1E1XA

Human cyclin dependent kinase 2 complexed with the inhibitor nu6027
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
298
structure length
290
Chain Sequence
MENFQKVEKIGEGTYGVVYKARNKLTGEVVALKKIVPSTAIREISLLKELNHPNIVKLLDVIHTENKLYLVFEFLHQDLKKFMDASALTGIPLPLIKSYLFQLLQGLAFCHSHRVLHRDLKPQNLLINTEGAIKLADFGLARAFGVPVRTYTHEVVTLWYRAPEILLGCKYYSTAVDIWSLGCIFAEMVTRRALFPGDSEIDQLFRIFRTLGTPDEVVWPGVTSMPDYKPSFPKWARQDFSKVVPPLDEDGRSLLSQMLHYDPNKRISAKAALAHPFFQDVTKPVPHLRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Protein kinase
molecule keywords CYCLIN-DEPENDENT PROTEIN KINASE 2
publication title Identification of Novel Purine and Pyrimidine Cyclin-Dependent Kinase Inhibitors with Distinct Molecular Interactions and Tumor Cell Growth Inhibition Profiles.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 82
structure length 290
sequence length 298
ec nomenclature ec 2.7.11.22: Cyclin-dependent kinase.
pdb deposition date 2000-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1e1xA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1e1xA01
4XG6A 3QTRA 4IVBA 3DXPA 1GY3A 5HU3A 1OKZA 2I0YA 4EH9A 4CKIA 5ANGA 1AD5A 3R1YA 4ACGA 3D5WA 2I1MA 5K4JA 4FKQA 1J7LA 3L8XA 3COKA 4II5A 2C1AA 5FQDC 3V5JA 4B9DA 3BYVA 4QP1A 4I0RA 3DV3A 4IWPA 2BALA 2OH4A 3G9LX 3QTWA 1M14A 3E8CA 2PVHA 2XM8A 3QQUA 4DA5A 5FBOA 3D4QA 3MA6A 4R8QA 4AE6A 1BMKA 1DM2A 3DZQA 3QALE 2WIHA 5JFWA 2G1TA 2C5XA 5CWZA 3EQCA 2R5TA 4IH8A 2P55A 4HYHA 1BYGA 4HGSA 4QOXA 4FZDB 3O8TA 2PVMA 5GIPE 3MGYA 1MQBA 3LE6A 3LIJA 5TT7A 1WCCA 4XV9A 5J1VA 1M2QA 5ETFA 3RAWA 2AUHA 1J91A 3U8WA 3W8QA 4P5ZA 2QR7A 3FMMA 4AFEA 1WVYA 3E5AA 4JQ8A 2JDSA 5AUWA 1ZLTA 5BVFA 3RKBA 3P7CA 5CAUA 5HTIA 4JR3A 3CQEA 3LXPA 4FKVA 2QOLA 2VTHA 3CXWA 4IADA 5HVYA 4DFZE 3T9TA 3UYTA 3QCXA 4OT6A 2B9IA 3AMAA 2X6DA 2XMYA 4FG8A 2WTKB 1W98A 1R0EA 3ROCA 3LMIA 1P4OA 3ANQA 4DFBA 3DOGA 3OG7A 3ODZX 4FT0A 3WZEA 