1H26A

Cdk2/cyclina in complex with an 11-residue recruitment peptide from p53
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
297
structure length
296
Chain Sequence
SMENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIRLDTETEGVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords CELL DIVISION PROTEIN KINASE 2
publication title Specificity Determinants of Recruitment Peptides Bound to Phospho-Cdk2/Cyclin A
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 85
structure length 296
sequence length 297
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2002-07-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1h26A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1h26A01
1V0BA 4EH3A 2A27A 3CKXA 3VRZA 3K2LA 3UDBA 5AUYA 3WE4A 4D9UA 3U6JA 4O1PA 5GZ8A 2Z2WA 1OVEA 2PZPA 4RA5A 2Q0BA 3R8MA 4M67A 3KN6A 2HWOA 5IEYA 2C5YA 3Q04A 3OD6X 5HICA 2X4FA 2QG5A 3MFTA 4L67A 3TDWA 1SNUA 3MY5A 2JKOA 3F5GA 3LCDA 1UKIA 3LE6A 4LV8A 1GZKA 3Q9YA 5EM6A 4ZSEA 4EYJA 2GNHA 2OLCA 3MWUA 5LCKA 4PNIA 2JFMA 4X2FA 1STCE 3PWDA 4IX6A 2V62A 4FG9A 4WT6A 4YJQA 4BY9E 2XCKA 3LCSA 4CKIA 4R1YA 3GNIB 3VS0A 1KE9A 4A4OA 2CGWA 3QD3A 2C6DA 4OTHA 4YLJA 5T3QA 2BHHA 4AA0A 4C3PA 3DZQA 2AC5A 2QHMA 3LJ1A 3GI3A 4HPUE 4ZJIA 3HP2A 3C4FA 2OH0E 5DIAA 4AFEA 4I6QA 4OTQA 3WE8A 3OCBA 3PVUA 4O0UA 2GDOA 4NSTA 4XH6A 4B99A 1ZMWA 3F69A 4AA5A 4DEAA 5EDPA 2GS6A 1PXPA 2JDSA 3EZRA 3KFAA 3UYTA 3VBYA 2QC6A 3BQCA 5AA9A 1J91A 1R78A 4IW0A 5EFQA 2W1FA 4MNEB 4RLLA 2PYWA 3ZZEA 4MWHA 4G3GA 4ACHA 1OL5A 5EHLA 3E92A 5CF5A 3KB7A 1CM8A 1NT2A 3EQBA 4FTTA 4LGHA 3R71A 4MH7A 5FEEA 1F5QA 4O7RA 5KKRC 3BV2A 4WG5A 2VTMA 3QYWA 2QG7A 3NUYA 1KSWA 3G0EA 4IQ6A 4C2WA 5BUJA 4E26A 4DF3A 4WNOA 4HYSA 3NYVA 3OBJA 4YJUA 2WTIA 5GHVA 3TZ7A 2PUNA 4XYFA 3ZFXA 2QLUA 4OT5A 1XBCA 5L2TA 4BDDA 2PVRA 4FIJA 4NM3A 3ODZX 