1H0WA

Human cyclin dependent protein kinase 2 in complex with the inhibitor 2-amino-6-[cyclohex-3-enyl]methoxypurine
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
298
structure length
283
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Probing the ATP Ribose-Binding Domain of Cyclin-Dependent Kinases 1 and 2 with O(6)-Substituted Guanine Derivatives
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 80
structure length 283
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h0wA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h0wA01
2GS7A 2WNTA 4FGBA 3TXOA 4AAAA 3MY1A 4QTEA 4ANOA 5AAFA 2PUIA 5FWKK 2GNIA 5GINE 5EOBA 4C62A 1W83A 3QUPA 4G3EA 1Q8ZA 2RG6A 4IWOA 3ZXTA 1PMNA 1PXJA 4LYNA 3NNXA 5J5TA 1JKKA 4JBOA 2YCSA 4WRSA 4YNOA 3MH3A 3UPXA 4C7TA 5AP2A 3NX8A 4TNBA 1UV5A 4MNFA 5M55A 4FV2A 1YXSA 5E8UA 3QRTA 4DEBA 2CNUA 3SLSA 3W8QA 2UW0A 4RT7A 4E93A 1ZYSA 4B6LA 5HG9A 3TV6A 4EORA 5IDPA 3T9TA 1WBSA 4YJTA 4M0ZA 3UC3A 2JD5A 1P14A 5KNJA 1E1VA 2OH4A 3OCSA 4L6QA 4DGMA 5EHOA 4U0IA 3DBQA 4G2FA 4AT5A 4O7WA 2A1AB 1IR3A 2YJRA 3ITZA 3WYXA 4UN0C 3E8NA 3UIBA 4EKLA 2C3LA 4JI9A 1Z9XA 4D1SA 1QPJA 4GJ2A 1DI9A 2X6EA 5J95A 4DTAA 3N9XA 4IM0A 3BHTA 3LMHA 3A7GA 3C4FA 5M56A 1OITA 4EH7A 4YTCA 4J71A 2WTCA 3UYSA 3SV0A 4E4LA 4L52A 4CFFA 5JFSA 3SW4A 3D2IA 4AFJA 4AN9A 5CAOA 5FQDC 3IECA 2DS1A 2JAMA 3EQBA 2WHBA 2HOGA 5E8ZA 2YCQA 3BU5A 5HD4A 3D2KA 5AV0A 5FDPA 1OI9A 1KOAA 1XBCA 5L2IA 2WEVA 5I9WA 3E3BX 2GS6A 4HOKA 5JFWA 3HECA 3TKIA 2OJ9A 3FI8A 2A4LA 2B7AA 2R5TA 4ZEGA 4APCA 4W4XA 4FV3A 2OO8X 3I7CA 3E88A 3FYKX 5DT4A 3HKOA 4DEIA 4RJ6A 4EOSA 2J0IA 1ZY4A 4FT7A 4QQTA 4NZWB 2PZ5A 2F2UA 4FYOA 3DOGA 2PVHA 3ZEPA 2YM5A 3AOXA 4O7SA 1YXTA 3VRZA 4K8AA 4MVFA 2AC5A 4RIYB 4NKAA 3NNWA 1PJKA 1PXOA 3RWQA 2G9XA 2R3QA 1VYWA 3NEWA 2PVLA 4G6OA 3RK7A 