3DKOA 5D41A 4M68A 4CG8A 2UW4A 5DRBA 4R1YA 5HX6A 4GW8A 3I60A 4L7SA 3MV5A 4IJPA 4AT5A 1HCKA 2O3PA 3BHUA 3KKVA 3SX9A 3EKNA 4FOCA 1LUFA 3OD6X 4GU6A 4BGHA 3QUDA 2Q0NA 2CLXA 5GHVA 3TEIA 2J2IB 3QCQA 1SNUA 3Q9XA 1OMWA 3QRUA 2CNVA 3TV4A 3Q6UA 3UZRA 3TNQB 1F0QA 4FC0A 3TM0A 3NEWA 3GFWA 4LV5A 3PE1A 4O0YA 1OB3A 1WBNA 3E3PA 3CJGA 1W8CA 1YWRA 2VZ6A 3A7GA 4LL5A 3NYXA 3QF9A 1YXXA 2PZIA 4E1ZA 5CT7A 4UALA 1VYWA 4JBOA 2P0CA 5DYJA 4IZ5A 5LXMA 2ZV9A 4XCUA 2QODA 5I3OA 3GFEA 4GVJA 4QPSA 2HENA 4PUZA 2QO9A 4C4IA 4O1OA 3QXPA 2VTQA 2BRNA 1WVXA 3IGGA 3MI9A 4FSYA 4FF8A 3RPYA 2CLQA 3QUEA 4B8LA 2WTVA 4RC3A 4APPA 3LJ2A 3R7GA 4FNXA 3NUXA 4HOKA 3KL8A 4QP8A 2BAJA 4TWNA 4XG9A 3ULZA 5FDPA 4E5WA 4WBBB 2IW6A 2WMXA 4EH2A 2W17A 3Q9WA 5E91A 4G34A 4C02A 1O6KA 1NVRA 3H10A 4OTRA 3DK6A 4I5CA 4QRCA 3ULIA 4BBMA 4ZY5A 4HCTA 5F4NA 3JVSA 1KE9A 5E8ZA 2C3IB 2XNMA 4EUUA 3R7UA 4YJNA 5GIOE 4QP4A 4CRSA 3PUPA 2PVJA 1U46A 1OECA 4P4CA 4DINA 1OUKA 2VO6A 4P7EA 4AXAA 4BBFA 3GP0A 4RJ4A 2R3HA 5DHJA 5EQPA 3Q6WA 2GU8A 1YHWA 2OICA 3IW4A 4BHNA 1CTPE 4F7NA 3WF8A 3RPVA 4QT1A 3IDPA 4JDIA 4KSQA 5D12A 3UYSA 4DFUA 2CJMA 2OKRA 3KMMA 3TL8A 4L45A 3WILA 2YDIA 4XEYA 3NRMA 5JN2A 2EB2A 4ZZOA 3ZLSA 5CNOA 4DAWA 2RFDA 4FTJA 3UVRA 4RX8A 1G5SA 1GIHA 3DAJA 5DR9A 3RZFA 1SYKA 1OUYA 2GNGA 2XBJA 4NH1A 5ANEA 4C59A 3NW6A 3AD5A 1YRPA 2YM4A 4IW0A 2UZUE 3DPKA 5H2UA 3RJCA 4J8NA 4ITHA 2CGWA 3F9NA 1GAGA 4FTIA 1ERKA 4XLIA 4CNHA 1PXIA 5KKRB 4GH2A 4L00A 2PUNA 3EWHA 2A0CX 3PYYA 2GNFA 3M2WA 3HL7A 3DBQA 4IM3A 5JQ5A 3ZONA 4OGRA 3TUCA 3ZO1A 1H1PA 4D9UA 3AC5A 4FSNA 1H26A 4JIAA 3VUKA 4JDKA 3C0GA 5CEPA 3CGFA 2Z7LA 3EYGA 4IDVA 4V01A 4CQGA 4EZ3A 3GC0A 4U5JA 3FEGA 3ACJA 3CS9A 5AAGA 2F7XE 5CU3A 3OY1A 3KF7A 3U6JA 3R21A 3Q9ZA 3D7TB 4KA3A 2EB3A 4RZWA 3BHVA 4U79A 3WARA 4FIGA 4BN1A 1Q24A 4DT9A 2PSQA 5DRDA 3AC1A 5HNGA 5CSVA 3FZOA 2B9JA 2PMOX 2X8DA 3FBVA 4BTFA 3CD8A 1UNHA 5IU2A 1E9HA 1IR3A 2QC6A 4JDHA 3LPBA 2H96A 3JY9A 