3ZLWA

Crystal structure of mek1 in complex with fragment 3
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
344
structure length
312
Chain Sequence
ELELDEQQRKRLEAFLTQKQKVGELKDDDFEKISELGAANGGVVFKVSHKPSGLVMARKLIHLEIKPAIRNQIIRELQVLHECNSPYIVGFYGAFYSDGEISICMEHMDGGSLDQVLKKAGRIPEQILGKVSIAVIKGLTYLREKHKIMHRDVKPSNILVNSRGEIKLCDFGVSGQLIDSMAVGTRSYMSPERLQGTHYSVQSDIWSMGLSLVEMAVGRYPIPPPDAKELELMFGCPMAIFELLDYIVNEPPPKLPSGVFSLEFQDFVNKCLIKNPAERADLKQLMVHAFIKRSDAEEVDFAGWLCSTIGLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords DUAL SPECIFICITY MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE 1 M
publication title The Use of Virtual Screening and Differential Scanning Fluorimetry for the Rapid Identification of Fragments Active Against Mek1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 312
sequence length 344
ec nomenclature ec 2.7.12.2: Mitogen-activated protein kinase kinase.
pdb deposition date 2013-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3zlwA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3zlwA01
2W05A 3NIEA 3V5LA 4DAWA 3RP9A 1YHSA 3OCBA 3POOA 3UOLA 4NZWB 3TV6A 2BKKA 3A62A 4BHZA 4W8EA 3PXFA 2A4LA 4D4VA 3E92A 2BHHA 5M4UA 1WBNA 2DS1A 2BUJA 2V7OA 4AQCA 1YOLA 2CKOA 2DUVA 2OU7A 4WG4A 4B8MA 2GSFA 3DU8A 3QZFA 2P0CA 2CCHA 2R3LA 5LXMA 5M4CA 1FMKA 5AV2A 4IB0A 4AP7A 4YZ9A 3BU3A 1Q8ZA 5DR6A 4L8MA 5TE0A 3BE2A 3NMUF 2WZJA 4IVAA 2YJRA 4BDBA 3PIXA 2XK4A 1MQBA 5CSPA 2OXXA 4UALA 4FIHA 5ACBC 2E9NA 3Q32A 4KKHA 5DH3A 5AR4A 3DXPA 3F3ZA 1ZLTA 4FT9A 5AUXA 2YM7A 3KXNA 2JFLA 3DGKA 3PA3A 1ZYJA 3C51A 3O71A 4JI9A 5DA3A 4Z3VA 1NW1A 1PXNA 2CHLA 3QRIA 5CF6A 1QPJA 4D9UA 1GOLA 5JFVA 1YVJA 3COIA 4XV3A 3F3VA 3ZXZA 2W1EA 5HBJA 4C3FA 3P79A 3AGMA 2OZOA 4BTJA 4FSWA 4NTSA 3MY1A 3ZFXA 4IC7A 4B4LA 4RIWA 4FTOA 5IQHA 3QCSA 3NWWA 5BVDA 4HVIA 3IDPA 1OKZA 4WNPA 3C4FA 3TL8A 4CLIA 1SM2A 2IW6A 3UGCA 1WVXA 3QBNA 4BCIA 3KK8A 5HD7A 2OG8A 3P86A 4U80A 5CEQA 1GY3A 4B7TA 3OOMA 2CSNA 4MF1A 4TWCA 3SRVA 4BYJA 4O82A 3MA3A 3KRRA 3TTIA 4UN0C 4JDHA 2YWPA 2OK1A 2I0EA 4DN5A 3QZIA 4GMYA 3ACKA 3NUAA 5EQEA 2E2BA 2C47A 5H8BA 3NAYA 1ZMUA 