2YIQA

Structural analysis of checkpoint kinase 2 in complex with inhibitor pv1322
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
300
structure length
280
Chain Sequence
VYPKALRDEYIMSKTLGGEVKLAFERKTCKKVAIKIISKVETEIEILKKLNHPCIIKIKNFFDAEDYYIVLELMEGGELFDKVVGNKRLKEATCKLYFYQMLLAVQYLHENGIIHRDLKPENVLLSSQEEDCLIKITDFGHSKILGETSLMRTLCGTPTYLAPEVLVSVGTAGYNRAVDCWSLGVILFICLSGYPPFSEHRTQVSLKDQITSGKYNFIPEVWAEVSEKALDLVKKLLVVDPKARFTTEEALRHPWLQDEDMKRKFQDLLSEENESTALPQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE CHK2
publication title X-Ray Structures of Checkpoint Kinase 2 in Complex with Inhibitors that Target its Gatekeeper-Dependent Hydrophobic Pocket.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 89
structure length 280
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2011-05-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 2yiqA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 2yiqA01
3FXZA 2VO3A 3U55A 4FTOA 1OBDA 3U6HA 5DPVA 3BGPA 4C61A 1KE8A 3NYOA 2YM7A 4KINA 5AMNA 1JKTA 1TVOA 2WIPA 3TV6A 2X6EA 4LGDA 2ZOQA 3NR9A 4C4FA 3UP2A 2Z60A 3D5UA 4YTIA 4BDBA 4C35A 4ZJVA 4OTFA 3IW4A 3CTJA 4M0ZA 4S32A 5B2MA 3TZ8A 3D4QA 3JS2A 3VHEA 5IA5A 2B52A 3KMWA 4KSQA 3VUMA 3SHEA 4AG8A 1STCE 1L3RE 4G34A 4Z7HA 4JBQA 4XOZA 5EFQA 2XJ1A 5CF8A 3PRIA 3GCQA 2BKZA 1UKHA 4PL3A 2VGPA 1JBPE 1FOTA 4R6VA 3RM7A 4GK4A 2AC3A 3QQUA 2O5KA 4USFA 3D7TB 4KA3A 3LCTA 1WBPA 5BYLA 4K8AA 4OLIA 3AMAA 4FEVA 3MGYA 2ETMA 3Q04A 1XJDA 5HIEA 4C0TA 5BNJA 3EWHA 2J0KA 2UZNA 1OPKA 2QLUA 4FK6A 4Q9SA 1ZARA 1F0QA 3RHXA 1KUTA 3PRFA 3O0GA 5GJFA 3A8XA 3GCPA 4XG4A 2F4JA 2OIQA 3V5JA 4ANMA 2BRHA 5ACKA 2X7OA 1PXMA 4AUAA 3ATTA 1M2RA 3VS3A 3EHAA 3SLSA 1WBSA 1WCCA 2ACXA 3I60A 3E3PA 5HESA 4AGDA 2G2FA 4GT4A 5FBOA 4A07A 4M13A 4FKLA 1OKVA 4NIFB 5I3OA 4BYIA 4ZSAA 3FMNA 3UG2A 3ZU7A 3IDBA 1H00A 2QOBA 2BR1A 4BGHA 5LQFA 4P4CA 3A61A 2HXQA 5DRBA 3FZOA 2OSCA 3QX4A 4ITIA 3SXFA 2R5TA 3FV8A 5CI6A 4DFZE 1CKIA 2YHVA 3W1FA 4ZTSA 3DAEA 3ZC5A 3TJDA 2H6DA 3PJ1A 4EBWA 3Q4TA 5IQAA 4IX5A 1UKIA 4YU2A 3DOGA 1CMKE 4IAZA 4JQ7A 2X7GA 4FG7A 3F5PA 