5JQ8A

Crystal structure of cdk2 in complex with inhibitor icec0943
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
sequence length
296
structure length
278
Chain Sequence
NFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Cyclin-dependent kinase 2
publication title Inhibitor Selectivity for Cyclin-Dependent Kinase 7: A Structural, Thermodynamic, and Modelling Study.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 278
sequence length 296
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2016-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 5jq8A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 5jq8A01
3UPXA 1YKRA 3HRBA 5FRIA 5HG9A 4JOAA 3OC1A 3CBLA 5CVGA 4NEUA 4YU2A 2OIQA 2FO0A 4AZWA 5DMZA 3OP5A 1ZY4A 3H9RA 3C4FA 1KE6A 4RJ7A 5IISA 2C6IA 1OBDA 4DLJA 1PXKA 4WG4A 4NUSA 4EKLA 2XBAA 3SDJA 4EH9A 4ZEGA 4M69B 4ZTHA 2BZJA 3BV3A 3GC7A 4IM0A 4YLKA 2J4ZA 3LXLA 4QNYA 4RZWA 4UN0C 3VUMA 1PXIA 1AD5A 4V0GA 4EOOA 4U41A 1J1CA 1T46A 3QYZA 3DXNA 3DBQA 2SRCA 1FMKA 2ITQA 2UW8A 2W4OA 3DCVA 3MVJA 3ZO3A 1LPUA 3I7CA 4FNYA 4MF0A 3MSSA 3ZZWA 2F2UA 4DT8A 3OWKA 2QOOA 5HE1A 4D2PA 1YI6A 3GC0A 3RNIA 3ZCLA 4EHVA 4FV6A 4F7JA 3C0HA 1KV2A 3TIYA 2J0MB 3COHA 4OTPA 2REIA 5HBEA 5T68A 4I21A 1BX6A 4FL3A 5ETCA 1ERKA 1XHAA 2CNQA 1XH7A 2OO8X 2YDIA 5L2QA 2A19B 3S4QA 1Z9XA 3FLYA 1HCKA 2FSMX 4YJVA 2ZDUA 2YIYA 4Z16A 2E9UA 5I3OA 2P2HA 4USEA 4XCUA 1Y91A 2QKRA 2WFYA 4FV7A 4U40A 5CNOA 1ZYJA 5M55A 3KEXA 3QHRA 2WQMA 4HVGA 2WEIA 5J79A 4MK0A 3AMBA 4AUAA 5JQ8A 5BNJA 2WB8A 2XK9A 3OWPA 2PL0A 2R3IA 4P2KA 2F7XE 1FINA 3AC1A 3QRIA 4FSWA 4FV8A 5K9IA 4FEUA 2GS6A 1TKIA 3PP1A 3MY0A 3F82A 5A4EA 3H4JA 4L53A 1BL6A 3LMHA 2UVXA 2B54A 3MA6A 3UMXA 1E1XA 1QL6A 2WMTA 3WE8A 1BUHA 5FEDA 1Z5MA 2E9VA 5M4CA 4UX9A 4HGLA 3EQFA 4NW5A 5CALA 5CU4A 1IAHA 4FGRA 5IG1A 2R3MA 3OBJA 1ZZ2A 5A9UA 3HNGA 4FTQA 1YDSE 1Q8ZA 4FODA 3T9TA 4YMJA 2LGCA 3C50A 5AWMA 3VQUA 3CTJA 3M2WA 3NNVA 2EWAA 3FYJX 3WIGA 3O17A 1UU3A 4K18A 4GK4A 5C4KA 3DFAA 1E1VA 2I0YA 3EQCA 5H8EA 2BHEA 