5A6OA

Crystal structure of the apo form of the unphosphorylated human death associated protein kinase 3 (dapk3)
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
270
structure length
265
Chain Sequence
VEDHYEMGEELGSGQFAIVRKCRQKGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREEIEREVNILREIRHPNIITLHDIFENKTDVVLILELVSGGELFDFLAEKESLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLDKNVPNPRIKLIDFGIAHKIEKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYILLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQSLEHSWIKAI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DEATH-ASSOCIATED PROTEIN KINASE 3
publication title De Novo Fragment Design for Drug Discovery and Chemical Biology.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 265
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2015-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5a6oA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5a6oA01
3KN6A 5E1SA 2FA2A 4G6LA 4O2ZA 4UN0C 5TT7A 4FKOA 3PY1A 4RLKA 3BGQA 3FI3A 2QOIA 4JDJA 4ACCA 1R78A 4F70A 4ZS4A 2W9ZB 2R3IA 4ORKA 4OBOA 1YW2A 1KV2A 4E4MA 3VC4A 4DH3A 2OXDA 2JAVA 5I3RA 4XOYA 4ARKA 2JIVA 3T8OA 4BDGA 2C0OA 4EUTA 4MXYA 3KREA 1IAHA 4RIOA 3N51A 3BQCA 3WBLA 2ZAZA 4L45A 4FV4A 3AQVA 4ENXA 2WU7A 4U5JA 1GZ8A 4FV3A 3FY2A 4HYHA 4U8ZA 2OW3A 3NIZA 5KKRB 3A60A 4PMSA 1U59A 2GCDA 1F5QA 3C4WA 4RFMA 4FUXA 3WF9A 1XQZA 4ZXTA 2AC3A 2BHEA 3BWJA 2PVMA 3CXWA 3HMIA 3TKUA 4BN1A 2ITOA 4FSTA 3SDJA 3S00A 3UMWA 2BRHA 2W1EA 2PVFA 4EOMA 4QPSA 3LZBA 3QGWA 2QO7A 3MH2A 3FKLA 3BU3A 3KQ7A 5EI2A 5HIDA 3NVKI 2QLQA 4C4FA 5DWRA 2RFSA 2UW8A 4QMYA 4BDJA 2BCJA 3GENA 5CEOA 5AWMA 1FPUA 3PJ3A 4Z9LA 4AUAA 2OG8A 2PMLX 2F2CB 5D41A 4NW6A 5LCJA 4FIHA 3BQRA 4HGLA 4KKHA 2A19B 3BI6A 3MVLA 1OPLA 1XBAA 4GSBA 1ZRZA 5EW8A 5FWKK 3TL8A 4J52A 4UXQA 5ANEA 4EJNA 4EYMA 3FZPA 5DT3A 3VS5A 3G90X 1H1SA 5M4UA 1CSNA 3CQUA 4HVSA 3QLFA 2XK7A 2Y7JA 3E88A 2SRCA 4AN9A 1R3CA 3JS2A 4D4SA 3EQPA 2PL0A 3QRUA 3ORPA 3WYYA 5M4IA 3KXMA 3IK3A 2RKUA 3HUCA 5HNBA 4TXCA 2UZTA 4K9YA 3CY3A 4W9XA 5CZIA 3VS6A 1OPKA 3FC1X 4FGBA 