2BIKB

Human pim1 phosphorylated on ser261
Total Genus 87
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
87
sequence length
273
structure length
272
Chain Sequence
PLESQYQVGPLLGSGGFGSVYSGIRVSDNLPVAIKHVEKDRISDWGELPNGTRVPMEVVLLKKVSSGFSGVIRLLDWFERPDSFVLILERPEPVQDLFDFITERGALQEELARSFFWQVLEAVRHCHNCGVLHRDIKDENILIDLNRGELKLIDFGSGALLKDTVYTDFDGTRVYSPPEWIRYHRYHGRSAAVWSLGILLYDMVCGDIPFEHDEEIIGGQVFFRQRVSECQHLIRWCLALRPSDRPTFEEIQNHPWMQDVLLPQETAEIHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords PROTO-ONCOGENE SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE PIM-1
publication title Human Pim1 Phosphorylated on Ser261
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 87
structure length 272
sequence length 273
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-01-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2bikB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2bikB01
3A2CA 3MVHA 4TZRA 1LPUA 5KZIA 2O0UA 4CKIA 4DG2E 3JVSA 4HYSA 4YP8A 1ZOHA 2YAKA 3U4WA 2WB8A 3FKLA 5DR6A 3SKCA 2HZIA 3C0HA 4IM3A 3ZYAA 3PXRA 3M1SA 1YKRA 4N0SA 4HNIA 2KULA 3SLSA 3FSFA 1GOLA 3DB8A 5A3XA 5A46A 4R1VA 2OK1A 4XCUA 3ZEPA 4R7BA 4O7LA 3V5TA 1CKIA 5IZFA 3KMMA 1WVWA 2F49A 4L46A 4UMRA 4I1ZA 3PG1A 4K11A 3G6HA 2A27A 3DKFA 2I1MA 3H4JA 3R9HA 3A99A 4A9TA 1XH5A 2C5VA 2PZYA 3LMGA 1M7NA 1UU3A 5KX8A 1FOTA 3MY0A 4W4VA 3QU0A 1JKKA 4E20A 2C4GA 5LARA 4U6RA 2W17A 3HDNA 3B8QA 4FTOA 4I6QA 3PJ1A 4X3FB 3TIZA 3VS1A 4HCTA 3KVXA 4NJ3A 2WXVA 4A9YA 4IWOA 2CGWA 5DR9A 4QP8A 4EBVA 2VWYA 3FZRA 1XWSA 2YISA 2J0MB 3H3CA 2YABA 5EDRA 2ZB0A 2Y4IC 4AZSA 2ZV7A 5BVWA 2PK9A 3CS9A 1FBNA 3ULZA 2KTYA 4ITIA 4RBLA 2J50A 3VS7A 1F0QA 3KQ7A 3V04A 4I5HA 4FTQA 1LEZA 3O7LB 3QQGA 4M84A 3CPCA 4QYFA 4X6QC 3COIA 4UMTA 4LUEA 1SM2A 4DEEA 1AD5A 2IPXA 2B9HA 3UIUA 4D2SA 2WMVA 4FVQA 1KE6A 3FMDA 3VQHA 4O91A 2DUVA 3BBTB 4G2FA 4TPTA 3DT1A 4YZDA 1YXXA 3PDTA 1Q8WA 2PMNX 3UE4A 5JKGA 5E92A 3DBCA 3QTSA 4HVGA 2CKQA 5DPVA 1ZMUA 4FODA 4BCNA 3EL7A 4GU9A 3R7EA 3U54A 2UVZA 3HL7A 5LQFA 1JVPP 2JKMA 3MH0A 3KVWA 4XRJA 5L6WL 4BDHA 4M68A 2IN6A 3MY5A 