1ZYCA

Crystal structure of eif2alpha protein kinase gcn2: wild-type in apo form.
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
295
structure length
261
Chain Sequence
SLRYASDFEEIAVLGQGAFGQVVKARNALDSRYYAIKKIRHTEEKLSTILSEVMLLASLNHQYVVRYYAAWLERRNKKSTLFIQMEYCENRTLYDLIHSENLNQQRDEYWRLFRQILEALSYIHSQGIIHRDLKPMNIFIDESRNVKIGDFGLAKNIGTAMYVATEVLDGTGHYNEKIDMYSLGIIFFEMIYPFSTGMERVNILKKLRSVSIEFPPDFDDNKMKVEKKIIRLLIDHDPNKRPGARTLLNSGWLPVKHQDEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Serine/threonine-protein kinase GCN2
publication title Structural Basis for Autoinhibition and Mutational Activation of Eukaryotic Initiation Factor 2{alpha} Protein Kinase GCN2
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 67
structure length 261
sequence length 295
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2005-06-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1zycA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1zycA01
2IPXA 3R9RA 5DI1A 3DJ5A 3JVSA 4JAJA 5IG1A 3NCGA 4PL4A 1V0BA 2HY0A 1WBOA 2E2BA 3H0ZA 3OROA 2R3PA 2HY81 2RFDA 4I4FA 2XKFA 3E8NA 4N0SA 1P5EA 2YCFA 4FTMA 4BC6A 1UU7A 3ZYAA 3Q9ZA 2UZWE 4A4LA 5EYMA 3L8XA 4AW0A 4IX3A 3PJ3A 3BQRA 3EL7A 4W4XA 3Q4ZA 4AW5A 4E26A 3LJ0A 1Z57A 4ZTNA 3HMPA 5LVMA 2BZKB 3EQPA 4YLJA 4ALWA 5B2LA 4CSVA 3O17A 5CENA 4PDYA 2PUUA 4J99A 3WZEA 3KEXA 4FZFB 4ZXTA 4FG9A 4GT4A 4U43A 3KF4A 4PPBA 3DCVA 3BV3A 3VBQA 3HRBA 4Z16A 3ZEWA 4QNYA 4I5CA 2W4KA 4K8AA 2R4BA 3CKWA 3EQIA 1Q41A 5EW8A 4EQCA 2JFMA 4IX5A 4WBOA 2XH5A 4RIWA 1ZYDA 4CEGA 2Y0AA 4FEXA 3PFQA 2QI8A 4BDFA 4MNEA 2E9OA 3DTWA 4RQVA 4TYEA 3MV5A 4O27B 4EK8A 2PYWA 1JSVA 5DH3A 4U9AA 4FR4A 4YUQA 4Q5HA 1FGIA 3DTCA 3Q4CA 3VW8A 2VV9A 5TKDA 3IDPA 3VUKA 4ZTSA 2QONA 4AT4A 3QC9A 4DG0E 1J91A 1VYWA 2VZ6A 4DFLA 3RZFA 5AX9A 3FQEA 4XBUA 3EQCA 3HVCA 3QALE 2IZTA 3VJNA 4HVHA 4CMTA 3KCKA 3QCSA 4X2GA 4D2SA 4BGGA 2JD5A 3GCPA 1IAHA 4TYHA 5BYZA 1OL2A 4XRLA 1CKJA 2CDZA 4O0WA 4R6VA 2GNIA 3OBJA 1IG1A 3FC1X 3FDNA 4APCA 4AAAA 2WIHA 2G01A 3I7BA 4G1WA 3PPZA 2CPKE 1SVGA 3G0FA 3A7GA 1FMOE 4LFIA 3C0HA 2QOLA 3SV0A 3T3VA 2J0IA 