1XH6A 2KTYA 3BYUA 4QO9A 1ZZ2A 3D5UA 1YI3A 1YXUA 3CBLA 3HUBA 4G2FA 4ZMEA 3RTPA 2R3IA 2Z02A 1Q61A 4DH1A 5KHXA 4HJOA 3RWPA 1E1VA 2OO8X 4GV1A 4IHPA 3TZ9A 5AV4A 4OTFA 1FMKA 3ERKA 2WU6A 1R39A 2YJSA 1GZNA 2BRMA 5CQWA 3OCTA 5JFVA 1JKTA 3K54A 4L44A 5AP7A 5AX9A 5IQCA 4C8BA 4UMQA 5ACKA 4NCTC 2WMAA 2FSMX 1P5EA 2XNGA 3UC4A 5CF4A 2XIYA 1QMZA 3KU2A 3L8VA 2XKFA 2GS7A 2R7BA 5BX0A 4QYFA 4DH7A 1Y91A 3PPZA 2H9VA 4BI2A 5L6WL 2Z7QA 2ZOQA 2I0VA 2RIOA 2G9XA 3ZFXA 1IA9A 4XOYA 4EZ5A 3HAMA 3BEGA 2WMBA 3DTWA 5AWMA 4TYHB 1XQZA 5DBXA 3FPQA 4OW8A 1CSNA 3BV2A 2ITWA 3QYWA 5D10A 4NKAA 5BVKA 4NM3A 3P78A 4EC9A 3DK7A 2OJGA 2VGPA 1LP4A 1NXKA 1JSUA 3W16A 4CSVA 4CTBA 4E8AA 3PTGA 2VWWA 3PZHA 4O6EA 1E1XA 4L7FA 1WBPA 1GJOA 3F5GA 4KKHA 4RX9A 4RC4A 3PJ1A 5ETIA 3E8NA 3F2NA 5AUZA 5A9UA 3R8UA 4C61A 3AD4A 5LMAA 4CVAA 3UZPA 4QNYA 5DLSA 3IDBA 3IW7A 3MH2A 3QA8A 4QTDA 4QMPA 4IB5A 4IB1A 2YIYA 1Z5MA 4JG6A 4XMOA 1KSWA 4YJVA 4ZSEA 1R1WA 1VZOA 2HXLA 3KXNA 3KC3A 4L42A 2W1IA 4J98A 4QMTA 5GZAA 4MVFA 5FEEA 3I79A 3EN6A 3NIZA 1NT2A 3VWAA 2C3LA 2JD5A 3NR9A 2R3FA 5HCYA 2CGVA 4E6AA 4EKLA 3EYHA 5HO8A 4C62A 3AT4A 2W5AA 4C2WA 4R6VA 4EOOA 4FKWA 4JS8A 4U6RA 3PZEA 4KIPA 2R3GA 4C3PA 5JK3A 2XIRA 4XYFA 3FMLA 4ASEA 4XP3A 3KK9A 4FTTA 2RGPA 4F0GA 3VS6A 3A4OX 5KBQA 1ZARA 4O22A 4TYGA 3OC1A 4I4FA 4USFA 4YNEA 5A14A 3FKNA 3E88A 4O84A 4BIBA 2XCKA 1MRYA 3LXLA 4KD1A 4BBEA 5I9WA 4CGAA 3W33A 4ZS4A 2OH0E 4YZDA 5FUTA 3DNDA 3DAEA 4H1MA 3SXRA 4FUXA 4XV1A 3RGFA 4WD5A 4FKIA 3NAYA 2W96B 3GXLA 4FNWA 2QU5A 4I6BA 1U5QA 2HY81 2B1PA 4CT2A 4C4EA 5FWKK 3W1FA 4LMNA 1FPUA 5KNJA 4MKCA 4KIKA 5AR7A 5IDPA 5CVHA 4AU8A 5DA3A 4G5JA 4XRJA 2BUJA 2IG7A 4RA5A 4NK9A 3OBGA 3UE4A 5M07A 3DS6A 2WZJA 3HECA 5H8EA 3BYMA 4C33A 3LFDA 4X2NA 5BVOA 4GMYA 3U4WA 3W2OA 4LL0A 4DFYA 2PMLX 1K9AA 4GFMA 1PY5A 1WBWA 2AYPA 3K3IA 2X0GA 4LGGA 3FWQA 2WQOA 4BI1A 4CFVA 3ZFMA 4QMZA 4E4LA 5KE0A 4HNIA 4O2ZA 2QOFA 3NNVA 4DGLC 5J9LA 2QOHA 