3W16A 4BHNA 3FC1X 4JR3A 4UMQA 3RK5A 4CLJA 3UO5A 3EKNA 2HIWA 4JVGA 1CKJA 1FBNA 4H1JA 1H00A 2XKCA 4NM5A 1J7LA 2F9GA 5M4FA 4FSTA 3ORTA 4HNIA 3F6XA 1QPEA 3MH2A 4JDHA 4PX6A 1WFCA 3A62A 2RFSA 4D2RA 4EK5A 2X8DA 1J7IA 4LRMA 2OI4X 4KBKA 4WSQA 3CP9A 4MWIA 2PULA 4DA5A 2G01A 3FE3A 3JS2A 1NY3A 2UZEA 4LRKA 5ACKA 4EHGA 4BCFA 3GCPA 4FT7A 4L52A 2WTDA 1EH4A 4CZTA 3GC0A 4BIEA 2XF0A 4O27B 3BWFA 4RWIA 4U6RA 4BCKA 4FTOA 4O0WA 5T68A 4ERWA 5G1XA 3UNZA 3UG2A 3V01A 3ET7A 3HUBA 4TL0A 3ENMA 4YZDA 4KABA 2C6KA 4J96A 4P5QA 4TWPA 1W0XC 4H1MA 4FKVA 2YAAA 4JX3A 2O0UA 5HE1A 3JVRA 3TNPC 4BI0A 3MTLA 4Y83A 4FV3A 4O84A 3GU5A 3BLQA 2P0CA 4IADA 4Y95A 3RK9A 3KF4A 5FM3A 3MYGA 4C2VA 3PA3A 4EHZA 5M4CA 4GSBA 4EKKA 4NYEA 3G0FA 3IW6A 3FQSA 3HMNA 2OIQA 4IFGA 4LRJA 4S33A 3WI6A 4GFOA 4EHEA 3ZO3A 3DV3A 2IPXA 4I24A 1IEPA 4OTRA 4ZSLA 3UC4A 3PIYA 1TQMA 3SG8A 4H39A 4AGCA 3SGCA 4I5CA 2WPAA 1GZOA 3CXWA 4HW7A 1OM1A 3ULZA 5CEOA 4QYEA 3ORXA 3MVLA 3VS5A 4YHFA 5HGIA 4BRXA 3N51A 3QRIA 5HZNA 2VN9A 4PL4A 4DCEA 2XIYA 1YRPA 4I94A 2GQRA 2PVMA 5FM2A 2R0UA 3QC4A 3DKGA 3RKBA 4GK3A 4E5BA 4CFVA 1MUOA 2W1GA 3CGOA 3PP1A 3W18A 1A48A 4EOSA 1FOTA 4BL1A 2C4GA 5AWMA 3RZBA 5LJJA 1JKSA 2OKRA 3NW5A 3QKLA 4HGLA 2W5BA 5A6OA 1OITA 1JSUA 4XX9A 3PXFA 2RSVA 3E87A 4YSMA 3BE2A 4IHPA 4ONAA 4W4VA 4A9TA 4QQTA 4R8QA 3DAKA 3BV3A 3WARA 2UZBA 4CCUA 4NJDA 3R1NA 5CEMA 2A19B 2CKEA 4IWPA 4AT4A 3QA8A 3KULB 4LOOA 4ITIA 4M7IA 3KA0A 3GQLA 1ZMUA 5CEIA 4BGQA 2W9ZB 4XBRA 3RAHA 1KV1A 2ETKA 2R3FA 4FC0A 4PTEA 4ALUA 3MIAA 4ITJA 4EYMA 3Q53A 2XYUA 2E9PA 2XK3A 4U7ZA 5IQBA 3FLWA 4EOKA 4BR3A 2W0JA 3MPTA 1H07A 3CS9A 4IB5A 5HCXA 4RJ6A 4ALWA 1WAKA 3PJ1A 3TZMA 2CKQA 3CTJA 5KNJA 3GQIA 1P2AA 3NEWA 2NPQA 4DGGA 3AT4A 4WIHA 3NAXA 3S95A 4TYHB 4JDKA 1Z5MA 5CS6A 2YACA 1ZLTA 3POZA 3TNHA 4D2PA 4IWQA 5CI7A 2CLXA 3FMHA 2YWVA 4MX9A 2VWBA 4O0RA 2OXXA 5KMOA 3WZEA 