4H3QA 4MH7A 4BCFA 4O1PA 5LOHA 4FMQA 4RWLA 5E90A 4FSQA 4P5ZA 3RK9A 4E7WA 1BLXA 3LQ3A 4KWPA 3NIEA 4LI5A 2F7XE 4BIDA 4QO9A 4J7BA 3UNKA 2FVDA 3QRJA 1YHSA 5CU2A 1OI9A 3EN7A 1TQMA 3V3VA 5ETIA 3VBWA 3E3BX 3VUMA 5GIPE 1QPJA 3HECA 4X0MA 3MJ1A 4UWYA 5DHJA 3OT3A 4ZTMA 1FQ1B 1H1RA 2GS6A 4YJSA 4MXZA 2RSVA 3UZPA 2I0HA 5CF6A 5KUPA 2RL5A 4FEQA 5CEOA 2QO7A 3BLQA 4LV5A 3I7BA 4AW5A 4P90A 1GIJA 4XP3A 4RJ6A 4EH3A 4FIEA 5JZNA 3NGAA 3AC1A 3POZA 2C5XA 2YM8A 4KRDA 3T8OA 4YTCA 3HVCA 1TQPA 4MBIA 3FMLA 5DMZA 2WTIA 2I0YA 4JLCA 5J9ZA 1KE7A 2BTSA 3NUXA 3OUKA 2WEIA 4F63A 3GCQA 5D10A 4F65A 3P79A 3IK3A 3GGFA 4X21A 3FHIA 4RWKA 2PUIA 3EQHA 4AGCA 2E9VA 4NCTA 2ONLC 5HU9A 4D5HA 2LAVA 1VYWA 4E4LA 2W4JA 5IA1A 3UPXA 3W2CA 4X7QA 2C0TA 5BYYA 3UOKA 4RG0A 4PWNA 4PV0A 4U5JA 4L8MA 1ZXEA 4ACCA 4KRCA 4ZJVA 3EN9A 4C58A 4IB1A 2BIKB 4Y73A 5E8ZA 5JRSA 3M11A 3OWKA 5CANA 2OJ9A 4J95A 4BGGA 5HU3A 4IIRA 2W5HA 4EH8A 5CSPA 1NVSA 4KBKA 2J5FA 5AMNA 4DAWA 3F3ZA 3KCFA 1ATPE 3R8VA 3WF5A 3PZHA 4F0GA 2GPHA 4DCAA 1OPLA 4NL0A 5CSWA 3GQIA 4TTHB 3OT8A 4WNKA 2QOQA 3T3VA 2R4BA 2VWZA 4BZNA 4M66A 3LMHA 1FVRA 5F95A 3DQWA 1JAMA 1KE5A 2VTLA 3IQ7A 4D1XA 4B6LA 4W8EA 2OKRA 4AXAA 3WIGA 4L00A 3LJ2A 1PXOA 4H39A 4R7HA 2E2BA 4BDAA 3CTHA 4IANA 5LXMA 2OH0E 2ERKA 3EWHA 4C3FA 5IEXA 3KMUA 3KULA 2CCHA 5HNGA 3VS0A 4CV8A 3B8RA 3MW1A 4YTHA 5FM3A 4DGNA 5AAGA 3VUKA 5D12A 5AM6A 3ZUVA 1YXVA 2HYYA 3A62A 5J1VA 4G6OA 2BDWA 4BGQA 4FK6A 2BIYA 4M14A 2F2UA 3LPBA 3BHVA 4AE9A 3E88A 5ANEA 3P0MA 4FV5A 1OKZA 3UVPA 4F9AA 2VU3A 3OXTA 3NEWA 5A4CA 4WSQA 4D1SA 5HLWA 3VIDA 4IJ9A 4TYIA 3QTXA 2X2LA 3QD4A 2YIWA 3VF9A 2XVDA 3UQFA 1Q3WA 3U87A 2C5YA 4DGLC 3LXNA 3QCXA 4L9IA 5KBRA 2VTSA 4AZEA 4CYJA 1OIYA 5TR6A 4C4GA 5HVJA 2IW6A 4QMMA 2WD1A 3E8CA 2UZUE 3Q6WA 5K4IA 3KCKA 2ZMDA 3DDPA 5ANOA 4EQUA 4MTAA 5EOLA 3V8TA 3WARA 4M69A 4M12A 3HV7A 4IZYA 4AQCA 2XUUA 1G8SA 4FSTA 4MX9A 2QOOA 3QL8A 3G15A 2HAKA 2OXDA 2Y0AA 4JX3A 4DEDA 4K9YA 3OD6X 3WYXA 4YO4A 4HOKA 2OXXA 3MYGA 4HZRA 4EONA 4Y83A 4O7YA 5IQFA 4LV8A 5AIRA 3BHHA 5IQEA 5IU2A 4BZOA 5D7AA 2ZV8A 4RT7A 4U45A 5BVFA 4AE6A 3TV4A 4WRGA 1YXTA 2IVTA 