4F0IA

Crystal structure of apo trka
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
290
structure length
284
Chain Sequence
CVHHIKRRDIVLKWELGEGAFGKVFLAECHNLLPDKMLVAVKALKSARQDFQREAELLTMLQHQHIVRFFGVCTEGRPLLMVFEYMRHGDLNRFLRSHGPDAKLLAGGEDVAPGPLGLGQLLAVASQVAAGMVYLAGLHFVHRDLATRNCLVGQGLVVKIGDFGMSRDIYSTDYYRVGGRTMLPIRWMPPESILYRKFTTESDVWSFGVVLWEIFTYGKQPWYQLSNTEAIDCITQGRELERPRACPPEVYAIMRGCWQREPQQRHSIKDVHARLQALAQAPPV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords High affinity nerve growth factor receptor
publication title The Crystal Structures of TrkA and TrkB Suggest Key Regions for Achieving Selective Inhibition.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 284
sequence length 290
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2012-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4f0iA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4f0iA01
4PL5A 4ZOGA 2J5FA 5C03A 3WZJA 3A4OX 2VWYA 2BDWA 3Q9ZA 5J95A 3QXPA 4JXFA 3DKOA 3P7CA 2GNGA 3EHAA 4ANNA 3FBVA 2J0LA 5M08A 4CFVA 3UP2A 2AYPA 2QHMA 4KIKB 4NT4A 4D4YA 2W9ZB 3C4FA 2WHBA 2ETMA 4OR5A 1GNGA 2C1BA 4FTAA 2X2MA 2FGIA 4DA5A 5DEYA 3HAVA 2B1PA 3PE2A 2J0KA 3RPOA 2Y0AA 4OTPA 4TYJA 2GQGA 5E90A 4LV8A 4QNAA 4II5A 3PY0A 4AT3A 1NW1A 2YACA 4QP9A 4H58A 2B4SB 5IQIA 4RBLA 2J90A 3KRRA 3FLWA 2XBJA 1BX6A 2J2IB 4WOVA 3OHTA 4I41A 3VBQA 4G3CA 4LI5A 5AAEA 3CTJA 3LFFA 4FIJA 4H36A 4C8BA 4QTBA 3WZUA 4A7CA 2CGXA 3NGAA 4HZRA 3MIYA 2XMYA 2EB3A 3P9JA 1REKA 2SRCA 2QOKA 4GW8A 2W1DA 5L6PA 4DGLC 2QKWB 2YABA 2XYUA 3EJ1A 3PJ3A 2JITA 5BYYA 2UZDA 4PRJA 5EM7A 3BHYA 5HEZA 1H1SA 4AF3A 3NEWA 4FVRA 4L43A 3QX2A 4XG6A 3R7UA 2VUWA 4G6LA 4DINA 3FEGA 2OZAA 5JGDA 3DXNA 4EYMA 4FEWA 3MYGA 2W05A 2QI8A 4YGAA 3C51A 5I9VA 3CP9A 4DEDA 5BPYA 5A4CA 4PPAA 4LRMA 3PJCA 4ZTLA 3EOCA 2CNQA 3Q5ZA 3FQSA 4PDOA 3V5QA 4XOZA 4CLJA 4H3PA 2GPHA 4FTJA 3V5PA 4EH5A 3AC8A 3C7QA 4AA5A 4FIFA 5C4KA 1T45A 3L1SA 3JPVA 2CKEA 1U5RA 2I40A 2OZAB 3TZ9A 3VUTA 3UIXA 4GMYA 3DGKA 3POOA 4BKYA 4RQVA 4I24A 5IH5A 2BKKA 4N70A 1A9UA 2VN9A 4B8LA 1ZYJA 1STCE 3EQCA 4E93A 3LFBA 