2VTHA 3BLHA 3GCUA 3FZRA 5BVKA 3I5NA 2BIYA 4DH3A 1YDTE 4DYMA 1OITA 4HGLA 2XM8A 3PPZA 3SOAA 4FTCA 1Q62A 3GVUA 3ZUTA 4F63A 2PE2A 3NYNA 3QRJA 4H1JA 1J1BA 4HNFA 4I0RA 4ANNA 2YA9A 5FQDC 1E1VA 3V3VA 4A9RA 4EWQA 3W16A 5KO1A 3ACJA 1TKIA 3QRTA 1H1RA 1O6YA 4C62A 3ITZA 4LI5A 2PU8A 2WMQA 1KE9A 1M14A 2LGCA 2XNBA 2V55A 5JFSA 2PUUA 3H30A 4LGGA 2P2IA 2UZTA 3ZSHA 3DV3A 2EUFB 4NYEA 2VGOA 4YUQA 2W06A 3QQHA 4G3FA 4OT6A 3S0OA 3TV4A 3U6JA 5A4QA 2VWYA 3EJ1A 4YJUA 3OT3A 4DFYA 4AOIA 4YSJA 4EI4A 3MTLA 5FD2A 5FWKK 2X2MA 3FKOA 5C9CA 3O51A 5ANGA 4ZLYA 4I5PA 3LQ3A 2JKMA 5CAQA 2YIQA 3HGKA 3ZC6A 1WVWA 3WBLA 3FWQA 4D58A 3AC4A 4X6QC 3R8LA 2PVMA 4R7IA 4HVGA 3WF8A 4ASZA 2BAQA 4C4IA 4EYMA 4RWKA 2PMIA 3Q6WA 3BELA 3R8PA 4HZRA 2BHEA 3O8UA 2C3IB 4TWCA 3VS1A 4F9AA 2CGXA 3C4ZA 4F6SA 2C0OA 1ZZ2A 3P9JA 4FODA 1OKYA 2X4FA 2OH0E 4FKGA 1H28A 3VS4A 2ITQA 3PSCA 4AOJA 1JPAA 2XNPA 4WNKA 4BCKA 5AV2A 1V0BA 4IM3A 4PNKA 3W18A 1OMWA 5FXQA 2V5QA 5JQ5A 2J0MB 4ANQA 3R1QA 5HE1A 2WMAA 4U79A 4RSSA 4QTCA 5GZ9A 3ZDUA 3MVMA 5FM2A 4BL1A 1VYZA 3PVWA 4LUDA 3NAXA 3FXWA 4XG2A 4XNEA 2VRXA 4F99A 4QP3A 4RC4A 4YO6A 1VEBA 1R1WA 4HYSA 4OT5A 4JBOA 3RVGA 4JDKA 2WTVA 4EOSA 3CGOA 3OWPA 4RX9A 1Z9XA 4O22A 3FSFA 2R0UA 1WBOA 3BI6A 3O7LB 1YXSA 2W1ZA 4QD6A 3ZBFA 4A9TA 2UW7A 4ZAUA 2PULA 3LXKA 5E8ZA 2GS2A 4KIPA 4W4WA 5AADA 1U59A 2VX3A 2RG6A 5EH0A 4ALVA 4YURA 3Q5IA 5I5ZA 5K5XA 3UQFA 3OT8A 5T3QA 1M52A 2QLQA 5F4NA 5LXMA 3OW4A 2GNIA 4FSNA 5EM8A 4BY9E 3UPXA 1REJA 4HGEA 3KCKA 2W0JA 3EL7A 4FL2A 2I1MA 4R7BA 3NCGA 2GFCA 4ANOA 1YWRA 4H58A 2ZM1A 2HWOA 2XIXA 3EMGA 3ZONA 1YXTA 2XP2A 4R77A 4NTSA 2C3LA 3EQBA 2FSLX 2OIBA 3A62A 3DPKA 1YXUA 3FI2A 5EI8A 4A9SA 5KMOA 3MW1A 3E88A 3HMPA 3PP1A 4EH2A 5HX6A 4C2WA 2E9NA 4B8MA 2QODA 4QQJA 1OI9A 4DFNA 2HW6A 4EK8A 1JAMA 3EQRA 5J95A 3PJ2A 3PY3A 3WYYA 3QQKA 4IEBA 5KZ0A 3DDPA 3NW5A 4WBBB 2C69A 3HV7A 5IPJA 2XK3A 5ANJA 3A7GA 3DFAA 4U3ZA 4HVHA 4P5ZA 3N51A 5DEYA 2XIZA 4LMNA 3EKKA 3UZPA 2CLXA 3WZUA 4EH3A 4ORKA 4XEYA 1SVEA 3W2PA 3R83A 3QCYA 4NWMA 1XO2B 4YJPA 2G9XA 4Y83A 5LVLA 2R3PA 1P14A 2YJSA 2CKEA 1NW1A 3D5XA 4B99A 2GQSA 4O0WA 3QUPA 4LRMA 