 3AQVA 4F9YA 4O38A 4I1ZA 5A9UA 4FKOA 2C5VA 3A2CA 3UO5A 2VTTA 2EB3A 2F7XE 1R0EA 4FZFB 5AM6A 3UBDA 3ENHA 4GYGA 4J8NA 3EQBA 4IXPA 2GS7A 5ETIA 3OFMA 1ZY4A 1E9HA 5IA2A 4X3FC 3H0ZA 4FTOA 4O1OA 1M52A 3OWPA 3SOCA 3JVRA 2QG7A 2AC5A 3ELJA 2XNGA 3TDVA 4EOKA 3QQGA 4ACHA 3NCGA 4RVLA 1NXKA 3UIMA 1KSWA 3WF9A 3ZHPC 4NKAA 3AOXA 4CYJA 5CF4A 5CSXA 3MA3A 4O96A 3PVBA 4I0RA 4O0RA 3LAUA 5HNIX 2QONA 5HIBA 3LJ1A 3UOJA 4WT6A 2YCFA 4AA5A 4E93A 4ID7A 3SAYA 3F2AA 2XA4A 2B0QA 4M97A 4YO4A 4ANSA 3FMNA 1SYKA 4IX6A 2XK3A 1H1RA 3Q9WA 3PJ1A 4FIEA 1PXJA 2UW6A 4KS7A 3SDJA 3UO6A 3BU6A 5C8KA 3QX2A 3D5XA 4HGSA 1JAMA 4WUAA 3P78A 3W55A 1UNLA 4FV8A 4X2FA 3LFDA 3H9FA 4XLVA 4ZLZA 4M68A 2VTHA 3UGCA 3MIYA 2PK9A 2G2IA 5AA9A 4JBPA 4IIRA 1RW8A 4PL5A 5HG7A 4AZVA 4DFYA 4M15A 4O7VA 4IZ7A 5JZNA 2WNTA 4DTBA 1TQIA 3BWFA 5LWMA 4ZTSA 4A7CA 3NS9A 1JKTA 1U4DA 2XK8A 2OWBA 4M0YA 1OL6A 5FWKK 1VYZA 5J95A 4I23A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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