3BYUA 5J5SA 4W4XA 4PDPA 4EJ7A 3UOHA 3FY2A 5I9XA 2KTYA 2WTVA 2C3LA 5LVLA 4YC3A 4C33A 1U59A 4M97A 2BDFA 5C1QB 2C6KA 3T3UA 4IZ5A 4BCOA 4G3GA 2V22A 5D7VA 4O96A 3V5TA 2LAVA 4ACMA 2X4ZA 4D2SA 4PUZA 3DBDA 4FKQA 3MB6A 4OTFA 4XBRA 3CKWA 5K0KA 4FTTA 4XG9A 4BGHA 3FZTA 5DGZA 5KMJA 3KULA 2NPQA 4QMPA 5DBXA 2O2UA 2GFSA 5KX8A 4FSZA 4F1OA 1PMVA 3CC6A 2WPAA 3GFEA 2G2IA 3QCQA 4W8DA 3L8VA 1ND4A 1Y57A 2QOCA 5AR3A 4KUJA 2C3IB 2BRBA 2CLXA 4XG8A 3ALOA 4IHPA 2BZIB 4WG5A 4AU8A 1H00A 2QOLA 3UVQA 4AW5A 4DGGA 4X7QA 3FPQA 3IW5A 3FV8A 5KE0A 5LVOA 2WEVA 2VNWA 4IQ6A 3G51A 3PWYA 4RJ4A 3DV3A 1Q99A 3NR9A 3KULB 4RFZA 5DMZA 4KKGA 3F61A 1FVRA 3G0FA 4FTIA 2C5XA 5EI8A 4G5JA 2PULA 4JJRA 4V05A 4EHZA 5CAOA 4DFZE 2ZV9A 3GGFA 3AQVA 4BI2A 1YDTE 2R64A 1X8BA 3DK6A 5B7VA 1XBAA 3O8TA 3N4UA 4QMLA 4MQ2A 5EM6A 3U8WA 2QQ7A 5J87A 4EH3A 2OF2A 4WNMA 4K33A 3DZQA 4M15A 5TE0A 4QMTA 4BI0A 4CG9A 5EOLA 5J5TA 4WRGA 1Z9XA 4IZYA 4MHAA 2YM7A 2DWBA 3R9RA 2OW3A 3SD0A 2OJ9A 3BHHA 2VU3A 3JY9A 4RPVA 4KINA 4D5HA 4AAAA 3ZM9A 3HRCA 4UWYA 4D0XA 2HCKA 4BZDA 3QCXA 4YPDA 3MJ2A 4W4YA 4ZLOA 2RFNA 3D2KA 3B8QA 1FVVA 3CPBA 3OUKA 5IH6A 3WIGA 2WD1A 3EQIA 4XNEA 3DDPA 3EWHA 3A7IA 4BIBA 4XP0A 3R8PA 4JAJA 2R3PA 2EXEA 2HIWA 4GSBA 4I5HA 4FVPA 4DEEA 2YFXA 4KSPA 4YJPA 3IS5A 3IDPA 4TN6A 3MFUA 3MVHA 5LCJA 2XYNA 4QNYA 2CHLA 4E26A 3RK7A 4M67A 3ORNA 4IMYA 4EZ7A 4FKWA 4JBVA 4F7SA 5BVNA 5FQDC 4S31A 4X6RA 5TKDA 3BEAA 1WBSA 3ROYA 5L8LA 4ZTRA 2Z7SA 4F70A 2W4OA 3ZBFA 2WMUA 3DBEA 2VGOA 2QC6A 3ZUUA 4C4IA 4FL3A 5HVJA 5ETIA 3VS4A 3JUHA 2I7QA 3QA8A 4ACHA 4QTCA 5AV2A 3VUDA 1JKTA 1JOWB 1UU8A 4GEOA 2X8DA 4JOAA 3TNPC 4U8ZA 3RBWA 4GFMA 3ORLA 2OKRA 4F0GA 2O3PA 2X39A 3ZLWA 4BDBA 3P0MA 3Q9YA 5I9WA 3P79A 4XMOA 5E8ZA 3A60A 3T3VA 3ZXZA 2Z02A 3COMA 4IM2A 2OGVA 4EOSA 5M06A 3ID6C 3NYNA 4QP1A 3LLAA 1PXMA 4NW5A 1A06A 4ZTNA 4BCJA 5HX8A 5LVMA 2H34A 3N51A 2BALA 4ZP5A 4TWNA 2FUMA 2XK9A 3QX4A 3RI1A 3RWPA 3VS2A 2O64A 3WI6A 2VWZA 4JBQA 4EOQA 4ZTHA 5J7HA 4L53A 3G6HA 1YW2A 3QTSA 3I1AA 4W4VA 1OECA 4E6CA 4DG0E 1YRPA 3GVUA 1ZOHA 3ZSHA 4U3YA 3NW5A 5H8GA 3ZLYA 1OL6A 2Y7JA 4GK4A 4EOOA 3ZOSA 3LCDA 