4AP7A 4EH3A 5CEKA 4YNOA 2IW9A 1XWSA 5K5XA 1PMUA 4IQ6A 2R3MA 3F3ZA 4FICA 3QQUA 4LMNA 2CKOA 3AT4A 1OI9A 2V55A 3GGFA 5FDPA 4E6CA 3MH1A 4D4VA 3FKNA 2YM7A 4B6LA 4CFWA 4Z7HA 3QD0A 2VX3A 4RPVA 4RGJA 2OK1A 4PV0A 4UMUA 3PVUA 1WVXA 3QFVA 3OUNB 4APCA 3ORTA 3VQUA 4DE4A 4WOVA 3V8SA 4EYJA 3U8WA 2YJSA 3PJCA 3H9RA 2VO6A 4C2WA 1RJBA 3AC4A 3DNEA 4HVGA 2CNUA 4O81A 4CV9A 2PMNX 1W7HA 4CKRA 3EKKA 4ZJVA 5BYLA 3PY0A 5HNGA 5GIOE 4BCNA 2CNQA 5ETIA 3R8PA 4OTQA 3OCGA 3HX4A 3DNDA 1GNGA 1H27A 1ZMVA 1UU8A 2QOBA 3DZOA 4PUZA 3ZLXA 5FM3A 4E6QA 4DEIA 4DFYA 3TTJA 4FT9A 1UKIA 2ITXA 2ZM3A 2QOKA 2YHVA 3QHRA 4QNAA 4YC8A 4FTIA 3V5WA 1M2RA 4GJ3A 3K3IA 2F9GA 3MIYA 3KFAA 4DA5A 4TT7A 5IEXA 3P86A 5HG8A 2JEDA 5L6OA 5ITAA 2PU8A 1V0OA 2J5EA 3VBWA 1SZMA 4KIKA 1OUKA 3O0GA 5AADA 2WEIA 3E3BX 3I6UA 3AC5A 4I6HA 2OIBA 2PVNA 2B1PA 2ZMCA 3QRTA 4BDAA 2Z8CA 4DTKA 3R9NA 3BIZA 1UV5A 4U40A 2OU7A 4DT8A 1V1KA 4U44A 3VAPA 2VU3A 3P5KA 4C7TA 4E4LA 2OO8X 3FI8A 3DQWA 3BEAA 2UVXA 4X2NA 3LCDA 3RALA 3ZM4A 4FTUA 1NT2A 2J5FA 1XBCA 3MB7A 3NYOA 1QCFA 1SNUA 4RLLA 4YU2A 4F0GA 3BWFA 2QKRA 1XBBA 3ZDIA 2XM8A 5LXMA 3OW4A 1AD5A 3N9XA 2YA9A 1YDRE 2ETKA 4EOPA 2WMXA 4EOQA 3FZTA 4BWPA 2X0GA 1ZYJA 4LFIA 4IZAA 4Q9ZA 4FKGA 3P7AA 3G2FA 4FNXA 5AFVA 3Q4UA 1U4DA 1E1XA 4G9RA 2OH4A 1VYZA 4D0XA 3P78A 5HICA 2JFLA 4JDKA 5CI6A 1M7NA 2W1IA 4C35A 3DDPA 4DCEA 4E3CA 4GH2A 3GCVA 5CEPA 5HBJA 3QTQA 2C3KA 2JKMA 3BV3A 3SG9A 5EYDA 4MK0A 3PJ8A 4FK6A 5FLFA 3LOKA 3OXTA 4ALWA 5E90A 3NS9A 3O50A 3UBDA 3QQLA 3BHVA 5KMMA 3AOXA 3SQQA 4O7NA 4OT6A 3SVVA 2OLCA 5CVFA 1PYXA 5M06A 3FYJX 4L3LA 3LVPA 5KZ0A 3EQDA 4E5BA 4IACA 4DFZE 4LM5A 5KNJA 4KBCA 2PZYA 5ACKA 3DPKA 1IA9A 1GJOA 1YI6A 3TNWA 4HYIA 4LV8A 3T9IA 3QTUA 5L6PA 3LXNA 4R1VA 4ZJJA 2J2IB 4YO4A 4R5YA 4QPAA 4C4JA 3AXWA 3R2BA 4S32A 3C4EA 1WBPA 3A4PA 4FTNA 4FG8A 4AZWA 4NM0A 2W5HA 3TIZA 3R8LA 2HK5A 1OIRA 4IX6A 3WILA 5LQFA 3VJNA 3KULA 3KCFA 5GHVA 3NUUA 3C0IA 4QMUA 3FMMA 4Z3VA 4DINA 1YI3A 2PMIA 4RJ5A 2XK9A 1W98A 4FV7A 2C5OA 2JDTA 3UJGA 4RRVA 4AWIA 4RX5A 1K9AA 3WZEA 5EQYA 3D7TA 3LCTA 4ANQA 2KULA 2OF4A 4XRLA 5ANOA 2VD5A 3FZOA 2C0TA 3UNZA 5AUTA 2HZNA 