3OS3A 5IQBA 4J95A 5IQIA 3KN6A 4RGJA 4YZBA 4GJ3A 2VWBA 2XNEA 2WQNA 5L4QA 5AR4A 3VULA 4HNFA 3BU3A 3BZ3A 3MY5A 3SW7A 4ZLOA 4OUCA 3E8DA 3LW0A 3OMVA 4RIOA 5KCVA 1M52A 2Y6OA 3FC1X 4IAKA 2I6LA 3NUPA 4L68A 3EQIA 1Q8TA 3QRIA 4G5PA 4MD7E 2PE2A 4QMVA 3VF8A 4APCA 4CMTA 5IDNA 3HV6A 3HZTA 3QBNA 2X7OA 5IA2A 5AFVA 3F7ZA 2FVDA 3LQ8A 3G9NA 4MBIA 4BDBA 4EH5A 3MTFA 4X6RA 4RPVA 2IO6A 4JQEA 2I40A 3OFMA 1PJKA 2YCRA 4FNYA 3IOKA 4U43A 3OXTA 3NMUF 3F3TA 3F5PA 5CEOA 5HO7A 1Y57A 3LZBA 4U3ZA 1FVTA 3ODYX 3S0OA 5LOHA 3MJ1A 4BB4A 3MH0A 4QMUA 5HVJA 3TJCA 4M69A 2OLCA 3NZ0A 3CSVA 2BDJA 5J7BA 5ETCA 2W9FB 4ZS0A 3R9DA 4ASXA 3V5LA 2B9HA 3VUMA 4YUQA 5I9YA 4BZNA 3PA4A 4DBNA 3OP5A 4EWHA 4RVTA 1VR2A 4FL1A 1JAMA 2Y4IB 2HZ4A 3UVQA 4BICA 2IW9A 2GCDA 5HLNA 1XBBA 4WRSA 5JZJA 5AMNA 2WFYA 1AQ1A 3O23A 2PVYA 2UZNA 2ONLC 3IK3A 3R00A 3CY2A 3H9OA 4MF0A 4UXQA 3WZUA 2EXEA 3I81A 3C4CA 1V1KA 3ZDUA 2HCKA 3SHEA 4MQ2A 4A9SA 5EYCA 1JOWB 2WTKC 2YCFA 4LUDA 5GNKA 5CEIA 1REJA 4CQEA 4F7SA 4FL2A 3R7OA 3LCOA 3PRIA 5KMLA 2B52A 4DTAA 4FZAB 5LVPA 2PU8A 5JRSA 5A3XA 1KOBA 3R83A 1AGWA 5AR8A 1JQHA 3BV3A 4XBUA 4BDGA 3AT2A 3TIYA 3VBWA 5FTGA 2JLDA 2Q0BA 2QOBA 4IAIA 4F0FA 2PMIA 3GGFA 5HLPA 4FTAA 3GBZA 1B38A 4FA2A 4BFMA 2VV9A 4FV0A 4GCJA 3AC8A 2VRXA 2OIQA 1LEWA 3PPKA 4JLCA 2E9VA 3SC1A 3L1SA 2CCIA 4IWDA 4WOVA 5ANJA 3BLQA 1UKIA 1YDSE 2YIRA 5E1EA 2W1HA 4JNWA 1FMOE 2GMXA 1JWHA 2WMTA 3C4XA 3FZTA 3FZPA 3BGPA 4KKEA 4MD8E 5TKDA 3SAYA 1KE7A 3UOJA 2HZNA 4TZRA 3O50A 2VTMA 3DJ7A 2CCHA 4F64A 4PL3A 2A27A 3GI3A 4QP3A 4ZEGA 2O64A 2BFXA 5TR6A 4FV4A 5IISA 1TQIA 4I92A 4NL0A 3BIZA 5L8JA 3ZXZA 5BMMA 3V8SA 1Y8YA 2EWAA 4P2KA 1LEZA 4IAFA 3R9HA 3C7QA 2VWYA 3ETAA 5ICPA 3SA0A 4OT5A 3PIXA 3RAIA 4KIQA 4O27B 2Y8OA 4QP7A 4KAOA 4USDA 4RIXB 4CG9A 2F9GA 2ZMDA 5LQFA 1GZOA 2X1NA 3FZRA 1OIQA 2CSNA 4F65A 2BIYA 2Z60A 2XYUA 2BDWA 3BE9A 4NW5A 3FSFA 4R1VA 3TI1A 3H9FA 3R01A 1A9UA 3E7OA 4JI9A 4C3FA 4O7YA 4R78A 1SVHA 3MH1A 