1YWNA 4LOQA 4MXXA 5CSWA 5CU2A 3V6RA 3P86A 3QUPA 2UW6A 3ZM9A 5BVDA 1PMVA 2FH9A 4C4JA 3BCEA 2X4ZA 3R8VA 3TI1A 4P2KA 2E9OA 3AC2A 3R28A 4L7SA 3D9VA 4D4SA 2VTTA 4E4LA 4BCGA 5CX9A 4U40A 5IU2A 4M69A 4DFBA 1JPAA 4IX5A 5J8IA 3PG3A 5FDPA 3OC1A 5AEPA 4I0RA 2OF4A 4RVLA 1WBTA 3FZRA 4IMYA 3ACJA 3O8PA 5EK7A 5CSPA 4BDJA 2HXLA 3HRCA 2WAJA 5C9CA 3NUNA 4IC7A 3G15A 3MBLA 4AZEA 2J4ZA 2HWPA 4TT7A 2BKZA 3C4WA 3ZLYA 2WOTA 3UO6A 4C38A 5J9ZA 3F3UA 3FEGA 5M06A 2OICA 3LFCA 5FBOA 3QTUA 3Q60A 1A06A 3W10A 5BVWA 4XG8A 2PVNA 4P5ZA 1KOBA 4HZRA 2H9VA 4X2JA 1CMKE 4RQKA 4BCMA 5L6PA 4UMTA 3Q2MA 3O71A 2A2AA 1V0PA 3BI6A 4BTFA 2VTQA 4O22A 3V5TA 5LXMA 4AGDA 5A46A 2C3IB 3TKHA 3OXZA 1H25A 4MCVA 1OZ1A 2IN6A 3VUDA 2B9IA 2VO6A 5FXRA 2CKPA 4IIRA 2C1AA 1YI6A 5L6OA 2XA4A 4CKJA 3A7IA 3VAPA 1NVQA 4E8AA 4B8LA 4E1ZA 2PMOX 4ZLZA 2PMIA 5IF1A 5JFXA 2RF9A 3QQKA 3NNXA 2CMWA 2UVZA 3MIYA 1PKDA 4RVKA 4D4VA 3AOXA 1KOAA 4KIKA 3ZS5A 4J71A 1TKIA 2VX0A 4IC8A 3M2WA 3R04A 4G16A 2YABA 3FMNA 3NX8A 3V5PA 2BRHA 4M3QA 4ASZA 4C34A 3MFRA 4ERKA 1M52A 3A8WA 4LMNA 3QD2B 4FTCA 3G6HA 3TUBA 4O7TA 4C7TA 5HO7A 1LUFA 4JJRA 1T46A 3VBWA 4YLLA 3LW0A 4QP1A 3RNIA 2DUVA 3MA6A 3AMYA 3WILA 2FSTX 5AAEA 2CGUA 2QU5A 4DITA 3HUCA 5AR4A 4KS8A 3PE2A 3F7WA 1H8FA 4MXZA 5AP3A 4PDSA 3LKMA 4C36A 5ICPA 4ID7A 4Q5HA 4U80A 3PVGA 3QRJA 2YIQA 4X2GA 4F7JA 2QHNA 2FUMA 2REIA 3HZTA 5C26A 5CU3A 5E1SA 1WVXA 2X6EA 2UZLA 2XK8A 2KULA 4BTKA 2JEDA 4XEYA 2WNTA 4MK0A 1GZNA 4BDEA 3AT2A 2PMNX 3QLFA 5AUZA 2PTKA 2C6EA 2Y8OA 4ITHA 3TWJA 3MH1A 3FMDA 4YJNA 5IH5A 4IAYA 4EC8A 4ZTLA 4YR8A 2C6OA 4KRDA 4GVJA 5E91A 3RBWA 2W7XA 2YM8A 3CGFA 4YUQA 2J50A 4C0TA 5CAQA 5JKGA 4F1MA 4H58A 2QKWB 2XZSA 2E9NA 4L3JA 4EQMA 2B53A 3ERKA 3A8XA 4LM5A 4RQVA 3FY2A 3EQDA 1V0OA 5FDXA 2Z7RA 4UZHA 4JT3A 1JBPE 4F1TA 4QT1A 5L4QA 5FEQA 2J5FA 2VNYA 1SVEA 1OPJA 4IZ5A 3D4QA 4ENXA 4DG2E 3RM6A 