2HY0A 4I41A 1YHWA 4BWXA 5BVNA 3LFSA 5AR2A 3MIYA 4IAZA 3KVWA 4G1WA 3C5IA 1Q61A 2DWBA 1ZYLA 2CLXA 2W4JA 2Z8CA 3I6UA 3LMGA 4KKGA 4EYMA 4CKRA 5J9LA 4LGHA 5CU2A 4TYGA 2YDJA 5AUXA 2W1HA 4CLJA 3RZBA 4CRSA 4EH8A 2W1IA 4YSMA 3MGYA 1WBPA 4GH2A 2VTLA 4LGDA 5L8LA 3NIEA 5IH5A 4ACHA 1ZYDA 2ESMA 4ZLZA 4ITIA 3TTIA 3BYOA 5JRSA 4OTFA 1OIRA 2UZUE 3EWHA 1Y57A 4G6LA 4DEDA 4D1XA 3JR1A 3W18A 2HZ4A 4XLVA 5H2UA 5CAUA 1YOJA 4O7TA 2XVDA 2HXQA 4C4HA 4O0WA 1GJOA 2GHGA 4MXYA 4A9TA 3HAMA 4MCVA 5BMMA 3U4UA 4JDKA 3ZRMA 3MPMA 1CKJA 2OXYA 3EQFA 3OUNB 3OCBA 5AM6A 4FK3A 1H28A 3R02A 4MBJA 4LMNA 5BMSA 2F7EE 4ORKA 1OL5A 3LMIA 1H8FA 1ZLTA 3AT3A 2GNJA 4L67A 2YA9A 1K3AA 3AD6A 2XK6A 5CF6A 1SVGA 4QYFA 3E3PA 4ZJIA 4RIYA 2OF4A 2X6DA 3S95A 4DEEA 4BYIA 4EUUA 1JOWB 2PE2A 3BYMA 2KULA 3W1FA 2X8DA 1MRVA 3L8PA 2OXXA 5HCYA 4ANQA 4XG4A 4IDVA 5A46A 2H8HA 4XV2A 2ETRA 3MA6A 4FVQA 5BYZA 5CENA 4C34A 2JIIA 2BHHA 1M2RA 3AQVA 4LRMA 4ASDA 4FOCA 5HE0A 1H0WA 4PF4A 5I5ZA 2BRHA 2X1NA 4I0TA 4M14A 4DE4A 4FV4A 4GVJA 4H1JA 4HCUA 2LAVA 3KXMA 3PXYA 3VQUA 5C26A 3QHRA 4D2SA 2R3GA 3DU8A 4IADA 4XG8A 3HYHA 3V51A 3SGCA 3BE9A 4FEWA 2WAJA 3KK9A 3PA4A 4FG8A 4QQ5A 5AR5A 3ZONA 4BC6A 3OBGA 4FTCA 3QD0A 3I4BA 5CEPA 1Q5KA 2PZRA 2X4ZA 5FP5A 1JVPP 4USEA 5DYJA 3I1AA 5AUZA 5KBRA 1WFCA 3D7ZA 3EQGA 1PYXA 3ANQA 3OW3A 3NNUA 4U8ZA 4WSYA 2OIQA 1QPCA 3QFVA 4MBLA 2XYNA 2CDZA 4CMTA 2VV9A 3MSSA 3QRKA 3GENA 3VRYA 3UIUA 4EBVA 2BALA 4I6HA 2PMIA 4IXPA 1S9IA 2JEDA 2P2HA 2OZAB 4I93A 4CMOA 1MRYA 4AWIA 4O0RA 4AG8A 4JBVA 5LXMA 5CF8A 2RKUA 2VUWA 4NT4A 3ENHA 2IJMA 2Y8OA 2WU7A 1XBBA 4IE9A 3QGYA 1APME 2AC3A 4IZ7A 1QL6A 2UZTA 2V62A 3R7VA 5JMSA 3MN3A 5BNJA 5DNRA 4ZSLA 3HDMA 3TACA 1QPDA 3GVUA 2RSVA 5AMNA 4DFNA 3GOPA 4RG0A 4YLKA 3PP1A 4F1OA 4Y5QA 2GQRA 1XWSA 2NP8A 5K5XA 3IS5A 3PXRA 3VAPA 4LFIA 3W8LA 3HV3A 4A9YA 3C4XA 