2R3FA

Crystal structure of cyclin-dependent kinase 2 with inhibitor
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
298
structure length
290
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Cell division protein kinase 2
publication title Structure-guided discovery of cyclin-dependent kinase inhibitors.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 84
structure length 290
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2007-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2r3fA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2r3fA01
1ZMVA 2PUPA 2H34A 4MHAA 4OTQA 2R3FA 4DH7A 3DDPA 4FKLA 3EQRA 3S4QA 3ALNA 4A9RA 3VQHA 2WB8A 3A8XA 3QTWA 4I6BA 3U9NA 1A48A 3CJGA 3H9FA 4FSMA 4H3BA 5K5NA 3C5IA 4M3QA 3DA6A 4RRVA 3BE2A 4Y95A 4ZSLA 3SOAA 3ZXTA 3OROA 4WOVA 4EWHA 3P1AA 2BAQA 2GNGA 3HLLA 3ORPA 4KRDA 1WVYA 4C4JA 3P7AA 4DBNA 4RX5A 2OF4A 1DI8A 3P23A 3BPRA 3RAHA 4WT6A 1YHWA 1PF8A 2QLUA 3NCGA 2VTSA 3ZC6A 3ORIA 1XBCA 2JKQA 2WTJA 5HE0A 4DEIA 1UV5A 1Z9XA 3NW6A 4M69A 5JQ8A 3SVVA 2PUNA 5GZ8A 3WE4A 2FUMA 3CD8A 2ZV9A 3NAYA 2VTJA 2ZB0A 1CTPE 3PY3A 2NO3A 3TI1A 3KVXA 4V05A 3QZGA 5DNRA 2BVAA 3PA3A 4AFJA 4OTHA 1JSUA 2BZIB 2O8YA 5FDXA 1PJKA 4AX8A 1WZYA 2R64A 1P4FA 2X1NA 4BI2A 2H96A 4EH3A 5C8NA 1H1WA 1WBOA 4C3RA 2C3LA 5G6VA 2QOQA 3AMYA 4ZSGA 5CSHA 4CLIA 5B2MA 3VBXA 2HXLA 1SVHA 4I93A 2XVDA 3NCZA 3GBZA 4O0VA 4C02A 3UNJA 2YIWA 1IA9A 2W1DA 3QC4A 3R00A 3TIYA 4F7SA 3ZZWA 4QYEA 4BIDA 4L3LA 5CAVA 4BFMA 3U4WA 3BI6A 5KMJA 4G6NA 1M7NA 3E8DA 4JNWA 3PE2A 5JFSA 1LR4A 3RWPA 3M11A 1OZ1A 2IVUA 2ZDUA 4KIQA 1PMNA 1BKXA 3OWJA 3DFCB 4OUCA 5E8VA 4EK5A 4N57A 2BZJA 5HO6A 4BZDA 4U44A 2ITVA 3G6GA 3LZBA 5HQ0A 3QGYA 4U80A 2CKPA 4RVKA 4BGGA 4PY1A 1ND4A 5K9IA 3RTPA 5I9VA 4MYGA 2HWOA 5IA2A 4CRLA 2IZSA 5LWMA 2RG5A 2WMAA 4W4VA 3PXZA 5CI6A 2F49A 