2OH0E 2XF0A 4JLCA 2JKOA 3DNDA 5CF5A 3KMMA 3F3TA 4I4EA 3QCYA 4CKIA 4X3FC 4C61A 4OUCA 4GU9A 5KMKA 2X81A 5GIOE 4XRLA 2IPXA 4YR8A 4KRCA 3FY2A 3VUHA 1PXMA 1GZNA 2X2MA 3PIZA 4UMQA 5L4QA 3GCSA 4G6LA 1S9JA 4WOVA 3ZHPC 3GC9A 4WSYA 3O51A 2I0HA 1YHVA 3SRVB 3QTXA 2OJIA 3VW8A 3VNTA 3TXOA 3IDCA 5CZIA 4ZSJA 4A9RA 2XNGA 2BRNA 2NP8A 2FYSA 1NW1A 3QZGA 3L9NA 4HCUA 4N0SA 5J95A 4GCJA 2R7IA 1ZZLA 4CMTA 4WRGA 5AP5A 2DQ7X 5EHYA 4KBCA 2J0KA 2Y8OA 5DLSA 3ITZA 4M84A 2BCJA 2VO6A 2YWPA 3K3JA 3K54A 3QLGA 2C6LA 4BHNA 1XH9A 4IC8A 4U80A 3F7ZA 5D1JA 4UB7A 3EFJA 3UGCA 4BI2A 3IGGA 2CGWA 3M1SA 5L6WL 2R0UA 5K3YA 5DH3A 4G3EA 4YO6A 1YI4A 5LARA 4JX3A 5F4NA 2X7GA 4LGDA 4LFIA 4O27B 4J7BA 2PVYA 4EKKA 5FLFA 3BEGA 5EOLA 4DA5A 4TPTA 3WZEA 4WNKA 3DV3A 1R3CA 3MVMA 3NUPA 1BLXA 4MX9A 4EC8A 5IA3A 1SVHA 3G15A 4JAIA 1U5RA 3RMFA 3A62A 3ODZX 3SX9A 5KMMA 5G1XA 3EL7A 4FIJA 2PE0A 3ORKA 5CSHA 3F9NA 5L6PA 5HNIX 3HZTA 4C33A 1ZOHA 5EHLA 5CASA 4AW5A 4MKCA 3ODYX 3W2PA 2CDZA 2ETRA 4RA4A 3NS9A 2X8IA 1V0PA 2JLDA 3I1AA 3EYGA 3NUNA 4GEOA 4BDGA 3EKKA 4JQEA 3CJGA 3TTIA 4FTRA 5AR7A 3ACJA 3MW1A 4IX5A 2GNGA 1I44A 4EHEA 1FBNA 4TYGA 3V8TA 4DFNA 1OPLA 2IZSA 4GMYA 3REPA 1M2RA 3HV5A 3RM7A 4EK5A 5JGAA 4YZNA 3WF9A 2H8HA 1F5QA 4C36A 2YM3A 4FKLA 4J53A 4O91A 3S2PA 4A4OA 4USDA 2WXVA 5AUXA 3C7QA 4MCVA 2J5FA 1H01A 2W5BA 3R9DA 2WAJA 3U6JA 2CKQA 1OL1A 4XG3A 1XR1A 4HZRA 3ZXTA 4D4YA 1LUFA 2PUNA 4JDHA 4BZNA 3F66A 2YIRA 3CKXA 2LAVA 3RAWA 2ITOA 2R3GA 2VTOA 4FTIA 5CVHA 5TT7A 3TJDA 4EEVA 2WZJA 2F7EE 4FVRA 2Y4IB 5JQ5A 5KMNA 4C02A 3PSDA 2A27A 3DKGA 3ZO2A 4C38A 5FUTA 1YOMA 2JAVA 2J0IA 3R1NA 4FOBA 3U55A 1SVEA 3QQFA 4RIWA 2QNJA 4ASDA 2YZLA 2UZLA 4JL9A 5ANOA 4HVSA 4W9XA 4P7EA 4FT5A 1H08A 4GT4A 4X21A 1RE8A 2JBOA 4DC2A 3B2TA 3L8PA 3AC4A 4U8ZA 5HO6A 1IASA 4WG5A 4C59A 4FE2A 4BF2A 4BGHA 4DFYA 4JQ8A 4AT3A 3ERKA 4FV4A 4QP3A 1ZY5A 2R3RA 3VJNA 2BKZA 4AGCA 3UZPA 2RF9A 3EFKA 3G6HA 2HWOA 5BUJA 3TNQB 2XNOA 4CFUA 2WELA 3IOKA 5EFQA 3UVRA 4KRDA 1SM2A 3CCNA 4DH5A 2W4KA 5AV3A 4G9CA 4U7ZA 4R7BA 3R30A 3NNUA 2OW3A 4I20A 