3D94A 5AV4A 3B8QA 3P78A 4UYNA 4UALA 4A7CA 4PQNA 3F5PA 4FL2A 3ROCA 2FYSA 2E9PA 1NT2A 5L2SA 3RCDA 4YJPA 4V05A 2P4IA 2P3GX 1S9JA 2JDRA 4GUBA 1WBVA 3EQIA 3LZBA 3HDNA 1J7IA 4JQ8A 3RPSA 1OBGA 1J7LA 5KMKA 4R3RA 1U59A 4O91A 2UW3A 5CSWA 4HYIA 2X2KA 5JQ8A 5LVPA 2X39A 3D83A 3MPTA 5CQUA 3FI3A 4D4YA 3NCZA 4I92A 1UNLA 4PL4A 3LIJA 4TZRA 5FM2A 4ANLA 2IVTA 3EFWA 2W1FA 3FYJX 2PK9A 4RX7A 3DBEA 4GS6A 2OH0E 4FT3A 3ROYA 4S32A 3TI1A 3BYUA 4D4VA 3RHXA 3MIAA 2BKZA 3PVWA 3VO3A 4C4GA 1PW2A 4Z7GA 3RBWA 4E3CA 5HEZA 3LE6A 2OZAA 2YM3A 3POOA 3QRUA 4BTJA 4R8QA 5BVWA 3FUPA 4KS7A 1FOTA 3BX5A 4MXCA 3SA0A 3LFDA 5FP6A 2FSOX 4EOKA 4AS0A 4BYJA 2B55A 1PY5A 2ERZE 3EMGA 4YTHA 5IUIA 4B4LA 3FEGA 4A06A 4EH4A 1WBNA 1J1CA 3FJQE 2UZVA 4X3FB 4E6DA 5KZ0A 3VF9A 5FBOA 2R3IA 4XS2A 1BLXA 2CN8A 1URCA 2ZV2A 4J97A 4AW1A 1YHVA 2YDKA 4QMUA 5C8MA 1Q8UA 4FG9A 3I5ZA 4F9YA 2WMAA 5CYIA 2VU3A 1OIUA 3A4PA 2WXVA 1PRYA 4FKTA 4M3QA 1X8BA 5ETFA 3R7IA 4MNEA 2ONLC 4DH3A 2E2BA 1Q24A 5JEBA 4BDAA 4D2PA 3CTHA 4I6FA 5FEEA 4DFBA 1TVOA 2EVAA 2F7ZE 4G6NA 3O8TA 1ATPE 3O7LB 4ASXA 4OUCA 3C0IA 5IG1A 3ZYAA 4ZTMA 4E20A 4M12A 4FSYA 4OT5A 5CSXA 4BBMA 1YXUA 2V7AA 2RFNA 1YHSA 4FKWA 4P90A 4AZWA 2WTDA 4FSWA 2F49A 3AC8A 3K3JA 3GU8A 2WIHA 4WBOA 2WMTA 5HLPA 4ALVA 5KX8A 2PHKA 2QKRA 5HCZA 5I9UA 4BBFA 4BIBA 3I6WA 3Q9WA 2R3RA 3MVHA 3P0MA 4JJRA 4KAOA 1QCFA 4XRLA 4ZXTA 2XK9A 3IK3A 1EH4A 3BELA 1PXKA 3G90X 3IDCA 5EHYA 2XJ0A 5FDXA 2R3OA 4GKIA 3P7BA 1B38A 3LCKA 4WD5A 4FV0A 4GU6A 4GW8A 3UYTA 2JFLA 3QQHA 4F7LA 4JVGA 2UVXA 4P5ZA 5C1QB 4O21A 2QG7A 4AGCA 2SRCA 2ZVAA 4X3JA 2H9VA 3A99A 3REPA 3D9VA 2VX1A 4BZDA 1IAHA 3O0GA 4CTBA 3D5XA 4NFNA 4ANMA 1Q3WA 3E62A 3U6HA 2CN5A 3R8ZA 3EQPA 4W8EA 5HG5A 5CZIA 4IVCA 4M84A 3UG2A 2XNPA 3NS9A 2ITYA 4PL3A 1RE8A 3A60A 4KIOA 4BCQA 3FY2A 3DBCA 5ANOA 4YZNA 5HVJA 3UVQA 4MF0A 4X2GA 