4QP2A 4TKSA 3R7IA 3OFMA 2OJ9A 2HW6A 2QQ7A 3G2FA 5IA5A 4F6SA 3UQFA 3FMKA 4NW5A 2WMRA 3D4QA 2XRUA 4P4CA 4QTEA 4EOKA 3BIZA 2V7AA 1TKIA 1H1WA 3TKIA 3A7JA 2O64A 5KMKA 4OAVB 1R3CA 4FSUA 3MYGA 4GK3A 5M56A 4O7VA 5IQIA 4GVJA 3OP5A 4C8BA 3OY3A 4NM7A 2OZAB 4Q2AA 4V0GA 1YOMA 4F1TA 1RE8A 3RZFA 4EH7A 3RAWA 4FYNA 4JBVA 3PJ8A 3ORKA 3JS2A 4KIQA 4G3FA 4LM5A 4NIFA 4DITA 5M51A 5E9EA 4GT3A 4MD9E 4EONA 2YIWA 3Q9WA 5CAPA 5K0KA 2Z7LA 2WMQA 3EJ1A 3ZFMA 4ASZA 1WMKA 2F4JA 5FTGA 2RL5A 4BTKA 4QYYA 1Q3DA 1XH4A 3TNIA 4AS0A 3ET7A 3S00A 3LXLA 4IFCA 3S4QA 3VBQA 4AZSA 4EJ7A 4E4MA 3LXNA 5HX6A 3PDTA 4G9CA 4FNYA 1JKTA 3F3TA 5DI1A 5KO1A 2C3LA 3JUHA 4EH4A 4IE9A 5CU0A 3HLLA 2XNOA 3GU5A 4X7QA 4DFUA 2Y7JA 3CPCA 3LOKA 2QODA 1LEZA 1JLUE 5CVHA 3ORXA 4V01A 2EXMA 3DBDA 2AYPA 2O65A 3G0EA 4C3PA 4EH9A 2VWXA 4QNYA 4RG0A 2ITUA 5C8NA 3IECA 4DEIA 2YJSA 1XBAA 3LJ2A 4R7HA 5FM3A 5DR2A 5LOHA 4G9RA 4O21A 4ZJIA 5HG7A 2H96A 3R28A 3ZLSA 3AT4A 3ZLXA 1BUHA 5EYKA 1I44A 3D5VA 4PV0A 2XCKA 3Q04A 5C1QB 4WNKA 3DKOA 1P4OA 1R0PA 4JQEA 3LFBA 3DBQA 2PVMA 2G2IA 2RSVA 3MFSA 3Q9ZA 2HK5A 3QKLA 3OEFX 4AN9A 4JBQA 4D2TA 2FYSA 2PPQA 4OT5A 4RX7A 5CZHA 3TZ7A 2HOGA 2RFNA 4N4SA 3FLQA 4S32A 4QQCA 4AZVA 4OTHA 1YXVA 1ZY4A 4F09A 4EJNA 3E3BX 4P7EA 1CKJA 3O8UA 4MH7A 4J99A 4G2FA 4O1PA 4U8ZA 4I92A 5DWRA 3IONA 5FD2A 5JN2A 5CWZA 4FKRA 3QL8A 4E8AA 5EOBA 4J7BA 3QHRA 3HGKA 2X4ZA 3PTGA 5LCJA 2UW8A 1R78A 2PZIA 3MV5A 3GU6A 3HV7A 4PL3A 3DFAA 4AXAA 3MFUA 4EZ3A 1NVSA 2BAKA 3K2LA 4I94A 2WMTA 5IEVA 4RC2A 3R83A 2E9OA 4HCTA 5CU6A 1CM8A 4AGUA 5IH6A 2BZKB 3LQ5A 3TJDA 3Q9XA 3V5QA 3W1FA 4A4XA 4E3CA 1GNGA 4EORA 3BBTB 3HYHA 3JY9A 3F9NA 4I0RA 2W9FB 4ASXA 2BDFA 1M14A 1DI9A 2BRGA 2Y4PA 3F3WA 4FA2A 3GOKA 4Y5HA 3BCEA 5FG8A 3PG3A 4CZYB 2ZAZA 2CGWA 2BTSA 3FZOA 3ZSGA 2XRWA 3U6IA 2C3IB 2YM5A 3EQFA 3MFTA 4ERWA 5FBOA 2OH4A 3GOPA 5CF8A 4OR5A 1P2AA 3A8XA 2Z8CA 3DFCB 3IO7A 3GXLA 3BV3A 3RM6A 5HIBA 5A14A 4L3LA 4H1JA 3TIZA 3N4TA 4G1WA 4D5HA 3RK7A 2ONLC 4ANLA 5D9HA 1DAYA 2ITVA 3O7LB 3U54A 4K2RA 4L42A 5E90A 4BHNA 4O0XA 4ANBA 1FINA 3MN3A 4DA5A 3Q9YA 5CEIA 1M17A 1UA2A 4BIEA 2CLQA 1SYKA 2GTMA 3CKXA 2C30A 3DQWA 2QLQA 4K77A 4LMUA 