2VO7A 3C4FA 5L8LA 3RCDA 4O86A 4TL0A 4EK6A 3BQCA 4IAZA 2UW9A 2XRUA 2ZV7A 3UMXA 4M84A 3W55A 4B0GA 3MPTA 5BQ0A 4CKJA 3V5WA 2W1GA 4DF3A 2YWPA 2ZM3A 2OFUA 2WIPA 3EQBA 1BI7A 4YTFA 2R3OA 5HG5A 4IC8A 2EU9A 2V7OA 2YAAA 4MNEB 2BROA 4GJ2A 1ZYJA 4ZP5A 4DG0E 4BDFA 1YKRA 3F3ZA 4UBAA 5E8WA 3RHXA 3MVHA 2PWLA 4MF1A 5GJFA 3UMWA 5L6PA 4FZ6A 3UOLA 1ZY4A 1LPUA 2VTIA 4FSRA 2QONA 3ORXA 2ZJWA 3MWUA 4JBQA 4PTCA 1H0VA 1URWA 4KUJA 2PVNA 4RA4A 2C5VA 5DNRA 2BTRA 4ALUA 5KKRC 2V7AA 1WVWA 5DN3A 4EK5A 5L6OA 2OU7A 4FUYA 3GU5A 1J3HA 2DQ7X 2XS0A 3OWPA 4UXLA 2JKKA 3WI6A 2X7FA 4M0YA 4O0SA 4E26A 4CD0A 4J97A 4FX3A 2XIXA 1I09A 4RIWA 3HMMA 4ZSJA 2FGIA 2XJ1A 1PHKA 5CAPA 1H1QA 4AT4A 2IPXA 4RIYB 3EL8A 4ZY6A 1KUTA 1XWSA 5ANOA 5TO8A 3FXXA 4DH8A 2VTNA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XG6 A;  3QTR A;  4IVB A;  3DXP A;  1GY3 A;  5HU3 A;  1OKZ A;  2I0Y A;  4EH9 A;  4CKI A;  5ANG A;  1AD5 A;  3R1Y A;  4ACG A;  3D5W A;  2I1M A;  5K4J A;  4FKQ A;  1J7L A;  3L8X A;  3COK A;  4II5 A;  2C1A A;  5FQD C;  3V5J A;  4B9D A;  3BYV A;  4QP1 A;  4I0R A;  3DV3 A;  4IWP A;  2BAL A;  2OH4 A;  3G9L X;  3QTW A;  1M14 A;  3E8C A;  2PVH A;  2XM8 A;  3QQU A;  4DA5 A;  5FBO A;  3D4Q A;  3MA6 A;  4R8Q A;  4AE6 A;  1BMK A;  1DM2 A;  3DZQ A;  3QAL E;  2WIH A;  5JFW A;  2G1T A;  2C5X A;  5CWZ A;  3EQC A;  2R5T A;  4IH8 A;  2P55 A;  4HYH A;  1BYG A;  4HGS A;  4QOX A;  4FZD B;  3O8T A;  2PVM A;  5GIP E;  3MGY A;  1MQB A;  3LE6 A;  3LIJ A;  5TT7 A;  1WCC A;  4XV9 A;  5J1V A;  5BV3 A;  1M2Q A;  5ETF A;  3RAW A;  2AUH A;  1J91 A;  3U8W A;  3W8Q A;  4P5Z A;  2QR7 A;  3FMM A;  4AFE A;  1WVY A;  3E5A A;  4JQ8 A;  2JDS A;  5AUW A;  1ZLT A;  5BVF A;  3RKB A;  3P7C A;  5CAU A;  5HTI A;  4JR3 A;  3CQE A;  3LXP A;  4FKV A;  2QOL A;  2VTH A;  3CXW A;  4IAD A;  5HVY A;  4DFZ E;  3T9T A;  3UYT A;  3QCX A;  4OT6 A; 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