4OR5A 2GFCA 4BHZA 3BHUA 1AD5A 5IEXA 3EFWA 3Q4TA 5IH5A 2I0YA 3OP5A 3Q96A 5H9BA 3RCJA 3RK5A 3W1FA 1REKA 3FKNA 3KC3A 3LOKA 5DH3A 4YBKA 3ZSIA 3QUEA 1ZMWA 2R3QA 2Y6MA 4I22A 3FZSA 4L8MA 4XG7A 4ZTLA 2HWPA 1HCLA 4MBLA 5FLFA 4D55A 4DYMA 4I41A 1GIHA 1O9UA 4YJNA 4O2PA 1WBVA 3E7OA 5DLSA 3DXPA 4JIAA 4L68A 3ULIA 5D12A 2YIRA 3UVRA 4K11A 5CS6A 4BDJA 4QMWA 4FTJA 2BZKB 3ORMA 4A9TA 4AFEA 1ZYSA 4S33A 1IAJA 1JKTA 3HP5A 4UN0C 3RHKA 4D5HA 1H24A 4I5MA 4WIHA 4NW5A 3RKBA 2Y0AA 3OS3A 4NL0A 5KKRC 4ZS0A 2H8HA 2JIVA 2CCIA 4YJTA 1OKYA 5TR6A 4GFMA 3PA5A 4ASEA 4IB5A 4NK9A 3V5QA 4K8AA 3R21A 4I92A 3DGKA 3FZPA 3O23A 5IUHA 4APPA 1MRYA 4PNIA 4S31A 4LQMA 3ZXZA 5TT7A 3KMUA 3KN5A 3OBJA 3ATTA 3DTWA 2QOOA 4RJ6A 3O8PA 4QMSA 5IEVA 1BUHA 2WTCA 2E9OA 4CQGA 4QMMA 3R71A 5EM6A 3RI1A 3E92A 4A4OA 1TQMA 3PXFA 1CSNA 4OTGA 2C6KA 4EZ7A 4NW6A 4RIXB 1J1BA 3PLSA 4JI9A 4YGAA 2HENA 3VS5A 4BTJA 2QVSE 2GNFA 2YIXA 3CEKA 3GFEA 4MXXA 5HBHA 1H26A 4GT3A 4TKSA 4YMJA 2ITTA 3RZFA 3QHWA 4RWLA 4KRCA 1WMKA 2R3JA 4M67A 3GCPA 4BCOA 1PMEA 4M0ZA 2JIIA 1OUKA 2XRUA 3R8VA 4YURA 1FVVA 2P2IA 3Q2MA 4FOBA 3ZFYA 2CNQA 2GS6A 2WMSA 1STCE 4BDIA 4APCA 1UU9A 4Z3VA 5DYJA 4BCNA 1Q99A 3ID6C 4XP0A 5GJDA 3VUHA 5J9YA 5LXMA 2QO2A 1XJDA 3BQCA 3L8PA 2YCFA 4QP7A 5CVFA 2QHNA 4ARKA 4QP2A 5HU9A 5KHXA 4ZS4A 2RIOA 3A62A 3NW7A 4O7ZA 3E3PA 5I0BA 1XH9A 5HBEA 2XM8A 5IDNA 4AZVA 2JIUA 3DQXA 4BDGA 4TXCA 3VRYA 2VTAA 4B4LA 5JGDA 1Q62A 4BYIA 2Y9QA 4FTTA 4IVCA 3KF7A 4BVUA 4TWNA 4L00A 3K2LA 4FKRA 5AP5A 5A6NA 4KBCA 4R1VA 4DFXE 1PXIA 4RZVA 5AM6A 4CXAA 4Y5HA 5KMNA 1WBNA 3LXLA 2WIHA 3LCOA 2DWBA 4HJOA 1VYWA 2UZWE 3MIAA 4YC3A 5JZNA 4F7LA 4HVSA 4IEBA 5EFQA 4QPSA 3FV8A 5KBQA 3QRUA 3PRFA 3BLQA 3ZTXA 4F1OA 5D7AA 2GHMA 3DB8A 1M52A 3PJ8A 1PYXA 4YJVA 5DOSA 2R3RA 3P7BA 3MB7A 4HVIA 4J52A 4MKCA 4RVLA 2CGXA 1UNHA 4AZFA 2WGJA 4F1MA 3MGYA 2C5XA 