4IX4A 5K0KA 4TN6A 2XKCA 4E20A 3FDNA 5DEYA 5DLSA 3UIUA 2WOUA 4CG8A 4RX9A 3QD3A 1FMOE 5CQUA 5CQWA 3WF7A 4XP3A 2QO9A 3ULIA 1H28A 4XLVA 1OPJA 2ZM4A 2WFYA 5B7VA 4R7BA 1KE5A 4IAKA 5HGIA 4XG4A 4ZMEA 2O8YA 2YITA 1TKIA 2WQEA 4G6NA 1PXOA 5ANJA 3UIBA 4C4GA 3NUAA 5DE2A 1JKKA 3OFMA 4YZCA 4QQCA 5AP7A 5L8LA 3KKVA 1OL6A 1YXVA 4FKQA 4I23A 5AMNA 5C8KA 4O84A 4EHEA 5DVRA 4N4SA 3GVUA 1Q3WA 1Y8GA 4LMUA 4ZEGA 3SAYA 4CT2A 2Z02A 5HU3A 4RJ8A 3R02A 3KEXA 4BBFA 4F63A 4JAIA 2JITA 1JVPP 3GP0A 3UVQA 3AG9A 3QYZA 4NM3A 5DR2A 5IISA 4F1OA 3ZBFA 4MD7E 4XG7A 1URWA 5JRQA 2CMWA 5AR4A 3OD6X 4ANMA 2G2FA 4EK6A 2CGUA 3KRXA 3GI3A 1M52A 2GHMA 2WMTA 3ZLYA 3EHAA 3OROA 3W18A 3MPMA 3C0HA 4FKUA 1H01A 2W9FB 2YIWA 3V5JA 5HO6A 4GT5A 4E4XA 3L1SA 2E2BA 5CTPA 2QO2A 4B99A 4RJ3A 1SVHA 3HYHA 3OG7A 3QXOA 2HAKA 3RM7A 4MNEA 4A9UA 4ZTLA 4OR5A 3I60A 3RAWA 4M69A 3NEWA 1NVQA 4G3FA 4FA2A 2YIQA 3ODZX 2REIA 5KHWA 3ATTA 5BVFA 4WG5A 4ACGA 3JY0A 4D58A 4O6EA 4P4CA 3OY3A 5HNIX 4E93A 5L2TA 3NGAA 3VBVA 5E8WA 4XUFA 4D9UA 5IA2A 3R30A 1TQIA 4UZHA 1ERKA 3MI9A 5BYYA 4PL4A 5M09A 2J4ZA 3ORLA 4GW8A 3FEGA 1CM8A 4W4VA 4X3FC 2NNWB 5JQ8A 4D2SA 5E4HA 2BKZA 4PPCA 1U54B 3ALNA 3JVSA 4RVKA 4ALUA 1B39A 3DXPA 5I3OA 3KK8A 4MCVA 2OJFE 3DLZA 5FEDA 2H34A 3ACKA 3HUBA 5CU0A 2R3QA 4EOKA 3IO7A 3QRJA 4G2FA 2XRWA 4ZAUA 4ZLYA 3FSFA 1IRKA 3W2RA 1WMKA 5HG7A 3RP9A 3QRIA 2JC6A 4LL5A 5CT0A 4G9CA 4NKAA 4D1ZA 3ZLSA 1Z5MA 2Z7RA 4ZTRA 3VRYA 3G6HA 5L3AA 4R78A 4I1ZA 4I0SA 4MTAA 3GOKA 5ETCA 3KXHA 4UX9A 2Z7QA 2UZBA 2W7XA 2ONLA 3BU6A 5AP4A 1FGIA 2OZAB 4CLJA 3LJ1A 3I4BA 3EWHA 1YHWA 4G31A 4L52A 4WNOA 5GJGA 3BKBA 3VUTA 3Q6WA 4PX6A 2A2AA 3OCTA 4RQVA 2AYPA 5ANIA 4DFBA 1KUTA 2AUHA 3OMVA 4XOZA 3LW0A 2BALA 4JQ8A 2WOTA 3NAXA 3NWWA 4OGRA 5AM7A 2WPAA 4DN5A 2XNEA 4QMZA 2R3PA 4U42A 4BVUA 3LLTA 1JKSA 3JR1A 3IPHA 4IZ7A 1XHAA 4QQJA 4RJ7A 4YTFA 5CEMA 3SC1A 3F66A 3I1AA 3UNKA 3QCXA 3OCSA 3QWKA 2EXMA 4GYGA 3PIXA 3VWAA 4AFEA 2G2HA 5KKRC 4L68A 3ZFXA 1OKWA 2IJMA 2Y6MA 3CBLA 3GNIB 4A4LA 5LMKA 3LMHA 1HCLA 3RPOA 4YTHA 1O9UA 4YTCA 2X6EA 4WA9A 4U9AA 5IU2A 2CCIA 3AC1A 3GQLA 4CGAA 4RC4A 1TQPA 5IQGA 1JNKA 1JKTA 3PXYA 