2VTRA 5HVYA 3DOGA 4I0SA 3PA3A 1JWHA 3MN3A 4G3DA 4ZTLA 2WKMA 4Y95A 1J1BA 2IW8A 3WOWA 4D2TA 5JGDA 3HAMA 5AUUA 4E93A 5ANDA 4LG4A 5IA2A 4O7LA 2OICA 3PVBA 4O0TA 3NVMB 3E87A 2YAKA 1GNGA 3BIZA 3EIDA 1YVJA 1XH6A 3QFVA 2BZHB 3EN5A 3FYKX 4FKVA 2XBJA 3DJ7A 4L68A 4EC9A 4U9AA 5LMAA 3RCDA 4BY9E 2R4BA 4G6OA 4J96A 3ZLWA 4G3FA 2XNBA 3TTJA 1APME 4RT7A 3PVGA 5H2UA 3DGKA 4IVDA 3CPCA 3CC6A 2BPMA 3QCXA 4UWYA 3ZC6A 2R3HA 4Q5EA 4QP2A 4Y72A 4YJUA 3PY3A 1H28A 2VNWA 3WARA 3GOPA 4PP9A 5E8SA 3VJOA 4DINA 1CSNA 1U46A 4GJ2A 4FOCA 5HBJA 2X6DA 4YJTA 3RPSA 3LVPA 4FV3A 5M4UA 1H07A 2ESMA 5AV2A 3TDVA 4XBRA 4XYFA 5ANJA 5ETFA 2OFUA 2P3GX 2WMBA 4IAYA 5IDPA 4PDYA 3FSFA 5DEWA 3D5XA 3DBFA 4FZDB 4C58A 3HA8A 3O8PA 5DR9A 5C03A 4ALVA 4CLJA 4FV1A 3MFRA 3R9HA 1NA7A 4EK8A 4U3YA 4JBPA 4ASXA 4FTNA 1QPEA 5FBNC 3AG9A 1UNLA 1JKTA 4L9IA 2GQSA 2OFVA 2F4JA 4AE6A 3U87A 3EQGA 3Q9WA 3BYUA 4G1WA 3H9OA 4JG7A 1WFCA 4QMLA 3O71A 2Q0NA 3MIAA 5L2TA 4FNWA 3ULIA 4G31A 3EKNA 5CSXA 3THBA 5BX0A 3H30A 3ZLSA 4CZTA 3DA6A 2B0QA 3SGCA 1XH5A 4IXPA 1OKVA 3E62A 4U42A 2VV9A 4IAFA 2HW7A 3FMJA 4A9SA 3OTVA 2XYUA 3CD3A 5FG8A 3AC8A 4QMNA 3IGOA 3BQCA 5ANIA 3CJFA 1AQ1A 3ENMA 3PJCA 3KRRA 4AFJA 4CKRA 4E4NA 4IMYA 4JIKA 4HYIA 3R7OA 2J0LA 3DDQA 5HBHA 3QRKA 5T6KA 2JDSA 4G5PA 4M3QA 4XV9A 3FUPA 4CFVA 4TYEA 2CSNA 2VU3A 3DPKA 5AP2A 1VR2A 3ZLYA 3MI9A 4NCTC 5EM7A 4R3PA 4XJ0A 1YWRA 3GXLA 4TWCA 2I0EA 1R1WA 2HCKA 3IS5A 3VS5A 2VWZA 2XIXA 3BHVA 3DJ6A 2KTYA 5F20A 5TO8A 2UUEA 2HZ0A 3N9XA 2OLCA 4R3RA 1G5SA 4KS8A 4BDAA 4BKZA 4EOJA 4QMSA 5D12A 2HK5A 3Q4ZA 3R8VA 2VTPA 3EJ1A 4RIYA 5HG8A 3A7FA 4C2WA 4F09A 1GIHA 4FSRA 4IANA 5ANGA 2HOGA 4B6LA 4XP0A 5L8LA 3QRTA 3A61A 5DT0A 5IMEA 3OOGA 4TRLA 4C3PA 4X6QC 3GU4A 3I81A 1F3MC 3ZFXA 5C8MA 3LCKA 1LP4A 3CS9A 2VTJA 2X2LA 3BCEA 3LJ2A 4E26A 4RPVA 4E5AX 4FIGA 3IKAA 3SXRA 2XIKA 3ALNA 4Y73A 5D11A 4QTAA 4XG6A 2B9FA 1J3HA 4IC7A 3RP9A 5AR4A 2PZPA 3TKUA 3OEFX 5A4TA 2WTJA 2PPQA 2RG6A 3DJ5A 3MVLA 3GVUA 5B2KA 4XS2A 2WMSA 3V8SA 4GKIA 3KXXA 3R7GA 5AADA 5LVPA 5EKNA 4OTIA 5CNNA 4PV0A 