4NH1A 1XHAA 3KVWA 5I9ZA 1XH8A 2UW9A 3D5UA 4ACHA 2XKEA 4U79A 3EYGA 2CLQA 3BEGA 5AIRA 1URWA 5FM3A 2WO6A 3PYYA 4H1JA 5IEYA 2J5EA 2O64A 5CU2A 2QQ7A 5AP2A 5BVDA 3ZHPC 4CZYB 4CV9A 3FMLA 4PP7A 5GZAA 2ERKA 3E62A 3EYHA 4O38A 3L9PA 2BZHB 2PVRA 3JY0A 5ACKA 3VBQA 5HLNA 4G3CA 5HVJA 2HZIA 4RJ7A 4OAVB 4DCAA 2CLXA 3MTFA 4R5YA 3DXQA 1ZOEA 1F5QA 2HCKA 4B0GA 2VV9A 2C6TA 5E8ZA 5DA3A 3UQFA 4NM5A 5B2KA 3Q4CA 2OJFE 4F6SA 1M2QA 3U6JA 1OI9A 3AD4A 2OJJA 3I5ZA 4WUNA 4AXAA 3R9HA 4FTRA 2W99B 2VO6A 2QR7A 4XP2A 5J87A 4BKZA 4H3QA 3VS7A 3P0MA 5BMMA 3FXZA 5CEQA 2B52A 4FKGA 4Z7GA 2YHVA 3PLAE 4QPMA 4QYGA 2CNVA 4R1YA 4DE4A 4F9YA 5AR4A 3LKMA 2W5AA 3PP1A 4IWDA 4NJDA 4E4XA 5IH4A 1M2PA 2GDOA 3UG1A 1E9HA 2XKCA 2RSVA 2F7ZE 5FTQA 3HEGA 1R78A 4L52A 5CX9A 1RW8A 3D5XA 2R3HA 3NWWA 4PTEA 2PZPA 3ZOSA 2ITUA 4FIFA 4XBRA 5IKWA 5CEPA 5HLWA 4O7NA 3QZIA 4GUBA 5HG5A 2ZVAA 4DITA 4EI4A 3JR1A 1GAGA 3KXHA 2NPQA 3D94A 3GXLA 4EHZA 2OZAA 3I81A 2YM6A 5DG5A 3SAYA 3BHTA 2PU8A 3I79A 3KMMA 3NX8A 4GCJA 4BBFA 2XK8A 2W1EA 4PDPA 3V5PA 3HAVA 2FGIA 5L4QA 4F9AA 2VTRA 1OIRA 5BUJA 3F5GA 2Q83A 3ZLWA 4MXYA 4XS2A 3P86A 3TN8A 4D9TA 4E93A 4WBOA 5F1ZA 3UO5A 4O86A 5IQFA 3DKCA 3IS5A 4GVAA 1YXVA 1BMKA 2BIKB 3FI3A 3A7IA 4NFNA 1TQIA 2WD1A 4CTCA 2WU7A 3OF0A 4QMVA 2VTHA 3OC1A 5BYYA 3CXWA 4IB1A 4FG9A 5M57A 1Q3WA 4TPTA 4W4YA 4E4MA 3ZRLA 3R9DA 2J2IB 2B9IA 3VQUA 5IUIA 2Y4IB 2IJMA 3GP0A 1YDSE 4FA2A 3DFAA 5HKMA 3U6IA 3U6HA 4AN9A 2PHKA 5LMBA 3SGCA 3QD2B 2OXXA 3Q6WA 4RIWA 4FKVA 1H0WA 5KUPA 2B9JA 1V0PA 4W4WA 3EJ1A 5DN3A 1XH5A 4ZTRA 5FDPA 3OTUA 3UIBA 2ITNA 5CF4A 4ZMEA 4NCTC 2WTWA 4J1RA 2B7AA 2DS1A 3VUGA 2G1TA 4DHFA 5EYDA 3GFWA 4N6ZA 4FMQA 4ANNA 3RMFA 1O6LA 4ZTHA 3UP2A 5JKGA 4WG5A 1SZMA 4C4HA 1Q97A 5AX3A 2IVTA 5ITAA 3VF8A 3MVJA 4G3DA 5AWMA 5LMKA 2YM8A 2NNWB 5EYCA 4LI5A 5AMNA 3QBNA 5CQUA 3L8VA 4FEQA 5K5XA 4H05A 