1PXMA 3UDBA 1JPAA 4YBJA 4X2FA 3DZQA 4AA0A 4DEAA 5A4EA 3VUGA 4U0IA 2B7AA 4D4SA 5H9BA 4RRVA 2PYWA 1LUFA 4BKJA 2VRXA 4D9TA 4FNXA 4H1MA 3WZUA 4E4LA 1W82A 2WU6A 4GT5A 4KKEA 1Z57A 4RA5A 1OKYA 2RIOA 3QALE 4CKIA 2WMVA 1IR3A 5T68A 3GGFA 4QMWA 1URCA 4Y8DA 1IA8A 2ETRA 4GRBA 2WFYA 5IU2A 4EK6A 4MAOA 4DBXA 5CU2A 4EK3A 4GFMA 2PZ5A 1FPUA 2XYNA 3K3IA 3I7BA 5E8TA 3QRTA 4UMRA 1OL2A 2WXVA 3DB6A 4FTIA 3OXIA 3E8EA 3E64A 2BPMA 2HIWA 3I6UA 3NUSA 5J5SA 5M4IA 4FIEA 5G6VA 3LHJA 2R0IA 2R3JA 3EN7A 2ZM3A 2V5QA 3ANQA 3MY5A 5H3QA 4BCQA 1JBPE 3FAAA 3BQRA 5CSXA 4QMOA 3LKMA 1GAGA 4UMPA 5KZ0A 4PWNA 4J97A 4ZY5A 3TV4A 5GIPE 1Q41A 5AIKA 4QQJA 2J9MA 3FMDA 3DK3A 3I5ZA 4KIOA 4XBUA 4RX8A 4MWIA 2YCSA 4NFNA 3MB6A 2W06A 4KS7A 4GW8A 1XQZA 3QD3A 4XP0A 4M0ZA 4GYIA 4YJUA 5AR8A 4AGWA 1H0WA 4BICA 4UEUA 5IZFA 3KK9A 4DFXE 3KFAA 2VWWA 3LCOA 5M55A 2EXEA 3F82A 4JT3A 2BZIB 3VRZA 1P4FA 1RDQE 3KXZA 4L52A 3WIGA 4AW0A 3BEGA 5HVKA 4DH1A 2QOBA 3OS3A 1WBPA 3KULA 5JSMA 2UZWE 4GKIA 4TZRA 3KKVA 3P9JA 3H0ZA 5FDXA 1ZAOA 1XBCA 3D5WA 4QMMA 3L8VA 4HVHA 4TYHA 2AC3A 2F9GA 5F4NA 4XG6A 3QQJA 2XF0A 1G8SA 5GJDA 2XKCA 1YW2A 3ETAA 4MEDA 2JLDA 2Y6OA 2OXYA 4CZTA 4EQMA 3DS6A 3BELA 4IZ5A 5FUTA 3VNTA 2P33A 4RFZA 2CKEA 2IVTA 3MESA 2OF4A 1VYWA 3ZZWA 5TKDA 1J7UA 2HCKA 3GEQA 4QMUA 3AC2A 1OIQA 5EKNA 2W9ZB 2QOCA 3FXWA 3BE9A 3GU8A 4L44A 5JQ8A 3MVMA 5M07A 4S31A 5TO8A 3PXKA 3A4PA 4G5PA 2YDJA 3LFAA 4FYOA 5C4LA 4YJNA 2VGOA 2XK8A 1BYGA 1H24A 1KWPA 4D2WA 4BGGA 3W2RA 4FV6A 4MCVA 5AUTA 5BVNA 3RAIA 3FMJA 4C4JA 3HA6A 4IWOA 3FLYA 2OJGA 3MTFA 1VZOA 1RQQA 3UZRA 3A7IA 4BCJA 5AAFA 4CTBA 3DDQA 3UP2A 5J9ZA 3F7ZA 3AT3A 4IH8A 3KRLA 2QO2A 4FI1A 4O7YA 4E5BA 3WZEA 5L2IA 1FQ1B 3PE2A 4RZWA 3SA0A 3DOGA 3G51A 1GIJA 3SVVA 2WMAA 4JLCA 4I6QA 2X7FA 4DFZE 4E5AX 3EYHA 4NK9A 4ACGA 4CFNA 4N57A 1G3NA 4RIWB 4WNMA 5FEEA 3VS4A 5KX8A 4ZSEA 3UTOA 2XKFA 4IIRA 3BHUA 4D2PA 1M52A 4FVQA 4ALUA 4CKJA 2C6KA 4O0VA 2XCHA 4I5HA 5M44A 3CY3A 3R1YA 5GZ9A 2RFDA 3DJ6A 1MP8A 1IRKA 3SRVB 4ZTRA 4YJQA 2C69A 5IISA 3S2PA 2C5XA 3G6HA 3UBDA 4RWLA 3PFQA 4W4VA 3R7EA 2CNUA 3V5TA 3OD6X 2UW6A 3EYGA 3KXXA 4C4IA 3AMYA 2BHEA 4FE2A 3R7YA 1SMHA 2OW3A 5AP5A 