5DRDA 4L01A 4KKEA 5ETIA 1WFCA 3R8ZA 5I9XA 5M53A 4JBVA 3SDJA 4FEVA 1UNGA 3TUCA 2R3NA 3BYOA 3GFEA 2UW9A 4XV3A 3UIMA 3UZPA 5JGBA 4G6NA 4BBMA 5TOZA 3P7BA 3LMGA 3S95A 3PVBA 4FODA 4KABA 5EM5A 5DOSA 2HW7A 4OGRA 4H3BA 5AMNA 4ZEGA 4ANLA 2W4OA 3R01A 3IW5A 2VWVA 1OPLA 2RG6A 3L8PA 2O5KA 3FMLA 4R5YA 3ZH8A 4DFUA 1K3AA 3ZC6A 4F70A 4IJ9A 4M0YA 3QD3A 2PMLX 2DYLA 4BTMA 5AWMA 2WTJA 1M7QA 1PMEA 4IJPA 4E93A 4F9WA 4ERWA 3D15A 5EDPA 3FKLA 3FMKA 2ZB0A 2X2LA 3KL8A 4IAFA 4JT3A 3UOKA 5JGDA 5A4TA 5ANIA 4E7WA 5A3XA 3LXNA 3OF0A 4KA3A 3HEGA 5E8XA 3LFSA 4XX9A 3MFSA 5AV0A 1JKTA 3QL8A 4BBFA 5I9VA 2R3KA 3SA0A 4QYFA 3IW4A 5A6NA 4V04A 3H3CA 1G5SA 1URWA 3ENHA 5F4NA 3SRVB 1IRKA 1GZKA 4XEYA 4BIEA 4RX9A 3PP0A 3WOWA 1M52A 4YTIA 4ZJIA 3VAPA 2H9VA 3HUCA 4WRGA 3FQSA 4NM3A 4U80A 5CYIA 2O0UA 4OTPA 1PYXA 3SOAA 5HX6A 3SXRA 3FZOA 1UVRA 3TJDA 3W55A 2BVAA 3AC5A 3IW7A 3KRWA 4AZFA 5T3QA 2CKQA 2GPHA 3TV6A 4UMRA 3TDVA 2O63A 3KMMA 3VBXA 3EN4A 1M2RA 3KU2A 4M69A 3UC4A 4PTGA 3PLAE 4FT7A 4S2ZA 4I24A 4W9XA 4EKKA 3HZTA 4GK2A 4L46A 2OKRA 5C01A 4DGGA 3TI1A 4PMTA 4AFEA 4YHFA 3R22A 1JKKA 4AWIA 4C34A 4DEGA 4QTDA 3QZIA 3CSVA 3PA5A 4FV7A 2VNWA 5ETAA 4BYJA 4DEAA 5LQFA 4FSUA 5LVNA 3GCVA 3TIYA 4RVMA 5CSHA 3NZ0A 1TVOA 4P5ZA 4E4NA 5HBEA 2O8YA 4EHZA 4Z55A 4X6RA 2W5HA 2XZSA 3PXFA 3E63A 3QCXA 4L3PA 4TNBA 5IUIA 3O23A 3R9OA 4EWHA 5HD4A 4MVFA 3CJFA 2WKMA 4GG5A 4IHPA 1J7UA 4QO9A 3TG1A 3R04A 2J0KA 2ZJWA 3CQEA 3W32A 4WO5A 4YSMA 3UTOA 4YO4A 5EYDA 2FA2A 4EEVA 5CAUA 3HRFA 3HAVA 5F9EA 4BYIA 5FM3A 1YXUA 4AT3A 1ZY5A 3JPVA 4LL0A 3R7IA 2XIXA 2R64A 4X3FC 1AQ1A 2VTNA 4PNKA 2HOGA 4D1SA 2ZB1A 3FYKX 1OMWA 3ZCLA 3OBGA 2GS6A 3SGCA 4ALUA 4BTJA 4PRJA 1CKIA 1KE7A 3QTSA 3BWFA 2YDIA 3MTLA 3FL5A 5A46A 2BZHB 1U54A 2OLCA 4BTKA 3S1HA 2B54A 2VTSA 3Q9WA 4GSBA 4O7NA 3NNVA 4L45A 5F20A 4AA4A 2UV2A 3QTQA 4QTBA 2NO3A 3PUPA 4EYJA 5HHWA 3QQGA 1XH6A 3TN8A 3WZDA 4L3JA 3W2OA 1DAWA 2XNGA 2UVXA 4EQUA 3NS9A 2YM3A 3GOPA 4FSZA 5FGKA 3MB7A 3NW6A 2VTIA 4DA5A 3R63A 5HQ0A 3W18A 4FV3A 4EC9A 4RX5A 4TYJA 1MUOA 4LYNA 3W1FA 4BCPA 3FLWA 1J7LA 4EOPA 5CXZA 3Q96A 3PVGA 1P2AA 2B9JA 4CFWA 4ENXA 2X6DA 1YXTA 