2PVRA 3IKAA 4L3JA 4ZIMA 1UKIA 3HV4A 1PKDA 2UZDA 2VTRA 3UBDA 4ZS0A 4DITA 3NR9A 3QGWA 4XEYA 3Q32A 4ZOGA 5GZ9A 5I9ZA 3GUBA 2WQBA 2GTNA 4L7FA 4FV5A 5AJQA 2JGZA 4BDBA 5EM5A 5CAPA 3E92A 1Z5MA 4BVUA 2C1BA 3A4OX 1ZOEA 3A7FA 3G6GA 2IW9A 5C01A 4MWIA 5HO7A 5HX8A 4QMMA 3HRBA 4U79A 4QQJA 1YQJA 3R83A 5JFVA 3CBLA 4OLIA 2O64A 4EKKA 3OBJA 4FZFB 3L1SA 4LOPA 3W33A 1DAYA 3BLHA 3MS9A 5DFPA 4ZSAA 3GCQA 3FXZA 4QPSA 3RJCA 4ANSA 4NCTC 4DF3A 2WTWA 4ZSGA 3R8VA 5DE2A 4ACGA 2C0IA 3AMBA 3QKMA 1PMVA 4DCEA 5IA2A 3FC2A 3C4ZA 3L9NA 4CZUA 3QX4A 4PDYA 4A4XA 5KMOA 2W1EA 5LWMA 4QP4A 5E1SA 4I5PA 3G9NA 1J1BA 4KIQA 4P5QA 4AT3A 4A9SA 4FNYA 5H9BA 3SX9A 3UMXA 1RW8A 4CNHA 2I0YA 2UW8A 5IH4A 2RFEA 2IG7A 2VTJA 3OWPA 1U5QA 5DA3A 4QPAA 3DDPA 3LFEA 3C50A 4D58A 3FLQA 1M14A 3BZ3A 3MFRA 4BIDA 5GHVA 3VS7A 4QMQA 5EI2A 4C37A 3M1SA 3I0QA 2XRWA 3PRIA 1UU8A 2VTMA 2W9FB 4KKHA 4L3PA 3TZ9A 4I0RA 4AOTA 3S2PA 4M8TA 1M52A 4I1ZA 5ETAA 3BBWA 1CMKE 5D10A 5AV2A 3RNIA 2YN8A 3TEIA 3FZ1A 2QO9A 4HVIA 3C4EA 2I7QA 2YCRA 5I9YA 3MTLA 3E64A 2GFCA 2Q0NA 1XHAA 4FTTA 4CG9A 3ZLXA 4MX9A 2XCKA 2W0JA 4F64A 5J7HA 3M2WA 2JC6A 5CVHA 1JKSA 3E87A 2Y6OA 2YZAA 4J95A 1GY3A 5J9YA 3ZCLA 1NXKA 3KRRA 4WG5A 1UU3A 4H1MA 4CTCA 4JR3A 4HGEA 3HX4A 3BI6A 4CEGA 2W5HA 4RFMA 4YHFA 2HELA 3AC2A 1R78A 5I9XA 2I6LA 5FXSA 3ZC6A 3QQUA 2BZHB 4TT7A 3PPZA 4BN1A 4FX3A 3Q9XA 4IAAA 4NIFA 3UO5A 3DXQA 3SG8A 3Q5IA 4KWPA 4KBAA 3QRJA 4FYNA 1DS5A 4C36A 2WMRA 3MY0A 2C30A 3NWWA 1O6YA 4HVHA 3PJ3A 1B6CB 2QQ7A 5KO1A 4I5MA 5I0BA 1O6KA 4IX5A 1YDSE 5K4IA 3S3IA 3CLYA 3PE1A 3PXFA 3R8UA 3H30A 4W4VA 2IWIA 4X0MA 3A7IA 2BRNA 4OAUC 3W2CA 3FMEA 4ZTRA 1HCLA 3ZDIA 1OB3A 4N4SA 3ZU7A 3UNJA 2PZPA 4NWMA 4XBUA 5EM7A 4KABA 1SVHA 1GNGA 2QOKA 4BI0A 1PXLA 2ITNA 2WMWA 2UVYA 4Q2AA 3MY5A 5FLFA 4A4LA 3ZO2A 3VWAA 2W06A 5ETIA 5D41A 2X2LA 2OSCA 4M69A 3QTUA 