4RZWA 4YP8A 4PPAA 1REKA 4OW8A 4IX4A 3C50A 3LLAA 4CSVA 5J1WA 2OJJA 2BTSA 1FVRA 1Z57A 2P0CA 4I23A 4GT5A 4YBJA 5C1QB 4NCTA 1UNGA 3KULA 3Q3BA 4L43A 3UIUA 1ZY4A 2J4ZA 4W4VA 5HQ0A 2VTNA 4IHPA 3OCTA 1UNLA 2VWUA 4BIBA 4E8AA 3MSSA 2QOQA 3F3UA 1LPUA 4LRJA 2B7AA 2RFSA 3V5LA 5A4EA 4PDYA 5D12A 3FYKX 4OR5A 4IB5A 1PJKA 4V0GA 3G6HA 3PJ3A 3E63A 4GK2A 3R04A 4GJ2A 4R7HA 3Q4CA 4L52A 2PVFA 4CCUA 2GQGA 3RAIA 2YAAA 3FMKA 3JXWA 2OF4A 4KBKA 3BX5A 4UMRA 2X8IA 2ZVAA 5I9XA 3UO6A 4MQ2A 4TWOA 3KXZA 3IW8A 1CKPA 3NUYA 1E9HA 4CZYB 4LRKA 5KCVA 2UUEA 3P4KA 2ITYA 2YWPA 4IX3A 4ASEA 4DH7A 3BQCA 3CEKA 3G51A 3MYGA 4UX9A 4MXAA 3SRVA 3QTRA 4E5BA 3L8PA 4WT6A 2OJ9A 4IB3A 4X3JA 2UW3A 3F88A 5AR2A 3RAHA 5C8NA 1TQMA 2XKEA 3E3BX 2X9EA 4JI9A 5DT3A 3V8WA 3AG9A 1J3HA 5M44A 3JYAA 4EOLA 3BU5A 4BHNA 3IKAA 4KNBA 2CKPA 4EUUA 1H4LA 5ANOA 3OCGA 2OO8X 3IG7A 4O6LA 3C0IA 3SX9A 5IQBA 2C6TA 3FUPA 3MY1A 3WZJA 3I6WA 4QMPA 3TIYA 1ZOGA 3UPZA 5M4FA 3UZTA 2VO6A 3U9NA 3QTXA 4F7SA 4IZYA 4S30A 4BICA 1Q3DA 2WMSA 3QTQA 5FEQA 1U5QA 2YIYA 3V5TA 3NCZA 5A6NA 2R2PA 2WELA 4BBMA 4AT5A 1B39A 1ZMVA 3LXPA 1ND4A 4I24A 5H2UA 3JR1A 4BDGA 1F3MC 5TOZA 1GOLA 3LQ5A 1T46A 4Q5HA 4C4EA 5IA2A 4MHAA 5L6OA 2BPMA 4CKJA 4HCTA 2E9PA 3MY0A 3P5KA 3QA8A 3CQUA 3GB2A 4QTDA 2RL5A 4PRJA 4GVAA 4E5AX 3NUAA 4ARKA 2C30A 5TO8A 4NTTA 3LFFA 1ZY5A 2WKMA 2VX1A 5D7AA 5TKDA 2ONLA 2HOGA 5EK7A 4RJ3A 4V04A 3G6GA 4E4NA 3II5A 4EQUA 3DBFA 5IA3A 5GZ8A 1SNUA 3HECA 2OXYA 2C47A 3I0OA 4IWPA 1MQ4A 4RX7A 3SG8A 4IAKA 3HVCA 3VS7A 3VBVA 3BU6A 2PVKA 2R3LA 1GNGA 4J98A 5E8UA 1NXKA 5J79A 2EXMA 4IZAA 4I5HA 5HCXA 3ZS5A 3ROCA 5I9ZA 1SM2A 3FY0A 5HORA 3OP5A 5M55A 1U46A 2O63A 4I92A 2RGPA 3CBLA 4GCJA 4I6HA 4QP8A 1YDSE 4O21A 3DK7A 3EQFA 5CSXA 2IW8A 4E6CA 3CSVA 1IRKA 3O8TA 4L9IA 3HMOA 1J7IA 3EFLA 2J7TA 4EOJA 1WBWA 3BEAA 3LCDA 3O50A 4G2FA 5DG5A 3FC1X 3QRUA 2VTQA 3GFWA 3HYHA 3IGOA 4FTKA 4QNAA 4RRVA 3I7CA 3HAVA 2H9VA 3FMDA 3KF7A 4UYNA 3ULZA 5HTIA 5CI7A 3NYXA 1OECA 2ZM3A 1CSNA 4Z7GA 1FVTA 2B4SB 4FMQA 4CFVA 3O2MA 1XH5A 3UOLA 1JVPP 3W8QA 4D28A 3R00A 3OC1A 4C57A 5JH6A 1FMOE 3UBDA 2XYNA 4RPVA 5DRDA 2CNUA 3BGQA 3ZEWA 