5A54A 2OIBA 1OI9A 2B52A 5CASA 2ZB0A 4HOKA 2R3QA 2QQ7A 3WOWA 4AZTA 4PMPA 4UN0C 1V1KA 4F0FA 4DTBA 5AR8A 2XH5A 2R3MA 1IR3A 3IG7A 5EW3A 3ACKA 3TZ9A 1Q8YA 3IW7A 3ZSIA 3CC6A 1P4FA 4G17A 3ZO4A 3CY2A 2CN5A 3D15A 3ITZA 1Y8GA 3HNGA 3TT0A 4F65A 4I93A 4BKJA 3OUKA 2LAVA 3VUKA 3ORPA 2WXVA 1ZOGA 1XBBA 5HLPA 3UODA 2GTMA 5B7VA 4U45A 1OPKA 5CENA 3AC8A 2BTRA 2XRUA 4BI2A 1PMNA 2X0GA 5HNIX 2XS0A 3FXZA 3UMWA 3WZKA 2PE1A 4FL2A 2AYPA 3QU0A 4RIYA 4D55A 3DNEA 2RFDA 5JN2A 4MF1A 5TE0A 3WZJA 4BCOA 1KE5A 4KB8A 1KWPA 4BGHA 1H1QA 3O8TA 5HG7A 4C4GA 4R7IA 3LVPA 4RVMA 2WQBA 5CAPA 3ODYX 3OCSA 3T9IA 3PPJA 5CEQA 3QX4A 4V0GB 3H9FA 4XG2A 4F7NA 3NGAA 2SRCA 4BC6A 4QTBA 4DHFA 4BCNA 2HENA 4FIHA 4FVRA 5IDNA 4FKSA 5AAGA 4F09A 2FSMX 3EZVA 3L9MA 3DBDA 4E6DA 1H1WA 3QGWA 3GXLA 4QTDA 4RZVA 2P4IA 4BZDA 4L46A 4WBOA 4R77A 4KRCA 2W5AA 5AV2A 4CXAA 5KMNA 4CT1A 2VWWA 3JVSA 3OCTA 2RG6A 4LGGA 3R7OA 3CJFA 2VWUA 3FHRA 4PMTA 4BHZA 3RCDA 4FTQA 3D7TA 4H3PA 4DE4A 3E3PA 3EQGA 4DFUA 3UZPA 2Y4IC 2WIHA 2CSNA 2YWPA 2PVHA 2WTKB 4I20A 1WMKA 4YO6A 3AD4A 3NCGA 5CANA 2GHGA 4FV0A 5DG5A 1WBSA 4MD8E 1YDSE 1YXUA 3LQ3A 3L8SA 3UOLA 3U87A 4F9YA 4L68A 4I5PA 4OBQA 4GUBA 3LFBA 3GENA 4QP3A 4EOLA 2ONLA 3R9OA 3PP0A 2FO0A 5L8KA 4APPA 4G6OA 3KXMA 5E92A 5CAVA 3DZOA 5BYLA 4RX5A 5EG3A 5CYIA 2E9UA 5D9HA 2OJGA 4ZXTA 1FVVA 5GZAA 4PDYA 3QKKA 1W98A 4USFA 4OW8A 2GHMA 2C5VA 2UW7A 4E7WA 4HNFA 2WMXA 2C0OA 4K11A 5EDRA 1Q5KA 2C30A 2EUFB 3BIZA 2YHVA 4FTMA 3R7YA 2O63A 5D12A 4R1VA 1WBWA 3COMA 3DS6A 4DH5A 4RGJA 4F6UA 2VTIA 3WZDA 4AZFA 3DFAA 4PV0A 2YIRA 5A4TA 3TCPA 5EW9A 1OPLA 4XCUA 2YCRA 3O23A 3U4WA 2R3HA 4NW6A 4F7SA 5IQCA 3NW7A 4U97A 4YZCA 5DT4A 4C4IA 2R3GA 4APCA 4MBJA 4JIAA 4NEUA 2J0MB 3VUGA 4PDPA 3R7IA 2ONLC 2V7AA 3DFCB 3NWWA 2ITUA 4HZSA 4JLCA 3NAYA 3PXZA 4M66A 1KE6A 1MQ4A 5FBNC 5HI2A 2HAKA 4U3ZA 5E9EA 5JGDA 5ANOA 4LMUA 4QD6A 2CGXA 