4CFMA 1IR3A 4WSQA 4IX3A 5EM7A 4D4YA 5IUHA 1ZOHA 4QYFA 2OBJA 3LE6A 2WTWA 4PDSA 5D10A 4UBAA 4J96A 3D4QA 2GQRA 4ASDA 3W32A 4M97A 1LEZA 4V0GB 3R9RA 5L2WA 3OOMA 3OWKA 3H30A 3T3VA 2FSMX 2J0KA 3HVCA 4F7JA 3NR9A 2UW9A 2C5XA 4MXOA 3O8PA 4RT7A 3VUGA 4YJRA 1GZNA 4V0GA 4JBQA 1OITA 4TNDA 3ZUVA 2UZUE 5FP5A 4AS0A 3Q5IA 3W8LA 3CR0A 4DLIA 4B7TA 4RA4A 5HLWA 4PWNA 4O0UA 4U97A 1YWRA 3R2YA 4BGGA 4C62A 3MBLA 3LXLA 4RWJA 4TYHA 2VTPA 3LCOA 3Q9YA 1WZYA 2W06A 4JR7A 1KOAA 1X8BA 2QOOA 4DG2E 4CVAA 2YM5A 4FC0A 4CXAA 3I79A 2R3RA 4FKTA 3PG3A 2XYNA 5JFXA 3UZRA 4C61A 4KS8A 4BIDA 4RIYB 1PHKA 5B2KA 4IJPA 4DH8A 1ZARA 3BLRA 2GNGA 1G5SA 4RIYA 4MXAA 2E9NA 3FQHA 5CWZA 3D0EA 3QC4A 4F9BA 3GOPA 4C4EA 4RQKA 4YUQA 3OEZA 2PVLA 4UY9A 4YC3A 4X0MA 2C69A 3MVMA 3RAKA 1GZOA 4FZ6A 4NIFB 4L44A 3N4UA 2G15A 5J9ZA 3R8UA 2QR8A 4ZOGA 3RTPA 4FEQA 5DPVA 4JX3A 4QMNA 5AV2A 2QCSA 4P2KA 4EH9A 3TJCA 1LUFA 4JRVA 2YJRA 5AX3A 3BPRA 2BRBA 3FLQA 4FIFA 5CSWA 3BHUA 4FL1A 3GC0A 5CAQA 5EKNA 3AGLA 3PUPA 4H1JA 4R1YA 3I6WA 2J0LA 2J6MA 3EFJA 3U51A 4YLLA 1U5RA 3LJ0A 4DBNA 3R01A 4Q5HA 5D11A 4L8MA 2VRXA 2PE1A 3QKLA 4KSQA 3E3PA 5DRDA 3WYXA 4QMWA 4HCTA 3VW6A 4YZMA 5HCXA 2GDOA 3S1HA 5KMIA 3F3VA 2G01A 3KMMA 4WNMA 4OT5A 2VO3A 4M0YA 2GS2A 3ZONA 5KMOA 2E9OA 2BPMA 2GFCA 3A61A 5AA9A 5G1XA 3PVGA 4ZLOA 4BB4A 3TDWA 5GZAA 3HMNA 4RJ4A 4AGWA 2IZSA 2WMBA 3ETAA 4JLCA 3NNWA 3P7BA 4BDBA 4O83A 5AP3A 4RX7A 1OKVA 2UZWE 3PTGA 4CFFA 2F2UA 5EYKA 3NCZA 3Q9ZA 3R00A 4FEVA 3RINA 4QMQA 1OL5A 3R28A 2WHBA 3FQEA 4V05A 2VO7A 3Q32A 3D2KA 2X2MA 2XYUA 1AQ1A 3A62A 3OP5A 4IADA 4RZVA 4IWOA 3N4VA 1FINA 4O7WA 4KB8A 3C4FA 4DYMA 3CE3A 2E9VA 1IAJA 3GU8A 4L42A 1PRYA 2IZTA 3NRMA 3R1SA 3UQFA 2PMOX 3P0MA 4O0RA 3QTXA 3PZEA 4MXZA 3ZSIA 4AT3A 3VS7A 1SYKA 3VUDA 3TUCA 2A0CX 3RAHA 4BGHA 5C03A 1SVEA 5TR6A 2BROA 3UVRA 4BFMA 4EOJA 2C5NA 3IOPA 3HRFA 2RFNA 1JKLA 3I7CA 4Q9SA 2CKQA 4FTTA 3E64A 3F7ZA 2XCKA 3GB2A 3GUBA 3G6GA 3ZHPC 3EQCA 4USDA 1V0PA 1PKDA 2BFXA 2ZV2A 4GL9A 3COHA 2F49A 2V7AA 4A07A 2WMWA 3RHKA 2IVSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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