4EOMA 4D2SA 2X7FA 4Q9SA 3DAKA 4O2ZA 4NW6A 2WTCA 3L8SA 5AP7A 3D0EA 3Q5ZA 4H39A 4D28A 5K5NA 3KN6A 5IU2A 5E8ZA 2GU8A 4EHZA 4L7FA 1XH4A 3TNIA 4LMUA 3LCDA 2JFLA 1SNXA 3R1QA 2OZAB 3TACA 3UG2A 5I0BA 4XV2A 4FYOA 4YUQA 1XH8A 3L8XA 2NNWB 3CQUA 3DAEA 4LYNA 3GQIA 4OTDA 4RVMA 5CU2A 3EN7A 2UW4A 2J51A 3G9NA 1ZMVA 2UW0A 4FSUA 3HAVA 1UU8A 3OEZA 5EK7A 3RNYA 3V6SA 1WCCA 1Q8WA 4ZSLA 4RX8A 1CKIA 3DK7A 3GUBA 4LQMA 4P90A 2R64A 3KCKA 4I5PA 4QTCA 5AUZA 3RK7A 4BDIA 4FT7A 4D1XA 5J1WA 4LMNA 3QD4A 2JC6A 4FVQA 3OCTA 3G6GA 1T45A 4FZ6A 4G2FA 3TZ8A 3ET7A 4GH2A 4AOTA 3HMIA 4X7QA 1CM8A 3LQ3A 3BGPA 4KBAA 5JRSA 4HVHA 3A99A 3UQCA 4IBMA 5K0XA 3Q60A 2GTNA 3BWFA 2GQGA 3HEGA 3KL8A 2W4JA 3AC2A 5JH6A 2VO3A 2QO2A 4IAZA 4F6WA 3PIXA 1SYKA 4MBJA 2RKUA 4FSQA 1YDTE 5AM7A 1UWJA 3LFFA 4WNPA 2GFCA 4YJSA 4G9RA 2QOBA 4AZEA 4BIEA 2ITUA 5J5SA 3QTZA 2C5OA 3QWJA 4R1YA 1Q62A 4QNAA 3LJ1A 2YERA 4J99A 2YJSA 2PMNX 4ZS4A 1H25A 4QMTA 1PMVA 1REKA 2BUJA 3LFBA 4FYNA 4FZ7A 5HLPA 5CX9A 5BVKA 4RQVA 5L6OA 1J7IA 5CAUA 5GJDA 3D4QA 4NM0A 2QHMA 3FI8A 4C57A 4RC4A 3DS6A 3Q9ZA 3AT2A 5AIRA 3VUGA 1R78A 1OITA 4H1MA 5FP5A 3NCGA 4P5ZA 4ACCA 3CP9A 5LVLA 3HDNA 2QLUA 4D1SA 3P7BA 1UVRA 3EN4A 2J5EA 4I5HA 5HU3A 2XIRA 3HRCA 2QOFA 3FLSA 2O64A 4RIWB 4LOOA 3SRVA 1ZOGA 3BBTB 1TVOA 4UY9A 3RKBA 3QWKA 3LM0A 3QF9A 4S33A 4ZK5A 4GIHA 2XJ1A 5IA0A 4JG6A 3B2WA 4RWKA 3FMKA 1GZKA 2PE2A 3NNXA 2HY81 3PRFA 2OK1A 4JX7A 2R3FA 5FDXA 4LM5A 3T8OA 3UO5A 4M14A 5FQDC 5EM8A 4F1OA 5CZHA 3RPOA 1MRYA 3P7CA 4Q2AA 1Q8TA 4PRJA 4F7LA 2X1NA 3HV4A 5H8BA 3U9CA 5FDPA 4CRLA 1JNKA 4NYEA 4QYGA 1VJYA 2QVSE 4A9YA 5J7HA 2BTSA 3MJ1A 3MH2A 5DHJA 5EOBA 3ZFYA 2G2HA 3JXWA 5JFXA 3NUXA 3N4UA 2F9GA 2ETKA 5FM2A 1H4LA 3L8VA 4FI1A 4FV0A 4V04A 3FXZA 5AUTA 1H8FA 4MQ2A 3QZFA 1WAKA 4RVTA 4Y83A 4C4EA 2B4SB 4BI0A 4EUTA 3I6UA 4I92A 5IKWA 4NK9A 4TNDA 5H3QA 3KK8A 3W2QA 1DI9A 3LXPA 5BYZA 3PJ8A 3TUCA 5HX6A 5FWKK 3GQLA 2ZOQA 2QKWB 3LJ0A 3O7LD 4XG8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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