3ATTA 2ZMCA 3LCTA 1P4OA 3ELJA 3PJ1A 5L2WA 3SOCA 2EB2A 2R4BA 4O0TA 5HNBA 4ZLYA 5JKGA 1PXIA 3GU6A 4G3GA 4FT9A 4D5KA 4C4JA 3DKOA 4MD9E 3IW6A 4MQ2A 5L8KA 1OKWA 1ZMVA 3QQFA 3TUBA 4EEVA 3HVCA 4GG7A 2KTYA 5FTQA 4EOMA 3OFMA 3LQ3A 4AZVA 3QZFA 2P33A 3FKOA 4JIAA 2XKFA 4ZTLA 3DA6A 2JDOA 2FB8A 5AP6A 5CXHA 3NUAA 4FE2A 1KOBA 2VNWA 4CGAA 3KULA 3FL4A 4ERKA 3DAEA 2WTIA 3AT2A 4FT0A 3HMOA 4GUEA 4XHKB 3LVPA 3LXLA 5IA3A 3HUBA 4FZ7A 3RMFA 2XNNA 4G5PA 4NSTA 4E26A 2PVMA 2XS0A 4F1TA 3FMNA 4JX7A 5C8KA 1KV2A 4A07A 3P7AA 4L01A 4QP6A 3KMWA 4IFGA 4YJQA 3MFSA 3F5GA 4C58A 4IVAA 4R7HA 1WVWA 4GK3A 1PMUA 4J52A 4BCPA 4F63A 1H4LA 2PUUA 4Y83A 3VBTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2GS7 A;  2WNT A;  4FGB A;  3TXO A;  4AAA A;  3MY1 A;  4QTE A;  4ANO A;  5AAF A;  2PUI A;  5FWK K;  2GNI A;  5GIN E;  5EOB A;  4C62 A;  1W83 A;  3QUP A;  4G3E A;  1Q8Z A;  2RG6 A;  4IWO A;  3ZXT A;  1PMN A;  1PXJ A;  4LYN A;  3NNX A;  5J5T A;  1JKK A;  4JBO A;  2YCS A;  4WRS A;  4YNO A;  3MH3 A;  3UPX A;  4C7T A;  5AP2 A;  3NX8 A;  4TNB A;  1UV5 A;  4MNF A;  5M55 A;  4FV2 A;  1YXS A;  5E8U A;  3QRT A;  4DEB A;  2CNU A;  3SLS A;  3W8Q A;  2UW0 A;  4RT7 A;  4E93 A;  1ZYS A;  4B6L A;  5HG9 A;  3TV6 A;  4EOR A;  5IDP A;  3T9T A;  1WBS A;  3AKK A;  4YJT A;  4M0Z A;  3UC3 A;  2JD5 A;  1P14 A;  5KNJ A;  1E1V A;  2OH4 A;  3OCS A;  4L6Q A;  4DGM A;  5EHO A;  4U0I A;  3DBQ A;  4G2F A;  4AT5 A;  4O7W A;  2A1A B;  1IR3 A;  2YJR A;  3ITZ A;  3WYX A;  4QDE A;  4UN0 C;  3E8N A;  3UIB A;  4EKL A;  2C3L A;  4JI9 A;  1Z9X A;  4D1S A;  1QPJ A;  4GJ2 A;  1DI9 A;  2X6E A;  5J95 A;  4DTA A;  3N9X A;  4IM0 A;  3BHT A;  3LMH A;  3A7G A;  3C4F A;  5M56 A;  1OIT A;  4EH7 A;  4YTC A;  4J71 A;  2WTC A;  3UYS A;  3SV0 A; 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