2B54A 4BTKA 2BDJA 4FNZA 2HIWA 2I6LA 4I41A 2YDKA 3VRZA 4XP2A 5CEPA 4KD1A 4NEUA 4X21A 3W32A 4AS0A 4KB8A 2UZOA 3FQEA 2UZEA 4QQCA 5IDNA 2DS1A 5ETAA 2VN9A 5CF4A 5GIPE 5AUZA 1Q3WA 3BE9A 3VQUA 2IVUA 3WI6A 1KOBA 5KMLA 3OZ6A 5ICPA 5IISA 2IO6A 4FSWA 3RALA 4DH1A 5BUJA 2F9GA 4ZTRA 5E8SA 3V8TA 5E7RA 3FJQE 3C4WA 4IDVA 4WA9A 3O96A 4IBMA 4K9YA 1NVSA 4IX6A 3MH0A 4MWHA 3AMBA 4EK5A 2OFUA 2P4IA 2WMWA 3Q9XA 1SVHA 5AUVA 3B8QA 3DCVA 3REPA 2CGVA 3W2QA 2DQ7X 3UQGA 4B0GA 2PUIA 3KN5A 3EQDA 3PG1A 4MKCA 4MWIA 4I6BA 4DF3A 5DT0A 2V22A 4EEVA 4G5PA 2QOOA 4MF0A 1I09A 1H1SA 3UOJA 4BIDA 1M2PA 5M07A 4UZHA 5LCJA 4PL4A 3EKNA 3NMUF 4KUJA 5D7VA 4AP7A 4FKRA 3VUDA 3GP0A 4Q5EA 4AQCA 1Y57A 4E6AA 2BKKA 5IU2A 4ZSJA 2CKQA 3I79A 4C4GA 3COHA 3QQJA 5L6PA 2Y0AA 4J97A 1BLXA 3EQPA 3EQHA 3R1YA 3VUIA 4CFXA 3O17A 1Q4LA 2O64A 4FSQA 5IEXA 5I9UA 1H1QA 3GC0A 4XV1A 2BFYA 2OICA 1XBAA 2I0HA 4DEAA 2Y4PA 5KMJA 4QMMA 2QURA 4EH8A 3E8NA 3OXZA 5FXRA 3DJ7A 1UU8A 3DBQA 1JSVA 2B1PA 3PLSA 4YBKA 4M69A 5HG5A 1XH9A 3F61A 2C0IA 3HDNA 5ANIA 4DGGA 2W96B 3NDMA 3P86A 2WAJA 1OIQA 2EVAA 3PWDA 3H0YA 4QMYA 4ZSEA 4EHEA 1GZNA 2FB8A 5AV0A 2PVYA 3DU8A 4I22A 5LARA 2QG7A 4NM5A 5BYZA 1J91A 3CY2A 1RDQE 2EB2A 3O7LD 4X2FA 1X8BA 5KE0A 4CQGA 2ZJWA 2NP8A 3QWJA 3VAPA 1U5RA 3SGCA 5A9UA 3SXRA 4RZVA 5EQPA 5BQ0A 3CD8A 4UWCA 3ZH8A 4FIGA 4YJQA 4BVUA 5AV4A 4LM5A 2R9SA 4L67A 2B9FA 2J0JA 3ZCLA 4XHKB 1YI6A 3PXQA 4ACDA 1SZMA 1NVRA 1A06A 3FZPA 5CEOA 3KXMA 4DG0E 3ID6C 2HCKA 2CGUA 3ZLXA 2C0TA 5BVNA 1IR3A 3UIMA 1OL1A 3PPKA 3WF7A 4C59A 2YDIA 4UMQA 5DLSA 4QMVA 3W2OA 4J8MA 1KE7A 3QKMA 5CEKA 1V1KA 3FXXA 4AN3A 5K4IA 4YJSA 4YHJA 5AX3A 3H10A 3VF9A 1Y6AA 2BCJA 3DK6A 4MXCA 4PX6A 5FG8A 4II5A 2J0LA 3LLTA 4Z16A 5DYJA 3QHRA 4RFMA 4EKKA 1CKJA 4F7LA 3QXOA 4GYIA 4I5MA 4DN5A 1PKDA 3E8DA 2XH5A 1NVQA 2C6OA 2NNWB 3OHTA 5IH4A 4C34A 2XCHA 4U8ZA 3PXFA 4I0TA 5M08A 4FNXA 4OTQA 1BL6A 3OXIA 3GU6A 4C4HA 4BCFA 4TN6A 4C37A 2C6DA 4G6NA 3HEGA 3TUCA 2HW7A 4RIYB 2UZWE 2XK4A 3ORPA 2XVDA 4GSBA 1RE8A 4RT7A 1NT2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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