1Y6BA 2W06A 4M84A 3FWQA 4GJ2A 4I0RA 3UOHA 3A7FA 3NUUA 3A7JA 3KULB 3VAPA 2ETMA 3V8SA 3VUMA 4IJ9A 4UZHA 4PMMA 5M55A 2PL0A 3ZFXA 1RE8A 4IM0A 5E8WA 5M44A 4H39A 5DT3A 3ZU7A 4CMOA 5M53A 4ZZOA 4E5BA 4AW0A 4E20A 4IAZA 3FZTA 3FI8A 1YHSA 3EB0A 3GCVA 5HTIA 3CD3A 2IZUA 1IG1A 2QU5A 5C01A 5E91A 3BU5A 3EQIA 3MVMA 2X6EA 4F9CA 2GQSA 3UOKA 3KRLA 3LQ5A 4LGDA 5J7HA 3DAJA 4A4XA 2C5OA 2O2UA 4FNXA 4KD1A 4KIOA 2GU8A 2W5BA 2ETRA 2Y8OA 4RC3A 4WSQA 3NUYA 2VTNA 3MS9A 5DEWA 3NUXA 5DE2A 1SYKA 4KSQA 5A6OA 5L6OA 4EJNA 3TM0A 5EM7A 3WOWA 4P5ZA 2YLEA 3LFNA 2VX1A 2ZM3A 3F88A 1NA7A 4ZK5A 5CXHA 4D4RA 5A4CA 5HVYA 5CI7A 3FAAA 4ONAA 4DGOA 1YI6A 4ANLA 5CSPA 1JNKA 4YLLA 5ETFA 5C03A 4UMRA 5J1WA 3UPXA 4AF3A 4IFCA 2XIYA 1SNUA 2Z7RA 2EXCX 4E3CA 4EH6A 3PSBA 3G6HA 2PVHA 4JBVA 5DMZA 1ZYDA 4EORA 5HESA 5HO7A 1G3NA 1Z5MA 3V5LA 5DVRA 4M8TA 4EONA 2X7FA 3NYNA 5HG8A 5L2SA 4CFUA 2BRMA 3FMKA 2GHGA 4QMOA 2QR8A 2ZDTA 5A4QA 4BCIA 2XA4A 4YSJA 3LFQA 4WUAA 2Y7JA 4DN5A 1YKRA 4DFZE 2ONLA 4JT3A 1XKKA 4M69B 1Q24A 2J6MA 3SV0A 4B99A 5BNJA 1P5EA 2C0TA 3I60A 4N70A 5BVKA 5HNBA 4ORKA 4MF1A 4QD6A 2OFUA 3GU8A 4CMUA 3I0OA 4QMPA 3L9LA 5CNNA 2C6EA 4BWXA 4FVPA 4I20A 3H4JA 4IQ6A 4YJUA 5GNKA 5A4TA 5LVPA 3QQKA 4TWOA 3U51A 4Z55A 3QUPA 4OT5A 1FPUA 1M14A 1W8CA 2BROA 2EU9A 4JJRA 4L9IA 4OT6A 5E1EA 4ZZMA 4C7TA 4DT8A 3WF9A 3RAIA 1PY5A 4EOSA 2Y4IC 4O83A 2JITA 4UWCA 3RP9A 1NVQA 4J8MA 4GFGA 4XRJA 2PPQA 5BX0A 5E8SA 4XV1A 3UQGA 2GNJA 2AC3A 3PE1A 4IWQA 4A9SA 1ZYJA 1WAKA 2HW6A 4XCUA 4CQEA 4FK3A 3HRBA 5FP5A 2J9MA 5FXSA 4G17A 5AM7A 4QQ5A 4G16A 3W8LA 4S30A 1Q5KA 4IIRA 3DKGA 3D83A 2WMTA 2EB2A 4AZSA 3VVHA 4I4FA 5DT4A 2X2MA 1H28A 3W2RA 3RAKA 2BALA 3O7LB 1KOAA 2YAKA 1MQBA 4C38A 2E9PA 4HYSA 4C8BA 2ZYBA 3HUCA 3RBWA 3KGAA 3W2PA 5AR3A 3C4XA 3DLZA 5TKDA 4BDEA 5A54A 3OUKA 3F2RA 4UYNA 3PY1A 4DF3A 3COKA 3LQ8A 4V0GA 4ANOA 4YTCA 