3C4EA 4JR3A 4KRCA 5IPJA 4BDFA 4CMUA 3GOPA 3IW8A 5FEDA 3P78A 1MRYA 4FKSA 4FKPA 2ERZE 4YO4A 4FV1A 4WT6A 1I09A 3EQBA 3SQQA 4KWPA 2ITZA 2OJFE 2YDKA 3FMEA 4R1VA 2B9HA 2RGPA 2R7IA 5BUJA 4GT3A 3C50A 3SDJA 3THBA 4G16A 3CKXA 2Z7QA 2VO6A 4PY1A 4BDCA 3N9XA 3CTHA 4FSNA 1H0WA 1OI9A 3FKLA 4FZDB 3NYXA 2QU6A 4LFIA 3R63A 3KN5A 3PIYA 4MQ1A 3R1YA 2ZOQA 4TL0A 2C3JA 3UPXA 4I23A 3QF9A 4R5SA 5KMOA 4IWOA 1SVGA 4QP6A 4FKUA 2W1EA 4X21A 5K4JA 2W1HA 5AUWA 3MBLA 4BR3A 3ZONA 5LMBA 4FV3A 3ZUTA 2CNVA 3RPSA 4MWIA 2HOGA 5IA2A 4HYIA 4BB4A 2WTKC 3ZBXA 4D9UA 2JKKA 1M2RA 3BGQA 2R5TA 2IJMA 4XUFA 2HZNA 5FXSA 2R3JA 2R9SA 3NLBA 3E5AA 3DFCB 3GC8A 3QRKA 4RVLA 1JBPE 1GIJA 1PXIA 2IG7A 2VWVA 1PXKA 5F94A 3TUBA 4GL9A 4CGAA 4FV7A 5EHLA 3HRFA 4ORKA 4CCUA 4LYNA 4P5ZA 4BFMA 2J9MA 4GH2A 3ORPA 4E6AA 3U55A 4E3CA 2DUVA 2PVNA 2VAGA 3FMJA 5DR6A 3ZU7A 3LCSA 4RIYA 2PZYA 2QOHA 1J1BA 2VTSA 1NY3A 3ZXTA 4D55A 4CG8A 4I5CA 1BI8A 3DJ6A 3MVLA 3ZDIA 2XIXA 1ZMWA 3B2WA 1VZOA 4RJ3A 4C2WA 2WU7A 3LM5A 5LOHA 5DR9A 3VBXA 3I6UA 4EOKA 2GTNA 4HVHA 1TVOA 2QU5A 4BDAA 4PP9A 3DKFA 1QMZA 3QQJA 3FMDA 4RIYB 5TF9A 5KKRC 4IH8A 3DAEA 3NNUA 1OMWA 2B53A 2DQ7X 2I0HA 2VZ6A 3GCPA 4GK2A 5L3AA 2GNHA 3VVHA 3BE9A 1YWRA 3VUIA 3DJ5A 4B0GA 3BYOA 4CQEA 3R71A 3UE4A 4YHTA 5CAUA 1APME 4EHVA 3RHKA 3UP7A 5ANGA 2JBPA 4OGRA 4IZ7A 4G3EA 4IB3A 4H05A 3PSBA 3KXZA 3OBJA 1H1PA 3LPBA 4NUSA 4R3PA 4X3FA 4ZSLA 1BKXA 2WEIA 1H1RA 4ZZMA 5IKWA 2OIDA 4HGLA 3FXXA 3IW7A 4HYHA 4QMVA 5IH4A 5K0XA 4K8AA 5AUTA 2UW9A 2A1AB 3E64A 3M1SA 3UVRA 3HMIA 5EOBA 3R8VA 4QYYA 1F3MC 1KE9A 4ACGA 4FA2A 3PLSA 4KS7A 2GHMA 3F5UA 4ZJJA 3W2PA 3QXOA 2XM9A 4ZS0A 3SHEA 4FX3A 3FSKA 4OUCA 4N6ZA 5CEQA 2XK7A 4X3FB 2QKRA 4X3JA 3CLYA 4RFYA 3NNVA 1ATPE 2WMTA 2ZV2A 3QGWA 5B2MA 4EZ3A 4J53A 2YIXA 2XS0A 4BDJA 3LMHA 2C6IA 4HCVA 3EQDA 2YZAA 2G2HA 2HZ0A 3ZH8A 5KMMA 3D94A 2VWWA 3TZ7A 4HOKA 5T3QA 2GNJA 2X8IA 2BCJA 5EYDA 4C62A 1XH6A 4P7EA 4UZHA 4U41A 5IQGA 3H9RA 3MVJA 3MH3A 4QMZA 3K3JA 4GKHA 5CEOA 4FSMA 3BRBA 4O6LA 4TY1A 4AE6A 5EQPA 3HX4A 5IEVA 2WMQA 3NAYA 4QTAA 4DAWA 3FSFA 4O0XA 4MBJA 3MJ1A 4ALWA 3N4VA 3ODYX 3GC7A 4XG7A 4FIHA 