3QTSA 2ZB0A 4AOJA 4IACA 1S9JA 4XEYA 3WZKA 3W2QA 4F7SA 3CLYA 5BVFA 1GJOA 4KSPA 3EHAA 4OTDA 4K0YA 1E1VA 1YDTE 2XJ1A 2XYUA 2YITA 1H26A 3DKFA 3NNUA 5L2SA 5EQPA 2V0DA 4CCBA 4WUNA 2PZPA 3TZMA 4I4FA 1REJA 1IASA 3VC4A 2J0MB 1LR4A 3O0GA 4FV9A 4CLJA 4FEQA 4MNEB 4CZUA 4NIFB 3V3VA 4TNDA 2WIHA 2B9IA 4IVBA 4HVSA 3HUCA 4ITJA 4AZFA 1ZYSA 1KE6A 1ZMVA 4MNFA 5ANEA 4GG5A 4F08A 2WU7A 4L00A 2WIPA 5EDRA 4FKIA 5CLPA 3LLAA 3E5AA 3HUBA 3H9RA 2CCIA 2UZDA 3PY0A 2R3MA 4RJ4A 5HHWA 5HICA 4A9RA 2PVNA 3LFDA 3FC2A 4C38A 3PVGA 4BCOA 3PVWA 1YXUA 4Y72A 3H9OA 3UJGA 4YBKA 1NY3A 4TTHB 4IAAA 4E6CA 3KL8A 2GPHA 3EL8A 4L46A 3CQWA 4FZDB 5HBHA 4E1ZA 2X6EA 1ZOHA 3IW5A 4LOQA 4O0YA 4F1OA 1UVRA 2PWLA 2UVXA 4GJ3A 4QO9A 3C1XA 5CSWA 4GUBA 5F94A 2Z60A 1SVGA 4WNOA 1K9AA 3G15A 4Y46A 2IO6A 4DEEA 4JX3A 1YQJA 5ETIA 4NEUA 4RMZA 3N51A 4YZBA 4AU8A 3U51A 3C4ZA 1UKHA 3EIDA 4HGTA 4U3YA 3TKHA 5IDPA 4U44A 4KINA 4N6ZA 3P23A 4EC9A 3HV5A 2ZV2A 4RVLA 2JDOA 2WOUA 2W1GA 5ANOA 5CSHA 4E6QA 4XOZA 2YCFA 4IADA 2WTKC 1AD5A 5BYZA 3NUUA 3LCKA 1IAHA 1JSVA 4O22A 2IW8A 4Q9ZA 2YAKA 3ORPA 1PXPA 5CZIA 4F6UA 3FI3A 2WELA 3ENMA 2QR8A 3PWDA 4RFYA 4AN3A 4J52A 4BZNA 4GG7A 3BI6A 3VUMA 4BIDA 4XNEA 5E92A 4O96A 1O9UA 4FEXA 3IDCA 3RAKA 4CGAA 5EW9A 5GIOE 3NLBA 4AF3A 4IM3A 3TUDA 3RPSA 4FIIA 3LIJA 4AN2A 5HLWA 4MXAA 4IB5A 2IZUA 4I22A 3EWHA 4RGJA 2ITZA 4OTPA 2W1ZA 3F2NA 5CF5A 3IKAA 2XK6A 2XVDA 4YJSA 2ERZE 3LPBA 3FY0A 3SG8A 2RG5A 3PXZA 3RHXA 3VN9A 4QP7A 1QL6A 5IQCA 1RJBA 3DBCA 4ZTQA 5DT3A 3R1NA 3PPZA 2PVHA 4CV8A 3RWPA 2VWBA 5HEZA 3KXMA 2V22A 2JKQA 3UMXA 2VX0A 2OICA 1R39A 3VHKA 4L9IA 5J8IA 4M15A 3VBWA 3I60A 5K3YA 3FQHA 5K5XA 2KULA 3A7GA 3MIAA 3DNDA 3LFFA 4KAOA 4PNIA 4E6AA 3JXWA 1BMKA 4XBRA 3ZEPA 5EOLA 5L6WL 4YZMA 3L8PA 2BILB 1J1BA 3MH1A 4TN6A 5HIEA 2IZSA 3FC1X 1EH4A 3UO6A 3WYXA 5IEYA 4AW1A 5KUPA 2UVZA 2PVKA 2R7BA 5HCYA 2QG5A 4RWKA 2I7QA 2F7EE 4M69B 4EHVA 4BBEA 2FSTX 1YDSE 2W99B 1QPDA 3F7WA 3PWYA 4HPUE 1WBSA 4GU9A 2F7ZE 4L43A 3HV3A 2XKEA 4PPBA 2GHGA 2HENA 4JR7A 4O2ZA 4AT3A 3LAUA 4HVDA 4GS6A 4Y73A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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