2OI4X 2YIRA 3I0OA 4XG9A 2IW8A 3WOWA 2P33A 5FBNC 3VBQA 4RVMA 4I6BA 4O96A 5M44A 4M0ZA 4IZ5A 4NT4A 2ZVAA 1OUYA 2R7BA 5A4QA 4PPCA 1M52A 3UOHA 4FKRA 4GT5A 1U5RA 1F3MC 4IZ7A 4JR7A 4TYHB 3UIMA 4BDGA 2P55A 4LM5A 2GNLA 4D0WA 3U51A 3BYMA 2WGJA 3HMPA 4F7NA 4YZMA 2XKCA 4F09A 4ACMA 4O0SA 5HO8A 3FKOA 4W9XA 1CM8A 1YW2A 4NKSA 3CY3A 2B54A 2XA4A 3PSDA 3DXPA 4D2PA 1RJBA 2ZDUA 4TYEA 1YQJA 2BZIB 3BIZA 4MXAA 1APME 4QYEA 4D9UA 1Z57A 4K77A 4O0UA 2OJGA 4FL3A 5DR2A 2P2IA 3CIKA 5BYZA 1DAYA 4BTFA 4O38A 5DEYA 4G34A 4PX6A 5HG9A 4CFFA 5IQHA 4TNDA 4D4YA 3ZLXA 4I5MA 1BYGA 3EYGA 4FNZA 3RNYA 4NM3A 1J7IA 3FUPA 4G3CA 4O7NA 4I23A 4FEVA 3D9VA 4ZXTA 5AR2A 2V7OA 4MXXA 5AV4A 3LCDA 4AFJA 3ZCLA 2GS2A 2ZMCA 3HGKA 1YHVA 4GCJA 1H01A 4KKEA 4WRSA 4OUCA 4XHKB 2FUMA 3G6GA 4FEWA 5EM6A 3QTWA 3BHYA 3V8SA 4QMSA 3D5XA 4Z9LA 3E8NA 5FEDA 5FXQA 5HIEA 4XYFA 4B8LA 3HV6A 4FNYA 1U54A 5HNBA 3C50A 2QCSA 3UYSA 4CYIA 3MV5A 2JIUA 4X6RA 3R04A 4KABA 2OF2A 2C6LA 3GNIB 4F6UA 4NCTC 4EOLA 4QP4A 4K8AA 1YI3A 4MD7E 1R78A 2GNFA 3R2YA 2NP8A 3ITZA 4IFCA 4PQNA 1H0WA 1NA7A 5ETAA 5HVYA 5IUGA 3KMWA 3W16A 5A54A 3A7HA 2R3LA 4CCUA 1OIUA 3AGLA 4RX9A 1ZY4A 5HE3A 4ERKA 3AMAA 3TZ7A 2WQOA 4M67A 2QI8A 3C5IA 5BVNA 4GS6A 5JFVA 1E9HA 3JVRA 5CU0A 4KINA 4EWHA 5LWNA 4XP2A 1JQHA 3KRXA 2GQGA 4FK3A 4QRCA 5BMSA 1M14A 5JEBA 5I3RA 3RP9A 2QLUA 2XRUA 2Z7RA 4O0TA 5BUJA 4IAYA 1M2QA 5AP2A 4UXQA 4WNMA 5C8KA 4CG9A 4FT7A 4QYGA 4LRMA 4MWIA 2F4JA 3PVGA 3WF7A 4QNYA 4J71A 3VW8A 3ZO2A 4XBUA 4BZDA 4ORKA 1NY3A 4FG8A 3R1YA 4JDKA 5JH6A 3MBLA 5EI2A 4PMPA 4EKLA 2WOUA 3PSBA 3W2RA 5LMKA 3GOPA 2G1TA 2XS0A 2J90A 4HPUE 5DT4A 4YO6A 4N6ZA 3F7ZA 3VJNA 5FTQA 2JBOA 3FZ1A 4I6HA 3R8PA 2PSQA 2RG6A 3MPTA 4FBXA 3Q5IA 4NIFA 2GNHA 3U6HA 3R8LA 5CVHA 3VJOA 2IVSA 3EFWA 4XJ0A 2PTKA 2JD5A 4FKGA 1KE9A 4L3LA 5BUIA 4N57A 4XLVA 4TY1A 4D2WA 5IMEA 4GG7A 4U97A 3C9WA 3QYZA 4EK5A 5E4HA 5BYLA 3Q5ZA 4ASDA 4FV4A 1OPKA 3GU8A 4A4OA 4WHZA 5B7VA 4JJRA 4FTUA 4CFWA 4QMWA 3ZLYA 2QOHA 5A14A 3JXWA 5CF5A 3MN3A 4CV9A 4A9UA 5F1ZA 1PXLA 2R0UA 3DXQA 2ZM1A 3PVWA 4ZJIA 1H00A 2BR1A 2JC6A 3CQUA 4WBBB 4EH4A 3QFVA 4GYIA 4QMLA 3RPRA 2OGVA 