3PXZA 5KO1A 3W32A 4QMYA 4APPA 1LR4A 4YZ9A 4C58A 4PPCA 3OC1A 3PJ1A 4C7TA 4G3FA 4K1BA 1YOJA 5IF1A 4F7NA 4H3QA 1OPJA 5E8UA 3UZPA 4OT5A 5M51A 4O7WA 3VHKA 2PE0A 2IZUA 3Q4UA 4G1WA 5HO6A 5I4NA 5JK3A 1B39A 1B38A 4BL1A 3R02A 4DH3A 4Z55A 2J5EA 3HLLA 3W33A 5FP5A 4HGSA 4O0YA 3MPAA 3R9DA 4DGNA 3FZSA 3NUPA 4RVTA 1YDRE 4UB7A 5IQBA 5ACKA 4AZTA 5K3YA 3OF0A 4X2FA 3ATSA 2PE1A 4L44A 1LP4A 4IB1A 5EKOA 4BCGA 3UQCA 4APCA 4ZZOA 4DH5A 3LJ0A 2C6EA 5HIDA 1OM1A 3NSZA 1IA8A 2R3FA 4EK6A 2CKPA 4FZFB 2VTAA 3OTUA 4IW0A 5DRDA 1OKYA 2IVVA 2H6DA 4PTCA 4RT7A 4MCVA 5EK7A 2XA4A 3OBGA 3QTIA 1J7UA 2QG7A 4I0RA 3LQ8A 4PWNA 2X81A 3AC3A 4GUBA 3GCQA 5GINE 3E3PA 5HD7A 5D10A 3G15A 2VWBA 4GT5A 5IQFA 3F3WA 3ODZX 5AEPA 4G34A 2R0UA 1P14A 3MY0A 5DNRA 3D5UA 3VAPA 4AS0A 3CQUA 3SXFA 5M4UA 4C4EA 3TIYA 2GS2A 4D0WA 2XH5A 4AGUA 4I5MA 2OJGA 3CS9A 4GU9A 3HDMA 4MF1A 3RMFA 5HORA 3LM0A 3OCGA 3QTQA 3OXTA 4P5QA 5CU2A 5CEIA 3R8ZA 2A27A 3UOJA 3ORIA 2UUEA 4FSRA 1KV2A 2Y4PA 3DLSA 3VRZA 3QQKA 2YZLA 3A7HA 4M69A 3DQWA 2YWVA 2R7BA 2PVFA 5D41A 3G9LX 5IQAA 2ZB0A 4KS8A 4EBWA 1OIYA 1SVEA 3EQPA 5AP0A 4PDYA 4LOOA 3H3CA 3QD3A 4OTQA 5AUVA 5AP3A 4QP4A 2QOFA 4UYAA 4WNPA 3FL5A 4RA4A 3AMBA 4DHFA 2QCSA 4RFMA 3HAMA 3ZUVA 4KBKA 4D58A 5C8KA 3KN6A 2RIOA 1OKWA 3FL4A 4M69B 1QCFA 5B2KA 2IW9A 3LMIA 2FYSA 3CY3A 2XK4A 5EM8A 3AT3A 1H27A 2NO3A 4O7RA 3GEQA 3FLNC 3UC3A 4JDJA 3AT4A 4YR8A 4FKVA 4QPAA 3RPRA 1J3HA 2WMXA 3MA6A 1UKIA 5GJDA 3ZCLA 1YI4A 3I7CA 5FDXA 3V8WA 4PMTA 4C4FA 2E9OA 1SZMA 2R3OA 2YWPA 2ONLC 2GNIA 3D5WA 4P90A 5EDPA 3V04A 4DE4A 1FBNA 4BCKA 5EW8A 2XUUA 3VUMA 4Z7GA 3PWDA 2CSNA 2E9UA 4F64A 3R04A 3SG9A 1YDSE 3KY2A 4L9IA 3WZEA 4EQMA 2CN5A 2KULA 3IO7A 3AC1A 2P2IA 3SRVA 1P4OA 3E93A 5CU4A 3BV3A 5E8VA 5HLWA 3Q6UA 2QO9A 4W4WA 4TWCA 2C4GA 2W1ZA 3OOMA 5HIEA 5AX3A 5K5NA 3VWAA 3NIZA 4JR7A 4AW2A 4YTIA 3NNXA 1CDKA 2CGVA 2X6DA 4FT0A 2ETRA 2B9FA 4CRLA 1O6YA 3BU6A 3HDNA 3SRVB 4AT4A 3BHTA 4R77A 3K5VA 4DGMA 2WQBA 3GI3A 3MFRA 4FC0A 4HCUA 1XR1A 4NZWB 1Q24A 2B7AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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