4G9RA 4USFA 2WMUA 4EBWA 3TUDA 4FV7A 3EQGA 3PZHA 3WYYA 4KIPA 1LEZA 4JQ7A 2WAJA 4X6QC 4AGDA 4FKSA 3VUTA 3QX4A 4DG2E 5AAFA 1FVTA 3D7TA 4HGLA 4PMSA 5AP3A 3WBLA 4ACGA 2UVZA 3IK3A 4R7IA 3CJFA 3ORNA 4MNFA 5E8UA 2YWPA 1PW2A 2XJ0A 3TKIA 3V04A 1QMZA 3QD3A 1AGWA 2UUEA 5EH0A 3GQLA 4G5PA 5GJGA 3ZRKA 4X2FA 4E5WA 5I3RA 3DV3A 4EZ3A 1PXPA 3VUKA 3A7HA 2W5HA 5IA4A 5KO1A 2Z7QA 2VTQA 3QC9A 3L8XA 3UYTA 3OXIA 5JQ5A 4IFGA 2JDSA 3GVUA 3S00A 3OWLA 3LLAA 3Q32A 4G1WA 3PJCA 2V7AA 4FKQA 5AEPA 2XMYA 4XUFA 5HD4A 4DBXA 2VTLA 2GCDA 4DCEA 3NPCA 4IC7A 4F0FA 2HZNA 4OTPA 5IDPA 3PVWA 1QPEA 2A2AA 4FV1A 4AOTA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1ZMV A;  2PUP A;  2H34 A;  4MHA A;  4OTQ A;  2R3F A;  4DH7 A;  3DDP A;  4FKL A;  3EQR A;  3S4Q A;  3ALN A;  4A9R A;  3VQH A;  2WB8 A;  3A8X A;  3QTW A;  4I6B A;  3U9N A;  1A48 A;  3CJG A;  3H9F A;  4FSM A;  4H3B A;  5K5N A;  3C5I A;  4M3Q A;  3DA6 A;  4RRV A;  3BE2 A;  4Y95 A;  4ZSL A;  3SOA A;  3ZXT A;  3ORO A;  4WOV A;  4EWH A;  3P1A A;  2BAQ A;  2GNG A;  3HLL A;  3ORP A;  4KRD A;  1WVY A;  4C4J A;  3P7A A;  4DBN A;  4RX5 A;  2OF4 A;  4I6L A;  1DI8 A;  3P23 A;  3BPR A;  3VON A;  3RAH A;  4WT6 A;  1YHW A;  1PF8 A;  2QLU A;  3NCG A;  2VTS A;  3ZC6 A;  3ORI A;  1XBC A;  2JKQ A;  2WTJ A;  5HE0 A;  4DEI A;  1UV5 A;  1Z9X A;  3NW6 A;  4M69 A;  5JQ8 A;  3SVV A;  2PUN A;  5GZ8 A;  3W0R A;  3WE4 A;  2FUM A;  3CD8 A;  2ZV9 A;  3NAY A;  2VTJ A;  2ZB0 A;  1CTP E;  3PY3 A;  2NO3 A;  3TI1 A;  3KVX A;  4V05 A;  3QZG A;  5DNR A;  2BVA A;  3PA3 A;  4AFJ A;  4OTH A;  1JSU A;  2BZI B;  2O8Y A;  5FDX A;  1PJK A;  4AX8 A;  1WZY A;  2R64 A;  1P4F A;  2X1N A;  4BI2 A;  3TMO A;  2H96 A;  4EH3 A;  5C8N A;  1H1W A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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