5C4LA 5CX9A 4J8NA 3UTOA 3ERKA 2XIKA 3R9OA 5E8SA 3GEQA 4RIWA 1GZNA 3FZPA 4G3EA 4ZZOA 5M06A 4O27B 4TWCA 4RVKA 5FEQA 3LCTA 3PWDA 3GB2A 2FSTX 4NM7A 2HIWA 3VF8A 3QGYA 4O7WA 4R7IA 3C51A 3DXNA 3BU6A 4GK4A 4EOIA 5KHXA 2QD9A 4O0WA 3IDCA 5CT7A 3FLYA 3R9DA 1K3AA 4FSWA 3QWJA 4QMQA 2YERA 1VR2A 4EHGA 4TT7A 4BGHA 2XB7A 3FI3A 3HMOA 3NNWA 2HOGA 2UZDA 3V5JA 5CAQA 4ITHA 1FGKA 2OJIA 3LXLA 3ZUTA 3COKA 1GZOA 5KMOA 3PXQA 1UV5A 3DFCB 3P7AA 3P7CA 2IVUA 2PVHA 3FL4A 4MYGA 4RQKA 4Y46A 5CSXA 5EDQA 2VV9A 5H8GA 2PZRA 3WIKA 2C69A 3IONA 1GAGA 2NO3A 4IDTA 5AX3A 5BQ0A 1YVJA 3TNHA 4XG3A 4S33A 2VTAA 4C2VA 3UO5A 4C61A 2R3PA 2AC3A 4K1BA 3G0EA 3RCJA 3VRYA 4RJ7A 4UX9A 3LMIA 4FTCA 3CE3A 4PPBA 4LOOA 3ZO1A 4O22A 5JQ8A 5GJGA 4O0RA 5AEPA 3FMNA 2CNVA 2BDFA 3JUHA 3LM0A 3D83A 4YJRA 2C6MA 4I5PA 3NNVA 4XS2A 2W1FA 3EKNA 3IOKA 3QA8A 4FZ6A 5IF1A 5GZ9A 3TM0A 5HLPA 5EYCA 3QD0A 2BROA 4I21A 3B2TA 2FSLX 1REJA 4B7TA 4DTBA 5FUTA 4H1MA 4I0SA 3PJ2A 5CQWA 1ND4A 2HENA 4NTTA 4I94A 3V5PA 1TVOA 2OZAA 4AGWA 4EOMA 5IQBA 3Q2MA 5J9YA 3SAYA 3ZC5A 3P4KA 3GP0A 5AFVA 5J87A 4FA2A 3TNQB 3AD5A 3R7YA 3ZSGA 3VHKA 3PXYA 5H8EA 2CKPA 4FSZA 2UZBA 4C2WA 3K5VA 5HI2A 3BWJA 2X1NA 3DNDA 4ZAUA 3PPZA 4C35A 5FM2A 3BE9A 4O84A 3MFSA 4HYHA 3EFKA 1M7QA 1R0EA 5IISA 4M69B 2OH4A 1NXKA 3G2FA 1VJYA 5M4CA 1L8TA 4PL3A 1BMKA 3RPOA 2QOIA 4QP9A 3OW3A 3JR1A 1SYKA 3QRUA 3CLYA 4XG7A 2JFMA 3LFSA 2XF0A 4F08A 5IDPA 2I0EA 4LYNA 1OVEA 2QVSE 3QD3A 2WZJA 4AN3A 5B2MA 4USEA 4FGRA 4B99A 5B2KA 4DGOA 4YLLA 1H26A 2RFEA 4E6CA 5I9ZA 4U44A 4R1YA 2BALA 3K5UA 1SNXA 4DEAA 4QT1A 3O7LD 5K9IA 3A7IA 3ACJA 4M13A 4DGMA 3AMYA 3H0ZA 5E8XA 2JEDA 4KSQA 4BY9E 1Q24A 4OAVB 4RJ5A 5AUVA 3BCEA 1PMNA 4PNIA 3NYXA 4F9CA 2WIPA 4JBPA 3QX2A 4DGGA 4IFGA 4OT5A 4UZHA 2XEZA 3FC2A 3DAJA 3IDBA 3EHAA 4FTIA 4QMVA 4WUNA 4DN5A 4FIGA 3MPAA 4FIJA 2CGXA 2IZTA 4J97A 3ODZX 4ZP5A 3ZH8A 5IA3A 3SD0A 1SNUA 2FO0A 4XG2A 4RX8A 4XBRA 5DEWA 2VWIA 1E1XA 4PP9A 4ANOA 4IB0A 3MPMA 4QMPA 4F99A 3UIXA 3BYVA 4CTCA 1JPAA 1Q8ZA 4AGUA 4DC2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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