4IVDA 4TTHB 4IC8A 5DWRA 5M09A 2W5BA 3IQ7A 1OUKA 5IEVA 4A9UA 4AW1A 5IUGA 2ITWA 3F5XA 3MGYA 4FV1A 2Q0NA 3PY3A 4NIFB 5DGZA 1LR4A 3FZ1A 3OCTA 4GVAA 5IMXA 4ZZMA 3QRUA 5D7VA 5K0XA 5CF8A 5EK7A 5L6PA 3L8VA 3IK3A 2QURA 3TNHA 1OI9A 3IOPA 4AZVA 2ZMDA 4GT5A 4EOMA 4ZY4A 2C6OA 4RFYA 2EXEA 3QKLA 3D5UA 3VS0A 2A1AB 3OCSA 3SRVA 2C3LA 4J95A 1Q8UA 4YPDA 1VR2A 3SKCA 3BIZA 2X7FA 4FIFA 4BCNA 4DFXE 2WMQA 4J8MA 4APPA 4KIOA 2UW6A 1FVVA 1J7IA 4UZDA 3QXPA 4OBPA 1ZRZA 4F09A 3NDMA 2VTRA 3W33A 2PVRA 2QO7A 2BALA 2FO0A 2ZV2A 2BCJA 3HV3A 4ZSJA 1UA2A 4HYSA 4KRCA 4DGNA 4MF1A 4QYGA 4USFA 1MP8A 3BRBA 4UBAA 4W9WA 4NM5A 4PX6A 3SW4A 5HEZA 4C4GA 4NTTA 3ATSA 4YR8A 2WTKB 4IANA 4BGHA 2C0TA 1OGUA 4GYIA 4AUAA 5F1ZA 3EQHA 1W84A 3TCPA 3C5IA 3G51A 1Q3DA 2WMUA 3PY1A 3QRJA 2X6EA 4FC0A 4MK0A 5CNOA 2NPQA 4YJRA 2IZSA 4HJOA 1T45A 1GJOA 1H1PA 4LGGA 2BAJA 5GZ9A 3PJCA 3K5UA 2BUJA 3AD6A 4F0IA 1DM2A 4NZWB 1PXKA 2GTNA 2GHLA 3HUBA 4D2RA 3WIKA 4K18A 3V51A 4PMPA 4I0TA 3DNDA 3LMHA 4GIHA 2BKKA 3MTFA 4O0XA 3ZSGA 4UX9A 1YHSA 4J7BA 4XMOA 5H3QA 3QFVA 4QP9A 2I40A 2XK3A 3MJ2A 4FV0A 3NUSA 4ANNA 2VTAA 4DTAA 2IW8A 4F7SA 3TZ9A 4PWNA 3UG2A 3MY5A 3DOGA 4IAYA 2Z7RA 2XKEA 3NYVA 3Q3BA 1XBAA 1YW2A 5CEMA 4YZMA 1YI6A 5DNRA 4ACCA 2REIA 4UMQA 5JQ5A 4OBOA 3VQHA 2PZRA 1NVRA 1Q8TA 1UKHA 4U41A 4FNZA 4Y8DA 1Y6AA 4BDEA 1M2PA 4P4CA 4D0WA 5CAVA 4N57A 3TUBA 3KVXA 3FZSA 2AC3A 2ONLC 4FKRA 5HO8A 4Z7HA 3V8SA 4U44A 1UWJA 3KC3A 4QMWA 3UZRA 5LVOA 3ACKA 4F1OA 4LV8A 4NH1A 3BU6A 4EK6A 5L4QA 5AIKA 3HX4A 2UUEA 4FV6A 5KMMA 5ETFA 5IQBA 3U55A 4RA5A 2XRUA 2XBJA 3NUPA 3QTUA 4GW8A 2CN5A 2R3FA 2J5EA 1OIYA 5CAOA 3MPAA 2O2UA 1RW8A 3SXSA 2WZJA 3E8CA 1B39A 1U5QA 4TKSA 3R9DA 3T9TA 5CEPA 4FSRA 3MBLA 3QCQA 2QVSE 4QMZA 4QMLA 5EOBA 4AOIA 3PYYA 5JKGA 3E93A 3I6WA 5CS6A 2BAKA 5FM2A 4YZBA 4IE9A 3OOGA 4QMSA 4FGBA 3G6HA 2BR1A 4ZIMA 3LFDA 5IMEA 1OPJA 3GT8A 3EHAA 4NIFA 2CN8A 3D7TA 5JFVA 1FVRA 2HZIA 5IA5A 3R8MA 3ZDIA 4J71A 3ODYX 1H27A 1L8TA 2X0GA 4GMYA 1SNUA 1YWVA 5C9CA 2HWPA 3ZO2A 4YHJA 4II5A 2EWAA 4H3QA 4HVDA 4QMQA 5J5TA 3S0OA 4HPUE 5AEPA 4N6YA 4QQTA 3UP2A 4GT3A 4O6LA 4EBVA 2O3PA 1PW2A 3L9NA 4XG3A 