3FZTA 5L2QA 3EN4A 4QNAA 2XNNA 3BBTB 4X2KA 2GU8A 3QCYA 3R7VA 4HVDA 2JBOA 4YHTA 3S2PA 4ALVA 4XV1A 2C47A 4RC4A 3UP2A 1M14A 2ZM1A 5HX6A 3Q4ZA 2AC3A 4XNEA 4L42A 1ZYLA 3B2WA 3HYHA 4Y5QA 4FKOA 2UW9A 4YZ9A 1ZRZA 5IA5A 4EJNA 3BYSA 2WEIA 1ZYDA 3RTPA 1FPUA 5KMJA 2I0VA 4RFMA 4R5YA 3K3IA 1YI3A 4I5MA 3VS4A 1SMHA 3QBNA 5CVFA 4YJPA 5LVPA 5GIPE 1YW2A 3ENHA 3UVQA 3E8DA 5G6VA 3BHHA 3NNWA 4RJ4A 4NKAA 1HCLA 4D9TA 3R9RA 2CN8A 1YWRA 4RIWB 4PRJA 4HVHA 5DI1A 3MY0A 2R9SA 2XYNA 4FTJA 4WRGA 3V8WA 3H4JA 4N6ZA 2Y4PA 3DQXA 2J2IB 2W1HA 1L8TA 1XHAA 4W4YA 3MW1A 5I3RA 4EZ5A 3BWJA 4J7BA 4J99A 4AT3A 4TRLA 4YC6A 4JG6A 5TR6A 3DXQA 2F7EE 2JKMA 4KS7A 4EH6A 5AUUA 3DB6A 2BUJA 3E7VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1V0B A;  4EH3 A;  2A27 A;  3CKX A;  3VRZ A;  3K2L A;  3UDB A;  5AUY A;  3WE4 A;  4D9U A;  3U6J A;  4O1P A;  5GZ8 A;  2Z2W A;  1OVE A;  2PZP A;  4RA5 A;  2Q0B A;  3R8M A;  4M67 A;  3KN6 A;  2HWO A;  5IEY A;  2C5Y A;  3Q04 A;  3OD6 X;  5HIC A;  2X4F A;  2QG5 A;  3MFT A;  4L67 A;  3TDW A;  1SNU A;  3MY5 A;  2JKO A;  3F5G A;  3LCD A;  1UKI A;  3LE6 A;  4LV8 A;  1GZK A;  3Q9Y A;  5EM6 A;  4ZSE A;  4EYJ A;  2GNH A;  2OLC A;  3MWU A;  5LCK A;  4PNI A;  2JFM A;  4X2F A;  1STC E;  3PWD A;  4IX6 A;  2IEW A;  2V62 A;  4FG9 A;  4WT6 A;  4YJQ A;  4BY9 E;  2XCK A;  3LCS A;  4CKI A;  4R1Y A;  3GNI B;  3VS0 A;  1KE9 A;  4A4O A;  2CGW A;  3QD3 A;  2C6D A;  4OTH A;  4YLJ A;  5T3Q A;  2BHH A;  4AA0 A;  4C3P A;  3DZQ A;  2AC5 A;  2QHM A;  3LJ1 A;  1XML A;  3GI3 A;  4HPU E;  4ZJI A;  3HP2 A;  3C4F A;  2OH0 E;  5DIA A;  4AFE A;  4I6Q A;  4OTQ A;  3WE8 A;  3OCB A;  3PVU A;  4O0U A;  2GDO A;  4NST A;  4XH6 A;  4B99 A;  1ZMW A;  3F69 A;  4AA5 A;  4DEA A;  5EDP A;  2GS6 A;  1PXP A;  2JDS A;  3EZR A;  3KFA A;  3UYT A; 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