5E8UA 4IB1A 5A14A 2OIQA 5IH5A 3LFBA 4M84A 4FK6A 4FKUA 4O0RA 3RK9A 4GK3A 5E91A 4M14A 5E8VA 3E8EA 1ZAOA 3TKUA 2UW3A 4IM2A 1YVJA 4RBLA 4CKJA 4R7HA 5CEKA 2WMBA 4RQKA 5IA2A 2R3OA 2BZIB 4ACHA 3CQWA 5BMSA 4YJTA 5FRIA 1VEBA 3D9VA 4GFOA 2R3RA 3LCKA 2GFSA 3MS9A 4M13A 4AFJA 3A7FA 1NXKA 3MW1A 4LOQA 1QL6A 4QP4A 4RFMA 1GNGA 5CVHA 5E9EA 4XG7A 1XH4A 1ZMWA 3KXZA 4R3PA 2OH4A 4O7LA 4DH5A 4NCTC 2YAKA 5M4CA 4RIYB 3FY2A 3GVUA 4IWPA 4RIXA 3HDNA 4JIKA 2XNEA 4OTDA 4PF4A 5FTOA 1JKSA 3DBCA 3UNKA 4GH2A 1WBWA 2Z7LA 3VUHA 3AT2A 3F2RA 1PKDA 3C0IA 5BUJA 3Q5IA 2J51A 2JBPA 3W2SA 4O2ZA 4X3FA 3BYMA 4M3QA 3H9RA 4LOPA 1QMZA 1JVPP 4QMTA 2WU6A 3MH3A 4IC7A 2I0YA 3D5VA 4NM7A 4UN0C 1PMNA 3D2KA 1YHWA 3E88A 4KIKA 2QODA 4FEQA 3ZDUA 2YM6A 5IEYA 4W8DA 4FTQA 3MA3A 5EI6A 2JITA 3ROCA 4RJ6A 4I6HA 5DRBA 2ITQA 5J79A 2C0IA 4AN3A 1FOTA 3GU5A 2DUVA 4QYYA 3BBTB 4W4YA 5K4JA 2PVHA 3TIZA 1OIQA 1JSUA 4PUZA 2C6IA 3DXPA 4FSWA 4YO6A 5B0XA 3DQXA 2C6TA 4G6OA 4N70A 3RMFA 3TL8A 3BU3A 2WAJA 3L9PA 5I9WA 5C4KA 3ZU7A 5AUVA 3O8TA 2P55A 2X4FA 2GCDA 4C57A 3HGKA 1FQ1B 1SMHA 1Q8ZA 2XM8A 3C13A 3EQBA 4FKJA 5I9ZA 2LGCA 4HGEA 2CKEA 2F7XE 3EB0A 4G9CA 3TV4A 3F88A 4IZ5A 1Q5KA 2ITYA 1OUYA 3QX4A 2XUUA 3PIZA 2A0CX 4YGAA 3JR1A 5FEQA 2RG5A 5FD2A 3VF9A 3NUNA 1FPUA 3RINA 4USEA 2XEZA 3EQRA 5H8EA 4EHVA 3AMBA 4H3PA 4M66A 4MHAA 4Y5QA 2WEVA 4JQ8A 5KMOA 3TWJA 4F64A 4BCOA 2UZLA 4D2TA 4QMOA 3WF9A 2IWIA 1H26A 4IVAA 2AC5A 3QAME 4IZYA 1H1RA 3R28A 4Y46A 4BZDA 3E92A 3ORTA 3OWLA 2C6LA 4KBAA 3V5LA 4AE9A 3B2WA 3R7OA 2RL5A 2CKOA 2Z7QA 2JIIA 2E9NA 3DB6A 4FV4A 4BDIA 5HESA 2YIYA 3V5QA 2XNNA 3RWQA 5L2IA 3PP1A 4V01A 3NYNA 4OLIA 3DQWA 1FINA 2VNYA 4NK9A 4C8BA 4ASXA 4CFNA 4FIEA 4ZZNA 1R0EA 1REJA 3CXWA 4G3CA 4FTOA 3V8WA 1QPEA 4IWDA 4CZUA 4HVSA 4YC8A 4ANMA 3LHJA 3DU8A 5J95A 3E3BX 3LQ8A 4F9BA 3CR0A 1AD5A 4S31A 3NEWA 4FE2A 3UQFA 4DG2E 3CY3A 3TV7A 3LXLA 3DK7A 3EH9A 4YNEA 4OTGA 3HV7A 3R7YA 4FTTA 1ZXEA 2VWIA 3KXGA 5F94A 2BAQA 3EN5A 2BRGA 1EH4A 2WD1A 4KBCA 4K77A 3U51A 4EKLA 2XNOA 2XS0A 1DAYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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